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經(jīng)典word整理文檔,僅參考,雙擊此處可刪除頁眉頁腳。本資料屬于網(wǎng)絡(luò)整理,如有侵權(quán),請聯(lián)系刪除,謝謝!-班級學(xué)號姓名一、名詞解釋54共1EST:。2、:3ORF:或4、GenBank:GenBank是美國國家生物技術(shù)信息中心(NationalCenterforBiotechnologyInformation,NCBI)建立的DNA序列數(shù)據(jù)庫,從公共資源中獲取序列數(shù)據(jù),主要是科研人員直接提供或來源于大規(guī)模基因組測序計劃(Benson等,1998)。為保證數(shù)據(jù)盡可能的完全,GenBank與、DDBJ建立了相互交換數(shù)據(jù)的合作關(guān)系。5Evolutionary:生物進化樹在生物學(xué)中,用來表示物種之間的進化關(guān)系。生物分的圖表上,簡明地表示生物的進化歷程和親緣關(guān)系。從進化樹中還可看出:生物進化有一個規(guī)律,都是從水生到陸生,從低等到高等,從簡單到復(fù)雜。二、簡答題2,共分)1、蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的研究非常重要。簡述從蛋白質(zhì)的氨基酸序列預(yù)測其空間三維結(jié)構(gòu)的方法有哪些?1的HP2、簡述多序列比對的用途。、三、綜合分析操作題1共分)從生物信息數(shù)據(jù)庫中檢索近緣物種某一種基因編碼區(qū)序列或蛋白質(zhì)序列近5年來的相關(guān)記錄,從中選取6條以上序列進行多序列比對,在此基礎(chǔ)上構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,并簡要評述獲得的系統(tǒng)發(fā)育樹。唾液淀粉酶序列系統(tǒng)發(fā)育分析1、序列獲得:①進入NCBIEntrez”按鈕進入EntrezNucleotide”按鈕選擇核酸序列數(shù)據(jù)庫。②點擊“Limits”按鈕,在檢索欄中填入“SalivaryamylaseTitleSearch”按鈕2GenBank登錄號:NM_001008219.1NM_001008221.1NM_001010970.1,XM_006710579.1多序列比對:①將獲取的六條基因序列以純文本文檔保存②點擊Clustalx.exe圖標進入界面③點擊File下拉菜單下的Loadsequences按鈕,導(dǎo)入純文本文檔④點擊Alignment下拉菜單下的DocompleteAlignment按鈕,彈出對話框,點擊ALIGN按鈕,執(zhí)行多序列比對,保存生成的結(jié)果到指定的路徑目錄下2⑥點擊File下拉菜單下的ConvertToMEGAFormatClustalXMEGA格式文檔并保存ClickToactivateadatafileMEGA格式文檔,選擇序列類型⑧點擊頁眉上的下拉菜單,執(zhí)行相關(guān)分析內(nèi)容保守位點:變異位點:>=2個變異的位點)在所有群體中只有1個群體中發(fā)生變異的位點:四種堿基及密碼子第1、23位在各群體中的使用概率Transi
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