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口腔粘膜細(xì)胞基因組DNA制備第1頁(yè)/共20頁(yè)基因組DNA的提取通常用于構(gòu)建基因組文庫(kù)、Southern雜交(包括RFLP)及PCR分離基因等。是一般的基因工程實(shí)驗(yàn)中DNA操作的最初步驟。
一、基因組DNA的提取與純化目的:第2頁(yè)/共20頁(yè)二、人基因組DNA的制備
實(shí)驗(yàn)?zāi)康募耙饬x:從人口腔上皮細(xì)胞中提取純的基因組DNA掌握基因組DNA抽提的方法,理解核酸分離純化的基本原理第3頁(yè)/共20頁(yè)分離純化基因組DNA的常用方法:不同生物(植物、動(dòng)物、微生物)的基因組DNA的提取方法有所不同,分離方法也有差異。主要根據(jù)不同細(xì)胞的特點(diǎn)而有區(qū)別,但原理相似,因此它們有共同的步驟:
裂解細(xì)胞:SDS裂解細(xì)胞,EDTA抑制核酸酶
除去蛋白質(zhì):蛋白酶K水解蛋白質(zhì),酚和氯仿/異戊醇抽提、分離蛋白質(zhì);析出DNA:乙醇沉淀使DNA從溶液中析出。第4頁(yè)/共20頁(yè)細(xì)胞樣品的核酸提取的主要步驟破碎細(xì)胞去除細(xì)胞內(nèi)的其它分子:蛋白質(zhì)多糖脂類去除鹽類、有機(jī)溶劑等雜質(zhì)第5頁(yè)/共20頁(yè)實(shí)驗(yàn)材料及試劑材料:人口腔上皮細(xì)胞試劑:抽提緩沖液:Tris-ClpH8.0,EDTA,NaCl,RNAase,SDS,蛋白酶K水飽和酚氯仿/異戊醇(V/V=24:1)70%乙醇、無(wú)水乙醇TE緩沖液:Tris,EDTA第6頁(yè)/共20頁(yè)主要試劑的功能抽提緩沖液:由SDS、EDTA、蛋白酶K組成SDS的作用是裂解細(xì)胞EDTA的作用是絡(luò)合掉鎂等二價(jià)金屬離子,防止DNA酶對(duì)DNA分子的降解作用。蛋白酶K的作用是水解蛋白質(zhì)。酚和氯仿/異戊醇:抽提分離蛋白質(zhì)乙醇:沉淀DNATE:溶解DNA第7頁(yè)/共20頁(yè)取材:用生理鹽水漱口后,口含生理鹽水10~15ml約2~3min,用15ml離心管(4000rpm
10min)收集細(xì)胞沉淀
(離心機(jī)的使用,平衡)
加入0.5ml抽提緩沖液,重懸沉淀,轉(zhuǎn)移至1.5mlEP管①
(微量移液器的正確使用)混勻,65℃溫育30min
加入等體積的【飽和酚(~0.25ml):氯仿/異戊醇(~0.25ml)】充分顛倒混勻(不要?jiǎng)×艺鹗帲。?shí)驗(yàn)步驟及注意事項(xiàng)(一人一份):
第8頁(yè)/共20頁(yè)12000rpm5min,上層水相轉(zhuǎn)移至新的EP管②
(高速離心機(jī)的使用與安全意識(shí))
加入等體積【氯仿/異戊醇】,顛倒混勻12000rpm5min,上層水相轉(zhuǎn)移到新的EP管③
加入2倍體積無(wú)水乙醇,顛倒混勻12000rpm10min
第9頁(yè)/共20頁(yè)棄上清,沉淀中加入300l70%乙醇
12000rpm2min
輕輕棄去上清,打開(kāi)EP蓋,室溫靜置5~10min
加入30-50l0.1×TE溶液,充分混勻后檢測(cè)結(jié)果
第10頁(yè)/共20頁(yè)核酸分離純化的原則:
保證核酸一級(jí)結(jié)構(gòu)完整排除其它分子的污染:細(xì)胞內(nèi):蛋白質(zhì)、脂類、糖、RNA等提取過(guò)程中:有機(jī)熔劑、金屬離子、外源DNA
第11頁(yè)/共20頁(yè)核酸提取注意事項(xiàng)減少化學(xué)因素對(duì)核酸的降解如過(guò)量酸堿減少物理因素對(duì)核酸的降解機(jī)械剪切力:強(qiáng)烈震蕩、滲透壓急劇改變、反復(fù)凍融高溫防止核酸的生物降解核酸酶的預(yù)防
第12頁(yè)/共20頁(yè)常見(jiàn)問(wèn)題:
1、提取的DNA不純?cè)??改進(jìn)的方法?2、提取的DNA成涂布狀原因?改進(jìn)的方法?3、沒(méi)有獲得足夠量的DNA改進(jìn)的方法?第13頁(yè)/共20頁(yè)分子醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng)微量移液器的正確使用離心機(jī)的正確使用上課紀(jì)律撰寫(xiě)實(shí)驗(yàn)報(bào)告的規(guī)范第14頁(yè)/共20頁(yè)實(shí)驗(yàn)結(jié)果及其分析定性分析:DNA瓊脂糖凝膠電泳HLA基因多態(tài)性分析PCR下次實(shí)驗(yàn)課進(jìn)行第15頁(yè)/共20頁(yè)預(yù)習(xí)電泳的原理基因診斷、分子診斷PCR的原理乙肝病毒臨床檢測(cè)方法HLA基因第16頁(yè)/共20頁(yè)實(shí)驗(yàn)報(bào)告格式實(shí)驗(yàn)?zāi)康暮蛻?yīng)用價(jià)值實(shí)驗(yàn)原理樣品與試劑實(shí)驗(yàn)基本流程和注意事項(xiàng)實(shí)驗(yàn)結(jié)果和討論總結(jié)或感想完成兩部分的作業(yè):課后作業(yè),實(shí)驗(yàn)報(bào)告第17頁(yè)/共20頁(yè)其它/science-educati
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