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文檔簡(jiǎn)介
熒光原位雜交技術(shù),簡(jiǎn) 介,原位雜交技術(shù)(in situ hybridization,ISH) Gall和Pardue 1969年建立。 用標(biāo)記的DNA或RNA作為探針,對(duì)組織細(xì)胞內(nèi)的核酸或有絲分裂中期的染色體進(jìn)行原位檢測(cè)和觀察。 最初的探針大多以同位素3H、32P等標(biāo)記,但因同位素標(biāo)記探針對(duì)人體有放射損害、實(shí)驗(yàn)周期長(zhǎng)、放射自顯影的分辨率有限、環(huán)境污染等缺點(diǎn),給研究及實(shí)際應(yīng)用帶來(lái)了諸多不便。,熒光原位雜交技術(shù)(Fluorescence in situ hybridization ,F(xiàn)ISH) 利用熒光物質(zhì)標(biāo)記探針(直接或間接),再進(jìn)行雜交,可通過(guò)熒光顯微鏡對(duì)靶序列進(jìn)行定性、定位和定量分析 FISH技術(shù)的應(yīng)用已經(jīng)證實(shí)或發(fā)現(xiàn)了用經(jīng)典細(xì)胞遺傳學(xué)方法無(wú)法證實(shí)或發(fā)現(xiàn)的腫瘤染色體改變,成為銜接細(xì)胞遺傳學(xué)和分子遺傳學(xué)之間的一座橋梁。開(kāi)創(chuàng)了一個(gè)新的學(xué)科分子細(xì)胞遺傳學(xué)。,雜交流程,a.兩要素: 探針和靶序列 b.標(biāo)記探針 直接標(biāo)記和間接標(biāo)記 c.變性 探針和靶序列成為單鏈 d.混合雜交 e.間接標(biāo)記的探針需連接熒光基團(tuán)的步驟,F I S H,熒光原位雜交特點(diǎn),與其它原位雜交技術(shù)相比,F(xiàn)ISH的優(yōu)點(diǎn): 經(jīng)濟(jì)安全,快速方便; 敏感性高,特異性強(qiáng),背景低; 宜于多靶雜交,對(duì)同一標(biāo)本同時(shí)進(jìn)行多個(gè)探針雜交,不同的探針可以顯示不同的熒光顏色; 使用G帶玻片可作出回顧性分析; 缺點(diǎn): 不能達(dá)到100%雜交,特別是在應(yīng)用較短的cDNA探針時(shí)效率明顯下降。,基因特異探針靶向每條染色體只有一個(gè)拷貝的DNA序列。 主要用于間期或中期染色體中識(shí)別染色體易位、倒位、重復(fù)和缺失、鄰近基因綜合征、標(biāo)記染色體和染色體擴(kuò)增等,可檢測(cè)基因的擴(kuò)增和重排。,常用探針類型 基因特異探針,常用探針類型 重復(fù)序列探針,重復(fù)序列探針的結(jié)合位點(diǎn)是基因組中多拷貝的短重復(fù)堿基對(duì)序列(例如著絲粒和端粒探針)所在的染色體區(qū)域。 著絲粒常常是A-T豐富區(qū),而端粒已知含有TTAGGG序列。由于重復(fù)序列相對(duì)容易制備和分辨率較高(0.5Mb),這種FISH被普遍用于篩查一般的染色體非整倍體、亞端粒缺失和標(biāo)記染色體。,21三體FISH,常用探針類型 WCP探針,全基因組繪畫(huà)(WCP)探針是一種復(fù)合DNA探針。除著絲粒和端粒區(qū)外,全基因組繪畫(huà)探針對(duì)全長(zhǎng)染色體有高度親和力。這些探針最適用于識(shí)別中期染色體的基因組不平衡,尤其是在許多癌癥中觀察到的復(fù)雜染色體重排。 M-FISH用特殊選擇的窄帶濾色片連續(xù)捕獲5種熒光色素中的每一種熒光色素圖像;SKY用于熒光色素組合分析的成像設(shè)備不同:冷電荷耦合器(CCD)照相機(jī)和Fourier變換光譜法相結(jié)合,同步曝光成像。 這些技術(shù)目前在國(guó)內(nèi)一些重點(diǎn)細(xì)胞遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)室中開(kāi)展。,WCP探針(SKY),技術(shù)結(jié)合產(chǎn)前BoBS,BACs是人類DNA的長(zhǎng)片段克隆序列,典型的150-170kbp,相對(duì)于短的DNA探針具有更好的信噪比、不受DNA質(zhì)量影響、更高的覆蓋率。 將BAC DNA探針耦聯(lián)至Luminex xMAP熒光編碼的微球上,將FISH技術(shù)與Luminex技術(shù)平臺(tái)結(jié)合,BACs-on-Beads技術(shù)可以在同一個(gè)微孔內(nèi)實(shí)現(xiàn)多個(gè)FISH探針的檢測(cè),相對(duì)于同時(shí)進(jìn)行成百上千次FISH實(shí)驗(yàn)。 高通量、標(biāo)本來(lái)源廣、快速、結(jié)果明確;除了檢測(cè)13,18,21,X,Y染色體拷貝數(shù)目的變化外,還可檢測(cè)9種常見(jiàn)的微缺失綜合征。,技術(shù)結(jié)合 FQ-PCR,來(lái)自于分子生物學(xué)技術(shù)-定量熒光聚合酶鏈反應(yīng) 和FISH的結(jié)合; 對(duì)染色體13、18、21、X和Y采用熒光引物對(duì)染色體特異性高度多態(tài)性DNA短重復(fù)序列進(jìn)行PCR擴(kuò)增,快速診斷非整倍體;特定的基因引物可以檢測(cè)基因的缺失與擴(kuò)增 檢測(cè)“有”或“無(wú)”和數(shù)目異常;位置異常無(wú)法判斷,如平衡性染色體重排。,幾種技術(shù)平臺(tái)比較,細(xì)胞遺傳學(xué)技術(shù)的比較,FISH相關(guān)項(xiàng)目,羊水細(xì)胞熒光原位雜交分析(包括未培養(yǎng)和培養(yǎng)) 血細(xì)胞熒光原位雜交分析 其他各類細(xì)胞熒光原位雜交分析 SRY等單基因分析 胚胎染色體病診斷(PGD),結(jié)合技術(shù)相關(guān)檢測(cè)項(xiàng)目,染色體病快速產(chǎn)前診斷(FISH、qPCR、BoBs) 產(chǎn)前單基因病診斷 SNP Array 檢測(cè) 某些代謝病的產(chǎn)前診斷,項(xiàng)目意義,1.快速且準(zhǔn)確進(jìn)行檢測(cè) 較羊水染色體分析,F(xiàn)ISH技術(shù)可以確定13、18、21、X、Y的染色體數(shù)目信息,緩解唐篩陽(yáng)性患者或高齡孕婦精神負(fù)擔(dān);緩解醫(yī)生核型分析工作壓力,能夠有針對(duì)性的對(duì)樣本進(jìn)行處理。 2.彌補(bǔ)核型檢測(cè)失敗無(wú)報(bào)告的問(wèn)題 FISH對(duì)于樣本要求比較低,對(duì)于羊水量少、羊水活細(xì)胞數(shù)目少、孕周偏大、細(xì)胞培養(yǎng)失敗、核型結(jié)果難以判讀等各種原因?qū)е碌暮诵头治鍪【舍槍?duì)性的給予彌補(bǔ),解決占染色體數(shù)目異常的80-90%問(wèn)題。 3.FISH與羊水染色體核型分析構(gòu)成較為完整的染色體異常診斷平臺(tái),提高了產(chǎn)科胎兒產(chǎn)前診斷水平。 4.BoBs可檢測(cè)9種常見(jiàn)的微缺失綜合征,拓寬了檢測(cè)范圍。,工作基礎(chǔ),探針 商品化探針 原位雜交儀 Luminex xMAP 液相芯片檢測(cè)平臺(tái),工作基礎(chǔ),工作人員 1)項(xiàng)目負(fù)責(zé)人 劉紅衛(wèi),男,婦產(chǎn)科實(shí)驗(yàn)室技術(shù)負(fù)
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