生物學(xué)XX生物技術(shù)研發(fā)研究員助理實習(xí)報告一、摘要2023年7月1日至2023年8月31日，我在XX生物技術(shù)公司擔(dān)任技術(shù)研究員助理，負(fù)責(zé)高通量基因測序數(shù)據(jù)分析與實驗樣本處理。核心工作成果包括完成120例RNASeq數(shù)據(jù)質(zhì)控與定量分析，平均處理時間縮短至48小時；協(xié)助建立并驗證了3種細(xì)胞培養(yǎng)標(biāo)準(zhǔn)化流程，使細(xì)胞傳代成功率提升至92%；運用Python腳本自動化數(shù)據(jù)處理流程，將重復(fù)性任務(wù)效率提升40%。專業(yè)技能應(yīng)用涉及QIAGENNGS數(shù)據(jù)處理平臺操作、Bioconductor包統(tǒng)計分析及無菌實驗規(guī)范執(zhí)行。提煉出可復(fù)用的數(shù)據(jù)質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)化流程，通過優(yōu)化文庫構(gòu)建參數(shù)，使測序錯誤率從1.5%降至0.8%，驗證了參數(shù)優(yōu)化對實驗結(jié)果的直接影響。二、實習(xí)內(nèi)容及過程實習(xí)目的主要是了解實驗室實際運作，掌握分子生物學(xué)技術(shù)流程，提升動手能力。實習(xí)單位是專注于基因編輯技術(shù)的研發(fā)中心，主要進行CRISPR相關(guān)研究，實驗室設(shè)備比較齊全，有高通量測序儀和細(xì)胞培養(yǎng)設(shè)施。實習(xí)內(nèi)容涉及樣本前處理和數(shù)據(jù)分析兩個部分。7月5號到10號，跟著師傅學(xué)習(xí)細(xì)胞培養(yǎng)，包括原代細(xì)胞復(fù)蘇和傳代，我負(fù)責(zé)每天檢查細(xì)胞狀態(tài)并記錄，8號遇到細(xì)胞污染問題，導(dǎo)師指導(dǎo)我使用抗生素處理，之后兩周傳代成功率穩(wěn)定在90%以上。7月15號開始接觸RNA提取，用了3天時間處理20例樣本，后來參與優(yōu)化了TRIzol法提取流程，使RNA純度從A260/A280=1.9提升到2.1。8月初參與一個糖尿病模型基因表達分析項目，我負(fù)責(zé)RNASeq數(shù)據(jù)質(zhì)控，用了5天時間用FastQC和Trimmomatic處理了120例數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)30%樣本存在接頭污染，通過調(diào)整參數(shù)將污染率降到了10%以下。遇到的挑戰(zhàn)主要是高通量數(shù)據(jù)處理的效率問題，初期每天處理20例數(shù)據(jù)感覺很吃力，后來學(xué)了Python腳本自動讀取文件和批量處理，效率提升明顯。另一個問題是細(xì)胞培養(yǎng)經(jīng)驗不足，剛開始傳代時總有點擔(dān)心污染，現(xiàn)在對無菌操作規(guī)范更熟悉了。實習(xí)成果體現(xiàn)在三個方面，一是掌握了從樣本到數(shù)據(jù)的完整流程，二是獨立完成了30例全流程實驗，三是參與優(yōu)化的RNA提取方法被團隊采納。最大的收獲是學(xué)會了如何把理論知識應(yīng)用到實際問題中，比如通過調(diào)整測序文庫的片段大小，使目標(biāo)基因的檢出率從60%提升到85%。這段經(jīng)歷讓我意識到自己在實驗設(shè)計方面還有欠缺，以后要多學(xué)習(xí)統(tǒng)計學(xué)知識。實習(xí)單位的管理上，我覺得培訓(xùn)機制可以更完善一些，比如新來的同事需要兩到三個月才能完全熟悉各種儀器操作，如果能有更系統(tǒng)的培訓(xùn)手冊就好了。崗位匹配度方面，雖然做了很多技術(shù)性工作，但感覺理論學(xué)習(xí)和實際應(yīng)用之間還是有差距，希望學(xué)校以后能安排更多這樣的實踐機會。如果條件允許，建議單位可以建立電子實驗記錄系統(tǒng)，現(xiàn)在大家用紙質(zhì)本記錄，偶爾會出錯或者找不到之前的實驗數(shù)據(jù)。三、總結(jié)與體會這八周，從7月1號到8月31號，感覺像是從書本里走了出來，真正觸摸到了生物學(xué)研究的脈搏。實習(xí)最大的價值在于把課堂上學(xué)到的抽象概念，變成了每天能摸到、能重復(fù)的實驗步驟。比如RNASeq數(shù)據(jù)處理，剛開始對著海量數(shù)據(jù)眼都花了，后來通過不斷調(diào)試FastQC報告和STAR軟件的參數(shù)，慢慢掌握了不同樣本質(zhì)量差異的規(guī)律，最后處理120例數(shù)據(jù)只花了原來一半時間，這種從生疏到熟練的過程，就是實習(xí)給我最好的禮物。對我職業(yè)規(guī)劃的影響挺直接的。之前覺得搞科研就是做實驗，現(xiàn)在明白數(shù)據(jù)分析同樣重要。8月15號那會兒，導(dǎo)師讓我分析一批基因表達數(shù)據(jù)，我根據(jù)之前的經(jīng)驗，用Python寫了個腳本自動篩選差異基因，結(jié)果篩出來幾百個，跟預(yù)期差得挺遠(yuǎn)。后來回去查文獻，發(fā)現(xiàn)沒考慮批次效應(yīng)，重新加進sbatch工具校正后，結(jié)果才準(zhǔn)了。這件事讓我意識到，做研究不能只靠感覺，得有工具、有方法，這直接促使我計劃下學(xué)期考個R語言的數(shù)據(jù)分析證書。行業(yè)趨勢上，高通量技術(shù)確實在改變研究方式。實習(xí)里接觸的基因編輯技術(shù)，感覺未來和臨床結(jié)合會越來越緊密。有個案例是8月初參與的糖尿病模型研究，我們團隊用了CRISPR篩選，我負(fù)責(zé)提取和處理樣本。當(dāng)時有個樣本因為操作失誤，RNA降解嚴(yán)重，最后測序結(jié)果幾乎是廢的。這件事讓我印象深刻，現(xiàn)在明白為什么很多公司會投入巨資搞自動化設(shè)備，畢竟人工操作容錯率太低了。心態(tài)轉(zhuǎn)變也挺明顯。剛開始去的時候，覺得什么都會，結(jié)果第一個實驗細(xì)胞傳代就搞砸了，第二天培養(yǎng)基就長毛了。當(dāng)時挺沮喪的，后來師傅跟我說“實驗室里沒干不成的事，重要的是找到問題在哪”，我就開始記錯誤日志，每天對著顯微鏡看細(xì)胞形態(tài)，三個月下來，現(xiàn)在自己培養(yǎng)的細(xì)胞狀態(tài)比師傅還穩(wěn)定。這種從學(xué)生到職場人的責(zé)任感，感覺是學(xué)校里學(xué)不到的。未來打算把實習(xí)經(jīng)驗用在深化專業(yè)課上。比如之前沒太重視生物信息學(xué)，現(xiàn)在計劃下學(xué)期把學(xué)校選修的《基因組學(xué)分析》重修一遍，爭取拿高分。另外，實習(xí)里用的很多軟件，像SequencingStudio和R語言包，我都準(zhǔn)備買書系統(tǒng)學(xué)一下。感覺這八周像打了疫苗，雖然現(xiàn)在還沒遇到真正的挑戰(zhàn)，但心里有底了，以后無論是考研還是直接工作，都有個明確的抓手。四、致謝在此期間，感謝公司提供了實踐平臺，讓我有機會將理論知識應(yīng)用于實際工作。特別感謝導(dǎo)師在實驗方向上的指導(dǎo)，