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文檔簡介
實時熒光定量PCR
技術(shù)在腫瘤分子病理檢測中的應用樣本選擇與前處理檢測流程與結(jié)果分析質(zhì)量控制常見問題與處理建議Contents
目
錄樣本選擇與前處理強烈推薦使用手術(shù)切除組織或活檢組織
FFPE樣
本在腫瘤分子病理檢測中,應優(yōu)先選擇手術(shù)
切除組織或活檢組織的福爾馬林固定石蠟
包埋樣本,以確保檢測結(jié)果的準確性和可
靠
性
。外周血等體液樣本作為最后選擇若組織和細胞學樣本均不可及,則推薦使
用外周血等體液樣本進行循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)
突變檢測,但需注意假陰性
風
險
。細胞學樣本作為替代選擇當無法及時獲取手術(shù)切除組織或活檢組織
時,可選用細胞學樣本進行檢測,尤其是
制備成細胞蠟塊后,其處理及檢測方式與
組織樣本相似。020301手術(shù)切除組織或活檢組織推薦對于質(zhì)控合格的細胞學樣本,可涂片
或液基細胞學制片,鏡下評估腫瘤細
胞數(shù)量及比例。強烈推薦將細胞學樣本制備成細胞蠟塊,使用4%中性甲醛或95%乙醇固定液進行固定。細胞學樣本的制備和保存細胞蠟塊制備
涂片與液基制片漿膜腔積液離心處理外周血ctDNA的定義與重要性循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA
)
是從血液中
檢測到的來自腫瘤細胞的DNA
片
段
,
對癌癥的早期診斷和治療監(jiān)測具有重
要意義。外周血ctDNA突變檢測的優(yōu)勢利
用qPCR
技術(shù)對外周血中的ctDNA
進
行突變檢測,具有操作簡便、耗時短
、靈敏度高的優(yōu)點,適用于無法獲取
組織樣本的情況。外周血ctDNA的采樣方法通過使用含有游離DNA保護劑和防細
胞裂解劑的專用采血管采集不少于10ml
的全血,然后進行血漿分離以提取
ctDNA。外周血ctDNA突變檢測檢測流程與結(jié)果分析吸附柱法
01吸附柱法利用特殊材料吸附核酸,適用于大多數(shù)樣本類型。磁珠法
02磁珠法通過磁性顆粒捕獲核酸,適合高純度核酸提取。商品化試劑盒與自建試劑選擇
03推薦使用經(jīng)NMPA
注冊/備案的商品化試劑盒,確保性能穩(wěn)定。核酸提取方法的選擇qPCR檢測與結(jié)果分析核酸提取與質(zhì)量評估核酸的質(zhì)量和純度是qPCR
檢測結(jié)
果準確可靠的基礎(chǔ)。推薦使用紫外分光光度計進行檢測,確保DNA
和RNA
的A260/280比值在規(guī)
定范圍內(nèi)。qPCR
檢測流程與結(jié)果分析強烈推薦采用經(jīng)NMPA
注冊/備案的商品化試劑盒進行qPCR
檢
測
,
并根據(jù)試劑盒說明書和實驗室實
際情況建立SOP。
加樣時避免氣
泡和核酸機械損傷,擴增完成后
先確認陰性質(zhì)控和陽性/弱陽性
質(zhì)控是否在控,再分析樣本檢測
結(jié)果。檢測報告出具各醫(yī)療機構(gòu)應根據(jù)實際情況,設(shè)
置符合規(guī)范的結(jié)果報告模版,由
病理醫(yī)師和分子檢測人員協(xié)同及
時、準確地完成分子病理診斷報
告,為患者診療提供參考。患者及樣本信息報告應包括患者的姓名、性別、年齡等基本信息,以及樣本來源、接收時間
和病理質(zhì)控信息。檢測項目與方法報告需明確指出檢測的基因變異位點,使用的qPCR
試劑盒及其性能參數(shù),
如敏感度和特異度。檢測結(jié)果與局限性說明報告應詳細列出檢測到的基因變異位點和結(jié)果,同時注明檢測的責任范圍及
可能存在的局限性。檢測報告內(nèi)容及審核質(zhì)量控制試劑性能驗證01準確度驗證通過使用標準品和已知結(jié)果的臨床樣本進
行驗證,評估陽性符合率和陰性符合率。03精密度驗證包括重復性和重現(xiàn)性兩個方面,使用一定
數(shù)量的臨床樣本或標準品在不同條件下進
行多次檢測。02檢出限驗證使用已知濃度的標準品進行梯度稀釋至檢
出限濃度,重復測定多次,以確認穩(wěn)定性失控分析與糾正措施當室內(nèi)質(zhì)控結(jié)果失控時,需立即進行
失控分析并采取相應的糾正和預防措
施,防止問題再次發(fā)生。質(zhì)控品的選擇和使用室內(nèi)質(zhì)控品應選擇商品化或自制質(zhì)控
品,確保其制備和驗證程序及記錄的
完整性。質(zhì)控品的分裝與保存質(zhì)控品在使用時應注意分裝,避免反
復凍融,以保證檢測結(jié)果的穩(wěn)定性和
準確性。室內(nèi)質(zhì)控的實施定期參加室間質(zhì)評并通過評估,可
增強實驗室在行業(yè)內(nèi)的信譽和認可
度。提升實驗室信譽通過參加室間質(zhì)評,實驗室可以驗
證自身檢測結(jié)果的一致性和準確性提高檢測一致性識別并糾正偏差室間質(zhì)評幫助實驗室發(fā)現(xiàn)檢測方法中
的系統(tǒng)偏差,及時進行修正。室間質(zhì)評的重要性常見問題與處理建議樣本質(zhì)量問題的解決010203二腫瘤細胞含量評估對于FFPE樣本,應使用病理醫(yī)
師評估腫瘤細胞含量不少于200
個且占比不低于20%,避免使用
強酸脫鈣處理后的樣本。核酸提取過程優(yōu)化核酸提取過程中操作不規(guī)范,如
脫蠟不徹底、乙醇揮發(fā)不徹底等
,均會影響qPCR
檢測的準確性。保存年限和前處理樣本前處理不當或保存年限過長
,會導致提取的核酸質(zhì)量不佳,
影響qPCR
檢測??赡苌婕皟x器、耗材、試劑及實驗
流程等方面問題,需要詳細檢查和
調(diào)整實驗設(shè)置。常見原因是污染和非特異性擴增,
需通過優(yōu)化實驗條件或更換試劑盒
進行解決??赡苡蓪嶒炇噎h(huán)境不穩(wěn)定或PCR管
與儀器不匹配引起,需檢查并優(yōu)化
實驗環(huán)境及使用配套耗材。擴增曲線翹尾
擴增曲線下彎、彎折
部分孔位曲線異常擴增曲線異常的處理PCR
抑制物影響樣本中存在血紅素及其前體或降解產(chǎn)
物等PCR
抑制物,可能導致突變位點
Ct
值臨界或假陰性。同一批次鄰近樣本或連續(xù)多個樣
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