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文檔簡介
104蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)
鶴壁職業(yè)技術(shù)學(xué)院
孔曉朵蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的分級一級結(jié)構(gòu)基本結(jié)構(gòu)二級結(jié)構(gòu)三級結(jié)構(gòu)空間結(jié)構(gòu)(構(gòu)象)四級結(jié)構(gòu)定義:
多肽鏈中氨基酸從N-端至C-端的排列順序。一、蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)是由遺傳信息來決定的主要化學(xué)鍵:肽鍵二硫鍵一級結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)氨基酸的排列順序?維持蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的主要化學(xué)鍵:主要是肽鍵,另外還有二硫鍵胰島素胰島素的一級結(jié)構(gòu)SerGlyIleValGluGlnCysCysThrIleCysSerLeuTyrGlnLeuGluAsnTyrCysAsnPheValAsnGlnHisLeuCysGlySerHisLeuValGluAlaLeuTyrLeuValCysGlyGlyGluArgPhePheTyrThrProLysThrNH215101520COOHA鏈NH2151015202530HOOCB鏈二、蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)分子中某一段肽鏈的局部空間結(jié)構(gòu),即該段肽鏈主鏈骨架原子的相對空間位置,并不涉及氨基酸殘基側(cè)鏈的構(gòu)象
。定義
特點:1.局部或某一段肽鏈2.主鏈構(gòu)象(-N-C-C-N-C-C-)3.不含側(cè)鏈(R)的構(gòu)象主鏈骨架:NCαC-NCαC-NCαC…側(cè)鏈:肽鏈中氨基酸殘基中的R基團(tuán)
蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的主要形式
-螺旋
-折疊
-轉(zhuǎn)角
無規(guī)卷曲
主要的化學(xué)鍵:氫鍵
-螺旋:多肽鏈的主鏈原子沿一中心軸盤繞所形成的右手螺旋結(jié)構(gòu)。左手螺旋右手螺旋
(一)
-螺旋LPauling(1901-1994)特點:(2)3.6殘基/螺旋,螺距0.54nm(3)穩(wěn)定作用力:氫鍵(4)R基在螺旋外側(cè)(1)右手螺旋角蛋白Keratin廣泛存在于動物的毛發(fā)、甲、角、鱗和羽等,角蛋白中主要的是
-角蛋白。
-角蛋白主要由
-螺旋構(gòu)象的多肽鏈組成。一般是由三條右手
-螺旋肽鏈形成一個原纖維,原纖維的肽鏈之間有二硫鍵交聯(lián)以維持其穩(wěn)定性。電子顯微鏡下的人體頭發(fā)卷發(fā)的生化原理(二)
-折疊
兩條或兩條以上折疊成鋸齒狀的多肽鏈通過氫鍵相連進(jìn)而形成較伸展的片層結(jié)構(gòu)。⑴肽鍵平面折疊成鋸齒狀(折紙狀),R基交錯位于齒狀結(jié)構(gòu)上下方⑵氫鍵維持穩(wěn)定,與主鏈長軸垂直⑶兩條以上肽鏈并列時,
-折疊有順向反向平行β-折疊:平行式和反平行式順向平行反向平行
-折疊結(jié)構(gòu)絲蛋白是典型的反平行式折疊,多肽鏈呈鋸齒狀折疊構(gòu)象。絲蛋白(fibroin)α-螺旋和
-折疊結(jié)構(gòu)比較區(qū)別點
α-螺旋
-折疊形狀螺旋狀鋸齒狀氫鍵鏈內(nèi),與長軸平行鏈間,與長軸垂直R-基團(tuán)較大較小延伸性較大較小舉例毛發(fā)角蛋白蠶絲蛋白(四)
-轉(zhuǎn)角和無規(guī)卷曲
-轉(zhuǎn)角:是多肽鏈180°回折部分所形成的一種二級結(jié)構(gòu)。無規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu)
insulincomplementC-moduledomainsnaketoxin無規(guī)則卷曲:是用來闡述沒有確定規(guī)律性的那部分肽鏈結(jié)構(gòu)。
限制性內(nèi)切核酸酶的三級結(jié)構(gòu)
-轉(zhuǎn)角
-折疊無規(guī)卷曲
-螺旋練習(xí)模體(motif)
:二個或三個具有二級結(jié)構(gòu)的肽段,在空間上相互接近,形成一個特殊的空間構(gòu)象。模體是具有特殊功能的超二級結(jié)構(gòu)鈣結(jié)合蛋白中的結(jié)合鈣離子的基序鋅指結(jié)構(gòu)是一種常出現(xiàn)在DNA結(jié)合蛋白中像手指狀的一種結(jié)構(gòu)。三、蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)定義:整條肽鏈中全部氨基酸殘基的相對空間位置。即肽鏈中所有原子在三維空間的排布位置。抹香鯨肌紅蛋白(三級結(jié)構(gòu))盤狀物代表血紅素具有二級結(jié)構(gòu)的多肽鏈進(jìn)一步折疊、卷曲形成復(fù)雜的球狀的分子結(jié)構(gòu)。維持三級結(jié)構(gòu)的化學(xué)鍵非共價鍵疏水鍵:數(shù)量最多鹽鍵(離子鍵)氫鍵范德華力次級鍵共價鍵:二硫鍵三、蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)二硫鍵三、蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)四、蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)分子中各亞基的空間排布及亞基接觸部位的布局和相互作用,稱為蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)。有些蛋白質(zhì)分子含有二條或多條多肽鏈,每一條多肽鏈都有完整的三級結(jié)構(gòu),稱為蛋白質(zhì)的亞基。亞基之間的結(jié)合力:非共價鍵(主要是氫鍵和離子鍵)含有四級結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì),單獨的亞基一般沒有生物學(xué)功能,只有完整的四級結(jié)構(gòu)才有生物學(xué)功能。
由一條肽鏈形成的Pr只有一、二和三級結(jié)構(gòu),由兩條或兩條以上多肽鏈形成的Pr才可能有四級結(jié)構(gòu)。胰島素由51個氨基酸組成了A、B兩條多肽鏈,兩鏈之間通過二硫鍵相連,下列關(guān)于胰島素的敘述正確的是:A.含有50個肽鍵B.游離的α-氨基和α-羧基各有2個C.游離的α-氨基和α-羧基各有1個D.具有四級結(jié)構(gòu)B.游離的α-氨基和α-羧基各有2個血紅蛋白的一、二、三、四級結(jié)構(gòu)小結(jié)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)層次
一級結(jié)構(gòu)(肽鏈結(jié)構(gòu),指多肽鏈中的氨基酸排列順序)
↓
二級結(jié)構(gòu)(多肽鏈主鏈骨架盤繞折疊形成的有規(guī)律性的結(jié)構(gòu))
↓
超二級結(jié)構(gòu)(模體)(相鄰二級結(jié)構(gòu)的聚集體)
↓
三級結(jié)構(gòu)(蛋白質(zhì)中所有原子在空間的相對位置)
↓
四級結(jié)構(gòu)(亞基聚合體)
肽鍵、二硫鍵氫鍵疏水鍵、二硫鍵非共價鍵穩(wěn)定作用力小結(jié)蛋白質(zhì)的元素組成:C、H、O、N(16%)、S組成蛋白質(zhì)的基本單位氨基酸
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