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文檔簡介
ICS65.020.01
CCSB16
15
內(nèi)蒙古自治區(qū)地方標(biāo)準(zhǔn)
DB15/T2957—2023
馬鈴薯晚疫病菌PCR檢測方法
DetectionofpathogenicfungusforpotatolateblightbyPCRmethod
2023-04-26發(fā)布2023-05-26實施
內(nèi)蒙古自治區(qū)市場監(jiān)督管理局發(fā)布
DB15/T2957—2023
目次
前言.................................................................................II
1范圍...............................................................................1
2規(guī)范性引用文件.....................................................................1
3術(shù)語和定義.........................................................................1
4原理...............................................................................1
5試劑與儀器.........................................................................1
試劑...........................................................................1
溶液配制.......................................................................2
儀器...........................................................................2
6操作步驟...........................................................................2
對照的設(shè)立.....................................................................2
取樣...........................................................................2
馬鈴薯組織樣品DNA提取.........................................................2
PCR擴(kuò)增........................................................................2
7瓊脂糖凝膠電泳.....................................................................3
8結(jié)果判定...........................................................................3
試驗成立的條件.................................................................3
結(jié)果判定.......................................................................3
I
DB15/T2957—2023
前言
本文件按照GB/T1.1—2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定
起草。
本文件由內(nèi)蒙古自治區(qū)農(nóng)牧廳提出。
本文件由內(nèi)蒙古自治區(qū)馬鈴薯標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(SAM/TC40)歸口。
本文件起草單位:內(nèi)蒙古自治區(qū)產(chǎn)品質(zhì)量檢驗研究院、內(nèi)蒙古中加農(nóng)業(yè)生物科技有限公司、烏蘭察
布市檢驗檢測中心、內(nèi)蒙古朱日和鎮(zhèn)綜合保障和技術(shù)推廣中心。
本文件主要起草人:劉廣晶、劉曉權(quán)、包美麗、高曉娟、呂文霞、趙莉、高俊、齊桂敏、姜濤、李
燕、田艷花、趙欣、孫輝遠(yuǎn)、任瑋、常青、侯曉云、李建青、李藝凡、李翔、王慧娟、董志剛、王勐、
喬奇、王美霞。
II
DB15/T2957—2023
馬鈴薯晚疫病菌PCR檢測方法
1范圍
本文件規(guī)定了馬鈴薯晚疫病菌PCR檢測方法。
本文件適用于馬鈴薯植株、塊莖中晚疫病菌的檢測。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
GB/T6682分析實驗室用水規(guī)格和試驗方法
3術(shù)語和定義
下列術(shù)語和定義適用于本文件。
馬鈴薯晚疫病potatolateblight
由致病疫霉(Phytophthorainfestans(Montagne)deBary)侵染引起馬鈴薯病害??汕秩抉R鈴薯
的葉片、莖桿以及塊莖等。發(fā)病初期病斑多在葉尖和葉緣處形成水浸狀褪綠斑,后擴(kuò)大為圓形暗綠色斑,
病斑邊緣界限不明顯。在空氣濕度大時,病斑可擴(kuò)及葉的大半以及全葉,病斑邊緣有一環(huán)白色稀疏的霉
輪,莖部受害,可形成長短不一的褐色斑。塊莖發(fā)病,初為褐色或紫褐色不規(guī)則的病斑,稍凹陷,后期
導(dǎo)致薯肉不同深度的褐色壞死。潮濕條件下,莖稈和塊莖發(fā)病部位能夠形成白色稀疏的霉層。
4原理
本文件采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PolymeraseChainReaction,PCR)方法檢測馬鈴薯晚疫病菌。其原
理是:以馬鈴薯晚疫病菌ITS序列區(qū)設(shè)計特異性引物,以基因組DNA為模板,在TaqDNA聚合酶的作
用下進(jìn)行PCR擴(kuò)增,根據(jù)PCR擴(kuò)增結(jié)果判斷該樣品中是否含有目的片段,從而達(dá)到鑒定馬鈴薯晚疫
病菌的目的。
5試劑與儀器
試劑
5.1.1以下所有試劑,除另有規(guī)定外,均使用分析純試劑;水為符合GB/T6682中規(guī)定的一級水。
5.1.2植物基因組提取試劑盒、2×TaqPCRMasterMix、無水乙醇、50×TAE電泳緩沖液、溴化乙錠、
DNAMarker、6×DNALoadingBuffer等均從試劑公司購買。
1
DB15/T2957—2023
溶液配制
5.2.1溴化乙錠溶液(10mg/mL)
稱取溴化乙錠100mg,加水溶解,定容至10mL。
5.2.21×TAE電泳緩沖液
量取50×TAE電泳緩沖液20mL,加水定容至1L。
5.2.31.0%瓊脂糖凝膠
稱取1.0g瓊脂糖,加入100mL的1×TAE電泳緩沖液,微波爐加熱至瓊脂糖融化,待溶液冷卻至50℃
左右時,加入5μL溴化乙錠溶液,搖勻,倒入制膠板中均勻鋪板,凝固后取下梳子,備用。
儀器
PCR儀、臺式高速離心機(jī)(離心力1180g~12470g)、電泳儀、水平電泳槽、凝膠成像儀、水浴鍋、
移液器、高壓蒸汽滅菌鍋、4℃冰箱、普通天平(感量0.01g)。
6操作步驟
對照的設(shè)立
檢測體系以馬鈴薯晚疫病菌的DNA作為陽性對照,以不添加DNA模板的反應(yīng)體系作為陰性對照。
取樣
一塊地取發(fā)病馬鈴薯植株或塊莖組織,將樣品保存于4℃冰箱中,DNA提取時取馬鈴薯葉片或塊莖
組織0.2g,樣品需現(xiàn)用現(xiàn)取。
馬鈴薯組織樣品DNA提取
將樣品置于滅過菌的研缽中,加液氮研磨成粉末,轉(zhuǎn)至1.5mL離心管,利用植物基因組DNA提取
試劑盒提取。
PCR擴(kuò)增
6.4.1PCR擴(kuò)增引物
在ITS序列區(qū)設(shè)計引物,引物序列如下:
上游引物:5’-TGGGCGAGCCCTATCAAAA-3’。
下游引物:5’-CGATTCAAATGCCAAGCTAA-3’。
擴(kuò)增片段大小為613bp。
用超純水將上、下游引物分別配制成工作濃度為10ng/μL的溶液。
6.4.2PCR反應(yīng)體系
馬鈴薯晚疫病菌PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系如表1所示,按照以下順序加入相應(yīng)試劑到PCR管中,混勻并離心
10s,使混合液都沉降到PCR管底。詳見表1。
2
DB15/T2957—2023
表1PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系
PCR反應(yīng)物加入PCR反應(yīng)體系的體積
uL
ddH2O18.0
2×TaqPCRMasterMix4.0
上游引物(10ng/uL)1.0
下游引物(10ng/uL)1.0
模板DNA1.0
總體積
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