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文檔簡介
第七講生物化學(xué)
一、競賽中涉及的問題
在中學(xué)生物學(xué)教學(xué)大綱中,已簡單介紹過蛋白質(zhì)、核酸、ATP的
結(jié)構(gòu)和功能、酶和酶特性以及蛋白質(zhì)的生物合成等知識,根據(jù)國際生
物學(xué)奧林匹克競賽綱要和全國中學(xué)生生物學(xué)競賽大綱(試行)的要求,
有關(guān)生物化學(xué)的內(nèi)容在競賽中經(jīng)常要用到的一些知識,還必須在原有
高中生物基礎(chǔ)上加以充實(shí)和提高。
(一)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和生物學(xué)功能
蛋白質(zhì)是構(gòu)成細(xì)胞和生物體的基本物質(zhì),占細(xì)胞干重的一半,生
物膜中蛋白質(zhì)的含量占60%?70%,蛋白質(zhì)在原生質(zhì)的有機(jī)成分中
占80%。所有蛋白質(zhì)的元素組成都很近似,都含有C、H、O、N四
種元素,其中平均含氮量約占16%,這是蛋白質(zhì)在元素組成上的一
個(gè)特點(diǎn)。蛋白質(zhì)是一類極為復(fù)雜的含氮高分子化合物,其基本組成單
位是氨基酸。
1.蛋白質(zhì)的基本組成單位——氨基酸
H
組成蛋白質(zhì)的氨基酸有20種,其中19種結(jié)構(gòu)可用通式R-卜COOH
NHj
表示。另一種為脯氨酸,它也有類似結(jié)構(gòu),但側(cè)鏈與氮原子相接形成
亞氨基酸。除甘氨酸外,蛋白質(zhì)中的氨基酸都具有不對稱碳原子,都
有L—型與D一型之分,為區(qū)別兩種構(gòu)型,通過與甘油醛的構(gòu)型相比
較,人為地規(guī)定一種為L型,另種為D一型。當(dāng)書寫時(shí)一NH2寫在
左邊為L型,一NH2在右為D一型。已知天然蛋白質(zhì)中的氨基酸都
屬L型。
20種基本氨基酸中,有許多是能在生物體內(nèi)從其他化合物合成
的。但其中有8種氨基酸是不能在人體內(nèi)合成的,叫必需氨酸。它們
是:蘇氨酸(Thr)、亮氨酸(Leu)、異亮氨酸(lie)、甲硫酸(Met)、
苯丙氨酸(Phe)^色氨酸(Try)、賴氨酸(Lys)和綴氨酸(Vai)。
20種氨基酸的分類,主要是根據(jù)R基來區(qū)分的。早些年根據(jù)R基的
結(jié)構(gòu)把氨基酸分為脂肪族、芳香族和雜環(huán)族三類,其中脂肪族又分為
中性(一氨基一竣基)、酸性(一氨基二竣基)和堿性(二氨基一竣
基)氨基酸。近年來都按R基的極性來區(qū)分氨酸的種類。
對于含有一個(gè)氨基和一個(gè)竣基的a-氨基酸來說,在中性溶液中
或固體狀態(tài)下,是以中性分子的形式還是以兩性離子的式存在呢?許
多實(shí)驗(yàn)證明主要是以兩性離子的形式存在。
+
NH2NH3
H-C—COOHH—C-OOQ-
II
RR
中性分子形式兩性離子形式
氨基酸由于含有氨基和竣基,因此在化學(xué)性質(zhì)上表現(xiàn)為是的一種
兼有弱堿和弱酸的兩性化合物。氨基酸在溶液中的帶電狀態(tài),會隨著
溶液的pH值而變化,如果氨基酸的凈電荷等于零,在外加電場中不
發(fā)生向正極或負(fù)極移動(dòng)的現(xiàn)象,在這種狀態(tài)下溶液的pH值稱為其等
電點(diǎn),常用pl表示。由于各種氨基酸都有特定的等電點(diǎn),因此當(dāng)溶
液的pH值低于某氨基酸的等電點(diǎn)時(shí),則該氨基酸帶凈正電荷,在電
場中向陰極移動(dòng)。若溶液的pH值高于某氨基酸的等電點(diǎn)時(shí),則該氨
基酸帶凈負(fù)電荷,在電場中向陽極移動(dòng)。氨基酸等電點(diǎn)的計(jì)算方法:
對于單氨基單竣基的氨基酸,其等電點(diǎn)是pK和Pk2的算術(shù)平均值,
即從pI=l/2(pK,+pK2)公式中求得;對于含有3個(gè)可解離基團(tuán)的
氨基酸來說,只要依次寫出它從酸性經(jīng)過中性至堿性溶溶解高過程中
的各種離子形式,然后取兩性離子兩側(cè)的pK值的算術(shù)平均值,即可
得其pl值。例如Asp解離時(shí),有3個(gè)pK值,在不同pH條件下可以
有4種離子形式,如下圖所示。
COOHcooOOO"產(chǎn)f
1\I
+OH-.+OH-.
CHNH/CHNH;CHNH;CHNH:
r+H*11+H*|
CH?pKi=2.09CH:pK=3.86
2CH2PKJ=9.82CH2
(or-COOH)
11(P-OOOH)1(a-NH;)1
COOHOQOH000-GOO
Asp*1
AspAsp*Asp二
pH<1.0pHJ.O左右pH6~8pH>11.0
在等電點(diǎn)時(shí),兩性離子形式主要是Asp1',毗Asp的pl=l/2(pK]
+pK2)=1/2(2.09+3.86)=2.98。同樣方法可以求得其他含有3
個(gè)pK值的氨基酸的等電點(diǎn)。各種氨基酸在可見光區(qū)都沒有光吸收,
而在紫外光區(qū)僅色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸有吸收能力。其中色氨酸
的最大吸收波長為279nm,酪氨酸的最大吸收波長為278nm,苯丙氨
酸的為259nm。利用紫外光法可以測定這些氨基酸的含量。蛋白質(zhì)在
280nm的紫外光吸收絕大部分是由色氨酸和酪氨酸所引起的。因此測
定蛋白質(zhì)含量時(shí),用紫外分光光度法測定蛋白質(zhì)在280nm的光吸收
值是一種既簡便而又快速的方法。
2.蛋白質(zhì)的化學(xué)結(jié)構(gòu)與空間結(jié)構(gòu)
組成蛋白質(zhì)的氨基酸,是借助肽鍵連接在一起的。肽鍵是由一個(gè)
氨基酸分子中的a氨基與相鄰的另一個(gè)氨基酸分子中a-竣基,通過
失水縮合而成,這樣連起來的氨基酸聚合物叫做肽。肽鏈上的各個(gè)氨
基酸,由于在相互連接的過程中丟失了a-氨上的H和a-竣基上
的OH,被稱之為氨基酸殘基。在多肽鏈一端氨基酸含有一個(gè)尚未反
應(yīng)的游離氨基(一NH2),稱為肽鏈的氨末端氨基酸或N末端氨基酸;
另一端的氨基酸含有一個(gè)尚未反應(yīng)的游離竣基(一COOH),稱為肽
鏈的竣基末端氨基酸或C末端氨基酸。一般表示多肽鏈時(shí),總是把N
末端寫在左邊,C末端寫右邊。合成肽鏈時(shí),合成方向是從N末端開
始,逐漸向C末延伸。
各種蛋白質(zhì)分子都有特定的空間結(jié)構(gòu),即構(gòu)象。
蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu):又稱初級結(jié)構(gòu)或化學(xué)結(jié)構(gòu),是指組成蛋質(zhì)分
子的多肽鏈中氨基酸的數(shù)目、種類和排列順序,多肽鏈的數(shù)目,同時(shí)
也包括鏈內(nèi)或鍵間二硫鍵的數(shù)目和位置等。蛋白質(zhì)分子的一級結(jié)構(gòu)是
由共價(jià)鍵形成的,肽鍵和二硫鍵都屬于共價(jià)鍵。肽鍵是蛋白質(zhì)分子中
氨基酸連接的基本方式,形成共價(jià)主鏈。二硫鍵(一S-S)是由兩個(gè)
半胱氨酸(殘基)脫氫連接而成的,是連接肽鏈內(nèi)或肽鏈間的主要化
學(xué)鍵。二硫鍵在蛋白質(zhì)分子中起著穩(wěn)定肽鏈空間結(jié)構(gòu)的作用,往往與
生物活力有關(guān)。二硫鍵被破壞后,蛋白質(zhì)或多肽的生物活力就會喪失。
蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)中,二硫鍵的數(shù)目多,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性就越強(qiáng)。在生
物體內(nèi)起保護(hù)作用的皮、角、毛發(fā)的蛋白質(zhì)中,二硫鍵最多。
蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu):是指多肽鏈本身折疊和盤繞方式,是指蛋白
質(zhì)分子中的肽鏈向單一方向卷曲而形成的有周期性重復(fù)的主體結(jié)構(gòu)
或構(gòu)象。這種周期性的結(jié)構(gòu)是以肽鏈內(nèi)或各肽鏈間的氫鍵來維持。常
見的二級結(jié)構(gòu)有a-螺旋、B-折疊、B-轉(zhuǎn)角等。例如動(dòng)物的各種
纖維蛋白,它們的分子圍繞一個(gè)縱軸纏繞成螺旋狀,稱為a-螺旋。
相鄰的螺旋以氫鍵相連,以保持構(gòu)象的穩(wěn)定。指甲、毛發(fā)以及有蹄類
的蹄、角、羊毛等的成分都是呈a-螺旋的纖維蛋白,又稱a-角蛋
白。B-折疊片是并列的比a-螺旋更為伸展的肽鏈,互相以氫鑄連
接起來而成為片層狀,如蠶絲、蛛絲中的B-角蛋白。
蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu):是指在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,進(jìn)一步卷曲折疊,
構(gòu)成一個(gè)很不規(guī)則的具有特定構(gòu)象的蛋白質(zhì)分子。維持三級結(jié)構(gòu)的作
用力主要是一些所謂弱的相互作用,即次級鍵或稱非共價(jià)鍵,包括氫
鍵、鹽鍵、疏水鍵和范德華力等。鹽鍵又稱離子健,是蛋白質(zhì)分子中
正、負(fù)電荷的側(cè)鏈基團(tuán)互相接近,通過靜電吸引而形成的,如竣基和
氨基、胭基、咪哇基等基團(tuán)之間的作用力。疏水鍵是多肽鏈上的某些
氨基酸的疏水基團(tuán)或疏水側(cè)鏈(非極性側(cè)鏈)由于避開水而造成相互
接近、粘附聚集在一起。它在維持蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)方面占有突出地位。
范德華引力是分子之間的吸引力。此外二硫鍵也對三級結(jié)構(gòu)的構(gòu)象起
穩(wěn)定作用。
具有三級結(jié)構(gòu)的球蛋白是一類比纖維蛋白的構(gòu)象更復(fù)雜的蛋白
質(zhì)。肽鏈也有a-螺旋、B-折疊片等構(gòu)象單元,這些構(gòu)象單元之間
由肽鏈中不規(guī)則卷曲的肽段相連接,使整個(gè)肽鑄折疊成近乎球狀的不
規(guī)則形狀。酶、多種蛋白質(zhì)激素、各種抗體以及細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞膜中的
蛋白質(zhì)都是球蛋白。和纖維蛋白不同,球蛋白的表面富有親水基團(tuán),
因此都能溶于水。
蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu):是由兩條或兩條以上的具有三級結(jié)構(gòu)的多肽
聚合而成特定構(gòu)象的蛋白質(zhì)分子。構(gòu)成功能單位的各條肽鏈,稱為亞
基,一般地說,亞基單獨(dú)存在時(shí)沒有生物活力,只有聚合成四級結(jié)構(gòu)
才具有完整的生物活性。例如,磷酸化酶是由2個(gè)亞基構(gòu)成的,谷氨
酸脫氫酶是由6個(gè)相同的亞基構(gòu)成的,血紅蛋白是由4個(gè)不同的亞基
(2個(gè)a肽鏈,2個(gè)B鏈)構(gòu)成的,每個(gè)鏈都是一個(gè)具三級結(jié)構(gòu)的球
蛋白。亞基聚合成四級結(jié)構(gòu),是通過分子表面的一些次級鍵,主要是
鹽鍵和氫鍵結(jié)合而聯(lián)系在一起的。有些蛋白質(zhì)分子只有一、二、三級
結(jié)構(gòu),并無四級結(jié)構(gòu),如肌紅蛋白、細(xì)胞色素C、核糖核酸酶、溶菌
酶等。另一些蛋白質(zhì),則一、二、三、四級結(jié)構(gòu)同時(shí)存在,如血紅蛋
白、過氧化氫酶、谷氨酸脫氫酶等。
3.蛋白質(zhì)的性質(zhì)及生物學(xué)功能
蛋白質(zhì)是由許多氨基酸分子組成的,分子量很大。所以它有的性
質(zhì)與氨基酸相同,有的性質(zhì)又與氨基酸不同,如膠體性質(zhì)、變構(gòu)作用
和變性作用等。
(1)膠體性質(zhì):蛋白質(zhì)分子量很大,容易在水中形成膠體粒,
具有膠體性質(zhì)。在水溶液中,蛋白質(zhì)形成親水膠體,就是在膠體顆粒
之外包含有一層水膜。水膜可以把各個(gè)顆粒相互隔開,所以顆粒不會
凝聚成塊而下沉。
(2)變構(gòu)作用:含2個(gè)以上亞基的蛋白質(zhì)分子,如果其中一個(gè)
亞基與小分子物質(zhì)結(jié)合,那就不但該亞基的空間結(jié)構(gòu)要發(fā)生變化,其
他亞基的構(gòu)象也將發(fā)生變化,結(jié)果整個(gè)蛋白質(zhì)分子的構(gòu)象乃至活性均
將發(fā)生變化,這一現(xiàn)象稱為變構(gòu)或別構(gòu)作用。例如,某些酶分子可以
和它所催化的最終產(chǎn)物結(jié)合,引起變構(gòu)效應(yīng),使酶的活力降低,從而
起到反饋抑制的效果。
(3)變性作用:蛋白質(zhì)在重金屬鹽(汞鹽、銀鹽、銅鹽等)、酸、
堿、乙醛、尿素等的存在下,或是加熱至70?100℃,或在X射線、
紫外線的作用下,其空間結(jié)構(gòu)發(fā)生改變和破壞,從而失去生物學(xué)活性,
這種現(xiàn)象稱為變性。變性過程中不發(fā)生肽鍵斷裂和二硫鍵的破壞,因
而不發(fā)生一級結(jié)構(gòu)的破壞,而主要發(fā)生氫鍵、疏水鍵的破壞,使肽鏈
的有序的卷曲、折疊狀態(tài)變?yōu)樗缮o序。
種類繁多的蛋白質(zhì)具有多種多樣的生物學(xué)功能,歸納起來主要具
有下列5個(gè)方面:(1)作為酶,蛋白質(zhì)具有催化功能。(2)作為結(jié)構(gòu)
成分,它規(guī)定和維持細(xì)胞的構(gòu)造。(3)作為代謝的調(diào)節(jié)者(激素或阻
遏物),它能協(xié)調(diào)和指導(dǎo)細(xì)胞內(nèi)的化學(xué)過程。(4)作為運(yùn)輸工具,它
能在細(xì)胞內(nèi)或者透過細(xì)胞膜傳遞小分子或離子。(5)作為抗體,它起
著保護(hù)有機(jī)體,防御外物入侵的作用。蛋白質(zhì)是一切生命現(xiàn)象不可缺
少的,即使像病毒、類病毒那樣以核酸為主體的生物,也必須在它們
寄生的活細(xì)胞的蛋白質(zhì)的作用下,才能表現(xiàn)出生命現(xiàn)象。
(-)核酸的結(jié)構(gòu)與生物學(xué)功能
核酸是生物體內(nèi)極其重要的生物大分子,是生命的最基本的物質(zhì)
之一。最早是瑞士的化學(xué)家米歇爾于1870年從膿細(xì)胞的核中分離出
來的,由于它們是酸性的,并且最先是從核中分離的,故稱為核酸。
核酸的發(fā)現(xiàn)比蛋白質(zhì)晚得多。核酸分為脫氧核糖核酸(簡稱DNA)
和核糖核酸(簡稱RNA)兩大類,它們的基本結(jié)構(gòu)單位都是核甘酸
(包含脫氧核甘酸)。
1.核酸的基本單位―核甘酸
每一個(gè)核甘酸分子由一分子戊糖(核糖或脫氧核糖)、一分子磷
酸和一分子含氮堿基組成。堿基分為兩類:一類是喋吟,為雙環(huán)分子;
另一類是口密咤,為單環(huán)分子。喋吟一般均有A、G2種,口密咤一般有
C、T、U3種。這5種堿基的結(jié)構(gòu)式如下圖所示。
喋吟g)朦黑蜂(A)鳥/吟(G)
由上述結(jié)構(gòu)式可知:腺喋吟是喋吟的6位碳原子上的H被氨基
取代。鳥喋吟是喋吟的2位碳原子上的H被氨基取代,6位碳原子上
的H被酮基取代。3種喀咤都是在口密咤2位碳原子上由酮基取代H,
在4位碳原子上由氨基或酮基取代H而成,對于T,喀咤的5位碳原
子上由甲基取代了Ho凡含有酮基的喀咤或口票吟在溶液中可以發(fā)生酮
式和烯醇式的互變異構(gòu)現(xiàn)象。結(jié)晶狀態(tài)時(shí),為這種異構(gòu)體的容量混合
物。在生物體內(nèi)則以酮式占優(yōu)勢,這對于核酸分子中氫鍵結(jié)構(gòu)的形成
非常重要。例如尿口密咤的互變異構(gòu)反應(yīng)式如下圖。
酮式(2,4-二氧口密嚏)烯酸式(2,4-二羥喀
咤)
在一些核酸中還存在少量其他修飾堿基。由于含量很少,故又稱
微量堿基或稀有堿基。核酸中修飾堿基多是4種主要堿基的衍生物。
tRNA中的修飾堿基種類較多,如次黃喋吟、二氫尿啼咤、5-甲基尿
口密咤、4-硫尿嗑咤等,tRNA中修飾堿基含量不一,某些tRNA中的
修飾堿基可達(dá)堿基總量的10%或更多。
核昔是核糖或脫氧核糖與喋吟或口密嗟生成的糖甘。戊糖的第1碳
麻(G)通常與喋吟的第9氮原子或喀咤的第1氮原子相連。在tRNA
中存在少量5-核糖尿嗑咤,這是一種碳甘,其C1是與尿喀咤的第5
位碳原子相連,因?yàn)檫@種戊糖與堿基的連接方式特殊(為C-C連接),
故稱為假尿昔如下圖。
腺昔(A)脫氧胸昔(dT)假尿甘(W)
核昔酸是由核昔中糖的某一羥基與磷酸脫水縮合而成的磷酸酯。
核甘酸的核糖有3個(gè)自由的羥基,可與磷酸酯化分別生成2,-、3'
-和5'-核甘酸。脫氧核甘酸的脫氧核糖只有2個(gè)自由羥基,只能
生成3'-和5'-脫氧核甘酸。生物體內(nèi)游離存在的核甘酸都是5'
-核甘酸。以RNA的腺甘酸為例:當(dāng)磷酸與核糖5位碳原子上羥基
縮合時(shí)為5'-腺甘酸,用5'-AMP表示;當(dāng)磷酸基連接在核糖3
位或2位碳原子上時(shí),分別為3'-AMP和2'-AMPo5'-腺普
酸和3'-脫氧胞甘酸的結(jié)構(gòu)式如下圖所示。
5'-腺甘酸A3,-胞嗑庭脫氧核普
(5'-AMP)(3Z-dCMP)
核甘酸結(jié)構(gòu)也可以用下面簡式(如下圖)表示。B表示喋吟或口密
咤堿基,直線表示戊糖,P表示磷酸基。
BBB
2,、l/P
、P3'p
、5,
2'-核甘酸3'-核甘酸5'-核甘酸
3'-或5'-核甘酸簡式也可分別用Np和pN表示(N代表核
昔)。即當(dāng)P在N右側(cè)時(shí)為3'-核昔核,P在N左側(cè)的為5'-核
甘酸,如3'-核甘酸和5'-核甘酸可分別用Ap和pA表示。
在生物體內(nèi),核甘酸除了作為核酸的基本組成單位外,還有一些
核甘酸類物質(zhì)自由存在于細(xì)胞內(nèi),具有各種重要的生理功能。
(1)含高能磷酸基的ATP類化合物:5'-腺甘酸進(jìn)一步磷酸
化,可以形成腺甘二磷酸和腺甘三磷酸,分別為ADP和ATP表示。
ADP是在AMP接上一分子磷酸而成,ATP是由AMP接上一分子焦
磷酸(PPi)而成,它們的結(jié)構(gòu)式如下圖所示。
fb
l(T
pI
P=POP
HO-=H0-H
OooO
腺甘二磷酸(ADP)腺甘三磷酸(ATP)
這類化合物中磷酸之間是以酸酎形式結(jié)合成鍵,磷酸酊鍵具有很
高的水解自由能,習(xí)慣上稱為高能鍵,通常用“?”表示。ATP分子
中有2個(gè)磷酸配鍵,ADP中只含1個(gè)磷酸酎鍵。
在生活細(xì)胞中,ATP和ADP通常以Mg2+或Mi?+鹽的復(fù)合物形
式存在。特別是ATP分子上的焦磷酸基對二價(jià)陽離子有高親和力;
加上細(xì)胞內(nèi)常常有相當(dāng)高濃度的Mg2+,使ATP對Mg2+的親和力遠(yuǎn)
大于ADP。在體內(nèi),凡是有ATP參與的酶反應(yīng)中,大多數(shù)的ATP是
以Mg2+—ATP復(fù)合物的活性形式起作用的。當(dāng)ATP被水解時(shí),有兩
種結(jié)果:一是水解形成ADP和無機(jī)磷酸;另一種是水解生成AMP
和焦磷酸。ATP是大多數(shù)生物細(xì)胞中能量的直接供體,ATP—ADP循
環(huán)是生物體系中能量交換的基本方式。
在生物細(xì)胞內(nèi)除了ATP和ADP外,還有其他的5'-核昔二磷
酸和三磷酸,如GDP、CDP、UDP和GTP、CTP、UTP;5'-脫氧
核昔二磷酸和三磷酸,如dADP、dGDP、dTDP、dCDP和dATP、
dCTP、dGTP、dTTP,它們都是通過ATP的磷酸基轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)化來的,
因此ATP是各種高能磷酸基的主要來源。除ATP外,由其他有機(jī)堿
構(gòu)成的核甘酸也有重要的生物學(xué)功能,如鳥普三磷酸(GTP)是蛋白
質(zhì)合成過程中所需要的,鳥昔三磷酸(UTP)參與糖原的合成,胞昔
三磷酸(CTP)是脂肪和磷脂的合成所必需的。還有4種脫氧核糖核
甘的三磷酸酯。即dATP、dCTP、dGTP、dTTP則是DNA合成所必
需的原材料。
(2)環(huán)狀核甘酸;核甘酸可在環(huán)化酶的催化下生成環(huán)式的一磷
酸核甘。其中以3',5'-環(huán)狀腺甘酸(以cAMP)研究最多,它是
由腺甘酸上磷酸與核糖3',5'碳原子酯化而形成的,它的結(jié)構(gòu)式如
下圖所示。
3'.5'-環(huán)腺昔酸(cAMP)
正常細(xì)胞中cAMP的濃度很低。在細(xì)胞膜上的腺甘酸環(huán)化酶和
Mg2+存在下,可催化細(xì)胞中ATP分子脫去一個(gè)焦磷酸而環(huán)化成
cAMP,使cAMP的濃度升高,但cAMP又可被細(xì)胞內(nèi)特異性的磷酸
二酯酶水解成5'-AMP,故cAMP的濃度受這兩種酶活力的控制,
使其維持一定的濃度。該過程可簡單表示如下:
腺甘酸環(huán)化酶入、cl2加布公硝酸二酯,,八、n
ATP----布丁*cAM71P+焦磷酸~五石方/*5-AM71P
現(xiàn)認(rèn)為cAMP是生物體內(nèi)的基本調(diào)節(jié)物質(zhì)。它傳遞細(xì)胞外的信
號,起著某些激素的“第二信使”作用。不少激素的作用是通過cAMP
進(jìn)行的,當(dāng)激素與膜上受體結(jié)合后,活化了腺甘酸環(huán)化酶,使細(xì)胞內(nèi)
的cAMP含量增加。再通過cAMP去激活特異性的蛋白激酶,由激
酶再進(jìn)一步起作用。近年來發(fā)現(xiàn)3'、5'-環(huán)鳥甘酸(cGMP)也有
調(diào)節(jié)作用,但其作用與cAMP正好相拮抗。它們共同調(diào)節(jié)著細(xì)胞的生
長和發(fā)育等過程。止匕外,在大腸桿菌中cAMP也參與DNA轉(zhuǎn)錄的調(diào)
控作用。
2.核酸的化學(xué)結(jié)構(gòu)(或一級結(jié)構(gòu))
核酸分子是由核甘酸單體通過3',5'-磷酸二酯鍵聚合而成的
多核甘酸長鏈。核甘酸單體之間是通過
脫水縮合而成為聚合物的,這點(diǎn)與蛋白
質(zhì)的肽鏈形成很相似。在脫水縮合過程
中,一個(gè)核甘酸中的磷酸給出一個(gè)氫原子;另一個(gè)相鄰核甘酸中的戊
糖給出一個(gè)羥基,產(chǎn)生一分子水,每個(gè)單體便以磷酸二酯鍵的形式連
接起來。由許多個(gè)核甘酸縮合而形成多核甘酸鏈。如果用脾磷酸二酯
酶來水解多核甘酸鏈,得到的是3'-核甘酸,而用蛇毒磷酸二酯酶
來水解得到的卻是5'-核甘酸。這證明多核甘酸鏈?zhǔn)怯蟹较虻?,?/p>
端叫3'-未端,一端叫5'?■末端。所謂3'-末端是指多核甘酸
鏈的戊糖上具有3'-磷酸基(或羥基)的末端,而具有5'-磷酸
基(或羥基)的末端則稱為5'末-端。多核甘酸鏈兩端的核甘酸為
末端核甘酸,末端磷酸基與核音相連的鍵稱為磷酸單酯鍵。書寫多核
甘酸鏈時(shí),通常將5'端寫在左邊,3'端寫在右邊。但在書寫一條
互補(bǔ)的雙鏈DNA時(shí)-,由于二條鏈?zhǔn)欠聪蚱叫械?,因此每條鏈的末端
必須注明5'或3'。通常寡核甘酸鏈可用右面的簡式表示(如右圖所
SO
述簡式還可簡化為pApCpGpUoH,若進(jìn)一步簡化,還可將核甘酸
鏈中的p省略,或在核甘酸之前加小點(diǎn),則變?yōu)镻ACGUOH或
pA?C?G?UOHO
3.核酸的性質(zhì)
(1)一般性質(zhì)
核酸和核甘酸既有磷酸基,又有堿性基團(tuán),為兩性電解質(zhì),因磷
酸的酸性強(qiáng),通常表現(xiàn)為酸性。核酸可被酸、堿或酶水解成為各種組
分,其水解程度因水解條件而異。RNA在室溫條件下被稀堿水解成
核甘酸而DNA對堿較穩(wěn)定,常利用該性質(zhì)測定RNA的堿基組成或
除去溶液中的RNA雜質(zhì)。DNA為白色纖維狀固體,RNA為白色粉
末;都微溶于水,不溶于一般有機(jī)溶劑。常用乙醇從溶液中沉淀核酸。
(2)核酸的紫外吸收性質(zhì)
核酸中的喋吟堿和喀I定堿均具有共麗雙鍵,使堿基、核甘、核普
酸和核酸在240?290nm的紫外波段有一個(gè)強(qiáng)烈的吸收峰,最大吸收
值在260nm附近。不同的核甘酸有不同的吸收特性。由于蛋白質(zhì)在
這一光區(qū)僅有很弱的吸收,蛋白質(zhì)的最大吸收值在280nm處,利用
這一特性可以鑒別核酸純度及其制劑中的蛋白質(zhì)雜質(zhì)。
(3)核酸的變性和復(fù)性
①核酸的變性:是指核酸雙螺旋區(qū)的氫鍵斷裂,堿基有規(guī)律的堆
積被破壞,雙螺旋松散,發(fā)生從螺旋到單鍵線團(tuán)的轉(zhuǎn)變,并分離成兩
條纏繞的無定形的多核甘酸單鍵的過程。變性主要是由二級結(jié)構(gòu)的改
變引起的,因不涉及共價(jià)鍵的斷裂,故一級結(jié)構(gòu)并不發(fā)生破壞。多核
甘酸骨架上共價(jià)鍵(3',5,一磷酸二酯?。┑臄嗔逊Q為核酸的降解,
降解引起核酸分子量降低。引起核酸變性的因素很多,如加熱引起熱
變性,pH值過低(如pHV4=的酸變性和pH值過高(pH>11.5)的
堿變性,純水條件下引起的變性以及各種變性試劑,如甲醇、乙醇、
尿素等都能使核酸變性。此外,DNA的變性還與其分子本身的穩(wěn)定
性有關(guān),由于C—C中有三對氫健而A—T對只有兩對氫鍵,故C+
G百分含量高的DNA分子就較穩(wěn)定,當(dāng)DNA分子中A+T百分含量
高時(shí)就容易變性。環(huán)狀DNA分子比線形DNA要穩(wěn)定,因此線狀
DNA較環(huán)狀DNA容易變性。
核酸變性后,一系列物理和化學(xué)性質(zhì)也隨之發(fā)生改變,如260nm
區(qū)紫外吸收值升高,粘度下降,浮力密度升高,同時(shí)改變二級結(jié)構(gòu),
有的可以失去部分或全部生物活性。DNA的加熱變性一般在較窄的
溫度范圍內(nèi)發(fā)生,很像固體結(jié)晶物質(zhì)在其熔點(diǎn)突然熔化的情況,因此
通常把熱變性溫度稱為“熔點(diǎn)”或解鍵溫度,用Tm表示。對DNA
而言,通常把DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)失去一半時(shí)的溫度(或變性量達(dá)最
大值的一半時(shí)的溫度)稱為該DNA的熔點(diǎn)或解鏈溫度。在此溫度可
由紫外吸收(或其他特性)最大變化的半數(shù)值得到。DNA的Tm值
一般在70℃?85℃。RNA變性時(shí)發(fā)生與DNA變性時(shí)類似的變化,
但其變化程度不及DNA大,因?yàn)镽NA分子中只有部分螺旋區(qū)。
②核酸的復(fù)性:變性DNA在適當(dāng)條件下,又可使兩條彼此分開
的鏈重新締合成為雙螺旋結(jié)構(gòu),這個(gè)過程稱為復(fù)性。DNA復(fù)性后,
許多物理、化學(xué)性質(zhì)又得到恢復(fù),生物活性也可以得到部分恢復(fù)。
DNA的片段越大,復(fù)性越慢;DNA的濃度越高,復(fù)性越快。
DNA或RNA變性或降解時(shí),其紫外吸收值增加,這種現(xiàn)象叫做
增色效應(yīng),與增色效應(yīng)相反的現(xiàn)象稱為減色效應(yīng),變性核酸復(fù)性時(shí)則
發(fā)生減色效應(yīng)。它們是由堆積堿基的電子間相互作用的變化引起的。
(三)酶的特點(diǎn)及功能
酶是由活細(xì)胞產(chǎn)生的、具有催化活性和高度專一性的特殊蛋白
質(zhì)。酶被稱為生物催化劑。生物體內(nèi)錯(cuò)綜復(fù)雜的代謝反應(yīng)必須具有酶
才能按一定規(guī)律有條不紊地進(jìn)行。酶缺陷或酶活性被抑制都會引起疾
病。例如,人體缺乏酪氨酸酶會引起白化病。許多中毒性疾病,如有
機(jī)磷中毒、鼠化物中毒、重金屬的中毒等,都是由于某些酶的活性被
抑制所引起的。
1.酶促反應(yīng)的特點(diǎn)
酶是生物催化劑,因而它既有與一般催化劑相同的性質(zhì),也有與
一般催化劑不同的特點(diǎn)。酶和一般催化劑的共同點(diǎn)是:①酶在催化反
應(yīng)加快進(jìn)行時(shí),在反應(yīng)前后酶本身沒有數(shù)量和性質(zhì)上的改變,因而很
少量的酶就可催化大量的物質(zhì)發(fā)生反應(yīng)。②酶只能催化熱力學(xué)上允許
進(jìn)行的反應(yīng),而不能使本來不能進(jìn)行的反應(yīng)發(fā)生。③酶只能使反應(yīng)加
快達(dá)到平衡,而不能改變達(dá)到平衡時(shí)反應(yīng)物和產(chǎn)物的濃度。因此,酶
既能加快正反應(yīng)進(jìn)行,也能加快逆反應(yīng)進(jìn)行。酶促反應(yīng)究竟朝哪個(gè)方
向進(jìn)行,取決于反應(yīng)物和產(chǎn)物的濃度。酶與一般的催化劑相比又有其
特點(diǎn),最突出的是它的高效性和專一性。
2.酶的化學(xué)本質(zhì)
通過對酶的性質(zhì)、組成和結(jié)構(gòu)等等方面的研究證實(shí),酶是蛋白質(zhì)
(也有RNA)。蛋白質(zhì)分為簡單蛋白質(zhì)和結(jié)合蛋白質(zhì)兩大類。酶按照
化學(xué)組成也可分為單純酶和結(jié)合酶兩大類。服酶、胃蛋白酶和核糖核
酸酶等一般水解酶都屬于簡單蛋白質(zhì),這些酶只由氨基酸組成,此外
不含其他成分。轉(zhuǎn)氨酶、碳酸酎酶、乳酸脫氫酶及其他氧化還原酶等
均屬于結(jié)合蛋白質(zhì)。這些酶除了蛋白質(zhì)組分外,還含有對熱穩(wěn)定的非
蛋白的小分子物質(zhì),前者稱酶蛋白,后者稱輔因子。酶蛋白與輔因子
單獨(dú)存在時(shí)一,均無催化活力,只有二者結(jié)合成完整的分子時(shí);才具有
活力。此完整的酶分子稱為全酶(全酶=酶蛋白十輔因子)。有的酶
的輔因子是金屬離子,有的是小分子有機(jī)化合物。通常將這些小分子
有機(jī)化合物稱為輔酶或輔基。輔酶或輔基并沒有本質(zhì)的差別,只不過
是它們與蛋白質(zhì)部分結(jié)合的牢固程度不同而已。通常把與酶蛋白結(jié)合
比較松的,用透析法可除去的小分子有機(jī)物稱為輔酶;反之為輔基。
在酶的催化過程中,輔酶或輔基的作用是作為電子、原子或某些基團(tuán)
的載體參與反應(yīng)并促進(jìn)整個(gè)催化過程。金屬在酶分子中或作為酶活性
部位的組成成分,或幫助形成酶活性所必需的構(gòu)象。一種輔酶常可與
多種不同的酶蛋白結(jié)合而組成具有不同專一性的全酶。可見決定酶催
化專一性的是酶的蛋白質(zhì)部分。
3.酶的活性中心和必需基團(tuán)
酶作為蛋白質(zhì),其分子比大多數(shù)底物要大得多,因此在反應(yīng)過程
中酶與底物的接觸只限于酶分子的少數(shù)基團(tuán)或較小的部位。因分子中
雖然有許多基團(tuán),但并不是所有的基團(tuán)都與酶的活性有關(guān),其中有些
基團(tuán)若經(jīng)化學(xué)修飾(如氧化、還原、?;?、烷化等)使其改變,則酶
的活性喪失,這些基團(tuán)就稱為必需基團(tuán)。常見的必需基團(tuán)有Ser的羥
基,His的咪哇基,Cys的筑基,Asp、Glu的側(cè)鏈竣基等。
活性中心(或稱活性部位)是指酶分子中直接和底物結(jié)合,并和
酶催化作用直接有關(guān)的部位。對于單純酶來說,它是由一些氨基酸殘
基的側(cè)鏈基團(tuán)組成的。對于結(jié)合酶來說,輔酶或輔基上的某一部分結(jié)
構(gòu)往往也是活性部位的組成部分。
酶的活性中心的必需基團(tuán)可分為兩種:一種是與作用物結(jié)合的必
需基團(tuán),稱為結(jié)合基團(tuán),它決定酶的專一性;另一種是促進(jìn)作用物發(fā)
生化學(xué)變化的基團(tuán),稱為催化基團(tuán),它決定酶的催化能力。但也有些
必需基團(tuán)同時(shí)具有這兩種作用。另外還有些必需基團(tuán)位于酶活性中心
以外的部位,但仍是維持酶催化作用所必需的,這種稱為酶活性中心
以外的必需基團(tuán)。由此可見,酶除了活性中心以外,其他部分并不是
可有可無的。活性中心必需基團(tuán)的作用,一方面使底物與酶依一定構(gòu)
型而結(jié)合成為復(fù)合物,這樣有利于相互影響和作用;另一方面影響底
物分子某些鍵的穩(wěn)定性,鍵被打斷或形成新的鍵,從而催化其轉(zhuǎn)變。
某些酶,特別是一些與消化作用有關(guān)的酶,在最初合成和分泌時(shí),
沒有催化活性,這種沒有活性的酶的前體稱為“酶原”。酶原在一定
條件下經(jīng)適當(dāng)?shù)奈镔|(zhì)作用可轉(zhuǎn)變?yōu)橛谢钚缘拿?。酶原轉(zhuǎn)變成酶的過程
稱為酶原的激活。這個(gè)過程實(shí)質(zhì)上是酶活性部位形成或暴露的過程。
4,酶的催化機(jī)理
個(gè)反應(yīng)體系中,任何反應(yīng)物分子都有進(jìn)行化學(xué)反應(yīng)的可能,但并非全部反應(yīng)物分子都進(jìn)行反應(yīng)。因?yàn)樵诜磻?yīng)
體系中各個(gè)反應(yīng)物分子所含的能量高低不同,只有那些含能量達(dá)到或超過一定數(shù)值(此能量數(shù)值稱為此反應(yīng)的
能閾)的分子,才能發(fā)生反應(yīng),這些分子稱為活化分子,使一般分子變?yōu)榛罨肿铀璧哪芰浚捶肿蛹せ顟B(tài)
與基態(tài)之間的能量差)稱為活化能。在一個(gè)反應(yīng)體系中,活化分子越多,反應(yīng)就越快,設(shè)法增加活化分子的數(shù)
目就能加快反應(yīng)的速度。降低活化能,能使本來不夠活化水平的分子也成為活化分子,從而增加了活化分子的
數(shù)目?;罨苡档停瑒t活化分子的數(shù)目就愈多°陋的催化作用就是降低化學(xué)反應(yīng)的活化能,如下圖圖所示。
由于在催化反應(yīng)中只需較少的能量就可使反應(yīng)物進(jìn)入“激活態(tài)”,所以同非催化反應(yīng)相比,活化分子的數(shù)量大大
增加,從而加快了反應(yīng)速度。
自
由
能激活態(tài)
葬痂拔應(yīng)所
需活化自由能
罹論反應(yīng)所需
,活出包由能
反應(yīng)前后
自由能之差
反應(yīng)過程
非催化過程與催化過程自由能的變化
目前認(rèn)為酶降低活化能的原因在于酶參與了反應(yīng),即它先與底物
結(jié)合形成不穩(wěn)定的中間產(chǎn)物,然后使中間產(chǎn)物再分解,釋放出酶及生
成反應(yīng)產(chǎn)物。此過程可用下式表示:
扁LV與
這樣,把原來無酶參加的一步反應(yīng)S===P(能閾較高),變成能
閾較低的兩步反應(yīng)(S+E==ES和ES===E+P)o反應(yīng)的總結(jié)果是相
同的,但由于反應(yīng)的過程不同,活化能就大大降低了。這就是目前所
公認(rèn)的中間產(chǎn)物學(xué)說。關(guān)于酶與底物如何結(jié)合形成中間產(chǎn)物,又如何
完成催化作用,目前有鎖鑰學(xué)說和誘導(dǎo)契合學(xué)說。
5.影響酶作用的因素
影響酶促反應(yīng)的因素有酶的濃度、底物濃度、
V
pH值、溫度、抑制劑和激活劑等。酶促反應(yīng)速度
0(E)
指的是反應(yīng)初速度,此時(shí)反應(yīng)速度與酶的濃度成正比關(guān)系,避免反應(yīng)
產(chǎn)物以及其他因素的影響。研究某一因素對酶促反應(yīng)速度的影響時(shí),
在保持其他因素不變的情況下,單獨(dú)改變研究的因素。
(1)酶的濃度;當(dāng)?shù)孜餄舛却蟠蟪^酶的濃度,酶的濃度與反
應(yīng)速度呈正比關(guān)系(見右圖所示)。
(2)底物濃度:在酶濃度不變的情況下,底vr____(Y),.
物濃度對反應(yīng)速度影響的作圖呈現(xiàn)矩形雙曲線
(見右圖所示)。當(dāng)?shù)孜餄舛群艿蜁r(shí),反應(yīng)速度隨°e⑸
底物濃度的增加而急驟加快,兩者呈正比關(guān)系。隨著底物濃度的升高,
反應(yīng)速度的增加幅度不斷下降。如果繼續(xù)加大底物濃度,其反應(yīng)速度
不再增加,說明酶已被底物所飽和。所有酶都有飽和現(xiàn)象,只是達(dá)到
飽和時(shí)所需的底物濃度各不相同。
(3)溫度:在一定的溫度范圍內(nèi)一般化學(xué)反應(yīng)速度均隨溫度升
高而加快,酶促反應(yīng)也服從這個(gè)規(guī)律。酶是蛋白質(zhì),其本身因溫度升
高而達(dá)到一定高度時(shí)會變性,破壞其活性中心的結(jié)構(gòu),從而減低反應(yīng)
速度或完全失去其催化活性。在某一溫度時(shí),酶促反應(yīng)的速度最大,
此時(shí)的溫度稱為酶作用的最適溫度。
(4)pH:酶分子中含有許多極性基團(tuán),在不同的pH環(huán)境中,
這些基團(tuán)的解離狀態(tài)不同,所帶電荷的種類和數(shù)量也不盡相同,酶的
活性中心往往只處于某一解離狀態(tài)時(shí)最有利于同底物結(jié)合。酶催化活
性最大時(shí)的pH值稱為酶作用的最適pHo溶液的pH值高于或低于最
適pH時(shí)都會使酶的活性降低,遠(yuǎn)離最適pH值時(shí)甚至導(dǎo)致酶的變性
失活。
(5)激活劑和抑制劑:激活劑是指能增強(qiáng)酶活性的物質(zhì),如C1
一是唾液淀粉酶的激活劑。與激活劑相反,凡能降低酶的活性,甚至
使酶完全喪失活性的物質(zhì)稱為酶的抑制劑。抑制劑對酶活性的抑制作
用包括不可逆抑制和可逆抑制兩類:
①不可逆抑制作用,其抑制劑通常以共價(jià)鍵與酶活性中心上的必
需基團(tuán)相結(jié)合,使酶失活。如有機(jī)磷化合物能與許多種酶活性中心絲
氨酸殘基上的羥基結(jié)合,使酶失活。
②可逆的抑制作用:包括競爭性抑制與非競爭性抑制兩種。在競
爭性抑制中,抑制劑常與底物的結(jié)構(gòu)相似,它與底物共同競爭酶的活
性中心,從而阻礙底物與酶的結(jié)合,如丙二酸對琥珀酸脫氫酶的抑制。
非競爭性抑制中的抑制劑可以與酶活性中心外的部位可逆結(jié)合,這種
結(jié)合不影響酶對底物的結(jié)合。底物與抑制劑之間無競爭關(guān)系,但酶一
底物一抑制劑不能進(jìn)一步釋放出產(chǎn)物。對酶促反應(yīng)速度及其影響因素
的研究具有重要的理論和實(shí)踐意義。
(四)生物氧化
生物體需要的能量主要是通過代謝物在體內(nèi)氧化而獲得的。物質(zhì)
在生物體內(nèi)經(jīng)過氧化最后生成水和CO?并釋放能量的過程,稱為生物
氧化,由于這一過程是在組織細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行的,表現(xiàn)為細(xì)胞攝取。2而
釋放CO2,因此生物氧化又稱為組織呼吸或細(xì)胞呼吸。雖然糖、脂肪
及蛋白質(zhì)等在體內(nèi)外氧化分解,都產(chǎn)生水和CO2,并釋放出等量的能
量,但生物氧化與燃燒的過程有顯著不同:生物氧化反應(yīng)是在溫和的
條件下進(jìn)行的酶促反應(yīng),所釋放的能量,有一部分以化學(xué)能的形式儲
存在ATP分子中。
1.生物氧化的方式和酶類
(1)生物氧化中二氧化碳生成的方式
生物體內(nèi)二氧化碳的生成并不是物質(zhì)中所含的碳、氧原子的直接
化合,而是來源于糖、脂肪等轉(zhuǎn)變來的有機(jī)酸的脫竣。根據(jù)脫去二氧
化碳的竣基在有機(jī)酸分子中的位置,可將脫竣反應(yīng)分為a-脫竣與3
-脫竣兩種類型。有些脫竣反應(yīng)不伴有氧化,稱為單純脫竣;有些
則伴有氧化,稱為氧化脫竣。例如蘋果酸的氧化脫竣:
CH?—COOHCH3
浜果檢能
CHOH-COOH—5n-CO-COOH+CO.
(2)生物氧化中物質(zhì)氧化的方式
在化學(xué)反應(yīng)中,失電子、脫氫、加氧都屬于氧化;得電子、加氫、
脫氧都屬于還原。這種變化規(guī)律,無論在體內(nèi)或體外,都是一樣的。
不同的是,體內(nèi)氧化都是酶促反應(yīng)。常見的氧化類型有脫電子、脫氫、
加水脫氫和加氧反應(yīng)。生物體內(nèi)并不存在游離的電子或氫原子,在上
述氧化反應(yīng)中脫下的電子或氫原子必須為另一物質(zhì)所接受。這種既能
接受又能供出電子或氫原子的物質(zhì)稱為遞電子體或遞氫體。
(3)與生物氧化有關(guān)的酶類
①氧化酶類:能直接利用氧分子作為受氫體,其中氧化酶含銅,
反應(yīng)產(chǎn)物是水,如細(xì)胞色素氧化酶。
②需氧脫氫酶類:通常以黃素腺喋吟二核甘酸(FAD)為輔基,
反應(yīng)產(chǎn)物為過氧化氫。習(xí)慣上有時(shí)將需氧脫氫酶不嚴(yán)格地稱為氧化
酶,如黃喋吟氧化酶。
③不需氧脫氫酶:不能以氧分子而只能以體內(nèi)某些輔酶為直接受
氫體,這些輔酶包括尼克酰胺腺喋吟二核甘酸(NADP+)、尼克酰胺
腺喋吟二核甘酸磷酸(NAD+)、黃素單核甘酸(FMN)或黃素腺喋
吟二核昔酸(FAD)等。
2.生物氧化中水的生成
生物氧化中水的生成,即代謝物脫下的成對氫原子通過多種酶和
輔酶所組成的連鎖反應(yīng),逐步傳遞,使之最終與氧結(jié)合生成水。由遞
氫體和遞電子體按一定順序排列構(gòu)成的此連鎖反應(yīng)與細(xì)胞攝取氧的
呼吸過程有關(guān),通常稱為呼吸鏈。
(1)呼吸鏈的組成
呼吸鏈由許多個(gè)組分組成,參加呼吸鏈的氧化還原酶有尼克酰胺
脫氫酶類、黃素脫氫酶類、鐵硫蛋白類、細(xì)胞色素類、輔酶Q類等。
①尼克酰胺脫氫酶類:以NAD+、NADP+為輔酶,它們能夠可逆
地加氫還原、脫氫氧化,故可作為遞氫體而起作用。尼克酰胺只能接
受一個(gè)氫原子和一個(gè)電子,而另一個(gè)質(zhì)子則留在介質(zhì)中(如下圖所
于O
②黃素脫氫酶類:其輔基為FMN、FAD,其分子中都含有異咯
嗪。異咯嗪的1和5位的兩個(gè)氮原子都可以進(jìn)行脫氫和加氫反應(yīng),故
它們都可作為遞氫體(如下圖所示)。
R
③鐵硫蛋白類:其分子中含非嚇咻鐵和對酸不穩(wěn)定的硫,其作用
是借鐵的變價(jià)進(jìn)行電子傳遞:
Fe31+e===Fe21
因其分子中含有兩個(gè)活潑的硫和兩個(gè)鐵原子,故稱鐵硫中心。
④輔酶Q類:此類酶是一種脂溶性的酯類化合物,因廣泛存在
于生物界,故又名泛釀。其分子中的苯醍結(jié)構(gòu)能可逆地加氫還原而形
成對苯二酚衍生物,故屬于傳氫體。
⑤細(xì)胞色素類:細(xì)胞色素是一類以鐵咋琳為輔基的蛋白質(zhì),在呼
吸鏈中,也依靠鐵的化合價(jià)的變化而傳送電子。目前發(fā)現(xiàn)的細(xì)胞色素
有多種,包括a,a3,b,c,5等。不同種類的細(xì)胞色素的輔基結(jié)構(gòu)
及與蛋白質(zhì)連接的方式是不同的。在典型的線粒體呼吸鏈中,其順序
是bf“fcfaa3fo2,其中僅最后一個(gè)a?可被氧分子直接氧化,但
目前還不能把a(bǔ)和a3分開,故把a(bǔ)和a3合稱為細(xì)胞色素氧化酶。除
aa3外,其余的細(xì)胞色素中的鐵原子均與其外嚇啾環(huán)和蛋白質(zhì)形成六
個(gè)配位健,惟有aa3的鐵原子形成五個(gè)配位鍵,還保留一個(gè)配位鍵,
能。2、CO、CN-等結(jié)合,其正常功能是與氧結(jié)合。
(2)呼吸鏈中傳遞體的排列順序
呼吸鏈中傳遞體的排列順序是根據(jù)下列實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)確定的:
①根據(jù)呼吸鍵各組分的標(biāo)準(zhǔn)氧化還原電位,按氧還電位遞增的
順序依次排列;
②利用阻斷呼吸鍵的特殊抑制劑,阻斷鏈中某些特定的電子傳
遞環(huán)節(jié)。若加入某種抑制劑后,則在阻斷環(huán)節(jié)的負(fù)電子性側(cè)速電子體
(遞氫體)因不能再氧化而大多處于還原狀態(tài),但在阻斷環(huán)節(jié)的正電
子性側(cè)遞氫、送電子體不能被還原而大多處于氧化狀態(tài)。現(xiàn)已基本確
定的兩條主要的呼吸鏈中各傳遞體的排列順序如下:
(1)NADH氧化呼吸鍵(如下圖所示)。
r--2H'_-
fFMNH2],
隗、/NAD,kzCoQ、”2CytF+、,I*
?(Fe-S)JVYV
A/TFMN1A八J
Rj、NADH+Hl\|,、COQH2,、02
L(Fe-S)J
(2)琥珀酸氫化呼吸鏈(如下圖所示)。
(3)胞液中NADH及NADPH的氧化
NADH必須通過線粒體內(nèi)膜上的呼吸鏈,其中的氫才能被氧化成
水,但是在胞液中形成的NADH(見糖代謝)不能透過正常線粒體內(nèi)
膜,因此線粒體外的NADH尚需通過穿梭系統(tǒng)才能將氫帶入線粒體
內(nèi),而后進(jìn)行氧化?,F(xiàn)已證明,動(dòng)物體內(nèi)有下列兩種主要的穿梭系統(tǒng)。
①蘋果酸穿梭系統(tǒng)(如下圖所示)。
胞液內(nèi)展線粒體
率果酸穿梭系統(tǒng)
①蘋果酸脫氫酶:②谷草轉(zhuǎn)氨酶;①?④線粒體內(nèi)膜上的不同轉(zhuǎn)位酶
②a-磷酸甘油穿梭系統(tǒng)(如下圖所示)。
ZADH+H'_______,NAT)1
畸破/丙陽a-rtttHirt
—T崎陂:涇內(nèi)赭。-俏版tr油
線粒體FADHa.二FAD
內(nèi)膜?一1,八
ICoQfb_*cLcfaaLQ
a-磷酸甘油穿梭系統(tǒng)
①胞液中a-磷酸甘油脫氫酶(輔酶為NAD+)
②線粒體內(nèi)a-磷酸甘油脫氫酶(輸基為FAD)
3.ATP與能量的轉(zhuǎn)換和利用
生物體需要利用生物氧化過程中所釋放的能量維持生命活動(dòng)。生
物氧化所釋放的一部分能量以熱能形式散發(fā)于周圍環(huán)境中,約占總能
量的60%左右;另一部分則以化學(xué)能的形式儲存于某些特殊類型的
有機(jī)磷酸化合物之中。
(1)高能磷酸化合物的生成
在物質(zhì)氧化過程中大約有40%能量用于ADP的磷酸化合成
ATP,該過程有兩種方式:一是直接由代謝物分子轉(zhuǎn)移磷酸鍵至ADP,
以合成ATP,即所謂底物水平磷酸化;二是在呼吸鍵的電子傳遞過程
中偶聯(lián)的磷酸化,稱氧化磷酸化或電子傳遞水平磷酸化。
(2)氧化磷酸化的偶聯(lián)部位
根據(jù)下述實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)可以大致確定氧化磷酸化的偶聯(lián)部位,即ATP
的生成部位。
①P/O比值測定及意義:研究氧化磷酸化最常用的方法是測定
線粒體的P/O比值。該比值是指每消耗一摩爾氧原子所消耗無機(jī)磷
的摩爾數(shù),即合成ATP的摩爾數(shù)。代謝物脫下的一對氫原子通過
NADH呼吸鏈傳遞,P/O比值為3;若通過琥珀酸呼吸鏈傳遞,P
/O比值為2,即分別合成了3或2摩爾ATP。
②根據(jù)氧化還原電位之間的電位差計(jì)算能量:呼吸鏈中的三個(gè)偶
聯(lián)部位,亦可根據(jù)呼吸鏈傳遞過程中自由能的變化計(jì)算求得,三個(gè)
ATP分子的形成截獲了呼吸鏈中電子由NADH傳遞到氧所產(chǎn)生的全
部自由能的42%。
(3)氧化磷酸化的抑制作用
①呼吸鏈阻斷劑:能夠阻斷呼吸鏈中某一部位電子流的物質(zhì)稱為
電子傳遞阻斷劑或呼吸鍵阻斷劑。已知的阻斷劑及阻斷部。如下圖所
示。
作用物—NAD->[]-?CoQ-?Cytb-?Cytc.1-?Cytc-,Cytnaj-'Oa
7ttf
阿米妥抗騫*CO
魚/陰CN-
②解偶聯(lián)劑:解偶聯(lián)劑對于電子傳遞沒有抑制作用,只抑制由
ADP變?yōu)锳TP的磷酸化作用,即它使產(chǎn)能過程與貯能過程相脫離。2,
4-二硝基苯酚是最早發(fā)現(xiàn)的一種解偶聯(lián)劑。
磷酸肌酸是動(dòng)物體內(nèi)高能磷酸化合物的貯存形式。在酶的催化
下,ATP把高能磷酸鍵傳遞給肌酸,以生成磷酸肌酸。當(dāng)肌肉收縮時(shí),
除ATP直接分解供能外,磷酸肌酸又可以轉(zhuǎn)出高能磷酸鍵,使ADP
生成ATP,供組織利用。
二、典型例題
例1請用最簡便的方法,鑒別核糖、葡萄糖、果糖、蔗糖和淀
粉。
分析鑒別核糖、葡萄糖、果糖、蔗糖和淀粉最簡便的方法是顯
色法。首先在這五種糖中各加入適量碘液,只有淀粉變藍(lán)色,其余四
糖不變色。然后在除淀粉外的四糖中分別加適量的鹽酸和間苯二酚,
核糖呈綠色,葡萄糖呈淡紅色,果糖呈紅色,而蔗糖不變色。這一下
可鑒別出核糖和蔗糖。再在葡萄糖和果糖中分別加入幾滴清水,由于
葡萄糖具有還原性而使濱水褪色,果糖無還原性,不能使濱水褪色,
從而就能達(dá)到區(qū)分這兩種糖的目的。
【參考答案】
鑒別核糖、葡萄糖、果糖、蔗糖和淀粉的最簡便方法。
核糖葡賽糖果糖蔗糖淀粉
劑
礁液一一?——藍(lán)色
鹽酸、間茶二酚綠色淡紅色紅色——
裴林或本尼
紅黃色紅黃色紅黃色——
迪特試劑
加淡水褪色梃色——一
例2根據(jù)蛋白質(zhì)的有關(guān)知識回答下列問題:
(1)氨基酸的極性由什么決定?組成蛋白質(zhì)的20種氨基酸中具
有極性的氨基酸有多少種?
(2)組成蛋白質(zhì)的氨基酸中,哪一種不能參與形成真正的肽鍵?
為什么。
(3)什么是蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)(pl)?為什么說在等電點(diǎn)時(shí)蛋白
質(zhì)的溶解度最低?
分析(1)氨基酸的極性由其側(cè)鏈基團(tuán)(R)決定,組成蛋白
質(zhì)的20種氨基酸中具有極性的氨基酸有11種(2)組成蛋白質(zhì)的氨
基酸中,脯氨酸(Pro)不能參與形成真正的肽鎮(zhèn),因?yàn)镻ro是亞氨
基酸,沒有游離的氨基。(3)蛋白質(zhì)分子所帶凈電荷為零時(shí),溶液的
pH值為該蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)。處于等電點(diǎn)狀態(tài)的蛋白質(zhì)分子外層的凈
電荷被中和,分子之間相互聚集形成較大的顆粒而沉淀下來,故此時(shí)
蛋白質(zhì)的溶解度最低。
【參考答案】見分析過程。
例3(1)下列氨基酸的混合物在pH3.9時(shí)進(jìn)行紙電泳,指出
哪一些氨基酸朝正極移動(dòng),哪一些氨基酸如負(fù)極移動(dòng)?氨基酸混合物
的構(gòu)成為丙氨酸(Ala)、韁酸(Ser)、啊酸(Phe)、板酸(Leu)、
精氨酸(Arg)、天門冬氨酸(Asp)和組氨酸(His)。(2)具有相
同電荷的氨基酸,如Gly和Leu在紙電泳時(shí)總是稍稍分離,你能作出
解釋嗎?
(3)一個(gè)含有Ala、Vai、Glu、Lys和Thr的氨基酸混合物,在
pH6.0時(shí)進(jìn)行紙電泳,然后用苗三酮顯色。請畫出電泳后各氨基酸斑
點(diǎn)的位置,并標(biāo)明正極、負(fù)極、原點(diǎn)和不分開的氨基酸。
分析(1)因?yàn)锳la、Ser、Phe和Leu的等電點(diǎn)在pH6.0左右,
將其放在pH3.9條件下電泳時(shí),Ala、Ser、Phe和Leu都帶有電荷,
因此它們均向負(fù)極移動(dòng)。由于His和Arg等電點(diǎn)分別7.6和10.8,在
PH3.9時(shí)雖都帶正電荷,向負(fù)極移動(dòng),但因兩者帶正電荷數(shù)量不同,
因此兩者能分開。Asp的等電點(diǎn)是3.0,在pH3.9條件下帶負(fù)電荷,
故向正極移動(dòng)。
(2)在電泳時(shí),如果氨基酸帶有相同的電荷,則分子量大的氨
基酸比分子量小的氨基酸移動(dòng)慢些,由于Leu的分子量比Gly大,所
以Leu比Gly移動(dòng)慢,因此能達(dá)到稍稍分離的目的。
(3)在pH6.0時(shí),Ghi帶負(fù)電荷朝正極移動(dòng),Lys帶正電荷負(fù)
極移動(dòng)。Vai、Ala、Thr的等電點(diǎn)在pH6.0附近,移動(dòng)距離很小,故
不能完全分開。電泳后谷氨基酸斑點(diǎn)的位置如下圖所示。
【參考答案】見分析過程。
例4有一個(gè)蛋白質(zhì)分子在pH7的水溶液中可以折疊成球狀,通
常是帶極性側(cè)鏈的氨基酸位于分子外部,帶非極性側(cè)鏈的氨基酸位于
分子內(nèi)部。請回答:
(1)在Vai、Pro、Phe、Asp>Lys、lie和His中,哪些位于分
子內(nèi)部,哪些位于分子外部?
(2)為什么在球蛋白內(nèi)部和外部都能發(fā)現(xiàn)Gly和Ala?
(3)Ser>Thr、Asn和Gin都是極性氨基酸,為什么會在分子內(nèi)
部發(fā)現(xiàn)?
(4)在球蛋白的分子內(nèi)部和外部都能找到Gys,為什么?
分析(1)Vai、Pro、Phe、He是帶有非極性測鏈的氨基酸,這
些氨基酸殘基位于分子內(nèi)部;Asp、Lys、His是帶有極性側(cè)鍵的氨
基酸,這些氨基酸殘基位于分子的外部。
(2)因?yàn)锳la和Gly兩者的側(cè)鏈都比較小,疏水性和極性都??;
Gly只有一個(gè)H+與a-碳原子相連,Ala只有一(2出與a-碳原子相
連,故它們既可以出現(xiàn)在分子內(nèi)部,也可以出現(xiàn)在分子外部。
(3)Ser、Thr、Asn、Gin在pH7.0時(shí)含有不帶電荷的極性側(cè)鏈,
參與分子內(nèi)部的氫鍵形成,從而減少了它們的極性,故會在分子內(nèi)
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