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1、圖書(shū)館的自我重塑吳慧貞/編譯計(jì)算機(jī)專家喬杜里在約翰·霍普金斯大學(xué)圖書(shū)館演示可視化操作界面。這是該大學(xué)為促進(jìn)研究人員轉(zhuǎn)變數(shù)據(jù)處理方式所作的努力 隨著科學(xué)出版向數(shù)據(jù)開(kāi)放的轉(zhuǎn)型,圖書(shū)館和研究人員們也正努力緊隨其后,跟上時(shí)代的步伐。如果說(shuō)錯(cuò)綜龐雜的數(shù)據(jù)環(huán)境是預(yù)報(bào)器的話,那么圖書(shū)館終將會(huì)成為處理信息管理這個(gè)生態(tài)系統(tǒng)中的一部分。當(dāng)賽義德·喬杜里(Sayeed Choudhury)揮動(dòng)著右臂時(shí),幾個(gè)路過(guò)的學(xué)生忍不住多看了兩眼:其架勢(shì)看似像在練習(xí)慢動(dòng)作舞蹈,但實(shí)際上,他卻在與天文數(shù)據(jù)“玩?!薄T谶@個(gè)去年建成的耗資3 200萬(wàn)美元的約翰·霍普金斯大學(xué)圖書(shū)館內(nèi),喬杜里面對(duì)著一個(gè)2米&

2、#215;4米、由電視屏幕組成的可視化墻面。隨著手臂的指點(diǎn),他從哈勃太空望遠(yuǎn)鏡拍攝的40張圖片中選出了一張環(huán)狀星云圖片。隨后,喬杜里攤開(kāi)雙手做了一個(gè)歡迎手勢(shì)(見(jiàn)上圖),該環(huán)狀星云圖邊緣發(fā)光的橙色氣體逐漸填滿了整個(gè)墻面。這面可視化墻正是計(jì)算機(jī)專家格雷格·海格(Greg Hager)和喬杜里的杰作。他們花費(fèi)了30 000美元,將監(jiān)視器、處理器和能夠識(shí)別肢體語(yǔ)言的微軟Kinect 系統(tǒng)組裝在一起。去年10月,他們實(shí)驗(yàn)性地將這塊可視化墻面放在圖書(shū)館中,便于學(xué)生和研究人員檢索該校的數(shù)據(jù)資料(從恒星系統(tǒng)到中世紀(jì)的插畫(huà)手稿)?!半S著數(shù)字內(nèi)容的日益增多,如何讓人們擁有以及有效地利用這些文字內(nèi)容便成為

3、我們需要面對(duì)的一個(gè)問(wèn)題?!眴潭爬镎f(shuō)道。他認(rèn)為這面可視墻便是解答這個(gè)問(wèn)題的鑰匙:化學(xué)工程師可以用它來(lái)顯現(xiàn)和操縱分子,天文學(xué)家通過(guò)它能給學(xué)生講解星系分類。通過(guò)多種方式來(lái)實(shí)現(xiàn)資料的檢索和共享,喬杜里稱這面墻便是“一種新的出版形式”。新數(shù)據(jù)之爭(zhēng)為了適應(yīng)21世紀(jì)知識(shí)更新的變化,世界各地的大學(xué)圖書(shū)館都在重塑自身:一方面忙著為老師開(kāi)發(fā)課程提供技術(shù)支撐,另一方面忙著為師生采購(gòu)課本、獲取學(xué)術(shù)期刊的訪問(wèn)權(quán),以及為學(xué)生提供更多學(xué)習(xí)和訓(xùn)練的空間。但是,對(duì)于那些不離開(kāi)書(shū)桌便能在線瀏覽科學(xué)文獻(xiàn)的科學(xué)家而言,圖書(shū)館的這些變化并不明顯。對(duì)許多人來(lái)說(shuō),圖書(shū)館似乎不能滿足他們的需求,開(kāi)始變成歷史的紀(jì)念。這一現(xiàn)狀可能很快就會(huì)改變。

4、包括約翰·霍普金斯大學(xué)在內(nèi)的許多頂尖大學(xué)圖書(shū)館,希望從改變科學(xué)家管理和出版自己研究成果的方式入手,積極參與到相關(guān)的研究中,為收集、探索、可視化和信息共享提供指導(dǎo)和工具?!拔覀冋谙蚩茖W(xué)研究的頂端邁進(jìn),成為創(chuàng)造新知識(shí)的貢獻(xiàn)者?!庇?guó)牛津大學(xué)圖書(shū)館館長(zhǎng)莎拉·托馬斯(Sarah Thomas)說(shuō)。隨著數(shù)據(jù)管理趨勢(shì)的發(fā)展,圖書(shū)館正進(jìn)入到一個(gè)由商業(yè)出版社、信息存儲(chǔ)公司以及諸如GENBANK(對(duì)DNA序列進(jìn)行存檔)等特定學(xué)科數(shù)據(jù)庫(kù)的擁擠市場(chǎng)中。尤其在當(dāng)前圖書(shū)館和研究人員都面臨預(yù)算緊縮的情況下,圖書(shū)館的自我重塑能否成功目前尚不明朗。但是,依然有許多人認(rèn)為,圖書(shū)館是數(shù)據(jù)世界中一個(gè)不可或缺的

5、角色,其重要性只能隨著研究成果的開(kāi)放度的提高而增強(qiáng)。今年二月,美國(guó)總統(tǒng)奧巴馬要求向公眾開(kāi)放由聯(lián)邦政府資助的研究成果。阿爾伯克基新墨西哥大學(xué)的信息科學(xué)家威廉·米切納(William Michener)認(rèn)為,這將為數(shù)據(jù)保護(hù)和科學(xué)應(yīng)用贏得更多的支持。而圖書(shū)館與之利益相關(guān),當(dāng)教職工在管理數(shù)據(jù)方面遇到問(wèn)題時(shí),圖書(shū)館將是他們的第一道防線。在圖書(shū)館的轉(zhuǎn)型上,約翰·霍普金斯大學(xué)謝里登圖書(shū)館的研究小組率先進(jìn)行了嘗試。這部分要?dú)w功于其十多年斯隆數(shù)字巡天數(shù)據(jù)(已繪制了近一百萬(wàn)個(gè)星云圖)的管理經(jīng)驗(yàn)。喬杜里同時(shí)也是一項(xiàng)美國(guó)科學(xué)基金會(huì)(NSF)9.4億美元項(xiàng)目的主要研究人員(該項(xiàng)目旨在促進(jìn)數(shù)據(jù)保護(hù)、研

6、究和開(kāi)發(fā)數(shù)據(jù)管理工具)。2011年,該大學(xué)推出了一項(xiàng)數(shù)據(jù)和資料管理的收費(fèi)服務(wù)。 固定標(biāo)識(shí)符號(hào)在2011年該項(xiàng)目的成果描述討論會(huì)上,包括約翰·霍普金斯大學(xué)生物力學(xué)家在內(nèi)的諾亞·考恩(Noah Cowan)等人認(rèn)為,這種強(qiáng)制性的數(shù)據(jù)管理費(fèi)用跟稅收提案有些相似,當(dāng)時(shí)并不被看好?!皩?duì)研究者而言,數(shù)據(jù)和資料的保存并不是一個(gè)大賣點(diǎn),一些人只是缺少意識(shí)?!贝髮W(xué)數(shù)據(jù)管理顧問(wèn)貝琪·古尼亞(Betsy Gunia)指出。作為首批客戶之一的考恩認(rèn)為,這項(xiàng)服務(wù)有助于對(duì)他的原有實(shí)驗(yàn)進(jìn)行改進(jìn):用刀魚(yú)模擬電流中游泳的高速視頻來(lái)驗(yàn)證其獲得的數(shù)據(jù)。在這項(xiàng)試驗(yàn)中,他的研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)記錄魚(yú)鰭的運(yùn)動(dòng)以及測(cè)

7、量其神經(jīng)信號(hào),對(duì)動(dòng)物如何控制其在水中的位置進(jìn)行了研究。 盡管考恩的研究屬前沿性的,但其處理數(shù)據(jù)的方法就相對(duì)老派了。研究完成后,他把視頻和分析數(shù)據(jù)存儲(chǔ)在硬盤(pán)中。像其他研究人員一樣,對(duì)成果的分享是在他人請(qǐng)求下單獨(dú)進(jìn)行回應(yīng)。去年夏天,一名研究生對(duì)七年前的一項(xiàng)研究再分析時(shí)花了好幾個(gè)月的時(shí)間,就是因?yàn)閿?shù)據(jù)是分開(kāi)存放的且有多個(gè)版本??级髦赋?,在使用這些低質(zhì)量的元數(shù)據(jù)(數(shù)據(jù)的描述信息)時(shí),就如在進(jìn)行尋寶游戲那般困難。所以,當(dāng)考恩開(kāi)始起草一項(xiàng)由NSF發(fā)起的探索鳥(niǎo)鳴神經(jīng)活動(dòng)的預(yù)案時(shí),他與古尼亞等人設(shè)計(jì)了一項(xiàng)便于其他研究人員成果共享的項(xiàng)目數(shù)據(jù)管理計(jì)劃。如果項(xiàng)目計(jì)劃獲得NSF認(rèn)可,學(xué)校圖書(shū)館會(huì)與之簽訂合同,將為考恩

8、研究組提供5年的數(shù)據(jù)和資料管理及儲(chǔ)存服務(wù)。數(shù)據(jù)管理過(guò)程并非簡(jiǎn)單的通過(guò)諸如Dropbox存儲(chǔ)數(shù)據(jù)開(kāi)展在線數(shù)據(jù)存儲(chǔ)服務(wù)??级鲗⑻峁┰獢?shù)據(jù)“自述”文件,以及其他用于收集或處理數(shù)據(jù)的預(yù)印本。這項(xiàng)服務(wù)可以幫助他將數(shù)據(jù)進(jìn)行唯一且永久性的標(biāo)記。例如,在出版業(yè)廣泛應(yīng)用的數(shù)字對(duì)象標(biāo)識(shí)符(DOI)通過(guò)Web鏈接一個(gè)數(shù)據(jù)集,可以破解那些導(dǎo)致大家極為熟悉的“404錯(cuò)誤”。通過(guò)固定標(biāo)識(shí)符的使用,數(shù)據(jù)就可以為他人直接引用。如果項(xiàng)目得到資助,就意味著這項(xiàng)服務(wù)將花費(fèi)約2%左右的直接成本,但考恩并不介意。他說(shuō):“有了這項(xiàng)服務(wù),我的時(shí)間可以被更好地用于指導(dǎo)學(xué)生以及收集和分析數(shù)據(jù),這遠(yuǎn)比被用在處理長(zhǎng)期數(shù)據(jù)歸檔有意義得多?!标P(guān)注數(shù)據(jù)

9、管理很多科學(xué)家由于太過(guò)忙祿或缺乏相關(guān)知識(shí),可能難以親自管理數(shù)據(jù)。2010年對(duì)1 300名科學(xué)家一項(xiàng)的調(diào)查顯示:超過(guò)80表示如果別人的研究數(shù)據(jù)很容易獲取,他們會(huì)選擇利用,但只有36的人表示愿意對(duì)他人開(kāi)放自己的數(shù)據(jù)。 然而,科學(xué)家本人做數(shù)據(jù)管理時(shí)也可以有一些新的選擇,如DataONE,一個(gè)由米切納領(lǐng)導(dǎo)、NSF資助的國(guó)際數(shù)據(jù)保護(hù)和共享網(wǎng)站;另一個(gè)是Dryad,可以幫助研究人員識(shí)別數(shù)據(jù)集,并將之存儲(chǔ)和鏈接出版物。目前,很多公司都開(kāi)展了這方面的數(shù)據(jù)服務(wù)業(yè)務(wù),包括倫敦figshare(隸屬于自然前身麥克米倫出版社)和去年由湯姆森路透集團(tuán)在紐約發(fā)起的數(shù)據(jù)引文索引。2010年,諾克斯維爾田納西大學(xué)的信息科學(xué)家

10、卡羅爾·特諾皮爾(Carol Tenopir)對(duì)科學(xué)家數(shù)據(jù)利用習(xí)慣做了一項(xiàng)調(diào)查,范圍涉及美國(guó)100多個(gè)研究性高校圖書(shū)館。次年12月,一項(xiàng)尚未發(fā)表的研究結(jié)果顯示:只有不到20的圖書(shū)館提供數(shù)據(jù)管理服務(wù),接近40的圖書(shū)館計(jì)劃在兩年內(nèi)向科學(xué)家提供數(shù)據(jù)管理和存儲(chǔ)服務(wù)。牛津大學(xué)博德利圖書(shū)館開(kāi)發(fā)了一種新的收費(fèi)方法,計(jì)算方法以存儲(chǔ)層級(jí)的不同為基礎(chǔ),從完全封閉的敏感信息層(如病人的數(shù)據(jù))到可以公開(kāi)訪問(wèn)的數(shù)據(jù)及元數(shù)據(jù)層。去年針對(duì)牛津大學(xué)研究人員的一項(xiàng)調(diào)查表明,第一年,他們共有約3 PB級(jí)(300萬(wàn)GB)的數(shù)據(jù)存放量是目前保存在牛津大學(xué)中央文件系統(tǒng)中數(shù)據(jù)的兩倍。博德利圖書(shū)館開(kāi)發(fā)數(shù)字服務(wù)的沃爾弗拉曼

11、3;霍斯特曼(Wolfram Horstmann)指出,他們不會(huì)存入全部的數(shù)據(jù),調(diào)查也沒(méi)有提到研究人員必須支付數(shù)據(jù)存檔費(fèi)。其他大學(xué)也在嘗試探索不同的數(shù)據(jù)管理方法。例如,加州斯坦福大學(xué)正在試行一個(gè)對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)管理和儲(chǔ)存的服務(wù),研究人員可以存入自己的數(shù)據(jù),小項(xiàng)目是免費(fèi)的。許多高校由于缺乏資源充實(shí)他們數(shù)據(jù)庫(kù),只能暫時(shí)選擇幫助研究人員尋找合適且已存在的數(shù)據(jù)庫(kù)。特諾皮爾指出:“只有頂級(jí)的研究機(jī)構(gòu)才擁有自己的數(shù)據(jù)庫(kù)?!迸c此同時(shí),一些國(guó)家也在加速推動(dòng)數(shù)據(jù)共享計(jì)劃。例如,澳大利亞政府投入7 550萬(wàn)澳元在墨爾本莫納什大學(xué)建立的澳大利亞國(guó)家數(shù)據(jù)服務(wù)項(xiàng)目,旨在幫助澳大利亞大學(xué)識(shí)別和發(fā)布各種信息提供服務(wù)。對(duì)于約翰

12、83;霍普金斯等大學(xué)嘗試推出的數(shù)據(jù)管理服務(wù)新模式,有人認(rèn)為這是科學(xué)出版界掀起的一場(chǎng)革命,它改變了過(guò)去以敘事和基于文本為主的成果產(chǎn)出模式。即過(guò)去300年來(lái)的傳統(tǒng)學(xué)術(shù)出版模式已經(jīng)達(dá)到了極限,到了非改不可的地步。從論文到產(chǎn)品今年以來(lái),NSF修改了其項(xiàng)目申請(qǐng)指南,即在項(xiàng)目申請(qǐng)書(shū)中允許研究人員列出他們所創(chuàng)造的“產(chǎn)品”,如數(shù)據(jù)集和軟件,而不僅僅是出版物,這意味著朝數(shù)據(jù)共享的方向又邁進(jìn)了一步。在二月的國(guó)會(huì)聽(tīng)證會(huì)上,喬杜里等人提出,公眾獲取科學(xué)數(shù)據(jù)的能力是一個(gè)國(guó)家競(jìng)爭(zhēng)力的體現(xiàn)。一些開(kāi)放數(shù)據(jù)的支持者認(rèn)為,數(shù)據(jù)共享將有助于揭露學(xué)術(shù)造假和研究中存在的錯(cuò)誤。荷蘭阿姆斯特丹技術(shù)及醫(yī)學(xué)出版社負(fù)責(zé)人伊弗基·斯密特(Eefke Smit)指出:“現(xiàn)在判定圖書(shū)館在數(shù)字時(shí)代轉(zhuǎn)型是否成功還為時(shí)過(guò)早,但其中肯定不乏一些成功的新事物。” 如果錯(cuò)綜龐雜的數(shù)據(jù)環(huán)境是預(yù)報(bào)器的話,那么圖書(shū)館

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