質(zhì)粒DNA及λDNA的酶切、連接、轉(zhuǎn)化及重組子的篩選鑒定_第1頁(yè)
質(zhì)粒DNA及λDNA的酶切、連接、轉(zhuǎn)化及重組子的篩選鑒定_第2頁(yè)
質(zhì)粒DNA及λDNA的酶切、連接、轉(zhuǎn)化及重組子的篩選鑒定_第3頁(yè)
質(zhì)粒DNA及λDNA的酶切、連接、轉(zhuǎn)化及重組子的篩選鑒定_第4頁(yè)
質(zhì)粒DNA及λDNA的酶切、連接、轉(zhuǎn)化及重組子的篩選鑒定_第5頁(yè)
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質(zhì)粒DNA及入DNA的酶切、連接、轉(zhuǎn)化及重組子的篩選鑒定一、【實(shí)驗(yàn)?zāi)康摹?、 學(xué)習(xí)在實(shí)現(xiàn)DNA的體外重組過(guò)程中,如何正確選擇合適的載體和限制性核酸內(nèi)切酶,并利用限制性核酸內(nèi)切酶對(duì)載體和目的DNA進(jìn)行切割;2、 學(xué)會(huì)設(shè)計(jì)構(gòu)建重組DNA的基本方法并掌握載體和目的DNA酶切的操作技術(shù);3、 學(xué)習(xí)利用T4-DNA連接酶連接載體片段和目的DNA片段,構(gòu)建體外重組DNA;4、 掌握利用CaCl2制備感受態(tài)細(xì)胞的原理與方法和熱擊法轉(zhuǎn)化的原理和方法;5、 學(xué)習(xí)并掌握使用紅白菌落法篩選獲得重組子以及邁補(bǔ)篩選法的原理及方法;6、 學(xué)習(xí)并掌握使用試劑盒抽提質(zhì)粒的方法及進(jìn)一步確定重組質(zhì)粒中含有外源目的DNA片段。二、【實(shí)驗(yàn)原理】本階段實(shí)驗(yàn)采用單酶切法,用限制性核酸內(nèi)切酶HindIII將上階段實(shí)驗(yàn)中提取并用瓊脂糖凝膠電泳驗(yàn)證了的大腸桿菌質(zhì)粒DNApUC19和買來(lái)的入DNA同時(shí)酶切,然后用DNA連接酶將上述酶切的質(zhì)粒pUC19和入DNA在有Mg2+、ATP存在的連接緩沖系統(tǒng)中連接起來(lái),得到重組質(zhì)粒。之后再將重組質(zhì)粒導(dǎo)入到用CaCl2處理的大腸桿菌DH5a感受態(tài)細(xì)胞中,經(jīng)培養(yǎng)后,再將這些大腸桿菌涂布在麥康凱培養(yǎng)基中,通過(guò)a互補(bǔ)篩選法,根據(jù)菌洛顏色篩選出重組子,并將其劃線接種于加入氨芐青霉素的麥康凱培養(yǎng)基中進(jìn)行驗(yàn)證,最后大量培養(yǎng),并用試劑盒提取重組DNA,并進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。1、限制性核酸內(nèi)切酶限制性核酸內(nèi)切酶是一類能夠識(shí)別雙鏈DNA分子中的某種特定核苷酸序列,并由此切割DNA雙鏈結(jié)構(gòu)的酶。主要是從原核生物中分離純化出來(lái)的。根據(jù)1994年美國(guó)出版的《分子生物學(xué)百科全書》的統(tǒng)計(jì)數(shù)字,僅II型核酸內(nèi)切限制酶一項(xiàng)就已從各種不同的微生物當(dāng)中,分離出了2300種以上、可識(shí)別230種不同的DNA序列。在核酸內(nèi)切限制酶的作用下,侵入細(xì)菌的“外源”DNA分子便會(huì)被切割成不同大小的片段,而細(xì)菌自己固有的DNA由于修飾酶(通常是一種甲基化酶)的保護(hù)作用,則可免受限制酶的降解。目前已經(jīng)鑒定出3種不同類型的核酸內(nèi)切限制酶,即I型酶、II型酶和III型酶。II型核酸內(nèi)切限制酶具有3個(gè)基本的特性:①在DNA分子雙鏈的特異性識(shí)別序列部位切割DNA分子,產(chǎn)生鏈的斷裂;②2個(gè)單鏈斷裂部位在DNA分子上的分布通常不是彼此直接相對(duì)的;③斷裂結(jié)果形成的DNA片段往往具有互補(bǔ)的單鏈延伸末端。限制性內(nèi)切酶的切割方式:根據(jù)切割位點(diǎn)相對(duì)于對(duì)稱軸的位置而言有三種,在對(duì)稱軸5'側(cè)切割產(chǎn)生5'粘端,在對(duì)稱軸的3'側(cè)切割產(chǎn)生3'粘端,在對(duì)稱軸處切割產(chǎn)生平端。核酸內(nèi)切限制酶對(duì)DNA底物的酶解作用是否完全,直接關(guān)系到連接反應(yīng)、重組體分子的篩選和鑒定等實(shí)驗(yàn)結(jié)果。核酸內(nèi)切限制酶活性的充分發(fā)揮受到以下幾個(gè)因索的影響:1)DNA樣品的純度,2)DNA的甲基化程度,3)酶切消化反應(yīng)的溫度,4)DNA的分子結(jié)構(gòu),5)核酸內(nèi)切限制酶的緩沖液。內(nèi)切酶的星號(hào)活性:內(nèi)切酶通常有嚴(yán)格的識(shí)別特異性,能精確地識(shí)別Dna排列順序。但在某些反應(yīng)條件下,識(shí)別順序的特異性可能發(fā)生變化。結(jié)果一種內(nèi)切酶酶切同一種DNA片段會(huì)產(chǎn)生新的酶切位點(diǎn),得到不同的酶切片段,這就是內(nèi)切酶的星號(hào)活性。最常見的例子是EcoRI,—般條件下它識(shí)別GAATTC六個(gè)核苷酸順序,而EcoR1(表現(xiàn)有星號(hào)活性),僅能識(shí)別AATT四個(gè)核苷酸的順序。在這種條件下的酶解反應(yīng),電泳后出現(xiàn)的DNA條帶數(shù)可能增多。促使內(nèi)切酶產(chǎn)生星號(hào)活性的因素有多種,主要由如下一些因素引起:(1)甘油濃度過(guò)高。這是引起星號(hào)反應(yīng)的常見原因。(2)離子強(qiáng)度不合適。鹽濃度降低也可能引起星號(hào)反應(yīng)。(3)陽(yáng)離子變化。若將Mg2+改為Mn2+可能促使EcoRI和HindIII產(chǎn)生星號(hào)活性。(4)溶液中pH變化。如用EcoRI酶切時(shí),反應(yīng)溶液的pH值由7.5升高到8.5時(shí)也會(huì)出現(xiàn)星號(hào)反應(yīng)。(5)有機(jī)溶劑殘留的影響。2、酶切方法體外構(gòu)建重組DNA分子,首先要了解目的基因的酶切圖譜,選用的限制性核酸內(nèi)切酶都不能在目的基因內(nèi)部有專一的識(shí)別位點(diǎn),即當(dāng)用一種或者兩種限制性核酸內(nèi)切酶切割外源供體DNA時(shí),能夠得到完整的目的基因。其次,選擇具有相應(yīng)的單一酶切位點(diǎn)的質(zhì)粒、噬菌體等載體分子再為克隆的載體。常用的酶切方法有雙酶切法和單酶切法兩種。3、DNA連接酶1967年,世界上有幾個(gè)實(shí)驗(yàn)室?guī)缀跬瑫r(shí)發(fā)現(xiàn)了一種能夠催化2條DNA分子之間形成磷酸二酯鍵的酶,即DNA連接酶(ligase)。這種酶能夠參與DNA裂口的修復(fù),在一定條件下還能連接DNA分子的自由末端。連接的功能是通過(guò)合成相鄰核苷酸之間的磷酸二酯鍵,從而修復(fù)缺口(nick)或單鏈的裂口(gap)。DNA連接酶能催化雙鏈DNA片段緊靠在一起的3'羥基末端與5'磷酸基團(tuán)末端之間形成磷酸二酯鍵,使兩末端連接。目前用于連接DNA片段的DNA連接酶有E.coliDNA連接酶和T4DNA連接酶。DNA連接酶只能催化雙鏈DNA片段互補(bǔ)黏性末端之間的連接,不能催化雙鏈DNA片段平末端之間的連接。T4DNA連接酶既可用于雙鏈DNA片段互補(bǔ)黏性末端之間的連接,也能催化雙鏈DNA片段平末端之間的連接,但平末端之間連接的效率比較低。DNA連接酶同核酸內(nèi)切限制酶一樣,都是在體外構(gòu)建重組DNA分子所必不可少的基本工具酶。核酸內(nèi)切限制酶可以將DNA分子切割成不同大小的片段,然而要將不同來(lái)源的DNA片段組成新的雜種DNA分子,還必須將它們彼此連接起來(lái)。目前有3種體外連接DNA片段的方法:①用DNA連接酶連接具有互補(bǔ)黏性末端的DNA片段;②用T4DNA連接酶直接將平末端的DNA片段連接起來(lái),或是用末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶給具平末端的DNA片段加上poly(dA)-poly(dT)尾之后,再用DNA連接酶連接起來(lái);③先在DNA片段末端加上化學(xué)合成的銜接物或接頭,使之形成黏性末端,再用DNA連接酶連接起來(lái)。這3種方法雖然互有差異,但共同的一點(diǎn)都是利用DNA連接酶所具有的連接和封閉單鏈DNA的功能。4、連接反應(yīng)外源DNA片段與載體分子連接的方法,即DNA分子體外重組技術(shù),主要依賴于核酸內(nèi)切限制酶和DNA連接酶催化完成的。DNA連接酶催化兩雙鏈DNA片段相鄰的5'-磷酸和3'-羥基間形成磷酸二酯鍵。在分子克隆中最有用的DNA連接酶是來(lái)自T4噬菌體的DNA連接酶:T4-DNA連接酶,該酶需要ATP作為輔助因子。5、感受態(tài)細(xì)胞的制備及質(zhì)粒轉(zhuǎn)化構(gòu)建好的重組DNA轉(zhuǎn)入感受態(tài)細(xì)胞中進(jìn)行表達(dá)的現(xiàn)象就是轉(zhuǎn)化。能進(jìn)行轉(zhuǎn)化的受體細(xì)胞必須是感受態(tài)細(xì)胞,即受體細(xì)胞最容易接受外源DNA片段實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)化的生理狀態(tài),它決定于受體菌的遺傳特性,同時(shí)與菌齡、外界環(huán)境等因素有關(guān)。人工轉(zhuǎn)化是通過(guò)人為誘導(dǎo)的方法使細(xì)胞具有攝取DNA的能力,或人為地將DNA導(dǎo)入細(xì)胞內(nèi),該過(guò)程與細(xì)菌自身的遺傳控制無(wú)關(guān),常用熱擊法,電穿孔法等。能否實(shí)現(xiàn)質(zhì)粒DNA的轉(zhuǎn)化還與受體細(xì)胞的遺傳特性有關(guān),所用的受體細(xì)胞一般是限制修飾系統(tǒng)的缺陷變異株,即不含限制性內(nèi)切酶和甲基化酶的突變株。目前常用的感受態(tài)細(xì)胞制備方法有CaCl2法,制備好的感受態(tài)細(xì)胞可以加入終濃度為15%的無(wú)菌甘油,-70°C可保存半年至一年。經(jīng)過(guò)CaCl2處理的細(xì)胞細(xì)胞膜通透性增加,允許外源DNA分子進(jìn)入。在低溫下,將攜帶有外源DNA片段的載體與感受態(tài)細(xì)胞混合,經(jīng)過(guò)熱擊或電穿孔技術(shù),使載體分子進(jìn)入細(xì)胞。進(jìn)入受體細(xì)胞的外源DNA分子通過(guò)復(fù)制、表達(dá),使受體細(xì)胞出現(xiàn)新的遺傳性狀。將這些轉(zhuǎn)化后的細(xì)胞在選擇性培養(yǎng)基上培養(yǎng),即可篩選出重組子。本實(shí)驗(yàn)以E.coliDH5a菌株為受體細(xì)胞,用CaCl2處理,使其處于感受態(tài),然后將重組后的PUC19質(zhì)粒在42C下熱擊90s,實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)化。6、重組子的篩選鑒定重組DNA轉(zhuǎn)化到宿主細(xì)胞后,并非所有的受體細(xì)胞都能被導(dǎo)入重組DNA分子,一般僅有少數(shù)重組DNA分子能進(jìn)入受體細(xì)胞,同時(shí)也只有極少數(shù)的受體細(xì)胞在吸納重組DNA分子之后能良好增殖。并且它們是與其他大量未被轉(zhuǎn)化的受體菌細(xì)胞混雜在一起。再者,在這些被轉(zhuǎn)化的受體細(xì)胞中,除部分含有我們所期待的重組DNA分子外,另外一些還可能是由于載體自身或一個(gè)載體與多個(gè)外源DNA片段形成非期待重組DNA分子導(dǎo)入所致。因此必須使用各種篩選及鑒定手段區(qū)分轉(zhuǎn)化子與非轉(zhuǎn)化子,并從轉(zhuǎn)化的細(xì)胞群體中分離出帶有目的基因的重組子。本實(shí)驗(yàn)中采用的方法是平板篩選法和電泳檢測(cè)??顾幮院Y選主要用于重組質(zhì)粒DNA分子的轉(zhuǎn)化子的篩選,而不含重組質(zhì)粒DNA分子的受體菌則不能存活,質(zhì)粒pUC19攜帶有氨芐青霉素抗性基因,在含有氨芐青霉素平板上篩選轉(zhuǎn)化子。沒(méi)有導(dǎo)入質(zhì)粒PUC19的受體細(xì)胞,在含有氨芐青

霉素的平板上不生長(zhǎng)。a互補(bǔ)篩選法根據(jù)菌落顏色篩選含有重組質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化子,利用B-半乳糖苷酶篩選系統(tǒng)來(lái)選擇。載體上帶有一個(gè)來(lái)自大腸桿菌的lac操縱子的DNA區(qū)段,這一區(qū)段編碼B-半乳糖苷酶氨基端的一個(gè)蛋白片段°IPTG(異丙基-B-D-硫代半乳糖苷)可以誘導(dǎo)該片段的合成,而該片段能與宿主細(xì)胞所編碼的B-半乳糖苷酶羧基端的一個(gè)蛋白片段互補(bǔ)(a互補(bǔ))。故暴露于誘導(dǎo)物IPTG的細(xì)菌含有編碼lacZ基因的質(zhì)粒可同時(shí)合成該酶的兩種片段,該菌在麥康凱培養(yǎng)基上利用乳糖產(chǎn)酸生成紅色菌落。將多克隆位點(diǎn)克隆入B-半乳糖苷酶氨基端的基因中,外源DNA插人質(zhì)粒的多克隆位點(diǎn)后可使B-半乳糖苷酶氨基端片段滅活,從而破壞了a互補(bǔ)作用。帶有重組質(zhì)粒的細(xì)菌將產(chǎn)生白色菌落。利用這種篩選方法可方便地將含目的基因的重組子篩選出來(lái)。挑選在氨芐青霉素培養(yǎng)基上生長(zhǎng)的白色菌落,通過(guò)擴(kuò)增培養(yǎng)。因?yàn)樵S多菌落存在假陽(yáng)性情況,在氨芐青霉素培養(yǎng)基上的白色菌落可能是導(dǎo)入的重組載體DNA菌落,也可能是載體自連后發(fā)生突變的菌落,所以還要鑒定轉(zhuǎn)化子中重組質(zhì)粒DNA分子的大小,可將重組的載體DNA提取出來(lái),進(jìn)行后續(xù)的酶切、電泳檢驗(yàn)。如下圖為質(zhì)粒pUC19酶切圖譜:2686怕kby質(zhì)粒pUC19的酶切圖譜分析2686怕kby質(zhì)粒pUC19的酶切圖譜分析pucw^il(2.686kb)Hindi£cgRIKpntBa/nHlAccWPsflHtndill■■■■1■SadXma\XoalOspMISphlSmal*Polylinkef三、【實(shí)驗(yàn)材料及儀器】菌株:E.coliDH5a培養(yǎng)基:LB培養(yǎng)基、麥康凱培養(yǎng)基(加入氨芐青霉素)試劑材料:酶切反應(yīng):(DNAPUC19質(zhì)粒,酶切l(wèi)Oxbuffer,HindIII,重蒸水,久DNA。)連接反應(yīng):(酶切后的DNAPUC19質(zhì)粒和久DNA,連接lOxbuffer,T4連接酶,重蒸水。)感受態(tài)細(xì)胞的制備:(0』Caj)轉(zhuǎn)化:(連接液和感受態(tài)細(xì)胞,0.1MCaCl2,冰塊。重組菌的挑選、檢驗(yàn):試劑盒(含有RnaseA的溶液I,溶液II,溶液III,HBbuffer,DNAwashingbuffer,elutionbuffer),酶切后的DNAPUC19質(zhì)粒,試劑盒抽提的DNA,酶切l(wèi)Oxbuffer,HindIII,重蒸水,瓊脂糖,TAE緩沖液。上樣緩沖液,EB染液。4.儀器器材:20、200、lOOOul的槍和槍尖,1.5ml的Ep管,恒溫培養(yǎng)箱,水浴鍋,平板,三角瓶,試管,接種環(huán),牙簽,酒精燈,火柴,冰箱,離心機(jī),電泳槽,紫外儀,PCR擴(kuò)增儀四、【實(shí)驗(yàn)步驟】(一)酶切1、在1.5ml的Eppendorf管中依次加入酶切反應(yīng)的各種成分,混勻,適當(dāng)離心,使樣品集中于管底;酶切反應(yīng)各成分添加如表1:表1pUC19質(zhì)粒及2DNA酶切反應(yīng)體系載體DNA(pUC19質(zhì)粒)目的DNA(ADNA)試劑體積/uL試劑體積/uLddH2O7.5ddH2O20pUC195ADNA5Hindi核酸內(nèi)切酶1Hindi核酸內(nèi)切酶210*Buffer1.510*Buffer3反應(yīng)體系總體積15反應(yīng)體系總體積30注意:加樣的順序應(yīng)該是,先加ddH20,其次是10*Buffer和DNA,最后加酶。且前幾步要把樣品加到管底的側(cè)壁上,加完后將其甩到管底,而酶液要在加入前從-20C的冰箱取出,并酶管放置冰上,取酶液時(shí)吸頭應(yīng)從表面吸取,防止由于插入過(guò)深而使吸頭外壁沾染過(guò)多的酶液。取出的酶液應(yīng)立即加入反應(yīng)混合液的液面以下,并充分混勻。限制性內(nèi)切酶的酶切反應(yīng)屬于微量

操作技術(shù),無(wú)論是DNA樣品還是酶的用量都極少,必須嚴(yán)格注意吸樣量的準(zhǔn)確性并確保樣品和酶全部加入反應(yīng)體系。此外,酶切反應(yīng)的所有塑料制品(Eppendorf管、吸頭等)必須是新的,并經(jīng)過(guò)高溫滅菌,操作時(shí)打開使用,操作過(guò)程不要求無(wú)菌,但要注意手和空氣中雜酶的污染,因此要求環(huán)境干凈,戴手套操作,盡量減少走動(dòng),縮短Eppendorf管的開蓋時(shí)間。2、 將上述反應(yīng)體系在37°C恒溫水浴鍋中反應(yīng)1h以上。3、 采用瓊脂糖電泳檢測(cè)酶切結(jié)果4、 質(zhì)粒DNA、入DNA的酶切瓊脂糖電泳結(jié)果及分析94164369123456789101112131415161794164369入入DNA/HindIII酶切電泳圖分析:從左到右各泳道分別為第一泳道:PUC19質(zhì)粒第二、十五、十六、十七泳道:用Hindill酶切完的入DNA第三至第十四泳道:第1至第12小組Hindill酶切的pUC19質(zhì)粒分析:我在第一組,所點(diǎn)樣品在第三泳道,依稀可見三條帶,從上而下依次為帶1、帶2、帶3。對(duì)比酶切的入DNA,可知帶①在2.6Kb左右,而且?guī)?在第一泳道雙螺旋質(zhì)粒pUC19上方,據(jù)此判斷帶①為線性pUC19質(zhì)粒;而帶②基本上在雙螺旋pUC19質(zhì)粒位置,因此帶②為未切開的雙螺旋pUC19質(zhì)粒。帶3位于凝膠底部呈現(xiàn)比較模糊的連續(xù)帶可能為未降解的小RNA分子。對(duì)比帶1和帶2發(fā)現(xiàn),帶1的亮度明顯比帶2大,說(shuō)明酶切較為徹底,至少有60%的pUC19已被酶切,可進(jìn)行接下來(lái)的連接操作。但是我這組的帶1明顯比第4、5、6、7、9、11、12組同學(xué)的帶1暗,原因是我組在實(shí)驗(yàn)第一階段提取的pUC19質(zhì)粒樣品濃度較低。二)連接

1、在500ul的Eppendorf管中依次加入連接反應(yīng)的各種成分,混勻,可適當(dāng)離心,使樣品集中于管底;連接反應(yīng)各成分添加如下表2:表2連接反應(yīng)體系試劑體積/uL入DNA/HindIII2.0pUC19DNA/HindIII2.010*LigaseBuffer1.0ddH2O4.0T4-DNA連接酶1.0連接反應(yīng)體系總體積10.0注意:加樣順序和酶切反應(yīng)時(shí)一樣,先加ddH20,其次是10*Buffer和DNA,最后加酶2、在16°C的恒溫水浴鍋中過(guò)夜反應(yīng)三) 感受態(tài)細(xì)胞的制備1、用接種環(huán)從含有E.coliDH5a的培養(yǎng)基平板上挑取少量E.coli菌落接種到20mlLB液體培養(yǎng)基里,37C振蕩培養(yǎng)過(guò)夜。接種過(guò)程及以下的轉(zhuǎn)接操作均須嚴(yán)格無(wú)菌操作,以防污染。2、 從振蕩培養(yǎng)箱中取出37C過(guò)夜培養(yǎng)物,此時(shí)的培養(yǎng)物較渾濁,顏色變深。按1%的接種量吸取200山轉(zhuǎn)接到20mlLB培養(yǎng)基中,37C振蕩培養(yǎng)2—3小時(shí)。注意吸取前應(yīng)充分混勻菌液,使吸取的菌量足夠。培養(yǎng)完成后,分別取1.5ml菌液于2個(gè)無(wú)菌的1.5mlEppendorf管中,5000rpm離心5min,棄上清液,如此重復(fù)收集菌體一次,使菌量增多。離心完后,棄上清液,吸干。3、 每支離心管中加入用冰預(yù)冷的1000ul0.1mol/lCaCl2溶液,漩渦震蕩使細(xì)胞懸浮混勻,冰上放置15min,4C5000rpm離心5min;棄上清液,吸干,加入100ulCaCl2懸浮冰浴。其中吸干上清可用200ul量程槍尖達(dá)到較好吸干效果,如果用1000ul槍尖則容易將菌體吸入槍尖內(nèi),造成菌體量的損失。四) 轉(zhuǎn)化1、取出制備好的感受態(tài)細(xì)胞懸液,搖勻,分別從中吸取50ul、50ul、100ul置于三個(gè)新的,已滅菌的Eppendorf管中,并編號(hào)為1、2、3,往2號(hào)Eppendorf管中加入2ul質(zhì)粒Puc19,混勻。3號(hào)Eppendorf管中加入之前連接步驟中制備好的連接液?;靹?。然后將這三個(gè)Eppendorf管冰浴30min;2、 30min后,將上述三個(gè)Eppendorf管取出,置于42C水浴中熱擊2min,然后迅速置于冰上,冰浴5min,此時(shí)質(zhì)粒已經(jīng)吸附到感受態(tài)細(xì)胞的表面,不能劇烈振蕩,以增加轉(zhuǎn)化效率;3、 向上述3管中分別加入500ulLB液體培養(yǎng)基,37C搖床培養(yǎng)1h,使受體菌恢復(fù)正常生長(zhǎng)狀態(tài)。注意每次加LB液體時(shí)均需換槍尖,防止雜菌污染感受態(tài)細(xì)胞。五) 稀釋和涂布平板1、無(wú)菌操作,將轉(zhuǎn)化細(xì)胞溶液按以下分組涂布平板:(1)受體菌對(duì)照管:取100ul受體菌液分別涂布含有氨芐青霉素和不含氨芐青霉素的麥康凱培養(yǎng)基上;(2)pUC19質(zhì)粒對(duì)照組:取20ul、100ul培養(yǎng)液涂布于含有氨芐青霉素的麥康凱培養(yǎng)基;(3)重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化組:取20ul、50ul、100ul、150ul、200ul培養(yǎng)液分別涂布含有氨芐青霉素的麥康凱培養(yǎng)基,2、 當(dāng)菌液完全被培養(yǎng)基吸收后(大約10min)倒置培養(yǎng)皿,于37°C恒溫培養(yǎng)24~36h,觀察菌落生長(zhǎng)情況(紅白菌落法)。3、 結(jié)果統(tǒng)計(jì)及分析。各培養(yǎng)皿內(nèi)菌落生長(zhǎng)情況如下表:各實(shí)驗(yàn)組在培養(yǎng)皿內(nèi)菌落生長(zhǎng)狀況組別不含Amp培養(yǎng)基含Amp培養(yǎng)基結(jié)果說(shuō)明受體菌對(duì)照組有大量白色菌落生長(zhǎng)無(wú)菌落生長(zhǎng)感受態(tài)細(xì)胞對(duì)氨芐青霉素敏感PUC19質(zhì)粒對(duì)照組-有大量紅色菌落生長(zhǎng)PUC19質(zhì)粒已導(dǎo)入感受態(tài)細(xì)胞,使其抗青霉素重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化組有大量紅色菌落生長(zhǎng),少數(shù)白色菌落生長(zhǎng)目的基因已插入質(zhì)粒多克隆位點(diǎn),破壞a互補(bǔ)作用,從而生成白色菌落根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果,我組之前連接的重組質(zhì)粒已基本上轉(zhuǎn)化進(jìn)入感受態(tài)細(xì)胞,實(shí)驗(yàn)結(jié)果與實(shí)驗(yàn)預(yù)期基本一致。六)重組子的篩選與鑒定1、取一個(gè)含有氨芐青霉素的麥康凱培養(yǎng)基平板,在底部劃線分成2個(gè)區(qū)域;在涂有重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化組的平板上分別選取2個(gè)單個(gè)的白色轉(zhuǎn)化子,用接種針劃線轉(zhuǎn)接到平分成2份的含有氨芐青霉素的麥康凱培養(yǎng)基上;37C過(guò)夜培養(yǎng);3、分別取3ml菌液,用Omega試劑盒抽提重組質(zhì)粒DNA,具體步驟見說(shuō)明書;4、瓊脂糖凝膠電泳鑒定。帶1帶2DL5000DNAmarker56423I3J941B66574J61入DNA/Hindm對(duì)照?qǐng)D從左至右各泳道依次為:第一泳道:未酶切的質(zhì)粒pUC19第二泳道:入DNA/Hindlll第三至第十四泳道:第一組至第12組提取的重組質(zhì)粒第十五泳道:入DNA/Hindlll第十六泳道:DL5000DNAmarker第十七至第二十五泳道:各組提取的重組質(zhì)粒分析:(1)我們組提取的樣品點(diǎn)在第三泳道,與圖1:從左至右依次為分析:(1)我們組提取的樣品點(diǎn)在第三泳道,與圖1:從左至右依次為pUC19、入DNA/Hindis、第3、4、5、9、11、13泳道樣品、入DNA/HindmarkerHI、DL5000DNA圖2:從左至右依次為第六、七、564bp,與插入片段大小非常接近。另外,重組質(zhì)粒亮度與質(zhì)粒pUC19的亮度相比,重組質(zhì)粒的亮度約為其5倍,質(zhì)粒pUC19的量為200nq,則重組質(zhì)粒的量可判斷為200*5=1000nq,重組質(zhì)粒濃度為1000/4=250nq/ul。不過(guò),其中第九泳道樣品亮度比本組其它樣品亮度稍小,其重組質(zhì)粒濃度也應(yīng)較小,大約為180nq/ul。(2)第六、七、八、二十泳道的樣品電泳結(jié)果各條帶基本在同一水平線上,從上往下可見兩條比較明顯的帶,依次為帶1,帶2(如圖2)。與入DNA/Hindlll對(duì)照?qǐng)D相比可知帶1大小約為9.5kb,判斷其為被酶切開而沒(méi)有連接上的入DNA片段,它的亮度較小,推知其濃度較小。帶2大小約為5.1kb,且它的亮度很大,推知帶2就是這些組同學(xué)們提取的八、二十泳道樣品、入DNA/Hind皿、DL5000DNAmarker第四、五、九、十一、十三、二十五泳道的樣品基本在一條水平線上,帶型亦相似,依稀可見三條帶(如圖1)。從上而下依次為帶1、帶2、帶3。帶1很暗,大致在入DNA/Hindill的第三條帶稍下方,可判斷帶1大小約為5.8kb,帶2較窄,較暗,估測(cè)其大小為4.5kb,帶3最寬,也遠(yuǎn)比帶1,帶2亮,應(yīng)該就是我們所要提取的重組質(zhì)粒,它大致與入DNA/Hindlll的第五條帶稍上方平齊,與DL5000DNAmarker的第二、三條帶的中間地帶平齊,據(jù)此可判斷其大小約為2.5kb,而空載體質(zhì)粒pUC19的大小約為1.9kb,由此判斷插入片段大小約為2.5—1.9=0.6kb左右,可初步判斷插入片段為入DNA/Hindlll電泳圖譜中的第七條帶,其大小為重組質(zhì)粒,那么,這些重組質(zhì)粒中所插入的外源片段大小為5.1-1.9=3.2kb,而入DNA/Hindlll酶切圖譜中沒(méi)有3.2kb的條帶,故不可判斷出插入片段為哪段。根據(jù)它的亮度約為pUC19條帶亮度的4倍,據(jù)此可知,第四、五小組同學(xué)所提取的重組質(zhì)粒濃度約為(200*5)/4=250nq/ul,而第六、二十組同學(xué)的樣品亮度略大于第四、五組的,約為他們的1.5倍,于是他們組的重組質(zhì)粒濃度為375nq/ul。(3)第十二、十四、十八、十九、二十一、二十二泳道的電泳結(jié)果大致相同(如圖3)。其中最亮的那條帶與第一泳道的空載體本在一水平線上,可初步判定它們是未連入外源DNA的質(zhì)粒圖3:從左至右依次為帶12、14圖3:從左至右依次為帶12、14、18、19、21、22、入DNA/HindIU、DL5000DNAmarker>質(zhì)粒pUC19可見亮條帶,帶1,帶2(如圖4。帶2明顯比帶1亮,大小約為3.1kb,可判斷為重組質(zhì)粒,插入片段大小可計(jì)算為3.1kb-1.9kb=1.2kb,入DNA/Hindlll酶切圖譜中沒(méi)有1.2kb的條帶,故不可判斷出插入片段為哪段。將它的亮度與質(zhì)粒PUC19帶的亮度相比,前者約為后者的6倍,可計(jì)算重組質(zhì)粒濃度約為(6*200)/4=300nq/ul。(如圖4)為

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