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第六章微生物菌種的分離篩選第一節(jié)菌種分離的總體設(shè)計(jì)第二節(jié)分離樣本的采樣第三節(jié)含微生物樣品的富集培養(yǎng)第四節(jié)微生物的培養(yǎng)分離1PPT課件第六章微生物菌種的分離篩選第一節(jié)菌種分離的總體設(shè)計(jì)1P第一節(jié)菌種的分離簡(jiǎn)介
一、菌種的來源根據(jù)資料直接向有科研單位、高等院校、工廠或菌種保藏部門索取或購買;從大自然中分離篩選新的微生物菌種。2PPT課件第一節(jié)菌種的分離簡(jiǎn)介一、菌種的來源2PPT課件二、分離思路
新菌種的分離是要從混雜的各類微生物中依照生產(chǎn)的要求、菌種的特性,采用各種篩選方法,快速、準(zhǔn)確地把所需要的菌種挑選出來。實(shí)驗(yàn)室或生產(chǎn)用菌種若不慎污染了雜菌,也必須重新進(jìn)行分離純化。有了優(yōu)良的菌種,還要有合適的工藝條件和合理先進(jìn)的設(shè)備與之配合。3PPT課件二、分離思路新菌種的分離是要從混雜的各類微生物中依照生產(chǎn)的定方案:首先要查閱資料,了解所需菌種的生長(zhǎng)培養(yǎng)特性。采樣:有針對(duì)性地采集樣品。增殖:人為地通過控制養(yǎng)分或培養(yǎng)條件,使所需菌種增殖培養(yǎng)后,在數(shù)量上占優(yōu)勢(shì)。分離:利用分離技術(shù)得到純種。發(fā)酵性能測(cè)定:進(jìn)行生產(chǎn)性能測(cè)定。這些特性包括形態(tài)、培養(yǎng)特征、營(yíng)養(yǎng)要求、生理生化特性、發(fā)酵周期、產(chǎn)品品種和產(chǎn)量、耐受最高溫度、生長(zhǎng)和發(fā)酵最適溫度、最適pH值、提取工藝等。三、新種分離與篩選的步驟4PPT課件定方案:首先要查閱資料,了解所需菌種的生長(zhǎng)培養(yǎng)特性。三、新種菌種篩選主要步驟調(diào)查研究及查閱充分的資料
↓
設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)方案
↓確定采集樣品的生態(tài)環(huán)境
采樣
↓確定特定的增殖條件
增殖培養(yǎng)
↓確定特殊的選擇培養(yǎng)基及可能的
↓定性或半定量快速檢出法
平板分離
↓
5PPT課件菌種篩選主要步驟調(diào)查研究及查閱充分的資料
↓原種斜面
↓確定發(fā)酵培養(yǎng)基礎(chǔ)條件
篩選
↓
初篩(1株1瓶)
↓
復(fù)篩(1株3~5瓶)
↓結(jié)合初步工藝條件摸索
再復(fù)篩(1株3~5瓶)
↓
3~5株
↓
單株純種分離
↓生產(chǎn)性能試驗(yàn)
↓→毒性試驗(yàn)
菌種鑒定6PPT課件原種斜面
↓確定發(fā)酵培養(yǎng)基礎(chǔ)條件
篩選
第二節(jié)分離樣本的采樣1、采樣對(duì)象以采集土壤為主。一般園田土和耕作過的沼澤土中,以細(xì)菌和放線菌為主;富含碳水化合物的土壤和沼澤地中,酵母和霉菌較多,如一些野果生長(zhǎng)區(qū)和果園內(nèi)。采樣的對(duì)象也可以是植物,腐敗物品,某些水域等。7PPT課件第二節(jié)分離樣本的采樣1、采樣對(duì)象7PPT課件從自然界篩選8PPT課件從自然界篩選8PPT課件2、采樣季節(jié):以溫度適中,雨量不多的秋初為好。3、采土方式:在選好適當(dāng)?shù)攸c(diǎn)后,用小鏟子除去表土,取離地面5-15cm處的土約10g,盛入清潔的牛皮紙袋或塑料袋中,扎好,標(biāo)記,記錄采樣時(shí)間、地點(diǎn)、環(huán)境條件等,以備查考。為了使土樣中微生物的數(shù)量和類型盡少變化,宜將樣品逐步分批寄回,以便及時(shí)分離。9PPT課件2、采樣季節(jié):以溫度適中,雨量不多的秋初為好。9PPT課件二根據(jù)微生物生理特點(diǎn)采樣1、根據(jù)微生物營(yíng)養(yǎng)類型2、根據(jù)微生物生理特性10PPT課件二根據(jù)微生物生理特點(diǎn)采樣10PPT課件三特殊環(huán)境下采樣11PPT課件三特殊環(huán)境下采樣11PPT課件第三節(jié)含微生物樣品的富集培養(yǎng)
為了容易分離到所需的菌種,讓無關(guān)的微生物至少是在數(shù)量上不要增加,可以通過配制選擇性培養(yǎng)基,選擇一定的培養(yǎng)條件來控制。一、控制培養(yǎng)基的成分例如碳源利用的控制,可選定糖,淀粉、纖維素,或者石油等,以其中的一種為唯一碳源,那么只有利用這一碳源的微生物才能大量正常生長(zhǎng),而其它微生物就可能死亡或淘汰。這樣對(duì)下階段的純種分離就會(huì)順利得多。12PPT課件第三節(jié)含微生物樣品的富集培養(yǎng)為了容易分離到所需的菌二、控制培養(yǎng)條件pH值的控制細(xì)菌、放線菌:pH7.0~7.5酵母菌、真菌:pH6.5~7.0溫度的控制通氣量的控制13PPT課件二、控制培養(yǎng)條件13PPT課件三抑制不需要的菌類如使用不同類型的抗生素、高溫、高壓等條件,抑制不需要的菌類。14PPT課件三抑制不需要的菌類14PPT課件第四節(jié)微生物的培養(yǎng)分離
盡管通過增殖培養(yǎng)效果顯著,但還是處于微生物的混雜生長(zhǎng)狀態(tài)。因此還必須分離,純化。在這—步,增殖培養(yǎng)的選擇性控制條件還應(yīng)進(jìn)一步應(yīng)用,而且控制得細(xì)一點(diǎn),好一點(diǎn)。純種分離的方法有劃線分離法、稀釋分離法。15PPT課件第四節(jié)微生物的培養(yǎng)分離盡管通過增殖培養(yǎng)效果顯著,但還1.稀釋平皿分離法1.稀釋平皿分離法100ml1g9ml9ml9ml9ml9ml9ml1/1001/100010-810-710-610-510-41ml1ml1ml1ml1ml(1)稀釋16PPT課件1.稀釋平皿分離法1.稀釋平皿分離法100ml1g9ml9m1.稀釋平皿分離法b.涂布平皿分離法a.傾注平皿分離法17PPT課件1.稀釋平皿分離法b.涂布平皿分離法a.傾注平皿分離法17P2.平皿劃線分離法
a.連續(xù)劃線分離法b.分區(qū)劃線分離法18PPT課件2.平皿劃線分離法18PPT課件(四)篩選
這一步是采用與生產(chǎn)相近的培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件,通過三角瓶的容量進(jìn)行小型發(fā)酵試驗(yàn),以求得適合于工業(yè)生產(chǎn)用菌種。19PPT課件(四)篩選這一步是采用與生產(chǎn)相近的培養(yǎng)基和培(五)毒性試驗(yàn)
自然界的一些微生物是在一定條件下產(chǎn)毒的,將其作為生產(chǎn)菌種應(yīng)當(dāng)十分當(dāng)心,尤其與食品工業(yè)有關(guān)的菌種,更應(yīng)慎重。據(jù)有的國(guó)家規(guī)定,微生物中除啤酒酵母、脆壁酵母、黑曲霉、米曲霉和枯草桿菌作為食用無須作毒性試驗(yàn)外,其他微生物作為食用,均需通過兩年以上的毒性試驗(yàn)。20PPT課件(五)毒性試驗(yàn)自然界的一些微生物是在一定條件下產(chǎn)毒培養(yǎng)分離
從自然界中分離培養(yǎng)微生物是菌種選育的重要和基礎(chǔ)的步驟。到目前為止,還沒有一種分離培養(yǎng)方法能揭示一個(gè)試樣中所包含的所有微生物總數(shù)和種類。在任一試樣中所存在的微生物僅為極少數(shù)特定種類的菌株;在工業(yè)微生物篩選過程中,應(yīng)及時(shí)調(diào)整檢測(cè)方法,以與各種不同類型的生長(zhǎng)和代謝之微生物相適應(yīng)。因此,建立一更為科學(xué)的和針對(duì)性不強(qiáng)的分離方法是必要的。21PPT課件培養(yǎng)分離從自然界中分離培養(yǎng)微生物是菌種選育的重要和基礎(chǔ)一、成功的分離培養(yǎng)方法(1)認(rèn)真考察所需產(chǎn)品的特征和生產(chǎn)過程;(2)制訂初步的篩選標(biāo)準(zhǔn);(3)將生態(tài)學(xué)方法運(yùn)用到分離和篩選過程。22PPT課件一、成功的分離培養(yǎng)方法(1)認(rèn)真考察所需產(chǎn)品的特征和生產(chǎn)過程三、將生態(tài)學(xué)方法用于培養(yǎng)分離的一般思路要點(diǎn)1.羅列出所要分離的微生物類群;2.根據(jù)所采集樣本的各種生態(tài)參數(shù),描述所要分離的微生物之生態(tài)系統(tǒng)或棲息地:3.將若干樣本分成若干類型,如植物和植物各部,土壤(類型和土層)、巖石、水、昆蟲和發(fā)酵食品等;4.羅列出所要考察和測(cè)量的環(huán)境參數(shù),如pH、鹽分、水分、氧化還原電勢(shì)及溫度等;23PPT課件三、將生態(tài)學(xué)方法用于培養(yǎng)分離的一般思路要點(diǎn)1.羅列出所要分離5.列出生物系統(tǒng)中有用的自然底物,如森林土壤中的幾丁質(zhì)、葡萄表皮的果膠;
6.根據(jù)上述1-5項(xiàng)中所獲得的數(shù)據(jù),設(shè)計(jì)分離方法,即選擇適宜的稀釋液、底物、試樣、天然浸出汁和培養(yǎng)條件;
7.用標(biāo)準(zhǔn)方法作對(duì)照來評(píng)價(jià)生態(tài)學(xué)分離方法;
8.根據(jù)待檢材料的生態(tài)參數(shù)需要,修改已知的方法;
9.運(yùn)用特定的富集方法,富集那些可能具有篩選意義的微生物類群。24PPT課件5.列出生物系統(tǒng)中有用的自然底物,如森林土壤中的幾丁四、自然界中細(xì)菌的分離25PPT課件四、自然界中細(xì)菌的分離25PPT課件
(一)采樣和采集方法為了從一特定生態(tài)系統(tǒng)中分離出具有代表性的細(xì)菌菌群,特別是分離那些在唯一微環(huán)境區(qū)域中出現(xiàn)的菌群時(shí),必須十分重視樣本的采集。樣本采集時(shí)所需的工具通常有無菌刮鏟、土樣采集器、鑷子、解剖刀、手套、無菌小塑料袋和塑料瓶等。26PPT課件(一)采樣和采集方法為了從一特定生態(tài)系統(tǒng)中分離出具有代表性采樣的注意事項(xiàng)1、采樣時(shí)應(yīng)盡可能保持相對(duì)無菌;2、所采集的樣本必須具有某種代表性;3、采好的樣必須完整地標(biāo)上樣本的種類及采集日期、地點(diǎn)以及采集地點(diǎn)的地理、生態(tài)參數(shù)等;4、應(yīng)充分考慮采樣的季節(jié)性和時(shí)間因素,因?yàn)檎嬲脑鼐旱某霈F(xiàn)可能是短暫的;27PPT課件采樣的注意事項(xiàng)1、采樣時(shí)應(yīng)盡可能保持相對(duì)無菌;27PPT課件5、采好的樣應(yīng)及時(shí)處理,暫不能處理的也應(yīng)貯存于4℃下,但貯存時(shí)間不宜過長(zhǎng)。這是因?yàn)橐坏┎蓸咏Y(jié)束,試樣中的微生物群體就脫離了原來的生態(tài)環(huán)境,其內(nèi)部生態(tài)環(huán)境就會(huì)發(fā)生變化,微生物群體之間就會(huì)出現(xiàn)消長(zhǎng)28PPT課件5、采好的樣應(yīng)及時(shí)處理,暫不能處理的也應(yīng)貯存于4℃下,但貯存(二)生態(tài)學(xué)參數(shù)及培養(yǎng)基
的組成原則1、加入培養(yǎng)基中的天然提取物種類和用量、環(huán)境生物物理學(xué)參數(shù)以及用于平板涂布分離樣本的溶劑都會(huì)影響實(shí)驗(yàn)中所要分離的細(xì)菌的數(shù)量和種類。2、就分離培養(yǎng)基的組成而言,部分培養(yǎng)基中必須含有10-50%的天然提取物。加入培養(yǎng)基中的天然提取物,部分培養(yǎng)基中則應(yīng)含有多種碳、氮源,如幾丁質(zhì)、纖維素或果膠。29PPT課件(二)生態(tài)學(xué)參數(shù)及培養(yǎng)基
的組成原則1、加入培養(yǎng)基中的天然提3、所有分離培養(yǎng)基中都應(yīng)含有抗真菌劑(如放線菌酮和制霉素),摻加濃度一般為50μg/m1,以抑制真菌的生長(zhǎng)。4、瓊脂平板在使用前應(yīng)置于37℃培養(yǎng)箱中孵育l、2天。5、培養(yǎng)基的生物物理學(xué)參數(shù),如pH及鹽分也應(yīng)調(diào)節(jié)到與試樣的生態(tài)系統(tǒng)參數(shù)值相近。30PPT課件3、所有分離培養(yǎng)基中都應(yīng)含有抗真菌劑(如放線菌酮和制霉素),二、分離目的微生物不純,需分離純化。采用簡(jiǎn)便迅速,有一定準(zhǔn)確性的檢出方法,提高篩選效率。常用平皿反應(yīng)法:紙片培養(yǎng)顯色法:浸有指示劑濾紙。透明圈法:混濁底物被分解后形成透明圈。如可溶性淀粉、碳酸鈣等。
變色圈法:直接用顯色劑或指示劑。
生長(zhǎng)圈法:利用某些具有特殊營(yíng)養(yǎng)要求的微生物作為工具菌,要分離的微生物能在一般培養(yǎng)條件下生長(zhǎng)而合成該營(yíng)養(yǎng)物而使工具菌能生長(zhǎng),形成生長(zhǎng)圈。
抑制圈法:瓊脂塊培養(yǎng)法。31PPT課件二、分離目的微生物不純,需分離純化。采用簡(jiǎn)便迅速,有一定準(zhǔn)確用剛果紅染色法鑒定篩選降解纖維素的菌株
羧甲基纖維素鈉作培養(yǎng)物抗生素篩選檢定菌培養(yǎng),加上發(fā)酵液32PPT課件用剛果紅染色法鑒定篩選降解纖維素的菌株羧甲基纖維素鈉作培養(yǎng)五、放線菌的分離培養(yǎng)基的組成原則大多數(shù)放線菌的分離培養(yǎng)是在貧脊或復(fù)雜底物的瓊脂平板上進(jìn)行的。除嗜溫性放線菌外,其他放線菌一般在培養(yǎng)4-20天內(nèi)在分離平板上緩慢形成菌落。在放線菌分離瓊脂中通常都加入抗真菌劑制霉菌素或放線菌酮,以抑制真菌的繁殖。選擇性地添加抗生素。分離瓊脂平板制備好后,一般皆應(yīng)在37℃培養(yǎng)箱中存放3天。33PPT課件五、放線菌的分離培養(yǎng)基的組成原則大多數(shù)放線菌的分離培養(yǎng)是在貧放線菌的分離土樣中放線菌的非選擇性分離:土樣風(fēng)干,磨碎,無菌海綿壓印土樣后壓印平板后培養(yǎng)。植物體上放線菌的分離:無菌取植物組織,干燥以減少細(xì)菌數(shù)量,剪碎植物材料后植入平板表層后培養(yǎng)。也可洗下微生物后振蕩培養(yǎng)。水中放線菌的分離:為使所要分離的放線菌的數(shù)量種類增多,一般將水樣離心或?yàn)V紙過濾,取離心沉積或?yàn)V紙表面沉積進(jìn)行系列稀釋和涂布。34PPT課件放線菌的分離土樣中放線菌的非選擇性分離:土樣風(fēng)干,磨碎,無菌次代培養(yǎng)及純化菌落形成后可根據(jù)肉眼可見的菌落形態(tài)上的差異,作初步的鑒定和區(qū)分。通過高倍放大進(jìn)行鏡檢,可了解氣生和營(yíng)養(yǎng)孢子形成情況。成功地分離出各種不同的放線菌屬及種的關(guān)鍵是所采集樣本的本身及其分離用的瓊脂培養(yǎng)基;而肉眼識(shí)別不同的生長(zhǎng)形態(tài)、從而初步地加以鑒定,在分離放線菌時(shí)顯得尤為重要。將分離平板上所形成的菌落用經(jīng)火焰灼燒滅菌的鉤形針或無菌牙簽挑取,點(diǎn)接到瓊脂平板上進(jìn)行影印培養(yǎng),以進(jìn)一步篩選和分離。35PPT課件次代培養(yǎng)及純化菌落形成后可根據(jù)肉眼可見的菌落形態(tài)上的差異,作放線菌菌落形態(tài)36PPT課件放線菌菌落形態(tài)36PPT課件六、真菌分離1、利用低碳/氮比的培養(yǎng)基可使真菌生長(zhǎng)菌落分散,利于計(jì)數(shù),分離和鑒定。這里主要是利用營(yíng)養(yǎng)成分的減少而使生長(zhǎng)減慢,并由此限制真菌的遷徙生長(zhǎng)。2、改變培養(yǎng)溫度將有利于不同嗜溫區(qū)真菌的分離。3、有時(shí),真菌子實(shí)體形成必須有光線,這在分離培養(yǎng)時(shí)應(yīng)加以考慮。37PPT課件六、真菌分離1、利用低碳/氮比的培養(yǎng)基可使真菌生長(zhǎng)菌落分散,4、選擇性富集:是通過一定的方式使樣本中一種或一群微生物數(shù)量上的增加而利于分離的一種技術(shù)。富集可以是種水平的,如通過營(yíng)養(yǎng)要求的改變來富集分離鐮刀菌;也可以是組成群水平的,如以纖維素為唯一碳源的選擇性培養(yǎng)基可選擇性富集所有能降解纖維素的纖維素裂解微生物。5、在分離培養(yǎng)基中加入一定的抗生素即可有效地抑制細(xì)菌生長(zhǎng)及菌落形成。38PPT課件4、選擇性富集:是通過一定的方式使樣本中一種或一群微生物數(shù)量真菌的分離方法土中真菌的分離:稀釋法,混入法,壓貼法,粘附法,浮選法,注射器采集法,土過篩法,庶糖密度梯度離心法。植物材料中真菌的分離:植入法,壓貼法,洗滌法,浸泡法。水中真菌的分離:水樣稀釋后涂布分離。餌誘技術(shù)常用于水中真菌的富集。子實(shí)體直接分離培養(yǎng)擔(dān)子菌:新采集的子實(shí)體組織植入平板內(nèi)或在放于液體培養(yǎng)基表面放一小塊無菌濾紙上培養(yǎng)。39PPT課件真菌的分離方法土中真菌的分離:稀釋法,混入法,壓貼法,粘附法微生物菌種分離實(shí)例分解纖維素的微生物的分離實(shí)驗(yàn)?zāi)康膹耐寥乐蟹蛛x能分解纖維素的微生物,純化得到1-5株菌.并通過此次實(shí)驗(yàn),培養(yǎng)以下三方面的能力:1.基本技術(shù)訓(xùn)練:在目前專業(yè)課程學(xué)習(xí)基礎(chǔ)上進(jìn)一步練習(xí)培養(yǎng)基的配制,干濕熱滅菌,以及微生物分離純化技術(shù)。2.初步的科研訓(xùn)練:練習(xí)科研過程中查閱資料、設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)方案、動(dòng)手實(shí)施方案、綜合安排實(shí)驗(yàn)、解決臨時(shí)實(shí)際困難等方面的基本能力,認(rèn)識(shí)科研程序,感受科研樂趣和困難。3.培養(yǎng)實(shí)事求是的工作作風(fēng),科學(xué)嚴(yán)謹(jǐn)?shù)墓ぷ鲬B(tài)度。40PPT課件微生物菌種分離實(shí)例分解纖維素的微生物的分離40PPT課件實(shí)驗(yàn)原理纖維素與纖維素酶纖維素酶是一種復(fù)合酶,一般認(rèn)為至少包含三部分,C1,Cx,和葡萄糖苷酶組成。前兩種使纖維素分解成纖維二糖,第三種將纖維二糖分解成葡萄糖,正是在這三種酶的協(xié)同作用下,纖維素最終被分解成葡萄糖,為微生物的生長(zhǎng)提供營(yíng)養(yǎng)。
41PPT課件實(shí)驗(yàn)原理41PPT課件纖維素分解菌的篩選
纖維素-剛果紅混合培養(yǎng)基42PPT課件纖維素分解菌的篩選42PPT課件剛果紅染色法常用的剛果紅染色法有兩種:一是先培養(yǎng)微生物,再加入剛果紅進(jìn)行顏色反應(yīng),二是倒平板時(shí)就加剛果紅。方法一是傳統(tǒng)的方法,缺點(diǎn)是操作繁瑣,加入剛果紅溶液會(huì)使菌落之間發(fā)生混雜;其優(yōu)點(diǎn)是這樣顯示出的顏色反應(yīng)基本上是纖維素分解菌的作用。方法二的優(yōu)點(diǎn)是操作簡(jiǎn)便,不存在菌落混雜問題,缺點(diǎn)是由于實(shí)驗(yàn)材料和瓊脂都含有淀粉類物質(zhì),可以使能夠產(chǎn)生淀粉酶的微生物出現(xiàn)假陽性反應(yīng)。但這種只產(chǎn)生淀粉酶的微生物產(chǎn)生的透明圈較為模糊,無明顯影響.方法二的另一缺點(diǎn)是:有些微生物具有降解色素的能力,它們?cè)陂L(zhǎng)時(shí)間培養(yǎng)過程中會(huì)降解剛果紅形成明顯的透明圈,與纖維素分解菌不易區(qū)分。短時(shí)間培養(yǎng)也無大礙。43PPT課件剛果紅染色法43PPT課件1.實(shí)驗(yàn)材料及方法
1.1樣品:從校園找到的竹子下的土壤、松樹下的土壤、混合土;熊貓糞;牛糞。1.2實(shí)驗(yàn)所用的器材:培養(yǎng)皿,250mL錐形瓶,無菌稱量瓶,濾紙,藥匙、1mL和10mL的移液管、電子秤、無菌培養(yǎng)皿、涂布器、解剖鏡、顯微鏡、接種針、溫箱等44PPT課件1.實(shí)驗(yàn)材料及方法
44PPT課件1.3實(shí)驗(yàn)用培養(yǎng)基配方及配制注意事項(xiàng)1.3.1、選擇培養(yǎng)基:纖維素分解細(xì)菌--赫奇遜培養(yǎng)基:CMC,KH2PO41.0g、MgSO4·7H2O0.3g、NaCl0.1g、FeCl30.01g、NaNO32.5g、水1000mL、pH7.2~7.4、瓊脂20g、剛果紅.纖維素分解放線菌培養(yǎng)基:CMC、KNO31.00g、KH2PO40.50g、MgSO4·7H2O0.50g、NaCl0.50g、10%FeSO42滴、H2O1000mL、pH7.2~7.4、瓊脂20g、剛果紅.45PPT課件1.3實(shí)驗(yàn)用培養(yǎng)基配方及配制注意事項(xiàng)45PPT課件纖維素分解真菌培養(yǎng)基:CMC、馬鈴薯200gKH2PO43.00g、MgSO4·7H2O1.50g、蛋白胨0.50g、VB12丸、瓊脂20.00g、H2O1000mL、pH6.0~6.5、瓊脂20g。纖維素分解菌(混合)的選擇培養(yǎng)基:
纖維素粉5g、NaNO31g、Na2HPO31.2g、KH2PO30.9g、MgSO40.5g、KCl0.5g、酵母膏0.5g、水解酪素0.5g、以上物質(zhì)溶解后蒸餾水定容到1000ml
1.3.2、鑒別及純化培養(yǎng)基(半固體)鑒別培養(yǎng)基的成分:(NH4)2SO42g,MgSO40.5g,K2HPO41g,NaCl0.5g,剛果紅0.4g,水1000mL,瓊脂5g、自然pH值、剛果紅、濾紙片(去淀粉)。注:需無菌操作,配制時(shí)先配含無機(jī)鹽的半固體培養(yǎng)基,滅菌倒平板后,平鋪入用剛果紅染色的無菌去淀粉濾紙片。46PPT課件纖維素分解真菌培養(yǎng)基:46PPT課件1.4實(shí)驗(yàn)方法與步驟:取樣→菌懸液的制備→將菌懸液涂布到有選擇與鑒定作用的培養(yǎng)基(含剛果紅)上→挑選單菌落純培養(yǎng)→對(duì)純培養(yǎng)物制片鏡檢(有條件的話查出菌的種屬類別)→將純培養(yǎng)接種到無菌試管內(nèi)保藏。47PPT課件1.4實(shí)驗(yàn)方法與步驟:47PPT課件1.4.1土樣采集土樣的采集選擇富含纖維素的環(huán)境,這是因?yàn)樵诶w維素含量豐富的環(huán)境,通常會(huì)聚集較多的分解纖維素的微生物。本實(shí)驗(yàn)以在濕潤(rùn)的松針堆積層下、腐爛的草下、多種混合葉腐爛堆下的土壤,熊貓糞和牛糞為樣本。48PPT課件1.4.1土樣采集48PPT課件1.4.2選擇培養(yǎng)配制細(xì)菌培養(yǎng)基、放線菌培養(yǎng)基、真菌培養(yǎng)基、混合培養(yǎng)基(不需無菌操作)四種不同成分的培養(yǎng)基,前三種分別用來選擇培養(yǎng)能分解纖維素的細(xì)菌、放線菌、霉菌,第四種培養(yǎng)基選擇所有可分解纖維素的微生物.分別把五種樣本接種到四種培養(yǎng)基上,且每種培養(yǎng)基均設(shè)空白對(duì)照,即不接種任何樣本做對(duì)照實(shí)驗(yàn)。49PPT課件1.4.2選擇培養(yǎng)49PPT課件1.4.3分離純化在選擇培養(yǎng)基上選擇水解圈大的不同菌種,分別接種到鑒別及純化培養(yǎng)基(須無菌操作)上,待其生長(zhǎng)。觀察菌落情況和濾紙被分解的情況。將純培養(yǎng)接種到無菌試管斜面上保藏.50PPT課件1.4.3分離純化50PPT課件第六章微生物菌種的分離篩選第一節(jié)菌種分離的總體設(shè)計(jì)第二節(jié)分離樣本的采樣第三節(jié)含微生物樣品的富集培養(yǎng)第四節(jié)微生物的培養(yǎng)分離51PPT課件第六章微生物菌種的分離篩選第一節(jié)菌種分離的總體設(shè)計(jì)1P第一節(jié)菌種的分離簡(jiǎn)介
一、菌種的來源根據(jù)資料直接向有科研單位、高等院校、工廠或菌種保藏部門索取或購買;從大自然中分離篩選新的微生物菌種。52PPT課件第一節(jié)菌種的分離簡(jiǎn)介一、菌種的來源2PPT課件二、分離思路
新菌種的分離是要從混雜的各類微生物中依照生產(chǎn)的要求、菌種的特性,采用各種篩選方法,快速、準(zhǔn)確地把所需要的菌種挑選出來。實(shí)驗(yàn)室或生產(chǎn)用菌種若不慎污染了雜菌,也必須重新進(jìn)行分離純化。有了優(yōu)良的菌種,還要有合適的工藝條件和合理先進(jìn)的設(shè)備與之配合。53PPT課件二、分離思路新菌種的分離是要從混雜的各類微生物中依照生產(chǎn)的定方案:首先要查閱資料,了解所需菌種的生長(zhǎng)培養(yǎng)特性。采樣:有針對(duì)性地采集樣品。增殖:人為地通過控制養(yǎng)分或培養(yǎng)條件,使所需菌種增殖培養(yǎng)后,在數(shù)量上占優(yōu)勢(shì)。分離:利用分離技術(shù)得到純種。發(fā)酵性能測(cè)定:進(jìn)行生產(chǎn)性能測(cè)定。這些特性包括形態(tài)、培養(yǎng)特征、營(yíng)養(yǎng)要求、生理生化特性、發(fā)酵周期、產(chǎn)品品種和產(chǎn)量、耐受最高溫度、生長(zhǎng)和發(fā)酵最適溫度、最適pH值、提取工藝等。三、新種分離與篩選的步驟54PPT課件定方案:首先要查閱資料,了解所需菌種的生長(zhǎng)培養(yǎng)特性。三、新種菌種篩選主要步驟調(diào)查研究及查閱充分的資料
↓
設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)方案
↓確定采集樣品的生態(tài)環(huán)境
采樣
↓確定特定的增殖條件
增殖培養(yǎng)
↓確定特殊的選擇培養(yǎng)基及可能的
↓定性或半定量快速檢出法
平板分離
↓
55PPT課件菌種篩選主要步驟調(diào)查研究及查閱充分的資料
↓原種斜面
↓確定發(fā)酵培養(yǎng)基礎(chǔ)條件
篩選
↓
初篩(1株1瓶)
↓
復(fù)篩(1株3~5瓶)
↓結(jié)合初步工藝條件摸索
再復(fù)篩(1株3~5瓶)
↓
3~5株
↓
單株純種分離
↓生產(chǎn)性能試驗(yàn)
↓→毒性試驗(yàn)
菌種鑒定56PPT課件原種斜面
↓確定發(fā)酵培養(yǎng)基礎(chǔ)條件
篩選
第二節(jié)分離樣本的采樣1、采樣對(duì)象以采集土壤為主。一般園田土和耕作過的沼澤土中,以細(xì)菌和放線菌為主;富含碳水化合物的土壤和沼澤地中,酵母和霉菌較多,如一些野果生長(zhǎng)區(qū)和果園內(nèi)。采樣的對(duì)象也可以是植物,腐敗物品,某些水域等。57PPT課件第二節(jié)分離樣本的采樣1、采樣對(duì)象7PPT課件從自然界篩選58PPT課件從自然界篩選8PPT課件2、采樣季節(jié):以溫度適中,雨量不多的秋初為好。3、采土方式:在選好適當(dāng)?shù)攸c(diǎn)后,用小鏟子除去表土,取離地面5-15cm處的土約10g,盛入清潔的牛皮紙袋或塑料袋中,扎好,標(biāo)記,記錄采樣時(shí)間、地點(diǎn)、環(huán)境條件等,以備查考。為了使土樣中微生物的數(shù)量和類型盡少變化,宜將樣品逐步分批寄回,以便及時(shí)分離。59PPT課件2、采樣季節(jié):以溫度適中,雨量不多的秋初為好。9PPT課件二根據(jù)微生物生理特點(diǎn)采樣1、根據(jù)微生物營(yíng)養(yǎng)類型2、根據(jù)微生物生理特性60PPT課件二根據(jù)微生物生理特點(diǎn)采樣10PPT課件三特殊環(huán)境下采樣61PPT課件三特殊環(huán)境下采樣11PPT課件第三節(jié)含微生物樣品的富集培養(yǎng)
為了容易分離到所需的菌種,讓無關(guān)的微生物至少是在數(shù)量上不要增加,可以通過配制選擇性培養(yǎng)基,選擇一定的培養(yǎng)條件來控制。一、控制培養(yǎng)基的成分例如碳源利用的控制,可選定糖,淀粉、纖維素,或者石油等,以其中的一種為唯一碳源,那么只有利用這一碳源的微生物才能大量正常生長(zhǎng),而其它微生物就可能死亡或淘汰。這樣對(duì)下階段的純種分離就會(huì)順利得多。62PPT課件第三節(jié)含微生物樣品的富集培養(yǎng)為了容易分離到所需的菌二、控制培養(yǎng)條件pH值的控制細(xì)菌、放線菌:pH7.0~7.5酵母菌、真菌:pH6.5~7.0溫度的控制通氣量的控制63PPT課件二、控制培養(yǎng)條件13PPT課件三抑制不需要的菌類如使用不同類型的抗生素、高溫、高壓等條件,抑制不需要的菌類。64PPT課件三抑制不需要的菌類14PPT課件第四節(jié)微生物的培養(yǎng)分離
盡管通過增殖培養(yǎng)效果顯著,但還是處于微生物的混雜生長(zhǎng)狀態(tài)。因此還必須分離,純化。在這—步,增殖培養(yǎng)的選擇性控制條件還應(yīng)進(jìn)一步應(yīng)用,而且控制得細(xì)一點(diǎn),好一點(diǎn)。純種分離的方法有劃線分離法、稀釋分離法。65PPT課件第四節(jié)微生物的培養(yǎng)分離盡管通過增殖培養(yǎng)效果顯著,但還1.稀釋平皿分離法1.稀釋平皿分離法100ml1g9ml9ml9ml9ml9ml9ml1/1001/100010-810-710-610-510-41ml1ml1ml1ml1ml(1)稀釋66PPT課件1.稀釋平皿分離法1.稀釋平皿分離法100ml1g9ml9m1.稀釋平皿分離法b.涂布平皿分離法a.傾注平皿分離法67PPT課件1.稀釋平皿分離法b.涂布平皿分離法a.傾注平皿分離法17P2.平皿劃線分離法
a.連續(xù)劃線分離法b.分區(qū)劃線分離法68PPT課件2.平皿劃線分離法18PPT課件(四)篩選
這一步是采用與生產(chǎn)相近的培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件,通過三角瓶的容量進(jìn)行小型發(fā)酵試驗(yàn),以求得適合于工業(yè)生產(chǎn)用菌種。69PPT課件(四)篩選這一步是采用與生產(chǎn)相近的培養(yǎng)基和培(五)毒性試驗(yàn)
自然界的一些微生物是在一定條件下產(chǎn)毒的,將其作為生產(chǎn)菌種應(yīng)當(dāng)十分當(dāng)心,尤其與食品工業(yè)有關(guān)的菌種,更應(yīng)慎重。據(jù)有的國(guó)家規(guī)定,微生物中除啤酒酵母、脆壁酵母、黑曲霉、米曲霉和枯草桿菌作為食用無須作毒性試驗(yàn)外,其他微生物作為食用,均需通過兩年以上的毒性試驗(yàn)。70PPT課件(五)毒性試驗(yàn)自然界的一些微生物是在一定條件下產(chǎn)毒培養(yǎng)分離
從自然界中分離培養(yǎng)微生物是菌種選育的重要和基礎(chǔ)的步驟。到目前為止,還沒有一種分離培養(yǎng)方法能揭示一個(gè)試樣中所包含的所有微生物總數(shù)和種類。在任一試樣中所存在的微生物僅為極少數(shù)特定種類的菌株;在工業(yè)微生物篩選過程中,應(yīng)及時(shí)調(diào)整檢測(cè)方法,以與各種不同類型的生長(zhǎng)和代謝之微生物相適應(yīng)。因此,建立一更為科學(xué)的和針對(duì)性不強(qiáng)的分離方法是必要的。71PPT課件培養(yǎng)分離從自然界中分離培養(yǎng)微生物是菌種選育的重要和基礎(chǔ)一、成功的分離培養(yǎng)方法(1)認(rèn)真考察所需產(chǎn)品的特征和生產(chǎn)過程;(2)制訂初步的篩選標(biāo)準(zhǔn);(3)將生態(tài)學(xué)方法運(yùn)用到分離和篩選過程。72PPT課件一、成功的分離培養(yǎng)方法(1)認(rèn)真考察所需產(chǎn)品的特征和生產(chǎn)過程三、將生態(tài)學(xué)方法用于培養(yǎng)分離的一般思路要點(diǎn)1.羅列出所要分離的微生物類群;2.根據(jù)所采集樣本的各種生態(tài)參數(shù),描述所要分離的微生物之生態(tài)系統(tǒng)或棲息地:3.將若干樣本分成若干類型,如植物和植物各部,土壤(類型和土層)、巖石、水、昆蟲和發(fā)酵食品等;4.羅列出所要考察和測(cè)量的環(huán)境參數(shù),如pH、鹽分、水分、氧化還原電勢(shì)及溫度等;73PPT課件三、將生態(tài)學(xué)方法用于培養(yǎng)分離的一般思路要點(diǎn)1.羅列出所要分離5.列出生物系統(tǒng)中有用的自然底物,如森林土壤中的幾丁質(zhì)、葡萄表皮的果膠;
6.根據(jù)上述1-5項(xiàng)中所獲得的數(shù)據(jù),設(shè)計(jì)分離方法,即選擇適宜的稀釋液、底物、試樣、天然浸出汁和培養(yǎng)條件;
7.用標(biāo)準(zhǔn)方法作對(duì)照來評(píng)價(jià)生態(tài)學(xué)分離方法;
8.根據(jù)待檢材料的生態(tài)參數(shù)需要,修改已知的方法;
9.運(yùn)用特定的富集方法,富集那些可能具有篩選意義的微生物類群。74PPT課件5.列出生物系統(tǒng)中有用的自然底物,如森林土壤中的幾丁四、自然界中細(xì)菌的分離75PPT課件四、自然界中細(xì)菌的分離25PPT課件
(一)采樣和采集方法為了從一特定生態(tài)系統(tǒng)中分離出具有代表性的細(xì)菌菌群,特別是分離那些在唯一微環(huán)境區(qū)域中出現(xiàn)的菌群時(shí),必須十分重視樣本的采集。樣本采集時(shí)所需的工具通常有無菌刮鏟、土樣采集器、鑷子、解剖刀、手套、無菌小塑料袋和塑料瓶等。76PPT課件(一)采樣和采集方法為了從一特定生態(tài)系統(tǒng)中分離出具有代表性采樣的注意事項(xiàng)1、采樣時(shí)應(yīng)盡可能保持相對(duì)無菌;2、所采集的樣本必須具有某種代表性;3、采好的樣必須完整地標(biāo)上樣本的種類及采集日期、地點(diǎn)以及采集地點(diǎn)的地理、生態(tài)參數(shù)等;4、應(yīng)充分考慮采樣的季節(jié)性和時(shí)間因素,因?yàn)檎嬲脑鼐旱某霈F(xiàn)可能是短暫的;77PPT課件采樣的注意事項(xiàng)1、采樣時(shí)應(yīng)盡可能保持相對(duì)無菌;27PPT課件5、采好的樣應(yīng)及時(shí)處理,暫不能處理的也應(yīng)貯存于4℃下,但貯存時(shí)間不宜過長(zhǎng)。這是因?yàn)橐坏┎蓸咏Y(jié)束,試樣中的微生物群體就脫離了原來的生態(tài)環(huán)境,其內(nèi)部生態(tài)環(huán)境就會(huì)發(fā)生變化,微生物群體之間就會(huì)出現(xiàn)消長(zhǎng)78PPT課件5、采好的樣應(yīng)及時(shí)處理,暫不能處理的也應(yīng)貯存于4℃下,但貯存(二)生態(tài)學(xué)參數(shù)及培養(yǎng)基
的組成原則1、加入培養(yǎng)基中的天然提取物種類和用量、環(huán)境生物物理學(xué)參數(shù)以及用于平板涂布分離樣本的溶劑都會(huì)影響實(shí)驗(yàn)中所要分離的細(xì)菌的數(shù)量和種類。2、就分離培養(yǎng)基的組成而言,部分培養(yǎng)基中必須含有10-50%的天然提取物。加入培養(yǎng)基中的天然提取物,部分培養(yǎng)基中則應(yīng)含有多種碳、氮源,如幾丁質(zhì)、纖維素或果膠。79PPT課件(二)生態(tài)學(xué)參數(shù)及培養(yǎng)基
的組成原則1、加入培養(yǎng)基中的天然提3、所有分離培養(yǎng)基中都應(yīng)含有抗真菌劑(如放線菌酮和制霉素),摻加濃度一般為50μg/m1,以抑制真菌的生長(zhǎng)。4、瓊脂平板在使用前應(yīng)置于37℃培養(yǎng)箱中孵育l、2天。5、培養(yǎng)基的生物物理學(xué)參數(shù),如pH及鹽分也應(yīng)調(diào)節(jié)到與試樣的生態(tài)系統(tǒng)參數(shù)值相近。80PPT課件3、所有分離培養(yǎng)基中都應(yīng)含有抗真菌劑(如放線菌酮和制霉素),二、分離目的微生物不純,需分離純化。采用簡(jiǎn)便迅速,有一定準(zhǔn)確性的檢出方法,提高篩選效率。常用平皿反應(yīng)法:紙片培養(yǎng)顯色法:浸有指示劑濾紙。透明圈法:混濁底物被分解后形成透明圈。如可溶性淀粉、碳酸鈣等。
變色圈法:直接用顯色劑或指示劑。
生長(zhǎng)圈法:利用某些具有特殊營(yíng)養(yǎng)要求的微生物作為工具菌,要分離的微生物能在一般培養(yǎng)條件下生長(zhǎng)而合成該營(yíng)養(yǎng)物而使工具菌能生長(zhǎng),形成生長(zhǎng)圈。
抑制圈法:瓊脂塊培養(yǎng)法。81PPT課件二、分離目的微生物不純,需分離純化。采用簡(jiǎn)便迅速,有一定準(zhǔn)確用剛果紅染色法鑒定篩選降解纖維素的菌株
羧甲基纖維素鈉作培養(yǎng)物抗生素篩選檢定菌培養(yǎng),加上發(fā)酵液82PPT課件用剛果紅染色法鑒定篩選降解纖維素的菌株羧甲基纖維素鈉作培養(yǎng)五、放線菌的分離培養(yǎng)基的組成原則大多數(shù)放線菌的分離培養(yǎng)是在貧脊或復(fù)雜底物的瓊脂平板上進(jìn)行的。除嗜溫性放線菌外,其他放線菌一般在培養(yǎng)4-20天內(nèi)在分離平板上緩慢形成菌落。在放線菌分離瓊脂中通常都加入抗真菌劑制霉菌素或放線菌酮,以抑制真菌的繁殖。選擇性地添加抗生素。分離瓊脂平板制備好后,一般皆應(yīng)在37℃培養(yǎng)箱中存放3天。83PPT課件五、放線菌的分離培養(yǎng)基的組成原則大多數(shù)放線菌的分離培養(yǎng)是在貧放線菌的分離土樣中放線菌的非選擇性分離:土樣風(fēng)干,磨碎,無菌海綿壓印土樣后壓印平板后培養(yǎng)。植物體上放線菌的分離:無菌取植物組織,干燥以減少細(xì)菌數(shù)量,剪碎植物材料后植入平板表層后培養(yǎng)。也可洗下微生物后振蕩培養(yǎng)。水中放線菌的分離:為使所要分離的放線菌的數(shù)量種類增多,一般將水樣離心或?yàn)V紙過濾,取離心沉積或?yàn)V紙表面沉積進(jìn)行系列稀釋和涂布。84PPT課件放線菌的分離土樣中放線菌的非選擇性分離:土樣風(fēng)干,磨碎,無菌次代培養(yǎng)及純化菌落形成后可根據(jù)肉眼可見的菌落形態(tài)上的差異,作初步的鑒定和區(qū)分。通過高倍放大進(jìn)行鏡檢,可了解氣生和營(yíng)養(yǎng)孢子形成情況。成功地分離出各種不同的放線菌屬及種的關(guān)鍵是所采集樣本的本身及其分離用的瓊脂培養(yǎng)基;而肉眼識(shí)別不同的生長(zhǎng)形態(tài)、從而初步地加以鑒定,在分離放線菌時(shí)顯得尤為重要。將分離平板上所形成的菌落用經(jīng)火焰灼燒滅菌的鉤形針或無菌牙簽挑取,點(diǎn)接到瓊脂平板上進(jìn)行影印培養(yǎng),以進(jìn)一步篩選和分離。85PPT課件次代培養(yǎng)及純化菌落形成后可根據(jù)肉眼可見的菌落形態(tài)上的差異,作放線菌菌落形態(tài)86PPT課件放線菌菌落形態(tài)36PPT課件六、真菌分離1、利用低碳/氮比的培養(yǎng)基可使真菌生長(zhǎng)菌落分散,利于計(jì)數(shù),分離和鑒定。這里主要是利用營(yíng)養(yǎng)成分的減少而使生長(zhǎng)減慢,并由此限制真菌的遷徙生長(zhǎng)。2、改變培養(yǎng)溫度將有利于不同嗜溫區(qū)真菌的分離。3、有時(shí),真菌子實(shí)體形成必須有光線,這在分離培養(yǎng)時(shí)應(yīng)加以考慮。87PPT課件六、真菌分離1、利用低碳/氮比的培養(yǎng)基可使真菌生長(zhǎng)菌落分散,4、選擇性富集:是通過一定的方式使樣本中一種或一群微生物數(shù)量上的增加而利于分離的一種技術(shù)。富集可以是種水平的,如通過營(yíng)養(yǎng)要求的改變來富集分離鐮刀菌;也可以是組成群水平的,如以纖維素為唯一碳源的選擇性培養(yǎng)基可選擇性富集所有能降解纖維素的纖維素裂解微生物。5、在分離培養(yǎng)基中加入一定的抗生素即可有效地抑制細(xì)菌生長(zhǎng)及菌落形成。88PPT課件4、選擇性富集:是通過一定的方式使樣本中一種或一群微生物數(shù)量真菌的分離方法土中真菌的分離:稀釋法,混入法,壓貼法,粘附法,浮選法,注射器采集法,土過篩法,庶糖密度梯度離心法。植物材料中真菌的分離:植入法,壓貼法,洗滌法,浸泡法。水中真菌的分離:水樣稀釋后涂布分離。餌誘技術(shù)常用于水中真菌的富集。子實(shí)體直接分離培養(yǎng)擔(dān)子菌:新采集的子實(shí)體組織植入平板內(nèi)或在放于液體培養(yǎng)基表面放一小塊無菌濾紙上培養(yǎng)。89PPT課件真菌的分離方法土中真菌的分離:稀釋法,混入法,壓貼法,粘附法微生物菌種分離實(shí)例分解纖維素的微生物的分離實(shí)驗(yàn)?zāi)康膹耐寥乐蟹蛛x能分解纖維素的微生物,純化得到1-5株菌.并通過此次實(shí)驗(yàn),培養(yǎng)以下三方面的能力:1.基本技術(shù)訓(xùn)練:在目前專業(yè)課程學(xué)習(xí)基礎(chǔ)上進(jìn)一步練習(xí)培養(yǎng)基的配制,干濕熱滅菌,以及微生物分離純化技術(shù)。2.初步的科研訓(xùn)練:練習(xí)科研過程中查閱資料、設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)方案、動(dòng)手實(shí)施方案、綜合安排實(shí)驗(yàn)、解決臨時(shí)實(shí)際困難等方面的基本能力,認(rèn)識(shí)科研程序,感受科研樂趣和困難。3.培養(yǎng)實(shí)事求是的工作作風(fēng),科學(xué)嚴(yán)謹(jǐn)?shù)墓ぷ鲬B(tài)度。90PPT課件微生物菌種分離實(shí)例分解纖維素的微生物的分離40PPT課件實(shí)驗(yàn)原理纖維素與纖維素酶纖維素酶是一種復(fù)合酶,一般認(rèn)為至少包含三部分,C1,Cx,和葡萄糖苷酶組成。前兩種使纖維素分解成纖維二糖,第三種將纖維二糖分解成葡萄糖,正是在這三種酶的協(xié)同作用下,纖維素最終被分解成葡萄糖,為微生物的生長(zhǎng)提供營(yíng)養(yǎng)。
91PPT課件實(shí)驗(yàn)原理41PPT課件纖維素分解菌的篩選
纖維素-剛果紅混合培養(yǎng)基92PPT課件纖維素分解菌的篩選42PPT課件剛果紅染色法常用的剛果紅染色法有兩種:一是先培養(yǎng)微生物,再加入剛果紅進(jìn)行顏色反應(yīng),二是倒平板時(shí)就加剛果紅。方法一是傳統(tǒng)的方法,缺點(diǎn)是操作繁瑣,加入剛果紅溶液會(huì)使菌落之間發(fā)生混雜;其優(yōu)點(diǎn)是這樣顯示出的顏色反應(yīng)基本上是纖維素分解菌的作用。方法二的優(yōu)點(diǎn)是操作簡(jiǎn)便,不存在菌落混雜問題,缺點(diǎn)是由于實(shí)驗(yàn)材料和瓊脂都含有淀粉類物質(zhì),可以使能夠產(chǎn)生淀粉酶的微生物出現(xiàn)假陽性反應(yīng)。但這種只產(chǎn)生淀粉酶的微生物產(chǎn)生的透明圈較為模糊,無明顯影響.方法二的另一缺點(diǎn)是:有些微生物具有降解色素的能力,它們
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