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第三節(jié)方差分析根據(jù)實(shí)際情況確定線性模型,明確變異來(lái)源平方和與自由度的分解列方差分析表(做F測(cè)驗(yàn))多重比較/EMS估計(jì)總結(jié)/解釋方差分析的基本步驟用于方差分析的SAS過(guò)程主要有方差分析(ANOVA,analysisofvariance)、廣義線性模型(GLM,generallinearmodels)。此外還有方差分量估計(jì)(VARCOMP,variancecomponentsestimation)等。其中ANOVA一般用于平衡資料(資料中各因素均衡搭配且沒(méi)有發(fā)生數(shù)據(jù)缺失),非平衡資料的分析一般用GLM過(guò)程。方差分析的SAS分析ANOVA過(guò)程和GLM過(guò)程簡(jiǎn)介ANOVA過(guò)程ANOVA過(guò)程主要用于處理均衡設(shè)計(jì)(即:對(duì)于每個(gè)因素、每個(gè)水平的觀測(cè)數(shù)是相等的,另外還可以處理拉丁方設(shè)計(jì)、正交設(shè)計(jì)等)的一元、多元方差分析和重復(fù)測(cè)量的方差分析,也可用于多個(gè)變量的對(duì)比檢驗(yàn)。
PROCANOVA過(guò)程首先要檢查試驗(yàn)設(shè)計(jì)是否均衡,如果不均衡,也不是上面提到的幾種情況之一,就建議使用GLM過(guò)程。ANOVA過(guò)程和GLM過(guò)程最后需用QUIT語(yǔ)句退出。進(jìn)行方差分析的ANOVA過(guò)程PROC
ANOVA
[選擇項(xiàng)]FREQ變量表MODLE因變量=自變量CLASS變量BY變量表MEANS變量/選項(xiàng)CLASSACLASSABMODELY=AMODELY=ABMODELY=ABA*BY/LSDY/DUNCANY/SNKMODELy=ij(i)ANOVA過(guò)程語(yǔ)句格式:
PROCANOVA選擇項(xiàng)1;CLASS變量;MODEL因變量=效應(yīng)變量/選擇項(xiàng)2;MANOVAH=效應(yīng)變量E=效應(yīng)變量;BY變量;MEANS效應(yīng)變量/選擇項(xiàng)3;
RUN;ANOVA過(guò)程語(yǔ)句格式:
PROCANOVA選擇項(xiàng)1;CLASS變量;MODEL因變量=效應(yīng)變量/選擇項(xiàng)2;MANOVAH=效應(yīng)變量E=效應(yīng)變量;BY變量;MEANS效應(yīng)變量/選擇項(xiàng)3;
RUN;ANOVA過(guò)程語(yǔ)句格式:
PROCANOVA選擇項(xiàng)1;CLASS變量;MODEL因變量=效應(yīng)變量/選擇項(xiàng)2;MANOVAH=效應(yīng)變量E=效應(yīng)變量;BY變量;MEANS效應(yīng)變量/選擇項(xiàng)3;
RUN;不同的試驗(yàn)設(shè)計(jì)有其相應(yīng)的線性數(shù)學(xué)模型,而方差分析正是根據(jù)這一線性數(shù)學(xué)模型進(jìn)行的,因此所獲數(shù)據(jù)的試驗(yàn)設(shè)計(jì)決定了其分析方法(即自由度和平方和的分解以及度量各效應(yīng)是否顯著的尺度)。正是如此,方差分析的SAS程序中模型的確定是關(guān)鍵。以下結(jié)合教材內(nèi)容順序說(shuō)明各種情況下的SAS程序編寫(xiě)方法。(一)單向分組資料
(單因素完全隨機(jī)試驗(yàn))1.組內(nèi)觀察值數(shù)目相等的資料以教材P111例6.10為例。
[例6.10]作一水稻施肥的盆栽試驗(yàn),設(shè)5個(gè)處理,A和B系分別施用兩種不同工藝流程的氨水,C施碳酸氫銨,D施尿素,E不施氮肥。每處理4盆(施肥處理的施肥量每盆皆為折合純氮1.2克),共5×4=20盆,隨機(jī)放置于同一網(wǎng)室中,其稻谷產(chǎn)量(克/盆)列于表6.11,試測(cè)驗(yàn)各處理平均數(shù)的差異顯著性。表6.11
水稻施肥盆栽試驗(yàn)的產(chǎn)量結(jié)果處
理觀察值(yij)(克/盆)
A(氨水1)2430282610827.0
B(氨水2)272421269824.5
C(碳酸氫銨)3128253011428.5
D(尿素)3233332812631.5
E(不施)212216218020.052626.3DATAtb611;DOtrt=1TO5;(或DOtrt=”A”,”B”,”C”,”D”,”E”;)DOr=1To4;INPUTy@@;OUTPUT;END;END;使用兩套循環(huán)(DO…;END;)進(jìn)行簡(jiǎn)化數(shù)據(jù)輸入,這是在數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)整理加工后的方法,當(dāng)然也可直接按田間(或試驗(yàn)記錄)順序輸入。OUTPUT語(yǔ)句用于輸出一組觀察值,它表明一條記錄的結(jié)束。CARDS;2430282627242126312825303233332821221621;PROCANOVA;CLASStrt;MODELy=trt;MEANStrt/DUNCAN;RUN;在PROCANOVA后可加上選項(xiàng),包括DATA=輸入數(shù)據(jù)集名和OUTSTAT=輸出數(shù)據(jù)集名(用于存儲(chǔ)方差分析結(jié)果)。CLASS一句用于指明分類變量,此語(yǔ)句一定要設(shè)定,并且應(yīng)出現(xiàn)在MODEL語(yǔ)句之前。MODEL語(yǔ)句用于定義分析所用的線性數(shù)學(xué)模型,通常試驗(yàn)誤差項(xiàng)(Error)一項(xiàng)不列。MEANS語(yǔ)句用于計(jì)算效應(yīng)平均數(shù),并在“/”號(hào)后設(shè)定多重比較方法、顯著水平
[例6.11]某病蟲(chóng)測(cè)報(bào)站,調(diào)查四種不同類型的水稻田28塊,每塊田所得稻縱卷葉螟的百叢蟲(chóng)口密度列于表6.15,試問(wèn)不同類型稻田的蟲(chóng)口密度有否顯著差異?表6.15
不同類型稻田縱卷葉螟的蟲(chóng)口密度
稻田類型編號(hào)總和平均ni12345678Ⅰ1213141515161710214.577Ⅱ1410111314117312.176Ⅲ
9
21011121312118010.008Ⅳ121110
9
810127210.297T=327
11.68
28Datainsect;Doi=1to4;Doj=1to8;Inputy@@;Output;End;end;Cards;12131415151617.141011131411..92101112131211121110981012.;PROCANOVA;Classi;Modely=i;Meansi/LSD;Run;
[例6.12]在溫室內(nèi)以4種培養(yǎng)液(l=4)培養(yǎng)某作物,每種3盆(m=3),每盆4株(n=4),一個(gè)月后測(cè)定其株高生長(zhǎng)量(mm),得結(jié)果于表6.19,試作方差分析。培養(yǎng)液ABCD總和盆號(hào)A1A2A3B1B2B3C1C2C3D1D2D3生長(zhǎng)量503545505555856570606065553540456045607070558565403040505065908070354585354050455055856570707575盆總和Tij180140175190215220320280280220265290盆平均453543.847.553.855.080.070.070.055.066.372.5T=2775?=57.8125培養(yǎng)液總和Ti495625880775培養(yǎng)液平均41.352.173.364.6表6.194種培養(yǎng)液下的株高增長(zhǎng)量(mm)/*LT6-12*/dataaa;doi=1to4;doj=1to3;dol=1to4;inputy@@;output;end;end;end;cards;5055403535
35304045404050504550455560505055456555856090856570806570707070605535706085457565658575;procanova;classij;modely=ij(i);TESTH=iE=j(i);meansi/duncan
E=j(i)alpha=0.01;run;(二)兩向分組資料1.組合內(nèi)只有單個(gè)觀察值的兩向分組資料(單因素隨機(jī)區(qū)組或二因素完全隨機(jī)設(shè)計(jì))
P119
[例6.13]采用5種生長(zhǎng)素處理豌豆,未處理為對(duì)照,待種子發(fā)芽后,分別每盆中移植4株,每組為6盆,每盆一個(gè)處理,試驗(yàn)共有4組24盆,并按組排于溫室中,使同組各盆的環(huán)境條件一致。當(dāng)各盆見(jiàn)第一朵花時(shí)記錄4株豌豆的總節(jié)間數(shù),結(jié)果列于表6.25,試作方差分析。處
理
(A)組
(B)
總和Ti.
平均ⅠⅡⅢⅣ未處理(CK)6062616024360.8赤霉素6565686526365.8動(dòng)力精6361616024561.3吲哚乙酸6467636125563.8硫酸腺嘌吟6265626425363.3馬來(lái)酸6162626525062.5平均62.563.762.862.5總平均=62.875總和T.j375382377375T=1509表6.25
生長(zhǎng)素處理豌豆的試驗(yàn)結(jié)果DATAtb625;DOszs=1TO6;DOblk=1TO4;INPUTy@@;OUTPUT;END;END;CARDS;本例用ANOVA過(guò)程,效應(yīng)項(xiàng)包括生長(zhǎng)素效應(yīng)和區(qū)組效應(yīng)以及省去的誤差。對(duì)生長(zhǎng)素效應(yīng)分別用LSD法和DUNNETT氏最小顯著差數(shù)法(DLSD法,默認(rèn)對(duì)照是處理項(xiàng)中第一項(xiàng))進(jìn)行多重比較。CARDS;606261606565686563616160646763616265626461626265;PROCANOVA;CLASSszs
blk;MODELy=szs
blk;MEANSszs/T;MEANSszs/DUNNETT;RUN;2.組合內(nèi)有重復(fù)的兩向分組資料的方差分析(二因素完全隨機(jī)設(shè)計(jì))
[例6.14]施用A1、A2、A33種肥料于B1、B2、B33種土壤,以小麥為指示作物,每處理組合種3盆,得產(chǎn)量結(jié)果(g)于表6.31。試作方差分析。表6.31
3種肥料施于3種土壤的小麥產(chǎn)量(g)(a=3,b=3,n=3,abn=27)肥料種類(A)盆土壤種類(B)總和平均B1(油砂)B2(二合)B2(白僵)A1121.419.617.6221.218.816.6169.218.8320.116.417.562.754.851.7A2112.013.013.3214.213.714.0118.213.1312.112.013.938.338.741.2A3112.814.212.0213.813.614.6122.013.6313.713.314.040.341.140.6總
和141.3134.6133.5T=409.4平
均15.715.014.8DATAtb631;DOa=1TO3;DOb=1TO3;DOr=1to3;INPUTy@@;OUTPUT;END;END;END;CARDS;21.421.220.119.618.816.417.616.617.512.014.212.113.013.712.013.314.013.912.813.813.714.213.613.312.014.614.0;PROCANOVA;CLASSab;MODELy=a|b;MEANSaba*b/DUNCAN;RUN;“MODELy=a|b;”是“MODELy=aba*b;”的簡(jiǎn)化形式,使用簡(jiǎn)化形式可使模型語(yǔ)句簡(jiǎn)潔,以下是一些簡(jiǎn)化表示法及其所代表的意義:簡(jiǎn)化示法意義a|b|ca|b|c@2a|b(a)|ca|b(a)|c@2a|c(b)a(b)|c(b)aba*bca*cb*ca*b*caba*bca*cb*cab(a)ca*cb*c(a)ab(a)ca*cac(b)a*c(b)a(b)c(b)a*c(b)
MEANS語(yǔ)句對(duì)肥料、土壤及兩者互作的平均數(shù)進(jìn)行多重比較。(三)數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)
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