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文檔簡介
Cobasvs.ARMScobasEGFR-等位基因特異擴增(ASA,Allele-specificenzymaticamplification)
更寬廣的突變點覆蓋和更高的靈敏度第一步:等位基因特異擴增可選擇性擴增目標序列,只與突變DNA的3’端特異結合為了減少假陽性率,引物做了進一步的修飾,從而與野生型DNA結合會極不穩(wěn)定可實現(xiàn)多條突變序列同時擴增第二步:通過實時熒光PCR檢測突變DNA鏈上結合有特異的探針,該探針中含有一個熒光基團和淬滅基團,在PCR擴增過程中,當擴增鏈延伸至探針時,探針脫落后產(chǎn)生熒光信號。具不同的熒光信號的探針可以用來檢測不同的突變類型ASA引物在突變型DNA上延伸3’5’3’5’TA3’5’3’5’TC擴增不擴增ASA引物在野生型DNA上不延伸熒光基團淬滅基團ARMS技術的基本原理特異引物介導的位點特異性PCR等位基因特異性擴增(ASA)-又稱擴增阻礙突變系統(tǒng)(ARMS)利用PCR引物的3’端末位堿基必須與其模板DNA互補才能有效擴增的原理,設計等位基因特異性PCR擴增引物。ASA或ARMS的特點是:“僅是引物選擇靶序列階段”“只有在引物3’堿基與模板配對時才能出現(xiàn)PCR擴增帶,野生型的不擴增”關于ARMS方法——ARMS和ASA為同一類方法廈門艾德不同的只是后期的熒光激發(fā)方式特性therascreenEGFRRGQ艾德EGFR檢測cobas
EGFRcobas的差異化檢測技術ARMSPCRARMSPCRASAPCR實為同一種方法突變位點覆蓋(EGFR)29種21種41種更高的突變覆蓋范圍,減少漏檢率,結果更可靠靈敏度Undefined細胞株:1%突變水平FFPET:沒有經(jīng)過驗證細胞株:1%突變水平FFPET:5%突變水平市面上唯一進行FFPET驗證的檢測,來自臨床最真實樣本的靈敏度和特異性,結果更可靠檢測結果處理人工計算人工計算自動打印結果輕松得到實驗結果檢測平臺和流程Rotor-GeneQ和QIAampFFPE試劑盒使用不同的儀器和基因提取試劑盒使用cobasz480和cobasFFPE提取試劑盒就有極佳的室間重復性,方便實驗室質量控制各PCR方法比較
cobas
腫瘤突變檢測與艾德比較
cobas靈敏度高于艾德試劑cobas比廈門艾德多檢測出20個位點,靈敏度有了很大的提升,因而:使更多的患者獲得及時而正確的治療為臨床提高用藥國內(nèi)臨床實驗數(shù)據(jù):cobas和艾德的符合率為93%結果通過測序驗證后,104例樣本中,cobas比艾德多檢出6個突變1例20-Ins12376,艾德說明書有,但沒檢測到1例20-Ins12378,艾德說明書有,但沒檢測到1例20-Ins13558,艾德說明書沒有該位點1例19-Del13556,艾德說明書沒有該位點2例19-Del,艾德沒有檢測到外顯子18外顯子19外顯子19外顯子19外顯子20外顯子21G719A6239Del6223Del12387Del13550T790M6240L858R6224G719S6252Del6225Del6210Del12386S768I6241L858R12429G719C6253Del12370Del26038Del13552Ins12376Del12382Del13556Del12385Ins13428Del12369Del12422Del12416Ins12378Del12384Del6220Del18427Ins12377Del6255Del13551Del23571Ins13558Del12383Del12367Del12403Del12678Del12419Del6218Del12728Del6254紅色的為艾德缺少的位點*選自cobasEGFR臨床試驗檢測報告對比
艾德檢測cobas檢測自動得到結果..特點cobas的優(yōu)勢臨床價值檢測結果高靈敏度,高重復性使更多的患者獲得及時而正確的治療減少因結果無效導致的重復檢測檢測速度PCR反應時間優(yōu)于測序更快的樣本周轉時間,及時的治療能
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