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文檔簡介
一、引言外泌體作為細胞分泌的納米級囊泡,攜帶來源細胞的蛋白質(zhì)、核酸、脂質(zhì)等生物分子,在細胞間通訊、疾病診斷與治療等領(lǐng)域展現(xiàn)出巨大潛力。精準的外泌體實驗方案是開展相關(guān)研究的核心基礎(chǔ),其分離純度、鑒定準確性及功能驗證的可靠性直接影響研究結(jié)論的科學(xué)性。本文結(jié)合前沿研究技術(shù)與實踐經(jīng)驗,系統(tǒng)闡述外泌體實驗的全流程操作要點,為科研工作者提供可參考的實驗范式。二、樣本收集與預(yù)處理(一)細胞培養(yǎng)上清樣本1.細胞培養(yǎng):選取對數(shù)生長期的目的細胞(如腫瘤細胞、干細胞等),采用無外泌體血清(或無血清培養(yǎng)基)培養(yǎng)48~72小時,避免血清中外泌體的干擾。若使用含血清培養(yǎng)基,需提前通過超速離心(100,000×g,16小時,4℃)去除血清外泌體,經(jīng)0.22μm濾膜過濾后備用。2.上清收集:收集細胞培養(yǎng)上清時,先以300×g離心10分鐘(4℃)去除懸浮細胞,再以2,000×g離心10分鐘(4℃)去除細胞碎片,最后經(jīng)0.22μm濾膜過濾,獲得澄清的待分離上清,置于冰上或-80℃暫存(短期保存建議4℃,避免反復(fù)凍融)。(二)體液樣本(血清、尿液、腦脊液等)1.血清樣本:采集全血后室溫靜置30分鐘待凝固,3,000×g離心15分鐘(4℃)分離血清,再經(jīng)0.22μm濾膜過濾,去除纖維蛋白及細胞殘渣。若需長期保存,可分裝后-80℃凍存,避免反復(fù)凍融導(dǎo)致外泌體降解。2.尿液樣本:留取中段尿,4℃條件下3,000×g離心15分鐘去除細胞及沉淀,上清經(jīng)0.22μm濾膜過濾后,可直接用于分離或-80℃凍存。需注意尿液中蛋白濃度低,分離時可適當擴大樣本量。三、外泌體分離純化方法(一)超速離心法(經(jīng)典金標準)原理:利用外泌體與其他囊泡、蛋白復(fù)合物的密度及沉降系數(shù)差異,通過梯度離心實現(xiàn)分離。操作步驟:1.取預(yù)處理后的樣本(細胞上清或體液),置于超速離心管中,4℃條件下依次進行:10,000×g離心30分鐘,去除大囊泡及蛋白聚集體;100,000×g離心70分鐘(或120,000×g離心90分鐘),使外泌體沉降;棄上清,用預(yù)冷的PBS(或無血清培養(yǎng)基)重懸沉淀,再次以100,000×g離心70分鐘,洗滌外泌體以去除殘留蛋白。2.最終沉淀用適量PBS重懸,即為粗提外泌體,可立即用于后續(xù)實驗或-80℃凍存。注意事項:離心管需嚴格平衡,避免超速離心機失衡;全程保持4℃,防止外泌體膜結(jié)構(gòu)破壞;重復(fù)離心可提高純度,但會損失部分產(chǎn)量。(二)密度梯度離心法(提高純度)原理:通過蔗糖或碘克沙醇等密度梯度介質(zhì),使不同密度的囊泡在離心場中分層,外泌體(密度1.13~1.19g/mL)可與高密度蛋白復(fù)合物、低密度微囊泡分離。操作步驟:1.制備密度梯度:將蔗糖溶液(如0.25、0.8、1.25M)或碘克沙醇溶液(如5%、20%、40%)依次鋪于超速離心管中,形成連續(xù)或不連續(xù)梯度;2.樣本鋪于梯度上層,100,000×g離心16~20小時(4℃);3.用注射器從管底分層吸取不同密度組分,通過WB或NTA鑒定外泌體所在層,收集后用PBS透析或稀釋,去除梯度介質(zhì)。優(yōu)勢:純度高于超速離心法,適用于外泌體功能研究或蛋白組學(xué)分析。(三)免疫親和捕獲法(特異性分離)原理:利用外泌體表面標志物(如CD63、CD9、EpCAM等)的抗體,通過免疫磁珠或免疫親和柱特異性捕獲外泌體。操作步驟(以磁珠法為例):1.將包被抗體的磁珠(如抗CD63磁珠)與預(yù)處理樣本4℃孵育2~4小時,輕柔振蕩;2.用磁力架分離磁珠-外泌體復(fù)合物,棄上清;3.用含蛋白酶抑制劑的PBS洗滌磁珠3次,去除未結(jié)合雜質(zhì);4.加入洗脫液(如甘氨酸-HCl,pH2.5)洗脫外泌體,立即用Tris-HCl中和pH。優(yōu)勢:可富集特定來源或功能的外泌體,適用于微量樣本或標志物研究。(四)試劑盒法(簡便高效)原理:基于聚合物沉淀(如PEG)或柱層析原理,通過試劑與外泌體的相互作用實現(xiàn)快速分離。操作步驟(以PEG沉淀法為例):1.樣本與沉淀試劑(如PEG8000溶液)按比例混合,4℃孵育過夜;2.10,000×g離心1小時(4℃),棄上清;3.沉淀用PBS重懸,經(jīng)0.22μm濾膜過濾,去除聚合物殘留。優(yōu)勢:操作簡單、耗時短,適合高通量樣本,但純度略低于超速離心法,需結(jié)合后續(xù)鑒定優(yōu)化。四、外泌體鑒定(一)形態(tài)學(xué)鑒定:透射電子顯微鏡(TEM)1.樣本制備:取10μL外泌體重懸液,滴加至碳支持膜銅網(wǎng)上,靜置5分鐘;2.用濾紙吸去多余液體,滴加2%磷鎢酸(pH6.8)負染5分鐘,濾紙吸去染液后自然干燥;3.透射電鏡下觀察,外泌體典型形態(tài)為“茶托狀”或“杯狀”囊泡,直徑30~150nm。(二)粒徑與濃度分析:納米顆粒跟蹤分析(NTA)1.儀器準備:預(yù)熱NTA儀器,校準激光及攝像頭;2.樣本處理:將外泌體重懸液用PBS稀釋至合適濃度(通常10^8~10^9particles/mL),避免顆粒重疊;3.檢測與分析:注入樣本,設(shè)置檢測參數(shù)(如溫度25℃、檢測時間60秒),儀器自動分析顆粒的粒徑分布、濃度及流體力學(xué)半徑。(三)蛋白標志物檢測:WesternBlot(WB)1.蛋白提?。和饷隗w樣本加入RIPA裂解液(含蛋白酶抑制劑),冰上裂解30分鐘,12,000×g離心15分鐘(4℃),取上清;2.電泳與轉(zhuǎn)膜:按常規(guī)WB流程,分離膠濃度10%~12%,轉(zhuǎn)膜采用濕轉(zhuǎn)或半干轉(zhuǎn);3.抗體孵育:一抗選擇外泌體標志物(如CD63、CD9、TSG101)及陰性對照(如Calnexin,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白,外泌體中應(yīng)為陰性),4℃孵育過夜;4.顯影:二抗室溫孵育1小時,ECL或化學(xué)發(fā)光底物顯影,觀察條帶。五、外泌體功能驗證實驗(一)細胞攝取實驗1.外泌體標記:用PKH67(綠色熒光)或DiI(紅色熒光)標記外泌體:將外泌體與染料在無血清培養(yǎng)基中37℃孵育30分鐘,用PBS洗滌2次(100,000×g離心70分鐘)去除游離染料;2.共孵育:將標記的外泌體與受體細胞(如腫瘤細胞、內(nèi)皮細胞)共孵育(濃度1×10^9particles/mL,時間2~24小時);3.觀察與檢測:熒光顯微鏡或共聚焦顯微鏡觀察細胞內(nèi)熒光信號,或流式細胞術(shù)定量分析攝取效率。(二)功能調(diào)控實驗(以促增殖為例)1.細胞分組:設(shè)置對照組(無外泌體)、外泌體處理組(不同濃度或來源的外泌體);2.處理與檢測:外泌體與細胞共培養(yǎng)24~72小時,采用CCK-8、EdU或MTT法檢測細胞增殖活性,或通過WesternBlot檢測增殖相關(guān)蛋白(如PCNA、Ki-67)的表達。(三)體內(nèi)功能驗證(可選)通過尾靜脈注射或瘤內(nèi)注射標記的外泌體,觀察其在體內(nèi)的分布、靶組織攝取及對疾病進程(如腫瘤生長、組織修復(fù))的影響,需結(jié)合動物模型設(shè)計實驗。六、注意事項與常見問題解決(一)樣本質(zhì)量控制新鮮樣本優(yōu)先:體液樣本采集后應(yīng)立即處理,避免室溫放置過久導(dǎo)致外泌體降解;無菌操作:全程使用無酶、無熱源耗材,防止微生物污染;避免反復(fù)凍融:外泌體凍存后應(yīng)一次性使用,若需分裝,建議小體積(如100μL)保存。(二)分離效率優(yōu)化超速離心參數(shù)調(diào)整:根據(jù)樣本類型(如細胞上清或血清)優(yōu)化離心轉(zhuǎn)速和時間,可通過預(yù)實驗確定最佳條件;聯(lián)合分離法:如“超速離心+免疫親和”,兼顧純度與特異性;外泌體產(chǎn)量評估:通過NTA或BCA蛋白定量,對比不同方法的產(chǎn)量差異。(三)鑒定結(jié)果異常分析TEM無典型形態(tài):可能是負染過度或樣本濃度過低,需調(diào)整染色時間或增加樣本量;NTA粒徑分布異常:可能是樣本聚集或污染,需優(yōu)化稀釋倍數(shù)或重新分離;WB無標志物條帶:可能是上樣量不足或抗體效價低
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