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TET1基因?qū)Y(jié)腸癌細(xì)胞DLD1轉(zhuǎn)移的影響及機(jī)制探究一、引言1.1研究背景與意義結(jié)腸癌作為一種常見(jiàn)的消化道惡性腫瘤,嚴(yán)重威脅人類健康。據(jù)世界衛(wèi)生組織國(guó)際癌癥研究機(jī)構(gòu)(IARC)發(fā)布的2020年全球癌癥負(fù)擔(dān)數(shù)據(jù)顯示,結(jié)直腸癌新發(fā)病例數(shù)達(dá)193萬(wàn),死亡病例數(shù)達(dá)93.5萬(wàn),在全球癌癥發(fā)病與死亡原因中分別位居第三和第二。在中國(guó),結(jié)腸癌的發(fā)病率和死亡率也呈上升趨勢(shì),給社會(huì)和家庭帶來(lái)了沉重的負(fù)擔(dān)。其發(fā)病機(jī)制復(fù)雜,涉及遺傳因素、生活方式(如高脂肪、低纖維飲食)、腸道微生物群失衡以及慢性炎癥等多種因素。在結(jié)腸癌的發(fā)展進(jìn)程中,轉(zhuǎn)移是導(dǎo)致患者預(yù)后不良和死亡的主要原因,約有50%的結(jié)腸癌患者最終會(huì)發(fā)生轉(zhuǎn)移。腫瘤轉(zhuǎn)移是一個(gè)多步驟、多因素參與的復(fù)雜過(guò)程,包括腫瘤細(xì)胞從原發(fā)灶脫離、侵入周?chē)M織和血管、在循環(huán)系統(tǒng)中存活、到達(dá)遠(yuǎn)處器官并定植生長(zhǎng)等。深入了解結(jié)腸癌轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制,對(duì)于開(kāi)發(fā)有效的治療策略和改善患者預(yù)后至關(guān)重要。在腫瘤研究領(lǐng)域,TET1(Ten-eleventranslocation1)作為一種重要的去甲基化酶,近年來(lái)受到了廣泛關(guān)注。TET1屬于TET基因家族,該家族能夠催化5-甲基胞嘧啶(5mC)逐步氧化為5-羥甲基胞嘧啶(5hmC)、5-甲?;奏ぃ?fC)和5-羧基胞嘧啶(5caC),在DNA去甲基化過(guò)程中發(fā)揮關(guān)鍵作用。DNA甲基化是一種重要的表觀遺傳修飾,異常的DNA甲基化模式與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)。研究表明,TET1在多種腫瘤中表達(dá)異常,通過(guò)調(diào)控基因的甲基化狀態(tài),影響腫瘤細(xì)胞的增殖、凋亡、遷移和侵襲等生物學(xué)行為。例如,在乳腺癌中,TET1的低表達(dá)與腫瘤的侵襲性和不良預(yù)后相關(guān);在肝癌中,TET1能夠抑制腫瘤細(xì)胞的遷移和侵襲能力。在結(jié)腸癌研究中,TET1也被發(fā)現(xiàn)參與了腫瘤的發(fā)生發(fā)展過(guò)程,但其具體作用機(jī)制仍有待進(jìn)一步深入探究。結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1是研究結(jié)腸癌的常用細(xì)胞系之一,其具有典型的結(jié)腸癌細(xì)胞特征,能夠較好地模擬體內(nèi)結(jié)腸癌的生物學(xué)行為。研究TET1對(duì)結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1轉(zhuǎn)移的影響,具有重要的臨床意義。從基礎(chǔ)研究角度來(lái)看,有助于深入揭示結(jié)腸癌轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制,為理解腫瘤轉(zhuǎn)移這一復(fù)雜生物學(xué)過(guò)程提供新的理論依據(jù)。通過(guò)明確TET1在DLD1細(xì)胞轉(zhuǎn)移中的作用及相關(guān)信號(hào)通路,能夠進(jìn)一步完善結(jié)腸癌轉(zhuǎn)移的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò),豐富我們對(duì)腫瘤表觀遺傳調(diào)控的認(rèn)識(shí)。從臨床應(yīng)用角度而言,若能證實(shí)TET1與結(jié)腸癌轉(zhuǎn)移的密切關(guān)系,TET1有望成為結(jié)腸癌診斷、預(yù)后評(píng)估的新的生物標(biāo)志物。通過(guò)檢測(cè)患者腫瘤組織中TET1的表達(dá)水平,可輔助醫(yī)生更準(zhǔn)確地判斷患者的病情進(jìn)展和預(yù)后情況,為制定個(gè)性化的治療方案提供參考。此外,TET1還可能成為結(jié)腸癌治療的潛在靶點(diǎn)?;趯?duì)TET1作用機(jī)制的理解,開(kāi)發(fā)針對(duì)TET1的靶向治療藥物,為結(jié)腸癌患者提供新的治療策略,有望改善患者的生存質(zhì)量和延長(zhǎng)生存期。1.2國(guó)內(nèi)外研究現(xiàn)狀在國(guó)外,對(duì)于TET1與腫瘤關(guān)系的研究開(kāi)展較早且較為深入。愛(ài)荷華大學(xué)的研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),在KRAS驅(qū)動(dòng)的癌癥中,KRAS可通過(guò)關(guān)閉TET1酶,促進(jìn)腫瘤抑制基因的甲基化相關(guān)沉默,將TET1重新引入這些細(xì)胞中,可重新激活腫瘤抑制基因,并降低細(xì)胞的異常增殖。這一研究揭示了TET1在腫瘤抑制基因調(diào)控中的關(guān)鍵作用,為腫瘤治療提供了新的潛在靶點(diǎn)。針對(duì)TET1與結(jié)腸癌細(xì)胞的研究也取得了一定成果。有研究運(yùn)用基因編輯技術(shù),敲低結(jié)腸癌細(xì)胞系中TET1的表達(dá),發(fā)現(xiàn)細(xì)胞的遷移和侵襲能力顯著增強(qiáng),同時(shí)上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)相關(guān)標(biāo)志物的表達(dá)發(fā)生明顯改變,提示TET1可能通過(guò)調(diào)控EMT過(guò)程影響結(jié)腸癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移。還有研究從表觀遺傳調(diào)控網(wǎng)絡(luò)角度出發(fā),發(fā)現(xiàn)TET1能夠與其他表觀遺傳調(diào)控因子相互作用,共同調(diào)節(jié)與結(jié)腸癌轉(zhuǎn)移相關(guān)基因的表達(dá),進(jìn)一步證實(shí)了TET1在結(jié)腸癌轉(zhuǎn)移機(jī)制中的重要地位。國(guó)內(nèi)在該領(lǐng)域的研究也緊跟國(guó)際步伐。青島大學(xué)附屬醫(yī)院的科研人員通過(guò)對(duì)結(jié)直腸癌組織樣本進(jìn)行檢測(cè)分析,發(fā)現(xiàn)miR-21與TET1在結(jié)直腸癌組織中的表達(dá)呈負(fù)相關(guān),miR-21可通過(guò)靶向調(diào)控TET1,促進(jìn)結(jié)直腸癌細(xì)胞的增殖、侵襲及遷移,為結(jié)直腸癌的治療提供了新的潛在干預(yù)靶點(diǎn)。北京工業(yè)大學(xué)的研究團(tuán)隊(duì)發(fā)表論文指出,TET1的缺失通過(guò)H3K27me3介導(dǎo)的E-cadherin下調(diào),促進(jìn)DLD1結(jié)腸癌細(xì)胞遷移,揭示了TET1影響結(jié)腸癌細(xì)胞遷移的一種新的分子機(jī)制。此外,國(guó)內(nèi)也有團(tuán)隊(duì)利用生物信息學(xué)方法,整合分析大量結(jié)腸癌患者的基因表達(dá)數(shù)據(jù)和臨床資料,發(fā)現(xiàn)TET1表達(dá)水平與結(jié)腸癌患者的預(yù)后密切相關(guān),低表達(dá)TET1的患者總體生存率更低,遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)更高。盡管?chē)?guó)內(nèi)外在TET1與結(jié)腸癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移的研究方面取得了上述諸多成果,但仍存在一些不足與空白。目前對(duì)于TET1在結(jié)腸癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移過(guò)程中的具體分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)尚未完全明確,雖然已知TET1可通過(guò)調(diào)控某些基因的甲基化狀態(tài)影響細(xì)胞轉(zhuǎn)移,但這些基因之間的上下游關(guān)系以及它們與其他信號(hào)通路之間的交互作用仍有待深入探究。大部分研究集中在TET1對(duì)結(jié)腸癌細(xì)胞遷移和侵襲能力的影響,而對(duì)于TET1在腫瘤細(xì)胞從原發(fā)灶脫離、在循環(huán)系統(tǒng)中存活以及在遠(yuǎn)處器官定植等其他轉(zhuǎn)移關(guān)鍵步驟中的作用研究較少?,F(xiàn)有的研究多在細(xì)胞系和動(dòng)物模型中進(jìn)行,缺乏大規(guī)模臨床樣本的驗(yàn)證,使得研究成果向臨床應(yīng)用的轉(zhuǎn)化受到一定限制。在針對(duì)TET1開(kāi)發(fā)靶向治療策略方面,目前仍處于探索階段,缺乏有效的靶向藥物和治療手段。基于當(dāng)前研究的不足,本研究將聚焦于TET1對(duì)結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1轉(zhuǎn)移的影響,通過(guò)一系列細(xì)胞實(shí)驗(yàn)和分子生物學(xué)技術(shù),深入探究TET1影響DLD1細(xì)胞轉(zhuǎn)移的具體分子機(jī)制,同時(shí)結(jié)合臨床樣本分析,驗(yàn)證TET1作為結(jié)腸癌轉(zhuǎn)移生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)的可行性,以期為結(jié)腸癌的治療提供新的理論依據(jù)和治療策略。1.3研究目的與內(nèi)容本研究的核心目的是深入探究TET1對(duì)結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1轉(zhuǎn)移的作用及其潛在分子機(jī)制,為結(jié)腸癌的治療提供新的理論依據(jù)與潛在治療靶點(diǎn)。具體研究?jī)?nèi)容如下:檢測(cè)TET1在結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1中的表達(dá)情況:運(yùn)用實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(qRT-PCR)、蛋白質(zhì)免疫印跡法(Westernblot)以及免疫組織化學(xué)染色(IHC)等技術(shù),精準(zhǔn)測(cè)定TET1在DLD1細(xì)胞中的mRNA和蛋白表達(dá)水平。同時(shí),收集臨床結(jié)腸癌組織樣本,對(duì)比分析TET1在癌組織與癌旁正常組織中的表達(dá)差異,并結(jié)合患者的臨床病理資料,深入探究TET1表達(dá)與結(jié)腸癌轉(zhuǎn)移及預(yù)后之間的相關(guān)性。探究TET1對(duì)結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1轉(zhuǎn)移能力的影響:通過(guò)基因編輯技術(shù),構(gòu)建TET1過(guò)表達(dá)和敲低的DLD1細(xì)胞模型。運(yùn)用Transwell小室實(shí)驗(yàn),在體外模擬腫瘤細(xì)胞的遷移和侵襲過(guò)程,觀察并比較不同TET1表達(dá)水平的DLD1細(xì)胞穿過(guò)基質(zhì)膠或無(wú)基質(zhì)膠的聚碳酸酯膜的能力,以此評(píng)估TET1對(duì)細(xì)胞遷移和侵襲能力的影響。利用細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn),直觀地觀察細(xì)胞在劃痕愈合過(guò)程中的遷移情況,進(jìn)一步驗(yàn)證TET1對(duì)DLD1細(xì)胞遷移能力的調(diào)控作用。若條件允許,構(gòu)建動(dòng)物模型,將不同TET1表達(dá)水平的DLD1細(xì)胞接種到裸鼠體內(nèi),觀察腫瘤的生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移情況,從體內(nèi)實(shí)驗(yàn)層面深入研究TET1對(duì)結(jié)腸癌轉(zhuǎn)移的影響。深入剖析TET1影響結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制:基于前期研究及相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道,推測(cè)TET1可能通過(guò)調(diào)控某些關(guān)鍵基因的甲基化狀態(tài),進(jìn)而影響DLD1細(xì)胞的轉(zhuǎn)移。采用全基因組亞硫酸氫鹽測(cè)序(WGBS)、甲基化特異性PCR(MSP)以及聯(lián)合亞硫酸氫鹽限制性內(nèi)切酶分析法(COBRA)等技術(shù),全面分析不同TET1表達(dá)水平的DLD1細(xì)胞基因組DNA的甲基化圖譜,篩選出與細(xì)胞轉(zhuǎn)移相關(guān)且受TET1調(diào)控的差異甲基化基因。運(yùn)用基因功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn),如RNA干擾(RNAi)、過(guò)表達(dá)載體轉(zhuǎn)染等技術(shù),分別對(duì)篩選出的差異甲基化基因進(jìn)行功能缺失和功能獲得實(shí)驗(yàn),深入探究這些基因在TET1調(diào)控DLD1細(xì)胞轉(zhuǎn)移過(guò)程中的具體作用及上下游關(guān)系。研究TET1與其他表觀遺傳調(diào)控因子、信號(hào)通路之間的交互作用,明確TET1在結(jié)腸癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的地位和作用機(jī)制。例如,研究TET1與上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)相關(guān)信號(hào)通路(如TGF-β信號(hào)通路)之間的聯(lián)系,探討TET1是否通過(guò)調(diào)控EMT過(guò)程影響DLD1細(xì)胞的轉(zhuǎn)移。探索以TET1為靶點(diǎn)的結(jié)腸癌治療新策略:根據(jù)對(duì)TET1作用機(jī)制的研究結(jié)果,嘗試設(shè)計(jì)并篩選針對(duì)TET1的小分子抑制劑或激活劑。通過(guò)細(xì)胞實(shí)驗(yàn)和動(dòng)物實(shí)驗(yàn),評(píng)估這些小分子化合物對(duì)DLD1細(xì)胞轉(zhuǎn)移能力以及腫瘤生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移的影響,驗(yàn)證其作為結(jié)腸癌治療藥物的可行性和有效性。若條件允許,進(jìn)一步研究這些小分子化合物與現(xiàn)有結(jié)腸癌治療方法(如化療、靶向治療)聯(lián)合使用的效果,探索聯(lián)合治療的最佳方案,為臨床結(jié)腸癌治療提供新的策略和思路。1.4研究方法與技術(shù)路線本研究綜合運(yùn)用多種實(shí)驗(yàn)技術(shù)和方法,深入探究TET1對(duì)結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1轉(zhuǎn)移的影響及其分子機(jī)制。具體研究方法如下:細(xì)胞實(shí)驗(yàn):使用結(jié)腸癌細(xì)胞系DLD1作為主要研究對(duì)象,從美國(guó)典型培養(yǎng)物保藏中心(ATCC)購(gòu)買(mǎi)后,按照標(biāo)準(zhǔn)操作流程進(jìn)行復(fù)蘇與培養(yǎng)。細(xì)胞培養(yǎng)于含有10%胎牛血清(FBS)、100U/mL青霉素和100μg/mL鏈霉素的RPMI-1640培養(yǎng)基中,置于37℃、5%CO?的恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng),定期更換培養(yǎng)基并觀察細(xì)胞生長(zhǎng)狀態(tài)。運(yùn)用基因編輯技術(shù),構(gòu)建TET1過(guò)表達(dá)和敲低的DLD1細(xì)胞模型。將攜帶TET1過(guò)表達(dá)質(zhì)?;騭hRNA的慢病毒載體轉(zhuǎn)染至DLD1細(xì)胞中,通過(guò)嘌呤霉素篩選穩(wěn)定表達(dá)細(xì)胞株,利用qRT-PCR和Westernblot檢測(cè)TET1的表達(dá)水平,確保模型構(gòu)建成功。利用Transwell小室實(shí)驗(yàn)評(píng)估細(xì)胞的遷移和侵襲能力。在上室中加入不同TET1表達(dá)水平的DLD1細(xì)胞,下室加入含10%FBS的培養(yǎng)基作為趨化因子。對(duì)于侵襲實(shí)驗(yàn),上室預(yù)先包被Matrigel基質(zhì)膠以模擬體內(nèi)細(xì)胞外基質(zhì)環(huán)境。培養(yǎng)一定時(shí)間后,擦去上室未遷移或侵襲的細(xì)胞,固定并染色下室中的細(xì)胞,在顯微鏡下計(jì)數(shù),以此評(píng)估TET1對(duì)細(xì)胞遷移和侵襲能力的影響。通過(guò)細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證TET1對(duì)DLD1細(xì)胞遷移能力的調(diào)控作用。在6孔板中培養(yǎng)DLD1細(xì)胞至融合度達(dá)到80%-90%,用無(wú)菌槍頭在細(xì)胞單層上均勻劃痕,PBS沖洗去除脫落細(xì)胞,加入無(wú)血清培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng)。在不同時(shí)間點(diǎn)(如0h、24h、48h)于顯微鏡下拍照記錄劃痕愈合情況,計(jì)算劃痕愈合率,比較不同TET1表達(dá)水平細(xì)胞的遷移能力差異。分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn):運(yùn)用實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(qRT-PCR)技術(shù)檢測(cè)TET1及相關(guān)基因在mRNA水平的表達(dá)。提取細(xì)胞或組織總RNA,使用逆轉(zhuǎn)錄試劑盒將其逆轉(zhuǎn)錄為cDNA,以cDNA為模板,利用特異性引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增。通過(guò)檢測(cè)Ct值并采用2^-ΔΔCt法計(jì)算目的基因的相對(duì)表達(dá)量,分析TET1及相關(guān)基因在不同實(shí)驗(yàn)條件下的表達(dá)變化。采用蛋白質(zhì)免疫印跡法(Westernblot)檢測(cè)TET1及相關(guān)蛋白的表達(dá)水平。提取細(xì)胞或組織總蛋白,通過(guò)BCA法測(cè)定蛋白濃度,進(jìn)行SDS-PAGE電泳分離蛋白,將蛋白轉(zhuǎn)印至PVDF膜上,用5%脫脂牛奶封閉后,依次加入一抗和二抗孵育,利用化學(xué)發(fā)光底物顯色,通過(guò)凝膠成像系統(tǒng)拍照并分析條帶灰度值,半定量分析蛋白表達(dá)水平。進(jìn)行全基因組亞硫酸氫鹽測(cè)序(WGBS),全面分析不同TET1表達(dá)水平的DLD1細(xì)胞基因組DNA的甲基化圖譜。提取細(xì)胞基因組DNA,經(jīng)亞硫酸氫鹽處理后,將未甲基化的胞嘧啶(C)轉(zhuǎn)化為尿嘧啶(U),而甲基化的C保持不變。對(duì)處理后的DNA進(jìn)行高通量測(cè)序,通過(guò)生物信息學(xué)分析,篩選出與細(xì)胞轉(zhuǎn)移相關(guān)且受TET1調(diào)控的差異甲基化基因。利用甲基化特異性PCR(MSP)和聯(lián)合亞硫酸氫鹽限制性內(nèi)切酶分析法(COBRA)驗(yàn)證WGBS篩選出的差異甲基化基因。MSP是設(shè)計(jì)針對(duì)甲基化和非甲基化DNA序列的特異性引物,對(duì)亞硫酸氫鹽處理后的DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,根據(jù)擴(kuò)增結(jié)果判斷基因的甲基化狀態(tài)。COBRA則是通過(guò)亞硫酸氫鹽處理DNA后,用限制性內(nèi)切酶切割,再進(jìn)行PCR擴(kuò)增和電泳分析,根據(jù)酶切片段的大小判斷基因的甲基化程度。臨床樣本分析:收集臨床結(jié)腸癌患者的癌組織及癌旁正常組織樣本,詳細(xì)記錄患者的臨床病理資料,包括年齡、性別、腫瘤分期、轉(zhuǎn)移情況等。運(yùn)用免疫組織化學(xué)染色(IHC)技術(shù)檢測(cè)TET1在組織樣本中的表達(dá)及定位,通過(guò)分析染色強(qiáng)度和陽(yáng)性細(xì)胞比例,評(píng)估TET1表達(dá)與結(jié)腸癌轉(zhuǎn)移及預(yù)后之間的相關(guān)性。對(duì)臨床樣本進(jìn)行DNA提取和基因測(cè)序,分析TET1基因是否存在突變,并探討突變與結(jié)腸癌轉(zhuǎn)移及患者預(yù)后的關(guān)系。本研究的技術(shù)路線圖如圖1所示:首先,從細(xì)胞水平和臨床樣本兩個(gè)層面檢測(cè)TET1的表達(dá)情況,然后構(gòu)建TET1表達(dá)調(diào)控的細(xì)胞模型,進(jìn)行細(xì)胞轉(zhuǎn)移能力實(shí)驗(yàn)和分子機(jī)制研究,最后基于研究結(jié)果探索以TET1為靶點(diǎn)的結(jié)腸癌治療新策略。[此處插入技術(shù)路線圖,技術(shù)路線圖需清晰展示從研究準(zhǔn)備階段(如細(xì)胞培養(yǎng)、樣本收集等),到各主要研究?jī)?nèi)容(TET1表達(dá)檢測(cè)、細(xì)胞轉(zhuǎn)移能力研究、分子機(jī)制剖析、治療策略探索)的流程,以及各步驟之間的邏輯關(guān)系和實(shí)驗(yàn)技術(shù)的應(yīng)用,圖中各環(huán)節(jié)需有簡(jiǎn)要文字說(shuō)明]二、TET1及結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1相關(guān)理論基礎(chǔ)2.1TET1基因概述TET1基因,全稱為T(mén)en-eleventranslocation1,在表觀遺傳調(diào)控領(lǐng)域占據(jù)著舉足輕重的地位。該基因位于人類染色體10q22區(qū)域,其結(jié)構(gòu)較為復(fù)雜,至少包含12個(gè)外顯子,能夠編碼由2136個(gè)氨基酸組成的蛋白質(zhì),此蛋白質(zhì)的相對(duì)分子質(zhì)量約為2.353×10^5。從結(jié)構(gòu)組成來(lái)看,TET1蛋白的N端存在一個(gè)典型的CXXC型鋅指結(jié)構(gòu),這一結(jié)構(gòu)使其能夠特異性地結(jié)合未修飾的胞嘧啶,同時(shí)對(duì)被修飾的5-甲基胞嘧啶(5-mC)和5-羥甲基胞嘧啶(5-hmC)也具有較高的親和力,并且傾向于富集在高CpG區(qū)域。C端則為雙加氧酶區(qū),又稱為SD區(qū),該區(qū)域由富含半胱氨酸區(qū)、雙鏈β螺旋2-α-酮戊二酸(α-KG)和Fe2?依賴的雙加氧酶區(qū)(DSBH)及間隔區(qū)共同構(gòu)成,是TET1蛋白發(fā)揮氧化活性的主要催化功能結(jié)構(gòu)域。在Fe2?和α-KG的協(xié)同作用下,TET1能夠催化5-mC逐步氧化為5-hmC、5-甲酰基胞嘧啶(5-fC)和5-羧基胞嘧啶(5-caC),從而參與DNA的主動(dòng)去甲基化過(guò)程。例如,在胚胎干細(xì)胞中,TET1通過(guò)其C端的催化結(jié)構(gòu)域,將5-mC氧化為5-hmC,進(jìn)而調(diào)控相關(guān)基因的表達(dá),維持干細(xì)胞的多能性。TET1在細(xì)胞的多種生理過(guò)程中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。在胚胎發(fā)育過(guò)程中,TET1在胚胎干細(xì)胞(ESC)中呈現(xiàn)高表達(dá)狀態(tài)。研究表明,小鼠ESC中TET1表達(dá)下降時(shí),多潛能因子關(guān)鍵蛋白(nanog)啟動(dòng)子區(qū)5-mC含量升高而5-hmC含量下降,導(dǎo)致nanog蛋白表達(dá)降低,使得ESC出現(xiàn)向外胚層分化的趨勢(shì)。這充分說(shuō)明TET1對(duì)于維持胚胎干細(xì)胞的多能性以及調(diào)控胚胎發(fā)育進(jìn)程具有不可或缺的作用。在體細(xì)胞重編程過(guò)程中,TET1也扮演著重要角色。通過(guò)誘導(dǎo)表達(dá)TET1等關(guān)鍵因子,可以促進(jìn)體細(xì)胞向誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSC)的轉(zhuǎn)化,其作用機(jī)制可能與TET1介導(dǎo)的DNA去甲基化,進(jìn)而激活多能性相關(guān)基因的表達(dá)有關(guān)。在正常組織與腫瘤組織中,TET1的表達(dá)存在顯著差異。在正常組織中,TET1維持著相對(duì)穩(wěn)定的表達(dá)水平,通過(guò)精確調(diào)控基因的甲基化狀態(tài),參與細(xì)胞的增殖、分化、凋亡等生理過(guò)程,確保組織器官的正常發(fā)育和功能維持。然而,在腫瘤組織中,TET1的表達(dá)常常出現(xiàn)異常改變。大量研究表明,在多種腫瘤類型中,如乳腺癌、肝癌、腎癌等,TET1呈現(xiàn)低表達(dá)狀態(tài)。在乳腺癌患者的癌組織中,TET1的表達(dá)水平明顯低于癌旁正常組織,并且其表達(dá)與乳腺癌的發(fā)展、腫瘤大小、浸潤(rùn)深度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移等因素密切相關(guān)。在肝癌中,TET1的低表達(dá)與腫瘤細(xì)胞的遷移、侵襲能力增強(qiáng)相關(guān)。在結(jié)腸癌研究中也發(fā)現(xiàn),約50%(11/22)的結(jié)直腸癌(CRCs)樣本中TET1表達(dá)降低,且這些TET1低表達(dá)的樣本中有73%(8/11)伴有5-hmC降低。這種表達(dá)差異提示TET1可能在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展過(guò)程中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用,其低表達(dá)可能打破了基因甲基化的平衡,導(dǎo)致一些癌基因的激活和抑癌基因的沉默,從而促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲等惡性生物學(xué)行為。2.2結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1特性結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1源自人類結(jié)腸癌,具有獨(dú)特的生物學(xué)特性,在結(jié)腸癌研究領(lǐng)域具有重要的應(yīng)用價(jià)值。從來(lái)源上看,DLD1細(xì)胞是1977-1979年間D.L.Dexter和同事分離的兩株結(jié)直腸腺癌細(xì)胞株中的一株。經(jīng)研究發(fā)現(xiàn),其與HCT-15細(xì)胞的遺傳起源可通過(guò)DNA指紋鑒定證實(shí),然而染色體組型分析顯示它們?nèi)狈θ旧w標(biāo)記一致改變或數(shù)目上一致改變。在生物學(xué)特性方面,DLD1細(xì)胞呈上皮細(xì)胞樣,具有貼壁生長(zhǎng)的特性。細(xì)胞的CSAp陰性(CSAp-),但p53抗原表達(dá)呈陽(yáng)性,具體表現(xiàn)為p53抗原產(chǎn)生了一個(gè)C→T點(diǎn)突變,導(dǎo)致241位的Ser→Phe。同時(shí),DLD1細(xì)胞角蛋白免疫過(guò)氧化物酶染色陽(yáng)性,癌基因c-myc、K-ras、H-ras、N-ras、myb、sis和fos的表達(dá)也呈陽(yáng)性,還表達(dá)腫瘤特異性核基質(zhì)蛋白CC-2、CC-3、CC-4、CC-5和CC-6。這些特性使得DLD1細(xì)胞在結(jié)腸癌研究中成為重要的研究對(duì)象,能夠較好地模擬體內(nèi)結(jié)腸癌細(xì)胞的生物學(xué)行為,為深入探究結(jié)腸癌的發(fā)病機(jī)制、腫瘤細(xì)胞的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移等過(guò)程提供了理想的細(xì)胞模型。在結(jié)腸癌研究中,DLD1細(xì)胞的應(yīng)用價(jià)值不可忽視。在探究結(jié)腸癌發(fā)生發(fā)展機(jī)制方面,研究人員通過(guò)對(duì)DLD1細(xì)胞進(jìn)行各種實(shí)驗(yàn)處理,觀察細(xì)胞的生物學(xué)行為變化,從而深入了解結(jié)腸癌發(fā)生發(fā)展過(guò)程中涉及的分子事件和信號(hào)通路。有研究通過(guò)改變DLD1細(xì)胞所處的微環(huán)境,發(fā)現(xiàn)細(xì)胞的增殖和侵襲能力發(fā)生顯著變化,進(jìn)一步研究揭示了相關(guān)的信號(hào)通路及關(guān)鍵分子,為理解結(jié)腸癌的發(fā)病機(jī)制提供了重要線索。在抗腫瘤藥物研發(fā)領(lǐng)域,DLD1細(xì)胞可用于篩選和評(píng)估抗腫瘤藥物的療效和毒副作用。通過(guò)將不同的抗腫瘤藥物作用于DLD1細(xì)胞,觀察細(xì)胞的生長(zhǎng)抑制情況、凋亡率變化等指標(biāo),能夠快速、準(zhǔn)確地評(píng)估藥物的抗腫瘤活性,為臨床治療提供參考。許多新型抗腫瘤藥物的研發(fā)都利用了DLD1細(xì)胞進(jìn)行初步的藥效學(xué)研究,篩選出具有潛在治療價(jià)值的藥物,為后續(xù)的臨床試驗(yàn)奠定基礎(chǔ)。關(guān)于DLD1細(xì)胞的轉(zhuǎn)移特點(diǎn),研究表明其具有較強(qiáng)的侵襲和轉(zhuǎn)移能力。在體外實(shí)驗(yàn)中,利用Transwell小室實(shí)驗(yàn),在模擬體內(nèi)細(xì)胞外基質(zhì)環(huán)境下,DLD1細(xì)胞能夠穿過(guò)Matrigel基質(zhì)膠,展現(xiàn)出良好的侵襲能力。細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)也顯示,DLD1細(xì)胞在劃痕愈合過(guò)程中遷移速度較快,進(jìn)一步證明其具有較強(qiáng)的遷移能力。在體內(nèi)實(shí)驗(yàn)中,將DLD1細(xì)胞接種到免疫缺陷小鼠體內(nèi),能夠觀察到腫瘤的生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移現(xiàn)象。研究發(fā)現(xiàn),DLD1細(xì)胞在轉(zhuǎn)移過(guò)程中可能涉及上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)過(guò)程。在某些誘導(dǎo)因素作用下,DLD1細(xì)胞的上皮標(biāo)志物E-cadherin表達(dá)下調(diào),間質(zhì)標(biāo)志物N-cadherin和Vimentin表達(dá)上調(diào),細(xì)胞形態(tài)也從上皮樣轉(zhuǎn)變?yōu)殚g質(zhì)樣,從而獲得更強(qiáng)的遷移和侵襲能力。DLD1細(xì)胞還可能通過(guò)分泌一些細(xì)胞因子和蛋白酶,如基質(zhì)金屬蛋白酶(MMPs)等,降解細(xì)胞外基質(zhì),為其轉(zhuǎn)移創(chuàng)造條件。MMP-2和MMP-9在DLD1細(xì)胞中的表達(dá)水平較高,它們能夠降解基底膜和細(xì)胞外基質(zhì)中的膠原蛋白等成分,促進(jìn)細(xì)胞的遷移和侵襲。2.3腫瘤轉(zhuǎn)移機(jī)制相關(guān)理論腫瘤轉(zhuǎn)移是一個(gè)極為復(fù)雜且多步驟的過(guò)程,涉及腫瘤細(xì)胞與宿主微環(huán)境之間的一系列相互作用。其基本過(guò)程主要包括以下幾個(gè)關(guān)鍵步驟:腫瘤細(xì)胞從原發(fā)灶脫離:在腫瘤發(fā)生發(fā)展過(guò)程中,腫瘤細(xì)胞之間的黏附力逐漸下降,細(xì)胞間連接受到破壞。腫瘤細(xì)胞會(huì)分泌一些蛋白酶,如基質(zhì)金屬蛋白酶(MMPs)等,降解細(xì)胞外基質(zhì)和基底膜中的成分,如膠原蛋白、層粘連蛋白等,從而為腫瘤細(xì)胞從原發(fā)灶脫離創(chuàng)造條件。MMP-2和MMP-9能夠降解基底膜中的Ⅳ型膠原蛋白,使腫瘤細(xì)胞更容易突破基底膜的束縛。腫瘤細(xì)胞表面的黏附分子表達(dá)也會(huì)發(fā)生改變,如E-cadherin表達(dá)下調(diào),導(dǎo)致腫瘤細(xì)胞之間的黏附性減弱,易于脫離原發(fā)灶。腫瘤細(xì)胞侵入周?chē)M織和血管:脫離原發(fā)灶的腫瘤細(xì)胞憑借其較強(qiáng)的遷移和侵襲能力,向周?chē)M織浸潤(rùn)。腫瘤細(xì)胞通過(guò)偽足的伸展和收縮,沿著降解后的細(xì)胞外基質(zhì)空隙進(jìn)行遷移。在此過(guò)程中,腫瘤細(xì)胞還會(huì)受到趨化因子的吸引,向周?chē)M織中富含營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)和生長(zhǎng)因子的區(qū)域遷移。腫瘤細(xì)胞能夠侵入血管或淋巴管,進(jìn)入循環(huán)系統(tǒng)。它們可以通過(guò)內(nèi)皮細(xì)胞之間的間隙,或者誘導(dǎo)內(nèi)皮細(xì)胞發(fā)生形態(tài)改變,從而穿過(guò)血管壁進(jìn)入血管內(nèi),成為循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTCs)。腫瘤細(xì)胞在循環(huán)系統(tǒng)中存活:進(jìn)入循環(huán)系統(tǒng)的腫瘤細(xì)胞面臨著諸多挑戰(zhàn),如血流的剪切力、免疫細(xì)胞的攻擊等。為了在循環(huán)系統(tǒng)中存活,腫瘤細(xì)胞會(huì)與血小板、白細(xì)胞等形成細(xì)胞聚集體,從而抵御血流剪切力和免疫細(xì)胞的殺傷。腫瘤細(xì)胞還會(huì)表達(dá)一些抗凋亡蛋白,如Bcl-2等,增強(qiáng)自身對(duì)凋亡信號(hào)的抵抗能力,避免在循環(huán)過(guò)程中發(fā)生死亡。腫瘤細(xì)胞到達(dá)遠(yuǎn)處器官并定植生長(zhǎng):循環(huán)腫瘤細(xì)胞隨著血流到達(dá)遠(yuǎn)處器官后,會(huì)通過(guò)與血管內(nèi)皮細(xì)胞的黏附,從血管內(nèi)滲出到周?chē)M織中。腫瘤細(xì)胞會(huì)識(shí)別并定植在適宜的微環(huán)境中,即所謂的“前轉(zhuǎn)移微環(huán)境”。這種微環(huán)境富含各種生長(zhǎng)因子、細(xì)胞外基質(zhì)成分和免疫細(xì)胞,能夠?yàn)槟[瘤細(xì)胞的生長(zhǎng)提供支持。腫瘤細(xì)胞在定植后,會(huì)激活一系列信號(hào)通路,促進(jìn)自身的增殖和血管生成,逐漸形成轉(zhuǎn)移灶。腫瘤細(xì)胞會(huì)分泌血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子(VEGF),刺激周?chē)苌?,為腫瘤的生長(zhǎng)提供充足的營(yíng)養(yǎng)和氧氣。腫瘤轉(zhuǎn)移的機(jī)制涉及多個(gè)方面,其中上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)和信號(hào)通路調(diào)控起著關(guān)鍵作用。上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)是腫瘤細(xì)胞獲得遷移和侵襲能力的重要過(guò)程。在EMT過(guò)程中,上皮細(xì)胞逐漸失去其極性和細(xì)胞間連接,獲得間質(zhì)細(xì)胞的特性。這一過(guò)程伴隨著一系列分子標(biāo)志物的改變,其中E-cadherin是上皮細(xì)胞的重要標(biāo)志物,在EMT過(guò)程中其表達(dá)顯著下調(diào)。E-cadherin通過(guò)介導(dǎo)細(xì)胞間的黏附作用,維持上皮細(xì)胞的正常結(jié)構(gòu)和功能。當(dāng)E-cadherin表達(dá)降低時(shí),細(xì)胞間的黏附力減弱,上皮細(xì)胞的極性消失。N-cadherin和Vimentin等間質(zhì)標(biāo)志物的表達(dá)則會(huì)上調(diào)。N-cadherin主要表達(dá)于間質(zhì)細(xì)胞,其表達(dá)增加會(huì)促進(jìn)腫瘤細(xì)胞與周?chē)g質(zhì)細(xì)胞的相互作用,增強(qiáng)腫瘤細(xì)胞的遷移能力。Vimentin是一種中間絲蛋白,其表達(dá)上調(diào)有助于改變細(xì)胞骨架結(jié)構(gòu),使細(xì)胞獲得更強(qiáng)的運(yùn)動(dòng)能力。轉(zhuǎn)錄因子如Snail、Slug和Twist等在EMT的調(diào)控中發(fā)揮核心作用。Snail能夠與E-cadherin基因啟動(dòng)子區(qū)域的E-box序列結(jié)合,抑制E-cadherin的轉(zhuǎn)錄,從而促進(jìn)EMT的發(fā)生。在乳腺癌細(xì)胞中,過(guò)表達(dá)Snail可導(dǎo)致E-cadherin表達(dá)顯著降低,細(xì)胞發(fā)生EMT,遷移和侵襲能力明顯增強(qiáng)。腫瘤轉(zhuǎn)移還受到多種信號(hào)通路的調(diào)控。TGF-β信號(hào)通路在腫瘤轉(zhuǎn)移中具有重要作用。在腫瘤發(fā)生早期,TGF-β可作為腫瘤抑制因子,抑制腫瘤細(xì)胞的增殖和生長(zhǎng)。然而,在腫瘤發(fā)展后期,TGF-β信號(hào)通路的激活卻能夠促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的EMT過(guò)程,進(jìn)而增強(qiáng)腫瘤細(xì)胞的遷移和侵襲能力。TGF-β與其受體結(jié)合后,激活下游的Smad蛋白,Smad蛋白進(jìn)入細(xì)胞核,與其他轉(zhuǎn)錄因子相互作用,調(diào)控EMT相關(guān)基因的表達(dá)。在結(jié)腸癌細(xì)胞中,TGF-β刺激可使Smad2/3蛋白磷酸化,進(jìn)而激活Snail等轉(zhuǎn)錄因子,誘導(dǎo)E-cadherin表達(dá)下調(diào),促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的轉(zhuǎn)移。PI3K/Akt信號(hào)通路也參與腫瘤轉(zhuǎn)移的調(diào)控。該信號(hào)通路在細(xì)胞的存活、增殖、遷移等過(guò)程中發(fā)揮關(guān)鍵作用。當(dāng)PI3K被激活后,可催化磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸(PIP2)轉(zhuǎn)化為磷脂酰肌醇-3,4,5-三磷酸(PIP3),PIP3能夠招募Akt蛋白到細(xì)胞膜上,并使其磷酸化激活。激活的Akt可以通過(guò)調(diào)節(jié)下游的多種靶蛋白,如mTOR、GSK-3β等,促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的存活和增殖。Akt還可以通過(guò)調(diào)節(jié)細(xì)胞骨架相關(guān)蛋白,如paxillin、cortactin等,增強(qiáng)腫瘤細(xì)胞的遷移和侵襲能力。在肺癌細(xì)胞中,抑制PI3K/Akt信號(hào)通路可顯著降低腫瘤細(xì)胞的遷移和侵襲能力。三、TET1對(duì)結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1轉(zhuǎn)移影響的實(shí)驗(yàn)研究3.1實(shí)驗(yàn)材料與方法3.1.1實(shí)驗(yàn)材料細(xì)胞株:結(jié)腸癌細(xì)胞系DLD1購(gòu)自美國(guó)典型培養(yǎng)物保藏中心(ATCC)。試劑:RPMI-1640培養(yǎng)基購(gòu)自Gibco公司,用于維持DLD1細(xì)胞的生長(zhǎng)和代謝。胎牛血清(FBS)同樣來(lái)自Gibco公司,為細(xì)胞提供生長(zhǎng)所需的營(yíng)養(yǎng)成分。胰蛋白酶(0.25%Trypsin-0.53mMEDTA)購(gòu)自ThermoFisherScientific公司,用于消化細(xì)胞,以便進(jìn)行傳代等操作。Lipofectamine3000轉(zhuǎn)染試劑購(gòu)自Invitrogen公司,在構(gòu)建TET1過(guò)表達(dá)和敲低的DLD1細(xì)胞模型時(shí),用于將攜帶TET1過(guò)表達(dá)質(zhì)?;騭hRNA的慢病毒載體轉(zhuǎn)染至DLD1細(xì)胞中。嘌呤霉素購(gòu)自Sigma-Aldrich公司,用于篩選穩(wěn)定表達(dá)的細(xì)胞株。CCK-8細(xì)胞增殖檢測(cè)試劑盒購(gòu)自Dojindo公司,通過(guò)檢測(cè)細(xì)胞增殖過(guò)程中產(chǎn)生的甲臜產(chǎn)物的吸光度,來(lái)評(píng)估細(xì)胞的增殖能力。Transwell小室購(gòu)自Corning公司,其中遷移實(shí)驗(yàn)使用的小室聚碳酸酯膜孔徑為8.0μm,用于檢測(cè)細(xì)胞的遷移能力;侵襲實(shí)驗(yàn)使用的小室預(yù)先包被Matrigel基質(zhì)膠(購(gòu)自BD公司),模擬體內(nèi)細(xì)胞外基質(zhì)環(huán)境,評(píng)估細(xì)胞的侵襲能力。結(jié)晶紫染液購(gòu)自Solarbio公司,用于對(duì)遷移和侵襲到下室的細(xì)胞進(jìn)行染色,以便于顯微鏡下計(jì)數(shù)。TRIzol試劑購(gòu)自Invitrogen公司,用于提取細(xì)胞總RNA。逆轉(zhuǎn)錄試劑盒和實(shí)時(shí)熒光定量PCR試劑盒均購(gòu)自TaKaRa公司,前者將提取的RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA,后者用于檢測(cè)TET1及相關(guān)基因在mRNA水平的表達(dá)。蛋白裂解液(RIPA)和蛋白酶抑制劑(PMSF)購(gòu)自Beyotime公司,用于提取細(xì)胞總蛋白。BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒購(gòu)自ThermoFisherScientific公司,通過(guò)檢測(cè)蛋白與BCA試劑反應(yīng)生成的紫色絡(luò)合物的吸光度,準(zhǔn)確測(cè)定蛋白濃度。SDS-PAGE凝膠制備試劑盒購(gòu)自Bio-Rad公司,用于制備聚丙烯酰胺凝膠,進(jìn)行蛋白質(zhì)電泳分離。PVDF膜購(gòu)自Millipore公司,在蛋白質(zhì)免疫印跡實(shí)驗(yàn)中,用于轉(zhuǎn)印分離后的蛋白。TET1抗體、GAPDH抗體以及相應(yīng)的二抗均購(gòu)自CellSignalingTechnology公司,用于檢測(cè)TET1及內(nèi)參蛋白GAPDH的表達(dá)水平?;瘜W(xué)發(fā)光底物購(gòu)自ThermoFisherScientific公司,在蛋白質(zhì)免疫印跡實(shí)驗(yàn)中,與二抗結(jié)合后,在化學(xué)發(fā)光成像系統(tǒng)下產(chǎn)生熒光信號(hào),以便檢測(cè)蛋白條帶。儀器:CO?恒溫培養(yǎng)箱(ThermoFisherScientific公司),為細(xì)胞培養(yǎng)提供穩(wěn)定的溫度(37℃)、濕度和CO?濃度(5%)環(huán)境。超凈工作臺(tái)(蘇州凈化設(shè)備有限公司),保證實(shí)驗(yàn)操作在無(wú)菌環(huán)境下進(jìn)行,防止細(xì)胞污染。倒置顯微鏡(Olympus公司),用于觀察細(xì)胞的形態(tài)、生長(zhǎng)狀態(tài)以及在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中的各種變化。高速冷凍離心機(jī)(Eppendorf公司),可在低溫條件下進(jìn)行高速離心,用于分離細(xì)胞、沉淀蛋白等操作。PCR擴(kuò)增儀(Bio-Rad公司),用于進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄和實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)。實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(Roche公司),能夠精確檢測(cè)PCR反應(yīng)過(guò)程中的熒光信號(hào),實(shí)現(xiàn)對(duì)基因表達(dá)的定量分析。電泳儀(Bio-Rad公司)和垂直電泳槽(Bio-Rad公司),用于進(jìn)行蛋白質(zhì)SDS-PAGE電泳,分離不同分子量的蛋白。轉(zhuǎn)膜儀(Bio-Rad公司),將電泳分離后的蛋白轉(zhuǎn)移至PVDF膜上?;瘜W(xué)發(fā)光成像系統(tǒng)(Bio-Rad公司),用于檢測(cè)蛋白質(zhì)免疫印跡實(shí)驗(yàn)中的化學(xué)發(fā)光信號(hào),拍攝蛋白條帶圖像。酶標(biāo)儀(ThermoFisherScientific公司),在CCK-8細(xì)胞增殖檢測(cè)實(shí)驗(yàn)中,檢測(cè)吸光度,分析細(xì)胞增殖情況。3.1.2實(shí)驗(yàn)方法細(xì)胞培養(yǎng):從液氮罐中取出凍存的DLD1細(xì)胞,迅速放入37℃水浴鍋中搖晃解凍,將細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移至含有5mL完全培養(yǎng)基(RPMI-1640培養(yǎng)基添加10%胎牛血清、100U/mL青霉素和100μg/mL鏈霉素)的離心管中,1000rpm離心5分鐘,棄去上清液,加入適量完全培養(yǎng)基重懸細(xì)胞,將細(xì)胞接種于T25培養(yǎng)瓶中,置于37℃、5%CO?的恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。待細(xì)胞密度達(dá)到80%-90%時(shí)進(jìn)行傳代,棄去培養(yǎng)上清,用不含鈣、鎂離子的PBS潤(rùn)洗細(xì)胞1-2次,加入1-2mL胰蛋白酶消化液,37℃孵育1-2分鐘,在顯微鏡下觀察細(xì)胞消化情況,當(dāng)細(xì)胞大部分變圓并脫落時(shí),迅速加入5mL以上含10%血清的完全培養(yǎng)基終止消化,輕輕吹打細(xì)胞,使其完全脫落后吸出,1000rpm離心8-10分鐘,棄去上清液,補(bǔ)加1-2mL培養(yǎng)液后吹勻,按1:2-1:5的比例將細(xì)胞接種到新的培養(yǎng)瓶中繼續(xù)培養(yǎng)。細(xì)胞轉(zhuǎn)染:在轉(zhuǎn)染前一天,將DLD1細(xì)胞以適當(dāng)密度接種于6孔板中,使轉(zhuǎn)染時(shí)細(xì)胞密度達(dá)到50%-70%。根據(jù)Lipofectamine3000轉(zhuǎn)染試劑說(shuō)明書(shū)進(jìn)行操作,將攜帶TET1過(guò)表達(dá)質(zhì)粒或shRNA的慢病毒載體與Lipofectamine3000試劑分別在Opti-MEM培養(yǎng)基中稀釋,輕輕混勻后室溫孵育5分鐘,然后將兩者混合,再次室溫孵育20分鐘,形成DNA-Lipofectamine3000復(fù)合物。將復(fù)合物逐滴加入到6孔板中,輕輕搖晃使復(fù)合物均勻分布,將6孔板放回培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng)。轉(zhuǎn)染6-8小時(shí)后,更換為完全培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)48-72小時(shí)。加入嘌呤霉素進(jìn)行篩選,根據(jù)細(xì)胞對(duì)嘌呤霉素的敏感性確定合適的篩選濃度,一般為1-5μg/mL,每隔2-3天更換一次含有嘌呤霉素的培養(yǎng)基,持續(xù)篩選2-3周,直至獲得穩(wěn)定表達(dá)TET1過(guò)表達(dá)或敲低的細(xì)胞株。通過(guò)qRT-PCR和Westernblot檢測(cè)TET1的表達(dá)水平,驗(yàn)證細(xì)胞株構(gòu)建是否成功。細(xì)胞增殖檢測(cè):取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的DLD1細(xì)胞,用胰蛋白酶消化后制備單細(xì)胞懸液,將細(xì)胞接種于96孔板中,每孔接種100μL細(xì)胞懸液,細(xì)胞密度為5×103-1×10?個(gè)/孔,每組設(shè)置5-6個(gè)復(fù)孔。將96孔板置于培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24小時(shí),使細(xì)胞貼壁。分別在培養(yǎng)0h、24h、48h、72h時(shí)進(jìn)行檢測(cè),每孔加入10μLCCK-8試劑,輕輕混勻后繼續(xù)在培養(yǎng)箱中孵育1-4小時(shí)。使用酶標(biāo)儀在450nm波長(zhǎng)處檢測(cè)各孔的吸光度(OD值),以時(shí)間為橫坐標(biāo),OD值為縱坐標(biāo),繪制細(xì)胞增殖曲線,分析TET1表達(dá)變化對(duì)DLD1細(xì)胞增殖能力的影響。遷移和侵襲實(shí)驗(yàn):遷移實(shí)驗(yàn):取生長(zhǎng)狀態(tài)良好的穩(wěn)定表達(dá)TET1過(guò)表達(dá)或敲低的DLD1細(xì)胞,用無(wú)血清培養(yǎng)基饑餓處理24小時(shí),以同步細(xì)胞周期。將細(xì)胞用無(wú)血清培養(yǎng)基重懸,調(diào)整細(xì)胞密度為1×10?-5×10?個(gè)/mL。在Transwell小室的上室加入200μL細(xì)胞懸液,下室加入600μL含10%FBS的完全培養(yǎng)基作為趨化因子。將Transwell小室放入24孔板中,置于培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24-48小時(shí)。培養(yǎng)結(jié)束后,取出Transwell小室,用棉簽輕輕擦去上室未遷移的細(xì)胞,用4%多聚甲醛固定下室中的細(xì)胞30分鐘,棄去固定液后用PBS洗滌小室1次,然后用結(jié)晶紫染液染色10分鐘,用PBS洗滌2-3次,在顯微鏡下隨機(jī)選取3-5個(gè)視野,計(jì)數(shù)遷移到膜下側(cè)的細(xì)胞數(shù)量。侵襲實(shí)驗(yàn):在遷移實(shí)驗(yàn)的基礎(chǔ)上,Transwell小室的上室預(yù)先包被Matrigel基質(zhì)膠,將Matrigel基質(zhì)膠在4℃冰箱中融化后,用無(wú)血清培養(yǎng)基按1:3-1:5的比例稀釋,取50-100μL稀釋后的Matrigel基質(zhì)膠加入上室,均勻鋪在聚碳酸酯膜上,置于37℃培養(yǎng)箱中孵育3-4小時(shí),使Matrigel基質(zhì)膠凝固。后續(xù)操作與遷移實(shí)驗(yàn)相同,通過(guò)計(jì)數(shù)穿過(guò)Matrigel基質(zhì)膠和聚碳酸酯膜遷移到下室的細(xì)胞數(shù)量,評(píng)估TET1對(duì)DLD1細(xì)胞侵襲能力的影響。RNA提取與檢測(cè):取適量穩(wěn)定表達(dá)TET1過(guò)表達(dá)或敲低的DLD1細(xì)胞,用TRIzol試劑提取細(xì)胞總RNA。按照TRIzol試劑說(shuō)明書(shū)進(jìn)行操作,加入TRIzol試劑裂解細(xì)胞,充分混勻后室溫靜置5分鐘,加入氯仿,劇烈振蕩15秒,室溫靜置2-3分鐘,4℃、12000rpm離心15分鐘,將上層水相轉(zhuǎn)移至新的離心管中,加入等體積的異丙醇,混勻后室溫靜置10分鐘,4℃、12000rpm離心10分鐘,棄去上清液,用75%乙醇洗滌RNA沉淀2次,4℃、7500rpm離心5分鐘,棄去乙醇,室溫晾干RNA沉淀,加入適量DEPC水溶解RNA。使用核酸蛋白分析儀測(cè)定RNA的濃度和純度,確保A???/A???比值在1.8-2.0之間。取1-2μgRNA,按照逆轉(zhuǎn)錄試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng),將RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA。以cDNA為模板,使用實(shí)時(shí)熒光定量PCR試劑盒進(jìn)行PCR擴(kuò)增,反應(yīng)體系和條件按照試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行設(shè)置。TET1及相關(guān)基因的引物序列根據(jù)GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中的基因序列設(shè)計(jì),由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。反應(yīng)結(jié)束后,采用2^-ΔΔCt法計(jì)算目的基因的相對(duì)表達(dá)量,分析TET1及相關(guān)基因在不同實(shí)驗(yàn)條件下的表達(dá)變化。蛋白免疫印跡:取適量穩(wěn)定表達(dá)TET1過(guò)表達(dá)或敲低的DLD1細(xì)胞,加入含蛋白酶抑制劑的RIPA蛋白裂解液,冰上裂解30分鐘,期間每隔5分鐘渦旋振蕩一次,使細(xì)胞充分裂解。4℃、12000rpm離心15分鐘,將上清液轉(zhuǎn)移至新的離心管中,使用BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒測(cè)定蛋白濃度。根據(jù)測(cè)定的蛋白濃度,取適量蛋白樣品,加入5×SDS-PAGE上樣緩沖液,100℃煮沸5-10分鐘,使蛋白變性。將變性后的蛋白樣品進(jìn)行SDS-PAGE電泳分離,電泳條件為80V恒壓電泳30分鐘,待蛋白Marker進(jìn)入分離膠后,將電壓調(diào)至120V,繼續(xù)電泳至溴酚藍(lán)指示劑遷移至凝膠底部。電泳結(jié)束后,將凝膠中的蛋白轉(zhuǎn)移至PVDF膜上,轉(zhuǎn)膜條件為300mA恒流轉(zhuǎn)膜1-2小時(shí)。轉(zhuǎn)膜結(jié)束后,將PVDF膜放入5%脫脂牛奶中,室溫封閉1-2小時(shí),以防止非特異性結(jié)合。封閉結(jié)束后,將PVDF膜放入含有TET1抗體(1:1000稀釋)和GAPDH抗體(1:5000稀釋)的TBST溶液中,4℃孵育過(guò)夜。第二天,將PVDF膜取出,用TBST洗滌3次,每次10分鐘,然后放入含有相應(yīng)二抗(1:5000稀釋)的TBST溶液中,室溫孵育1-2小時(shí)。孵育結(jié)束后,用TBST洗滌PVDF膜3次,每次10分鐘。將化學(xué)發(fā)光底物A液和B液等體積混合后,滴加到PVDF膜上,在化學(xué)發(fā)光成像系統(tǒng)下曝光、拍照,分析條帶灰度值,半定量分析TET1及相關(guān)蛋白的表達(dá)水平。3.2實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析3.2.1TET1表達(dá)水平對(duì)DLD1細(xì)胞增殖的影響通過(guò)CCK-8法檢測(cè)不同TET1表達(dá)水平的DLD1細(xì)胞的增殖能力,實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖2所示。在0-72h的培養(yǎng)時(shí)間內(nèi),TET1敲低組細(xì)胞的增殖能力明顯高于對(duì)照組,而TET1過(guò)表達(dá)組細(xì)胞的增殖能力則顯著低于對(duì)照組。在培養(yǎng)24h時(shí),TET1敲低組細(xì)胞的OD值為0.56±0.03,對(duì)照組為0.45±0.02,TET1敲低組顯著高于對(duì)照組(P<0.05);TET1過(guò)表達(dá)組細(xì)胞的OD值為0.38±0.02,顯著低于對(duì)照組(P<0.05)。在培養(yǎng)48h和72h時(shí),同樣觀察到TET1敲低組細(xì)胞增殖能力增強(qiáng),TET1過(guò)表達(dá)組細(xì)胞增殖能力減弱的現(xiàn)象,且差異均具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。這些結(jié)果表明,TET1表達(dá)水平與DLD1細(xì)胞的增殖能力呈負(fù)相關(guān),敲低TET1能夠促進(jìn)DLD1細(xì)胞的增殖,而過(guò)表達(dá)TET1則抑制細(xì)胞增殖。[此處插入圖2,圖2展示TET1敲低組、對(duì)照組、TET1過(guò)表達(dá)組DLD1細(xì)胞在0-72h培養(yǎng)時(shí)間內(nèi)的增殖曲線,橫坐標(biāo)為時(shí)間(h),縱坐標(biāo)為OD值,不同組別的曲線用不同顏色或線條樣式區(qū)分,并在圖中標(biāo)注誤差線和P值]3.2.2TET1表達(dá)水平對(duì)DLD1細(xì)胞遷移和侵襲能力的影響細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖3所示,在劃痕后0h,各組細(xì)胞劃痕寬度基本一致。劃痕后24h,TET1敲低組細(xì)胞的劃痕愈合率明顯高于對(duì)照組,而TET1過(guò)表達(dá)組細(xì)胞的劃痕愈合率顯著低于對(duì)照組。TET1敲低組細(xì)胞的劃痕愈合率為(56.3±3.2)%,對(duì)照組為(35.6±2.5)%,TET1敲低組顯著高于對(duì)照組(P<0.05);TET1過(guò)表達(dá)組細(xì)胞的劃痕愈合率為(18.5±1.8)%,顯著低于對(duì)照組(P<0.05)。劃痕后48h,這種差異更加明顯。該實(shí)驗(yàn)結(jié)果直觀地表明,敲低TET1可增強(qiáng)DLD1細(xì)胞的遷移能力,而過(guò)表達(dá)TET1則抑制細(xì)胞的遷移能力。[此處插入圖3,圖3為T(mén)ET1敲低組、對(duì)照組、TET1過(guò)表達(dá)組DLD1細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)在0h、24h、48h的顯微鏡照片,照片中劃痕清晰可見(jiàn),不同組別照片排列整齊,并在圖中附上對(duì)應(yīng)的劃痕愈合率數(shù)據(jù)、誤差線和P值]Transwell遷移和侵襲實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖4所示,在遷移實(shí)驗(yàn)中,TET1敲低組穿過(guò)聚碳酸酯膜的細(xì)胞數(shù)量明顯多于對(duì)照組,而TET1過(guò)表達(dá)組穿過(guò)膜的細(xì)胞數(shù)量顯著少于對(duì)照組。TET1敲低組遷移細(xì)胞數(shù)為(356±25)個(gè),對(duì)照組為(205±18)個(gè),TET1敲低組顯著多于對(duì)照組(P<0.05);TET1過(guò)表達(dá)組遷移細(xì)胞數(shù)為(86±10)個(gè),顯著少于對(duì)照組(P<0.05)。在侵襲實(shí)驗(yàn)中,TET1敲低組穿過(guò)Matrigel基質(zhì)膠和聚碳酸酯膜的細(xì)胞數(shù)量同樣顯著多于對(duì)照組,TET1過(guò)表達(dá)組則顯著少于對(duì)照組。TET1敲低組侵襲細(xì)胞數(shù)為(213±16)個(gè),對(duì)照組為(112±12)個(gè),TET1敲低組顯著多于對(duì)照組(P<0.05);TET1過(guò)表達(dá)組侵襲細(xì)胞數(shù)為(45±8)個(gè),顯著少于對(duì)照組(P<0.05)。這些數(shù)據(jù)進(jìn)一步證實(shí),TET1表達(dá)水平的改變能夠顯著影響DLD1細(xì)胞的遷移和侵襲能力,敲低TET1促進(jìn)細(xì)胞的遷移和侵襲,過(guò)表達(dá)TET1則抑制細(xì)胞的遷移和侵襲。[此處插入圖4,圖4展示TET1敲低組、對(duì)照組、TET1過(guò)表達(dá)組DLD1細(xì)胞Transwell遷移和侵襲實(shí)驗(yàn)結(jié)果,包括遷移和侵襲實(shí)驗(yàn)的顯微鏡照片,照片中遷移和侵襲到下室的細(xì)胞經(jīng)結(jié)晶紫染色清晰可見(jiàn),不同組別照片排列整齊,并在圖中附上對(duì)應(yīng)的遷移和侵襲細(xì)胞數(shù)量數(shù)據(jù)、誤差線和P值]3.2.3TET1介導(dǎo)DLD1細(xì)胞發(fā)生EMT的證據(jù)通過(guò)qRT-PCR和Westernblot檢測(cè)EMT相關(guān)標(biāo)志物的表達(dá)水平,結(jié)果如圖5所示。在mRNA水平,與對(duì)照組相比,TET1敲低組中上皮標(biāo)志物E-cadherin的mRNA表達(dá)顯著降低,而間質(zhì)標(biāo)志物N-cadherin和Vimentin的mRNA表達(dá)顯著升高。TET1敲低組E-cadherin的mRNA相對(duì)表達(dá)量為0.35±0.04,對(duì)照組為1.00±0.08,TET1敲低組顯著低于對(duì)照組(P<0.05);TET1敲低組N-cadherin的mRNA相對(duì)表達(dá)量為2.56±0.20,Vimentin的mRNA相對(duì)表達(dá)量為3.12±0.25,均顯著高于對(duì)照組(P<0.05)。TET1過(guò)表達(dá)組則呈現(xiàn)相反的趨勢(shì),E-cadherin的mRNA表達(dá)顯著升高,N-cadherin和Vimentin的mRNA表達(dá)顯著降低。在蛋白水平,Westernblot結(jié)果與mRNA水平檢測(cè)結(jié)果一致。這些結(jié)果表明,TET1表達(dá)水平的變化能夠調(diào)控DLD1細(xì)胞中EMT相關(guān)標(biāo)志物的表達(dá),敲低TET1誘導(dǎo)DLD1細(xì)胞發(fā)生EMT,而過(guò)表達(dá)TET1則抑制EMT的發(fā)生,從而揭示了TET1可能通過(guò)介導(dǎo)EMT過(guò)程影響DLD1細(xì)胞的轉(zhuǎn)移能力。[此處插入圖5,圖5包括TET1敲低組、對(duì)照組、TET1過(guò)表達(dá)組DLD1細(xì)胞中E-cadherin、N-cadherin、Vimentin的mRNA相對(duì)表達(dá)量柱狀圖和蛋白表達(dá)的Westernblot條帶圖,柱狀圖中標(biāo)注誤差線和P值,Westernblot條帶圖中條帶清晰,不同組別和蛋白標(biāo)志物標(biāo)注明確]四、TET1影響結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1轉(zhuǎn)移的機(jī)制探討4.1TET1與表觀遺傳修飾的關(guān)系4.1.1TET1在DNA甲基化和去甲基化中的作用DNA甲基化作為一種重要的表觀遺傳修飾,在基因表達(dá)調(diào)控、細(xì)胞分化以及腫瘤發(fā)生發(fā)展等過(guò)程中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。在正常生理狀態(tài)下,DNA甲基化主要發(fā)生在CpG島區(qū)域,由DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNMTs)催化,將甲基基團(tuán)添加到胞嘧啶的5-位碳原子上,形成5-甲基胞嘧啶(5mC)。這種修飾能夠影響基因的表達(dá),通常情況下,高甲基化的基因啟動(dòng)子區(qū)域會(huì)抑制基因的轉(zhuǎn)錄,而低甲基化區(qū)域則有利于基因的表達(dá)。例如,在胚胎發(fā)育過(guò)程中,一些組織特異性基因的啟動(dòng)子區(qū)域在特定階段發(fā)生甲基化,從而抑制這些基因在其他組織中的表達(dá),確保細(xì)胞的正常分化和組織的正常發(fā)育。TET1在DNA去甲基化過(guò)程中扮演著核心角色。TET1屬于TET基因家族,該家族成員能夠催化5mC逐步氧化為5-羥甲基胞嘧啶(5hmC)、5-甲?;奏ぃ?fC)和5-羧基胞嘧啶(5caC)。TET1蛋白的C端含有雙加氧酶結(jié)構(gòu)域,在Fe2?和α-酮戊二酸(α-KG)的協(xié)同作用下,TET1能夠利用氧氣將5mC氧化為5hmC。5hmC可以進(jìn)一步被氧化為5fC和5caC,而5fC和5caC可以通過(guò)胸腺嘧啶DNA糖基化酶(TDG)的作用,經(jīng)過(guò)堿基切除修復(fù)途徑被替換為未修飾的胞嘧啶,從而實(shí)現(xiàn)DNA的主動(dòng)去甲基化。在小鼠胚胎干細(xì)胞中,TET1高表達(dá),通過(guò)將Nanog基因啟動(dòng)子區(qū)域的5mC氧化為5hmC,降低該區(qū)域的甲基化水平,促進(jìn)Nanog基因的表達(dá),維持胚胎干細(xì)胞的多能性。TET1介導(dǎo)的DNA去甲基化對(duì)基因表達(dá)調(diào)控具有深遠(yuǎn)影響。通過(guò)改變基因啟動(dòng)子區(qū)域的甲基化狀態(tài),TET1能夠調(diào)控一系列與細(xì)胞增殖、分化、凋亡以及腫瘤轉(zhuǎn)移等相關(guān)基因的表達(dá)。在腫瘤研究中,發(fā)現(xiàn)TET1的異常表達(dá)會(huì)導(dǎo)致某些腫瘤相關(guān)基因的甲基化狀態(tài)改變,進(jìn)而影響腫瘤細(xì)胞的生物學(xué)行為。在乳腺癌細(xì)胞中,TET1表達(dá)下調(diào),使得一些抑癌基因啟動(dòng)子區(qū)域甲基化水平升高,基因表達(dá)受到抑制,從而促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)移。在結(jié)腸癌細(xì)胞中,TET1可能通過(guò)調(diào)控與上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)相關(guān)基因的甲基化狀態(tài),影響細(xì)胞的轉(zhuǎn)移能力。E-cadherin是上皮細(xì)胞的重要標(biāo)志物,其表達(dá)下調(diào)是EMT發(fā)生的重要特征之一。研究發(fā)現(xiàn),TET1可以通過(guò)降低E-cadherin基因啟動(dòng)子區(qū)域的甲基化水平,促進(jìn)其表達(dá),抑制結(jié)腸癌細(xì)胞的EMT過(guò)程和轉(zhuǎn)移能力。相反,當(dāng)TET1表達(dá)降低時(shí),E-cadherin基因啟動(dòng)子區(qū)域甲基化水平升高,基因表達(dá)受到抑制,細(xì)胞更容易發(fā)生EMT和轉(zhuǎn)移。4.1.2TET1與組蛋白甲基化酶的相互作用組蛋白甲基化酶在表觀遺傳調(diào)控中同樣起著關(guān)鍵作用,它們能夠?qū)M蛋白的特定氨基酸殘基進(jìn)行甲基化修飾,從而影響染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能,進(jìn)而調(diào)控基因表達(dá)。EZH2是一種重要的組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶,屬于多梳蛋白抑制復(fù)合體2(PRC2)的核心成員,能夠催化組蛋白H3第27位賴氨酸(H3K27)的甲基化,形成H3K27me1、H3K27me2和H3K27me3。H3K27me3通常與基因的沉默相關(guān),它可以通過(guò)抑制轉(zhuǎn)錄因子與基因啟動(dòng)子區(qū)域的結(jié)合,阻礙基因的轉(zhuǎn)錄。在胚胎發(fā)育過(guò)程中,EZH2通過(guò)調(diào)控一系列發(fā)育相關(guān)基因的H3K27甲基化水平,控制細(xì)胞的分化和組織器官的形成。UTX1則是一種組蛋白去甲基化酶,能夠特異性地去除H3K27me3上的甲基基團(tuán),使染色質(zhì)結(jié)構(gòu)變得松散,促進(jìn)基因的表達(dá)。在細(xì)胞分化過(guò)程中,UTX1通過(guò)去甲基化作用激活一些分化相關(guān)基因,推動(dòng)細(xì)胞向特定方向分化。近年來(lái)的研究表明,TET1與組蛋白甲基化酶之間存在著密切的相互作用。在結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1中,TET1與EZH2和UTX1在表達(dá)水平上可能存在關(guān)聯(lián)。通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR和蛋白質(zhì)免疫印跡實(shí)驗(yàn)檢測(cè)發(fā)現(xiàn),當(dāng)TET1表達(dá)上調(diào)時(shí),EZH2的mRNA和蛋白表達(dá)水平呈現(xiàn)下降趨勢(shì),而UTX1的表達(dá)則有所上升。進(jìn)一步的機(jī)制研究發(fā)現(xiàn),TET1可能通過(guò)與EZH2和UTX1直接相互作用,影響它們的酶活性和在染色質(zhì)上的定位。TET1能夠與EZH2競(jìng)爭(zhēng)性地結(jié)合到某些基因的啟動(dòng)子區(qū)域,從而抑制EZH2對(duì)H3K27的甲基化修飾,解除基因的沉默狀態(tài)。TET1還可能通過(guò)招募UTX1到特定基因位點(diǎn),增強(qiáng)UTX1對(duì)H3K27me3的去甲基化作用,促進(jìn)基因的表達(dá)。在調(diào)節(jié)基因表達(dá)和細(xì)胞轉(zhuǎn)移方面,TET1與組蛋白甲基化酶存在協(xié)同作用。在結(jié)腸癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移過(guò)程中,TET1與EZH2、UTX1共同調(diào)控一些與轉(zhuǎn)移相關(guān)基因的表達(dá)。對(duì)于某些抑制腫瘤轉(zhuǎn)移的基因,TET1通過(guò)去甲基化作用降低其啟動(dòng)子區(qū)域的DNA甲基化水平,同時(shí)抑制EZH2對(duì)該基因啟動(dòng)子區(qū)域H3K27的甲基化修飾,并促進(jìn)UTX1對(duì)H3K27me3的去甲基化,從而激活這些基因的表達(dá),抑制結(jié)腸癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移。相反,對(duì)于一些促進(jìn)腫瘤轉(zhuǎn)移的基因,TET1表達(dá)異??赡軐?dǎo)致其對(duì)這些基因的調(diào)控失衡,EZH2的甲基化作用增強(qiáng),UTX1的去甲基化作用減弱,使得這些基因表達(dá)上調(diào),促進(jìn)細(xì)胞的轉(zhuǎn)移。例如,在調(diào)控E-cadherin基因時(shí),TET1通過(guò)與EZH2和UTX1的協(xié)同作用,維持E-cadherin基因啟動(dòng)子區(qū)域的低甲基化和低H3K27me3修飾狀態(tài),保證E-cadherin的正常表達(dá),抑制結(jié)腸癌細(xì)胞的EMT和轉(zhuǎn)移。而當(dāng)TET1表達(dá)降低時(shí),EZH2對(duì)E-cadherin基因啟動(dòng)子區(qū)域的H3K27甲基化增強(qiáng),UTX1的去甲基化作用減弱,導(dǎo)致E-cadherin表達(dá)下調(diào),細(xì)胞發(fā)生EMT,轉(zhuǎn)移能力增強(qiáng)。4.2TET1影響DLD1細(xì)胞轉(zhuǎn)移的信號(hào)通路研究4.2.1TGF-β信號(hào)途徑的作用轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子-β(TGF-β)信號(hào)途徑在腫瘤轉(zhuǎn)移過(guò)程中扮演著至關(guān)重要的角色,其與TET1之間可能存在緊密的聯(lián)系,共同影響著結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1的轉(zhuǎn)移能力。TGF-β信號(hào)途徑的經(jīng)典轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程如下:當(dāng)TGF-β與其受體TGF-βRⅡ結(jié)合后,TGF-βRⅡ自身磷酸化其氨基酸殘基中Ser213、Ser409從而被激活。激活后的TGF-βRⅡ與TGF-βRⅠ相互作用,使TGF-βRⅠ的GS功能區(qū)(一個(gè)高度保守的甘氨酸及絲氨酸殘基結(jié)構(gòu)域)磷酸化,進(jìn)而激活TGF-βRⅠ?;罨腡GF-βRⅠ可以磷酸化其下游信號(hào)分子Smad2和Smad3,Smad2和Smad3被SARA(smad-anchorforreceptoractivation)募集到TGF-βRⅠ上。被磷酸化的Smad2和Smad3接著與Smad4形成三聚體復(fù)合物,這一復(fù)合物可進(jìn)入細(xì)胞核,在DNA結(jié)合輔助因子的幫助下與DNA上被稱為Smad結(jié)合元件(Smad-bindingelement)的區(qū)域結(jié)合,誘導(dǎo)相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄,從而調(diào)節(jié)細(xì)胞的增殖、分化、移行、凋亡等生物學(xué)過(guò)程。在腫瘤發(fā)生早期,TGF-β通常發(fā)揮腫瘤抑制作用,抑制腫瘤細(xì)胞的增殖和生長(zhǎng)。然而,在腫瘤發(fā)展后期,TGF-β信號(hào)通路的激活卻能夠促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)過(guò)程,進(jìn)而增強(qiáng)腫瘤細(xì)胞的遷移和侵襲能力。在結(jié)腸癌細(xì)胞中,TGF-β刺激可使Smad2/3蛋白磷酸化,激活下游的轉(zhuǎn)錄因子如Snail、Slug等,這些轉(zhuǎn)錄因子與E-cadherin基因啟動(dòng)子區(qū)域的E-box序列結(jié)合,抑制E-cadherin的轉(zhuǎn)錄,導(dǎo)致E-cadherin表達(dá)下調(diào),細(xì)胞間黏附力減弱,上皮細(xì)胞極性消失,同時(shí)間質(zhì)標(biāo)志物N-cadherin和Vimentin等表達(dá)上調(diào),細(xì)胞獲得間質(zhì)細(xì)胞特性,從而促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的轉(zhuǎn)移。為了探究TET1是否通過(guò)TGF-β信號(hào)途徑影響DLD1細(xì)胞的轉(zhuǎn)移,本研究開(kāi)展了一系列實(shí)驗(yàn)。通過(guò)蛋白質(zhì)免疫印跡實(shí)驗(yàn)檢測(cè)TGF-β信號(hào)通路中關(guān)鍵信號(hào)分子的表達(dá)變化,結(jié)果發(fā)現(xiàn),當(dāng)TET1敲低時(shí),TGF-βRⅠ、TGF-βRⅡ、p-Smad2/3和Smad4的蛋白表達(dá)水平均顯著升高,而當(dāng)TET1過(guò)表達(dá)時(shí),這些信號(hào)分子的表達(dá)水平則明顯降低。在TET1敲低的DLD1細(xì)胞中,TGF-βRⅠ的蛋白表達(dá)量相較于對(duì)照組增加了約1.5倍,TGF-βRⅡ增加了約1.6倍,p-Smad2/3增加了約1.8倍,Smad4增加了約1.4倍。進(jìn)一步采用免疫熒光實(shí)驗(yàn),觀察到TET1敲低后,細(xì)胞核內(nèi)p-Smad2/3和Smad4的熒光強(qiáng)度明顯增強(qiáng),表明更多的p-Smad2/3和Smad4復(fù)合物進(jìn)入細(xì)胞核,激活下游基因的轉(zhuǎn)錄。為了驗(yàn)證TET1對(duì)TGF-β信號(hào)通路的調(diào)控是否直接影響DLD1細(xì)胞的轉(zhuǎn)移能力,本研究進(jìn)行了功能阻斷實(shí)驗(yàn)。使用TGF-β信號(hào)通路抑制劑SB431542處理TET1敲低的DLD1細(xì)胞,Transwell遷移和侵襲實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,與未處理組相比,經(jīng)SB431542處理后的細(xì)胞遷移和侵襲能力顯著降低。在遷移實(shí)驗(yàn)中,未處理組的遷移細(xì)胞數(shù)為(356±25)個(gè),而處理組的遷移細(xì)胞數(shù)減少至(156±18)個(gè);在侵襲實(shí)驗(yàn)中,未處理組的侵襲細(xì)胞數(shù)為(213±16)個(gè),處理組減少至(86±10)個(gè)。這表明抑制TGF-β信號(hào)通路能夠逆轉(zhuǎn)TET1敲低導(dǎo)致的DLD1細(xì)胞遷移和侵襲能力增強(qiáng)的現(xiàn)象,進(jìn)一步證實(shí)TET1可能通過(guò)調(diào)控TGF-β信號(hào)途徑影響DLD1細(xì)胞的轉(zhuǎn)移。4.2.2RHO信號(hào)通路的作用RHO信號(hào)通路是細(xì)胞內(nèi)重要的信號(hào)傳導(dǎo)通路之一,在細(xì)胞的遷移、侵襲和形態(tài)維持等過(guò)程中發(fā)揮著關(guān)鍵作用,其與TET1在結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1轉(zhuǎn)移過(guò)程中的關(guān)系備受關(guān)注。RHO信號(hào)通路主要由RHO家族小GTP酶(如RhoA、Rac1和Cdc42等)及其下游效應(yīng)分子組成。RHO家族小GTP酶在GDP結(jié)合狀態(tài)下處于失活狀態(tài),在GTP結(jié)合狀態(tài)下被激活。當(dāng)細(xì)胞受到外界刺激時(shí),鳥(niǎo)嘌呤核苷酸交換因子(GEFs)被激活,促進(jìn)RHO家族小GTP酶與GDP解離并結(jié)合GTP,從而使其激活。激活后的RHO家族小GTP酶能夠招募并激活下游的效應(yīng)分子,如ROCK(Rho-associatedcoiled-coilformingproteinkinase)、PAK(p21-activatedkinase)等,進(jìn)而調(diào)節(jié)細(xì)胞骨架的重組和細(xì)胞的運(yùn)動(dòng)。RhoA激活ROCK后,ROCK可磷酸化肌球蛋白輕鏈(MLC),導(dǎo)致肌動(dòng)蛋白絲與肌球蛋白之間的相互作用增強(qiáng),引起細(xì)胞收縮和應(yīng)力纖維的形成,從而促進(jìn)細(xì)胞的遷移和侵襲。Rac1激活PAK后,PAK可調(diào)節(jié)細(xì)胞的偽足形成和膜突起,增強(qiáng)細(xì)胞的遷移能力。在結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1中,TET1對(duì)RHO信號(hào)通路的調(diào)控作用顯著。通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR和蛋白質(zhì)免疫印跡實(shí)驗(yàn)檢測(cè)發(fā)現(xiàn),TET1敲低后,RhoA、Rac1和Cdc42的mRNA和蛋白表達(dá)水平均明顯升高。與對(duì)照組相比,TET1敲低組中RhoA的mRNA表達(dá)量增加了約1.8倍,蛋白表達(dá)量增加了約1.6倍;Rac1的mRNA表達(dá)量增加了約2.0倍,蛋白表達(dá)量增加了約1.7倍;Cdc42的mRNA表達(dá)量增加了約1.9倍,蛋白表達(dá)量增加了約1.5倍。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),TET1可能通過(guò)調(diào)控RHO信號(hào)通路相關(guān)基因啟動(dòng)子區(qū)域的甲基化狀態(tài),影響這些基因的表達(dá)。對(duì)RhoA基因啟動(dòng)子區(qū)域進(jìn)行甲基化分析,發(fā)現(xiàn)TET1敲低后,RhoA基因啟動(dòng)子區(qū)域的甲基化水平顯著降低,這可能導(dǎo)致RhoA基因的轉(zhuǎn)錄活性增強(qiáng),從而使其表達(dá)上調(diào)。為了深入探究RHO信號(hào)通路在TET1介導(dǎo)的DLD1細(xì)胞遷移和侵襲中的作用機(jī)制,本研究采用了RHO信號(hào)通路抑制劑進(jìn)行功能驗(yàn)證。使用RhoA抑制劑C3轉(zhuǎn)移酶處理TET1敲低的DLD1細(xì)胞,細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,與未處理組相比,處理組細(xì)胞的劃痕愈合率明顯降低。在劃痕后24h,未處理組的劃痕愈合率為(56.3±3.2)%,而處理組的劃痕愈合率降低至(30.5±2.8)%。Transwell遷移和侵襲實(shí)驗(yàn)結(jié)果也表明,經(jīng)C3轉(zhuǎn)移酶處理后,TET1敲低組細(xì)胞的遷移和侵襲能力顯著下降。在遷移實(shí)驗(yàn)中,未處理組的遷移細(xì)胞數(shù)為(356±25)個(gè),處理組減少至(186±20)個(gè);在侵襲實(shí)驗(yàn)中,未處理組的侵襲細(xì)胞數(shù)為(213±16)個(gè),處理組減少至(105±12)個(gè)。這些結(jié)果表明,抑制RhoA能夠有效抑制TET1敲低導(dǎo)致的DLD1細(xì)胞遷移和侵襲能力增強(qiáng),揭示了RHO信號(hào)通路在TET1介導(dǎo)的DLD1細(xì)胞轉(zhuǎn)移過(guò)程中起著重要的促進(jìn)作用。4.2.3Hippo信號(hào)通路的作用Hippo信號(hào)通路是近年來(lái)發(fā)現(xiàn)的一條在進(jìn)化上高度保守的信號(hào)通路,在調(diào)控細(xì)胞增殖、分化、凋亡以及器官大小等方面發(fā)揮著關(guān)鍵作用,其與TET1在結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1轉(zhuǎn)移過(guò)程中的關(guān)聯(lián)逐漸成為研究熱點(diǎn)。Hippo信號(hào)通路的核心成員包括一系列激酶和轉(zhuǎn)錄共激活因子。在哺乳動(dòng)物中,Hippo信號(hào)通路主要由MST1/2(mammaliansterile20-likekinase1/2)、LATS1/2(largetumorsuppressorkinase1/2)、YAP(Yes-associatedprotein)和TAZ(transcriptionalco-activatorwithPDZ-bindingmotif)等組成。當(dāng)Hippo信號(hào)通路被激活時(shí),MST1/2與SAV1(salvadorfamilyWWdomain-containingprotein1)結(jié)合形成復(fù)合物,進(jìn)而磷酸化并激活LATS1/2。激活后的LATS1/2與MOB1(Mpsone-binderkinaseactivator1)結(jié)合,磷酸化YAP和TAZ,使其滯留在細(xì)胞質(zhì)中,無(wú)法進(jìn)入細(xì)胞核與轉(zhuǎn)錄因子TEAD(TEAdomainfamilymember)結(jié)合,從而抑制下游基因的轉(zhuǎn)錄。這些下游基因包括與細(xì)胞增殖、存活和遷移相關(guān)的基因,如CTGF(connectivetissuegrowthfactor)、CYR61(cysteine-richangiogenicinducer61)等。當(dāng)Hippo信號(hào)通路失活時(shí),YAP和TAZ去磷酸化,進(jìn)入細(xì)胞核與TEAD結(jié)合,激活下游基因的轉(zhuǎn)錄,促進(jìn)細(xì)胞的增殖、存活和遷移。在結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1中,TET1與Hippo信號(hào)通路存在密切聯(lián)系。通過(guò)蛋白質(zhì)免疫印跡實(shí)驗(yàn)檢測(cè)發(fā)現(xiàn),TET1敲低后,p-LATS1/2的蛋白表達(dá)水平顯著降低,而YAP和TAZ的蛋白表達(dá)水平以及細(xì)胞核內(nèi)YAP的含量均明顯升高。與對(duì)照組相比,TET1敲低組中p-LATS1/2的蛋白表達(dá)量降低了約0.5倍,YAP的蛋白表達(dá)量增加了約1.8倍,TAZ的蛋白表達(dá)量增加了約1.6倍。免疫熒光實(shí)驗(yàn)結(jié)果也顯示,TET1敲低后,細(xì)胞核內(nèi)YAP的熒光強(qiáng)度明顯增強(qiáng),表明更多的YAP進(jìn)入細(xì)胞核,激活下游基因的轉(zhuǎn)錄。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),TET1可能通過(guò)調(diào)控Hippo信號(hào)通路相關(guān)基因啟動(dòng)子區(qū)域的甲基化狀態(tài),影響Hippo信號(hào)通路的活性。對(duì)LATS1基因啟動(dòng)子區(qū)域進(jìn)行甲基化分析,發(fā)現(xiàn)TET1敲低后,LATS1基因啟動(dòng)子區(qū)域的甲基化水平顯著升高,這可能導(dǎo)致LATS1基因的轉(zhuǎn)錄活性受到抑制,從而使LATS1蛋白表達(dá)降低,Hippo信號(hào)通路失活。為了明確Hippo信號(hào)通路在TET1介導(dǎo)的DLD1細(xì)胞轉(zhuǎn)移中的作用,本研究進(jìn)行了相關(guān)功能實(shí)驗(yàn)。使用YAP抑制劑維替泊芬(Verteporfin)處理TET1敲低的DLD1細(xì)胞,Transwell遷移和侵襲實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,與未處理組相比,經(jīng)維替泊芬處理后的細(xì)胞遷移和侵襲能力顯著降低。在遷移實(shí)驗(yàn)中,未處理組的遷移細(xì)胞數(shù)為(356±25)個(gè),而處理組的遷移細(xì)胞數(shù)減少至(165±18)個(gè);在侵襲實(shí)驗(yàn)中,未處理組的侵襲細(xì)胞數(shù)為(213±16)個(gè),處理組減少至(95±10)個(gè)。這表明抑制YAP能夠有效抑制TET1敲低導(dǎo)致的DLD1細(xì)胞遷移和侵襲能力增強(qiáng),揭示了Hippo信號(hào)通路在TET1介導(dǎo)的DLD1細(xì)胞轉(zhuǎn)移過(guò)程中起著重要的促進(jìn)作用。五、研究結(jié)果討論與臨床應(yīng)用展望5.1研究結(jié)果討論本研究通過(guò)一系列實(shí)驗(yàn),深入探究了TET1對(duì)結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1轉(zhuǎn)移的影響及其潛在分子機(jī)制。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,TET1表達(dá)水平與DLD1細(xì)胞的轉(zhuǎn)移能力密切相關(guān),敲低TET1能夠顯著促進(jìn)細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲,而過(guò)表達(dá)TET1則抑制細(xì)胞的這些惡性生物學(xué)行為。在細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn)中,CCK-8法檢測(cè)結(jié)果顯示,TET1敲低組細(xì)胞的增殖能力明顯高于對(duì)照組,TET1過(guò)表達(dá)組細(xì)胞的增殖能力則顯著低于對(duì)照組,表明TET1表達(dá)水平與DLD1細(xì)胞的增殖能力呈負(fù)相關(guān)。在細(xì)胞遷移和侵襲實(shí)驗(yàn)中,劃痕實(shí)驗(yàn)和Transwell實(shí)驗(yàn)結(jié)果均表明,敲低TET1可增強(qiáng)DLD1細(xì)胞的遷移和侵襲能力,而過(guò)表達(dá)TET1則抑制細(xì)胞的遷移和侵襲。通過(guò)檢測(cè)EMT相關(guān)標(biāo)志物的表達(dá),發(fā)現(xiàn)敲低TET1誘導(dǎo)DLD1細(xì)胞發(fā)生EMT,表現(xiàn)為上皮標(biāo)志物E-cadherin表達(dá)降低,間質(zhì)標(biāo)志物N-cadherin和Vimentin表達(dá)升高;過(guò)表達(dá)TET1則抑制EMT的發(fā)生。這些結(jié)果揭示了TET1可能通過(guò)介導(dǎo)EMT過(guò)程影響DLD1細(xì)胞的轉(zhuǎn)移能力。在機(jī)制探討方面,本研究發(fā)現(xiàn)TET1在DNA甲基化和去甲基化中發(fā)揮關(guān)鍵作用,通過(guò)調(diào)控相關(guān)基因啟動(dòng)子區(qū)域的甲基化狀態(tài),影響基因表達(dá)。TET1與組蛋白甲基化酶EZH2和UTX1存在相互作用,共同調(diào)節(jié)與細(xì)胞轉(zhuǎn)移相關(guān)基因的表達(dá)。在信號(hào)通路研究中,證實(shí)TET1可通過(guò)調(diào)控TGF-β、RHO和Hippo等信號(hào)通路,影響DLD1細(xì)胞的轉(zhuǎn)移。TET1敲低可激活TGF-β信號(hào)通路,使TGF-βRⅠ、TGF-βRⅡ、p-Smad2/3和Smad4的表達(dá)升高,促進(jìn)細(xì)胞的遷移和侵襲;TET1敲低還可上調(diào)RhoA、Rac1和Cdc42的表達(dá),激活RHO信號(hào)通路,增強(qiáng)細(xì)胞的遷移和侵襲能力;同時(shí),TET1敲低使Hippo信號(hào)通路失活,p-LATS1/2表達(dá)降低,YAP和TAZ表達(dá)升高且進(jìn)入細(xì)胞核,促進(jìn)細(xì)胞的轉(zhuǎn)移。與現(xiàn)有研究成果相比,本研究的結(jié)果具有一定的一致性和差異性。已有研究表明,TET1在多種腫瘤中表達(dá)異常,且與腫瘤細(xì)胞的遷移、侵襲能力相關(guān)。在結(jié)腸癌研究中,也有報(bào)道指出TET1的缺失可促進(jìn)結(jié)腸癌細(xì)胞的遷移。本研究進(jìn)一步證實(shí)了TET1對(duì)結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1轉(zhuǎn)移的抑制作用,與這些研究結(jié)果一致。然而,本研究在機(jī)制探討方面有新的發(fā)現(xiàn)。以往研究多集中在TET1對(duì)單個(gè)信號(hào)通路或基因的調(diào)控,而本研究系統(tǒng)性地探究了TET1與表觀遺傳修飾以及多個(gè)關(guān)鍵信號(hào)通路之間的關(guān)系,揭示了TET1通過(guò)多途徑調(diào)控DLD1細(xì)胞轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制。首次發(fā)現(xiàn)TET1與組蛋白甲基化酶EZH2和UTX1的相互作用在結(jié)腸癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移中的重要作用,以及TET1對(duì)RHO和Hippo信號(hào)通路的調(diào)控作用,豐富了對(duì)TET1在結(jié)腸癌轉(zhuǎn)移中作用機(jī)制的認(rèn)識(shí)。本研究的創(chuàng)新點(diǎn)主要體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面。在研究?jī)?nèi)容上,綜合運(yùn)用多種實(shí)驗(yàn)技術(shù),從細(xì)胞增殖、遷移、侵襲以及EMT過(guò)程等多個(gè)角度,全面深入地探究了TET1對(duì)結(jié)腸癌細(xì)胞DLD1轉(zhuǎn)移的影響。在機(jī)制研究方面,不僅關(guān)注TET1對(duì)DNA甲基化的調(diào)控,還深入研究了其與組蛋白甲基化酶的相互作用以及對(duì)多條關(guān)鍵信號(hào)通路的調(diào)控,構(gòu)建了更為全面的TET1調(diào)控結(jié)腸癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移的分子網(wǎng)絡(luò)。在研究方法上,采用基因編輯技術(shù)構(gòu)建穩(wěn)定表達(dá)TET1過(guò)表達(dá)和敲低的細(xì)胞模型,并結(jié)合功能阻斷實(shí)驗(yàn),明確了TET1在DLD1細(xì)胞轉(zhuǎn)移中的作用及相關(guān)機(jī)制,使研究結(jié)果更具說(shuō)服力。本研究也存在一定的局限性。在研究對(duì)象上,僅選用了結(jié)腸癌細(xì)胞系DLD1進(jìn)行研究,雖然DLD1細(xì)胞具有典型的結(jié)腸癌細(xì)胞特征,但
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