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文檔簡介
關于比較不錯卡方檢驗及SPSS分析第1頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四SPSS統(tǒng)計分析交叉表(Crosstabs)過程 (一)四格表(fourfolddata)資料的x2檢驗 (二)配對(paireddata)資料的x2檢驗 (三)R×C表資料的x2檢驗 (四)兩分類變量有無關聯(lián)分析及列聯(lián)系數(shù)C卡方(Chi-Square)過程 (五)擬合問題-比較樣本與已知總體的分布第2頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四第一節(jié)
四格表資料的檢驗
x2testoffourfolddata
第3頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四目的:推斷兩個總體率(構成比)是否有差別(和率的u檢驗等價)要求:兩樣本的兩分類個體數(shù)排列成四格表資料第4頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四
值計算
Pearson卡方值:自由度:一、檢驗的基本思想第5頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四
第6頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四
分布第7頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四實例分析例7-1
某院欲比較異梨醇口服液(試驗組)和氫氯噻嗪+地塞米松(對照組)降低顱內壓的療效。將200例顱內壓增高癥患者隨機分為兩組,結果見表7-1。問兩組降低顱內壓的總體有效率有無差別?表7-1兩組降低顱內壓有效率的比較
第8頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四
檢驗基本步驟
計算理論頻數(shù):計算統(tǒng)計量
建立檢驗假設
:兩總體陽性率相等
:兩總體陽性率不等H0
H1
第9頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四第10頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四
值的校正四格表檢驗的條件:
1)2)3)校正公式:
第11頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四SPSS操作過程①建立數(shù)據(jù)文件:chis01.sav
數(shù)據(jù)格式:包括4行3列的頻數(shù)格式,3個變量即行變量(group)、列變量(effect)和頻數(shù)變量(freq)。②說明頻數(shù)變量:數(shù)據(jù)加權個案
DataWeightCases③x2檢驗:從菜單選擇分析描述統(tǒng)計
交叉表
Analyze
DescriptiveStatisticsCrosstabs結合例7-1數(shù)據(jù)(chis01.sav)演示操作過程。第12頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四分類數(shù)據(jù)錄入格式頻數(shù)格式:用數(shù)據(jù)
加權個案(WeightCases)過程以指明反映頻數(shù)的變量。枚舉格式:第13頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四交叉表(Crosstabs)過程Crosstabs過程用于對分類資料和有序分類資料進行統(tǒng)計描述和統(tǒng)計推斷。該過程可以產生2維至n維列聯(lián)表,并計算相應的百分數(shù)指標。統(tǒng)計推斷包括了常用的x2檢驗、Kappa值,分層X2(X2M-H),以及四格表資料的確切概率(Fisher’sExactTest)值。第14頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四Crosstabs過程祥解界面說明-[行Rows框]用于選擇行×列表中的行變量。-[列Columns框]用于選擇行×列表中的列變量。-[層Layer框]指定分層變量,即控制變量。如果要指定不同的分層變量做分析,則將其選入Layer框,并用Previous和Next鈕設為不同層。-[Displayclusteredbarcharts復選框]:顯示復式條圖-[Suppresstable復選框]:不在輸出結果中給出行×列表。第15頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四Crosstabs過程祥解界面說明精確(Exact)子對話框:針對2×2以上的行×列表設計計算確切概率的方法。統(tǒng)計量(Statistics)子對話框:用于定義所需計算的統(tǒng)計量-Chi-square復選框:計算pearson卡方值,對四格表資料自動給出校正卡方檢驗和確切概率法結果。-Correlations復選框:計算行列變量的pearson相關系數(shù)和Spearman等級相關系數(shù)。第16頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四Crosstabs過程祥解界面說明-Kappa復選框:計算Kappa值,即內部一致性系數(shù),介于0~0.7071之間;-Risk復選框:計算比數(shù)比OR值、RR值;-McNemanr復選框:進行配對卡方檢驗的McNemanr檢驗(一種非參數(shù)檢驗)-Cochran’sandMantel-Haenszelstatistics復選框:計算X2M-H統(tǒng)計量、X2CMH,可在下方輸出H0假設的OR值,默認為1。第17頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四Crosstabs過程祥解界面說明單元格(Cells)子對話框:用于定義列聯(lián)表單元格中需要計算的指標。-Counts復選框:是否輸出實際觀察數(shù)(Observed)和理論頻數(shù)(Expected)-Percentages復選框:是否輸出行百分數(shù)(Row)、列百分數(shù)(Column)以及合計百分數(shù)(Total)-Residuals復選框:選擇殘差的顯示方式格式(Format)子對話框:用于選擇行變量是升序還是降序排列。第18頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四SPSS結果輸出第19頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四SPSS結果輸出(續(xù))結論:x2=12.857,df=1,雙側P<0.01,按照α=0.05檢驗水準,可認為兩組總體有效率差異顯著,即試驗組的療效優(yōu)于對照組。第20頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四結果中的其他檢驗方法連續(xù)性校正的卡方檢驗ContinuityCorrectionFisher’s確切概率法Fisher’sExactTest似然比卡方LikelihoodRatio線性相關性檢驗Linear-by-LinearAssociation:僅用于當兩變量均為等級變量的資料。注意檢查樣本例數(shù)n和理論頻數(shù)T是否滿足條件:N≥40且理論頻數(shù)T≥5。第21頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四第二節(jié)
配對四格表資料的檢驗
x2testofpairedfourfolddata
第22頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四
例7-3
某實驗室分別用乳膠凝集法和免疫熒光法對58名可疑系統(tǒng)紅斑狼瘡患者血清中抗核抗體進行測定,結果見表7-3。問兩種方法的檢測結果有無差別?實例分析第23頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四
表7-3兩種方法的檢測結果
第24頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四
上述配對設計實驗中,就每個對子而言,兩種處理的結果不外乎有四種可能:①兩種檢測方法皆為陽性數(shù)(a);②兩種檢測方法皆為陰性數(shù)(d);③免疫熒光法為陽性,乳膠凝集法為陰性數(shù)(b);④乳膠凝集法為陽性,免疫熒光法為陰性數(shù)(c)。第25頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四其中,a,d為兩法觀察結果一致的兩種情況,
b,c為兩法觀察結果不一致的兩種情況。檢驗統(tǒng)計量為第26頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四注意:
本法一般用于樣本含量不太大的資料。因為它僅考慮了兩法結果不一致的兩種情況(b,c),而未考慮樣本含量n和兩法結果一致的兩種情況(a,d)。所以,當n很大且a與d的數(shù)值很大(即兩法的一致率較高),b與c的數(shù)值相對較小時,即便是檢驗結果有統(tǒng)計學意義,其實際意義往往也不大。第27頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四檢驗步驟:第28頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四SPSS操作過程①建立數(shù)據(jù)文件:chis03.sav
數(shù)據(jù)格式:包括4行3列的頻數(shù)格式,三個變量分別為行變量、列變量和頻數(shù)變量。②說明頻數(shù)變量:數(shù)據(jù)加權個案
DataWeightCases③x2檢驗:從菜單選擇分析描述統(tǒng)計
交叉表
Analyze
DescriptiveStatisticsCrosstabs統(tǒng)計量Statistics:√McNemar√Kappa第29頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四一致性檢驗:計算Kappa系數(shù)Kappa系數(shù):為吻合度測量(measureofagreement)系數(shù),用以測量兩個觀測者或兩觀測設備之間的吻合程度,取值在-1至+1之間,取值越大,說明吻合程度越高。該系數(shù)利用了列聯(lián)表的全部信息,包括表格中的數(shù)據(jù)a和d。Kappa≥0.75一致性好
0.75>Kappa≥0.4一致性一般
Kappa<0.4一致性較差第30頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四SPSS結果輸出結論:配對x2檢驗的P<0.05,可以認為兩種方法的檢測結果差別顯著,免疫熒光法的總體陽性檢出率要高于乳膠凝集法;對兩種檢測方法的一致性檢驗Kappa=0.455,P<0.01,說明兩種方法的吻合度有統(tǒng)計學意義,但吻合度一般。第31頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四第四節(jié)
行×列表資料的檢驗
testofR×Ctable第32頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四行×列表資料①
多個樣本率比較時,有R行2列,稱為R×2表;②
兩個樣本的構成比比較時,有2行C列,稱2×C表;③
多個樣本的構成比比較,以及雙向無序分類資料關聯(lián)性檢驗時,稱為R×C表。第33頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四檢驗統(tǒng)計量第34頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四一、多個樣本率的比較第35頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四
例7-6
某醫(yī)師研究物理療法、藥物治療和外用膏藥三種療法治療周圍性面神經(jīng)麻痹的療效,資料見表7-8。問三種療法的有效率有無差別?表7-8三種療法有效率的比較第36頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四檢驗步驟:第37頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四SPSS操作過程(行×列表卡方檢驗)①建立數(shù)據(jù)文件:chis02.sav(例7-6數(shù)據(jù)) 數(shù)據(jù)格式:包括6行3列的頻數(shù)格式,3個變量分別為行變量、列變量和頻數(shù)變量。②說明頻數(shù)變量:數(shù)據(jù)加權個案
DataWeightCases③x2檢驗:從菜單選擇分析描述統(tǒng)計
交叉表
Analyze
DescriptiveStatisticsCrosstabs結合例7-6數(shù)據(jù)(chis02.sav)演示操作及界面。第38頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四SPSS結果輸出第39頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四SPSS結果輸出(續(xù))結論:按α=0.05檢驗水準拒絕H0,接受H1,可以認為三種療法治療周圍性面神經(jīng)麻痹的總體有效率有差別。
第40頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四二、樣本構成比的比較第41頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四
例7-7
某醫(yī)師在研究血管緊張素I轉化酶(ACE)基因I/D多態(tài)(分3型)與2型糖尿病腎病(DN)的關系時,將249例2型糖尿病患者按有無糖尿病腎病分為兩組,資料見表7-9。問兩組2型糖尿病患者的ACE基因型總體分布有無差別?表7-9DN組與無DN組2型糖尿病患者ACE基因型分布的比較第42頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四檢驗步驟第43頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四三、雙向無序分類資料的關聯(lián)性檢驗
表中兩個分類變量皆為無序分類變量的行列表資料,又稱為雙向無序表資料。注意:雙向無序分類資料為兩個或多個樣本,做差別檢驗(例7-7);若為單樣本,做關聯(lián)性檢驗(例7-8)。第44頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四例7-8
測得某地5801人的ABO血型和MN血型結果如表7-10,問兩種血型系統(tǒng)之間是否有關聯(lián)?
表7-10某地5801人的血型
(單樣本,做關聯(lián)性檢驗)第45頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四
表7-10資料,可用行×列表資料檢驗來推斷兩個分類變量之間有無關系(或關聯(lián));若有關系,可計算Pearson列聯(lián)系數(shù)C進一步分析關系的密切程度:
列聯(lián)系數(shù)C取值范圍在0~0.7071之間。0表示完全獨立;0.7071表示完全相關。第46頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四檢驗步驟第47頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四由于列聯(lián)系數(shù)C=0.1883,數(shù)值較小,故認為兩種血型系統(tǒng)間雖然有關聯(lián)性,但關系不太密切。第48頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四SPSS操作過程①建立數(shù)據(jù)文件:chis04.sav
數(shù)據(jù)格式:包括12行3列的頻數(shù)格式,三個變量分別為行變量、列變量和頻數(shù)變量。②說明頻數(shù)變量:數(shù)據(jù)加權個案
DataWeightCases③x2檢驗:從菜單選擇分析描述統(tǒng)計
交叉表
Analyze
DescriptiveStatisticsCrosstabs統(tǒng)計量Statistics:√Chi-square
名義√相依系數(shù)Contingencycoefficient第49頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四SPSS輸出結果第50頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四第51頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四1.行列表中的各格T≥1,并且1≤T<5的格子數(shù)不宜超過格子總數(shù)的1/5,否則可能產生偏性。處理方法有三種:
(1)增大樣本含量以達到增大理論頻數(shù)的目的(首選)。(2)根據(jù)專業(yè)知識,刪去理論頻數(shù)太小的行或列,或將理論頻數(shù)太小的行或列與性質相近的鄰行或鄰列合并。如:不同年齡組可以合并,但不同血型就不能合并。
(3)改用雙向無序R×C表的Fisher確切概率法。四、行×列表資料檢驗的注意事項第52頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四第53頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四第54頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四第五節(jié)
多個樣本率間的多重比較
Multiplecomparisonofsamplerates
第55頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四一、基本思想(卡方分割法)
因分析目的不同,k個樣本率兩兩比較的次數(shù)不同,故重新規(guī)定的檢驗水準的估計方法亦不同。通常有兩種情況:第56頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四
第57頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四第58頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四第59頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四
例7-9
對例7-6中表7-8的資料進行兩兩比較,以推斷是否任兩種療法治療周圍性面神經(jīng)麻痹的有效率均有差別?第60頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四檢驗步驟本例為3個實驗組間的兩兩比較
第61頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四表7-12三種療法有效率的兩兩比較
第62頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四第63頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四
例7-10
以例7-6表7-8資料中的藥物治療組為對照組,物理療法組與外用膏藥組為試驗組,試分析兩試驗組與對照組的總體有效率有無差別?
本例為各實驗組與同一對照組的比較第64頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四第65頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四第三節(jié)
四格表資料的Fisher確切概率法Fisherprobabilitiesinfourfolddata
第66頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四(一)適用條件①T<1或n<40②P≈
(二)基本思想(超幾何分布)
在四格表周邊合計不變的條件下,直接計算表內四個數(shù)據(jù)的各種組合之概率。找出的所有表格并將概率求和,若這些表的合計P<,則推翻H0假設。第67頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四(三)檢驗步驟假設H0、H1
2.計算最小理論頻數(shù)及值邊緣合計不變條件下,變動表中數(shù)據(jù)
3.找出邊緣合計中的最小值
對應的格子中的數(shù)據(jù)從0到,排出所有可能的四格表。5.選出值的所有表,分別求P值后相加。
第68頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四病人分型陽性數(shù)陰性數(shù)合計陽性率%活動型1(2.4)14(12.6)156.67穩(wěn)定型3(1.6)7(8.4)1030.00合計4212516.00表7兩型慢性布氏病的PHA皮試反應(四)應用(結合實例)第69頁,共77頁,2023年,2月20日,星期四表8確切概率法計算表(四格表周邊合計不變)
序號(i)陽性陰性P(i)00152.40.01664611141.4042833
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