標(biāo)準(zhǔn)解讀
《LY/T 1772-2008 楊樹品種分子鑒定實(shí)驗(yàn)方法 DNA擴(kuò)增片段長度多態(tài)性法(AFLP)》是一項(xiàng)針對楊樹品種進(jìn)行分子水平上鑒定的標(biāo)準(zhǔn)。該標(biāo)準(zhǔn)詳細(xì)規(guī)定了利用AFLP技術(shù)對不同楊樹品種進(jìn)行遺傳多樣性分析的具體步驟和要求,以達(dá)到準(zhǔn)確區(qū)分不同楊樹品種的目的。
AFLP(Amplified Fragment Length Polymorphism),即擴(kuò)增片段長度多態(tài)性,是一種基于PCR的DNA指紋技術(shù)。它結(jié)合了RFLP(限制性片段長度多態(tài)性)與RAPD(隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA)的優(yōu)點(diǎn),通過使用特定的限制性內(nèi)切酶切割基因組DNA,并將得到的片段連接到接頭序列上,隨后選擇性地?cái)U(kuò)增這些片段來揭示個(gè)體間的遺傳差異。
根據(jù)此標(biāo)準(zhǔn),整個(gè)實(shí)驗(yàn)流程主要包括以下幾個(gè)關(guān)鍵環(huán)節(jié):
- 樣品準(zhǔn)備:包括從新鮮或干燥的葉片中提取高質(zhì)量的總DNA。
- 酶切及接頭連接:采用兩種不同的限制性內(nèi)切酶同時(shí)消化樣品DNA,并立即與特制的人工合成接頭相連接。
- 預(yù)擴(kuò)增:利用帶有一個(gè)堿基選擇性的引物對連接產(chǎn)物進(jìn)行初步擴(kuò)增。
- 選擇性擴(kuò)增:在預(yù)擴(kuò)增的基礎(chǔ)上,使用具有更多選擇性堿基的引物進(jìn)一步放大目標(biāo)片段。
- 電泳分離與檢測:通過聚丙烯酰胺凝膠電泳或毛細(xì)管電泳等手段分離擴(kuò)增產(chǎn)物,并借助銀染或其他化學(xué)發(fā)光試劑顯色后觀察記錄。
- 數(shù)據(jù)分析:基于獲得的帶型圖譜,運(yùn)用適當(dāng)?shù)能浖ぞ哌M(jìn)行比對分析,從而識別出不同樣本之間的相似性和差異性。
該標(biāo)準(zhǔn)還特別強(qiáng)調(diào)了實(shí)驗(yàn)過程中需要注意的一些技術(shù)細(xì)節(jié),如如何保證酶切效率、提高接頭連接率以及優(yōu)化PCR反應(yīng)條件等,旨在確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性和重復(fù)性。此外,對于數(shù)據(jù)分析部分也給出了指導(dǎo)建議,幫助研究人員正確解讀AFLP譜帶信息,有效應(yīng)用于楊樹種質(zhì)資源的保護(hù)與利用研究當(dāng)中。
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- 廢止
- 已被廢除、停止使用,并不再更新
- 2008-09-03 頒布
- 2008-12-01 實(shí)施
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LY/T 1772-2008楊樹品種分子鑒定實(shí)驗(yàn)方法DNA擴(kuò)增片段長度多態(tài)性法(AFLP)-免費(fèi)下載試讀頁文檔簡介
犐犆犛65.020
犅61
中華人民共和國林業(yè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)
犔犢/犜1772—2008
楊樹品種分子鑒定實(shí)驗(yàn)方法
犇犖犃擴(kuò)增片段長度多態(tài)性法(犃犉犔犘)
犕狅犾犲犮狌犾犪狉犻犱犲狀狋犻犳犻犮犪狋犻狅狀犿犲狋犺狅犱犳狅狉狏犪狉犻犲狋犻犲狊狅犳狆狅狆犾犪狉—
犃犿狆犾犻犳犻犲犱犳狉犪犵犿犲狀狋犾犲狀犵狋犺狆狅犾狔犿狅狉狆犺犻狊犿(犃犉犔犘)
20080903發(fā)布20081201實(shí)施
國家林業(yè)局發(fā)布
書
犔犢/犜1772—2008
前言
本標(biāo)準(zhǔn)的附錄A為資料性附錄。
本標(biāo)準(zhǔn)由國家林業(yè)局提出。
本標(biāo)準(zhǔn)由全國林木種子標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會歸口。
本標(biāo)準(zhǔn)起草單位:中國林業(yè)科學(xué)研究院林業(yè)研究所、中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所和國家林
業(yè)局北方林木種子檢驗(yàn)中心。
本標(biāo)準(zhǔn)主要起草人:李金花、張綺紋、王斌、宋紅竹、周春江、盧孟柱、李慶梅、牛正田。
Ⅰ
書
犔犢/犜1772—2008
楊樹品種分子鑒定實(shí)驗(yàn)方法
犇犖犃擴(kuò)增片段長度多態(tài)性法(犃犉犔犘)
1范圍
本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了以楊樹新鮮組織(葉片、芽等)為材料,利用擴(kuò)增片段長度多態(tài)性DNA法(Amplified
FragmentLengthPolymorphism,簡稱AFLP)對楊樹品種進(jìn)行分子鑒定的實(shí)驗(yàn)方法。
本標(biāo)準(zhǔn)適用于楊樹品種的分子鑒定。
2原理
楊樹基因組DNA經(jīng)限制性內(nèi)切酶雙酶切后,形成分子量大小不等的隨機(jī)片段,將針對犈犮狅RI和
犕狊犲I的特定接頭連接在這些DNA片段的兩端,形成帶特異接頭的DNA片段,隨后利用一對與接頭和
鄰接酶切位點(diǎn)相匹配的引物進(jìn)行擴(kuò)增,最終通過變性聚丙烯酰胺凝膠電泳將這些特異性片段分離開來,
通過比較待測品種和對照品種間DNA指紋譜帶數(shù)據(jù)的差異,來判定待測品種與對照品種是否為相同
品種。
3儀器和設(shè)備
3.1通用實(shí)驗(yàn)室儀器設(shè)備。
3.2梯度PCR擴(kuò)增儀。
3.3瓊脂糖膠電泳系統(tǒng)。
3.4變性聚丙烯酰胺凝膠電泳系統(tǒng)。
3.5紫外透射儀。
3.6凝膠成像系統(tǒng)或照相系統(tǒng)。
3.7重蒸餾水儀。
4試劑與溶液
除非另有說明,在分析中使用分析純試劑。配制好的溶液經(jīng)高壓滅菌后使用。實(shí)驗(yàn)中所使用的水
均為無菌超純水。
4.1犇犖犃限制性內(nèi)切酶犈犮狅犚犐和犕狊犲犐(10犝/μ犔)及其10×反應(yīng)緩沖液
-20℃保存。
4.2犜犪狇犇犖犃聚合酶(1犝/μ犔)及其10×犘犆犚反應(yīng)緩沖液
10×PCR反應(yīng)緩沖液含200mmol/LTrisHCl(pH8.4)、15mmol/L氯化鎂(MgCl2)和
500mmol/L氯化鉀(KCl),-20℃保存。
4.3犜4犇犖犃連接酶(1犝/μ犔)及其10×連接反應(yīng)緩沖液
10×反應(yīng)緩沖液含350mmol/LTrisHCl(pH7.6)、50mmol/LMgCl2和500mmol/LKCl和
5mmol/Lβ巰基乙醇;-20℃保存。
4.4四種脫氧核糖核苷酸(犱犃犜犘,犱犆犜犘,犱犌犜犘,犱犜犜犘)混合溶液(各10犿犿狅
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