網(wǎng)絡(luò)藥理虛擬篩選方法簡介網(wǎng)絡(luò)藥理虛擬篩選方法簡介1什么是網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)？從系統(tǒng)生物學(xué)和生物網(wǎng)絡(luò)平衡的角度闡釋疾病的發(fā)生發(fā)展過程；從改善或恢復(fù)生物網(wǎng)絡(luò)平衡的整體觀角度認(rèn)識(shí)藥物與機(jī)體的相互作用并指導(dǎo)新藥發(fā)現(xiàn)。在高通量組學(xué)數(shù)據(jù)分析、計(jì)算機(jī)模擬計(jì)算及網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫檢索的基礎(chǔ)上，進(jìn)行生物網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建及分析，進(jìn)而進(jìn)行藥物作用機(jī)制的研究及創(chuàng)新藥物的發(fā)現(xiàn)

2什么是網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)？從系統(tǒng)生物學(xué)和生物網(wǎng)絡(luò)平衡的角度闡釋疾病的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究思路思路一：根據(jù)公共數(shù)據(jù)庫和公開發(fā)表的已有數(shù)據(jù)，建立特定藥物作用機(jī)制網(wǎng)絡(luò)預(yù)測模型，預(yù)測藥物作用靶點(diǎn)/機(jī)制，從生物網(wǎng)絡(luò)平衡的角度解析藥物作用的藥理學(xué)機(jī)制；思路二：利用各種組學(xué)技術(shù)以及高內(nèi)涵/高通量技術(shù)，觀察藥物對模型(分子、細(xì)胞、組織或/和動(dòng)物)的作用或模型對藥物的作用，針對所產(chǎn)生的大量數(shù)據(jù)，采用生物信息學(xué)的手段分析和構(gòu)建藥物-靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)，建立預(yù)測模型，進(jìn)而解析所研究藥物的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)機(jī)制。

3網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究思路思路一：根據(jù)公共數(shù)據(jù)庫和公開發(fā)表的已有數(shù)肆準(zhǔn)備待篩選分子壹叁貳靶點(diǎn)篩選通路篩選網(wǎng)絡(luò)藥理圖肆準(zhǔn)備待篩選分子壹叁貳靶點(diǎn)篩選通路篩選網(wǎng)絡(luò)藥理圖4第一章準(zhǔn)備待篩選分子第一章準(zhǔn)備待篩選分子5一、準(zhǔn)備待篩選分子6Chembiooffice2008以上版本作圖，文件格式須為sdf一、準(zhǔn)備待篩選分子6Chembiooffice2008以上第二章靶點(diǎn)篩選第二章靶點(diǎn)篩選7二、靶點(diǎn)篩選81/pharmmapper/點(diǎn)擊此處上傳分子結(jié)構(gòu)，每次只能投入1個(gè)分子結(jié)構(gòu)二、靶點(diǎn)篩選81/phaJodID是下載結(jié)果的“密碼”JodID是下載結(jié)果的“密碼”910下載結(jié)果10下載結(jié)果11Fit為分子和靶點(diǎn)的匹配度，越高代表越匹配。靶點(diǎn)名稱與人類相關(guān)的靶點(diǎn)代碼11Fit為分子和靶點(diǎn)的匹配度，越高代表越匹配。靶點(diǎn)名稱與人第三章通路篩選第三章通路篩選12三、通路的篩選將前面工作中得到的與人類相關(guān)的靶點(diǎn)代碼全部換成類似于P00517的形式，以投入博奧數(shù)據(jù)庫得到與靶點(diǎn)相關(guān)的通路。以靶點(diǎn)PDPK1_HUMAN為例：/此為蛋白編號(hào)靶點(diǎn)蛋白名稱三、通路的篩選將前面工作中得到的與人類相關(guān)的靶點(diǎn)代13注冊并登陸上傳project建議自己申請！注冊并登陸上傳project建議自己申請！14選擇與人類相關(guān)的選擇與人類相關(guān)的15靶點(diǎn)填于此處靶點(diǎn)填于此處161717靶點(diǎn)-通路一般選擇p值小于0.01的通路靶點(diǎn)-通路一般選擇p值小于0.01的通路18將選擇的靶點(diǎn)在uniprot上查的蛋白名稱將選擇的靶點(diǎn)在uniprot上查的蛋白名稱19第四章網(wǎng)絡(luò)藥理圖第四章網(wǎng)絡(luò)藥理圖20四、網(wǎng)絡(luò)藥理圖21將化合物對應(yīng)靶點(diǎn)，靶點(diǎn)對應(yīng)通路于同一EXCELL中。注意：要做成兩列即：化合物靶點(diǎn)靶點(diǎn)通路然后將表格導(dǎo)入Cytoscape軟件（官方下載地址：/），也可使用其他作圖軟件。四、網(wǎng)絡(luò)藥理圖21將化合物對應(yīng)靶點(diǎn)，靶點(diǎn)對應(yīng)通路于同一EXC點(diǎn)擊對形狀和背景進(jìn)行更改節(jié)點(diǎn)連線背景點(diǎn)擊對形狀和背景進(jìn)行更改節(jié)點(diǎn)連線背景22為了方便對圖進(jìn)行編輯和更改，我們可以導(dǎo)入attributes。令通路等于2，化合物名稱等于3?？稍诖颂帉Ｒ坏膶衔铩悬c(diǎn)。通路進(jìn)行更改顏色為了方便對圖進(jìn)行編輯和更改，我們可以導(dǎo)入attributes23也可以專一性的進(jìn)行形狀的更改也可以專一性的進(jìn)行形狀的更改24網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)與實(shí)驗(yàn)相關(guān)的環(huán)節(jié)基于實(shí)驗(yàn)結(jié)果構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)所需基本數(shù)據(jù)的獲取對所建立的網(wǎng)絡(luò)預(yù)測模型進(jìn)行實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證目前網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究在實(shí)驗(yàn)研究水平所涉及的相關(guān)技術(shù)除了組學(xué)(基因組、蛋白質(zhì)組、代謝組和糖組等)技術(shù)外，主要包括3個(gè)方面:高通量/高內(nèi)涵技術(shù)、雙高通量基因表達(dá)檢測技術(shù)和分子相互作用技術(shù)。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)與實(shí)驗(yàn)相關(guān)的環(huán)節(jié)基于實(shí)驗(yàn)結(jié)果構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)所需基本數(shù)據(jù)的25網(wǎng)絡(luò)藥理虛擬篩選方法簡介講課人：冰點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)藥理虛擬篩選方法簡介講課人：冰點(diǎn)26

播種行為，收獲習(xí)慣；播種習(xí)慣，收獲性格；播種性格，收獲命運(yùn)；學(xué)習(xí)歸根結(jié)底是培養(yǎng)習(xí)慣，行為養(yǎng)成習(xí)慣，習(xí)慣形成品質(zhì)，品質(zhì)決定命運(yùn)。寫在后面的話學(xué)習(xí)就像一個(gè)蓄電池，你學(xué)過的每一種知識(shí)，都會(huì)在將來的某一天，給你驚喜。播種行為，收獲習(xí)慣；學(xué)習(xí)歸根結(jié)底是培養(yǎng)習(xí)慣，行為養(yǎng)27這是一次心靈之旅請彼此信賴，彼此欣賞，彼此幫助用心學(xué)習(xí)，用心體會(huì)共同到達(dá)成功的彼岸溫馨提示這是一次心靈之旅溫馨提示28心身投入全心身投入全29通過培訓(xùn)收獲的五大心得空杯心態(tài)積極參與真誠建議掌聲鼓勵(lì)