甲狀腺激素受體基因突變監(jiān)測(cè)_第1頁
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文檔簡介

甲狀腺激素受體基因突變監(jiān)測(cè)演講人目錄01.甲狀腺激素受體基因突變監(jiān)測(cè)07.TR基因突變監(jiān)測(cè)的未來展望03.TR基因突變的類型與致病機(jī)制05.TR基因突變監(jiān)測(cè)的技術(shù)方法與進(jìn)展02.甲狀腺激素受體基因的結(jié)構(gòu)與功能基礎(chǔ)04.TR基因突變監(jiān)測(cè)的臨床應(yīng)用場(chǎng)景06.臨床監(jiān)測(cè)中的挑戰(zhàn)與應(yīng)對(duì)策略01甲狀腺激素受體基因突變監(jiān)測(cè)02甲狀腺激素受體基因的結(jié)構(gòu)與功能基礎(chǔ)甲狀腺激素受體的分子結(jié)構(gòu)特征甲狀腺激素受體(thyroidhormonereceptor,TR)是核受體超家族成員,由位于第3號(hào)染色體短臂的THRA基因(編碼TRα1、TRα2等亞型)和第17號(hào)染色體長臂的THRB基因(編碼TRβ1、TRβ2等亞型)編碼。在分子結(jié)構(gòu)上,TR包含多個(gè)功能域:N端的A/B域具有激活功能域(AF-1),參與配體非依賴性轉(zhuǎn)錄調(diào)控;C區(qū)的DNA結(jié)合域(DBD)含兩個(gè)鋅指結(jié)構(gòu),特異性識(shí)別甲狀腺激素反應(yīng)元件(TRE);E區(qū)的配體結(jié)合域(LBD)不僅結(jié)合T3(三碘甲狀腺原氨酸),還與輔調(diào)節(jié)因子相互作用;F域則發(fā)揮調(diào)節(jié)受體穩(wěn)定性的作用。值得注意的是,TRβ亞型在肝臟、垂體、骨骼肌等代謝活躍組織中高表達(dá),而TRα亞型在心肌、大腦中更為豐富,這種組織分布差異決定了不同突變導(dǎo)致的臨床表型異質(zhì)性。甲狀腺激素受體的生理功能與信號(hào)通路作為配門控轉(zhuǎn)錄因子,TR在未結(jié)合T3時(shí),通過與輔抑制因子(如N-CoR、SMRT)結(jié)合,招募組蛋白去乙酰化酶(HDAC),抑制靶基因轉(zhuǎn)錄;當(dāng)T3結(jié)合后,受體構(gòu)象改變,輔抑制因子解離,輔激活因子(如SRC、CBP)募集,組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(HAT)激活,最終促進(jìn)靶基因表達(dá)。其下游靶基因廣泛參與代謝調(diào)節(jié)(如解偶聯(lián)蛋白UCP1、葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)體GLUT4)、生長發(fā)育(如GH、IGF-1軸)、心血管功能(如心肌肌球蛋白重鏈基因MYH6/MYH7)及神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育(如神經(jīng)元粘附分子NCAM)等關(guān)鍵生理過程。在臨床工作中,我曾接診一例TRβ基因突變患兒,其表現(xiàn)為生長遲緩、心率緩慢,正是由于TR介導(dǎo)的GH-IGF-1信號(hào)通路和心肌收縮蛋白基因表達(dá)異常所致,這讓我深刻體會(huì)到TR功能對(duì)機(jī)體多系統(tǒng)的廣泛影響。03TR基因突變的類型與致病機(jī)制突變的分子類型與分布特征3.插入/缺失突變:引起移碼框改變,如TRβ的459-460insA,導(dǎo)致C端功能域缺失;TR基因突變以常染色體顯性遺傳為主,目前已報(bào)道超過300種致病突變,其中THRB基因突變占比>95,THRA基因突變相對(duì)罕見。從突變類型看:2.無義突變:導(dǎo)致提前終止密碼子產(chǎn)生,如TRβ的E356X,形成截短蛋白,喪失功能;1.錯(cuò)義突變:最常見(約占70%),多位于LBD(如TRβ的R316H、R429Q)或DBD(如TRα的R228W),直接影響配體結(jié)合或DNA識(shí)別能力;4.剪接位點(diǎn)突變:影響mRNA剪接,如THRB基因內(nèi)含子6的+1G→A突變,可突變的分子類型與分布特征產(chǎn)生異常轉(zhuǎn)錄本。值得注意的是,突變熱點(diǎn)區(qū)域具有亞型特異性:TRβ的LBD(外顯子9-10)和DBD(外顯子7-8)是突變高發(fā)區(qū),而TRα突變多集中在DBD和AF-1域,這與不同亞型的功能差異密切相關(guān)。突變的致病機(jī)制與表型關(guān)聯(lián)1.顯性負(fù)效應(yīng)(dominant-negativeeffect):突變型TR與野生型TR形成二聚體,通過競爭性結(jié)合TRE或輔因子,抑制野生型TR的功能,這是導(dǎo)致甲狀腺激素抵抗綜合征(RTH)的主要機(jī)制。例如,TRβ的R316H突變可阻礙T3結(jié)合,使受體無法解除對(duì)靶基因的抑制,即使血清T3、T4水平升高,仍表現(xiàn)為組織對(duì)甲狀腺激素不敏感。2.配體結(jié)合障礙:LBD突變(如TRβ的P453A)破壞T3結(jié)合口袋結(jié)構(gòu),導(dǎo)致T3親和力下降100-1000倍,即使高濃度T3也無法激活受體。3.DNA結(jié)合異常:DBD突變(如TRα的R228W)影響TRE識(shí)別,使TR無法正確結(jié)合靶基因啟動(dòng)子區(qū),轉(zhuǎn)錄調(diào)控失效。4.輔因子相互作用紊亂:部分突變(如TRβ的A234T)雖不影響T3結(jié)合,但改突變的致病機(jī)制與表型關(guān)聯(lián)變受體表面構(gòu)象,導(dǎo)致輔激活因子招募障礙,轉(zhuǎn)錄活性顯著降低。在臨床實(shí)踐中,我曾遇到一例家族性RTH患者,先證者表現(xiàn)為血清T3、T4升高伴TSH不適當(dāng)正常,基因檢測(cè)發(fā)現(xiàn)THRB基因R429Q突變,其父親及姐姐攜帶相同突變但癥狀較輕,這種表型異性與突變對(duì)受體功能的影響程度及遺傳背景修飾作用有關(guān)。04TR基因突變監(jiān)測(cè)的臨床應(yīng)用場(chǎng)景甲狀腺激素抵抗綜合征(RTH)的精準(zhǔn)診斷RTH是TR基因突變最典型的臨床表型,分為全身性(GRTH)和垂體性(PRTH),前者以周圍組織抵抗為主,后者以垂體抵抗為主,臨床表現(xiàn)為甲狀腺功能紊亂(如甲亢、甲減或混合表現(xiàn))伴生長發(fā)育異常、智力障礙等。傳統(tǒng)診斷依賴血清激素水平(T3、T4升高,TSH正?;蛏撸┖蚑RH興奮試驗(yàn),但存在一定局限性。基因檢測(cè)可明確病因:若發(fā)現(xiàn)THRB基因致病突變,即可確診RTH,避免誤診為“中樞性甲亢”或“垂體TSH瘤”而行不必要手術(shù)。例如,一例6歲患兒表現(xiàn)為身高落后、注意力不集中,血清T4210nmol/L(正常參考值62-154)、TSH5.2mIU/L(正常0.27-4.2),TRH興奮試驗(yàn)TSH無高峰,基因檢測(cè)發(fā)現(xiàn)THRB基因326位密碼子CGG→TGG(R316W突變),確診為GRTH,給予T3替代治療后癥狀明顯改善。分化型甲狀腺癌(DTC)的診療決策優(yōu)化近年來研究發(fā)現(xiàn),TRβ突變與DTC的發(fā)生、發(fā)展及治療反應(yīng)密切相關(guān)。一方面,TRβ可通過調(diào)控MAPK、PI3K/Akt等信號(hào)通路影響甲狀腺細(xì)胞增殖,突變可能導(dǎo)致受體抑癌功能喪失;另一方面,放射性碘(RAI)治療的療效依賴于鈉碘轉(zhuǎn)運(yùn)體(NIS)的表達(dá),而TR可上調(diào)NIS轉(zhuǎn)錄,TR突變可能通過抑制NIS表達(dá)導(dǎo)致RAI難治性DTC。因此,對(duì)DTC患者進(jìn)行TR基因突變監(jiān)測(cè),可預(yù)測(cè)RAI治療反應(yīng):若檢測(cè)到TRβ突變,提示RAI抵抗風(fēng)險(xiǎn)增加,需提前制定個(gè)體化治療方案(如靶向治療)。例如,一例肺轉(zhuǎn)移的DTC患者,RAI治療后病灶持續(xù)進(jìn)展,基因檢測(cè)發(fā)現(xiàn)THRB基因L457V突變,隨后改用索拉非尼聯(lián)合治療,轉(zhuǎn)移灶縮小50%。先天性甲狀腺功能減退癥(CH)的病因鑒別CH是新生兒常見內(nèi)分泌疾病,多數(shù)由甲狀腺發(fā)育異?;蚝铣擅溉毕菟?,約5%由TR基因突變引起。這類患兒通常表現(xiàn)為血清T4降低、TSH升高,但對(duì)外源性甲狀腺激素治療反應(yīng)不佳,易漏診為“甲狀腺發(fā)育不良”。通過TR基因檢測(cè),可明確是否為TRα突變所致的“甲狀腺激素抵抗樣CH”,此時(shí)需調(diào)整治療方案(如增加甲狀腺激素劑量)。例如,一例新生兒篩查TSH45mIU/L,甲狀腺超聲提示正常大小,給予左甲狀腺素鈉治療100μg/d后,TSH仍>20mIU/L,基因檢測(cè)發(fā)現(xiàn)THRA基因R384C突變,確診為TRα突變相關(guān)CH,將劑量增至150μg/d后,TSH逐漸恢復(fù)正常。妊娠期甲狀腺疾病的胎兒風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估妊娠期甲狀腺功能異??捎绊懱荷窠?jīng)系統(tǒng)發(fā)育,而TR基因突變可能是胎兒甲狀腺功能異常的潛在原因。對(duì)妊娠期甲減或甲亢孕婦,若胎兒超聲顯示甲狀腺腫大、羊水過多或生長受限,可行羊水穿刺或臍帶血穿刺進(jìn)行TR基因檢測(cè),明確是否存在胎兒TR突變。若確診,需在妊娠中晚期監(jiān)測(cè)胎兒甲狀腺功能,必要時(shí)給予宮內(nèi)治療(如母體服用抗甲狀腺藥物或直接向羊膜腔內(nèi)注射T3)。例如,一例妊娠28周孕婦,既往甲亢病史,胎兒超聲顯示甲狀腺腫大、心率170次/分,羊水指數(shù)25cm,羊水穿刺基因檢測(cè)發(fā)現(xiàn)胎兒THRB基因P453A突變,診斷為胎兒甲狀腺激素抵抗綜合征,母體調(diào)整甲巰咪唑劑量并密切監(jiān)測(cè),胎兒足月分娩后給予T3治療,神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育未受明顯影響。05TR基因突變監(jiān)測(cè)的技術(shù)方法與進(jìn)展傳統(tǒng)檢測(cè)技術(shù):Sanger測(cè)序法Sanger測(cè)序是TR基因突變的經(jīng)典檢測(cè)方法,其原理為鏈終止法,通過PCR擴(kuò)增目標(biāo)基因片段后,進(jìn)行雙向測(cè)序,與參考序列比對(duì)分析突變。該方法準(zhǔn)確性高(>99%),適合已知突點(diǎn)的驗(yàn)證及小樣本檢測(cè),但存在局限性:檢測(cè)通量低、無法檢測(cè)大片段缺失/重復(fù)、對(duì)低頻突變(如嵌合體)檢測(cè)靈敏度低(約15-20%)。在臨床工作中,對(duì)于RTH家系篩查,我們通常先對(duì)先證者行Sanger測(cè)序,若發(fā)現(xiàn)可疑突變,再對(duì)家系成員進(jìn)行驗(yàn)證,但曾遇到一例臨床高度疑似RTH但Sanger測(cè)序陰性的患者,最終通過NGS檢測(cè)發(fā)現(xiàn)嵌合體突變(突變比例約8%),這讓我深刻認(rèn)識(shí)到傳統(tǒng)技術(shù)的不足。高通量測(cè)序技術(shù):NGS的應(yīng)用下一代測(cè)序(NGS)技術(shù)的出現(xiàn)徹底改變了TR基因突變檢測(cè)的模式,主要包括靶向測(cè)序、全外顯子組測(cè)序(WES)和全基因組測(cè)序(WGS)。1.靶向測(cè)序:針對(duì)THRA、THRB基因及其側(cè)翼序列設(shè)計(jì)探針,捕獲目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行高通量測(cè)序,具有檢測(cè)效率高(可同時(shí)檢測(cè)數(shù)百個(gè)基因)、成本低、數(shù)據(jù)分析相對(duì)簡單的優(yōu)勢(shì),是目前臨床檢測(cè)的首選方法。例如,我們中心采用靶向Panel(包含甲狀腺疾病相關(guān)基因23個(gè)),對(duì)300例疑似RTH患者進(jìn)行檢測(cè),突變檢出率達(dá)78%,其中THRB突變占95.6%。2.全外顯子組測(cè)序:對(duì)全部外顯子區(qū)域進(jìn)行測(cè)序,可發(fā)現(xiàn)TR基因的新發(fā)突變及與其他基因的復(fù)合突變,適合表型不典型的患者。例如,一例表現(xiàn)為智力障礙、甲狀腺功能正常的患兒,WES發(fā)現(xiàn)THRB基因新發(fā)突變(c.923C>T,p.R308W)和DYRK1A基因突變,兩者共同導(dǎo)致表型復(fù)雜性。高通量測(cè)序技術(shù):NGS的應(yīng)用3.全基因組測(cè)序:覆蓋整個(gè)基因組,可檢測(cè)非編碼區(qū)、內(nèi)含子深部突變及結(jié)構(gòu)變異,但數(shù)據(jù)量大、分析復(fù)雜,目前主要用于科研或疑難病例診斷。數(shù)字化PCR與三代測(cè)序技術(shù)1.數(shù)字PCR(dPCR):通過微滴分區(qū)技術(shù)將樣本分成數(shù)萬份獨(dú)立反應(yīng)單元,對(duì)目標(biāo)突變進(jìn)行絕對(duì)定量,檢測(cè)靈敏度可達(dá)0.01%,適用于低頻突變(如腫瘤組織中的TR突變、嵌合體檢測(cè))及治療后微小殘留病監(jiān)測(cè)。例如,一例RAI難治性DTC患者,術(shù)后組織NGS未發(fā)現(xiàn)TR突變,但dPCR檢測(cè)外周血ctDNA中TRβ突變豐度為0.05%,提示循環(huán)腫瘤DNA中存在低頻突變,為靶向治療提供了依據(jù)。2.三代測(cè)序(PacBio、Nanopore):具有長讀長(可達(dá)100kb以上)的優(yōu)勢(shì),可檢測(cè)復(fù)雜結(jié)構(gòu)變異(如大片段插入/缺失、倒位)及重復(fù)序列區(qū)域的突變,適合解決NGS無法解析的疑難變異。例如,一例THRB基因內(nèi)含子9重復(fù)序列插入突變,NGS未能明確,三代測(cè)序顯示插入長度為156bp,成功解釋了RTH的發(fā)病機(jī)制。生物信息學(xué)分析與變異解讀NGS產(chǎn)生的大量數(shù)據(jù)需通過生物信息學(xué)流程處理:原始數(shù)據(jù)質(zhì)控(FastQC)、序列比對(duì)(BWA)、變異檢測(cè)(GATK)、注釋(ANNOVAR、VEP)等。變異解讀需遵循ACMG指南,分為5類:致病性(P)、很可能致病性(LP)、意義未明(VUS)、可能良性(LB)、良性(B)。其中VUS是臨床處理的難點(diǎn),需結(jié)合以下信息綜合判斷:-功能預(yù)測(cè):通過SIFT、PolyPhen-2、MutationTaster等工具評(píng)估突變對(duì)蛋白功能的影響;-保守性分析:比對(duì)物種間同源序列的保守性(如GERP++評(píng)分);-頻率數(shù)據(jù):參考gnomAD、千人基因組等數(shù)據(jù)庫中突變頻率(人群頻率<0.1%提示致病可能性大);生物信息學(xué)分析與變異解讀-功能實(shí)驗(yàn):若條件允許,通過細(xì)胞實(shí)驗(yàn)(如報(bào)告基因assay)驗(yàn)證突變對(duì)TR轉(zhuǎn)錄活性的影響。例如,一例新發(fā)THRB基因突變(c.1054G>A,p.V352M),ACMG分類為VUS,通過報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)顯示突變型TR轉(zhuǎn)錄活性僅為野生型的30%,最終升級(jí)為LP。06臨床監(jiān)測(cè)中的挑戰(zhàn)與應(yīng)對(duì)策略基因型-表型異質(zhì)性的挑戰(zhàn)同一種TR基因突變可導(dǎo)致不同臨床表型,甚至同一家系中攜帶相同突變的個(gè)體表型差異顯著,這種異質(zhì)性給臨床診療帶來困難。其發(fā)生機(jī)制包括:1.遺傳背景修飾:其他基因(如DIO2、SBNO2)的多態(tài)性可影響T3局部代謝或輔因子表達(dá),修飾突變表型;2.環(huán)境因素:碘攝入量、藥物暴露(如糖皮質(zhì)激素)等可改變甲狀腺激素水平,影響癥狀表現(xiàn);3.嵌合體比例:胚胎發(fā)育過程中新發(fā)突變的嵌合比例不同,導(dǎo)致組織間突變負(fù)荷差異。應(yīng)對(duì)策略:建立詳細(xì)的臨床表型數(shù)據(jù)庫,收集患者的激素水平、影像學(xué)特征、治療反應(yīng)等信息,結(jié)合基因型進(jìn)行綜合分析;對(duì)表型差異大的家系成員,檢測(cè)不同組織的突變負(fù)荷(如外周血、甲狀腺組織),明確嵌合比例對(duì)表型的影響。檢測(cè)技術(shù)局限性的突破當(dāng)前技術(shù)仍存在以下局限:-低頻突變檢測(cè)靈敏度:NGS對(duì)ctDNA中突變的檢測(cè)靈敏度約5%,難以發(fā)現(xiàn)極低豐度突變;-結(jié)構(gòu)變異檢測(cè)困難:NGS對(duì)大片段缺失/重復(fù)的檢測(cè)準(zhǔn)確率約80%,三代測(cè)序成本較高;-非編碼區(qū)變異解讀:TR基因啟動(dòng)子、增強(qiáng)子等非編碼區(qū)變異的功能研究較少,VUS比例高。應(yīng)對(duì)策略:開發(fā)多重檢測(cè)技術(shù),如NGS聯(lián)合dPCR,提高低頻突變的檢出率;利用長讀長三代測(cè)序結(jié)合光學(xué)圖譜(如Bionano)優(yōu)化結(jié)構(gòu)變異檢測(cè);開展功能基因組學(xué)研究(如CRISPR-Cas9篩選),明確非編碼區(qū)變異的調(diào)控作用。臨床轉(zhuǎn)化與患者管理的難點(diǎn)01在右側(cè)編輯區(qū)輸入內(nèi)容1.檢測(cè)結(jié)果解讀與溝通:VUS的解讀易引發(fā)患者焦慮,需由臨床醫(yī)生、遺傳咨詢師、分子診斷專家共同向患者解釋檢測(cè)的意義、局限性及后續(xù)管理建議;02在右側(cè)編輯區(qū)輸入內(nèi)容2.治療方案的個(gè)體化制定:RTH患者對(duì)甲狀腺激素治療的反應(yīng)差異大,需根據(jù)基因突變類型調(diào)整劑量(如TRβ突變患者需更高劑量T3);03應(yīng)對(duì)策略:建立多學(xué)科協(xié)作(MDT)團(tuán)隊(duì),定期召開病例討論會(huì),制定個(gè)體化診療方案;編寫患者教育手冊(cè),普及基因檢測(cè)相關(guān)知識(shí);建立長期隨訪機(jī)制,監(jiān)測(cè)患者的治療反應(yīng)及并發(fā)癥,及時(shí)調(diào)整治療方案。3.遺傳咨詢與產(chǎn)前診斷:對(duì)家系中致病突變攜帶者,需提供遺傳風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估及產(chǎn)前診斷(如絨毛穿刺、羊水穿刺)或胚胎植入前遺傳學(xué)檢測(cè)(PGT)的選項(xiàng)。倫理與法律問題的考量TR基因檢測(cè)涉及倫理與法律問題,包括:-隱私保護(hù):基因信息是個(gè)人隱私,需嚴(yán)格保密,防止基因歧視(如就業(yè)、保險(xiǎn));-知情同意:檢測(cè)前需向患者充分說明檢測(cè)目的、流程、潛在風(fēng)險(xiǎn)(如VUS解讀困難)及獲益,簽署知情同意書;-數(shù)據(jù)共享:臨床數(shù)據(jù)與基因數(shù)據(jù)的共享需符合倫理規(guī)范,避免患者信息泄露。應(yīng)對(duì)策略:嚴(yán)格遵守《人類遺傳資源管理?xiàng)l例》《涉及人的生物醫(yī)學(xué)研究倫理審查辦法》等法規(guī);建立基因數(shù)據(jù)加密存儲(chǔ)系統(tǒng),限制數(shù)據(jù)訪問權(quán)限;在科研中使用數(shù)據(jù)時(shí),需經(jīng)倫理委員會(huì)批準(zhǔn),并去除個(gè)人識(shí)別信息。07TR基因突變監(jiān)測(cè)的未來展望技術(shù)革新:從“檢測(cè)”到“實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)”隨著單細(xì)胞測(cè)序、液體活檢、CRISPR-Cas9等技術(shù)的發(fā)展,TR基因監(jiān)測(cè)將向更精準(zhǔn)、更動(dòng)態(tài)的方向發(fā)展:1.單細(xì)胞測(cè)序:可檢測(cè)同一患者不同組織中TR突變的異質(zhì)性,明確病變細(xì)胞的克隆演化規(guī)律,為靶向治療提供依據(jù);2.液體活檢:通過監(jiān)測(cè)外周血ctDNA中TR突變的動(dòng)態(tài)變化,實(shí)現(xiàn)腫瘤的早期診斷、療效評(píng)估及復(fù)發(fā)預(yù)警,避免反復(fù)有創(chuàng)操作;3.CRISPR-Cas基因編輯:基礎(chǔ)研究中已嘗試?yán)肅RISPR-Cas9修復(fù)TR基因突變,未來可能為RTH等遺傳性疾病提供根治性治療手段。3214臨床應(yīng)用:從“診斷”到“精準(zhǔn)醫(yī)療”TR基因監(jiān)測(cè)將深度融入精準(zhǔn)醫(yī)療體系:1.個(gè)體化治療:根據(jù)TR突變類型選擇靶向藥物(如TRβ激動(dòng)劑GC-1)、激素替代劑量或治療方案,提高療效,減少副作用;2.藥物研發(fā):基于TR突變結(jié)構(gòu),設(shè)計(jì)選擇性TRβ激動(dòng)劑,用于治療肥胖、高脂血癥等代謝性疾?。?.疾病預(yù)防:對(duì)高風(fēng)險(xiǎn)人群(如RTH家系成員)進(jìn)行基因篩查,早期干預(yù)

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