關(guān)于小鼠遺傳學(xué)及其分類命名遺傳學(xué)基礎(chǔ)知識(shí)實(shí)驗(yàn)小鼠起源實(shí)驗(yàn)小鼠的分類及其命名遺傳監(jiān)測(cè)繁育體系第2頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天分子遺傳學(xué)第3頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天編碼特定蛋白產(chǎn)物的DNA序列基因可能存在可變形式，稱為等位基因（allele）基因（GENE）第4頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天homozygousheterozygoushemizygous等位基因(Alleles)野生型“wildtype”在自然群體中往往有一種占多數(shù)的（因此常被視為正常的）等位基因第5頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天基因的命名沒(méi)有特定的命名體系,因此比較混亂通過(guò)基因功能命名(通常為酶)Nos2,Sod1通過(guò)基因產(chǎn)物的大小命名p53,p21通過(guò)表型命名Apc,Rb,Mom1同物異名當(dāng)基因功能確定后命名常會(huì)發(fā)生改變單個(gè)基因有多個(gè)功能時(shí)通常會(huì)有多個(gè)名字第6頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天基因型/表型

基因型(Genotype)狹義=個(gè)體特定基因的等位基因組成情況廣義=個(gè)體所有基因的整套等位基因(整個(gè)遺傳背景或基因組)表型(Phenotype)狹義=因特定基因的等位基因組成而引起的個(gè)體特征廣義=因個(gè)體的基因組組成而引起的一系列解剖,生理和行為學(xué)等特征第7頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天小鼠基因組學(xué)人基因組~3billionbp小鼠基因組~3billionbp其它模式生物基因組大小果蠅~140millionbp(21-foldless)線蟲~97millionbp(31-foldless)酵母~12millionbp(250-foldless)細(xì)菌(E.coli)~5millionbp(600-foldless)第8頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天小鼠基因組學(xué)小鼠是研究人類基因功能最好的模式動(dòng)物C57BL/6,BALB/c,C3H是歷史上最常使用的小鼠C57BL/6,129,FVB最常使用的基因工程小鼠可獲取基因組序列的小鼠品系C57BL/6(NIHMouseSequencingConsortium)A/J2,DBA/2,129X1/SvJ,129S1/SvImJ(CeleraGenomics)第9頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天小鼠基因組學(xué)小鼠基因組大概包含30,000到50,000個(gè)不同基因(~2000個(gè)每染色體)至少50%與人類基因同源(相似的序列和功能)與人類基因同源的小鼠基因的命名

Nitricoxidesynthase2Humangene=NOS2(斜體,全大寫)Mousegene=Nos2(斜體,首字母大寫)Protein=NOS2(正體,全大寫)第10頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天小鼠功能基因組學(xué)基因型驅(qū)動(dòng)的或”正向”基因組學(xué)引入突變(遺產(chǎn)工程)篩選表型改變具有人為偏好的特點(diǎn)表型驅(qū)動(dòng)的或”反向”基因組學(xué)隨機(jī)突變后觀測(cè)表型改變或隨機(jī)引入點(diǎn)突變(byENU)觀測(cè)表型改變找出表型相關(guān)基因位點(diǎn)鑒定未知基因,基因功能需要大量篩選工作第11頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天實(shí)驗(yàn)小鼠起源第12頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天第13頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天家鼠起源第14頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天M.musculus各亞種的地理分布第15頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天HistoryoftheLaboratoryMouse1100BC- color-variantmice(China)1909- firstinbredstrain1929- TheJacksonLaboratory1962- nudemouse1980- firsttransgenicmouse1989- firstknockoutmouse1990s- conditional/inducibleknockouts, knock-in,mousegenomeproject2002- RNAinterferenceknockouts?第16頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天JonA.Backetal.2000NatureGenetics,vol24,23-25第17頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天同基因型不同基因型近交系

?亞系F1雜合子同源突變近交系同源導(dǎo)入近交系

·混合近交系重組近交系/重組同類系Consomic/Conplasticstrain遠(yuǎn)交系/封閉群根據(jù)遺傳學(xué)分類小鼠品系分類第18頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天同基因型不同基因型近交系

?亞系F1雜合子同源突變近交系同源導(dǎo)入近交系

·混合近交系重組近交系/重組同類系Consomic/Conplasticstrain遠(yuǎn)交系/封閉群根據(jù)遺傳學(xué)分類小鼠品系分類第19頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天封閉群（遠(yuǎn)交群）

ClosedColonyorOutbredStock以非近親交配方式進(jìn)行繁殖生產(chǎn)的一個(gè)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物種群，在不從其外部引入新個(gè)體的條件下，至少連續(xù)繁殖4代以上，封閉群亦稱遠(yuǎn)交群。Labcode:stocksymble例如：N:NIH

表示由美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院（N）保持的NIH封閉群小鼠。

Lac:LACA

表示由英國(guó)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心（Lac）保持的LACA封閉群小鼠。某些命名較早，又廣為人知的封閉群動(dòng)物，名稱與上述規(guī)則不一致時(shí)，仍可沿用其原來(lái)的名稱。如：Wistar大鼠封閉群，日本的ddy封閉群小鼠等。第20頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天同基因型不同基因型第21頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天近交的結(jié)果第22頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天98.7％homozygosity第23頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天同基因型不同基因型近交系

?亞系F1雜合子同源突變近交系同源導(dǎo)入近交系

·混合近交系重組近交系/重組同類系Consomic/Conplasticstrain遠(yuǎn)交系/封閉群根據(jù)遺傳學(xué)分類小鼠品系分類第24頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天近交系：經(jīng)至少連續(xù)20代的全同胞兄妹交配培育而成，品系內(nèi)所有個(gè)體都可追溯到起源于第20代或以后代數(shù)的一對(duì)共同祖先。經(jīng)連續(xù)20代以上親代與子代交配與全同胞兄妹交配有等同效果。近交系Inbredstrain第25頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天近交系的命名基于毛色DBA(DiluteBrownnonAgouti,firstinbredmouse)基于起源NZW(NewZealandWhite)基于表型NOD(Non-ObeseDiabetic)其它BALB/c,C57BL,129第26頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天近交系的命名1．一般均用一個(gè)或幾個(gè)大寫英文字母表示，如A、AE、BA、AKR、DBA、NZB、STAR、NMRT、NYLR、NZBR等2．有些品系可在大寫英文字母間加入一些阿拉拍數(shù)字來(lái)表示，如C3H、C57BL、C57BR、C57L、CC57W、CC57BR等3．非正規(guī)的命名，如果已廣泛為國(guó)際所共知者，則可保留沿用，如：“129”、“101”、“615”等第27頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天近交系代數(shù)近交代數(shù)表示，一般是在品系符號(hào)后括號(hào)里寫上代數(shù)，并在代數(shù)前加寫“F”（Filial的縮寫），例如A（F78）。C57BL/6J(F？+10)C57BL/6JNga(F73+26)第28頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天同基因型不同基因型近交系

?亞系F1雜合子同源突變近交系同源導(dǎo)入近交系

·混合近交系重組近交系/重組同類系Consomic/Conplasticstrain遠(yuǎn)交系/封閉群根據(jù)遺傳學(xué)分類小鼠品系分類第29頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天亞系的形成近交系的亞系分化是指一個(gè)近交系內(nèi)各個(gè)分支的動(dòng)物之間，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)或十分可能存在遺傳差異。通常下述三種情況會(huì)發(fā)生亞系分化。a)在兄妹交配代數(shù)達(dá)40代以前形成的分支（即分支發(fā)生于F20到F40之間）；b)一個(gè)分支與其他分支分開繁殖超過(guò)100代；c)已發(fā)現(xiàn)一個(gè)分支與其他分支存在遺傳差異。產(chǎn)生這種差異的原因可能是殘留雜合、突變或遺傳污染（geneticcontamination）（即一個(gè)近交系與非本品系動(dòng)物之間雜交引起遺傳改變）。由于遺傳污染形成的亞系，通常與原品系之間遺傳差異較大，因此對(duì)這樣形成的亞系應(yīng)重新命名。例如由GLaxo保持的A近交系在發(fā)生遺傳污染后，重新命名為A2G。第30頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天亞系的命名C57BL/6,C57BL/10C57BL/6J,C57BL/6N例外BALB/c、C57BR/cd第31頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天亞系的命名更復(fù)雜的亞系命名是通過(guò)把實(shí)驗(yàn)室代碼按順序?qū)懗?不添加斜杠BALB/cByJ,BALB/cAnN,BALB/cJC57BL=parentstraindesignation6JOlaHsdEi=substraindesignation6=linenumber

J=laboratorycode

Ola=laboratorycode

Hsd=laboratorycode

Ei=LaboratorycodeC57BL/6JOlaHsdEi第32頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天實(shí)驗(yàn)室代碼由

InstituteforLaboratoryAnimalResearch(ILAR)來(lái)管理實(shí)驗(yàn)室代碼

InternationalLaboratoryCodeRegistry(LabCodes).環(huán)境因素會(huì)影響一個(gè)品系的特征,所以標(biāo)明一個(gè)品系是從哪來(lái)的是很重要的./ilar/codes.asp?id=codes

J：TheJacksonLaboratoryN：NationalInsititutesofHealthCrl：TheCharlesRiverLaboratoryRik：TheInstituteofPhysicalandChemicalResearch(RIKEN)第33頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天Reference:SpechtCG,SchoepferR.Deletionofthealpha-synucleinlocusinasubpopulationofC57BL/6Jinbredmice,BMCNeuroscience2001:2:11.亞系提供單位基因型表型C57BL/6JOlaHsdHarlan,Bicester,UKdeletionofthealpha-synuclein(Snca)locusImplicatedintheaetiologyofParkinsonandAlzheimerdiseasesC57BL/6JTheJacksonLaboratoryLocusintactNormalC57BL/6NCharlesRiver,Margate,UKLocusintactNormal近交系亞系之間的差異第34頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天BALB/c的家譜1932,Snell(addedthe/c),UniversityofTexas???,NCI,Amsterdam1935,F?,Andervont(An),NIH1967,F99,Bailey(By),JAXBALB/cAJcl1951,F72,NIHBALB/cAnN1975,F136,JAXBALB/cByJ1935,F26,SnellmovedtoJAX1961,Bailey,NIH1923,Little&MacDowell,startinbreeding1927,F12,Muller,UniversityofTexas1913,HalseyJ.Baggalbino1973,CIEA,Japan1989,CLEA,Japan免疫反應(yīng)最強(qiáng)第35頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天BALB/c亞系的差異SubstrainAnimalProviderGenotypePhenotypeBALB/cByJTheJacksonLaboratoryA278bpsdeletionoftheacyl-CoenzymeAdehydrogenase,shortchain,

(Acads

)locus●severeorganicaciduria●hypoglycemiaandelevatedurinaryandmusclebutyrylcarnitineconcentrations(after18hrsfasting)

BALB/cAnNTheNIHLocusintactNormalBALB/cAJclCLEA,JapanLocusintactNormalReference:ArmstrongDL;MasiowskiML;WoodPA,Pathologiccharacterizationofshort-chainacyl-CoAdehydrogenasedeficiencyinBALB/cByJmice.,AmJMedGenet1993;47(6):884-92第36頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天同基因型不同基因型近交系

?亞系F1雜合子同源突變近交系同源導(dǎo)入近交系

·混合近交系重組近交系/重組同類系Consomic/Conplasticstrain遠(yuǎn)交系/封閉群根據(jù)遺傳學(xué)分類小鼠品系分類第37頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天F1雜合子(F1Hybrids)定義:兩個(gè)不同近交系交配后生產(chǎn)的第一代優(yōu)點(diǎn):基因型和表型一致;雜交優(yōu)勢(shì);可以接受來(lái)自雙親品系的器官移植缺點(diǎn):不能自我維持品系延續(xù)第38頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天F1雜合子的命名用交配的兩個(gè)近交系的縮寫,先雌鼠后雄鼠再跟一個(gè)F1B6CBF1第39頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天雜合子命名中使用的標(biāo)準(zhǔn)縮寫縮寫品系縮寫

品系129P129P3/JLC57L/J129S129S1/SvImJCBACaCBA/CaGnLeAHeA/HeJCBCBAAA/JC3C3H/HeJAKAKR/JC3FeC3HeB/FeJCByBALB/cByJD1DBA/1JCBALB/cJD2DBA/2JBC57BLNZBNZB/BlNJB6C57BL/6JNZWNZW/LacJB10C57BL/10JSJLorJSJL/JBRC57BR/cdJSWSWR/J第40頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天品系縮寫C57這個(gè)縮寫可意味著七、八個(gè)特征不同的品系（如C57BL及其亞系6個(gè)，C57BR/cdJ,C57L）。C57BL就包括有幾個(gè)特征不同的亞系（如C57BL/1，C57BＬ/6J、C57BL/6N、C57BL/10J等）。只寫CBA亦為不確切的書寫法，因?yàn)樗灿腥舾蓚€(gè)特性不同的亞系，如CBA/J是有視網(wǎng)膜退變基因的，而CBA/ca則沒(méi)有這種基因，兩者對(duì)放射線的敏感性也不一樣，組織相容性也不同，至少有5個(gè)位點(diǎn)不同的；第41頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天同基因型不同基因型近交系

?亞系F1雜合子同源突變近交系同源導(dǎo)入近交系

·混合近交系重組近交系/重組同類系Consomic/Conplasticstrain遠(yuǎn)交系/封閉群根據(jù)遺傳學(xué)分類小鼠品系分類第42頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天同源突變近交系：兩個(gè)近交系，除了在一個(gè)指明位點(diǎn)等位基因不同外，其他遺傳基因全部相同，簡(jiǎn)稱同源突變系。同源突變系一般皆由近交系發(fā)生基因突變而形成。同源突變近交系CoisogenicInbredStrain第43頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天同源突變近交系命名由發(fā)生突變的近交系名稱后加突變基因符號(hào)（用英文斜體印刷體）組成，二者之間以連接號(hào)分開，如：BALB/cJ-nu。當(dāng)突變基因必須以雜合予形式保持時(shí)，用"+"號(hào)代表野生型基因，如：A/Fa-+/c.。第44頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天InbredmiceGreatjob!第45頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天小鼠基因工程第46頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天種植前小鼠胚胎發(fā)育FertilizationActivationofembryonicgenomeCompactionE0.5E2.5E3.5E1.5第47頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天轉(zhuǎn)基因小鼠的制作0.5天受精卵DNArecover原核融合移植到假孕鼠輸卵管首建鼠founder檢測(cè)表型第48頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天轉(zhuǎn)基因小鼠制備時(shí)間表DNA純化1天原核注射≥2天小仔出生3周斷奶，編號(hào)，剪尾～3－4周提尾巴gDNA2天Founder鑒定1天總計(jì)～2－2.5月第49頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天ES細(xì)胞基因打靶AnalyzeoffspringforphenotypeelectroporateselectionanalyzecoloniestestforgermlinetransmissionmakechimerascrossheterozygotestestoffspringforchimerismimplantP12第50頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天嵌合鼠的制作BlastocystInjectionAggregationFlushembryosUterusE3.5OviductE2.5BlastocystMorulaRecover1-2hoursRemovezonapellucidaDarningneedleaggregationcultureovernightimplantintopseudopregnantsurrogatemotherEScells第51頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天基因打靶小鼠制備時(shí)間表索取BAC質(zhì)粒1月載體構(gòu)建2-3月細(xì)胞培養(yǎng)電轉(zhuǎn)篩選6-10周囊胚注射2周驗(yàn)證種質(zhì)細(xì)胞傳遞12-14周總計(jì)～10月第52頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天轉(zhuǎn)基因動(dòng)物命名符號(hào)：一個(gè)轉(zhuǎn)基因符號(hào)由以下三部分組成，均以羅馬字體表示：C57BL/6J-TgN(CD8Ge)23Jwg轉(zhuǎn)基因方式TgN:非同源插入TgH:同源重組TgR:逆轉(zhuǎn)錄病毒載體感染的插入插入片段實(shí)驗(yàn)室指定序號(hào)實(shí)驗(yàn)室注冊(cè)代碼品系A(chǔ)n匿名序列Ge基因組Im插入突變Nc非編碼序列Rp報(bào)告基因Sn合成序列Et增強(qiáng)子捕獲裝置Pt啟動(dòng)子捕獲裝置XXX/YYY：fusiongenesXXX,YYY：doubletransgenes第53頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天打靶突變小鼠命名

129X1-Cftrtm1Uncthefirsttargetedmutationofthecysticfibrosistransmembraneregulator(Cftr)geneat129X1producedattheUniversityofNorthCarolina

129X1-En1tm1(Otx2)WrstthecodingregionofEn1wasreplacedbytheOtx2gene,originatingfromtheW.Wurstlaboratory第54頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天The129StrainsMostEScelllinesderivedfrom129strainsLotsofgeneticvariabilityamong129substrainsSimpsonetal.1997NatureGenetics16:19-27Threadgilletal.1997MammalianGenome8:390-393Importanttomatch129strainsintargetedmutagenesisDNAEScelllinesCrossingchimeratogeneratepure129strainB6129PF2/JmultiplecoatcolorssegregatingforAw,a,pandTyrc-chChangednomenclaturefrom129substrainstodifferent129parentalstrainsParental

Steel

TeratomaReference:/html/nomenclature/nomen_129.shtml第55頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天129小鼠的命名及ES細(xì)胞系的起源AbbreviatesFulldesignationFormerdesignationESCellLine129P1129P1/ReJ129/ReJ129P2129P2/OlaHsd129/OlaHsdE14TG2aHM-1(Hprtb-m1)129P3129P3/J129/J129X1129X1/SvJ129/SvJRW-4PJ1-5129S1129S1/Sv-+p+Tyr-cKitlSl-J/+129/Sv-+p+Tyr-c+MgfSl-J/+W9.5(+Kitl-SlJ)CJ7(+Kitl-SlJ)129S1129S1/SvImJ129S3/SvImJ(formerly129/SvImJ,129/Sv-+p+Tyr-c+Mgf-Sl/J)R1(+Kitl-SlJ)129S2129S2/SvPas129/SvPasD3129S4129S4/SvJae129/SvJaeJ1129S6129S6/SvEvTac129/SvEvTacTC1W4129S7129S7/SvEvBrd-Hprtb-m2129/SvEvBrd-Hprtb-m2AB1(+Hprt-bm2)AB2.1(+Hprt-bm2)129T1129T1/Sv-+pTyrc-chTer/+@Na129/Sv-+pTyrc-chTer/+@Na※JAXBulletn,No1,1999※JAXNotes,No481,2001第56頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天NatureGenet.16,19-27第57頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天轉(zhuǎn)基因鼠/KO鼠的回交N10F20第58頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天同基因型不同基因型近交系

?亞系F1雜合子同源突變近交系同源導(dǎo)入近交系

·混合近交系重組近交系/重組同類系Consomic/Conplasticstrain遠(yuǎn)交系/封閉群根據(jù)遺傳學(xué)分類小鼠品系分類第59頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天同源導(dǎo)入近交系（同類近交系）CongenicInbredStrain通過(guò)雜交-互交（cross-intercross）或回交（backcross）等方式將一個(gè)基因?qū)氲浇幌抵?，由此形成的一個(gè)新的近交系與原來(lái)的近交系只是在一個(gè)很小的染色體片段上的基因不同，稱為同源導(dǎo)入近交系（同類近交系），簡(jiǎn)稱同源導(dǎo)入系（同類系）。第60頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天同源導(dǎo)入近交系的命名同源導(dǎo)入系名稱由以下三部分組成：a)接受導(dǎo)入基因的近交系名稱；b)提供導(dǎo)入基因的近交系的縮寫名稱，并與a項(xiàng)之間用英文句號(hào)分開；c)導(dǎo)入基因的符號(hào)（用英文斜體），與b項(xiàng)之間以連字符分開。例如：B10.129-H-12b

表示該同源導(dǎo)入近交系的遺傳背景為C57BL/10sn(=B10)，導(dǎo)入B10的基因?yàn)镠-12b，基因提供者為129近交系。如果供體品系非近交系或是混合的或是未知的需要加Cg符號(hào).如B6.Cg-Tcrbtm1Mom第61頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天同基因型不同基因型近交系

?亞系F1雜合子同源突變近交系同源導(dǎo)入近交系

·混合近交系重組近交系/重組同類系Consomic/Conplasticstrain遠(yuǎn)交系/封閉群根據(jù)遺傳學(xué)分類小鼠品系分類第62頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天混合近交系

MixedInbredStrains來(lái)自于2個(gè)親代品系(其中1個(gè)可以是ES細(xì)胞系),還未達(dá)到近交系狀態(tài)(即未F≧20).命名:兩個(gè)品系的大寫縮寫之間用分號(hào)(;)隔開B6;129P2-Tcrbtm1MomAmixedstrainderivedfromC57BL/6Janda129EScelllinecarryingatargetedknockoutoftheTcrbgene第63頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天混合近交系

MixedInbredStrains來(lái)自于2個(gè)以上親代品系(其中1個(gè)可以是ES細(xì)胞系)或背景未知,還未達(dá)到近交系狀態(tài)(即未F≧20).命名:STOCK符號(hào)后空一格,加上突變的基因名稱或染色體的異常標(biāo)記STOCKRb(16.17)5Bnr3uhAnstrainofunknownorcomplexbackgroundcarryingtheRobertsoniantranslocationRb(16.17)5Bnr

STOCK

Hdhtm2MemAnstrainofunknownorcomplexbackgroundcarryingHdhtargetedmutation第64頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天MARC現(xiàn)有品系舉例第65頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天同基因型不同基因型近交系

?亞系F1雜合子同源突變近交系同源導(dǎo)入近交系

·混合近交系重組近交系/重組同類系Consomic/Conplasticstrain遠(yuǎn)交系/封閉群根據(jù)遺傳學(xué)分類小鼠品系分類第66頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天重組近交系（RecombinantInbredStrain）

和重組同類系（RecombinantCongenicStrain）a)重組近交系（RI）：由兩個(gè)近交系雜交后，經(jīng)連續(xù)20代以上兄妹交配育成的近交系。b)重組同類系（RC）：由兩個(gè)近交系雜交后，子代與兩個(gè)親代近交系中的一個(gè)近交系進(jìn)行數(shù)次回次（通?；亟?次），再經(jīng)無(wú)對(duì)特殊基因選擇的近親交配而育成的近交系。重組近交系（RI）命名：由BALB/c與C57BL兩個(gè)近交系雜交育成的一組重組近交系，分別命名為CXB1、CXB2……由兩個(gè)親代近交系的縮寫的縮寫名稱中間加小寫英文字母c命名，用其中做回交的親代近交系（稱受體近交系）在前，供體近交系在后。由相同雙親育成的一組重組同類系阿拉拍數(shù)字予以區(qū)分。如CcS1，表示由以BALB/c(C)為親代受體近親系，以STS（S）品系為供體近交系，經(jīng)2代回交育成的編號(hào)為1的重組同類系。第67頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天第68頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天同基因型不同基因型近交系

?亞系F1雜合子同源突變近交系同源導(dǎo)入近交系

·混合近交系重組近交系/重組同類系Consomic/Conplasticstrain遠(yuǎn)交系/封閉群根據(jù)遺傳學(xué)分類小鼠品系分類第69頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天定義:通過(guò)不斷的回交將一整條染色體替換到一個(gè)近交品系里,又叫染色體替換品系(chromosomesubstitutionstrains)

命名: HOSTSTRAIN-Chr#DONORSTRAINConsomicStrainsC56BL/6J-Chr19AAstrainChromosome19hasbeenbackcrossedontoC57BL/6J＊InJAX,thereare20C57BL/6consomicstrainsthatbeenbackcrossedfor20individualchromosomefromAstrains第70頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天第71頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天ConplasticStrains定義: 一個(gè)品系的核基因組與另一個(gè)品系的胞漿相配合,在不斷的回交過(guò)程中,線粒體只來(lái)源于雌鼠品系命名: NUCLEARGENOME-mt

CYTOPLASMICGENOMEC57BL/6J-mtBALB/cAstrainwiththenucleargenomeofC57BL/6Jandthecytoplasmic(mitochondrial)genomeofBALB/c第72頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天RulesforNomenclatureofGenes,GeneticMarkers,Alleles,andMutationsinMouseandRatFormouse:InternationalCommitteeonStandardizedGeneticNomenclatureforMice

/mgihome/nomen/gene.shtml#genenom

Forrat:RatGenomeandNomenclatureCommittee

/nomen_rules.html

第73頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天MouseGenomeInformatics(MGI)/TheJacksonLaboratory/第74頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天遺傳監(jiān)測(cè)第75頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天遺傳監(jiān)測(cè)傳統(tǒng)方法生化同功酶分析主要組織相容復(fù)合體(MHC)serologyforMHCantigenstailallografttransplants下頜骨測(cè)量分子方法(“DNAfingerprinting”)simplesequencelengthpolymorphisms(SSLP)microsatelliteDNArestrictionfragmentlengthpolymorphisms(RFLP)minisatelliteDNAPCRgenotypingforspecificgenemutations第76頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天PCR技術(shù)的原理1.變性：在加熱或堿性條件下可使DNA雙螺旋的氫鍵斷裂，形成單鏈DNA，稱之為變性。2.退火：是模板與引物的復(fù)性。引物是與模板某區(qū)序列互補(bǔ)的一小段DNA片段。3.延伸：從結(jié)合在特定DNA模板上的引物為出發(fā)點(diǎn)，將四種脫氧核苷酸以堿基配對(duì)形式按5’→3’的方向沿著模板順序合成新的DNA鏈。第77頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天第78頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天MouseMITmicrosatellitelist第79頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天DNA瓊脂糖電泳印跡轉(zhuǎn)移預(yù)雜交雜交（變性探針）洗膜放射自顯影或顯色SouthernBlot第80頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天小鼠毛色遺傳學(xué)4種基因(ABCD)主要負(fù)責(zé)毛色表型A=agouti(+) a=non-agouti(a)B=black(+) b=brown(Tyrp1b)C=color(+) c=albino(Tyrc)D=non-dilute(+) d=dilute(Myo5ad)第81頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天BALB/cCoatColorGeneticsA=Agoutib=Brownc=Albino(dominanttoothergenes)D=non-dilute第82頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天C3HCoatColorGeneticsA=Agouti(whenCallelefixed,AisdominanttoB)B=BlackC=ColorD=Non-dilute第83頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天C57BL/6CoatColorGenetics D=Non-dilute a=Non-agouti B=Black C=Color第84頁(yè),共96頁(yè)，2024年2月25日，星期天DBACoatColorGenetics3geneticlocifixedwit