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文檔簡介
表觀遺傳調(diào)控增強腫瘤免疫治療療效演講人013非編碼RNA:免疫調(diào)控網(wǎng)絡的“精細調(diào)節(jié)者”021表觀遺傳藥物與免疫檢查點抑制劑(ICIs)的協(xié)同作用033表觀遺傳調(diào)控調(diào)節(jié)免疫細胞分化與功能,重塑免疫微環(huán)境044克服免疫治療耐藥的表觀遺傳機制與逆轉(zhuǎn)策略051表觀遺傳藥物的特異性與安全性優(yōu)化062生物標志物的開發(fā)與患者篩選073個體化表觀遺傳調(diào)控策略的優(yōu)化084聯(lián)合治療的協(xié)同機制深化與臨床轉(zhuǎn)化目錄表觀遺傳調(diào)控增強腫瘤免疫治療療效作為腫瘤免疫治療領域的研究者,我始終在思考:為何同樣是PD-1/PD-L1抑制劑,部分患者能實現(xiàn)長期緩解,而多數(shù)卻療效不佳或迅速耐藥?近年來,隨著對腫瘤微環(huán)境(TME)研究的深入,表觀遺傳調(diào)控(EpigeneticRegulation)這一“基因表達的隱形指揮家”逐漸成為破解這一難題的關鍵。表觀遺傳修飾不改變DNA序列,卻通過DNA甲基化、組蛋白修飾、非編碼RNA調(diào)控等方式,動態(tài)調(diào)節(jié)基因表達,在腫瘤免疫逃逸、免疫細胞功能分化及治療響應中扮演著核心角色。本文將結(jié)合前沿研究與臨床實踐,系統(tǒng)闡述表觀遺傳調(diào)控如何通過重塑腫瘤免疫微環(huán)境,增強免疫檢查點抑制劑(ICIs)、細胞治療等腫瘤免疫治療的療效,并探討其臨床轉(zhuǎn)化挑戰(zhàn)與未來方向。一、表觀遺傳調(diào)控與腫瘤免疫逃逸的內(nèi)在關聯(lián):從分子機制到微環(huán)境重塑表觀遺傳異常是腫瘤的“標志性特征”之一,其通過調(diào)控免疫相關基因的表達,直接影響腫瘤細胞的免疫原性、免疫細胞的活化狀態(tài)及免疫抑制性微環(huán)境的形成,從而介導免疫逃逸。理解這一過程,是制定表觀遺傳調(diào)控增強免疫治療策略的理論基石。1.1DNA甲基化:免疫原性沉默與免疫檢查點異常的“分子開關”DNA甲基化是由DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNMTs,如DNMT1、DNMT3A/3B)催化,在CpG島二核苷酸胞嘧啶第5位碳原子上添加甲基的過程。在腫瘤中,DNMTs常過表達,導致全基因組低甲基化與特定基因啟動子區(qū)高甲基化共存,而后者是調(diào)控免疫相關基因表達的關鍵。-腫瘤抗原提呈相關基因沉默:腫瘤抗原是免疫細胞識別的“靶標”,其提呈效率取決于主要組織相容性復合體(MHC)分子及抗原加工相關基因的表達。研究發(fā)現(xiàn),黑色素瘤、肺癌中,MHC-I類基因(如HLA-A、HLA-B)的啟動子區(qū)常高甲基化,導致MHC-I表達下調(diào),使腫瘤細胞無法被CD8+T細胞有效識別。此外,抗原處理相關transporter(TAP1/2)、LMP2/7等基因的高甲基化,進一步削弱抗原提呈能力,形成“免疫隱匿”。-免疫檢查點分子異常上調(diào):免疫檢查點(如PD-L1、CTLA-4)是腫瘤免疫逃逸的關鍵“剎車分子”。PD-L1基因(CD274)啟動子區(qū)存在CpG島,其甲基化狀態(tài)直接調(diào)控PD-L1表達。在部分腫瘤中,DNMTs過表達導致PD-L1啟動子區(qū)低甲基化,PD-L1異常高表達;而另一些研究中,抑癌基因(如p16INK4a)高甲基化失活,可通過激活NF-κB信號間接上調(diào)PD-L1,形成“雙重調(diào)控”。-干擾素信號通路抑制:干擾素-γ(IFN-γ)是抗腫瘤免疫的核心細胞因子,其通過JAK-STAT信號誘導MHC分子、PD-L1等免疫相關基因表達。然而,腫瘤中STAT1基因啟動子高甲基化,導致IFN-γ信號通路受損,即使T細胞浸潤至腫瘤微環(huán)境,也無法有效激活抗腫瘤免疫。在臨床前模型中,使用DNMT抑制劑(如地西他濱、阿扎胞苷)可逆轉(zhuǎn)上述基因的甲基化狀態(tài):恢復MHC-I表達、下調(diào)PD-L1、重建IFN-γ信號通路,從而增強腫瘤細胞對CD8+T細胞的敏感性。這一機制已在肝癌、胃癌等模型中得到驗證,為DNMT抑制劑聯(lián)合免疫治療提供了理論依據(jù)。1.2組蛋白修飾:染色質(zhì)開放性與免疫基因表達的“動態(tài)調(diào)控器”組蛋白修飾(乙?;?、甲基化、磷酸化等)通過改變?nèi)旧|(zhì)結(jié)構(gòu)(常染色質(zhì)與異染色質(zhì)轉(zhuǎn)換),調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的“可及性”。其中,組蛋白乙?;山M蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(HATs,如p300、CBP)催化,組蛋白去乙酰化由組蛋白去乙?;福℉DACs,如HDAC1-11)催化,兩者動態(tài)平衡決定免疫相關基因的“開”與“關”。-組蛋白低乙?;瘜е碌拿庖呋虺聊篐DACs在腫瘤中常過表達,通過去除組蛋白H3、H4的乙?;?,使染色質(zhì)趨于緊縮狀態(tài),抑制免疫相關基因轉(zhuǎn)錄。例如,在非小細胞肺癌(NSCLC)中,HDAC1過表達可沉默CD8+T細胞趨化因子CXCL9、CXCL10的基因,阻礙T細胞浸潤至腫瘤內(nèi)部;在黑色素瘤中,HDAC3抑制MHC-II類基因表達,使腫瘤細胞無法被CD4+T細胞輔助激活。-組蛋白甲基化的“雙刃劍”作用:組蛋白甲基化由組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶(HMTs,如EZH2、SETD7/9)催化,可激活(H3K4me3、H3K36me3)或抑制(H3K27me3、H3K9me3)基因轉(zhuǎn)錄。EZH2是PRC2復合體的核心催化亞基,催化H3K27me3修飾,在乳腺癌、淋巴瘤中高表達,通過沉默MHC-I、抗原加工相關基因及Th1型趨化因子(如CXCL11),促進免疫逃逸。值得注意的是,H3K4me3修飾則可激活PD-L1基因,其水平與PD-1抑制劑耐藥相關。-“免疫激活型”組蛋白修飾的上調(diào):與低乙?;?、抑制性甲基化相反,H3K9ac、H3K27ac等激活型修飾可促進免疫相關基因轉(zhuǎn)錄。例如,在樹突狀細胞(DC)中,IFN-γ誘導H3K27ac修飾增強于MHC-II基因啟動子區(qū),提升抗原提呈能力;在腫瘤浸潤CD8+T細胞中,TCR信號通過HATs(如p300)增加PD-1基因啟動子區(qū)H3K27ac修飾,導致T細胞耗竭?;诖?,HDAC抑制劑(如伏立諾他、帕比司他)和EZH2抑制劑(如他澤司他)可通過增加組蛋白乙?;?、抑制H3K27me3修飾,恢復免疫基因表達,重塑腫瘤免疫微環(huán)境。例如,HDAC抑制劑可上調(diào)MHC-I、趨化因子,促進T細胞浸潤;EZH2抑制劑可逆轉(zhuǎn)T細胞耗竭相關基因(如PDCD1、TOX)的沉默,增強T細胞功能。013非編碼RNA:免疫調(diào)控網(wǎng)絡的“精細調(diào)節(jié)者”3非編碼RNA:免疫調(diào)控網(wǎng)絡的“精細調(diào)節(jié)者”非編碼RNA(ncRNA,包括miRNA、lncRNA、circRNA)不編碼蛋白質(zhì),卻通過轉(zhuǎn)錄后調(diào)控或染色質(zhì)修飾,參與免疫應答的精細調(diào)控。在腫瘤免疫逃逸中,ncRNA的異常表達是重要機制之一。-miRNA:免疫基因表達的“分子開關”:miRNA通過靶向免疫相關mRNA的3'UTR區(qū),促進其降解或抑制翻譯。例如,miR-148a在肝癌中高表達,靶向DNMT1,導致PD-L1啟動子區(qū)低甲基化,PD-L1上調(diào);而miR-34a在黑色素瘤中低表達,其靶基因SIRT1(去乙?;福┍磉_上調(diào),抑制T細胞活化。相反,miR-200家族可靶向PD-L1mRNA,直接下調(diào)PD-L1表達,增強免疫治療效果。3非編碼RNA:免疫調(diào)控網(wǎng)絡的“精細調(diào)節(jié)者”-lncRNA:表觀遺傳修飾的“腳手架”:lncRNA可通過結(jié)合表觀遺傳修飾復合體,定位至特定基因位點,調(diào)控其表達。例如,在NSCLC中,lncRNA-HOTAIR結(jié)合EZH2復合體,催化PD-L1基因啟動子區(qū)H3K27me3修飾,沉默PD-L1;而lncRNA-PVT1通過結(jié)合miR-200c,解除其對PD-L1mRNA的抑制,間接上調(diào)PD-L1。-circRNA:miRNA“海綿”與免疫檢查點調(diào)控:circRNA具有穩(wěn)定的環(huán)狀結(jié)構(gòu),可通過競爭性結(jié)合miRNA(ceRNA機制)調(diào)控靶基因表達。例如,circ-ITCH在胃癌中低表達,失去對miR-214的“海綿”作用,導致miR-214靶向PTEN,激活PI3K/Akt信號,上調(diào)PD-L1表達;而circ-Foxo3可結(jié)合miR-155,解除其對SOCS1的抑制,增強T細胞抗腫瘤活性。3非編碼RNA:免疫調(diào)控網(wǎng)絡的“精細調(diào)節(jié)者”ncRNA的調(diào)控網(wǎng)絡復雜且具有組織特異性,靶向特定ncRNA(如miR-34a類似物、lncRNA-HOTAIR抑制劑)可逆轉(zhuǎn)免疫逃逸,為免疫治療提供新的靶點。表觀遺傳調(diào)控增強腫瘤免疫治療的策略:從基礎研究到臨床實踐基于上述機制,表觀遺傳調(diào)控可通過多種策略增強免疫治療療效,包括表觀遺傳藥物與免疫檢查點抑制劑聯(lián)用、調(diào)控免疫原性細胞死亡(ICD)、調(diào)節(jié)免疫細胞分化及功能、克服免疫治療耐藥等。這些策略已在臨床前和早期臨床試驗中展現(xiàn)出良好前景。021表觀遺傳藥物與免疫檢查點抑制劑(ICIs)的協(xié)同作用1表觀遺傳藥物與免疫檢查點抑制劑(ICIs)的協(xié)同作用表觀遺傳藥物可通過逆轉(zhuǎn)免疫逃逸、增強免疫細胞功能,與ICIs形成“1+1>2”的協(xié)同效應,是目前研究最深入、轉(zhuǎn)化最快的方向。-DNMT抑制劑聯(lián)合PD-1/PD-L1抑制劑:DNMT抑制劑(如地西他濱)通過去甲基化作用,恢復腫瘤抗原提呈相關基因(MHC-I、TAP1/2)表達,上調(diào)腫瘤免疫原性;同時,可激活內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒(ERV)表達,產(chǎn)生“病毒模擬”狀態(tài),促進I型干擾素釋放,增強DC成熟和T細胞活化。在臨床前模型中,地西他濱聯(lián)合PD-1抑制劑可顯著抑制黑色素瘤、肺癌生長,并產(chǎn)生記憶性T細胞反應。在臨床中,一項II期試驗(NCT01256098)顯示,阿扎胞苷聯(lián)合帕博利珠單抗在晚期NSCLC中客觀緩解率(ORR)達33%,高于帕博利珠單抗單藥(18%),且甲基化水平低的患者療效更佳。1表觀遺傳藥物與免疫檢查點抑制劑(ICIs)的協(xié)同作用-HDAC抑制劑聯(lián)合PD-1/PD-L1抑制劑:HDAC抑制劑(如伏立諾他)通過增加組蛋白乙?;?,上調(diào)趨化因子(CXCL9、CXCL10)表達,促進CD8+T細胞浸潤;同時,可下調(diào)Treg細胞功能(抑制Foxp3表達)、減少髓系來源抑制細胞(MDSCs)浸潤,逆轉(zhuǎn)免疫抑制微環(huán)境。在霍奇金淋巴瘤中,HDAC抑制劑聯(lián)合PD-1抑制劑(納武利尤單抗)的ORR達87%,且療效持久。值得注意的是,HDAC抑制劑可上調(diào)PD-L1表達,但通過增強T細胞功能,整體仍呈現(xiàn)協(xié)同效應,這一“矛盾”現(xiàn)象提示我們需要更精準的用藥時機和劑量設計。-EZH2抑制劑聯(lián)合ICIs:EZH2抑制劑(如他澤司他)通過抑制H3K27me3修飾,恢復腫瘤抗原提呈相關基因及T細胞活化基因(如IFN-γ、IL-2)表達,同時減少Treg細胞分化。在淋巴瘤模型中,他澤司他聯(lián)合PD-1抑制劑可顯著延長小鼠生存期,且與腫瘤突變負荷(TMB)無關,為TMB低的患者提供了新的治療選擇。1表觀遺傳藥物與免疫檢查點抑制劑(ICIs)的協(xié)同作用協(xié)同機制的核心:表觀遺傳藥物不僅“喚醒”腫瘤細胞的免疫原性,還“解除”免疫抑制性微環(huán)境的束縛,使ICIs能夠更有效地激活和維持抗腫瘤免疫反應。2.2表觀遺傳調(diào)控調(diào)控免疫原性細胞死亡(ICD),增強免疫原性ICD是腫瘤細胞在應激(如放療、化療)下釋放損傷相關分子模式(DAMPs,如ATP、HMGB1、鈣網(wǎng)蛋白),激活DC成熟和T細胞應答的程序性死亡形式。表觀遺傳調(diào)控可通過調(diào)控ICD相關基因的表達,增強治療誘導的免疫原性。-DNMT抑制劑誘導“病毒樣”ICD:DNMT抑制劑可激活內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒(ERV)表達,產(chǎn)生dsRNA,激活MDA5-MAVS信號,促進I型干擾素釋放和DC成熟;同時,上調(diào)鈣網(wǎng)蛋白表達,增強腫瘤細胞對DC的抗原提呈。在肝癌模型中,地西他濱聯(lián)合侖伐替尼(TKI)可誘導顯著的ICD,促進CD8+T細胞浸潤,形成“冷腫瘤”向“熱腫瘤”的轉(zhuǎn)化。1表觀遺傳藥物與免疫檢查點抑制劑(ICIs)的協(xié)同作用-HDAC抑制劑增強DAMPs釋放:HDAC抑制劑可增加組蛋白乙?;?,上調(diào)HMGB1、ATP等DAMPs的表達。例如,伏立諾他可通過抑制HDAC6,促進溶酶體外排和ATP釋放,增強DC對腫瘤抗原的捕獲和提呈。在胰腺癌模型中,HDAC抑制劑聯(lián)合吉西他濱可顯著改善ICD缺陷,提高免疫治療效果。臨床意義:對于ICD缺陷的“冷腫瘤”(如胰腺癌、肝癌),表觀遺傳藥物可重塑其免疫原性,為放化療、靶向治療聯(lián)合免疫治療提供新思路。033表觀遺傳調(diào)控調(diào)節(jié)免疫細胞分化與功能,重塑免疫微環(huán)境3表觀遺傳調(diào)控調(diào)節(jié)免疫細胞分化與功能,重塑免疫微環(huán)境免疫細胞的功能狀態(tài)是決定免疫治療效果的關鍵,表觀遺傳修飾可調(diào)控免疫細胞的分化、活化與耗竭,從而優(yōu)化抗腫瘤免疫應答。-T細胞耗竭的逆轉(zhuǎn):T細胞耗竭是免疫治療耐藥的主要原因之一,其特征為PD-1、TIM-3、LAG-3等檢查點分子高表達,IL-2、IFN-γ等細胞因子分泌減少。表觀遺傳修飾在T細胞耗竭中發(fā)揮“記憶”作用:耗竭性T細胞(Tex)中,PDCD1、TOX、HAVCR2等基因啟動子區(qū)H3K27me3修飾減少,H3K4me3修飾增加,形成“表觀遺傳程序”維持耗竭狀態(tài)。EZH2抑制劑可通過增加H3K27me3修飾,沉默耗竭相關基因,促進Tex向“干細胞樣記憶T細胞”(Tscm)分化,恢復其抗腫瘤功能。3表觀遺傳調(diào)控調(diào)節(jié)免疫細胞分化與功能,重塑免疫微環(huán)境-巨噬細胞極化調(diào)控:腫瘤相關巨噬細胞(TAMs)多分化為M2型,促進免疫抑制和血管生成。表觀遺傳修飾可調(diào)控巨噬細胞極化:例如,HDAC抑制劑可增加H3K9ac修飾,上調(diào)M1型標志物(iNOS、IL-12),下調(diào)M2型標志物(CD163、IL-10);而lncRNA-HOTAIR通過招募EZH2,催化M1型基因啟動子區(qū)H3K27me3修飾,抑制M1極化。在乳腺癌模型中,EZH2抑制劑聯(lián)合CSF-1R抑制劑可促進TAMs向M1型極化,增強PD-1抑制劑療效。-NK細胞功能增強:NK細胞是先天免疫的重要效應細胞,其功能受表觀遺傳調(diào)控嚴格調(diào)控。例如,miR-150在NK細胞中高表達,靶向DNMT1,導致MHC-I類基因啟動子區(qū)低甲基化,增強NK細胞對腫瘤細胞的識別;而HDAC抑制劑可上調(diào)NKG2D、DNAM-1等活化性受體表達,促進NK細胞殺傷活性。3表觀遺傳調(diào)控調(diào)節(jié)免疫細胞分化與功能,重塑免疫微環(huán)境策略核心:通過表觀遺傳調(diào)控,將免疫細胞從“抑制狀態(tài)”轉(zhuǎn)化為“激活狀態(tài)”,構(gòu)建“免疫支持型”微環(huán)境,為免疫治療提供“效應細胞基礎”。044克服免疫治療耐藥的表觀遺傳機制與逆轉(zhuǎn)策略4克服免疫治療耐藥的表觀遺傳機制與逆轉(zhuǎn)策略免疫治療耐藥是臨床面臨的重大挑戰(zhàn),表觀遺傳異常是耐藥的重要機制之一,其可通過多種途徑導致治療失敗。-原發(fā)性耐藥的表觀遺傳基礎:部分腫瘤(如肝癌、胰腺癌)表現(xiàn)為“免疫沙漠”型微環(huán)境,缺乏T細胞浸潤,與MHC-I基因高甲基化、趨化因子基因沉默有關;另一些腫瘤(如膠質(zhì)瘤)中,PD-L1基因啟動子區(qū)高甲基化,導致PD-L1低表達,對PD-1抑制劑天然耐藥。-獲得性耐藥的表觀遺傳調(diào)控:長期使用ICIs后,腫瘤細胞可通過表觀遺傳修飾“逃避免疫監(jiān)視”:例如,在黑色素瘤耐藥模型中,DNMT3A過表達導致MHC-I基因重新高甲基化,逃避CD8+T細胞識別;HDAC1高表達沉默IFN-γ信號通路,阻斷PD-1抑制劑介導的腫瘤細胞殺傷。4克服免疫治療耐藥的表觀遺傳機制與逆轉(zhuǎn)策略逆轉(zhuǎn)耐藥的策略:基于耐藥的表觀遺傳機制,采用針對性藥物聯(lián)合治療。例如,對于MHC-I低甲基化導致的耐藥,聯(lián)合DNMT抑制劑;對于HDAC1過表達導致的耐藥,聯(lián)合HDAC抑制劑。在臨床前研究中,DNMT抑制劑聯(lián)合PD-1抑制劑可逆轉(zhuǎn)黑色素瘤耐藥模型中的免疫逃逸,恢復腫瘤對ICIs的敏感性。表觀遺傳調(diào)控增強免疫治療的挑戰(zhàn)與未來方向盡管表觀遺傳調(diào)控在增強免疫治療方面展現(xiàn)出巨大潛力,但其臨床轉(zhuǎn)化仍面臨諸多挑戰(zhàn):表觀遺傳藥物的特異性、毒性、生物標志物的缺乏、個體化治療策略的優(yōu)化等。未來,隨著技術的進步和研究的深入,這些問題有望逐步解決。051表觀遺傳藥物的特異性與安全性優(yōu)化1表觀遺傳藥物的特異性與安全性優(yōu)化目前臨床使用的表觀遺傳藥物(如DNMT抑制劑、HDAC抑制劑)多為“廣譜”抑制劑,可作用于多個基因位點,導致脫靶效應和毒性(如骨髓抑制、胃腸道反應)。提高藥物特異性是未來方向之一:-靶向特定表觀遺傳修飾酶:開發(fā)高選擇性抑制劑,如靶向DNMT3B的抑制劑(避免影響DNMT1導致的DNA復制損傷)、靶向HDAC6的抑制劑(減少對HDAC1/2的心臟毒性)。例如,西達本胺(選擇性HDAC1/6抑制劑)在中國淋巴瘤治療中已獲批,其心臟毒性顯著低于泛HDAC抑制劑。-表觀遺傳編輯技術的應用:利用CRISPR-dCas9系統(tǒng)融合表觀遺傳修飾域(如DNMT3A、TET1、p300),實現(xiàn)對特定基因位點的精準甲基化或乙酰化修飾。例如,dCas9-DNMT3A可沉默PD-L1基因,而不影響其他免疫相關基因,避免脫靶效應。目前,該技術已在臨床前模型中成功應用,但遞送系統(tǒng)和安全性仍需進一步優(yōu)化。062生物標志物的開發(fā)與患者篩選2生物標志物的開發(fā)與患者篩選表觀遺傳調(diào)控具有高度異質(zhì)性,并非所有患者都能從表觀遺傳藥物聯(lián)合免疫治療中獲益。開發(fā)預測療效的生物標志物是實現(xiàn)個體化治療的關鍵:-表觀遺傳修飾標志物:DNA甲基化譜(如MHC-I基因甲基化水平、PD-L1啟動子區(qū)甲基化狀態(tài))、組蛋白修飾水平(如H3K27me3、H3K9ac)、ncRNA表達譜(如miR-34a、lncRNA-HOTAIR)等,可作為療效預測標志物。例如,臨床前研究顯示,MHC-I基因低甲基化的患者對DNMT抑制劑聯(lián)合PD-1抑制劑更敏感。-多組學整合分析:結(jié)合基因組(TMB、突變基因)、轉(zhuǎn)錄組(免疫細胞浸潤評分)、蛋白組(PD-L1表達)和表觀基因組數(shù)據(jù),構(gòu)建綜合預測模型,提高患者篩選的準確性。例如,通過整合甲基化組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),可識別“免疫激活型”和“免疫抑制型”腫瘤,指導個體化治療。073個體化表觀遺傳調(diào)控策略的優(yōu)化3個體化表觀遺傳調(diào)控策略的優(yōu)化不同腫瘤類型、不同患者的表觀遺傳異常譜存在差異,需要制定個體化治療策略:-基于腫瘤類型的表觀遺傳調(diào)控:例如,肺癌中常見CDKN2A(p16)基因高甲基失活,可聯(lián)合DNMT抑制劑;淋巴瘤中EZH2高表達,可優(yōu)先選擇EZH2抑制劑;膠質(zhì)瘤中MGMT基因啟動子區(qū)甲基化與替莫唑胺療效相關,可結(jié)合表觀遺傳藥物調(diào)控MGMT表達。-基于治療階段的序貫治療:對于初治患者,可先使用表觀遺傳
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