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本文格式為Word版,下載可任意編輯——山羊絨DNA的提取及驗(yàn)證
材料與儀器
1.1試劑
試驗(yàn)用水應(yīng)符合GB/T6682中一級(jí)水的規(guī)格,組織和毛發(fā)提取試劑盒TaKaRaMiniBESTUniversalGenomicDNAExtractionKitVer.5.0(TaKaRaCode.9765),PremixExTaq?(ProbeqPCR)(TaKaRaCode.RR390A),100%乙醇,DNALaddarMarker。
1.2儀器與設(shè)備
冰箱:4℃~20℃,天平:感量0.0001g,分析研磨機(jī),剪刀,恒溫水浴鍋,離心機(jī)(12000rpm),渦旋混合器,微量可調(diào)移液器:0.1μL~2.5μL,1μL~10μL,2μL~20μL,10μL~100μL,20μL~200μL,100μL~1000μL,1.5mL離心管,超凈工作臺(tái),PCR儀,實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀,電泳裝置,凝膠成像儀。
2試驗(yàn)方法與步驟
2.1取樣
從山羊絨制品的不用部位取樣,共取約1g試樣。
2.2制樣
用剪刀將樣品剪碎,經(jīng)分析研磨機(jī)打散混勻,再用剪刀盡量剪碎至2mm以下,再次用分析研磨機(jī)混勻。
2.3DNA的提取
從混勻的樣品中稱取約5mg試樣,放入2mL離心管中,每個(gè)樣平行提取兩管,提取步驟嚴(yán)格按照試劑盒說明書舉行操作,此處不贅述。提取過程留神如殘存纖維狀組織無(wú)法完全裂解,裂解之后先12000rpm離心2分鐘,去除雜質(zhì)之后再舉行后續(xù)操作。提取試劑盒由寶生物工程(大連)有限公司供給,試劑盒型號(hào)TaKaRaMiniBESTUniversalGenomicDNAExtractionKitVer.5.0。
2.4引物探針信息
本文所用的引物和探針均由TakaRa寶生物工程(大連)有限公司合成,概括見表1。
表1山羊絨成分熒光定量PCR引物及探針
3結(jié)果與分析
3.1DNA提取效果
DNA提取終止后對(duì)其舉行DNA電泳以確保其DNA的提出,概括結(jié)果見圖1。由圖1可見,提取的DNA擴(kuò)增條帶明顯,提取效果良好。
圖1提取山羊絨DNA電泳圖
2μLApplied,1%Agarose;M:DNAMarkerλ-HindIIIdigest;1-2:山羊絨DNA
3.2引物特異性驗(yàn)證
在優(yōu)化好的PCR回響條件和回響體系下,以鴨絨、鵝絨、綿羊毛、兔毛、山羊絨、牦牛絨、羊駝毛的DNA為特異性試驗(yàn)對(duì)照舉行PCR檢測(cè)。電泳結(jié)果顯示,僅有山羊絨被擴(kuò)增出條帶,而陰性對(duì)照未擴(kuò)增出條帶,證明山羊絨引物的特異性良好,將其應(yīng)用于PCR方法,山羊絨成分可以從其他纖維中有效地鑒別出來(lái),概括結(jié)果見圖2。圖2所顯示的擴(kuò)增片段大小約是300bp,大小符合所設(shè)計(jì)的引物片段大小303bp,且陰性對(duì)照和其他非山羊絨模板對(duì)照均未展現(xiàn)特異性條帶。
12345678M
圖2PCR特異性檢測(cè)結(jié)果
5μLApplied,3%Agarose,M:100bpDNALaddarMarker;1:鴨絨PCR產(chǎn)物;2:鵝絨PCR產(chǎn)物;3:綿羊毛PCR產(chǎn)物;4:兔毛PCR產(chǎn)物;5:山羊絨PCR產(chǎn)物;6:牦牛絨PCR產(chǎn)物;7:羊駝毛PCR產(chǎn)物;8:陰性對(duì)照(NegativeControl)。
3.3檢測(cè)體系及結(jié)果
3.3.1回響體系及回響條件
(1)PCR回響體系
以提取的山羊絨DNA為模板,每次回響均設(shè)陰性對(duì)照和陽(yáng)性對(duì)照。實(shí)時(shí)熒光PCR回響體系25μL,概括見表2。
表2熒光定量PCR回響體系
注:Negativecontrol回響時(shí),參與RNasefreedH2O;Positive回響時(shí),做兩個(gè)平行樣。
(2)回響條件
本試驗(yàn)建立的熒光定量PCR初步回響參數(shù)包括預(yù)變性、變性、退火延遲三步。實(shí)時(shí)熒光定量PCR初步回響參數(shù)見表3。
表3熒光定量回響條件參數(shù)
ABI7500FastRealTimeSystem熒光定量PCR儀完全封閉操作,儀器可以直接讀數(shù),熒光定量PCR熒信號(hào)在每一循環(huán)延遲步驟完成后收集,并立刻顯示出結(jié)果,可實(shí)時(shí)查看每一循環(huán)收集熒光信號(hào)的強(qiáng)度。
3.3.2檢測(cè)結(jié)果
(1)Ct值及結(jié)果判定
在優(yōu)化好的熒光PCR回響條件和回響體系下,選擇鴨絨、鵝絨、綿羊毛、兔毛、山羊絨、牦牛絨、羊駝毛的DNA為特異性試驗(yàn)的對(duì)照來(lái)舉行熒光PCR檢測(cè)。檢測(cè)結(jié)果顯示,僅山羊絨Ct值為26.125,而其他樣品及陰性對(duì)照無(wú)Ct值,Ct值及結(jié)果判定見表4。
(2)熒光PCR檢測(cè)特異性試驗(yàn)結(jié)果
在優(yōu)化好的熒光PCR回響條件和回響體系下,選擇鴨絨、鵝絨、綿羊毛、兔毛、山羊絨、牦牛絨、羊駝毛的DNA為特異性試驗(yàn)的對(duì)照來(lái)舉行熒光PCR檢測(cè)。檢測(cè)結(jié)果顯示,僅山羊絨有擴(kuò)增曲線,而其他對(duì)照以及空白對(duì)照均沒有擴(kuò)增曲線,說明本試驗(yàn)設(shè)計(jì)的特異性引物和探針與山羊基因具有較高同源性,而與其他常見動(dòng)物物種的基因并沒有同源性,該檢測(cè)方法具較強(qiáng)的特異性。概括結(jié)果見圖3。
圖3山羊絨DNA熒光PCR結(jié)果
4結(jié)論
本文使用TaKaRaMiniBESTUniversalGenomicDNAExtractionKitVer.5.0試劑盒提取山羊絨DNA,經(jīng)檢測(cè)驗(yàn)證,DNA擴(kuò)增曲線良好,電泳條帶明顯,空白對(duì)照是陰性結(jié)果,引物對(duì)在其他幾種動(dòng)物纖維體系內(nèi),包含鴨絨、鵝絨、綿羊毛、兔毛、牦牛絨和羊駝毛,沒有擴(kuò)增。引物
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