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1、分子診斷技術(shù)在感控中的應(yīng)用分子生物學(xué)診斷技術(shù)檢測(cè)DNA、RNA或蛋白質(zhì)等物質(zhì)對(duì)疾病進(jìn)行診斷或 輔助診斷分析基因或蛋白的存在、變異或表達(dá)為疾病提供更直接的證據(jù)常見(jiàn)分子診斷技術(shù)核酸檢測(cè)核酸擴(kuò)增技術(shù)測(cè)序技術(shù)核酸雜交技術(shù)基因芯片技術(shù)生物傳感技術(shù)蛋白質(zhì)檢測(cè)光譜技術(shù)蛋白芯片技術(shù)標(biāo)記免疫分析技術(shù)質(zhì)譜技術(shù)醫(yī)院感染暴發(fā)調(diào)查Sivertsen A, Billstrom H, Melefors O , Liljequist BO, Wisell KT, et al. (2014) A Multicentre Hospital Outbreak in Sweden Caused by Introduction of
2、a vanB2 Transposon into a Stably Maintained pRUM-Plasmid in an Enterococcus faecium ST192 Clone. PLoS ONE 9(8): e103274. doi:10.1371/journal.pone.0103274屎腸球菌ST192Baier et al. Molecular characteristics and successful management of a respiratory syncytial virus outbreak among pediatric patients with h
3、emato-oncological disease Antimicrobial Resistance and Infection Control (2018) 7:21RSV感染 暴發(fā)Sanger測(cè)序病原體診斷關(guān)于測(cè)序技術(shù)Sanger測(cè)序新一代測(cè)序(next genome sequencing, NGS)第三代測(cè)序genome-wide association study, GWASwhole-genome sequencing ,WGS耐藥基因/耐藥突變葡萄球菌:mecA、SCCmec腸球菌:VanA、 VanB、 VanC結(jié)核分枝桿菌:ropB腸桿菌科:NDM-1、KPC、 mcr-1HB
4、V、HCV、HIVCRE:CPE?NO-CP-CRE?孔蛋白缺失+ 產(chǎn)ESBL / AmpC水解厄他培南臨床反應(yīng)可能與MIC一 致較低的傳播可能產(chǎn)碳青霉烯酶(如KPC,NDM)可能是交叉耐藥較高的暴發(fā)可能緊急感染控制Zhan L, et al.(2017) Outbreak by Hypermucoviscous Klebsiella pneumoniae ST11 Isolates with Carbapenem Resistance in a Tertiary Hospital in China. Front. Cell. Infect. Microbiol. 7:182. doi: 10
5、.3389/fcimb.2017.00182多種技術(shù)聯(lián)合應(yīng)用PFGEPCR擴(kuò)增測(cè)序血清分型MLST從經(jīng)驗(yàn)治療到直接干預(yù)快速:24小時(shí)內(nèi)報(bào)告分子診斷實(shí)驗(yàn)結(jié)果質(zhì)譜(MALDI-TOF)核酸擴(kuò)增/檢測(cè)(NAAT):多重PCR、微陣列(mecA, vanA, KPC; MRSA/SA, carbapenemases,C difficile)PNA-FISH(Enterococcus, Candida, Staphylococcus, EC/PSA/KP,mecA)T2MR: 用核磁信號(hào)檢測(cè),目前僅用于念 珠菌二代測(cè)序:宏基因組學(xué),但不快! 全自動(dòng)顯微鏡+ FISH:快速表型檢測(cè)Adapted from
6、 Chan, et al. Nature Biotechnology 30:1068-71CLSI AST News Update.2018,3(1).技術(shù)的局限性表型診斷實(shí)驗(yàn)(MIC)與臨床結(jié)果非常相關(guān)MIC升高,耐藥基因表達(dá)任何微生物實(shí)驗(yàn)室都可 以使用這種方法基因型診斷實(shí)驗(yàn)(機(jī)制)更好地預(yù)測(cè)傳播風(fēng)險(xiǎn)和 暴發(fā)可能表型方法差(例如MHTNAAT僅在參考/研究實(shí) 驗(yàn)室中可用納入醫(yī)院感染實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)和暴發(fā)預(yù)警系統(tǒng)Du et al.: Real-time automatic hospital-wide surveillance of nosocomial infections and outbreaks in a large Chinese tertiary hospital. BMC Medical Informatics a
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