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聚類分析-SPSS應(yīng)用快速聚類快速聚類-K均值聚類分層聚類點(diǎn)擊菜單Analyze->DescriptiveStatistics->Descriptives快速聚類1-數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化快速聚類2定義聚類中心確定分類數(shù)指定分析變量迭代和分類迭代選項(xiàng)輸出選項(xiàng),保存到數(shù)據(jù)表輸出選項(xiàng)4快速聚類3-迭代選項(xiàng)選定后,確定當(dāng)任一個(gè)樣品被分到某類后,即刻計(jì)算新的類中心。輸入最大迭代步數(shù)迭代收斂判據(jù)(>0and<1),含義當(dāng)兩次迭代計(jì)算的類中心的變化距離小于原中心距離的百分之N時(shí)迭代停止快速聚類4-輸出選項(xiàng)確定輸出各樣品的類別到數(shù)據(jù)表確定輸出各樣品到類中心的距離到數(shù)據(jù)表快速聚類5-輸出選項(xiàng)初始類中心方差分析表每個(gè)樣品的分類信息快速聚類-結(jié)果1初始類中心,前4個(gè)樣品作為初始中心。迭代中心的變化。本例2次迭代后停止??焖倬垲悾Y(jié)果2樣品分類信息最后的分類中心方差分析表。任意一個(gè)變量的類間均方(ClusterMS)均遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于類內(nèi)的誤差均方值(ErrorMS)快速聚類-結(jié)果3聚類小結(jié):給出每類的樣品數(shù)等。快速聚類-結(jié)果4分層聚類快速聚類-K均值聚類分層聚類Statistics:確定輸出的統(tǒng)計(jì)項(xiàng);Plots:確定輸出的圖表類型;Method:確定聚類方法;Save:確定輸出到數(shù)據(jù)表的新變量。分層聚類1指定參與分類的變量。指定標(biāo)識(shí)變量。選Cases,樣品聚類;選Variables,變量聚類ClusterMethod-聚類方法最近相鄰,Nearestneighbor最遠(yuǎn)相鄰Furthestneighbor組間連接betweengroupslinkage:合并兩類結(jié)果使得兩兩項(xiàng)對(duì)之間的平均距離最??;組內(nèi)連接within-groupslinkage:合并兩類結(jié)果使得類中的兩兩項(xiàng)對(duì)之間的平均距離最??;離差平方和法Ward重心法Centroidmethod,每類重心就是該類的均值分層聚類2Measure-距離或相似性測(cè)度植被等間隔參數(shù)(Interval)Count:用于計(jì)數(shù)數(shù)據(jù)Binary:用于二值變量。等間隔參數(shù)(Interval):Euclidean距離的平方:Euclidean距離Cosine—變量矢量的余弦Pearsoncorrelation-相關(guān)系數(shù)Chebychev:兩觀察單位之間的距離為其任意變量的最大絕對(duì)值。Block:City-Block或Manhattan。兩觀察單位之間的距離為其值差的絕對(duì)值和。Minkowski:即變量絕對(duì)值的第P次冪之和的平方根。P由用戶指定。Customized:即變量絕對(duì)值的第P次冪之和的第R次根。P與R由用戶指定。Count:用于計(jì)數(shù)數(shù)據(jù)Chi-Squaremeasure:卡方測(cè)度Phi-Squaremeasure:兩頻數(shù)之間的2測(cè)度。Binary:用于二值變量。1為出現(xiàn),0為不出現(xiàn)RRSMSSIRT…….TransformMeasures-距離測(cè)量結(jié)果的轉(zhuǎn)換方法:Absolutevalues:把距離值取絕對(duì)值。Changesign:把相似性變?yōu)椴幌嗨菩曰蛉》?。用取反的方法使距離順序顛倒過(guò)來(lái)。Rescaleto0-1range:通過(guò)首先減去最小值,然后除以范圍的方法使距離標(biāo)準(zhǔn)化。TransformValues-標(biāo)準(zhǔn)化Zscores:把數(shù)值標(biāo)準(zhǔn)化到Z分?jǐn)?shù)Range–1to1:把數(shù)值標(biāo)準(zhǔn)化到-1~1范圍。Maximummagnitude:把數(shù)值標(biāo)準(zhǔn)化到最大值1Range0to1:把數(shù)值標(biāo)準(zhǔn)化到0~1的范圍。Meanof1:把數(shù)值標(biāo)準(zhǔn)化到一個(gè)均值的范圍Standarddeviationof1:把數(shù)值標(biāo)準(zhǔn)化到單位標(biāo)準(zhǔn)差。凝聚狀態(tài)表距離或相似系數(shù)矩陣類成員欄:顯示每個(gè)樣品被分配到的類分層聚類樹(shù)型圖冰柱圖顯示方向(冰柱圖):垂直,水平分層聚類輸出到數(shù)據(jù)表-生成新變量不建立新變量-默認(rèn)選項(xiàng)單一結(jié)果指定范圍的結(jié)果分層聚類分層聚類結(jié)果數(shù)據(jù)信息表凝聚過(guò)程表Stage:聚類步驟(clustercombined)Cluster1,cluster2:該步被合并的兩類中的觀測(cè)量號(hào),合并結(jié)果取小的序號(hào);Coefficients:距離測(cè)度值(本例選擇歐氏距離)Stageclusterfirstappears:合并兩項(xiàng)第一次出現(xiàn)的聚類步序號(hào)。0表示觀測(cè)量,非0表示類。NextStage:此步合并結(jié)果在下一步合并時(shí)的步序號(hào)。分層聚類結(jié)果聚類結(jié)果的類成員表分層聚類結(jié)果第1列“Numberofclusters”:表示分多少類,因?qū)倬酆戏?,從聚類過(guò)程看該表應(yīng)該從下往上看;在“CASE”下所有列中:如果最近相連的兩列出現(xiàn)兩個(gè)“X”相連,則表示這兩個(gè)樣品已合并成一類,否則屬于不同的兩類。
分層聚類結(jié)果-冰柱圖(VerticalIcicle)第1行“Numberofclusters”:表示分多少類,因?qū)倬酆戏?,從聚類過(guò)程看該表應(yīng)該從右往左看;在“CAS
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