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文檔簡介

醫(yī)用SAS統(tǒng)計分析第五講10/7/20231第一頁,共七十五頁。

一、多元線性回歸根本概念多元線性回歸簡稱多元回歸,是研究一個應(yīng)變量與多個自變量間線性依存關(guān)系數(shù)量變化規(guī)律的一種方法。多元線性回歸方程式中:b0為回歸方程常數(shù)項,bj(j=1,2,┅,m)為偏回歸系數(shù),即在其他自變量固定的條件下,Xj改變一個單位時應(yīng)變量的改變量。

10/7/20232第二頁,共七十五頁。多元線性回歸方程的應(yīng)用

預(yù)測應(yīng)變量的估計值

探索影響應(yīng)變量y的主要因素當X為某一定值時,估計應(yīng)變量y的容許區(qū)間當X為某一定值時,估計其應(yīng)變量的總體均數(shù)的置信區(qū)間10/7/20233第三頁,共七十五頁。語句格式同單變量線性回歸根本相同。procreg[選項];model應(yīng)變量=自變量名列/[選項];必選語句,定義回歸分析模型procreg語句的[選項]data=數(shù)據(jù)集指明回歸分析所用的數(shù)據(jù)集。outset=數(shù)據(jù)集指定一個輸出數(shù)據(jù)集,用以存儲回歸分析所得的參數(shù)估計。simple輸出每個變量的簡單統(tǒng)計結(jié)果。10/7/20234第四頁,共七十五頁。model語句的[選項]selection=method規(guī)定變量篩選方法,method可以是以下幾種選項:forward〔或f〕前進法,按照sle規(guī)定的P值從無到有依次選一個變量進入模型backward〔或b〕后退法,按照sls規(guī)定的P值從含有全部變量的模型開始,以次剔除一個變量。stepwise逐步法,按照sle的標準依次選入變量,同時對模型中現(xiàn)有的變量按sls的標準剔除不顯著的變量。注:[選項]中沒有selection語句時,模型中含有全部自變量的回歸模型。sle=概率值入選標準,規(guī)定變量入選模型的顯著性水平,前進法默認為0.5,逐步法默認為0.15。sls=概率值剔除標準,指定變量保存在模型的顯著性水平,后退法默認為0.1,逐步法默認為0.15。10/7/20235第五頁,共七十五頁。stb輸出各自變量的標準偏回歸系數(shù)。cli輸出個體y值的95%容許區(qū)間上下限clm輸出預(yù)測值均值的95%可信區(qū)間上下限。P輸出實際值Yi,預(yù)測值、殘差及其標準誤。tol輸出各自變量的容許值。0≤tol值≤1,越接近于0,共線性越嚴重。vif輸出各自變量的方差膨脹因子。當vif≥10時,可認為多元共線性嚴重存在。collin要求詳細分析自變量之間的共線性,給出信息矩陣的特征根、條件指數(shù)和方差比,當條件指數(shù)≥10,方差比>0.5時,可認為存在多元共線性。collinoint與選擇項collin作用相同,但不包括回歸常數(shù)。R進行預(yù)測值的殘差分析〔即異常值識別與強影響分析〕,輸出學生化殘差值和Cook’s距離D值。當學生化殘差值>2時,所對應(yīng)的點可能是異常點,當D值>0.5時,可認為對應(yīng)的變量值對回歸函數(shù)是強影響點。10/7/20236第六頁,共七十五頁。

完全多元線性回歸例7-710名女中學生的體重〔X1,kg〕,胸圍〔X2,cm〕,胸圍的呼吸差〔X3,cm〕及肺活量〔Y,ml〕的資料如下表所示?,F(xiàn)作應(yīng)變量Y對自變量X1,X2,X3的三元線性回歸方程。datamreg1;inputx1x2x3y@@;cards;35690.7160040742.5260040642.0210042743.0265037721.1240045681.5220043784.3275037662.0160044703.2275042653.02500;procreg;modely=x1x2x3/stb;run;10/7/20237第七頁,共七十五頁。Model:MODEL1DependentVariable:YAnalysisofVarianceSumofMeanSourceDFSquaresSquareFValueProb>FModel31250109.0678416703.022595.6170.0355Error6445140.9322274190.15537CTotal91695250RootMSE272.37870R-square0.7374DepMean2315.00000AdjR-sq0.6061C.V.11.76582

10/7/20238第八頁,共七十五頁。ParameterEstimatesParameterStandardTforH0:VariableDFEstimateErrorParameter=0Prob>|T|INTERCEP1-3035.5363542168.6738473-1.4000.2111X1160.93182336.297137981.6790.1442X2137.80833422.980808911.6450.1510X31101.379460121.974703100.8310.4377StandardizedVariableEstimateINTERCEP0.00000000X10.46445689X20.39174762X30.2539945010/7/20239第九頁,共七十五頁。

逐步回歸

簡介

逐步回歸是篩選自變量的常用的方法之一。篩選自變量的方法還有前進法,后退法和最優(yōu)回歸子集法。逐步回歸法是依據(jù)事先給定的兩個顯著性水平SLE和SLS,將自變量逐個引入方程,同時每引入一個新變量后,對已選入的變量要進行逐個檢驗,將不顯著的變量剔除,這樣保證最后所得的變量都有顯著性。自變量間的多重共線性(multicollinearity)

整個回歸方程的統(tǒng)計檢驗P<α,而各偏回歸系數(shù)的檢驗均出現(xiàn)P>α的矛盾現(xiàn)象。偏回歸系數(shù)的估計值明顯與實際情況不符,或者是偏回歸系數(shù)的符號與專業(yè)知識的情況相反。10/7/202310第十頁,共七十五頁。據(jù)專業(yè)知識,該自變量與應(yīng)變量間關(guān)系密切,而偏回歸系數(shù)檢驗結(jié)果P>α。增加〔或刪除〕一個變量,或者改變〔或去除〕一個觀察值,引起回歸系數(shù)估計值發(fā)生大的變化。多重共線性是引起上述問題的重要原因。解決多重共線性的方法用主成分估計等有偏估計替代最小二乘估計。用逐步回歸等方法篩選自變量。如上例7-7,整個回歸模型P=0.0355,而b0,b1,b2,b3P值均大于0.05。估計變量之間存在共線性問題。10/7/202311第十一頁,共七十五頁。程序7-13datastepreg1;inputx1x2x3y@@;cards;35690.7160040742.5260040642.0210042743.0265037721.1240045681.5220043784.3275037662.0160044703.2275042653.02500;procreg;modely=x1-x3/stbtolvifcollincollinointR;modely=x1-x3/selection=stepwisesle=0.25sls=0.25stb;run;10/7/202312第十二頁,共七十五頁。

例〔?醫(yī)學統(tǒng)計學?王潔貞主編,例15.1〕某科研協(xié)作組調(diào)查某煤礦Ⅱ期高血壓病患者40例,X1為工作面污染程度等級,X2為井下工齡〔年〕,X3為體重〔kg〕,X4為吸煙年限(年),X5為飲酒年限〔年〕,Y為收縮壓(kPa),試作多元線性回歸分析。datastepreg2;infile'd:\sas\sas5\wang15_1.txt';inputidx1x2x3x4x5y@@;procreg;modely=x1-x5/stbtolvifcollincollinointr;modely=x1-x5/selection=stepwisesle=0.05sls=0.05stb;run;10/7/202313第十三頁,共七十五頁。二、多元線性相關(guān)研究多個變量間線性關(guān)系的一種統(tǒng)計分析方法。變量間相關(guān)系數(shù)有以下三類:簡單相關(guān)系數(shù)它是說明兩個變量相關(guān)程度和方向〔不考慮其他變量的影響〕的統(tǒng)計指標〔ri,j)。偏相關(guān)系數(shù)它是當其他變量固定時,說明某兩個變量間相關(guān)程度和方向的統(tǒng)計指標〔如r12,3〕。復(fù)相關(guān)系數(shù)R亦稱為全相關(guān)系數(shù)。說明應(yīng)變量與各自變量的線性關(guān)系的密切程度。決定系數(shù)R2復(fù)相關(guān)系數(shù)的平方。它說明應(yīng)變量的變異中由各自變量的改變而引起的占多少。如R2=0.8,那么說明應(yīng)變量的變異中有80%由自變量的改變而引起的。10/7/202314第十四頁,共七十五頁。

程序7-12datamcorr1;infile'd:\sas\sas5\mcorr1.txt';inputx1x2x3y@@;proccorrnosimple;/*禁止一些簡單統(tǒng)計量的輸出*/varx1x2x3y;/*包括了所有變量,實際可以省略*/proccorrnosimple;varx1x2;partialx3;/*partial語句的作用是固定x3*/proccorrnosimple;varx1x2;partialx3y;/*partial語句的作用是固定x3和y*/run;10/7/202315第十五頁,共七十五頁。

三、Logistic回歸分析簡介Logistic回歸模型是適用于應(yīng)變量〔因變量〕為分類變量的回歸分析。當應(yīng)變量為分類變量時,如應(yīng)變量結(jié)果為二分類變量的發(fā)病、不發(fā)病,生存、死亡等,是不能用多元線性回歸模型〔Y=β0+Σβixi)來分析各種危險因素與應(yīng)變量之間的關(guān)系的。因為應(yīng)變量Y只能取值為1和0。不符合線性回歸模型中應(yīng)變量Y應(yīng)具有正態(tài)分布和方差齊性的要求,同時線性回歸模型得到的Y值會出現(xiàn)大于1或小于0的不合理結(jié)果,顯然不能用線性回歸建立預(yù)測模型。以發(fā)病為例,發(fā)病的概率為P,不發(fā)病的概率為1-P,0≤P≤1。公式等號左邊簡稱為logit〔P〕,即logit(P)=β0+Σβixi可證明,無論Y得何值,均0<P<1。上式可推導(dǎo)為:10/7/202316第十六頁,共七十五頁。Logistic回歸的應(yīng)用logistic回歸在流行病學和臨床流行病學等方面應(yīng)用廣泛,既可用于前瞻性的隊列研究,又可用于回憶性的病例對照研究。常用于:病因?qū)W分析;預(yù)后分析;鑒別診斷;評價治療措施;毒物的半數(shù)效量和聯(lián)合作用10/7/202317第十七頁,共七十五頁。Logistic回歸的分類按應(yīng)變量的類型分類為:兩分類的Logistic回歸非條件logistic回歸即研究對象未經(jīng)過配對?!苍赟AS中調(diào)用logistic模塊進行統(tǒng)計〕。條件logistic回歸即在配對病例對照研究中的1:1和1:M及N:M配對?!苍赟AS中調(diào)用Phreg模塊進行統(tǒng)計〕。多分類有序反響變量的Logistic回歸〔在SAS中調(diào)用logistic模塊進行統(tǒng)計〕。多分類無序反響變量的Logistic回歸〔在SAS中調(diào)用Catmod模塊進行統(tǒng)計〕。本講主要介紹兩分類Logistic回歸

10/7/202318第十八頁,共七十五頁。兩分類非條件Logistic回歸語法格式Proclogistic[data=數(shù)據(jù)集][選項];model應(yīng)變量名=自變量名列/[選項];[freq<變量名>];可選項,指明頻數(shù)變量。output<out=數(shù)據(jù)集><pred|p=變量名>;output語句創(chuàng)立一個新的SAS數(shù)據(jù)集,其含有每個個體的原始數(shù)據(jù),pred|p=變量名為在out=數(shù)據(jù)集中含有每個個體預(yù)測概率。【Proc語句的[選項]】order=data規(guī)定按照數(shù)據(jù)集中反響變量水平出現(xiàn)的先后順序進行運算。descending(或des)規(guī)定按照反響變量降序水平進行運算。10/7/202319第十九頁,共七十五頁。

注意:以上兩個選項非常重要,如死亡為1,存活為0,為了得到死亡對存活的概率〔或者說是死亡的危險〕,應(yīng)選擇此兩個選項之一,否那么得到的是存活對死亡的概率,因為logistic回歸模型是自動按反響變量值為小的來擬合方程的。反之,如果死亡為0,存活為1,可不選此兩項之一,【model語句的[選項]】selection=forward(或f)|backward(或b)|stepwise(或s)|score規(guī)定變量的篩選方法,分別為向前、向后、逐步和最優(yōu)子集法。缺省時為none,擬合全回歸模型。sle=概率值指定變量進人模型的顯著水平,缺省為0.05。sls=概率值指定變量剔除模型的顯著水平,缺省為0.05。CL計算輸出所有回歸參數(shù)的可信區(qū)間。10/7/202320第二十頁,共七十五頁。clodds=pl計算輸出OR的可信區(qū)間。scale=noneaggregate要求對模型進行擬合優(yōu)度檢驗。例9-440例病人的治愈情況Y〔Y=0表示未愈,Y=1表示治愈,病情嚴重程度X1(X1=0表示不嚴重,X1=1表示嚴重〕,年齡X2為連續(xù)變量,治療方法X3(X3=0表示新方法,X3=1表示一般療法〕,數(shù)據(jù)如表9.6,試作logistic回歸分析。程序9-4datac;infile'd:\sas\sas5\cx9_4.txt';inputyx1-x3;proclogisticdes;/*按降序水平進行運算*/modely=x1-x3/scale=noneaggregate;/*對模型進行擬合優(yōu)度檢驗*/Outputout=bp=pr;/*在數(shù)據(jù)集b中含有每個個體的預(yù)測概率值*/run;10/7/202321第二十一頁,共七十五頁。TheLOGISTICProcedureDataSet:WORK.C數(shù)據(jù)集名ResponseVariable:Y反響變量YResponseLevels:2反響變量水平數(shù)2NumberofObservations:40觀察值40LinkFunction:Logit聯(lián)系函數(shù)logitResponseProfile反響變量的描述Ordered順序值ValueYCount計數(shù)值11172023

10/7/202322第二十二頁,共七十五頁。

DevianceandPearsonGoodness-of-FitStatistics模型的擬合優(yōu)度檢驗Pr>CriterionDFValueValue/DFChi-SquareDeviance3136.32311.17170.2344Pearson3129.55830.95350.5402ModelFittingInformationandTestingGlobalNullHypothesisBETA=0模型擬合信息和整體偏回歸系數(shù)為0的假設(shè)檢驗InterceptInterceptandCriterionOnlyCovariatesChi-SquareforCovariates判斷的準那么僅有截距所有變量協(xié)變量的卡方AIC56.54855.413.SC58.23762.169.-2LOGL54.54847.4137.135with3DF(p=0.0677)Score..6.630with3DF(p=0.0847)10/7/202323第二十三頁,共七十五頁。AnalysisofMaximumLikelihoodEstimates最大似然法估計值分析ParameterStandardWaldPr>StandardizedOddsVariableDFEstimateErrorChi-SquareChi-SquareEstimateRatioINTERCPT13.70252.14422.98170.0842..X11-0.61570.71350.74460.3882-0.1718770.540X21-0.09390.06362.18120.1397-0.3093360.910X31-1.52360.73964.24300.0394-0.4248130.218

AssociationofPredictedProbabilitiesandObservedResponses模型回代判別分析Concordant=71.9%(一致率〕Somers'D=0.448Discordant=27.1%(非一致率〕Gamma=0.452Tied=1.0%(結(jié)點率)Tau-a=0.224(391pairs)c=0.72410/7/202324第二十四頁,共七十五頁。治愈的概率模型為:例2

為了探討冠心病發(fā)生的有關(guān)危險因素,對26例冠心病病人和28例對照者進行病例

對照研究,各因素的說明見下表。試用logistic逐步回歸分析方法篩選危險因素。10/7/202325第二十五頁,共七十五頁。表冠心病8個可能的危險因素與賦值因素變量名賦值說明年齡(歲)X1<45=1,45

54=2,55

64=3,65

=4高血壓史X2無=0,有=1高血壓家族史X3無=0,有=1吸煙X4不吸=0,吸=1高血脂史X5無=0,有=1動物脂肪攝入X6低=0,高=1體重指數(shù)(BMI)X7<24=1,24

<26=2,26

=3A型性格X8否=0,是=1冠心病Y對照=0,病例=1

10/7/202326第二十六頁,共七十五頁。程序dataex16_2;infile'd:\sas\sas5\log2.txt';inputx1-x8y;proclogisticdes;modely=x1-x8/selection=stepwisesle=0.1sls=0.1clodds=pl

;run;10/7/202327第二十七頁,共七十五頁。條件Logistic回歸條件Logistic回歸分析是用phreg(proportionalhazardregression,比例風險回歸〕模塊完成的。Phreg模塊主要用于Cox回歸的計算〕語法格式在data步先建立一個時間啞變量,一般為time=1-case;〔如病例case=1,對照case=0,那么病例啞變量time=0,對照啞變量time=1,要求病例的time要小,對照的time要大〕。如果病例case=0,對照case=1,時間啞變量為time=case。Procphreg[選項];model<時間啞變量*對照指示變量名〔數(shù)值〕>=<自變量名列>/[選項];10/7/202328第二十八頁,共七十五頁。Strata<配對組指示變量名>;Freq<頻數(shù)變量名>;【Procphreg[選項]】;nosummary不打印輸出事件和截尾數(shù)值。

simple輸出模型中變量的簡單統(tǒng)計描述【model過程[選項]】

ties=discrete

用離散的logistic模型替代比例風險模型。此句必選!selection=forward(或f)|backward(或b)|stepwise(或s)|score規(guī)定變量的篩選方法,分別為向前、向后、逐步和最優(yōu)子集法。缺省時為none,擬合全回歸模型。10/7/202329第二十九頁,共七十五頁。

sle=概率值指定變量進人模型的顯著水平,缺省為0.05。sls=概率值指定變量剔除模型的顯著水平,缺省為0.05。risklimits計算輸出RR的可信區(qū)間。alpha=概率值指定RR的〔1-α〕可信區(qū)間,缺省時為0.05。1:1配對條件Logistic回歸例9-8為研究胃癌的危險因素,某醫(yī)學院用103對1:1配對資料,這里選用其中10對三個因素,即X1〔蛋白質(zhì)攝入量0,1,2,3〕,X2〔不良飲食習慣0,1,2,3〕及X3〔精神因素0,1,2〕。數(shù)據(jù)如表9.11。試作條件Logistic回歸分析。10/7/202330第三十頁,共七十五頁。表9.1110對胃癌的1:1配對數(shù)據(jù)對號病例對照X1X2X3X1X2X31234567891010011011323312121132012012122211011200200320200020100010000010/7/202331第三十一頁,共七十五頁。程序datalog1_2;doid=1to10;docase=0to1;inputx1-x3@@;time=case;output;end;end;cards;130101032130012020120100111121

022200111000112000332220222000;procphreg;modeltime*case(1)=x1-x3/ties=discreteselection=stepwisesle=0.25sls=0.25;strataid;run;10/7/202332第三十二頁,共七十五頁。ThePHREGProcedureDataSet:WORK.LOG1_2DependentVariable:TIME反響變量timeCensoringVariable:CASE截尾變量caseCensoringValue(s):1截尾值為1TiesHandling:DISCRETE結(jié)點處理方法為discreteSummaryoftheNumberofEventandCensoredValuesPercentStratumIDTotalEventCensoredCensored1121150.002221150.00┆┆┆┆┆┆101021150.00--------------------------------------------------------------Total20101050.0010/7/202333第三十三頁,共七十五頁。

Step1:VariableX3isentered.Themodelcontainsthefollowingexplanatoryvariables.X3TestingGlobalNullHypothesis:BETA=0WithoutWithCriterionCovariatesCovariatesModelChi-Square-2LOGL13.8637.1586.705with1DF(p=0.0096)Score..5.538with1DF(p=0.0186)Wald..3.139with1DF(p=0.0764)10/7/202334第三十四頁,共七十五頁。Step2:VariableX2isentered.Themodelcontainsthefollowingexplanatoryvariables.X2X3TestingGlobalNullHypothesis:BETA=0WithoutWithCriterionCovariatesCovariatesModelChi-Square-2LOGL13.8633.72410.139with2DF(p=0.0063)Score..7.229with2DF(p=0.0269)Walt..2.467with2DF(p=0.2913)NOTE:No(additional)variablesmetthe0.25levelforentryintothemodel.10/7/202335第三十五頁,共七十五頁。AnalysisofMaximumLikelihoodEstimatesParameterStandardWaldPr>RiskVariableDFEstimateErrorChi-SquareChi-SquareRatio

變量自由度參數(shù)估計值標準誤wald卡方值P值RR值X211.1653510.810802.065790.15063.207X312.0671571.639441.589850.20737.902SummaryofStepwiseProcedureVariableNumberScoreWaldPr>StepEnteredRemovedInChi-SquareChi-SquareChi-Square1X315.5385.0.01862X223.4594.0.0629胃癌患病的概率模型為:10/7/202336第三十六頁,共七十五頁。1:M或N:M的條件Logistic回歸1:M配比是一個病例配M個對照,N:M配比是N個病例配M個對照。使用的SAS語句和1:1配對根本是一致的。例題某北方城市研究喉癌發(fā)病的危險因素,用1:2配對的病例-對照研究方法進行了調(diào)查。先選取了6個可能的危險因素并節(jié)錄25對數(shù)據(jù),各因素的賦值說明見下表1,資料列于表2。試作條件Logistic逐步回歸。

10/7/202337第三十七頁,共七十五頁。表1喉癌的危險因素與賦值說明

因素變量名賦值說明咽炎X1無=1,偶爾=2,經(jīng)常=3吸煙量(支/日)X20=1,1~4=2,5~9=3,10~20=4,>20=5聲嘶史X3無=1,偶爾=2,經(jīng)常=3攝食新鮮蔬菜X4少=1,經(jīng)常=2,每天=3攝食水果X5很少=1,少量=2,經(jīng)常=3癌癥家族史X6無=0,有=1是否患喉癌Y病例=1,對照=010/7/202338第三十八頁,共七十五頁。表2喉癌1:2配對病例-對照調(diào)查資料整理表配比組號

iYX1X2X3X4X5X6

j11351110011133001113302113113001113200121320

i

┊┊┊┊

┊┊┊

2511411110111320011133010/7/202339第三十九頁,共七十五頁。

程序datalog1_4;infile'd:\sas\sas5\log1_4.txt';doi=1to25;doj=1to3;inputyx1-x6;time=1-y;output;end;end;procphregnosummary;modeltime*y(0)=x1-x6/ties=discreteselection=stepwisesle=0.1sls=0.1risklimits;stratai;run;10/7/202340第四十頁,共七十五頁。四、生存分析簡介

概念

生存分析是將事件的結(jié)果和出現(xiàn)此結(jié)果所經(jīng)歷的時間結(jié)合起來分析的統(tǒng)計分析方法。

生存分析的數(shù)據(jù)

完全數(shù)據(jù)

即掌握研究事件的起點,又掌握終點的生存時間資料為完全數(shù)據(jù),一般用t來表示。

不完全數(shù)據(jù)①因遷移原因失去聯(lián)系;②死于其他原因;③在總結(jié)分析時仍然生存。生存分析中稱這種不完全數(shù)據(jù)為截尾數(shù)據(jù)、刪失數(shù)據(jù)、終檢數(shù)據(jù)(censoreddata)。

生存率(survivalrate)又稱累積生存概率,即個體活過時點t的概率,用S(t)表示。10/7/202341第四十一頁,共七十五頁。生存分析的三種變量1.目標變量即生存時間,常記為t。2.協(xié)變量可以是研究因素,也可以是排除其影響的因素,常記為x1,x2,┄,xp。3.截尾變量常記為censor或d等。生存分析的任務(wù)估計生存率;比較生存率;尋找影響因素。生存分析的方法參數(shù)法能看出生存時間T服從某特定的分布類型,對分布的參數(shù)作統(tǒng)計描述與推斷。常見的有:Weibull分布,指數(shù)分布,正態(tài)分布等。相應(yīng)的SAS過程為lifereg。非參數(shù)法不知生存時間T的分布類型或不符合特定的分布類型,對整個分布或某個特征作統(tǒng)計描述與推斷。常用乘積極限10/7/202342第四十二頁,共七十五頁。法(productlimitmethod)和壽命表法(lifetablemethod)估計生存率和中位生存時間等;用時序檢驗(log-ranktest),Wilcoxon檢驗和似然比檢驗等作分組比較。相應(yīng)的SAS過程為:lifetest半?yún)?shù)法不知生存時間分布確切類型,用模型的方法對模型的局部參數(shù)作統(tǒng)計描述與推斷。常用的是Cox模型。相應(yīng)的SAS過程為:phreg。注:半?yún)?shù)法與參數(shù)法可用來研究多個因素對生存時間的影響,非參數(shù)法難以實施多因素生存分析。非參數(shù)法的lifetest過程語法格式:PROCLIFETEST[選項];TIME<生存時間變量*截尾指示變量〔數(shù)值〕>;10/7/202343第四十三頁,共七十五頁。STRATA<分組變量名列>;〔指定比較的分組變量,按分組變量名列分別進行分析和比較。〕TEST<協(xié)變量名列>;〔指定協(xié)變量名列,檢驗生存時間與該變量是否有關(guān)〕Freq<變量名>;〔指定頻數(shù)變量名〕PROC過程[選項]1.method=方法指定估計生存率所用的方法:PL要求用乘積極限法〔即Kaplan-Meier法〕估計生存率并計算中位生存時間等,為缺省方法。LT要求用壽命表法估計生存率等。2.intervals=(初值to終值by步長〕或width=數(shù)值只能在指定方法為壽命表法時使用。用壽命表法分析時,程序會自動10/7/202344第四十四頁,共七十五頁。

給定生存時間的區(qū)間。如果人為規(guī)定生存時間的分組區(qū)間,那么需用該選項指定。3.Plots=繪圖類型要求輸出生存分析圖??晒┹敵龅膱D形有:S對生存函數(shù)S(t)作圖。橫、縱坐標分別為t,S(t)。H對風險函數(shù)作圖。橫、縱坐標分別為t,H(t)。小樣本資料的乘積極限法(Kaplan-Meier法〕例15-125例某種癌癥的患者在不同的日期隨機分配至兩治療組,分別以A、B兩種治療方法進行治療。治療后繼續(xù)對這些病人進行隨訪至到2003年5月31日結(jié)束。資料如表15.1所示,數(shù)字后又+號者為刪失值。試進行生存率分析。10/7/202345第四十五頁,共七十五頁。datalife1;dogroup=1to2;inputn;doi=1ton;inputt@@;ift<0thencensor=1;elsecensor=0;t=abs(t);output;end;end;cards;12852586363220365452496-528-560-676131318237076180195210232300396-490-540;proclifetestplots=(s)formchar(1,2,7)='|-+';timet*censor(1);stratagroup;run;10/7/202346第四十六頁,共七十五頁。TheLIFETESTProcedureProduct-LimitSurvivalEstimatesGROUP=1SurvivalStandardNumberNumberTSurvivalFailureErrorFailedLeft

生存時間生存率死亡概率生存率標準誤死亡例數(shù)生存例數(shù)0.0001.0000000128.0000.91670.08330.079811152.0000.83330.16670.107621058.0000.75000.25000.12503963.000...4863.0000.58330.41670.142357220.0000.50000.50000.144366365.0000.41670.58330.142375452.0000.33330.66670.136184496.0000.25000.75000.125093528.000*...92560.000*...91676.000*...90*CensoredObservation10/7/202347第四十七頁,共七十五頁。SummaryStatisticsforTimeVariableTPoint95%ConfidenceIntervalQuantileEstimate[Lower,Upper)

四分位數(shù)點估計95%可信區(qū)間75%.220.000.50%292.50063.000496.00025%60.50052.000365.000Mean272.083StandardError62.231

生存時間均數(shù)均數(shù)的標準誤NOTE:Thelastobservationwascensoredsotheestimateofthemeanisbiased.10/7/202348第四十八頁,共七十五頁。

TheLIFETESTProcedureProduct-LimitSurvivalEstimatesGROUP=2SurvivalStandardNumberNumberTSurvivalFailureErrorFailedLeft0.0001.00000001313.0000.92310.07690.073911218.0000.84620.15380.100121123.0000.76920.23080.116931070.0000.69230.30770.12804976.0000.61540.38460.134958180.0000.53850.46150.138367195.0000.46150.53850.138376210.0000.38460.61540.134985232.0000.30770.69230.128094300.0000.23080.76920.1169103396.0000.15380.84620.1001112490.000*...111540.000*...110*CensoredObservation10/7/202349第四十九頁,共七十五頁。SummaryStatisticsforTimeVariableTPoint95%ConfidenceIntervalQuantileEstimate[Lower,Upper)75%300.000195.000.50%195.00070.000300.00025%70.00018.000195.000Mean192.692StandardError40.963SummaryoftheNumberofCensoredandUncensoredValuesGROUPTotalFailedCensored%Censored1129325.000021311215.3846Total2520520.000010/7/202350第五十頁,共七十五頁。

SDF||||||1.0+*AB|||S|||u|A*---Ar|||v|BB|i||AAv0.8+||a|B---|Bl|AA||D|*Bi|||s||B------------Bt0.6+||r|A-----------------Ai|BB|b||A-----------------Au|||t|B-B|i||A---------Ao0.4+||n|B--B|||A-----AF|B-------B|u|||n||Ac|B-----------Bt0.2+|i||o|Bn||||0.0+|||||+-----+-----+-----+-----+-----+-----+-----+-----+-----+-----+-----+-----+-----+-----+-050100150200250300350400450500550600650700T10/7/202351第五十一頁,共七十五頁。

TestofEqualityoverStrata

Pr>TestChi-SquareDFChi-SquareLog-Rank時序檢驗0.664010.4152Wilcoxon秩和檢驗0.327210.5673-2Log(LR)似然比檢驗

1.036210.308710/7/202352第五十二頁,共七十五頁。例王潔貞主編?醫(yī)學統(tǒng)計學?例14.1P202手術(shù)療法組:52789296105123145136*157*182*209*224*手術(shù)+化療組:7995117175203102*157*199*216*246*26910/7/202353第五十三頁,共七十五頁。datalife2;dogroup=1to2;inputn;doi=1ton;inputt@@;ift<0thencensor=1;elsecensor=0;t=abs(t);output;end;end;cards;1252789296105123145-136-157-182-209-224117995117175203-102-157-199-216-246269;proclifetestplots=(s)formchar(1,2,7)='|-+';timet*censor(1);stratagroup;run;10/7/202354第五十四頁,共七十五頁。大樣本資料的壽命表法例2王潔貞主編?醫(yī)學統(tǒng)計學?例14.2P20610/7/202355第五十五頁,共七十五頁。

datalife3;inputtcensorfg@@;/*t:月數(shù)的下限;censor:1=死亡,0=失訪;f:人數(shù);g:分組變量*/cards;0181000171517011131411300119121190017142704213122130221912219032251322502231112310423710237012;proclifetestmethod=Ltwidth=6plots=(s)formchar(1,2,7)='|-+';timet*censor(0);stratag;freqf;run;10/7/202356第五十六頁,共七十五頁。

TheLIFETESTProcedureLifeTableSurvivalEstimatesG=1ConditionalEffectiveConditionalProbabilityIntervalNumberNumberSampleProbabilityStandard[Lower,Upper)FailedCensoredSizeofFailureErrorSurvival

區(qū)間的上下限死亡數(shù)失訪數(shù)校正人數(shù)死亡概率死亡概率標準誤期初生存率068020.00.40000.10951.00006125111.50.43480.14620.60001218406.00.66670.19250.33911824202.01.000000.1130SurvivalMedianMedianIntervalStandardResidualStandard[Lower,Upper)FailureErrorLifetimeError

期初死亡率生存率標準誤中位剩余時間中位剩余時間標準誤06008.30002.57156120.40000.10957.03852.347712180.66090.10744.50001.837118240.88700.0744..10/7/202357第五十七頁,共七十五頁。LifeTableSurvivalEstimatesG=2ConditionalEffectiveConditionalProbabilityIntervalNumberNumberSampleProbabilityStandard[Lower,Upper)FailedCensoredSizeofFailureE

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