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群落學分析基本問題:(RDA,CCA,dbRDA輸出的校正R2)環(huán)境因子對群落組成變化影響程度的排序(相對重要性)KNOWLEDGEGAPHierarchicalPartitioning(AlbertChevan&MichaelSutherland,1991)calc.relimp{relaimpo}dominanceAnalysisFullcontributionOrder-independentX1rdacca.hppackage(spe.hp<-rdacca.hp(spe.hel,env,methFullcontributionOrder-independentIndividualeffect是所有變量組合模型的組合值其置換檢驗可信度。如果置換檢驗的結果符合預期,可使用共詞分析展示rdacca.hp包在各領域的應用截至2022年8月31日,使用的文章數(shù)量統(tǒng)計93篇(數(shù)據(jù)統(tǒng)計自Google學術)。rdacca.hp包的相關應用1生物多樣性群落3植物生理2生物地球化學4其他生態(tài)和環(huán)境應用廈門后溪流域浮游植物群落多樣性調(diào)查調(diào)查城市化對亞熱帶河流浮游植物群落結構和功能的影響,城市化面積百分比(BA)解釋了浮游植物群落的最大變異市化在塑造亞熱帶河流浮游植物群落結構和功能方面東北張廣才嶺甲蟲群落多樣性的研究稀有甲蟲類群只與季節(jié)變化有關,對生境的偏好不明顯(b)長期放牧改善了高寒典型草原氣候影響下的長期放牧改善了高寒典型草原氣候影響下的土壤化學性質(zhì)并有益于群落性狀基于相關性和最佳多元回歸模型的變量對群落多樣性和群落生基于相關性和最佳多元回歸模型的變量對群落多樣性和群落生的貢獻。圓圈大小代表變量重要性(即通過多元回歸建模和方差分解分析計算出的解釋變異性的比例亞熱帶樹木多樣性試驗中植物對土壤真菌的影響大于細菌群落和共生網(wǎng)絡結構整個土壤剖面變暖不會改變表層和深層土壤的微生物碳利用效率影響古土壤中有機質(zhì)分解的溫度敏感性的因素碳有效性是影響古土壤有機質(zhì)分解的溫度敏感性(Q10)表明古土壤中碳效性增加了有機質(zhì)分解的溫度敏感性(圖華中淮河流域稻田微生物群落研究無論淺耕(C)或深耕(D)土地,與氮有關的環(huán)境因子均是影響土壤巴倫支海底棲生物群落和食物網(wǎng)結構的時空變化層次分割計算所有子集模型的變量重要性,從而獲得對重要性的不依賴輸入順序的評估(Laietal.,2022)真菌條形碼的最佳實踐:從實驗設計到結果使用“rdacca.hp”包,利用層次分割來估計多元模型中單一預測因子的總體重要性。Usingthe"rdacca.hp"package,hierarchicalpartitioningisutilizedtoestimatetheoverallimportanceofasinglepredictorinamultivariatemodel(Laietal.,2022).氣候變暖情景下北極浮游食物網(wǎng)中汞和其他金屬的濃度利用“rdacca”進行了層次分割(HP)分析,確定了浮游動物種類豐度和環(huán)境變2022).熱巖溶湖發(fā)育不同階段底棲生物和浮游動物群落的物種多樣性及其驅(qū)動因素——以西伯利亞中部勒拿河三角洲為例ElenaS.Chertoprud列寧斯基共和國無人機-激光雷達顯示,林冠結構介導邊緣效應對森林多樣性、功能和小氣候的影響我們通過利用變差分解和層次分割分析,評估了邊緣距離、冠層結構和地形對不同森林屬性的共享效應和獨立效應的相對重要性。并且我們使用該方法用于評估基于典范冗余分析(RDA)的多響應回歸模型中不同預測因子的相東英吉利海峽(東北大西洋)六個河口歐洲鰻(AnguillaAnguilla)棲息地利用與個體狀況的關系濱海大學法國通過rdacca.hp受選定生物結構、空間位置和水文形態(tài)沉積協(xié)變量態(tài)(Malacostraca和放光翅蟲獵物,δ13C和T生物和非生物預測都解釋了從溫帶到亞北極地區(qū)湖泊藍藻生物量的顯著變化使用“rdacca.hp”包,量化和解釋由藍藻驅(qū)動因素解桉樹林的干擾改變了土壤微生物群落的組成、功能和組合andfungalcommuniti森林邊緣距離對秘魯亞馬孫東南部小型金礦開采后植被自然演替JorgeGarate-Quispe上帝之母國立亞馬遜大學秘魯基于Bray–Curtis距離的距離冗余分析(dbRDA)方法。使用“rdacca.hp”包來確定預測變量(到森林邊abandonmenttime).土壤微真核生物多樣性模式沿著海拔梯度最好的估計是增加海拔臺階數(shù),而不是在海拔帶復制使用層次分割來估計不同海拔梯度環(huán)境變量對土壤真核生物多樣性格局的相對解析大型植物殘骸中底棲生境的異質(zhì)性和空間結構植物功能群和系統(tǒng)發(fā)育規(guī)律通過鈣和鎂控制植物群落生物元素組成植物群落方面(功能群組成、系統(tǒng)發(fā)育多樣性和物模型公式、邊際和條件決定系數(shù)(R2)以及個人貢獻和獨立為濕地碳設定參考:考慮水文、地形和自然變化的重要性UV/過碳酸鈉處理水中的雙酚A:水質(zhì)參數(shù)對反應自由基形成森林干擾對微型節(jié)肢動物群落的影響取決于潛在的生態(tài)梯度和物種特征如何評估GLMM的擬合度(R2marginalR2種植園林下豆科植物功能群通過促進物種豐富度來提高土壤有機碳的固存量LandDegradation&Development基于正態(tài)分布的線性混合效應模型,使用glmm.hp包探究了林下物種豐富度(USR)和種植年齡對土壤有機碳(SOC)儲存的直接影響,并確定了由USR介導的林下豆類物種豐富度(ULSR)和土壤濕度(SM)的間接影響。結果表明,種增加了SOC固存,效果幾乎相同。ULSR可以通過促進USR來增加SOC封存,而SM分別對U草原生物多樣性對牲畜放牧、生產(chǎn)力和氣候的反應畜牧業(yè)過度放牧和氣候變化已被確定為草原退化和生物多樣性下降因,但其潛在機制尚不清楚?;谡龖B(tài)分布的線性混合模型,使用glmm.hp原生產(chǎn)力是推動生產(chǎn)者豐富度的關鍵因素,預測因子的總貢獻和個體貢獻在生物群落成分和多樣性測量中各不相同,這些發(fā)現(xiàn)可用于為未來的草原保護云南廢棄鉛鋅礦區(qū)植物群落自發(fā)演替的驅(qū)動因素及機制云南廢棄鉛鋅礦區(qū)植物群落自發(fā)演替的驅(qū)動因素及機制本研究調(diào)查了利用基于自然的恢復來促進采礦荒地中可行植物群落于自然的恢復提供見解?;谝话憔€性混合效應模型,使用glmm.hp包探究了演替過程中功能多樣性對物種多樣性和土壤環(huán)境的響應。數(shù)、Shannon-Wiener指復過程的主要因素。研究表明了基于自然的廢棄礦區(qū)穩(wěn)定戰(zhàn)略可以促進有效的植人為活動解釋了北亞熱帶生物多樣性熱點保護區(qū)和非保護區(qū)外來植物入侵的差異謝宗強團隊(2023)中科院植物所JournalofEnvironmentalManagement的范圍和影響的數(shù)據(jù),以支持大神農(nóng)架范圍內(nèi)外來植物的預防、控制和管理?;诓此煞植己透咚狗植嫉膹V義線性混合模型,使用glmm.hp包探究了樹種豐富度(或豐度)與環(huán)境變量(保護狀況、土地利用方式和繁殖體壓力)之間的關系。結果表明,保護狀況和與人類住宅區(qū)的距離是外來植物入侵最重要的預測因子。保護地內(nèi)外來植物的平均業(yè)活動是外來植物繁殖體的來源,強調(diào)了保護地與保護地、保護地與非保護地之間連河湖交錯帶土壤磷循環(huán)和生物有效性對植物入侵的響應劉春花團隊(2023)武漢大學EcologicalApplications基于正態(tài)分布的線性混合效應模型,使用glmm.hp包評估了旱生A.philo入侵對土壤生物有效磷形態(tài)和濃度的影響。結果發(fā)現(xiàn):旱生A.philo侵使無機磷濃度分別升高39.5%和3.7%,有機磷濃度分別降低32.7%和31.9%。此外,入侵促進了河湖交錯帶磷的循環(huán)和積累,導致土壤氮磷比和碳磷比分別平均下降7.9%和12.5%。這些結果突出了外來植物入侵對河湖交錯帶濕地生態(tài)沉水植物對底棲魚類干擾的適應性反應和轉(zhuǎn)基因可塑性劉春花團隊(2023)武漢大學EcologyandEvolution在一些亞熱帶湖泊中,底棲魚類在魚類群落中占主導地位,并影響水下植物的生全面了解底棲魚類對沉水植物的直接和間接影響很重要?;贐eta分布的廣義線性模型,使用glmm.hp包探究了處理組魚類密度(FD)和發(fā)芽實驗魚類密度(MD)對在相同的MD中,不同F(xiàn)Ds下的最終發(fā)芽率存在顯著差異。FD和MD的46.89%的發(fā)芽結果,F(xiàn)D和MD單獨解釋了9.53%和43.功能特征驅(qū)動樹種豐富度,導致幼樹群落落葉量和林地質(zhì)量增加黃志群團隊(2023)福建師范大學NewPhytologi雖然有證據(jù)表明樹木多樣性和土壤碳呈正相關,但大多數(shù)土壤碳研林底層碳對樹木多樣性損失的響應?;谡龖B(tài)分布的一般線性混合模型,使用glmm.hp包探究了樹種豐富度、功能多樣性和群落加權平均值對凋落物產(chǎn)量、面腐爛率和林地質(zhì)量的影響,結果發(fā)現(xiàn):樹木物種豐富度對凋落物產(chǎn)量影響最強物種豐富的森林中底部有機物積累越多,樹木多樣性對生態(tài)系統(tǒng)碳循環(huán)和服務產(chǎn)生華北平原小麥-玉米輪作系統(tǒng)氨損失潛力和緩解方案劉學軍團隊(2023)中國農(nóng)業(yè)大學Agriculture,EcosystemsandEnviron肥造成的氨揮發(fā)損失分別為9.1%和5.0%,且受施肥方法和氮肥類型的顯著影響。與傳統(tǒng)做法相比,優(yōu)化降低施氮量對NH3的緩解葉柄和軸的生物量和氮含量預測植物復葉小葉性狀的變化基于正態(tài)分布的線性混合效應模型,使用glmm.hp包來探索小葉性狀變異與線性元素(即葉柄和軸)的生物量或氮含量之間的關系。在低溫高地區(qū),線性元素的生物量和氮含量對小葉面積和質(zhì)量的預測性能最強。線基于線性元素的生物量和氮含量的葉片性狀變異預測性能的系統(tǒng)發(fā)育保守種子特征對嚙齒動物捕食偏好的影響在許多森林生態(tài)系統(tǒng)中,嚙齒動物的種子覓食偏好直接受種子性狀的影廣義線性混合效應模型,使用glmm.hp包探究鄰居效應對嚙齒動物的種子覓食偏好的影響。結果顯示:目標種子比相鄰種子外形越大,它被嚙齒動物搬運和貯藏的可能性就越大;目標種子比相鄰種子的營養(yǎng)含量越高,被搬運的與保護相關的植物物種預測不同營養(yǎng)水平的節(jié)肢動物豐富度Tobischetal,(2023)德國慕尼黑工業(yè)大學EcologicalI土地利用效應,并探索了植物物種豐度的環(huán)境驅(qū)動因素。結果發(fā)現(xiàn):營養(yǎng)類群的節(jié)肢動物物種數(shù)量對受保護棲息地的植物物種數(shù)量都有強烈的反應,而紅色大型無脊椎動物特征組成和功能多樣性的海拔格局葉麟團隊(2022)中國科學院水生生物研究所Ecolo高山地區(qū)的溪流生態(tài)系統(tǒng)容易受到環(huán)境快速變化的影響,包括氣候變活動增加?;谡龖B(tài)分布的線性混合模型,使用glmm.hp包探究了流域人類干擾和河流內(nèi)物理化學因素對河流大型無脊椎動物海拔模式的影響。研究結果表明,微弱的人類干擾是塑造大型無脊椎動物特征組成和功能多樣性的最重要驅(qū)螃蟹增強鹽沼中CO2和CH4的排放王法明團隊(2022)中國科學院華南植物園EcologicalIndicators基于負二項分布的廣義線性混合效應模型,使用glmm.hp包評估了在新英格同時,螃蟹活動使鹽沼植被中的土壤CO2和CH4排放量分別增加了51.7%。研究結果強調(diào)了在評估海岸的潛在碳封存能力時考慮洞穴活動的重西北干旱區(qū)荒漠植物葉片性狀的變異與關聯(lián)單立山團隊(2023)甘肅農(nóng)業(yè)大學EcologyandEvolution基于正態(tài)分布的線性混合效應模型,使用glmm.hp包探究了種內(nèi)和種間變異對每個葉片性狀總變異的貢獻,研究結果發(fā)現(xiàn)葉片性狀的種間變異對總體變異內(nèi)變異;不同生命形式葉片性狀的種內(nèi)和種間變異不同。研究結果促區(qū)群落聚集機制的理解,并表明未來的工作可能側(cè)重于植物性狀在種自然分布最南端蒙古樟子松的抗旱性:天然林和人工林的比較沈澤昊團隊(2023)北京大學ForestEcologyandManagement全球變暖增加了氣候干旱事件的頻率和強度,加劇了森林生態(tài)系統(tǒng)的脆弱性,尤其是在邊緣棲息地?;谡龖B(tài)分布的線性混合效應模型,使用glmm.hp包探究了環(huán)境因子和森林指標(樹齡、種群密度、樹高)對抵(Rt)、恢復力(Rc)、彈性(Rs)的影響,結果發(fā)現(xiàn):對于不同嚴重程度的干旱事件,天然林中的Rs比種植園中更穩(wěn)定,干旱前的高增長可能會削林和種植園的Rs。干

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