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文檔簡介
ICS65.150
CCSB52
DB50
重慶市地方標準
DB50/T1606—2024
水生動物細菌性病原鑒定技術規(guī)范
2024-07-08發(fā)布2024-10-08實施
重慶市市場監(jiān)督管理局?發(fā)布
前言
本文件按照GB/T1.1—2020《標準化工作導則第1部分:標準化文件的結構和起草規(guī)則》的規(guī)定
起草。
本文件的某些內容可能涉及專利。本文件的發(fā)布機構不承擔識別專利的責任。
本文件由重慶市水產技術推廣總站提出。
本文件由重慶市農業(yè)農村委員會歸口并組織實施。
本文件起草單位:重慶市水產技術推廣總站、中國水產科學研究院長江水產研究所、西南大學、重
慶市水產學會。
本文件主要起草人:張利平、王波、李虹、梅會清、翟旭亮、周勇、廖雨華、陳潔、馬龍強、馮俊、
薛明洋、薛洋、吳曉清、周春龍、何忠誼、徐鳳、甘婷婷、陳波、劉曉莉、梅建西。
I
水生動物細菌性病原鑒定技術規(guī)范
1范圍
本文件規(guī)定了水生動物細菌性病原鑒定的試劑、儀器設備、鑒定方法和無害化處理等技術要求。
本文件適用于水生動物細菌性病原鑒定和相關疫病診斷。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內容通過文中的規(guī)范性引用而構成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對應的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
GB/T6682分析實驗室用水規(guī)格和試驗方法
SC/T7015病死水生動物及病害水生動物產品無害化處理規(guī)范
SC/T7201.1魚類細菌性病檢疫技術規(guī)程第1部分:通用技術
3術語和定義
本文件沒有需要界定的術語和定義。
4縮略語
下列縮略語適用于本文件。
PCR:聚合酶鏈式反應(PolymeraseChainReaction)
dNTP:脫氧核糖核苷三磷酸(Deoxy-ribonucleosideTriphosphate)
TAE:三羥甲基氨基甲烷醋酸鹽(Tris(hydroxymethyl)aminomethaneAcetateSalt)
EDTA:乙二胺四乙酸(EthyleneDiamineTetraaceticAcid)
BHI:腦心浸出液肉湯(BrainHeartInfusionBroth)
BHIA:腦心浸出液瓊脂(BrainHeartInfusionAgar)
DEPC:焦碳酸二乙酯(Diethypyrocarbonate)
5試劑
實驗用水、TaqDNA聚合酶、dNTP、瓊脂糖、10×PCR緩沖液(含Mg2+,25mmol/L)、核酸染料、
BHI、BHIA。試劑配制見附錄A。實驗用水應符合GB/T6682中一級水的規(guī)定。
6儀器設備
超凈工作臺、生物安全柜、醫(yī)用冰箱、高速離心機(100rpm~20000rpm)、高壓滅菌鍋、PCR儀、
電泳儀、凝膠成像儀、生化培養(yǎng)箱、移液器等。
1
DB50/T1606—2024
7鑒定方法
樣品的制備
7.1.1同一采樣點每尾(只)動物個體視為一個樣本,同一采樣點同一次采集的相似臨床癥狀的樣本
不超過5個。優(yōu)先采集有代表性的樣本,即采集具有明顯臨床癥狀的發(fā)病動物或者離群、獨游、瀕死的
動物。
7.1.2用75%酒精對待檢測水生動物的表面進行擦拭消毒。
7.1.3放置于已消毒解剖盤中,觀察樣品臨床癥狀,若有,則用滅菌接種環(huán)或剪刀挑取部分病灶組織;
若無病變,用滅菌剪刀和鑷子,分別取肝、脾、腎等組織。
平板劃線分離及純化
7.2.1在超凈工作臺或生物安全柜中,用滅菌接種環(huán)蘸取病灶部位或其它組織在BHIA平板(或選擇性
培養(yǎng)基或血平板)上進行三區(qū)劃線,做好編號標記。
7.2.2將劃線好的平板倒置在培養(yǎng)箱中,28℃±2℃培養(yǎng)16h~24h。
7.2.3觀察菌落生長情況,挑取優(yōu)勢單菌落(參見附錄B圖B.1),在超凈工作臺或生物安全柜中用
無菌接種環(huán)挑取單菌落到裝有無菌BHI增菌液(或已知的適宜培養(yǎng)基)的離心管中(一個單菌落對應
一個離心管),做好編號標記。挑取的不是單菌落,可稀釋后重復劃線純化。
7.2.4將挑取的單菌落放置在培養(yǎng)箱中,28℃±2℃培養(yǎng)16h~24h,觀察菌液狀態(tài),若渾濁,則
于4℃保存待檢。
核酸模板制備
7.3.1吸取300μL的單菌落增菌液于無菌離心管中,12000rpm/min離心2min,棄上清。
7.3.2加入300μL的雙蒸水,洗脫,12000rpm/min離心2min;重復一次,棄上清。
7.3.3離心管中加入300μL的雙蒸水,100℃金屬浴(或水浴)10min,取出后馬上放入冰中冷卻,
等冷卻后4℃、12000r離心10min,吸取上清液作為核酸模板,放至無菌的離心管中冷藏備用;也
可使用同等抽提效果的商品化試劑盒或其它方法抽提DNA。
PCR檢測
7.4.116SrDNA的通用引物
上游引物27-F:5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3';下游引物1492-R:5'-GGTTACCTTGTTACGACTT-3'。
7.4.2反應體系
表1PCR反應體系
反應試劑加樣體積
10×PCR緩沖液(含Mg2+)5μL
dNTP1μL
上游引物1μL
下游引物1μL
TaqDNA聚合酶0.5μL
模板2.5μL
2
DB50/T1606—2024
表1PCR反應體系(續(xù))
反應試劑加樣體積
雙蒸水或DEPC水39μL
總體積50μL
7.4.3反應條件
94℃預變性3min,94℃30s;55℃30s;72℃70s;擴增32個循環(huán);72℃10min,最
后4℃保溫。
7.4.4瓊脂糖電泳
用1×TAE電泳緩沖液配置1.5%的瓊脂糖凝膠。將5μL樣品和1μL6×上樣緩沖液混勻后加入樣品
孔,在電泳時設立核酸標準分子量作對照。5V/cm電泳約0.5h,當溴酚藍快到達瓊脂糖凝膠底部時,
停止電泳。將瓊脂糖凝膠浸入核酸染料中進行泡染15min,于TAE緩沖液中脫色15min,將凝膠置于凝
膠成像儀上觀察。
結果判定:陽性對照16SrDNA的擴增產物在1500bp處出現特異性條帶,DNA分子量標準條清楚,陰
性對照和空白對照無特異性條帶,待測樣品出現1500bp的特異性核酸條帶,則可進行基因測序(待測
樣品出現1500bp的特異性核酸條帶參見附錄B圖B.2),否則無效。
7.4.5基因測序
取PCR產物進行基因序列測定,將測序結果與基因Bank中參考序列進行同源性比對。
7.4.6細菌種屬結果的確定
基因Bank進行同源性比對,根據比對結果判定細菌種屬。
8無害化處理
實驗過程中所用的器皿、耗材、及產物均需要經過121℃,15min高壓滅菌后,方可處置。
實驗后水生動物及其組織無害化處理按照SC/T7015規(guī)定執(zhí)行。
9生物安全防護
實驗人員必須穿著合適的實驗服、佩戴好口罩、帽子及一次性手套。進行活體處理或接觸含有微生
物的物品后,要洗手。離開實驗室前要脫掉手套,一次性手套不得清洗和再次使用。如果發(fā)生污染性物
質溢出等事故,應及時向實驗室負責人報告,并記錄經過和處理方案。
禁止在實驗室飲食、吸煙、化妝、儲存食物。非工作人員禁止進入實驗室。
3
DB50/T1606—2024
附錄A
(規(guī)范性)
試劑配制
A.150×TAE電泳緩沖液
2mol/LTris堿242g
1mol/L冰乙酸57.1mL
100mmol/LEDTA200ml的0.5mol/LEDTA(pH8.0)
加水定容至1000mL,室溫貯存。
A.21×TAE電泳緩沖液
加入50×電泳緩沖液20mL并加水定容至1000mL,配置成工作液,室溫貯存。
A.36×上樣緩沖液
蔗糖40g
溴酚藍
溫馨提示
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