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文檔簡介
微生物遺傳變異與育種第一頁,共一百零二頁,2022年,8月28日
微生物遺傳學研究意義1)微生物學的主要分支2)為生命遺傳現(xiàn)象的解釋提供依據(jù)3)是分子生物學發(fā)展的基礎學科4)促進工業(yè)微生物菌種的選育
第二頁,共一百零二頁,2022年,8月28日§.1遺傳變異的物質基礎
一、證明遺傳物質的三個典型實驗
----細菌轉化實驗----噬菌體感染實驗----植物病毒的重建實驗
第三頁,共一百零二頁,2022年,8月28日1、細菌轉化實驗----動物試驗(Grifith,1928)第四頁,共一百零二頁,2022年,8月28日----細菌培養(yǎng)實驗S(死)+R(活)S(少量活)+R(活)S(無細胞提取液)+R(活)S(少量活)+R(活)第五頁,共一百零二頁,2022年,8月28日----細菌培養(yǎng)試驗(Avery,1944)第六頁,共一百零二頁,2022年,8月28日第七頁,共一百零二頁,2022年,8月28日2.噬菌體感染實驗(Hershey;Chase,1952)第八頁,共一百零二頁,2022年,8月28日3.植物病毒的重建實驗(Fraenkel-Conrat,1956)第九頁,共一百零二頁,2022年,8月28日二、遺傳物質在細胞內的存在部位和方式(一)真核與原核微生物遺傳物質比較
第十頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●原核與真核微生物基因組大小第十一頁,共一百零二頁,2022年,8月28日細菌染色體數(shù)目與形狀第十二頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●細菌染色體結構第十三頁,共一百零二頁,2022年,8月28日真核微生物染色體結構(示核小體)
第十四頁,共一百零二頁,2022年,8月28日真核生物基因結構第十五頁,共一百零二頁,2022年,8月28日真核微生物基因表達控制第十六頁,共一百零二頁,2022年,8月28日(二)原核生物的質粒
質粒:游離于染色體外,獨立復制,環(huán)狀、共價、閉合dsDNA分子,即cccDNA。第十七頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●質粒的特點1)大小:大質粒:>60kb、1/cell小質粒:10-20/cell第十八頁,共一百零二頁,2022年,8月28日2)自主復制能力:型復制、滾環(huán)復制第十九頁,共一百零二頁,2022年,8月28日
數(shù)量控制:嚴緊型;松弛型第二十頁,共一百零二頁,2022年,8月28日3)轉移性:Tra區(qū)基因:附加體:某些質粒既可整合進宿主染色體,又可與染色體脫離,稱之~。第二十一頁,共一百零二頁,2022年,8月28日4)質粒的消除:
----理化因子----原生質體誘導法第二十二頁,共一百零二頁,2022年,8月28日5)不相容性:
兩種親緣關系相近的質粒不能穩(wěn)定地存在于同一個細胞中。(G-菌的部分不相容群)第二十三頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●質粒的遺傳表型1) F質粒(致育因子)Tra基因:編碼轉移相關蛋白;合成性纖毛
第二十四頁,共一百零二頁,2022年,8月28日2)R質粒(抗藥因子)----RTF基因(抗性轉移因子)----抗性決定子(抗抗生素、抗藥、抗種金屬)第二十五頁,共一百零二頁,2022年,8月28日3)Col質粒(大腸桿菌素因子)----產(chǎn)大腸桿菌素細菌素:由細菌質粒編碼產(chǎn)生的只能抑制或殺滅近緣細菌或同種不同菌株的蛋白質。Col質粒類型:----非接合型:松弛型----接合型:嚴緊型第二十六頁,共一百零二頁,2022年,8月28日4)Ti質粒:合成冠癭堿、大型質粒5)Ri質粒:產(chǎn)生根毛、大型質粒第二十七頁,共一百零二頁,2022年,8月28日7)降解質粒:降解、接合第二十八頁,共一百零二頁,2022年,8月28日8)致病性質粒:溶血素、腸毒素(S.aureus)9)共生固氮質粒:----結瘤基因(nod)----固氮基因(nif)10)隱蔽質粒:---未有明確表型第二十九頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●工程質粒----pBR322主要特點:1)分子量小2)穩(wěn)定、松弛型復制3)可大量擴增4)容易分離5)可攜帶小于10kb外源DNA 6)帶有2個選擇標記;7)多個單一酶切位點8)容易轉化第三十頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●利用選擇標記鑒別攜帶外源片段的轉化子(雙抗菌素對照篩選)第三十一頁,共一百零二頁,2022年,8月28日建議讀物第三十二頁,共一百零二頁,2022年,8月28日
§.2基因突變和誘變育種
一、基因突變●野生型菌株:從自然界分離獲得的菌株,稱之為~。●基本培養(yǎng)基(MM):滿足野生型菌株生長最低營養(yǎng)要求的合成培養(yǎng)基。第三十三頁,共一百零二頁,2022年,8月28日(一)突變類型●營養(yǎng)缺陷型:野生型菌株由于突變而喪失了某種營養(yǎng)合成能力,而無法在基本培養(yǎng)基上生長的變異類型。
表示:基因:his+,his-;表型:His+,His-第三十四頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●抗性突變型:野生型菌株由于突變而產(chǎn)了對某些化學藥物或致死物理因子抗性變異類型。表示:基因:
strr、strs;tetr、tets;
表型:Strr,Strs第三十五頁,共一百零二頁,2022年,8月28日
●條件致死突變型:某些菌株或病毒經(jīng)基因突變后,在某種條件可生長并實現(xiàn)表型,而在另一條件卻無法生長繁殖的突變類型。(如溫度敏感突變株:Ts)●形態(tài)突變株●抗原突變株●產(chǎn)量突變株第三十六頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●突變株類型劃分:----選擇性突變株:營養(yǎng)缺陷型、抗性突變型、條件致死突變型----非選擇突變株:形態(tài)、抗原、產(chǎn)量突變型第三十七頁,共一百零二頁,2022年,8月28日(二)突變率及其撿出●突變率:某一細胞在每一世代中發(fā)生突變的幾率。常用單位群體中每一世代產(chǎn)生的突變株的數(shù)目來表示。第三十八頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●突變株的撿出及突變率的計算撿出方法:1)選擇性突變株----營養(yǎng)缺陷型----抗藥性突變回復突變:第三十九頁,共一百零二頁,2022年,8月28日(三)基因突變的自發(fā)性與不對稱性
●突變的自發(fā)性:基因可自發(fā)產(chǎn)生突變。(輻射、自身有害物質、堿基配對錯誤)●突變的不對應性:突變性狀與引起突變的環(huán)境因素無直接對應關系。第四十頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●平板影印培養(yǎng)試驗
(Lederberg)第四十一頁,共一百零二頁,2022年,8月28日(四)基因突變及其機制1、誘發(fā)突變(點突變,畸變)1)點突變(1)堿基置換---轉換---顛換第四十二頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●可能的突變型:錯義突變無義突變同義突變第四十三頁,共一百零二頁,2022年,8月28日
●相關的誘變劑--直接引起置換:
亞硝酸、亞硝基胍、羥胺、烷化劑--間接引起置換:堿基類似物(5-BU,5-AU)第四十四頁,共一百零二頁,2022年,8月28日(2)移碼突變DNA序列中插入或缺失少數(shù)核苷酸,從而使該處后面遺傳密碼的閱讀框架發(fā)生改變的突變。第四十五頁,共一百零二頁,2022年,8月28日2)染色體畸變
DNA分子的大段損傷,包括缺失、重復、插入、易位(轉座)和倒拉等?!褶D座:DNA分子通過非同源重組方式,從染色體的某一部位轉移到另一部位的現(xiàn)象。
第四十六頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●轉座因子凡具有轉座作用的DNA序列均稱之~。
特點:---轉座作用---末端重復序列---轉座酶基因第四十七頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●轉座因子類型插入序列轉座子(或稱復合轉座子)轉座噬菌體第四十八頁,共一百零二頁,2022年,8月28日
a)插入序列(IS)b)轉座子(Tn)第四十九頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●轉座機理第五十頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●轉座子的遺傳效應和生物學意義(復制型轉座)遺傳效應1)插入突變2)DNA重排意義:進化,獲得突變株,抗藥性鑒定必須基因第五十一頁,共一百零二頁,2022年,8月28日
(五)紫外線對DNA的損傷及其修復1.損傷的機理:
形成胸腺嘧啶二聚體2、修復作用
1)光復活作用光解酶-二聚體復合物為光激活
第五十二頁,共一百零二頁,2022年,8月28日2.暗修復作用:
第五十三頁,共一百零二頁,2022年,8月28日3、重組修復4、SOS修復第五十四頁,共一百零二頁,2022年,8月28日
二、
突變與育種(一)自發(fā)突變與育種(定向培育)(二)誘變育種第五十五頁,共一百零二頁,2022年,8月28日1、基本原則(應考慮的問題)1)誘變劑的選擇(有效性,安全性,簡便性)第五十六頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●誘變劑誘變效果測定(回復突變率的測定)---艾姆氏試驗(檢測三致物質)第五十七頁,共一百零二頁,2022年,8月28日2)出發(fā)菌株3)誘變菌株的狀態(tài)----處理單胞(孢)懸液----選擇單倍體或單核細胞4)劑量:低劑量;(表示方法)5)提高檢出效率----利用形態(tài)特征----鑒別培養(yǎng)基第五十八頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●利用鑒別培養(yǎng)基檢出突變株----蛋白酶高活性菌株的檢出(酪蛋白為N源,加HgCl2觀察透明圈)----淀粉酶高活性菌株的檢出(淀粉為C源,加I2液觀察透明圈)----有機酸高產(chǎn)菌株的檢出(培養(yǎng)基加CaCO3觀察透明圈)第五十九頁,共一百零二頁,2022年,8月28日6)設計高效的篩選方案----初篩(數(shù)量、定性)----復篩(質量、定量)7)創(chuàng)新性的篩選方法第六十頁,共一百零二頁,2022年,8月28日2、營缺型的篩選(1)三種基本培養(yǎng)基●基本培養(yǎng)基[-]:滿足野生型菌株生長最低營養(yǎng)要求的組合培養(yǎng)基。●完全培養(yǎng)基[+]:滿足所有營缺型菌株生長營養(yǎng)要求的天然或半組合培養(yǎng)基。●補充培養(yǎng)基[A],[B]:滿足相應營缺型菌株生長營養(yǎng)要求的組合或半組合培養(yǎng)基。第六十一頁,共一百零二頁,2022年,8月28日(2)三類遺傳型個體●野生型:從自然界分離獲得的菌株不論營養(yǎng)狀況如何,均稱為~。(A+B+)●營缺型:野生型菌株經(jīng)誘變由于代謝障礙,而必須添加某種物質才能生長的突變株。
(A+B-)(A-B+)●原養(yǎng)型:營缺型回復突變后的菌株。
(A+B+)第六十二頁,共一百零二頁,2022年,8月28日
基本基完全基補充基野生型+++營缺型—++原養(yǎng)型+++第六十三頁,共一百零二頁,2022年,8月28日(3)篩選步驟
1)誘變2)淘汰野生型:抗生素法、菌絲過濾法3)檢出:夾層培養(yǎng)法;限量補充法逐個檢出法;影印平板法
第六十四頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●夾層培養(yǎng)法第六十五頁,共一百零二頁,2022年,8月28日(4)鑒定缺陷型(生長譜法)1)制備基本培養(yǎng)基;2)加充分洗滌菌懸液;3)加待測營養(yǎng)物;4)觀察生長。第六十六頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●定位(點)誘變盒式誘變寡核苷酸引物誘變第六十七頁,共一百零二頁,2022年,8月28日Strainimprovementforfermentationandbiocatalysisprocessesbygeneticengineeringtechnology建議讀物第六十八頁,共一百零二頁,2022年,8月28日§.3基因重組
●基因重組(遺傳重組):兩個獨立基因組內的遺傳物質,通過一定的途徑轉移到一起,形成新的穩(wěn)定的基因組過程。第六十九頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●遺傳工程
----基因重組技術經(jīng)典、同源、生物自然屬性、體內----DNA重組技術:分子水平、同--異源、體外第七十頁,共一百零二頁,2022年,8月28日一、原核生物的基因重組(一)轉化受體菌直接吸收供體菌游離的DNA片段而獲得部分遺傳性狀的現(xiàn)象。第七十一頁,共一百零二頁,2022年,8月28日1、轉化的基本條件(1)感受態(tài):受體菌最容易接受外源DNA片段并能實現(xiàn)轉化的一種生理狀態(tài)。影響因素:---遺傳因素(感受態(tài)因子;種屬的特異性;)---外部因素(CAMP、聚乙二醇、二價陽離子---低溫低滲CaCl處理、培養(yǎng)條件)
第七十二頁,共一百零二頁,2022年,8月28日
●轉化頻率:0.1~1%(很低),最高10%,質粒
為良好的轉化因子?!駶舛龋?0-5ug/ml●結構:一般轉化因子都是線狀雙鏈DNA,少數(shù)為
線狀單鏈DNA?!翊笮。好恳晦D化DNA片段分子量約1×107,約占染色體組0.3%,平均15個基因。(2)轉化因子第七十三頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●轉化因子非交換第七十四頁,共一百零二頁,2022年,8月28日2、轉化過程
1)酶解和吸收單鏈2)同源區(qū)配對、整合3)復制4)形成轉化子第七十五頁,共一百零二頁,2022年,8月28日3.轉染(Tranfection)提純的病毒DNA或RNA進入宿主細胞并增殖出正常的病毒后代現(xiàn)象。IfDNAfromavirusisusedasthecloningvector,theprocessiscalledtransfection.
(Introductiontomicrobiology,JohnL.Ingraham)第七十六頁,共一百零二頁,2022年,8月28日(二)轉導完全缺陷或部分缺陷噬菌體為媒介,使受體細胞獲得供體細胞部分遺傳性狀的現(xiàn)象。第七十七頁,共一百零二頁,2022年,8月28日1、普遍轉導
完全缺陷噬菌體對供體任何DNA小片段進行“誤包”,而將其遺傳性狀傳遞給受體菌的現(xiàn)象,包括完全普遍轉導和流產(chǎn)普遍轉導兩種類型。第七十八頁,共一百零二頁,2022年,8月28日
●完全轉導(形成轉導子)感染復數(shù):感染的噬菌體數(shù)/被感染細胞數(shù)第七十九頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●流產(chǎn)轉導:(僅形成一個轉導子,產(chǎn)生小菌落)●經(jīng)轉導進入受體菌的供體菌DNA片段,在受體菌內不交換、整合、復制,也不迅速消失,僅進行轉錄、翻譯、性狀表達轉導現(xiàn)象。
第八十頁,共一百零二頁,2022年,8月28日2、局限轉導部分缺陷的溫和噬菌體把供體菌少數(shù)特定的基因攜帶到受體菌中并獲得表達的轉導現(xiàn)象。
A、低頻轉導(LFT)1)噬菌體感染2)誘導裂解3)不正常切離(低頻轉導裂解物)(dgal、dbio)4)形成局限轉導子第八十一頁,共一百零二頁,2022年,8月28日B、高頻轉導(HFT)1)概念●低頻轉導(LFT)裂解物:溶源噬菌體感染后,帶少數(shù)局限轉導噬菌體的細胞裂解物?!耠p重溶源菌:同時感染有正常噬菌體和缺陷噬菌體的受體菌。(來源:LFT裂解物以高的感染復數(shù)感染宿主)第八十二頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●雙重溶源菌第八十三頁,共一百零二頁,2022年,8月28日2)高頻轉導:在局限轉導中,用雙重溶源菌誘導后產(chǎn)生的高頻轉導裂解物轉導受體菌可獲得的高達50%的轉導子,稱之~。3)過程:1)雙重溶源菌2)誘導,獲得高頻轉導裂解物3)高頻轉導裂解物低m.o.i感染受體菌第八十四頁,共一百零二頁,2022年,8月28日(3)溶源轉變
溫和噬菌體感染宿主后,宿主通過溶源化而獲得免疫性以外新性狀的現(xiàn)象?!癜缀矶舅兀喊缀項U菌的?-噬菌體帶有“TOX”基因第八十五頁,共一百零二頁,2022年,8月28日(三)接合
●接合:通過細胞間的直接接觸,由質粒介導的遺傳物質轉移的現(xiàn)象.●接合子:通過接合而獲得新的遺傳性狀的受體細胞。第八十六頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●存在方式:四種接合型菌株1、F-第八十七頁,共一百零二頁,2022年,8月28日
2、F+菌株Orit:起始子第八十八頁,共一百零二頁,2022年,8月28日3、Hfr菌株:高頻重組菌株,F(xiàn)+整合在染色體上成為附加體的狀態(tài),若與F-接合,有很高的重組頻率。1)細胞接觸2)Hfr斷裂、轉移、復制3)接合中斷4)形成接合子第八十九頁,共一百零二頁,2022年,8月28日●利用接合中斷
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