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1、第四章 化學(xué)事實(shí)數(shù)據(jù)庫Reaxys的使用全球最全面的科學(xué)期刊和在線期刊與科學(xué)數(shù)據(jù)服務(wù)商,主要產(chǎn)品有: Scopus 全球最大的文摘與引文數(shù)據(jù)庫 ScienceDirect 全球最大的外文期刊全文數(shù)據(jù)庫CrossFire:Beilstein全球最全的有機(jī)化學(xué)數(shù)值和事實(shí)庫 Patent Chemistry化學(xué)專利數(shù)據(jù)庫 Gmelin當(dāng)今最全面的無機(jī)與金屬有機(jī)化學(xué) 事實(shí)數(shù)據(jù)庫Reaxys Crossfire的升級(jí)產(chǎn)品PharmaPendium 綜合性藥物安全性數(shù)據(jù)的關(guān)鍵來源Elsevier(愛思唯爾)CrossFire 1.0Structures&Facts181718811988198919931
2、9962007Gmelin HandbookBeilstein HandbookCrossFire CommanderV3.2plusReactionsCrossFire CommanderV7.1January 1st 2009: Reaxys 1.0Beilstein on STNReaxys的發(fā)展歷程Reaxys的內(nèi)容豐富的內(nèi)容,全面的高質(zhì)量的數(shù)值與事實(shí)數(shù)據(jù)庫ReaxysPatentBeilsteinGmelin2800萬反應(yīng)1800萬物質(zhì)400萬文獻(xiàn)CrossFire Beilstein Database : 世界最全的有機(jī)化學(xué)數(shù)值和事實(shí)庫 時(shí)間跨度從1771年至今化學(xué)結(jié)構(gòu)相關(guān)的化學(xué)、
3、物理等方面的性質(zhì)化學(xué)反應(yīng)相關(guān)的各種數(shù)據(jù)詳細(xì)的藥理學(xué),環(huán)境病毒學(xué),生態(tài)學(xué)等信息資源Patent Chemistry Database: Beilstein的完美補(bǔ)充涵蓋的國際專利類別IPC(1976年之后) C07 有機(jī)化學(xué) A61K 藥物(醫(yī)藥,牙醫(yī),化妝品制備) A01N 生物殺滅劑(農(nóng)用化學(xué)品,消毒劑等) C09B 染料(可能具有藥理學(xué)活性)Crossfire簡(jiǎn)介Reaxys是什么?Reaxys的優(yōu)點(diǎn):Reaxys不需要要安裝客戶端軟件,使用方便;Reaxys功能不僅強(qiáng)大,而且使用界面也符合大眾使用習(xí)慣,容易上手Reaxys 將Beilstein/Patent/Gmelin三個(gè)數(shù)據(jù)庫整合為
4、一個(gè)Reaxys 能把檢索結(jié)果按照收率、催化劑等條件進(jìn)行二次過濾Reaxys 能幫助設(shè)計(jì)合成路線.操作系統(tǒng)windows操作系統(tǒng)版本W(wǎng)indows 2000Windows XPWindows VistaWindows 7瀏覽器必須允許Java和cookie運(yùn)行IE 6/ IE 7Firefox 2/ Firefox 3JAVA(安裝JavaSetup6u25.exe)Sun Microsystems Java Version 5.0 or Java Runtime Environment (JRE) Version 1.5.0 結(jié)構(gòu)式畫圖軟件(安裝reaxysplugin.exe)-Marvi
5、n Sketch -Symyx ISIS Draw -Symyx Draw -CrossFire Structure Editor Reaxys對(duì)電腦軟硬件要求MarvinSketch為默認(rèn)結(jié)構(gòu)編輯器在Reaxys中注冊(cè)用戶使用注冊(cè)的用戶進(jìn)行登陸進(jìn)入“My Settings”進(jìn)入“Modify Application Settings”下載并安裝“Reaxys Structure Editor Plugin” 在電腦中需安裝JAVA程序JavaSetup6u25.exe選擇需要的畫圖軟件,如ISIS Draw或Symyx Draw點(diǎn)擊“Save”進(jìn)行保存設(shè)置在Reaxys中注冊(cè)用戶和選擇結(jié)構(gòu)編
6、輯軟件的操作流程Reaxys的檢索界面(2)化學(xué)物質(zhì)結(jié)構(gòu)式輸入?yún)^(qū)域Reaxys的檢索界面(3)文獻(xiàn) 一、關(guān)鍵字檢索例1: 檢索CAS號(hào)為34014-18-1 的化合物輸入34014-18-134014-18-1檢索結(jié)果顯示檢索結(jié)果顯示檢索結(jié)果顯示例2: 檢索包含特定信息的文獻(xiàn)synthesis of aspirin檢索結(jié)果顯示 二、結(jié)構(gòu)式檢索1、精確結(jié)構(gòu)檢索2、子結(jié)構(gòu)檢索3、化學(xué)反應(yīng)檢索選擇你習(xí)慣的結(jié)構(gòu)編輯器(事先已下載安裝reaxysplugin.exe)1、精確結(jié)構(gòu)檢索雙擊此處進(jìn)入結(jié)構(gòu)編輯器例3: 查看氯苯的性質(zhì)及合成路線點(diǎn)擊返回Structure query options area精確
7、結(jié)構(gòu)式檢索檢索結(jié)果顯示檢索結(jié)果顯示說明:如果嫌ISIS/Draw編輯軟件畫結(jié)構(gòu)太麻煩,也可以通過你順手的軟件畫結(jié)構(gòu),以Molfile格式文件讀入ISIS/Draw ,如1、通過ChemSketch分子編輯軟件畫結(jié)構(gòu), 并輸出其Mol文件(如,MDLV2000.mol)2、通過ISIS/Draw分子編輯軟件讀入該Mol文件(MDLV2000.mol)。從而實(shí)現(xiàn)所需查詢化合物結(jié)構(gòu)的輸入。2、子結(jié)構(gòu)檢索例4、查詢包含某分子骨架(基本結(jié)構(gòu))的所有化合物點(diǎn)擊返回例5:Atom list 查詢 F, Cl, Br, I 右鍵點(diǎn)擊點(diǎn)擊返回3、化學(xué)反應(yīng)檢索例6、查詢一條如圖所示的反應(yīng)右鍵點(diǎn)擊點(diǎn)擊返回例7、半反
8、應(yīng)查詢方式例8、查詢鄰位C上連接一個(gè)芳基和一個(gè)鏈狀烷烴的羧基還原為醇羥基的反應(yīng)直鏈烷烴代表不包括氫的芳環(huán)去掉使用毒性較大溶劑的相關(guān)文獻(xiàn)選擇比較可信的期刊數(shù)量減為43個(gè)選擇收率比較高的現(xiàn)在您應(yīng)該滿意了吧? 三、 聯(lián)合檢索(關(guān)鍵字與結(jié)構(gòu)式)這里只選擇了編號(hào)為1,3兩條記錄作為選擇的記錄 四、化合物名稱檢索(既可以查化合物,也可以查反應(yīng))例9、查詢以下化合物的性質(zhì)及其合成路線Name:3-(2-pyridinyl)benzoic acidSmiles:O=C(O)c1cc(ccc1)c2ccccn2輸入 3-(2-pyridinyl)benzoic acid3-(2-pyridinyl)benzoi
9、c acid點(diǎn)擊查看化合物詳細(xì)信息點(diǎn)擊查看化合物合成方法合成計(jì)劃點(diǎn)擊查看備選合成方法備選合成方法點(diǎn)擊查看備選合成方法備選合成方法例10、查詢以下反應(yīng)信息Smiles:ClCl.c1ccccc1ClC1C(Cl)C(Cl)C(Cl)C(Cl)C1Cl輸入 ClCl.c1ccccc1ClC1C(Cl)C(Cl)C(Cl)C(Cl)C1ClClCl.c1ccccc1ClC1C(Cl)C(Cl)C(Cl)C(Cl)C1Cl 五、二次篩選的應(yīng)用第一次檢索結(jié)果較多,想直接篩選出符合自己需要的檢索條目或者有些檢索記錄是不需要的,需要從檢索條目中去除避免檢索時(shí)檢索條件太嚴(yán)格漏掉有用信息二次篩選功能是快速,高效
10、檢索文獻(xiàn)的利器二次檢索的分類類型,全部在左側(cè)列出展開后的二次檢索欄目,已經(jīng)自動(dòng)分類還可以通過人工選擇進(jìn)行過濾通過點(diǎn)擊方框回到之前查詢結(jié)果中,再次進(jìn)行不同條件篩選以各種Filter條件可以連續(xù)進(jìn)行二次篩選 六、 合成路線的智能設(shè)計(jì)例11、設(shè)計(jì)Gefitinib(吉非替尼,商品名:易瑞沙)合成路線(第一個(gè)批準(zhǔn)上市治療非小細(xì)胞肺癌的EGFR抑制劑)用順手的分子編輯器畫結(jié)構(gòu)產(chǎn)生Smiles編碼 Reaxys檢索結(jié)果的導(dǎo)出與保存要是選擇導(dǎo)出全部數(shù)據(jù),由于數(shù)據(jù)太多,會(huì)慢很多??梢赃x擇只導(dǎo)出自己需要的數(shù)據(jù)Reaxys檢索結(jié)果導(dǎo)出與保存Reaxys檢索條件本地保存Reaxys檢索結(jié)果在線保存Reaxys檢索結(jié)果在線保存Reaxys檢索結(jié)果在線保存總 結(jié)信息量:Reaxys數(shù)據(jù)庫
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