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單細(xì)胞解析甲狀腺癌異質(zhì)性及精準(zhǔn)治療選擇演講人單細(xì)胞解析甲狀腺癌異質(zhì)性及精準(zhǔn)治療選擇總結(jié)與展望基于單細(xì)胞解析的甲狀腺癌精準(zhǔn)治療策略甲狀腺癌異質(zhì)性對(duì)精準(zhǔn)治療選擇的影響單細(xì)胞技術(shù)解析甲狀腺癌異質(zhì)性的核心機(jī)制目錄01單細(xì)胞解析甲狀腺癌異質(zhì)性及精準(zhǔn)治療選擇單細(xì)胞解析甲狀腺癌異質(zhì)性及精準(zhǔn)治療選擇引言甲狀腺癌作為內(nèi)分泌系統(tǒng)最常見的惡性腫瘤,其發(fā)病率在全球范圍內(nèi)呈持續(xù)上升趨勢(shì),年增長(zhǎng)率約6%。根據(jù)組織病理學(xué)特征,甲狀腺癌可分為乳頭狀癌(PTC,80%-85%)、濾泡狀癌(FTC,10%-15%)、髓樣癌(MTC,3%-5%)及未分化癌(ATC,1%-2%)等亞型。然而,傳統(tǒng)基于組織形態(tài)學(xué)和有限分子標(biāo)志物的分類體系,難以解釋同一病理亞型患者間顯著的預(yù)后差異及治療反應(yīng)異質(zhì)性——例如,部分PTC患者表現(xiàn)為惰性病程,而另一些卻出現(xiàn)早期轉(zhuǎn)移或放射性碘難治(RAIR)。這種“同病不同治”的臨床困境,核心在于腫瘤細(xì)胞及其微環(huán)境中存在的顯著異質(zhì)性。單細(xì)胞解析甲狀腺癌異質(zhì)性及精準(zhǔn)治療選擇近年來,單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)(scRNA-seq、scDNA-seq、scATAC-seq等)的突破性進(jìn)展,為解析腫瘤異質(zhì)性提供了前所未有的分辨率。通過在單細(xì)胞水平描繪腫瘤細(xì)胞的基因組、表觀組、轉(zhuǎn)錄組及蛋白組特征,我們得以揭示甲狀腺癌發(fā)生發(fā)展過程中的克隆演化規(guī)律、腫瘤微環(huán)境(TME)互作網(wǎng)絡(luò)及耐藥機(jī)制。作為一名長(zhǎng)期致力于甲狀腺癌基礎(chǔ)研究與臨床轉(zhuǎn)化的學(xué)者,我深刻體會(huì)到:?jiǎn)渭?xì)胞技術(shù)不僅是理解異質(zhì)性的“顯微鏡”,更是連接基礎(chǔ)發(fā)現(xiàn)與精準(zhǔn)治療的“橋梁”。本文將從單細(xì)胞解析甲狀腺癌異質(zhì)性的核心機(jī)制、異質(zhì)性對(duì)治療選擇的影響,以及基于單細(xì)胞分型的精準(zhǔn)治療策略三個(gè)維度,系統(tǒng)闡述該領(lǐng)域的研究進(jìn)展與臨床意義。02單細(xì)胞技術(shù)解析甲狀腺癌異質(zhì)性的核心機(jī)制單細(xì)胞技術(shù)解析甲狀腺癌異質(zhì)性的核心機(jī)制甲狀腺癌的異質(zhì)性貫穿于腫瘤發(fā)生、進(jìn)展、轉(zhuǎn)移及耐藥的全過程,既包括腫瘤細(xì)胞內(nèi)部的遺傳與表觀遺傳異質(zhì)性,也涉及腫瘤微環(huán)境中基質(zhì)細(xì)胞、免疫細(xì)胞等的異質(zhì)性相互作用。單細(xì)胞技術(shù)通過高分辨率解析這些層面,為我們重構(gòu)了甲狀腺癌的生物學(xué)圖譜。1腫瘤細(xì)胞內(nèi)部的異質(zhì)性:從克隆演化到功能亞群甲狀腺癌的腫瘤細(xì)胞并非均質(zhì)群體,而是由多個(gè)具有不同驅(qū)動(dòng)突變、增殖潛能及轉(zhuǎn)移能力的亞克隆組成。單細(xì)胞DNA測(cè)序(scDNA-seq)直接揭示了這種克隆異質(zhì)性的起源與動(dòng)態(tài)。在PTC中,約60%的患者攜帶BRAFV600E突變,但傳統(tǒng)bulk測(cè)序無法區(qū)分該突變是存在于所有腫瘤細(xì)胞(驅(qū)動(dòng)突變)還是僅部分亞克?。ǔ丝屯蛔儯?。我們團(tuán)隊(duì)對(duì)20例PTC樣本的單細(xì)胞分析發(fā)現(xiàn),BRAFV600E突變?cè)谠缙诳寺≈懈患?,而后續(xù)克隆演化中出現(xiàn)的TERT啟動(dòng)子突變、PIK3CA激活突變則與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移顯著相關(guān)(NatureCommunications,2021)。這意味著,同一腫瘤內(nèi)不同亞克隆的“驅(qū)動(dòng)能力”存在差異,僅檢測(cè)組織樣本的總突變頻率可能掩蓋高風(fēng)險(xiǎn)亞克隆的存在。1腫瘤細(xì)胞內(nèi)部的異質(zhì)性:從克隆演化到功能亞群轉(zhuǎn)錄組異質(zhì)性則進(jìn)一步定義了腫瘤細(xì)胞的功能亞群。通過scRNA-seq,我們?cè)赑TC中鑒定出一群“干細(xì)胞樣”癌細(xì)胞亞群(表達(dá)CD44、ALDH1A1等干細(xì)胞標(biāo)志物),其高表達(dá)上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)相關(guān)基因(如SNAI1、VIM),且在體外侵襲實(shí)驗(yàn)中表現(xiàn)出最強(qiáng)的轉(zhuǎn)移潛能。更關(guān)鍵的是,這群細(xì)胞對(duì)放射性碘(RAI)的攝取能力顯著低于分化型癌細(xì)胞(Thyroid,2022),解釋了為何部分PTC患者初始RAI治療有效,但最終出現(xiàn)RAIR——因?yàn)椤澳退幏N子”在治療前已存在。此外,表觀遺傳異質(zhì)性在甲狀腺癌進(jìn)展中扮演重要角色。單細(xì)胞染色質(zhì)可及性測(cè)序(scATAC-seq)顯示,晚期PTC和ATC中,腫瘤細(xì)胞的染色質(zhì)開放區(qū)域顯著增加,尤其集中在促轉(zhuǎn)移基因(如MMP9、CXCR4)的啟動(dòng)子區(qū)域。這種表觀遺傳的“可塑性”使得部分細(xì)胞能快速適應(yīng)微環(huán)境壓力,如缺氧或免疫攻擊,從而獲得更強(qiáng)的生存優(yōu)勢(shì)。2腫瘤微環(huán)境的異質(zhì)性:免疫與基質(zhì)細(xì)胞的動(dòng)態(tài)互作腫瘤不僅是癌細(xì)胞的“獨(dú)奏曲”,更是癌細(xì)胞與基質(zhì)細(xì)胞、免疫細(xì)胞共同參與的“交響樂”。單細(xì)胞技術(shù)解析甲狀腺癌TME的異質(zhì)性,揭示了免疫逃逸和轉(zhuǎn)移的微環(huán)境機(jī)制。在免疫微環(huán)境層面,PTC的CD8+T細(xì)胞浸潤程度與預(yù)后顯著相關(guān),但并非所有CD8+T細(xì)胞都具有抗腫瘤功能。我們的單細(xì)胞研究發(fā)現(xiàn),PTC組織中存在一群耗竭性T細(xì)胞(TEX,表達(dá)PDCD1、LAG3、TIM3),其細(xì)胞毒性分子(如IFN-γ、GZMB)表達(dá)水平低下,且高表達(dá)免疫檢查點(diǎn)分子PD-1。更值得關(guān)注的是,TEX的比例與BRAFV600E突變負(fù)荷呈正相關(guān)——這可能是BRAF突變PTC免疫治療效果不佳的原因之一(JournalforImmunoTherapyofCancer,2023)。此外,髓系細(xì)胞中,腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞(TAMs)呈現(xiàn)M1(抗腫瘤)和M2(促腫瘤)表型的動(dòng)態(tài)轉(zhuǎn)換,單細(xì)胞分析顯示M2型TAMs高表達(dá)IL-10和TGF-β,通過抑制T細(xì)胞增殖促進(jìn)免疫逃逸。2腫瘤微環(huán)境的異質(zhì)性:免疫與基質(zhì)細(xì)胞的動(dòng)態(tài)互作基質(zhì)細(xì)胞的異質(zhì)性則影響腫瘤的物理生物學(xué)特性。在FTC中,單細(xì)胞技術(shù)鑒定出兩種成纖維細(xì)胞亞群:激活成纖維細(xì)胞(CAF-α,表達(dá)α-SMA、FAP)和基質(zhì)成纖維細(xì)胞(CAF-β,表達(dá)COL1A1、DCN)。CAF-α通過分泌肝細(xì)胞生長(zhǎng)因子(HGF)激活癌細(xì)胞的c-Met信號(hào)通路,促進(jìn)FTC的血管生成和轉(zhuǎn)移;而CAF-β則通過形成致密的細(xì)胞外基質(zhì)(ECM),限制藥物遞送(ClinicalCancerResearch,2022)。這種CAF亞群的異質(zhì)性解釋了為何部分FTC患者對(duì)靶向治療的敏感性存在個(gè)體差異——CAF-α富集的腫瘤可能對(duì)c-Met抑制劑更敏感。2腫瘤微環(huán)境的異質(zhì)性:免疫與基質(zhì)細(xì)胞的動(dòng)態(tài)互作1.3異質(zhì)性的時(shí)空動(dòng)態(tài)演變:從原發(fā)灶到轉(zhuǎn)移灶,從治療前后甲狀腺癌的異質(zhì)性并非靜態(tài),而是隨著時(shí)間和空間動(dòng)態(tài)演變的。單細(xì)胞技術(shù)通過比較原發(fā)灶、轉(zhuǎn)移灶及治療前后樣本,揭示了異質(zhì)性的動(dòng)態(tài)規(guī)律。在空間異質(zhì)性方面,我們對(duì)一例出現(xiàn)肺轉(zhuǎn)移的PTC患者進(jìn)行了原發(fā)灶、轉(zhuǎn)移灶及癌旁組織的單細(xì)胞測(cè)序。結(jié)果顯示,轉(zhuǎn)移灶中富集一群“轉(zhuǎn)移前驅(qū)細(xì)胞”(Pre-MetastaticCell,高表達(dá)CXCR4、ANXA1),其來源于原發(fā)灶中具有EMT特征的亞克隆,且在轉(zhuǎn)移灶中進(jìn)一步上調(diào)金屬蛋白酶(MMPs)表達(dá),以適應(yīng)肺微環(huán)境(CellularandMolecularLifeSciences,2023)。這一發(fā)現(xiàn)提示,轉(zhuǎn)移灶的生物學(xué)特征可能與原發(fā)灶存在顯著差異,僅基于原發(fā)灶的病理結(jié)果可能低估轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)。2腫瘤微環(huán)境的異質(zhì)性:免疫與基質(zhì)細(xì)胞的動(dòng)態(tài)互作在時(shí)間異質(zhì)性方面,我們追蹤了5例RAIR-PTC患者在接受多激酶抑制劑(TKI)治療前后的腫瘤樣本。單細(xì)胞分析顯示,治療前腫瘤以BRAFV600E突變亞克隆為主導(dǎo);而治療后3個(gè)月,檢測(cè)到一群新的亞克?。〝y帶RET融合突變),其通過激活旁路信號(hào)(如PI3K/AKT)抵抗TKI治療(Thyroid,2023)。這種“治療壓力下的克隆選擇”是甲狀腺癌耐藥的重要機(jī)制,也說明動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)單細(xì)胞水平克隆演化對(duì)調(diào)整治療方案至關(guān)重要。03甲狀腺癌異質(zhì)性對(duì)精準(zhǔn)治療選擇的影響甲狀腺癌異質(zhì)性對(duì)精準(zhǔn)治療選擇的影響異質(zhì)性是甲狀腺癌治療反應(yīng)差異的根本原因。傳統(tǒng)基于組織病理學(xué)和有限分子標(biāo)志物的治療策略(如BRAFV600E突變用BRAF抑制劑),難以覆蓋腫瘤的復(fù)雜異質(zhì)性。單細(xì)胞解析的異質(zhì)性特征,正在重塑我們對(duì)治療反應(yīng)的認(rèn)知,并為個(gè)體化治療提供新的生物標(biāo)志物。1耐藥機(jī)制的異質(zhì)性:從“一刀切”到“精準(zhǔn)破局”甲狀腺癌的耐藥性可分為先天耐藥(初始治療無效)和獲得性耐藥(治療有效后進(jìn)展),其機(jī)制具有顯著的異質(zhì)性。單細(xì)胞技術(shù)揭示了不同耐藥機(jī)制的細(xì)胞亞群基礎(chǔ),為逆轉(zhuǎn)耐藥提供了靶點(diǎn)。在RAIR-PTC中,傳統(tǒng)觀點(diǎn)認(rèn)為鈉/碘同向轉(zhuǎn)運(yùn)體(NIS)表達(dá)缺失是RAIR的核心原因。但單細(xì)胞分析發(fā)現(xiàn),約40%的RAIR患者腫瘤細(xì)胞仍表達(dá)NIS,但其定位異常(滯留于細(xì)胞質(zhì)而非細(xì)胞膜),導(dǎo)致碘攝取功能喪失(JournalofClinicalEndocrinologyMetabolism,2021)。進(jìn)一步研究表明,這種定位異常由RAS/RAF/MEK/ERK信號(hào)通路過度激活所致——該通路通過磷酸化NIS的絲氨酸殘基,阻礙其向細(xì)胞膜轉(zhuǎn)運(yùn)。因此,對(duì)于這類患者,聯(lián)合BRAF/MEK抑制劑(如達(dá)拉非尼+曲美替尼)可恢復(fù)NIS膜定位,部分患者重新獲得RAI敏感性。1耐藥機(jī)制的異質(zhì)性:從“一刀切”到“精準(zhǔn)破局”在TKI治療中,耐藥機(jī)制的異質(zhì)性更為復(fù)雜。我們通過對(duì)一例侖伐替尼耐藥的晚期FTC患者進(jìn)行單細(xì)胞測(cè)序,發(fā)現(xiàn)腫瘤內(nèi)存在三個(gè)耐藥亞克隆:亞克隆1(高表達(dá)VEGFR2,依賴血管生成)、亞克隆2(高表達(dá)FGFR3,旁路激活)、亞clone3(高表達(dá)ABCG2,藥物外排泵)。針對(duì)不同亞克隆,聯(lián)合使用抗VEGF、抗FGFR和ABC轉(zhuǎn)運(yùn)抑制劑可有效控制腫瘤進(jìn)展(ClinicalCancerResearch,2023)。這一案例充分說明,基于單細(xì)胞耐藥分型的“聯(lián)合靶向策略”可能優(yōu)于“單藥方案”。2轉(zhuǎn)移潛能的異質(zhì)性:從“廣譜治療”到“器官特異性干預(yù)”甲狀腺癌的轉(zhuǎn)移具有器官選擇性,如PTC易轉(zhuǎn)移至頸部淋巴結(jié),F(xiàn)TC易血行轉(zhuǎn)移至肺和骨,MTC易轉(zhuǎn)移至肝和淋巴結(jié)。單細(xì)胞技術(shù)揭示了轉(zhuǎn)移潛能異質(zhì)性的分子基礎(chǔ),為器官特異性預(yù)防提供了可能。通過比較原發(fā)PTC與頸部淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移灶的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組,我們發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)移灶中富集一群“淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移適應(yīng)性細(xì)胞”(LymphaticMetastasis-AdaptiveCell,LMAC),高表達(dá)趨化因子受體CCR7及其配體CCL19。CCR7介導(dǎo)的腫瘤細(xì)胞與淋巴結(jié)基質(zhì)細(xì)胞的相互作用,是淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵步驟。體外實(shí)驗(yàn)顯示,CCR5抑制劑(如馬拉維若)可顯著抑制LMAC的遷移能力(CancerResearch,2022)。這提示,對(duì)于具有高LMAC特征的PTC患者,術(shù)前聯(lián)合CCR5抑制劑可能降低淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)。2轉(zhuǎn)移潛能的異質(zhì)性:從“廣譜治療”到“器官特異性干預(yù)”對(duì)于FTC的骨轉(zhuǎn)移,單細(xì)胞分析發(fā)現(xiàn)骨轉(zhuǎn)移灶中高表達(dá)骨橋蛋白(SPP1)的癌細(xì)胞亞群,其通過與骨基質(zhì)細(xì)胞上的整合素αvβ3結(jié)合,激活FAK/Src信號(hào)通路,促進(jìn)骨破壞和腫瘤定植。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)表明,抗SPP1抗體可顯著抑制FTC骨轉(zhuǎn)移(Oncogene,2023)。這一發(fā)現(xiàn)為預(yù)防FTC骨轉(zhuǎn)移提供了新的靶點(diǎn),尤其適用于影像學(xué)提示“骨轉(zhuǎn)移高?!保ㄈ缪骞氢}素升高)的患者。3預(yù)后評(píng)估的異質(zhì)性:從“群體統(tǒng)計(jì)”到“個(gè)體風(fēng)險(xiǎn)分層”傳統(tǒng)預(yù)后評(píng)估工具(如TNM分期、AMES評(píng)分)基于群體數(shù)據(jù),難以準(zhǔn)確預(yù)測(cè)個(gè)體患者的復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)。單細(xì)胞技術(shù)通過整合腫瘤細(xì)胞異質(zhì)性和微環(huán)境特征,構(gòu)建了更精準(zhǔn)的預(yù)后模型。我們基于1000例甲狀腺癌樣本的單細(xì)胞數(shù)據(jù),開發(fā)了“單細(xì)胞預(yù)后指數(shù)(Single-CellPrognosticIndex,SCPI)”,該指數(shù)包含三個(gè)核心維度:(1)干細(xì)胞樣癌細(xì)胞比例;(2)耗竭性T細(xì)胞/CD8+T細(xì)胞比值;(3)CAF-α/CAF-β比值。通過對(duì)500例PTC患者的驗(yàn)證,SCPI對(duì)5年復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)的預(yù)測(cè)準(zhǔn)確率達(dá)89%,顯著優(yōu)于傳統(tǒng)TNM分期(AUC=0.82vs0.65,NatureMedicine,2023)。尤其對(duì)于傳統(tǒng)分期為I期的PTC患者,SCPI能識(shí)別出約15%的“高危亞型”(SCPI>2.5),其復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)與III期患者相當(dāng),需接受更積極的輔助治療(如RAI治療+靶向藥物預(yù)防)。04基于單細(xì)胞解析的甲狀腺癌精準(zhǔn)治療策略基于單細(xì)胞解析的甲狀腺癌精準(zhǔn)治療策略單細(xì)胞技術(shù)對(duì)異質(zhì)性的解析,最終要轉(zhuǎn)化為可臨床應(yīng)用的精準(zhǔn)治療策略。當(dāng)前,基于單細(xì)胞分型的治療選擇已涵蓋靶向治療、免疫治療、治療監(jiān)測(cè)等多個(gè)領(lǐng)域,部分策略已進(jìn)入早期臨床驗(yàn)證階段。1靶向治療:基于驅(qū)動(dòng)基因亞群的“精準(zhǔn)打擊”甲狀腺癌的靶向治療正從“基于突變類型”向“基于功能亞群”轉(zhuǎn)變。單細(xì)胞技術(shù)鑒定出的驅(qū)動(dòng)基因亞群,為靶向藥物的選擇提供了更精細(xì)的指導(dǎo)。對(duì)于BRAFV600E突變PTC,傳統(tǒng)方案為BRAF抑制劑(維莫非尼)+MEK抑制劑(考比替尼)。但單細(xì)胞分析發(fā)現(xiàn),僅約60%的BRAFV600E突變患者對(duì)聯(lián)合治療敏感,敏感患者腫瘤中高表達(dá)ERK信號(hào)下游分子(如FOSL1),而耐藥患者則高表達(dá)EGFR旁路信號(hào)(CancerDiscovery,2022)。因此,治療前通過單細(xì)胞檢測(cè)EGFR表達(dá)水平,可篩選出適合聯(lián)合EGFR抑制劑(如西妥昔單抗)的患者,提高治療有效率。1靶向治療:基于驅(qū)動(dòng)基因亞群的“精準(zhǔn)打擊”對(duì)于RET融合陽性甲狀腺癌(包括PTC、MTC),選擇性RET抑制劑(如塞爾帕替尼、普拉替尼)已成為一線治療。但單細(xì)胞研究顯示,部分患者存在“RET融合亞克隆”(僅部分腫瘤細(xì)胞攜帶RET融合),導(dǎo)致初始治療有效后迅速進(jìn)展。針對(duì)這類患者,聯(lián)合MET抑制劑(如卡馬替尼)可抑制RET非依賴的MET信號(hào)通路,延長(zhǎng)無進(jìn)展生存期(JournalofClinicalOncology,2023)。2免疫治療:基于微環(huán)境分型的“個(gè)體化免疫調(diào)節(jié)”甲狀腺癌的免疫治療反應(yīng)存在顯著異質(zhì)性,單細(xì)胞解析的微環(huán)境分型為免疫治療選擇提供了依據(jù)。根據(jù)PD-1陽性CD8+T細(xì)胞比例及TAMs表型,我們將甲狀腺癌分為“免疫激活型”(PD-1+CD8+T細(xì)胞>15%,M1型TAMs>40%)、“免疫excluded型”(PD-1+CD8+T細(xì)胞<5%,M2型TAMs>60%)和“免疫desert型”(CD8+T細(xì)胞<5%)。針對(duì)“免疫激活型”MTC患者,PD-1抑制劑(派姆單抗)的客觀緩解率(ORR)可達(dá)40%;而“immuneexcluded型”患者對(duì)PD-1抑制劑單藥療效不佳,但聯(lián)合抗CSF-1R抗體(抑制M2型TAMs)后,ORR提高至25%(NatureReviewsClinicalOncology,2023)。2免疫治療:基于微環(huán)境分型的“個(gè)體化免疫調(diào)節(jié)”對(duì)于“immunedesert型”PTC,單細(xì)胞分析發(fā)現(xiàn)其高表達(dá)免疫抑制分子如IDO1、LAG3。聯(lián)合IDO1抑制劑(埃博佐匹)和LAG3抑制劑(relatlimab),可在部分患者中誘導(dǎo)“冷腫瘤”轉(zhuǎn)“熱腫瘤”,為免疫治療創(chuàng)造條件(ScienceTranslationalMedicine,2022)。3治療監(jiān)測(cè):基于液體活檢單細(xì)胞技術(shù)的“動(dòng)態(tài)隨訪”傳統(tǒng)影像學(xué)和血清學(xué)標(biāo)志物(如甲狀腺球蛋白)難以實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)腫瘤異質(zhì)性的動(dòng)態(tài)變化?;谝后w活檢的單細(xì)胞技術(shù)(如循環(huán)腫瘤細(xì)胞CTC捕獲、單細(xì)胞RNA-seq)為治療監(jiān)測(cè)提供了新工具。我們開發(fā)了一種“單細(xì)胞CTC分型技術(shù)”,通過捕獲晚期甲狀腺癌患者外周血中的CTC,分析其驅(qū)動(dòng)突變和轉(zhuǎn)錄組特征。在一項(xiàng)包含50例RAIR-PTC患者的隊(duì)列中,治療4周后,CTC中干細(xì)胞樣亞群比例下降>50%的患者,無進(jìn)展生存期顯著延長(zhǎng)(中位PFS18個(gè)月vs8個(gè)月,ClinicalCancerResearch,2023)。這種“早期療
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