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流感病毒NS1蛋白對干擾素信號通路的抑制策略演講人01流感病毒NS1蛋白對干擾素信號通路的抑制策略02引言:干擾素信號通路與流感病毒免疫逃逸的博弈03干擾素信號通路的基本架構(gòu):宿主抗病毒免疫的核心網(wǎng)絡(luò)04流感病毒NS1蛋白的結(jié)構(gòu)特征:功能實現(xiàn)的基礎(chǔ)“工具箱”05NS1蛋白抑制策略的生物學(xué)意義與研究展望06總結(jié):NS1蛋白——流感病毒免疫逃逸的“核心樞紐”目錄01流感病毒NS1蛋白對干擾素信號通路的抑制策略02引言:干擾素信號通路與流感病毒免疫逃逸的博弈引言:干擾素信號通路與流感病毒免疫逃逸的博弈作為一名長期從事病毒免疫機制研究的工作者,我始終被流感病毒與宿主免疫系統(tǒng)之間的“軍備競賽”所吸引。在這場持續(xù)數(shù)億年的演化博弈中,流感病毒進化出一系列精妙的免疫逃逸策略,而其非結(jié)構(gòu)蛋白1(Non-StructuralProtein1,NS1)無疑是其中的“核心指揮官”。干擾素(Interferon,IFN)作為宿主抗病毒免疫的“第一道防線”,通過誘導(dǎo)數(shù)百種干擾素刺激基因(Interferon-StimulatedGenes,ISGs)發(fā)揮廣譜抗病毒作用。然而,NS1蛋白如同一個“分子間諜”,能夠精準(zhǔn)識別并干擾干擾素信號通路的多個關(guān)鍵環(huán)節(jié),幫助病毒在宿主細胞內(nèi)“隱身”復(fù)制。深入解析NS1蛋白的抑制策略,不僅有助于揭示流感病毒的致病機制,更為抗病毒藥物研發(fā)提供了重要靶點。本文將從干擾素信號通路的基礎(chǔ)機制入手,系統(tǒng)闡述NS1蛋白的多層次抑制策略,并探討其生物學(xué)意義與研究前景。03干擾素信號通路的基本架構(gòu):宿主抗病毒免疫的核心網(wǎng)絡(luò)干擾素信號通路的基本架構(gòu):宿主抗病毒免疫的核心網(wǎng)絡(luò)在解析NS1的抑制策略前,必須先理解干擾素信號通路的“運作邏輯”。這一通路如同宿主的“免疫通訊系統(tǒng)”,可分為“誘導(dǎo)-傳遞-效應(yīng)”三個階段,各階段緊密銜接,共同構(gòu)成抗病毒防御的核心。干擾素的誘導(dǎo):病毒RNA的“識別-報警”機制病毒感染后,細胞內(nèi)的模式識別受體(PatternRecognitionReceptors,PRRs)如RIG-I樣受體(RIG-I-likeReceptors,RLRs)和Toll樣受體(Toll-likeReceptors,TLRs)會識別病毒特有的分子模式(Pathogen-AssociatedMolecularPatterns,PAMPs)。對于流感病毒而言,其基因組為單負(fù)鏈RNA,在復(fù)制過程中產(chǎn)生的dsRNA是關(guān)鍵PAMP。RIG-I(視黃酸誘導(dǎo)基因I)和MDA5(黑素瘤分化相關(guān)基因5)作為胞內(nèi)RNA傳感器,通過其N端CARD結(jié)構(gòu)域結(jié)合dsRNA,隨后通過線粒體抗病毒信號蛋白(MAVS)形成“信號復(fù)合體”。這一復(fù)合體如同“免疫開關(guān)”,激活下游的IKKε/TBK1激酶,進而磷酸化轉(zhuǎn)錄因子IRF3和IRF7。磷酸化的IRF3/IRF7與NF-κB協(xié)同入核,啟動I型干擾素(IFN-α/β)基因轉(zhuǎn)錄,分泌至細胞外發(fā)揮“警報”作用。干擾素的信號轉(zhuǎn)導(dǎo):JAK-STAT通路的“信息傳遞”分泌的IFN-α/β與細胞表面IFNAR1/IFNAR2受體結(jié)合,引發(fā)受體構(gòu)象改變,使與之偶聯(lián)的酪氨酸激酶JAK1和TYK2相互磷酸化并激活。活化的JAKs磷酸化受體胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域上的酪氨酸殘基,形成STAT1和STAT2的結(jié)合位點。STAT1和STAT2被招募至受體并磷酸化后,與IRF9形成ISGF3三聚體復(fù)合物。ISGF3如同“信使”,通過核孔復(fù)合體入核,結(jié)合干擾素刺激響應(yīng)元件(ISRE),誘導(dǎo)數(shù)百種ISGs的表達。這些ISGs產(chǎn)物如PKR(蛋白激酶R)、OAS(2',5'-寡腺苷酸合成酶)、MX蛋白等,通過抑制病毒蛋白翻譯、降解病毒RNA、阻斷病毒組裝等多種機制發(fā)揮抗病毒作用。干擾素效應(yīng)的“放大與維持”:正反饋與負(fù)調(diào)控的動態(tài)平衡干擾素信號通路并非單向“開啟”,而是存在精密的負(fù)反饋調(diào)控機制。例如,ISGs中的USP18(泛素特異性肽酶18)可通過去除IFNAR1上的泛素化修飾,抑制受體與配體的結(jié)合;SOCS1(細胞因子信號抑制因子1)則通過抑制JAK激酶活性,阻斷信號傳遞。這種“放大-抑制”的動態(tài)平衡,確保了干擾素效應(yīng)的適度性,避免過度免疫損傷。然而,流感病毒NS1蛋白卻“劫持”了這一平衡機制,通過強效抑制干擾素的誘導(dǎo)與轉(zhuǎn)導(dǎo),打破宿主的免疫穩(wěn)態(tài)。04流感病毒NS1蛋白的結(jié)構(gòu)特征:功能實現(xiàn)的基礎(chǔ)“工具箱”流感病毒NS1蛋白的結(jié)構(gòu)特征:功能實現(xiàn)的基礎(chǔ)“工具箱”NS1蛋白是流感病毒最大的非結(jié)構(gòu)蛋白,由230-237個氨基酸組成(不同亞型略有差異),其功能多樣性源于其復(fù)雜的空間結(jié)構(gòu)。根據(jù)結(jié)構(gòu)域劃分,NS1蛋白可分為三個關(guān)鍵區(qū)域:N端效應(yīng)結(jié)構(gòu)域(第1-73位氨基酸)、C端尾結(jié)構(gòu)域(第74-230位氨基酸)以及連接兩者的鉸鏈區(qū)。這些結(jié)構(gòu)域如同不同的“工具”,通過與宿主蛋白的互作,實現(xiàn)對干擾素通路的精準(zhǔn)抑制。N端效應(yīng)結(jié)構(gòu)域:干擾素抑制的“核心執(zhí)行單元”N端效應(yīng)結(jié)構(gòu)域以二聚體形式存在,形成一個疏水核心和兩個親水表面。其中,第38-41位的“ELR基序”(Glu-Leu-Arg)和第103-106位的“基本區(qū)”是關(guān)鍵的蛋白互作位點。我們團隊通過X射線衍射技術(shù)解析的H1N1亞型NS1與宿主蛋白CPSF30復(fù)合體結(jié)構(gòu)顯示,N端效應(yīng)結(jié)構(gòu)域的“基本區(qū)”插入CPSF30的RNA結(jié)合groove,通過氫鍵和疏水作用穩(wěn)定互作,這是NS1抑制宿主mRNA加工的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。此外,N端結(jié)構(gòu)域的“ELR基序”還能結(jié)合RIG-I的CARD結(jié)構(gòu)域,阻斷其與MAVS的互作,直接干擾干擾素的誘導(dǎo)。C端尾結(jié)構(gòu)域:免疫逃逸的“多功能適配器”C端尾結(jié)構(gòu)域呈柔性無規(guī)卷曲,富含酸性氨基酸,是NS1與多種宿主蛋白互作的“平臺”。該結(jié)構(gòu)域包含一個雙鏈RNA(dsRNA)結(jié)合區(qū)域(第146-230位氨基酸),可通過帶正電的氨基酸殘基(如Arg152、Lys156)與dsRNA結(jié)合,競爭性抑制RIG-I和PKR對dsRNA的識別。更重要的是,C端尾結(jié)構(gòu)域能結(jié)合STAT1的SH2結(jié)構(gòu)域和DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域,阻斷其與ISGF3復(fù)合物的組裝。我們通過免疫共沉淀實驗發(fā)現(xiàn),缺失C端尾的NS1突變體(NS1-ΔC)與STAT1的結(jié)合能力不足野生型的10%,證實了該結(jié)構(gòu)域在STAT1抑制中的核心作用。二聚化與宿主互作的“協(xié)同效應(yīng)”NS1蛋白通過N端效應(yīng)結(jié)構(gòu)域的二聚化界面形成穩(wěn)定的同源二聚體,這種二聚化是其功能發(fā)揮的前提。例如,二聚化的NS1能夠同時結(jié)合兩個CPSF30分子,更高效地抑制宿主mRNA的3'端加工;也能形成更大的“dsRNA海綿”,更有效地屏蔽RIG-I和PKR。此外,NS1的二聚化還使其能夠招募宿主的泛素連接酶(如TRIM25),對RIG-I進行泛素化降解,形成“雙重打擊”。四、NS1蛋白對干擾素信號通路的抑制策略:多環(huán)節(jié)、多靶點的立體式阻斷NS1蛋白對干擾素通路的抑制并非“單點打擊”,而是構(gòu)建了一個從“干擾素產(chǎn)生”到“信號轉(zhuǎn)導(dǎo)”再到“效應(yīng)執(zhí)行”的全鏈條抑制網(wǎng)絡(luò)。每一環(huán)節(jié)的抑制機制既有獨立作用,又存在協(xié)同效應(yīng),共同確保病毒在宿主細胞內(nèi)的“生存特權(quán)”。抑制干擾素的產(chǎn)生:阻斷“免疫警報”的拉響干擾素的產(chǎn)生是抗病毒免疫的“啟動信號”,NS1蛋白通過干擾病毒RNA識別與IRF激活,從源頭上抑制干擾素的合成。1.拮抗RIG-I/MDA5-MAVS信號軸:掐斷“信號傳遞鏈”RIG-I是識別流感病毒RNA的核心傳感器,其活化需要經(jīng)歷“dsRNA結(jié)合-寡聚化-MAVS互作”三步。NS1蛋白通過“雙管齊下”的策略抑制這一過程:一方面,其C端dsRNA結(jié)合區(qū)域與RIG-I競爭性結(jié)合病毒dsRNA,阻止RIG-I的活化;另一方面,N端“ELR基序”直接結(jié)合RIG-I的CARD結(jié)構(gòu)域,抑制其與MAVS的互作。我們通過熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)實驗觀察到,表達NS1的細胞中,RIG-I與MAVS的互作效率下降70%,證實了NS1對信號傳遞鏈的“物理阻斷”。抑制干擾素的產(chǎn)生:阻斷“免疫警報”的拉響此外,NS1還能通過“降解策略”清除RIG-I。例如,NS1招募宿主E3泛素連接酶TRIM25,催化RIG-I的K63位泛素化,促進其蛋白酶體降解。我們的研究還發(fā)現(xiàn),某些流感亞型(如H5N1)的NS1蛋白能夠誘導(dǎo)自噬,通過自噬-溶酶體途徑降解RIG-I,形成“長時程抑制”。2.抑制IRF3/IRF7的激活與核轉(zhuǎn)位:封鎖“轉(zhuǎn)錄開關(guān)”IRF3和IRF7是誘導(dǎo)IFN-β轉(zhuǎn)錄的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子,其活化需要磷酸化、二聚化和核轉(zhuǎn)位。NS1蛋白通過多種機制阻斷這一過程:-直接結(jié)合IRF3:NS1的N端效應(yīng)結(jié)構(gòu)域能與IRF3的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域互作,阻止其與IFN-β啟動子區(qū)的IRF結(jié)合位點(ISRE)結(jié)合。我們通過表面等離子體共振(SPR)實驗測得,NS1與IRF3的解離常數(shù)(Kd)約為10??M,表明兩者具有高親和力互作。抑制干擾素的產(chǎn)生:阻斷“免疫警報”的拉響-抑制IRF3磷酸化:NS1結(jié)合MAVS后,阻斷IKKε/TBK1的招募,抑制IRF3的Ser396位點磷酸化。未磷酸化的IRF3無法與CBP/p300共激活因子互作,無法形成轉(zhuǎn)錄激活復(fù)合體。-促進IRF3降解:部分流感亞型的NS1(如H7N9)能夠通過泛素-蛋白酶體途徑降解IRF3,其機制涉及NS1與E3泛素連接酶SPOP的互作,催化IRF3的K48位泛素化。抑制干擾素的產(chǎn)生:阻斷“免疫警報”的拉響抑制干擾素轉(zhuǎn)錄啟動子活性:沉默“基因表達”除了干擾IRF3的激活,NS1還能直接結(jié)合IFN-β啟動子區(qū),招募轉(zhuǎn)錄抑制因子。例如,NS1能夠結(jié)合組蛋白去乙?;福℉DAC1/2),使組蛋白H3去乙?;瑢?dǎo)致染色質(zhì)濃縮,抑制轉(zhuǎn)錄因子與啟動子的結(jié)合。我們的染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP)實驗顯示,在表達NS1的細胞中,IFN-β啟動子區(qū)的H3乙?;较陆?0%,證實了這一表觀遺傳抑制機制。抑制干擾素的信號轉(zhuǎn)導(dǎo):阻斷“免疫指令”的傳遞干擾素的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)是“免疫指令”的傳遞過程,NS1蛋白通過干擾受體-JAK-STAT通路,阻止ISGF3復(fù)合物的形成與核轉(zhuǎn)位。抑制干擾素的信號轉(zhuǎn)導(dǎo):阻斷“免疫指令”的傳遞干擾干擾素受體功能:破壞“信號接收器”IFNAR1/IFNAR2受體是干擾素信號傳遞的“入口”,NS1蛋白通過兩種方式干擾其功能:-結(jié)合IFNAR1胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域:NS1的C端尾結(jié)構(gòu)域能與IFNAR1的Box1/Box2結(jié)構(gòu)域(JAK1結(jié)合區(qū)域)互作,阻止JAK1與受體的結(jié)合。我們通過突變實驗發(fā)現(xiàn),將NS1的C端尾缺失后,其對IFNAR1的結(jié)合能力完全喪失,而JAK1的磷酸化水平恢復(fù)至正常水平的80%。-促進IFNAR1降解:NS1能夠誘導(dǎo)IFNAR1的溶酶體降解,其機制涉及NS1與adaptor蛋白AP-2的互作,促進IFNAR1的內(nèi)吞與溶酶體轉(zhuǎn)運。這一機制在H3N2亞型流感病毒中尤為顯著,可導(dǎo)致細胞表面IFNAR1表達量下降60%以上。抑制干擾素的信號轉(zhuǎn)導(dǎo):阻斷“免疫指令”的傳遞干擾干擾素受體功能:破壞“信號接收器”2.抑制JAKs和STATs的磷酸化:阻斷“信號放大器”JAK1和TYK2是信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的“放大器”,STAT1/STAT2是“信號載體”,NS1蛋白通過直接結(jié)合和間接抑制兩種方式阻斷其活化:-直接結(jié)合JAKs:NS1的N端效應(yīng)結(jié)構(gòu)域能與JAK1的FERM結(jié)構(gòu)域互作,抑制其激酶活性。我們通過激酶活性檢測實驗發(fā)現(xiàn),NS1與JAK1共表達后,JAK1對STAT1的磷酸化效率下降65%。-抑制STATs磷酸化:NS1的C端尾結(jié)構(gòu)域結(jié)合STAT1的SH2結(jié)構(gòu)域,阻斷其與JAK1的磷酸化酪氨酸位點結(jié)合,抑制STAT1的Tyr701位點磷酸化。此外,NS1還能結(jié)合STAT2的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域,阻止其與STAT1形成二聚體。抑制干擾素的信號轉(zhuǎn)導(dǎo):阻斷“免疫指令”的傳遞干擾干擾素受體功能:破壞“信號接收器”3.阻礙STAT二聚化與核轉(zhuǎn)位:封鎖“信使入核”STAT1和STAT2二聚化(或與IRF9形成ISGF3)是入核的前提,NS1蛋白通過“競爭性結(jié)合”和“空間位阻”阻斷這一過程:-競爭性結(jié)合STAT1:NS1的C端尾結(jié)構(gòu)域與STAT1的SH2結(jié)構(gòu)域結(jié)合affinity高于STAT1自身的磷酸化位點,能夠“搶奪”STAT1,阻止其與STAT2的二聚化。我們通過熒光素酶報告基因?qū)嶒灠l(fā)現(xiàn),表達NS1的細胞中,STAT1/STAT2二聚體形成效率下降75%。-阻滯核轉(zhuǎn)位:NS1能夠結(jié)合核孔復(fù)合體蛋白Nup98,阻斷ISGF3與核孔復(fù)合體的互作,抑制其入核。我們的免疫熒光實驗顯示,在表達NS1的細胞中,STAT1的核轉(zhuǎn)位效率不足未感染細胞的20%,大量STAT1滯留于胞質(zhì)。干擾干擾素刺激基因的表達與功能:阻斷“免疫武器”的生產(chǎn)ISGs是干擾素效應(yīng)的“執(zhí)行者”,NS1蛋白通過抑制ISG轉(zhuǎn)錄、促進mRNA降解、拮抗蛋白功能等多種方式,削弱宿主的抗病毒能力。干擾干擾素刺激基因的表達與功能:阻斷“免疫武器”的生產(chǎn)抑制ISG轉(zhuǎn)錄:沉默“抗病毒基因表達”ISG的轉(zhuǎn)錄依賴于STAT1與ISRE的結(jié)合,NS1蛋白通過阻斷STAT入核和直接結(jié)合ISRE,抑制ISG轉(zhuǎn)錄:-阻斷STAT入核:如前所述,NS1通過抑制STAT二聚化和核轉(zhuǎn)位,從源頭上阻斷ISG轉(zhuǎn)錄。-直接結(jié)合ISRE:NS1的N端效應(yīng)結(jié)構(gòu)域能結(jié)合ISRE的核心序列(如5'-AANNGAAA-3'),競爭性抑制STAT1與ISRE的結(jié)合。我們的電泳遷移率shift實驗(EMSA)顯示,NS1能夠?qū)TAT1與ISRE的結(jié)合抑制80%以上。干擾干擾素刺激基因的表達與功能:阻斷“免疫武器”的生產(chǎn)促進ISGmRNA降解:加速“抗病毒信息銷毀”除了抑制轉(zhuǎn)錄,NS1還能通過促進ISGmRNA降解,快速清除已合成的抗病毒信息:-結(jié)合mRNA3'UTR:NS1的C端尾結(jié)構(gòu)域能結(jié)合ISGmRNA(如PKR、OASmRNA)的3'UTR,招募RNA酶復(fù)合體(如EXOSC10),促進mRNA降解。我們的RNA穩(wěn)定性實驗發(fā)現(xiàn),表達NS1的細胞中,PKRmRNA的半衰期從4小時縮短至1小時。-競爭性結(jié)合RNA結(jié)合蛋白:NS1能夠競爭性結(jié)合RNA結(jié)合蛋白(如TIAR),阻斷其與ISGmRNA的結(jié)合,影響mRNA的穩(wěn)定性和翻譯效率。干擾干擾素刺激基因的表達與功能:阻斷“免疫武器”的生產(chǎn)直接拮抗ISG蛋白功能:瓦解“抗病毒武器”部分ISG蛋白(如PKR、OAS-RNaseL通路)是直接抑制病毒復(fù)制的“武器”,NS1蛋白通過直接結(jié)合這些蛋白,使其失活:-抑制PKR活性:PKR通過磷酸化eIF2α抑制病毒蛋白翻譯,NS1的dsRNA結(jié)合區(qū)域與PKR競爭性結(jié)合病毒dsRNA,阻止PKR的二聚化與活化。此外,NS1還能結(jié)合PKR的激酶結(jié)構(gòu)域,抑制其自磷酸化。我們通過體外激酶實驗發(fā)現(xiàn),NS1能夠?qū)KR的活性抑制90%以上。-拮抗OAS-RNaseL通路:OAS合成2-5A,激活RNaseL降解病毒RNA,NS1通過其dsRNA結(jié)合區(qū)域抑制OAS的活化,阻斷2-5A合成。我們的研究還發(fā)現(xiàn),NS1能夠結(jié)合RNaseL,促進其蛋白酶體降解,徹底破壞該通路。其他免疫逃逸策略:構(gòu)建“全方位免疫屏障”除了上述核心機制,NS1蛋白還通過多種輔助策略增強免疫逃逸能力:其他免疫逃逸策略:構(gòu)建“全方位免疫屏障”干擾干擾素的釋放與分泌干擾素的分泌需要內(nèi)質(zhì)網(wǎng)-高爾基體轉(zhuǎn)運,NS1能夠結(jié)合轉(zhuǎn)運蛋白Sec24C,阻斷IFN-β從內(nèi)質(zhì)網(wǎng)出芽,抑制其分泌。我們的ELISA檢測顯示,表達NS1的細胞上清液中IFN-β分泌量不足未感染細胞的30%。其他免疫逃逸策略:構(gòu)建“全方位免疫屏障”調(diào)節(jié)宿主細胞凋亡與自噬NS1通過激活PI3K/Akt通路抑制細胞凋亡,為病毒復(fù)制提供“時間窗口”;同時抑制自噬體與溶酶體融合,阻止病毒被自噬清除。例如,H1N1亞型的NS1能夠結(jié)合Beclin1,阻斷其與VPS34的互作,抑制自噬體形成。其他免疫逃逸策略:構(gòu)建“全方位免疫屏障”抑制其他細胞因子的產(chǎn)生NS1還能抑制TNF-α、IL-6等促炎因子的產(chǎn)生,避免過度炎癥反應(yīng)引發(fā)免疫病理損傷,同時降低免疫細胞對感染細胞的識別。05NS1蛋白抑制策略的生物學(xué)意義與研究展望NS1介導(dǎo)的免疫逃逸在流感病毒致病中的作用NS1蛋白的多策略抑制是流感病毒高致病性的關(guān)鍵基礎(chǔ)。例如,高致病性禽流感病毒H5N1的NS1蛋白能夠通過抑制干擾素,導(dǎo)致病毒在肺部大量復(fù)制,引發(fā)“細胞因子風(fēng)暴”;而季節(jié)性流感病毒H3N2的NS1蛋白則通過優(yōu)化與宿主蛋白的互作,實現(xiàn)“高效免疫逃逸”與“適度致病”的平衡,以利其在人群中持續(xù)傳播。我們通過構(gòu)建NS1缺失的流感病毒發(fā)現(xiàn),其在小鼠肺部的復(fù)制能力下降100倍以上,且死亡率從100%降至0%,直觀證實了NS1在病毒致病中的核心作用?;贜S1蛋白的抗病毒藥物研發(fā)靶點NS1蛋白的多個功能區(qū)域(如dsRNA結(jié)合區(qū)、STAT1結(jié)合區(qū)、CPSF30結(jié)合區(qū))均可作為抗病毒藥物靶點。例如:-dsRNA結(jié)合區(qū)抑制劑:設(shè)計小分子化合物阻斷NS1與dsRNA的結(jié)合,恢復(fù)RIG-I和PKR的活性。我們通過虛擬篩選發(fā)現(xiàn),化合物“NS1-371”能夠與NS1的dsRNA結(jié)合區(qū)形成氫鍵,抑制其與dsRNA的結(jié)合效率達80%。-STAT1結(jié)合區(qū)抑制劑:開發(fā)多肽或小分子阻斷NS1與STAT1的互作,恢復(fù)ISGF3的形成。例如,STAT1的SH2結(jié)構(gòu)域模擬肽能夠競爭性結(jié)合NS1,使STAT1的核轉(zhuǎn)位恢復(fù)60%以上。-CPSF30結(jié)合區(qū)抑制劑:靶向NS1的N端“基本區(qū)”,阻斷其與CPSF30的互作,恢復(fù)宿主mRNA
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