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文檔簡介
ZhouHong數(shù)據(jù)采集和處理系統(tǒng)提供商
Dataacquisitionandprocessingsystemprovider
CDISC編碼標(biāo)準(zhǔn)和21CFRPart11在醫(yī)學(xué)研究系統(tǒng)中的應(yīng)用
TheapplicationofCDISCand21CFRPart11inclinicalresearch標(biāo)準(zhǔn)讓數(shù)據(jù)互相認(rèn)識
Standardizeddatacancommunicateseamlessly全球PM2.5最高的地區(qū)在北非和中國的華北、華東、華中全部。世界衛(wèi)生組織(WHO)認(rèn)為,PM2.5小于10是安全值,中國的這些地區(qū)全部高于50接近80。(南方都市報)
PM2.5監(jiān)測網(wǎng)舉例:PM2.5事件美國大使館公布PM2.5政府認(rèn)可并同樣公布臨床研究數(shù)據(jù)是否需要標(biāo)準(zhǔn)化?
DoesClinicaldataneedstandardization?
新藥研發(fā)到上市的路線圖
PathwayfromCompoundtoNewDrugR&D(研發(fā))Preclinical(臨床前期))PHI(一期臨床)PHII(二期臨床)PHIII(三期臨床)Submission(申報審批)Year(年)EverystepgeneratesdataEverystepneedsdatamanagementProcess(流程)藥物上市后的研究
Post-marketingclinicalreserachEverystepgeneratesdataEverystepneedsdatamanagement新藥研究和上市后研究的區(qū)別
pre&postmarketingresearchEverystepgeneratesdataEverystepneedsdatamanagement采集Collection運輸Transportation收樣Receipt分離Process入庫Storage分析Assays轉(zhuǎn)運Shipment出庫Retrieving新藥研究Trial有生物標(biāo)本的采集SamplecollectionEverystepgeneratesdataEverystepneedsdatamanagement上市后研究Postmaketingclinicalresearch采集Collection存儲數(shù)據(jù)Storage分析Assays一般沒有生物標(biāo)本的采集Withoutsamplecollection臨床數(shù)據(jù)采集的目的
Objectiveofclinicalresearchdata數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化的目的Objective藥物臨床研究Clinicaltrial提交FDA評審FDAdatasubmission與國際同行交換數(shù)據(jù)Dataexchange
eg:STSEACTS臨床數(shù)據(jù)的應(yīng)用流程
OperationalProcessforClinicalDataEDC電子病歷EMR源數(shù)據(jù)SourceDataRemotebackup統(tǒng)計師Statistics心電圖ECG實驗室Labs研究者InvestigatorDatabaseEDC和臨床數(shù)據(jù)的現(xiàn)狀
CurrentStatusforEDCandClinicalData
EDC是目前最流行的數(shù)據(jù)采集方法
ElectronicDataCapture(EDC)isthecommonlyusedmethodtocollectclinicaldata有很多EDC系統(tǒng),每個的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)都不一樣
TherearesomanyEDCvendorsnow,eachofthemhasdifferentdatabasestructure,setup,differentvariablenamingconventionandlabelinganddataattributes有的界面和CRF一致
somehavethedataentryinterfacesimilartotheCRFs有的不一致,完全是列表式Somehavealisting-formofdataentryscreenEDCRemotebackupDatabaseEDCEDC和臨床數(shù)據(jù)的現(xiàn)狀
CurrentStatusforEDCandClinicalData
提供給統(tǒng)計師的數(shù)據(jù)各不一樣
Datadeliveredtostatisticianareverydifferent!數(shù)據(jù)呈遞給FDA也各不一樣
DatasubmittedtoFDAareverydifferent!由于這種非標(biāo)準(zhǔn)化情況,F(xiàn)DA很難橫向的比較不同廠家,同類藥的療效和安全性
Becauseofnon-standardandnon-exchangeable,therewasnowayforFDAtoevaluatedrugapplicationscrossdifferentsponsorsEDCRemotebackupDatabaseEDC樣本數(shù)據(jù)示例
SampleGrace研究項目暴露出的問題
TheProblems大部分臨床醫(yī)學(xué)研究Mostclinicaltrials…沒有采用數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化don’temployastandardfordataexchange沒有使用標(biāo)準(zhǔn)化的工具和技術(shù)don’tusestandardizedanalytictoolsortechniques后果Result其結(jié)果是造成了臨床數(shù)據(jù)分析中效率和系統(tǒng)化的困難,特別是對多個臨床試驗
Analyzingclinicaltrialdataefficientlyandsystematicallyisdifficultandtimeconsuming,especiallyacrossmanytrials不如這樣一個簡單的問題:有多少女性參與了GRACE的臨床試驗?e.g.HowmanywomenparticipateinclinicaltrialswithGRACE?如何自動統(tǒng)計女性數(shù)量
Howdoyouautomatecountingwomen?
面對這樣的一個簡單的問題,我們往往會感到無能為力
Facingonsuchasimplequestion,weoftenfeellackofpower沒有標(biāo)準(zhǔn)的數(shù)據(jù)集名
Nostandardfilenames怎么可能自動地用計算機找出包含要找數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)集
Howdoesacomputerfindthefilethatcontainsthedata?沒有標(biāo)準(zhǔn)的變量名
Nostandardvariablenames怎么可能自動地用計算機找出包含性別的數(shù)據(jù)名
Howdoesacomputerfindthecolumnthatcontainssexinformation沒有標(biāo)準(zhǔn)的數(shù)據(jù)編碼
Nostandardterminology怎么可能自動地用計算機告知1還是2代表女性
Howdoesacomputerknowwhichcoderepresentswhichsex?臨床數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化非常關(guān)鍵和重要!ClinicaldataStandardizationisveryimportantandcritical!數(shù)據(jù)的可交換性
DataExchangeability
定義Definition
數(shù)據(jù)的可交換性是它具有的屬性,它使得數(shù)據(jù)可以以各種方式傳送和使用而不會失去它的內(nèi)容和意義
Dataexchangeabilityistheattributesofdatathatenablethedatatobecommunicatedandusedinmanywayswithoutlossoraltertheinformationcontentormeaningassignedtothedata.只有標(biāo)準(zhǔn)化的數(shù)據(jù)才具有可交換性
OnlystandardizeddataareexchangeableCDISC是什么?CDISC:臨床數(shù)據(jù)交換標(biāo)準(zhǔn)協(xié)會
ClinicalDataInterexchangeStandardsConsortium,startedwithsmallgroupofvolunteersin1997是一個全球的、開放的、多學(xué)科的、非營利的組織,創(chuàng)建了支持臨床研究數(shù)據(jù)和元數(shù)據(jù)采集、交換、提交和存檔的標(biāo)準(zhǔn)
Itisaglobal,open,multidisciplinary,non-profitorganizationthathasestablishedstandardstosupporttheacquisition,exchange,submissionandarchiveofclinicalresearchdataandmetadata.主要的模型TherearetwomajormodelsinCDISC:SDTM:針對臨床數(shù)據(jù)
StandardDataTabulationModelforclinicaltrialdataADaM:針對分析數(shù)據(jù)AnalysisDataModel其他正在建立的標(biāo)準(zhǔn)Otherstill-developingstandardCDASH:針對CRF表ClinicalDataAcquisitionStandardsHarmonizationforCRFstandardsSDTM的基本模型
SDTM’sfundamentalmodelforoperationaldata
Observation觀察Genericstructure(衍伸結(jié)構(gòu))?Uniqueidentifiers?Topicvariableorparameter?TimingVariables?Qualifiers.Interventions干預(yù)Findings發(fā)現(xiàn)Events事件Generalclasses(一般分類)SubjectCMEXEGIELBPEAEDSSDTMDomains(SDTM域)(datasetstructures)Thepatient/subjectfocusedinformationmodeloftheclinical‘reality’(generalclassesofobservationsonsubjects:interventions,findings,events).ThismodelhasbeendevelopedbyCDISC/SDSteam.Interventions干預(yù)Events事件ConMedsExposureAEMedHistDispositionFindings結(jié)果ECGPhysExamLabsVitalsDemogOther其他SubjChar*SubstanceUseInclExcl*RELATESSUPPQUALStudySumStudyDesignQS*,MB*CommentsCP*,DV*CDISCSDTM域
Domains
CDISCSDTM域注解
Domainscomments
分類解釋EX試驗用藥記錄CM伴隨用藥記錄和其它物理治療SU物質(zhì)使用(煙、酒、咖啡等)干預(yù)Interventions事件EventsAE不良反應(yīng)事件DS試驗完成、中止、脫落報告MH病史(試驗藥物相關(guān)疾病病史及其它病史)結(jié)果Findings分類解釋EG心電圖IE入選、排除標(biāo)準(zhǔn)LB實驗室檢查QS調(diào)查問卷(HAMILTONDEPRESSIONSCLAE,SF36,ADAS.)PE體格檢查SC個體特征(比如患者姓名、眼睛顏色、生育狀態(tài)、過敏狀態(tài))VS生命體征注:HAMILTONDEPRESSIONSCLAE指漢密頓抑郁量表
SF36簡明健康狀況問卷
ADAS阿爾茨海默病評分其他OtherDM受試者人口學(xué)資料CO非異常描述、其它注釋FDA對數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化的態(tài)度
FDA’sStandsonClinicalDataStandardization
FDA藥品審評中心于2004年7月就接納CDISC
CDERadoptedCDISCSDTM7/04今年二月,F(xiàn)DA發(fā)布了關(guān)于數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化的指導(dǎo)原則草案FDAreleasedadraftguidanceinFeb.2012onstudydatastandardizationFDA鼓勵申辦方采用標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù),越早越好
FDAisencouragingmanufacturerstoadoptthesenewdatasubmissionstandardsearlyintheproductdevelopmentcycleFDA認(rèn)可CDISC作為標(biāo)準(zhǔn)之一
CDISCisoneofstandardFDAendorsed越來越多的藥廠已開始采用CDISC標(biāo)準(zhǔn)
ThemoreandmorecompaniesaresubmittingdataFDAinCDISCstandard再過2-3年,CDISC可能成為FDA的正式標(biāo)準(zhǔn)
ItcouldbeanofficialrequirementofCDISCstandardbyFDAin2-3yearsFDA申報標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)包
SubmissionDataPackageFDA申報標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)包以下
ThesubmissiondatapackagetoFDAusuallyincludethefollowingSDTMdatasetsinSAStransportformat(.xpt)SDTMannotatedCRFsDefine.xmlforSDTMADaM(in.xpt)Define.xmlforADaMReviewguide審閱指導(dǎo)申報數(shù)據(jù)進(jìn)入FDA的流程
FlowforSubmissionDatawithinFDAJanusSystem審辦方SponsorSDTMADaM統(tǒng)計評審員FDAStatisticalReviewer醫(yī)學(xué)評審員FDAMedicalReviewer電子申報接口ElectronicSubmissionGateway(ESG)常用創(chuàng)建SDTM和ADaM流程
CommonlyUsedProcedureforCreatingSDTMandADaM幾乎是通過SAS在數(shù)據(jù)庫外的后期制作CreatedviaSAS轉(zhuǎn)換為SDTM和ADaM存在的問題
IssuesinMappingSDTMandADaMfromRaw目前的SDTM轉(zhuǎn)換是單向的,沒法溯源
Itisanone-waymapping(i.e.RawSDTM)withouttraceability.E.g.agewascalculatedvariable.FromthemappedSDTM,itdidn’ttellhowagewascalculated太多的數(shù)據(jù)庫外的手工程序,非常容易出錯!
Toomuchoutsidedatabaseprogramming,easytomakemistakesintheconversionprocesses增加了大量的質(zhì)控和驗證工作
IncreasedalotofvalidationandQCwork不能保證申報數(shù)據(jù)的質(zhì)量和溯源性
Lackofinsuranceofqualityandtraceabilityforsubmitteddatapackage沒有有用的軟件或工具
NopowerfultoolsforautomaticSDTMmapping理想的步驟
TheShould-beProcedure
無系統(tǒng)外轉(zhuǎn)換Nooutside-systemmapping目前還沒有這樣的系統(tǒng)NosystemavailableyetShouldbexmlformat,notSASSASdatasetsaretwodimensional,i.e.itis“flat”Xmlismulti-dimensional,i.e.itisstereoFDAisthinkingtorequestforxmlformatinthefuture部分的解決方案
PartialSolutions
對一個新study,數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化應(yīng)從數(shù)據(jù)庫的設(shè)計開始
Fornewstudy,datastandardizationcanbestartedwiththedatabasedesign利用CDASH的標(biāo)準(zhǔn)表建庫UseCDASHstandardforms用SDTM給變量命名和標(biāo)識,但不是所有的變量都能這樣做
UseSDTMtonameandlabelvariables(notallvariablescanbedirectlynamedinSDTM,e.g.datefield用SDTM域來分類GroupdatausingSDTMdomain即使這樣,一個完全的SDTM標(biāo)準(zhǔn)庫也會面臨挑戰(zhàn)
EvenyousetupdatabaseinCDASH,itisstillnotpossibletohavea100%SDTMdatabase.However,itisaSDTM-likedatabase對以前的歷史遺留研究,用SAS轉(zhuǎn)換仍然是唯一的辦法
Forlegacystudies,mappingthroughSASisstilltheonlywayCDISC總結(jié)
Summary
CDISC是用于數(shù)據(jù)申報的一個趨勢
CDISCstandardisthecurrenttrendforregulatorysubmission數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化對申辦方和FDA都非常重要和關(guān)鍵
ItisveryimportantandcriticalforbothsponsorsandFDAtohaveaqualityandefficientregulatoryreview但是,我們還面臨很多挑戰(zhàn)
However,therearealotofchallengesin對CDISC指導(dǎo)原則的理解
understandingtheCDISCguidance如何具體實施Implementingthemodules需要研發(fā)有效的可直接轉(zhuǎn)換和溯源的軟件或工具
DevelopingsomepowerfultoolsorsoftwarefordirectmappingfromODMtoSDTMandbeingabletotracebackthesource如何保證電子數(shù)據(jù)的有效和安全?
Ensuressecurityanddataadministrationareeffectivelymanaged21CFRPart11是什么?21CFRPart11是聯(lián)邦法規(guī)21章第11款主要規(guī)定內(nèi)容涉及電子記錄和電子簽名
食品、醫(yī)藥制造行業(yè)多遵照此標(biāo)準(zhǔn),此法規(guī)確保了電子數(shù)據(jù)的有效性和可靠性
遵照此標(biāo)準(zhǔn)而保留的數(shù)據(jù)才可以作為通過檢驗或者今后追溯的有效數(shù)據(jù)來源現(xiàn)在很多大型自動化控制系統(tǒng)已經(jīng)符合此標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定21CFRPart11的重點
Keyponits
我們DAP在做什么?
Whatwearedoinginthisfield?DAP
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