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文檔簡介

多聚核苷酸與核酸第一頁,共一百二十頁,2022年,8月28日核酸的分類及分布存在于細胞核和線粒體分布于細胞核、細胞質、線粒體(deoxyribonucleicacid,DNA)(ribonucleicacid,RNA)脫氧核糖核酸

核糖核酸攜帶遺傳信息,并通過復制傳遞給下一代。是DNA轉錄的產物,參與遺傳信息的復制與表達。某些病毒RNA也可作為遺傳信息的載體第二頁,共一百二十頁,2022年,8月28日1953年:Watson和Crick提出DNA雙螺旋結構模型(1962年獲諾貝爾獎),分子生物學時期的標志。

第三頁,共一百二十頁,2022年,8月28日多聚核苷酸(Polynucleotides)

多聚核苷酸是核苷酸通過3,5-磷酸二酯鍵連接的聚合物,是核酸分子中的基本形式。第四頁,共一百二十頁,2022年,8月28日核酸分子結構與功能一、核酸的分子結構與功能

核聚苷酸分子結構

DNA分子結構

RNA分子結構二、核酸的理化性質與研究技術第五頁,共一百二十頁,2022年,8月28日第一節(jié)多聚核苷酸Polynucleotides第六頁,共一百二十頁,2022年,8月28日5′端3′端CGA3,5-磷酸二酯鍵多聚核苷酸鏈方向性

一、多聚核苷酸的結構

核苷酸的多聚物5末端:磷酸3末端:羥基鏈延長:5→3第七頁,共一百二十頁,2022年,8月28日

核酸的一級結構:

核酸中核苷酸的排列順序核苷酸間的差異主要是堿基不同,也稱為堿基排列順序。即堿基序列。第八頁,共一百二十頁,2022年,8月28日AGP5PTPGPCPTPOH3書寫方法5pApCpTpGpCpT-OH

35

ACTGCT

3目錄第九頁,共一百二十頁,2022年,8月28日核酸分子大小表示法:

單鏈DNA或RNA:堿基數目,base,kilobase.

雙鏈DNA或RNA:堿基對數目,basepair(bp)kilobasepair(kb)

小的核酸片段(<50bp),稱為寡核苷酸(nt)第十頁,共一百二十頁,2022年,8月28日二、多聚核苷酸細胞內合成:DNA:單鏈核酸為模板,DNA聚合酶催化。RNA:單鏈核酸為模板,RNA聚合酶催化。三、多聚核苷酸體外合成:1.PCR(DNA聚合酶鏈反應):

模板指導,DNA引物上進行的鏈延長。解鏈(升溫)→聚合(降溫)→鏈延長(恒溫)2.亞磷酸酰胺三酯方法:DNA自動合成儀不需模板、引物,合成寡核苷酸引物和探針3.體外轉錄體系:無細胞模仿體內轉錄,生成RNA

需要模板、RNA聚合酶。第十一頁,共一百二十頁,2022年,8月28日亞磷酰胺DMT:5’-OH保護劑,二甲氧基三笨甲基TCA第十二頁,共一百二十頁,2022年,8月28日第十三頁,共一百二十頁,2022年,8月28日第二節(jié)DNA的結構和功能TheThreeDimensionalStructureofDNA

第十四頁,共一百二十頁,2022年,8月28日DNA的空間結構又分為二級結構(secondarystructure)和高級結構。DNA的空間結構(spatialstructure)構成DNA的所有原子在三維空間具有確定的相對位置關系。第十五頁,共一百二十頁,2022年,8月28日一、DNA的二級結構是雙螺旋結構第十六頁,共一百二十頁,2022年,8月28日(一)Waston和Crick提出DNA雙螺旋結構模型

堿基組成分析[A]=

[T]、[G]

[C]

不同生物堿基組成不同

同生物、不同組織堿基組成相同目錄模型理論基礎:hargaff規(guī)則獲得了高質量的DNA分子的X射線衍射照片。第十七頁,共一百二十頁,2022年,8月28日DNA雙螺旋結構模型要點(Watson,Crick,1953)1.反向平行、右手螺旋的雙鏈結構:

兩條相互平行、走向相反的脫氧核苷酸鏈組成圍繞同一個螺旋軸形成右手螺旋

雙螺旋結構的直徑為2.37nm,螺距為3.54nm目錄3.54nm

第十八頁,共一百二十頁,2022年,8月28日

親水性的脫氧核糖-磷酸為骨架位于雙鏈的外側。疏水性的堿基位于雙鏈的內側。第十九頁,共一百二十頁,2022年,8月28日

堿基垂直螺旋軸與對側堿基形成氫鍵配對(互補配對形式:A=T;GC)。目錄2.DNA雙鏈之間形成了互補堿基對第二十頁,共一百二十頁,2022年,8月28日

堿基互補配對:胞嘧啶/鳥嘌呤

第二十一頁,共一百二十頁,2022年,8月28日堿基互補配對:胸腺嘧啶/腺嘌呤第二十二頁,共一百二十頁,2022年,8月28日第二十三頁,共一百二十頁,2022年,8月28日大溝與小溝第二十四頁,共一百二十頁,2022年,8月28日大溝與小溝第二十五頁,共一百二十頁,2022年,8月28日目錄橫向結構穩(wěn)定:互補堿基對的氫鍵維系DNA橫向結構的穩(wěn)定??v向結構穩(wěn)定:相鄰兩個堿基對互相重疊產生的疏水作用,稱為堿基堆積力(basestackinginteraction),維系DNA縱向結構的穩(wěn)定。3.疏水作用力和氫鍵共同維系著DNA雙螺旋結構的穩(wěn)定。第二十六頁,共一百二十頁,2022年,8月28日堿基堆積作用力第二十七頁,共一百二十頁,2022年,8月28日(二)DNA雙螺旋結構的多樣性第二十八頁,共一百二十頁,2022年,8月28日B型DNA:Watson和Crick,右手螺旋(1953年)A型DNA:Wilkins(1953年)Z型DNA:Rich等,左手螺旋,(1979年)第二十九頁,共一百二十頁,2022年,8月28日旋向螺距(nm)堿基數(每圈)螺旋直徑(nm)骨架走行存在條件A型右手2.53112.55平滑體外脫水B型右手3.5410.52.37平滑DNA生理條件Z型左手4.56121.84鋸齒型CG序列三種DNA構型的比較第三十頁,共一百二十頁,2022年,8月28日A型-DNAB型-DNAZ型-DNA螺旋旋向右手螺旋右手螺旋左手螺旋螺旋直徑2.55nm2.37nm1.84nm每一螺旋的堿基對數目1110.512螺距2.53nm3.54nm4.56nm相鄰堿基對之間的垂直距離0.23nm0.34nm0.38nm糖苷鍵構象反式反式嘧啶為反式,嘌呤為順式,反式和順式交替

相鄰堿基對之間的轉角3334.2每個二聚體為-60使構象穩(wěn)定的相對環(huán)境濕度

75%92%堿基對平面法線與主軸的夾角1919大溝窄深寬深相當平坦小溝寬淺窄深窄深不同構象DNA的結構參數第三十一頁,共一百二十頁,2022年,8月28日部分回折:5’-TGCGATACTCATCGCA-3’局部DNA形成發(fā)夾形結構(三)DNA局部特殊結構

第三十二頁,共一百二十頁,2022年,8月28日

局部DNA形成十字形結構5’-TGCGATACTCATCGCA-3’3’-ACGCTATGAGTAGCGT-5第三十三頁,共一百二十頁,2022年,8月28日(四)某些DNA具有更復雜的螺旋結構Hoogsteen堿基配對形成三股螺旋DNAT*A=TC*G=CH-DNA的結構第三十四頁,共一百二十頁,2022年,8月28日三鏈結構第三十五頁,共一百二十頁,2022年,8月28日鳥嘌呤之間通過Hoogsteen氫鍵形成特殊的四鏈結構(tetraplex)。四鏈結構2.4條多聚鳥嘌呤核苷酸鏈形成四螺旋DNA第三十六頁,共一百二十頁,2022年,8月28日真核生物DNA3-末端是富含GT的多次重復序列,因而自身形成了折疊的四鏈結構。第三十七頁,共一百二十頁,2022年,8月28日二、DNA的三級結構是超螺旋結構超螺旋結構(superhelix或supercoil)

DNA在雙螺旋基礎上通過扭曲、折疊形成的特定三級結構。即超螺旋結構。雙螺旋纏繞過分或不足產生的張力,使DNA分子發(fā)生扭曲,以抵消張力,這種扭曲稱為超螺旋結構。

(一)超螺旋結構具有不同的拓撲異構體第三十八頁,共一百二十頁,2022年,8月28日正超螺旋(positivesupercoil)雙螺旋纏繞過分產生的超螺旋,為左手超螺旋。負超螺旋(negativesupercoil)雙螺旋纏繞不足產生的超螺旋,為右手超螺旋。核酸拓撲同分異構體松弛態(tài)DNA(relaxedDNA)以能量最低狀態(tài)存在的雙螺旋DNA。

第三十九頁,共一百二十頁,2022年,8月28日環(huán)狀DNA的三種拓撲異構體示意圖松弛形環(huán)狀負超螺旋(右手)正超螺旋(左手)環(huán)狀B-DNA:2000bp、右手雙螺旋周數200Lk:雙螺旋周數第四十頁,共一百二十頁,2022年,8月28日意義

DNA超螺旋結構整體的拓撲學變化,對DNA復制和RNA轉錄過程的調控具有關鍵作用。

自然條件下,DNA以負超螺旋存在,纏繞不足有利解鏈。第四十一頁,共一百二十頁,2022年,8月28日(二)原核生物DNA是環(huán)狀超螺旋結構大腸桿菌DNA,4639bp環(huán)狀超螺旋結構(類核)200bp形成一個超螺旋共價閉環(huán)雙螺旋結構第四十二頁,共一百二十頁,2022年,8月28日

真核生物的線粒體、葉綠體DNA也是環(huán)狀超螺旋結構

線粒體DNA(mtDNA):封閉雙鏈環(huán)狀分子。人mtDNA全長16,569個堿基對,共計37個基因,分別編碼13個蛋白質、2個rRNA、22個tRNA。第四十三頁,共一百二十頁,2022年,8月28日(三)真核生物DNA與組蛋白組成高度有序的染色體(一)核小體(nucleosome)

是染色質的基本組成單位,由DNA和蛋白質構成。

雙鏈DNA纏繞在組蛋白核心上構成核小體:

組成:DNA:約200bp

組蛋白:H1、H2A、H2B、H3、H4第四十四頁,共一百二十頁,2022年,8月28日2.組蛋白是小分子量的堿性蛋白質

5種組蛋白:

分子量和氨基酸序列有差異;分子量:11~21kD,富含精氨酸和賴氨酸。

H3,H4氨基酸序列高度保守,序列相似性多,提示功能相同。

H1、H2A、H2B的相似性很少。

第四十五頁,共一百二十頁,2022年,8月28日核心顆粒:140bp

H2A,H2B,H3,H4各兩分子連接區(qū):140bp

H1第四十六頁,共一百二十頁,2022年,8月28日

核小體的結構示意圖a組蛋白八聚體核心b核小體c直徑30nm纖維的剖面圖顯示H1的位置d核小體組成串珠樣的染色質acbd第四十七頁,共一百二十頁,2022年,8月28日(二)核小體進一步組裝成染色質/染色體DNA雙螺旋結構:2nm第1層次:

核小體:200bp,10nm,體積減少7倍第2層次:

纖維狀結構:6個核小體卷曲,30nm,100倍第3層次:

柱狀結構:

400nm,40倍染色質:

700nm,~1000倍染色體:1400nm,~10000倍第四十八頁,共一百二十頁,2022年,8月28日第四十九頁,共一百二十頁,2022年,8月28日(三)常染色質與異染色質的DNA活性不同常染色質(euchromatin),相對比較伸展,是基因表達活躍區(qū)域。對DNase敏感。異染色質(heterochromatin),折疊壓縮程度較高,是轉錄不活躍的區(qū)段,占染色質的10%,如著絲粒、端粒等。第五十頁,共一百二十頁,2022年,8月28日三、DNA是生物遺傳信息的載體以基因的形式攜帶和傳遞遺傳信息。DNA的堿基序列含有遺傳信息,可作為復制和轉錄的模板傳遞遺傳信息。是生命遺傳的物質基礎,也是生命活動的信息基礎?;虻倪z傳學定義:

是攜帶遺傳信息的結構單位,控制遺傳形狀的功能單位。(一)DNA是遺傳的物質基礎第五十一頁,共一百二十頁,2022年,8月28日基因的結構學定義:(PrinciplesofBiochemistry3th)AsegmentofaDNAmoleculethatcontainstheinformationrequiredforthesynthesisofafunctionalbiologicalproduct,whetherproteinorRNA,isreferredtoasagene.(P325)A

gene,therefore,isallofDNAthatencodestheprimarysequenceofsomefinalgeneproduct,suchasapolypeptideoranRNAwithastructuralorcatalyticfunction.(P908)

編碼有功能的多肽鏈或RNA所必需的DNA片段。第五十二頁,共一百二十頁,2022年,8月28日(二)細胞中全部遺傳信息稱為基因組(genome)基因組(genome):一個細胞或病毒的全部遺傳信息。絕大多數生物個體的基因組是DNA,但有些病毒的基因組是RNA。

真核生物基因組:是指一套完整的單倍體的染色體DNA和線粒體DNA的全部序列。Allofacell’sgenesandintergenicDNA(theDNAbetweengenes)formthecellulargenome.P907第五十三頁,共一百二十頁,2022年,8月28日人類基因組:3X109bp30%編碼蛋白質相關,1.5%編碼外顯子;45%轉座子DNA,可從基因組的一處轉移到另一處的長短不一的重復序列。25%其它序列:3%為SSR(簡單重復短序列),存在端粒和著絲粒。第五十四頁,共一百二十頁,2022年,8月28日第三節(jié)

RNA的結構與功能

RNA

StructureandFunction第五十五頁,共一百二十頁,2022年,8月28日RNA通常以單鏈的形式存在,但有復雜的局部二級結構或三級結構。RNA比DNA小的多。RNA的種類、大小和結構遠比DNA表現出多樣性。RNA與蛋白質共同負責基因的表達和表達過程的調控。RNA的特點:第五十六頁,共一百二十頁,2022年,8月28日真核細胞主要RNA的種類和功能種類細胞定位功能信使RNAmessengerRNA(mRNA)細胞核、細胞質、線粒體蛋白質的合成模板非均一核RNAheterogeneousnuclearRNA(hnRNA)細胞核成熟mRNA的前體轉運RNAtransferRNA(tRNA)細胞核、細胞質、線粒體轉運氨基酸核糖體RNA

ribosomalRNA(rRNA)細胞核、細胞質、線粒體構成核糖體非信使小RNAsmallnon-messengerRNA(sncRNA)細胞核、細胞質參與hnRNA的剪接和轉運、rRNA加工、基因表達調控等第五十七頁,共一百二十頁,2022年,8月28日DNAmRNA蛋白轉錄翻譯原核細胞細胞質細胞核DNA內含子外顯子轉錄轉錄后剪接轉運mRNAhnRNA翻譯蛋白真核細胞一、信使RNA(tRNA):

含有氨基酸編碼序列的RNA。第五十八頁,共一百二十頁,2022年,8月28日真核mRNA的成熟:

hnRNA:非均一核RNA,mRNA的初產物。經剪切成為mRNA。hnRNA內含子(intron)mRNA外顯子(exon)目錄第五十九頁,共一百二十頁,2022年,8月28日mRNA結構特點:氨基酸編碼區(qū)5’非翻譯區(qū)3’非翻譯區(qū)5′末端帽子結構(m7GpppNm-)3′末端多聚腺苷酸(polyA)結構第六十頁,共一百二十頁,2022年,8月28日帽子結構(一)5-端具有共同的帽結構

真核生物mRNA的5′末端7甲基鳥苷-三磷酸鳥苷結構稱為帽子結構。3,5-磷酸二酯鍵5,5-磷酸二酯鍵第六十一頁,共一百二十頁,2022年,8月28日

轉錄后在5末端加上一個7-甲基鳥苷,同時第一或第二個核苷酸的C2也進行甲基化,形成m7GpppNm-。7-基鳥苷-三磷酸鳥苷第六十二頁,共一百二十頁,2022年,8月28日帽子結構的功能:

維持mRNA5’末端穩(wěn)定性。與帽結合蛋白(capbindingproteins,CBPs)結合,轉運mRNA到細胞質。與核蛋白體、翻譯起始因子的結合,參與翻譯起始過程。

第六十三頁,共一百二十頁,2022年,8月28日(二)3-末端具有多聚A尾結構

真核mRNA的3末端多聚腺苷酸[poly(A)]結構,稱為多聚A尾。

PolyA與PolyA結合蛋白(PolyAbindingprotein,PABP)結合,每10~20個堿基結合一個PABP單體。形成PolyA蛋白質多聚體復合物。

mRNA從核內向胞質的轉移;維持mRNA3’末端穩(wěn)定性。

第六十四頁,共一百二十頁,2022年,8月28日

mRNA分子從5-末端的AUG開始,每3個核苷酸為一組,決定肽鏈上一個氨基酸,稱為三聯(lián)體密碼(tripletcode)或密碼子(codon)。由AUG及其以后的連續(xù)三聯(lián)體密碼組成的核苷酸序列稱為開放閱讀框(openreadingframe,ORF),是多肽鏈的編碼序列。(三)信使RNA中間序列編碼多肽鏈第六十五頁,共一百二十頁,2022年,8月28日(一)

tRNA分子含有較多稀有堿基74~95個核苷酸組成,含10~20%稀有堿基,如DHU具有TC(:假尿嘧啶核苷)3′末端為—CCA-OH5′末端大多數為G二、轉運RNA(tRNA)tRNA的功能活化氨基酸、搬運氨基酸到核糖體,參與蛋白質的翻譯。第六十六頁,共一百二十頁,2022年,8月28日tRNA中含有多種稀有堿基13第六十七頁,共一百二十頁,2022年,8月28日

1.氨基酸臂

2.反密碼環(huán)

3.DHU環(huán)

4.TΨC環(huán)

5.額外環(huán)氨基酸臂TψC環(huán)額外環(huán)三聯(lián)密碼子U環(huán)

(二)tRNA的二級結構形似三葉草tRNA單鏈局部堿基互補形成雙鏈結構。莖環(huán)結構(stem-loop)

發(fā)夾結構(hairpin)。第六十八頁,共一百二十頁,2022年,8月28日3-末端都以CCA結尾。3-末端的A與氨基酸共價連結,攜帶氨基酸不同的tRNA結合不同氨基酸。tRNATyr:

未結合酪氨酸的tRNA(未結合)Tyr-tRNATyr:

已結合酪氨酸的tRNA(已結合)氨基酸臂:tRNA的3-末端連接氨基酸第六十九頁,共一百二十頁,2022年,8月28日tRNA的反密碼子環(huán)上有一個由三個核苷酸構成的反密碼子(anticodon)。tRNA上的反密碼子依照堿基互補的原則識別mRNA上的密碼子。反密碼環(huán):tRNA的反密碼子識別mRNA的密碼子第七十頁,共一百二十頁,2022年,8月28日(三)tRNA的三級結構呈倒L型第七十一頁,共一百二十頁,2022年,8月28日

TψC環(huán)氨基酸臂DHU環(huán)反密碼環(huán)反密碼子tRNA三級結構及氫鍵的位置第七十二頁,共一百二十頁,2022年,8月28日*rRNA的結構三、核糖體RNA第七十三頁,共一百二十頁,2022年,8月28日*rRNA的種類(根據沉降系數)

真核生物18SrRNA

5SrRNA28SrRNA5.8SrRNA

原核生物16SrRNA

5SrRNA23SrRNA(一)原核生物有3種rRNA,真核生物有4種rRNA第七十四頁,共一百二十頁,2022年,8月28日(二)原核生物和真核生物的核糖體均由容易解聚的大、小兩個亞基組成。原核生物(以大腸桿菌為例)真核生物(以小鼠肝為例)小亞基30S40SrRNA16S1542個核苷酸18S1874個核苷酸蛋白質21種占總重量的40%33種占總重量的50%大亞基50S60SrRNA23S5S2940個核苷酸120個核苷酸28S5.85S5S4718個核苷酸160個核苷酸120個核苷酸蛋白質31種占總重量的30%49種占總重量的35%第七十五頁,共一百二十頁,2022年,8月28日rRNA與核糖體蛋白質共同構成核糖體。核糖體是蛋白質生物合成的場所,為肽鏈合成所需要的mRNA、tRNA、多種蛋白因子提供了相互結合的位點和相互作用的空間環(huán)境。(三)核糖體是蛋白質合成的場所第七十六頁,共一百二十頁,2022年,8月28日四、非信使小RNA除三種RNA外,細胞存在的其他種類小分子RNA,統(tǒng)稱為非信使小RNA。非信使小RNA

(smallnon-messengerRNAs,snmRNAs)

非編碼小RNA(smallnon-codingRNA,sncRNA)具有調節(jié)基因表達作用的小RNA。siRNA、miRNA第七十七頁,共一百二十頁,2022年,8月28日非信使小RNAs的種類:核內小RNA核仁小RNA胞質小RNA催化性小RNA小片段干涉RNA

(siRNA)

微小RNA(miRNA)

第七十八頁,共一百二十頁,2022年,8月28日研究細胞中非信使小RNAs的種類、結構和功能。參與基因的表達和轉錄調控。同一生物體內不同種類的細胞、同一細胞在不同時間、不同狀態(tài)下非信使小RNAs的表達具有時間和空間特異性。RNA組學第七十九頁,共一百二十頁,2022年,8月28日(一)核內小RNA參與mRNA剪接過程snRNA長度(nt)

剪接hnRNA的靶位點U1U2U4U5

U6U716518914511510663內含子5-端內含子腺苷酸分支點5端,補充分支點轉酯化反應,3剪接點,使外顯子連接,轉酯化反應組蛋白H3前體的mRNA3末端裂解

核內小RNA與蛋白質組成:細胞核小核蛋白體,是mRNA的剪切場所。核內小RNA富含尿嘧啶,U-snRNA。核內小RNA識別內含子與外顯子的節(jié)點。第八十頁,共一百二十頁,2022年,8月28日(二)催化小RNA參與特殊RNA剪接

具有催化作用的小RNA稱為核酶(ribozyme)或催化性RNA(catalyticRNA)。催化特定RNA降解,在RNA合成后的剪接中具有重要作用。RHA基因組剪切。

根據核酶的分子大小,核酶分為:小分子核酶和大分子核酶。1981年托馬斯.塞克發(fā)現RNA有自身催化作用。第八十一頁,共一百二十頁,2022年,8月28日1.小分子核酶錘頭核酶(hammerheadribozyme)

發(fā)夾核酶(hairpinribozyme)

其他小分子核酶

2.大分子核酶

I(類)內含子,hnRNA

剪切

II(類)內含子

P核酶

第八十二頁,共一百二十頁,2022年,8月28日3.核酶是基因靶向治療良好工具

核酶應用于抗病毒基因治療將RNA病毒基因組作為其剪切的底物。

酶切位點:病毒的啟動子區(qū)域、剪接信號序列或包裝信號序列等病毒的保守序列。設計核酶,有效地對抗各種病毒亞型,降低逃逸突變的可能性。

第八十三頁,共一百二十頁,2022年,8月28日核酶可用于腫瘤基因治療腫瘤病因:基因功能獲得性和缺失性變化(突變)。

DNA病毒或反轉錄病毒感染(轉化)?;蛞孜灰鹎逗匣颉?/p>

腫瘤基因治療的策略之一:抑制癌基因或嵌合基因的表達。核酶和脫氧核酶從策略、理論上可抑制腫瘤細胞而不影響正常細胞。

第八十四頁,共一百二十頁,2022年,8月28日(三)核仁小RNA參與rRNA中核苷酸殘基的修飾:甲基化:假尿核苷的形成:(四)小干擾RNA參與轉錄后調控第八十五頁,共一百二十頁,2022年,8月28日siRNA:是生物宿主對外源基因表達的雙鏈RNA進行切割,產生特定長度和特定核酸序列的小片段RNA。siRNA可以與外源基因表達的mRNA相結合,并誘發(fā)這些mRNA的降解?;诖藱C理,人們發(fā)明了RNA干擾技術。雙鏈RNA對基因表達的抑制作用,被稱為RNA干擾(RNAinterference,

RNAi)。

小片段干擾RNA

(smallinterferingRNA,siRNA)第八十六頁,共一百二十頁,2022年,8月28日miRNA是體內基因表達產物,與siRNA有相似的功能,在基因表達調控中起重要作用。對生長發(fā)育和行為具有十分深遠和復雜的影響,與人類疾病發(fā)生發(fā)展密切相關。對miRNA的研究還處在理論水平,對它的應用還有待進一步探討。以miRNA為靶點或者以miRNA為診斷和治療手段的設想,將成為研究的一個焦點。微小RNA:(microRNA,miRNA):第八十七頁,共一百二十頁,2022年,8月28日

近幾年生命科學研究的熱點,2001-2003年Science雜志連續(xù)將siRNA、miRNA、RNA干擾方面的研究評為十大科技突破。

siRNA和miRNA調控基因表達,影響細胞的許多功能,使人們重新認識RNA分子在細胞進化和功能作用的地位以及廣泛的應用前景。siRNA、miRNA的研究第八十八頁,共一百二十頁,2022年,8月28日第四節(jié)核酸的理化性質PhysicalandChemicalPropertiesofNucleicAcids目錄第八十九頁,共一百二十頁,2022年,8月28日(一)核酸可被酸、堿水解目錄核酸中的糖苷鍵和磷酸酯鍵都能被酸、堿和酶水解。DNA易被酸水解RNA易被堿水解

一、核酸具備多種基本物理化學性質第九十頁,共一百二十頁,2022年,8月28日堿基在體液環(huán)境中以堿性解離為主:嘌呤和嘧啶環(huán)及其取代基上的氮,具有酸堿兩性,中性條件以堿解離為主。核酸分子是酸性化合物:

核酸的磷酸基團以酸解離。(二)核酸是兩性化合物第九十一頁,共一百二十頁,2022年,8月28日堿基互變異構:中性條件以氨式、酮式為主烯醇式酮式氨式亞氨式第九十二頁,共一百二十頁,2022年,8月28日(三)核酸溶液有高分子性質粘度:DNA>RNA、dsDNA>ssDNA

粘度大,易斷裂。沉降系數:

不同空間結構,沉降速率不同;線性<環(huán)狀<超螺旋的DNA;超速離心分離。第九十三頁,共一百二十頁,2022年,8月28日(四)核酸有紫外線吸收的特性

核酸的紫外吸收:OD260單核苷酸>ssDNA(或RNA)>dsDNA

第九十四頁,共一百二十頁,2022年,8月28日堿基的紫外吸收光譜第九十五頁,共一百二十頁,2022年,8月28日1.DNA或RNA的定量OD260=1.0相當于50μg/ml雙鏈DNA40μg/ml單鏈DNA(或RNA)20μg/ml寡核苷酸2.判斷核酸樣品的純度DNA純品:OD260/OD280=1.8RNA純品:OD260/OD280=2.0OD260的應用第九十六頁,共一百二十頁,2022年,8月28日二、核酸變性、復性和雜交定義:在理化因素作用下,DNA雙鏈解開成兩條單鏈的過程。本質:破壞氫鍵,改變空間結構。方法:強酸、堿,加熱,變性試劑(尿素、酰胺)、有機溶劑(乙醇、丙酮)等。理化性質變化:OD260增高.(一)核酸變性第九十七頁,共一百二十頁,2022年,8月28日DNA變性的本質是雙鏈間氫鍵的斷裂第九十八頁,共一百二十頁,2022年,8月28日變性引起紫外吸收值的改變DNA的紫外吸收光譜增色效應:DNA變性時其溶液OD260增高的現象。(二)DNA變性與紫外吸收第九十九頁,共一百二十頁,2022年,8月28日DNA的解鏈曲線連續(xù)加熱DNA的過程中以溫度相對于A260值作圖,所得的曲線稱為解鏈曲線。解鏈過程中,紫外吸光度的變化達到最大變化值的一半時所對應的溫度。解鏈溫度(meltingtemperature,Tm)熱變性變性是在一個相當窄的溫度范圍內完成。

第一百頁,共一百二十頁,2022年,8月28日Tm值的影響因素:1.G-C堿基對含量決定熔解溫度高低:

G-C與Tm值呈正比。DNA均一性決定熔解溫度范圍大?。壕|DNATm范圍小、異質DNATm范圍大3.

介質中的離子強度影響變性:離子強度低、易變性,Tm低;

DNA高鹽保存。Tm值的經驗公式:Tm=69.3+0.41(%G+C)<20pb:Tm

=4(G+C)+2(A+T)第一百零一頁,共一百二十頁,2022年,8月28日解鏈曲線的變化G+C含量越高,解鏈溫度就越高。第一百零二頁,共一百二十頁,2022年,8月28日純蒸餾水中的DNA在室溫下就會變性,為什么每一個核苷酸的磷酸基上都帶有一個負電荷。如果這些負電荷沒有被中和,雙鏈之間的這種強有力的靜電排斥作用將驅使兩條鏈分開(在同一條鏈內雖然也存在著這種靜電斥力,但由于鏈內的共價鍵,這種靜電斥力并不重要)。但是當有鹽類加入時,這些帶負電荷的磷酸基團可以被正離子(如Na+)所中和,也就是正離子圍繞在磷酸基周圍形成了“離子云”,有效地屏蔽了磷酸基之間的靜電斥力。這就是Debye-Hvckel離子屏蔽理論。在生理鹽濃度(約0.2mol/L)時就發(fā)生了這種屏蔽作用.斥力也被中止。當離子濃度降低時,這種屏蔽作用減弱,斥力增大,因而Tm值隨之降低。事實上.純蒸餾水中的DNA在室溫下就會變性,也就是這個緣故。在超過生理鹽濃度時,Tm值仍然隨著離子強度的增加而上升,這是因為在高鹽濃度下堿基的溶解性降低而增加了疏水作用力,促進了雙螺旋結構的穩(wěn)定。事實上,平時制備的DNA也總是DNA的鈉鹽,每個磷酸基總是結合一個Na+在用Nacl和CsCl測量DNA分子量時,就會得到不同的數值,二者之比為0.75。因為單核苷酸的平均分子量為330,若是鈉鹽則為353,若是銫鹽則為467。353/467=0.75。這就是一個有力的證據。第一百零三頁,共一百二十頁,2022年,8月28日DNA復性(renaturation):在適當條件下,變性DNA的兩條互補鏈可恢復天然的雙螺旋構象,這一現象稱為復性。退火(annealing):

熱變性的DNA經緩慢冷卻后復性,這一過程稱為退火。(三)變性DNA的復性

減色效應:DNA復性時,其溶液OD260降低。第一百零四頁,共一百二十頁,2022年,8月28日DNA復性影響因素:

分子量大、濃度小、重復序列多,復性慢第一百零五頁,共一百二十頁,2022年,8月28日(四)核酸分子雜交核酸分子雜交(hybridyzation):不同來源,但具互補序列的核酸,按堿基配對原則形成雜化雙鏈的過程。雜化雙鏈:DNA與DNA分子,

DNA與RNA分子,

RNA與RNA分子間形成。第一百零六頁,共一百二十頁,2022年,8月28日DNA-DNA雜交雙鏈分子變性復性不同來源的DNA分子第一百零七

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