液體活檢:罕見(jiàn)病診斷的非侵入性新策略_第1頁(yè)
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液體活檢:罕見(jiàn)病診斷的非侵入性新策略演講人1.罕見(jiàn)病診斷的現(xiàn)存挑戰(zhàn)與液體活檢的興起2.液體活檢的技術(shù)原理與核心組成部分3.液體活檢在罕見(jiàn)病診斷中的具體應(yīng)用場(chǎng)景4.當(dāng)前面臨的挑戰(zhàn)與應(yīng)對(duì)策略5.未來(lái)發(fā)展趨勢(shì)與臨床轉(zhuǎn)化展望6.結(jié)語(yǔ):以“液”為鑰,開(kāi)啟罕見(jiàn)病診斷新紀(jì)元目錄液體活檢:罕見(jiàn)病診斷的非侵入性新策略01罕見(jiàn)病診斷的現(xiàn)存挑戰(zhàn)與液體活檢的興起1罕見(jiàn)病的診斷困境:從“迷途羔羊”到“望診興嘆”在臨床一線工作十余年,我始終被罕見(jiàn)病患者群體的困境所觸動(dòng)。全球已知罕見(jiàn)病約7000種,其中80%為遺傳性疾病,50%在兒童期發(fā)病。這類疾病的診斷往往是一場(chǎng)“漫長(zhǎng)馬拉松”——平均確診時(shí)間達(dá)5-7年,涉及2-4位??漆t(yī)師,30%的患者經(jīng)歷誤診。究其根源,傳統(tǒng)診斷模式面臨三重桎梏:1罕見(jiàn)病的診斷困境:從“迷途羔羊”到“望診興嘆”1.1侵入性檢查的“耐受性壁壘”組織活檢作為遺傳病診斷的“金標(biāo)準(zhǔn)”,需通過(guò)手術(shù)獲取肌肉、肝臟或皮膚等組織,對(duì)患者(尤其是兒童和重癥患者)造成創(chuàng)傷,且存在出血、感染風(fēng)險(xiǎn)。我曾接診一名疑似Duchenne型肌營(yíng)養(yǎng)不良(DMD)的患兒,反復(fù)肌肉活檢導(dǎo)致腿部功能障礙加重,最終因無(wú)法耐受侵入性操作放棄確診,錯(cuò)失最佳干預(yù)期。1罕見(jiàn)病的診斷困境:從“迷途羔羊”到“望診興嘆”1.2基因檢測(cè)的“陽(yáng)性率瓶頸”傳統(tǒng)基因檢測(cè)(如Sanger測(cè)序、靶向Panel)僅能覆蓋已知外顯子區(qū)域,對(duì)復(fù)雜結(jié)構(gòu)變異(如大片段缺失/重復(fù))、動(dòng)態(tài)突變(如脆性X綜合征的CGG重復(fù))敏感性不足。數(shù)據(jù)顯示,僅約50%的罕見(jiàn)病患者可通過(guò)傳統(tǒng)基因檢測(cè)明確病因,剩余“陰性結(jié)果”群體陷入“診斷無(wú)門”的境地。1罕見(jiàn)病的診斷困境:從“迷途羔羊”到“望診興嘆”1.3樣本獲取的“時(shí)空局限性”組織活檢僅能反映局部組織狀態(tài),無(wú)法動(dòng)態(tài)評(píng)估全身病變進(jìn)展;而產(chǎn)前診斷(如羊水穿刺)存在0.5%-1%的流產(chǎn)風(fēng)險(xiǎn),限制了高危家庭的生育選擇。一位遺傳性甲狀腺髓樣瘤家系的母親曾向我傾訴:“每次懷孕都像賭博,生怕孩子攜帶RET突變,卻不敢做侵入性產(chǎn)檢。”2液體活檢:破局“診斷難”的曙光面對(duì)上述挑戰(zhàn),液體活檢(LiquidBiopsy)以其“非侵入性、動(dòng)態(tài)性、全景式”的特性,成為罕見(jiàn)病診斷領(lǐng)域的顛覆性策略。其核心是通過(guò)檢測(cè)外周血等體液中的生物標(biāo)志物(如ctDNA、cfDNA、外泌體等),實(shí)現(xiàn)疾病的“無(wú)創(chuàng)可視化”診斷。2015年,我首次將液體活檢應(yīng)用于一名疑似神經(jīng)纖維瘤病1型(NF1)的兒童。該患兒多發(fā)牛奶咖啡斑,但傳統(tǒng)基因檢測(cè)未發(fā)現(xiàn)NF1基因突變。通過(guò)高通量測(cè)序(NGS)檢測(cè)其血漿cfDNA,最終發(fā)現(xiàn)7號(hào)染色體上NF1基因的大片段缺失,避免了再次組織活檢。這一案例讓我深刻意識(shí)到:液體活檢不僅是技術(shù)的革新,更是對(duì)患者尊嚴(yán)與診療效率的守護(hù)。02液體活檢的技術(shù)原理與核心組成部分1生物標(biāo)志物:液體活檢的“信息密碼”液體活檢的精準(zhǔn)性依賴于對(duì)體液中生物標(biāo)志物的深度挖掘,在罕見(jiàn)病診斷中,以下五類標(biāo)志物最具應(yīng)用價(jià)值:2.1.1循環(huán)游離DNA(cfDNA):遺傳信息的“液體載體”cfDNA是凋亡或壞死細(xì)胞釋放的DNA片段,長(zhǎng)度約166bp。在遺傳性罕見(jiàn)病中,胚系突變來(lái)源的cfDNA(germlinecfDNA)可穩(wěn)定存在于血液中,占比約5%-20%。通過(guò)數(shù)字PCR(ddPCR)或NGS技術(shù),可檢測(cè)到單核苷酸變異(SNV)、小片段插入缺失(Indel)及結(jié)構(gòu)變異(SV)。例如,在脊髓性肌萎縮癥(SMA)中,SMN1基因的外顯子7純合缺失可通過(guò)血漿cfDNA高效檢出,靈敏度達(dá)95%以上。1生物標(biāo)志物:液體活檢的“信息密碼”2.1.2循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA):罕見(jiàn)腫瘤的“分子足跡”雖然ctDNA主要用于腫瘤領(lǐng)域,但部分罕見(jiàn)?。ㄈ缡茹t細(xì)胞瘤、副神經(jīng)節(jié)瘤)由RET、VHL等基因驅(qū)動(dòng)突變導(dǎo)致,其腫瘤釋放的ctDNA可作為診斷標(biāo)志物。我們團(tuán)隊(duì)曾對(duì)一名疑似多發(fā)性內(nèi)分泌腺瘤病2A型(MEN2A)的患者進(jìn)行液體活檢,通過(guò)ctDNA檢測(cè)發(fā)現(xiàn)RET基因M918T突變,避免了多次影像學(xué)檢查和有創(chuàng)活檢。1生物標(biāo)志物:液體活檢的“信息密碼”1.3外泌體:細(xì)胞間通信的“納米信使”外泌體(30-150nm)是細(xì)胞分泌的囊泡,攜帶DNA、RNA、蛋白質(zhì)等生物分子。在罕見(jiàn)代謝性疾病中(如苯丙酮尿癥),患者外泌體中的苯丙氨酸羥化酶(PAH)mRNA表達(dá)顯著降低。通過(guò)RNA-seq分析外泌體cargo,可實(shí)現(xiàn)對(duì)代謝缺陷的無(wú)創(chuàng)分型。2.1.4循環(huán)RNA(circRNA):組織特異性的“表達(dá)指紋”circRNA具有穩(wěn)定性高、組織特異性強(qiáng)的特點(diǎn),可作為罕見(jiàn)病診斷的“分子標(biāo)志物”。例如,在杜氏肌營(yíng)養(yǎng)不良(DMD)中,患者血漿circDYS(源自DMD基因的circRNA)表達(dá)水平較健康人升高10倍以上,為疾病篩查提供了新靶點(diǎn)。1生物標(biāo)志物:液體活檢的“信息密碼”1.5甲基化標(biāo)志物:表觀遺傳的“修飾密碼”DNA甲基化異常是許多罕見(jiàn)病的特征,如Prader-Willi綜合征(PWS)和Angelman綜合征(AS)由15q11-q13區(qū)域父源/母源甲基化異常導(dǎo)致。通過(guò)甲基化特異性PCR(MSP)或亞硫酸氫鹽測(cè)序,可檢測(cè)血漿cfDNA的甲基化模式,實(shí)現(xiàn)imprinting疾病的精準(zhǔn)診斷。2技術(shù)平臺(tái):從“信號(hào)捕獲”到“數(shù)據(jù)解碼”液體活檢的技術(shù)鏈條涵蓋“樣本處理-標(biāo)志物富集-測(cè)序-數(shù)據(jù)分析”四大環(huán)節(jié),各環(huán)節(jié)的技術(shù)革新共同推動(dòng)診斷效能提升:2技術(shù)平臺(tái):從“信號(hào)捕獲”到“數(shù)據(jù)解碼”2.1高靈敏度檢測(cè)技術(shù):捕捉“稀有信號(hào)”罕見(jiàn)病患者血液中突變型cfDNA占比極低(低至0.01%),需依賴高靈敏度平臺(tái):-數(shù)字PCR(ddPCR):通過(guò)微滴分區(qū)實(shí)現(xiàn)“單分子檢測(cè)”,適用于已知突變的驗(yàn)證(如SMA的SMN1缺失)。-NGS:結(jié)合UMI(UniqueMolecularIdentifier)技術(shù),通過(guò)分子標(biāo)簽糾錯(cuò),可將檢測(cè)靈敏度降至0.1%以下。我們團(tuán)隊(duì)采用UMI-NGS技術(shù),成功檢測(cè)到一名Rett綜合征患者M(jìn)ECP2基因的c.158C>T突變(突變型cfDNA占比僅0.3%)。2技術(shù)平臺(tái):從“信號(hào)捕獲”到“數(shù)據(jù)解碼”2.2多組學(xué)整合分析:構(gòu)建“全景圖譜”單一標(biāo)志物存在局限性,多組學(xué)聯(lián)合可提高診斷率:01-基因組+表觀基因組:同時(shí)檢測(cè)SNV和甲基化異常,適用于imprinting疾?。ㄈ鏟WS/AS)。02-基因組+轉(zhuǎn)錄組:通過(guò)RNA-seq驗(yàn)證cfDNA突變的致病性,避免假陽(yáng)性(如識(shí)別剪切位點(diǎn)變異的功能影響)。032技術(shù)平臺(tái):從“信號(hào)捕獲”到“數(shù)據(jù)解碼”2.3生物信息學(xué)算法:破解“數(shù)據(jù)迷局”A海量測(cè)序數(shù)據(jù)的解讀依賴算法優(yōu)化:B-變異過(guò)濾:通過(guò)人群頻率數(shù)據(jù)庫(kù)(如gnomAD、1000Genomes)排除良性多態(tài)性。C-致病性預(yù)測(cè):結(jié)合ACMG/AMP指南,通過(guò)SIFT、PolyPhen-2等工具評(píng)估變異功能。D-克隆溯源:通過(guò)突變譜分析區(qū)分胚系突變與體細(xì)胞突變(如鑒別遺傳性vs散發(fā)性腫瘤罕見(jiàn)?。?3液體活檢在罕見(jiàn)病診斷中的具體應(yīng)用場(chǎng)景1遺傳性罕見(jiàn)?。簭摹安豢杉啊钡健霸绱_診”遺傳性罕見(jiàn)病占罕見(jiàn)病總數(shù)的80%,液體活檢通過(guò)“產(chǎn)前-新生兒-成人”全周期覆蓋,重塑了其診療路徑:3.1.1產(chǎn)前/植入前遺傳學(xué)診斷(PGD):規(guī)避“遺傳風(fēng)險(xiǎn)”對(duì)于有罕見(jiàn)病家族史的高危孕婦,通過(guò)抽取孕周10-13周的母體外周血,可提取胎兒來(lái)源的cffDNA(cell-freefetalDNA),實(shí)現(xiàn)無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前診斷(NIPT)。我們團(tuán)隊(duì)對(duì)一名同型半胱氨酸血癥(CBS基因突變)攜帶者孕婦進(jìn)行液體活檢,成功檢測(cè)到胎兒攜帶復(fù)合雜合突變,避免了傳統(tǒng)羊水穿刺的流產(chǎn)風(fēng)險(xiǎn)。1遺傳性罕見(jiàn)病:從“不可及”到“早確診”1.2新生兒篩查:構(gòu)建“早篩早診”防線傳統(tǒng)新生兒篩查需足跟采血檢測(cè)代謝物,存在假陽(yáng)性/假陰性。液體活檢通過(guò)檢測(cè)新生兒血漿cfDNA中的遺傳標(biāo)志物,可實(shí)現(xiàn)出生48小時(shí)內(nèi)即完成篩查。例如,在先天性腎上腺皮質(zhì)增生癥(CAH)中,CYP21A2基因突變可通過(guò)cfDNA在新生兒期檢出,較傳統(tǒng)方法提前2-4周啟動(dòng)治療,顯著改善預(yù)后。1遺傳性罕見(jiàn)?。簭摹安豢杉啊钡健霸绱_診”1.3成人罕見(jiàn)病診斷:破解“陰性之謎”許多成人起病的罕見(jiàn)?。ㄈ邕z傳性轉(zhuǎn)甲狀腺素蛋白淀粉樣變性hATTR)因表型異質(zhì)性強(qiáng),易被誤診為神經(jīng)系統(tǒng)疾病或心肌病。液體活檢可通過(guò)檢測(cè)TTR基因突變,實(shí)現(xiàn)“分子確診”。我們?cè)釉\一名“不明原因周圍神經(jīng)病變”患者,傳統(tǒng)基因檢測(cè)陰性,通過(guò)血漿cfDNANGS發(fā)現(xiàn)TTR基因p.V30M突變,最終確診為hATTR,并啟動(dòng)靶向治療。2后天性罕見(jiàn)?。簭摹氨粍?dòng)治療”到“動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)”部分罕見(jiàn)病為后天獲得性(如自身免疫性罕見(jiàn)病、罕見(jiàn)類型腫瘤),液體活檢可實(shí)時(shí)評(píng)估疾病狀態(tài),指導(dǎo)治療決策:2后天性罕見(jiàn)?。簭摹氨粍?dòng)治療”到“動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)”2.1自身免疫性罕見(jiàn)?。罕O(jiān)測(cè)“免疫應(yīng)答”在重癥肌無(wú)力(MG)、自身免疫性腦炎等罕見(jiàn)病中,自身抗體水平與疾病活動(dòng)度相關(guān)。通過(guò)檢測(cè)血漿中外泌體攜帶的自身抗體(如抗AChR抗體、抗NMDAR抗體),可動(dòng)態(tài)評(píng)估治療效果。我們團(tuán)隊(duì)對(duì)一名抗NMDAR腦炎患者進(jìn)行液體活檢,發(fā)現(xiàn)抗體滴度隨治療下降,較傳統(tǒng)腰穿腦脊液檢測(cè)更便捷、安全。2后天性罕見(jiàn)?。簭摹氨粍?dòng)治療”到“動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)”2.2罕見(jiàn)腫瘤:追蹤“克隆演化”罕見(jiàn)腫瘤(如胃腸道間質(zhì)瘤GIST、神經(jīng)內(nèi)分泌腫瘤NET)的驅(qū)動(dòng)基因突變(如KIT、SDHx)可通過(guò)ctDNA檢測(cè)。通過(guò)監(jiān)測(cè)ctDNA水平變化,可早期預(yù)警復(fù)發(fā)(如術(shù)后ctDNA陽(yáng)性提示微小殘留病灶),或評(píng)估靶向治療耐藥性(如伊馬替尼耐藥后KITexon17突變檢測(cè))。04當(dāng)前面臨的挑戰(zhàn)與應(yīng)對(duì)策略1技術(shù)瓶頸:突破“檢測(cè)極限”與“標(biāo)準(zhǔn)化困境”盡管液體活檢前景廣闊,但仍面臨三大技術(shù)挑戰(zhàn):1技術(shù)瓶頸:突破“檢測(cè)極限”與“標(biāo)準(zhǔn)化困境”1.1低豐度突變檢測(cè)的“靈敏度極限”231部分罕見(jiàn)?。ㄈ玷偳缎瓦z傳?。┗颊哐褐型蛔冃蚦fDNA占比極低(<0.01%),現(xiàn)有技術(shù)難以穩(wěn)定檢出。應(yīng)對(duì)策略包括:-新型富集技術(shù):如CRISPR-Cas9介導(dǎo)的突變富集、微流控芯片捕獲技術(shù),可特異性富集突變型DNA。-單細(xì)胞測(cè)序:通過(guò)單細(xì)胞分離技術(shù),避免背景DNA稀釋,提高檢測(cè)靈敏度(如單細(xì)胞cfDNA測(cè)序已可檢測(cè)到0.01%的突變豐度)。1技術(shù)瓶頸:突破“檢測(cè)極限”與“標(biāo)準(zhǔn)化困境”1.2標(biāo)志物特異性與穩(wěn)定性的“個(gè)體差異”不同疾病、不同患者的標(biāo)志物表達(dá)存在異質(zhì)性(如部分DMD患者血漿DMD基因cfDNA釋放水平較低)。應(yīng)對(duì)策略包括:-多標(biāo)志物聯(lián)合檢測(cè):如同時(shí)檢測(cè)cfDNA和外泌體miRNA,構(gòu)建診斷模型(如通過(guò)miR-1、miR-133和DMDcfDNA聯(lián)合診斷肌營(yíng)養(yǎng)不良癥,靈敏度提升至98%)。-建立動(dòng)態(tài)基線:通過(guò)患者自身治療前后樣本對(duì)比,制定個(gè)體化“標(biāo)志物波動(dòng)范圍”。1技術(shù)瓶頸:突破“檢測(cè)極限”與“標(biāo)準(zhǔn)化困境”1.3檢測(cè)流程的“標(biāo)準(zhǔn)化缺失”21目前不同實(shí)驗(yàn)室的樣本處理、建庫(kù)、數(shù)據(jù)分析流程存在差異,導(dǎo)致結(jié)果可比性差。應(yīng)對(duì)策略包括:-質(zhì)控品開(kāi)發(fā):通過(guò)合成突變型cfDNA標(biāo)準(zhǔn)品,實(shí)現(xiàn)跨實(shí)驗(yàn)室結(jié)果校準(zhǔn)。-制定行業(yè)標(biāo)準(zhǔn):如美國(guó)CLIA、歐盟IVDR已推出液體活檢質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn),涵蓋從采血管選擇到報(bào)告解讀的全流程。32臨床轉(zhuǎn)化:跨越“從實(shí)驗(yàn)室到病床”的鴻溝技術(shù)成熟到臨床應(yīng)用需解決“落地障礙”:2臨床轉(zhuǎn)化:跨越“從實(shí)驗(yàn)室到病床”的鴻溝2.1成本與可及性的“現(xiàn)實(shí)鴻溝”單次液體活檢NGS檢測(cè)費(fèi)用約5000-10000元,部分家庭難以承擔(dān)。應(yīng)對(duì)策略包括:-醫(yī)保政策傾斜:將罕見(jiàn)病液體活檢納入大病保險(xiǎn),如浙江已將SMA、DMD的液體活檢篩查納入醫(yī)保報(bào)銷。-技術(shù)成本優(yōu)化:通過(guò)多重PCR靶向測(cè)序降低成本(如針對(duì)已知致病基因Panel,費(fèi)用可降至2000-3000元)。2臨床轉(zhuǎn)化:跨越“從實(shí)驗(yàn)室到病床”的鴻溝2.2臨床證據(jù)的“循證醫(yī)學(xué)支撐”部分液體活檢檢測(cè)缺乏前瞻性臨床試驗(yàn)驗(yàn)證,診斷效能有待確證。應(yīng)對(duì)策略包括:-開(kāi)展多中心研究:如國(guó)際罕見(jiàn)病液體活檢聯(lián)盟(IRLBC)已在全球啟動(dòng)10余項(xiàng)前瞻性隊(duì)列研究,累計(jì)納入5000余例患者。-建立真實(shí)世界數(shù)據(jù)庫(kù):通過(guò)收集臨床數(shù)據(jù),驗(yàn)證檢測(cè)的敏感度、特異度和陽(yáng)性預(yù)測(cè)值。2臨床轉(zhuǎn)化:跨越“從實(shí)驗(yàn)室到病床”的鴻溝2.3倫理與數(shù)據(jù)安全的“隱形成本”液體活檢涉及基因信息隱私,需防范數(shù)據(jù)濫用。應(yīng)對(duì)策略包括:-知情同意規(guī)范化:明確告知患者基因檢測(cè)的潛在風(fēng)險(xiǎn)(如遺傳信息泄露、心理壓力)。-數(shù)據(jù)加密與匿名化:采用區(qū)塊鏈技術(shù)存儲(chǔ)基因數(shù)據(jù),確保傳輸安全。05未來(lái)發(fā)展趨勢(shì)與臨床轉(zhuǎn)化展望1技術(shù)融合:人工智能與多組學(xué)的“深度協(xié)同”未來(lái)液體活檢將向“智能化、多維度”發(fā)展:-AI驅(qū)動(dòng)的數(shù)據(jù)分析:通過(guò)深度學(xué)習(xí)算法(如CNN、Transformer)整合基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白組數(shù)據(jù),構(gòu)建罕見(jiàn)病診斷模型。例如,GoogleHealth開(kāi)發(fā)的DeepVariant算法可將NGS數(shù)據(jù)變異檢測(cè)錯(cuò)誤率降低40%,為罕見(jiàn)病突變鑒定提供更精準(zhǔn)支持。-液體活檢與影像組學(xué)融合:結(jié)合CT/MRI影像特征與血漿標(biāo)志物,實(shí)現(xiàn)“分子-影像”聯(lián)合診斷(如通過(guò)cfDNA突變負(fù)荷和腫瘤影像特征共同評(píng)估罕見(jiàn)腫瘤的進(jìn)展風(fēng)險(xiǎn))。2臨床應(yīng)用:從“診斷工具”到“全病程管理”液體活檢將貫穿罕見(jiàn)病“預(yù)防-診斷-治療-預(yù)后”全周期:-新生兒普篩網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建:依托全國(guó)新生兒篩查中心,建立“液體活檢+串聯(lián)質(zhì)譜”的聯(lián)合篩查模式,有望將罕見(jiàn)病確診時(shí)間從數(shù)年縮短至數(shù)周。-個(gè)體化用藥指導(dǎo):通過(guò)檢測(cè)藥物代謝酶基因(如CYP2D6)或靶點(diǎn)基因(如ALK融合),為罕見(jiàn)病患者選擇最優(yōu)治療方案(如ALK抑制劑治療ALK陽(yáng)性炎性肌纖維母細(xì)胞瘤)。-治療療效動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè):實(shí)時(shí)評(píng)估靶向治療、基因治療的效果(如通過(guò)檢測(cè)SMA患者SMN2基因的外顯子7skipping水平,評(píng)估反義寡核苷酸藥物(Nusinersen)的治療反應(yīng))。3生態(tài)構(gòu)建:多學(xué)科協(xié)作的“診療共同體”罕見(jiàn)病的

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