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ICS11.220CCSB4135DB35/T2024—2021鰻鱺皰疹病毒感染診斷技術(shù)規(guī)范ProtocolofdiagnosistechnologyforHerpesvirusanguillaeinfection2022-02-23實施福建省市場監(jiān)督管理局發(fā)布IDB35/T2024—2021前言 12規(guī)范性引用文件 13術(shù)語和定義 14縮略語 15主要試劑和材料 16主要儀器和設(shè)備 2 28實驗室分子診斷 29綜合判定 3附錄A(資料性)試劑配制 4附錄B(資料性)鰻鱺皰疹病毒陽性參考序列 6DB35/T2024—2021本文件按照GB/T1.1—2020《標準化工作導(dǎo)則第1部分:標準化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定起草。請注意本文件的某些內(nèi)容可能涉及專利。本文件的發(fā)布機構(gòu)不承擔識別專利的責任。本文件由福建省農(nóng)業(yè)科學院提出。本文件由福建省海洋與漁業(yè)局歸口。本文件起草單位:福建省農(nóng)業(yè)科學院農(nóng)業(yè)質(zhì)量標準與檢測技術(shù)研究所、福建省農(nóng)業(yè)科學院生物技術(shù)研究所、福州海關(guān)技術(shù)中心、清流縣畜牧獸醫(yī)水產(chǎn)中心。本文件主要起草人:饒秋華、葛均青、張志燈、羅土炎、黃文華、楊金先、劉洋、何肖云、陳強、宋鐵英、羅欽、黃薇。DB35/T2024—20211鰻鱺皰疹病毒感染診斷技術(shù)規(guī)范本文件適用于鰻鱺皰疹病毒感染的診斷。2規(guī)范性引用文件下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。GB/T6682分析實驗室用水規(guī)格和試驗方法3術(shù)語和定義本文件沒有需要界定的術(shù)語和定義。4縮略語下列縮略語適用于本文件。CTAB:十六烷基三甲基溴化銨(Cetyltrithylammoniumbromide)dATP:脫氧腺苷三磷酸(Deoxyadenosinetriphosphate)dCTP:脫氧胞苷三磷酸(Deoxycytidinetriphosphate)dGTP:脫氧鳥苷三磷酸(Deoxyguanosinetriphosphate)DNA:脫氧核糖核酸(Deoxyribonucleicacid)dNTP:脫氧核糖核苷三磷酸(Deoxy-ribonucleosidetriphosphate)dTTP:脫氧胸苷三磷酸(Deoxythymidinetriphosphate)EB:溴化乙啶(Ethidiumbromide)EDTA:乙二胺四乙酸(Ethylenediaminetetraaceticacid)PCR:聚合酶鏈式反應(yīng)(Polymerasechainreaction)Taq酶:DNA聚合酶(ThermusAquaticusDNAPolymerase)TBE:三羥甲基氨基甲烷-硼酸-乙二胺四乙酸(Tris-borate-EDTA)Tris:三羥甲基氨基甲烷(Trishydroxymethylaminomethane)5主要試劑和材料5.1水:應(yīng)符合GB/T6682中一級水的規(guī)定。5.2Taq酶:2U/μL,-20℃保存。2DB35/T2024—20215.3dNTP:dCTP、dGTP、dATP、dTTP,濃度為2.5mmol/L。5.4引物:上游引物HVA-F:5,-GTGTCGGGCCTTTGTGGTGA-3,,下游引物HVA-R:5,-CATGCCGGGAGTCTTTTTGAT-3,,引物濃度為10μmol/L。5.5瓊脂糖:電泳級。6主要儀器和設(shè)備6.1恒溫培養(yǎng)箱:溫度誤差±2℃。6.2高速離心機:12000g以上。6.3PCR儀。6.4水平電泳儀。6.5凝膠成像儀。6.6勻漿器。7臨床診斷7.1體表檢查觀察魚體是否出現(xiàn)下列癥狀:體表出現(xiàn)黏液脫落,鰓蓋、頜部、胸鰭和腹鰭等部位出現(xiàn)瘀血和出血,尤其頭部鰓蓋和頜部出血、淤血明顯,體表或形成明顯脫黏斑。7.2解剖檢查解剖病魚,觀察是否出現(xiàn)下列癥狀:鰓紅腫出血;肝臟腫大,有出血點和灰白色的壞死病灶;脾臟和腎臟腫大、出血;腸粘膜水腫、充血、發(fā)炎。7.3臨床判定體表檢查和解剖檢查中出現(xiàn)以上臨床癥狀,初步判斷為疑似鰻鱺皰疹病毒感染。8實驗室分子診斷8.1鰻鱺皰疹病毒的PCR檢測8.1.1采樣在鰻鱺的鰓、肝臟、脾臟、腎臟等部位及體表黏液,共取50mg~100mg樣品,置于1.5mL離心管8.1.2樣品處理首先加入150μLCTAB溶液(見附錄A的A.1),用小剪刀將樣品剪碎,再用勻漿器將樣品勻漿后,再加CTAB溶液到900μL,混勻后于室溫孵育2h,4000g離心5min,取上清液。8.1.3DNA抽提在上述上清液中先加600μL抽提液1(見附錄A的A.2),充分混合30s,12000g離心5min,取上層水相;再加700μL抽提液2(見附錄A的A.3),充分混合30s,12000g離心5min,取上層水相;然后加入1.5倍體積的異丙醇,混勻后,靜置5min,12000g離心10min,棄上清液;加入600μL75%DB35/T2024—20213乙醇,混勻后12000g離心10min,棄上清液,室溫靜置5min;最后加20μL水溶解沉淀,作為PCR模板。提取步驟也可采用等效商品化組織DNA提取試劑盒提取。8.1.4PCR擴增DNA在0.2mL離心管中加入10×PCR緩沖液(見附錄A的A.7)2.5μL、25mmol/L氯化鎂(MgCl2見附錄A的A.6)1μL、dNTP2μL、上下游引物各0.5μL、Taq酶2U、1μL待測樣品DNA為模板,補充水至總體積25μL,也可采用等效商品化試劑盒進行擴增。反應(yīng)液混勻后,離心使其集中在離心管底部,將離心管置于PCR擴增儀,按照94℃4min;再94℃30s,55℃30s,72℃30s,40次循環(huán);然后72℃10min;最后4℃保溫的反應(yīng)條件進行PCR擴增。8.1.5瓊脂糖凝膠電泳用TBE電泳緩沖液(見附錄A的A.4)配制1%的瓊脂糖[含0.5μg/mLEB(見附錄A的A.5)]凝膠。將平板放入水平電泳槽,使電泳緩沖液剛好淹沒膠面。取6μLPCR擴增產(chǎn)物和2μL電泳上樣緩沖液(見附錄A的A.8)混勻,加入樣品孔,5V/cm電泳約30min,當溴酚藍到達凝膠底部時停止電泳。在凝膠成像儀下觀察核酸條帶并判斷結(jié)果。8.1.6設(shè)立對照8.1.6.1取已知鰻鱺皰疹病毒感染陽性的組織DNA或鰻鱺皰疹病毒陽性克隆片段1μL為模板,作為陽性對照。8.1.6.2取已知鰻鱺皰疹病毒陰性的組織DNA1μL為模板,作為陰性對照。8.1.6.3用1μL水為模板,作為空白對照。8.2結(jié)果判定8.2.1PCR擴增后,陽性對照的PCR產(chǎn)物會出現(xiàn)一條約394bp的DNA條帶,陰性對照和空白對照沒有該條帶,則實驗結(jié)果成立。8.2.2待測樣品經(jīng)PCR擴增后,電泳后出現(xiàn)約394bp條帶的判定為陽性,沒有出現(xiàn)條帶或者條帶的大小不符合394bp的均判定為陰性。9綜合判定疑似鰻鱺皰疹病毒感染的樣品,經(jīng)PCR擴增出394bp片段,并經(jīng)測序比對分析后(見附錄B),同源性大于99%,判定為鰻鱺皰疹病毒病。無臨床癥狀和病理變化的樣品,經(jīng)PCR反應(yīng)擴增出394bp片段,并經(jīng)測序比對分析后(見附錄B同源性大于99%,判定為攜帶鰻鱺皰疹病毒。DB35/T2024—20214試劑配制A.1CTAB溶液按2%CTAB,1.4mmol/LNaCl,20mmol/LEDTA,20mmol/LTris-HClpH7.5配制。使用前加巰基乙醇至終濃度為0.25%。A.2抽提液1三氯甲烷/異戊醇(將三氯甲烷和異戊醇按24:1的比例混合,密閉避光保存)。A.3抽提液2混合,密閉避光保存)。A.4TBE電泳緩沖液(5X濃縮液)A.4.1成分表A.1TBE電泳緩沖液成分試劑名稱試劑含量Tris54.0g硼酸27.5gEDTA2.9gA.4.2制法將固體物質(zhì)溶解于蒸餾水,將總體積調(diào)整至1000mL,用5mol/L的HCl調(diào)pH至8.0。A.5溴化乙錠(EB)用水配制成10mg/mL的濃縮液。A.6氯化鎂(MgCl2)25mmol/L。A.710×PCR緩沖液(10×buffer)A.7.1成分DB35/T2024—20215表A.210×PCR緩沖液成分試劑名稱試劑含量Tris-HCl7.88g氯化鉀3.73gTritonX-100A.7.2制法將固體物質(zhì)溶解于蒸餾水,再加入1mLTritonX-100,將總體積調(diào)整至100mL。A.84×電泳上樣緩沖液每100mL溶液中含溴酚藍0.25g,蔗糖40g。DB35/T2024—20216鰻鱺皰疹病毒陽性參考序列以下為鰻鱺皰疹病毒陽性基因序列片段。CATGCCGGGAGTCTTTTTGATCACGTCCTCCACTATAAGGATCTTTTGTCGCCCCGAGAGCGTGGTCAACATCTGACAGATGCGATCCGATACGCCGTAGTGCGAGTTGGCGCAGATCTTCATCTCGTTCTGCAGCTGGTTGAAGTATTTTTTCAGTCCGGGGCTCTTGGCCGTCTTCAT

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