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染色體識(shí)別和計(jì)數(shù)第一頁,共十五頁,編輯于2023年,星期三小組成員趙歡何曉璇盧禹先王崇林胡威第二頁,共十五頁,編輯于2023年,星期三染色體識(shí)別和計(jì)數(shù)算法的設(shè)計(jì)1.圖像預(yù)處理——直方圖均衡化2.去噪處理3.圖像腐蝕4.圖像二值化5.粘連染色體處理6。染色體標(biāo)記7.染色體數(shù)統(tǒng)計(jì)第三頁,共十五頁,編輯于2023年,星期三圖像預(yù)處理均衡化后和均衡化前圖像對(duì)比直方圖均衡化templates,NewContentdesign,10welcometousethesepowerpointyearsexperience
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第四頁,共十五頁,編輯于2023年,星期三由于圖像中混入的噪聲并不能在前面的處理過程中被全部消除,剩余的噪聲也被賦予了標(biāo)號(hào)值,這就造成了統(tǒng)計(jì)結(jié)果的錯(cuò)誤,因此在對(duì)圖像標(biāo)號(hào)完畢后還要將被標(biāo)號(hào)的噪聲刪除掉。標(biāo)號(hào)對(duì)象的面積即該標(biāo)號(hào)對(duì)象所占的像素?cái)?shù),將標(biāo)號(hào)對(duì)象的面積與圖像中所有對(duì)象的平均面積進(jìn)行比較,以比較結(jié)果作為條件來刪除被標(biāo)號(hào)的噪聲對(duì)象去噪處理第五頁,共十五頁,編輯于2023年,星期三步驟(1)計(jì)算每個(gè)標(biāo)號(hào)對(duì)象的面積,然后計(jì)算所有對(duì)象的平均面積。(2)對(duì)每個(gè)對(duì)象做如下判斷:該對(duì)象的面積是否大于平均面積的6倍?若滿足以上條件,則可以認(rèn)為該對(duì)象為大噪聲,將該對(duì)象刪除。然后對(duì)下一個(gè)對(duì)象進(jìn)行判斷,至處理完所有對(duì)象為止。(3)重新計(jì)算所剩對(duì)象的平均面積,轉(zhuǎn)到(2)進(jìn)行處理,直到?jīng)]有對(duì)象被刪除。(4)重新計(jì)算所剩對(duì)象的平均面積。(5)對(duì)每個(gè)所剩的對(duì)象做如下判斷:該對(duì)象的面積是否小于平均面積的1/10?若是,則可以認(rèn)為該對(duì)象為小噪聲,將該對(duì)象刪除。然后對(duì)下一個(gè)對(duì)象進(jìn)行判斷,至處理完所有對(duì)象為止。(6)重新計(jì)算所剩對(duì)象的平均面積,轉(zhuǎn)到(5)進(jìn)行處理,直到?jīng)]有對(duì)象被刪除。(7)此時(shí)圖像中的噪聲已被刪除完畢,根據(jù)處理結(jié)果將標(biāo)號(hào)值進(jìn)行相應(yīng)修改。texttexttexttexttext第六頁,共十五頁,編輯于2023年,星期三去噪前后圖像對(duì)比第七頁,共十五頁,編輯于2023年,星期三腐蝕屬于數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)的處理技術(shù),它和膨脹不是互為逆運(yùn)算,灰度圖像腐蝕處理可得到兩種結(jié)果:(1)如果所有的結(jié)構(gòu)元素都為正,則輸出圖像將趨向比輸入圖像暗(2)在比結(jié)構(gòu)元素還小的區(qū)域中的明亮細(xì)節(jié)經(jīng)腐蝕處理以后其效果將減弱1.刪除邊界某些像素,使粘連性不大的染色體分開圖像的腐蝕第八頁,共十五頁,編輯于2023年,星期三腐蝕處理后的圖像對(duì)比第九頁,共十五頁,編輯于2023年,星期三1二值圖像是指圖像上的所有點(diǎn)的灰度值只有兩種可能,不為“0”就為“255”,也就是整個(gè)圖像呈現(xiàn)出明顯的黑白效果。2對(duì)圖像二值化一般采用閾值分割技術(shù),所有灰度大于或等于閾值的像素被判決為屬于物體,灰度值用“255”表示,否則這些像素點(diǎn)被排除在物體區(qū)域以外,灰度值為“0”,表示背景welcometousethesepowerpointtemplates,NewContentdesign,10yearsexperience圖像二值化第十頁,共十五頁,編輯于2023年,星期三粘連染色體的處理一個(gè)對(duì)象的面積與平均面積的比值基本反映了該對(duì)象中的染色體數(shù)目。大多數(shù)染色體的面積與平均面積相差無幾;而當(dāng)一個(gè)對(duì)象的面積大于平均面積的2倍時(shí),該對(duì)象中通常會(huì)含有粘連的染色體。
具體步驟如下第十一頁,共十五頁,編輯于2023年,星期三步驟3421YourText對(duì)象的面積是否大于平均面積的2倍。若滿足該條件,則認(rèn)為該對(duì)象中含有粘連染色體
YourText對(duì)每個(gè)含有粘連染色體的對(duì)象,運(yùn)用上述計(jì)算原理進(jìn)行計(jì)算,并對(duì)存儲(chǔ)的標(biāo)號(hào)結(jié)果進(jìn)行修正。
YourText得到的最終修正結(jié)果即為整個(gè)圖像中的染色體數(shù)目
our計(jì)算每個(gè)對(duì)象的面積,并計(jì)算所有對(duì)象的平均面積第十二頁,共十五頁,編輯于2023年,星期三染色體標(biāo)記對(duì)染色體的自動(dòng)計(jì)數(shù),其實(shí)就是對(duì)圖像中對(duì)象的統(tǒng)計(jì),因此采用標(biāo)號(hào)法來對(duì)圖像中的對(duì)象進(jìn)行標(biāo)注標(biāo)記后的圖如下:第十三頁,共十五頁,編輯于2023年,星期三結(jié)果分析經(jīng)過大量的實(shí)驗(yàn),該方法能夠?qū)φ尺B、重疊以及噪聲嚴(yán)重的染色體圖像進(jìn)行很準(zhǔn)確的染色體計(jì)數(shù),但是其中也存在一些誤差,經(jīng)分析誤差主要來自于以下幾方面:(1)若圖像中的一條或幾條染色體與較大的噪聲粘連在一起,在進(jìn)行噪聲對(duì)象刪除處理時(shí),會(huì)將這些染色體作為噪聲一并刪除,造成了統(tǒng)計(jì)結(jié)果小于實(shí)際數(shù)目(2)若幾條較小的染色體粘連在一起,由于這些染色體所占面積都比較小,在對(duì)粘連染色體對(duì)象進(jìn)行腐蝕運(yùn)算時(shí),可能會(huì)將其中的一條或幾條染色體腐蝕掉。
(3)若幾
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