浙江大學(xué)生物化學(xué)甲實(shí)驗(yàn)實(shí)驗(yàn)9氨基移換反應(yīng)及其產(chǎn)物的鑒定2課件_第1頁(yè)
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蔗糖酶分離純化產(chǎn)物的SDS-PAGE檢測(cè)分析及蛋白質(zhì)相對(duì)分子質(zhì)量測(cè)定實(shí)驗(yàn)五一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康暮鸵?、學(xué)習(xí)SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)的基本原理和操作方法2、蔗糖酶分離純化產(chǎn)物的SDS-PAGE檢測(cè)分析3、學(xué)習(xí)測(cè)定蛋白質(zhì)相對(duì)分子質(zhì)量(Mr)的方法二、實(shí)驗(yàn)基本原理1、電泳是帶電顆粒在電場(chǎng)作用下,作定向運(yùn)動(dòng)即向著與其電荷相反的電極移動(dòng)的現(xiàn)象。2、電泳法分離、檢測(cè)蛋白質(zhì)混合樣品,主要是根據(jù)各蛋白質(zhì)組分的分子大小和形狀以及所帶凈電荷多少等因素所產(chǎn)生的電泳遷移率的差別。3、區(qū)帶電泳:是樣品物質(zhì)在一惰性支持物上進(jìn)行電泳,因電泳后,樣品不同組分形成帶狀區(qū)間,故稱區(qū)帶電泳。4、聚丙烯酰胺凝膠(polyacrylamidegel,簡(jiǎn)稱PAG)是由丙烯酰胺(Acr)和交聯(lián)試劑N,N’-甲叉雙丙烯酰胺(Bis)在有引發(fā)劑(如過(guò)硫酸銨或核黃素)和增速劑(如N,N,N’,N’-四甲基乙二胺,TEMED)的情況下聚合而成的。丙烯酰胺N,N’-甲叉雙丙烯酰胺

5、聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)是在恒定的、非解離的緩沖系統(tǒng)中來(lái)分離蛋白質(zhì),這主要是由蛋白質(zhì)樣品所帶的電荷和分子質(zhì)量的差異性進(jìn)行分離;在電泳過(guò)程中仍保持蛋白質(zhì)的天然構(gòu)象、亞基之間的相互作用及其生物活性。6、聚丙烯酰胺凝膠電泳可分為:⑴連續(xù)系統(tǒng)凝膠緩沖液的pH值及凝膠濃度不變。該電泳系統(tǒng)具有電荷效應(yīng)、分子篩效應(yīng);⑵不連續(xù)系統(tǒng)凝膠緩沖離子成分、pH值、凝膠濃度、電位梯度不連續(xù),由濃縮膠和分離膠組成。由于濃縮膠的堆積(濃縮)作用,可使樣品(即使是稀釋樣品)在濃縮膠和分離膠的界面上先濃縮成一窄帶,然后在一定濃度(或一定濃度梯度)的凝膠上進(jìn)行分離。該電泳系統(tǒng)具有濃縮效應(yīng)、電荷效應(yīng)、分子篩效應(yīng)。

7、SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS)以PAG為支持物的電泳,由于各種蛋白質(zhì)所帶靜電荷、分子量大小和形狀不同而有不同的遷移率。為消除靜電荷對(duì)遷移率的影響,在整個(gè)電泳體系中加入一定量的陰離子去污劑“十二烷基硫酸鈉(簡(jiǎn)稱SDS)”和“強(qiáng)還原劑(巰基乙醇)”后,蛋白質(zhì)樣品就會(huì)與SDS結(jié)合形成帶負(fù)電荷復(fù)合物,而SDS作為一種變性劑和助溶劑,它能破壞蛋白質(zhì)分子內(nèi)和分子間的非共價(jià)鍵,并結(jié)合到蛋白質(zhì)分子上,使分子去折疊,破壞蛋白質(zhì)分子內(nèi)的二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu),使蛋白質(zhì)變性而改變?cè)械目臻g構(gòu)象。另外,SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物在強(qiáng)還原劑(巰基乙醇)存在下,可打開蛋白質(zhì)分子內(nèi)或肽鏈間的二硫鍵,并能避免重新氧化,這樣分離出的譜帶即為蛋白質(zhì)亞基。蛋白質(zhì)亞基的電泳的遷移率主要取決于亞基的相對(duì)分子質(zhì)量大小,而電荷的因素可以忽略。

8、蛋白質(zhì)亞基相對(duì)分子質(zhì)量的測(cè)方法在聚丙烯酰胺凝膠系統(tǒng)中,加入一定量的SDS時(shí),蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物在水溶液中的形狀,近似于雪茄煙形的長(zhǎng)橢圓棒。不同蛋白質(zhì)的SDS復(fù)合物的短軸長(zhǎng)度都一樣,約為1.8nm,而長(zhǎng)軸則隨蛋白質(zhì)的分子量成正比變化。這樣的蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物在凝膠中的遷移率,不再受蛋白質(zhì)原有電荷和形狀的影響,而只主要取決于它的橢圓棒的長(zhǎng)度即蛋白質(zhì)的相對(duì)分子質(zhì)量的大小,而其他因素對(duì)電泳遷移率的影響幾乎可以忽略不計(jì)。由于蛋白質(zhì)的相對(duì)分子質(zhì)量不同,所形成復(fù)合物的相對(duì)分子質(zhì)量不同,在電泳中反映出不同的遷移率。當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)或亞基的相對(duì)分子質(zhì)量在15,000~200,000之間時(shí),電泳遷移率與相對(duì)分子質(zhì)量的對(duì)數(shù)呈直線關(guān)系,符合下列方程式:lgMr=K-bRf式中Mr代表相對(duì)分子質(zhì)量,K代表常數(shù),b代表斜率,Rf代表遷移率。若將已知分子量的標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)的遷移率對(duì)分子量的對(duì)數(shù)作圖,可獲得一條標(biāo)準(zhǔn)曲線。未知蛋白質(zhì)在相同條件下進(jìn)行電泳,根據(jù)它的電泳遷移率即可在標(biāo)準(zhǔn)曲線上求得蛋白質(zhì)相對(duì)分子質(zhì)量。(8)蛋白質(zhì)樣品溶解液(2×蛋白質(zhì)樣品溶解液):內(nèi)含1%SDS,1%巰基乙醇,40%蔗糖或20%甘油,0.02%溴酚藍(lán),0.01mol/LTris-HClpH8.0緩沖液。(9)染色液:0.25g考馬斯亮藍(lán)R-250,加90.8ml50%甲醇,加9.2ml乙酸,溶解混勻后使用。(10)脫色液:75ml乙酸,50ml甲醇,加蒸餾水875ml,混勻使用。(11)蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)溶液:①β-半乳糖苷酶(MW116,000),②牛血清白蛋白(MW66,200),③卵清蛋白(MW45,000),④乳酸脫氫酶(MW35,000),⑤限制性內(nèi)切酶Bsp981(MW25,000),⑥β-乳球蛋白(MW18,400),⑦雞蛋清溶菌酶(MW14,400)。四、實(shí)驗(yàn)器材1、電泳儀、垂直電泳槽及配件(長(zhǎng)短玻璃板各1塊、封膠條2條、梳子1個(gè))

;2、微量移液器:10μl、20μl、200μl、1000μl;3、燒杯、長(zhǎng)滴管;4、微量注射器50μl;5、恒溫水浴100℃;6、高速臺(tái)式離心機(jī);7、離心管(1.5ml、0.5ml)及離心管架;8、¢15cm培養(yǎng)皿(染色、脫色用);9、搖床(染色、脫色用)。五、操作步驟1、準(zhǔn)備電泳裝置:電泳槽、電泳儀。2、配膠及凝膠的制備(1)配制凝膠:

不連續(xù)體系SDS-聚丙烯酰胺凝膠配制注:1、為去除抑制膠聚合的氧,加入AP前可進(jìn)行抽氣處理;2、過(guò)硫酸銨和TEMED的量應(yīng)根據(jù)室溫或聚合情況而定;12%分離膠所需試劑量(ml)5%濃縮膠所需試劑量(ml)30.8%凝膠貯液30.853mol/LTris-HCLpH8.9分離膠緩沖液0.950.5mol/LTris-HCLpH6.7濃縮膠緩沖液0.6310%SDS0.0750.05TEMED0.0050.005蒸餾水3.423.4510%Ap0.050.025總體積(ml)7.553、樣品處理與加樣⑴樣品制備取蔗糖酶樣品(樣品Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ)各50ul(樣品濃度約2~5mg/ml)

,分別放入1.5ml離心管中,10000r/min離心3min,收集上清為樣品溶液。⑵樣品處理將樣品溶液分別按等體積加入“2×蛋白質(zhì)樣品溶解液”,100℃保溫3分鐘,取出冷卻后,10000r/min離心1min,取上清直接加樣。⑶加樣用微量注射器向樣品槽內(nèi)注入10~20μl樣品混合液(每孔蛋白質(zhì)上樣量在20~40μg)

。如樣品濃度較低,可適當(dāng)增加上樣量。

蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)溶液加10μl/孔。

4、電泳在電泳槽中加入電泳緩沖液,上槽(加樣孔端)接負(fù)極、下槽接正極,接電泳儀電源,電流控制在2~3mA/樣品孔,一般樣品進(jìn)濃縮膠前,電流控制在10~20mA,待樣品進(jìn)分離膠后,將電流調(diào)到20~30mA,保持電流強(qiáng)度不變(恒流),待指示染料遷移至下沿約0.5~1cm處停止電泳。5、剝膠、固定和染色電泳結(jié)束后,取下凝膠模,用專用鏟子撬開短玻璃板,將凝膠一角切下做一加樣標(biāo)記,將凝膠板放在¢15cm培養(yǎng)皿內(nèi),加入染色液,固定、染色30min左右,6、脫色棄去染色液,加入蒸餾水漂洗數(shù)次,再用脫色液脫色,直至蛋白質(zhì)區(qū)帶清晰為止。六、實(shí)驗(yàn)結(jié)果1、計(jì)算蛋白質(zhì)樣品相對(duì)分子質(zhì)量將¢15cm培養(yǎng)皿放在一張坐標(biāo)紙上,量出加樣端距溴酚藍(lán)區(qū)帶中心間的距離(cm)以及各蛋白質(zhì)樣品區(qū)帶中心與加樣端(凝膠頂端)的距離(cm),按下式計(jì)算相對(duì)遷移率Rf蛋白樣品距加樣端距離(cm)相對(duì)遷移率Rf=溴酚藍(lán)區(qū)帶中心距加樣端距離(cm)列出電泳后各種蛋白質(zhì)的遷移率和分子量。以標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)的相對(duì)遷移率為橫坐標(biāo),標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)分子質(zhì)量lgM為縱坐標(biāo)在半對(duì)數(shù)坐標(biāo)紙上作圖,可得到一條標(biāo)準(zhǔn)曲線。根據(jù)蛋白質(zhì)樣品的相對(duì)遷移率可直接在標(biāo)準(zhǔn)曲線上查出其相對(duì)分子質(zhì)量。蛋白質(zhì)樣品相對(duì)分子質(zhì)量(Mr)=

3、作標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)相對(duì)分子量的對(duì)數(shù)與電泳相對(duì)遷移

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