標準解讀
《LY/T 2347-2014 剛竹屬DNA擴增片段長度多態(tài)性(AFLP)分析方法》是一項針對剛竹屬植物的分子標記技術標準,旨在通過AFLP技術對不同種類或個體間的遺傳差異進行鑒定。該標準詳細規(guī)定了從樣品采集到數(shù)據(jù)分析的整個流程,確保實驗結果的準確性和可重復性。
首先,在樣品采集階段,標準明確了如何選擇和處理用于提取DNA的竹子材料。要求選取健康、無病蟲害的新鮮葉片作為樣本,并且在采集后盡快進行低溫保存以防止DNA降解。
接下來是DNA提取部分,提供了具體的步驟來獲得高質量的基因組DNA。這一步驟對于后續(xù)的酶切反應至關重要,因為只有純度高且完整的DNA才能保證酶切效果良好。
然后進入AFLP核心操作環(huán)節(jié)——限制性內切酶消化與接頭連接。通過使用特定的限制性內切酶切割DNA,形成具有粘性末端的小片段;隨后將特制的人工合成接頭連接到這些片段上,為下一步的選擇性擴增做準備。
選擇性擴增是指利用帶有選擇性堿基的引物對已連接接頭的DNA片段進行PCR擴增。這一過程能夠放大那些攜帶特定序列信息的目標片段,從而使得即使是非常細微的遺傳變異也能被檢測出來。
最后,擴增產物需要經過電泳分離,并采用銀染法或其他合適的方法顯色,以便于觀察和記錄。根據(jù)條帶的位置及數(shù)量差異,可以構建出各個樣品之間的親緣關系圖譜。
此標準還強調了實驗過程中需要注意的一些細節(jié)問題,比如嚴格控制反應條件(溫度、時間等),以及合理設置對照實驗以排除假陽性或假陰性的干擾。通過遵循這套標準化的操作流程,研究人員能夠更有效地利用AFLP技術開展剛竹屬植物分類學研究、種質資源評價等工作。
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....
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- 廢止
- 已被廢除、停止使用,并不再更新
- 2014-08-21 頒布
- 2014-12-01 實施
文檔簡介
ICS6502020
B65..
中華人民共和國林業(yè)行業(yè)標準
LY/T2347—2014
剛竹屬DNA擴增片段長度多態(tài)性AFLP
()
分析方法
MethodofDNAamlificationframentlentholmorhismAFLP
pggpyp()
forPhyllostachysbamboo
2014-08-21發(fā)布2014-12-01實施
國家林業(yè)局發(fā)布
LY/T2347—2014
前言
本標準按照給出的規(guī)則起草
GB/T1.1—2009。
本標準的附錄為規(guī)范性附錄
。
本標準由全國竹藤標準化技術委員會提出并歸口
(SAC/TC263)。
本標準起草單位國際竹藤中心北京林業(yè)大學中國林業(yè)科學研究院亞熱帶林業(yè)研究所
:、、。
本標準主要起草人李雪平高志民牟少華陳敏袁金玲
:、、、、。
Ⅰ
LY/T2347—2014
剛竹屬DNA擴增片段長度多態(tài)性AFLP
()
分析方法
1范圍
本標準規(guī)定了剛竹屬Phyllostachys竹種的提取酶切連接擴增實驗步驟及采用的儀器
()DNA、、、
設備
。
本標準適用于剛竹屬竹種多態(tài)性的分析
DNA。
2試劑
21所用化學試劑如沒有特殊說明均為分析純
.,。
22提取液細胞裂解液
.DNA:1mol/LTris-HClpH8.2、(1mol/LTris-HClpH7.5,0.25mol/LED-
氯化鈉與按混合在使用前加入亞硫酸鈉至終濃
TApH8.0,5mol/L,2%CTAB)5%SLS5∶5∶2,
度為
0.02mol/L。
23三氯甲烷異戊醇
.∶=24∶1。
24異丙醇
.。
25乙醇無水乙醇加蒸餾水定容到
.70%:70mL100mL。
26氯化鈉稱取氯化鈉用蒸餾水溶解后定容到
.5mol/L:29.22g,100mL。
27溴化乙錠稱取溴化乙錠用蒸餾水溶解后定容到
.0.5mg/mL:5mg,10mL。
28變性緩沖液去離子甲酰胺二甲苯青溴酚
.:50mL,EDTA(0.5mol/L,pH=8.0)1mL,FF0.125g,
藍
0.125g。
29硼酸定容到
.10×TBE:Tris108.0g,55.0g,0.5mol/LEDTA(pH8.0)40mL,1000mL。
210丙烯酰胺溶液甲叉雙丙烯酰胺丙烯酰胺混合加水定容到
.40%:2.0g,38.0g100mL。
211過硫酸胺溶液過硫酸胺加水定容到
.10%:1.0g10mL。
3儀器
31儀具有功能溫度精度
.PCR(touchdown,±0.2℃)。
32移液器
.。
33低溫離心機以上
.4℃(max14000r/min)。
34水浴鍋
.。
35電泳儀可滿足測序
.(DNA)。
36紫外分光光度計
.。
37分析天平
.。
38搖床
.。
4試驗步驟
41DNA提取
.
按照附錄的方法提取和檢測竹子基因組電泳檢測主帶完整
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