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蘇云金芽孢桿菌噬菌體MZTP02c基因組文庫(kù)的構(gòu)建及保藏研究的開(kāi)題報(bào)告一、選題背景及研究意義蘇云金芽孢桿菌(Bacillussubtilis)是一種常見(jiàn)的細(xì)菌,在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)和工業(yè)生產(chǎn)中有著重要的應(yīng)用價(jià)值。與此同時(shí),噬菌體是一種可以廣泛應(yīng)用于生物防治領(lǐng)域的病毒,具有高效、環(huán)保、無(wú)毒副作用的特點(diǎn)。因此,將蘇云金芽孢桿菌與噬菌體結(jié)合,開(kāi)發(fā)針對(duì)蘇云金芽孢桿菌的噬菌體產(chǎn)品,不僅可以提高生物防治的效果,同時(shí)也可以減少農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中對(duì)化學(xué)農(nóng)藥的使用,有著重要的現(xiàn)實(shí)意義和實(shí)用價(jià)值。為了研究蘇云金芽孢桿菌對(duì)噬菌體的感受性和噬菌體對(duì)蘇云金芽孢桿菌的感染機(jī)制,需要對(duì)蘇云金芽孢桿菌噬菌體MZTP02c基因組文庫(kù)進(jìn)行構(gòu)建和保藏。本課題將從文庫(kù)構(gòu)建和保藏兩個(gè)方面展開(kāi)研究,旨在為蘇云金芽孢桿菌噬菌體產(chǎn)品的研發(fā)提供技術(shù)支撐和實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。二、研究?jī)?nèi)容及思路(一)文庫(kù)構(gòu)建1.研究菌株的選擇:選取蘇云金芽孢桿菌MZTP02c菌株和相應(yīng)的噬菌體進(jìn)行研究。2.DNA提取和文庫(kù)構(gòu)建:利用常規(guī)方法提取蘇云金芽孢桿菌和噬菌體的DNA,以RocheGSFLXTitaniumXL+系統(tǒng)為平臺(tái)構(gòu)建基因組文庫(kù)。3.測(cè)序和初步數(shù)據(jù)處理:進(jìn)行測(cè)序,得到數(shù)據(jù)后進(jìn)行質(zhì)控和去除低質(zhì)量序列,然后進(jìn)行基因組組裝與注釋。(二)文庫(kù)保藏1.存儲(chǔ)條件的確定:確定適合蘇云金芽孢桿菌噬菌體MZTP02c基因組文庫(kù)長(zhǎng)期保存的存儲(chǔ)條件,包括溫度、濕度、光照等因素。2.存儲(chǔ)介質(zhì)的選擇:選擇適合存儲(chǔ)蘇云金芽孢桿菌噬菌體MZTP02c基因組文庫(kù)的介質(zhì),進(jìn)行保藏。3.儲(chǔ)存模式的建立:建立儲(chǔ)存模式和管理程序,確保蘇云金芽孢桿菌噬菌體MZTP02c基因組文庫(kù)的長(zhǎng)期保存和維護(hù)。三、預(yù)期成果1.成功構(gòu)建蘇云金芽孢桿菌噬菌體MZTP02c基因組文庫(kù)。2.確定適合蘇云金芽孢桿菌噬菌體MZTP02c基因組文庫(kù)長(zhǎng)期保存的存儲(chǔ)條件和介質(zhì)。3.建立蘇云金芽孢桿菌噬菌體MZTP02c基因組文庫(kù)的儲(chǔ)存模式和管理程序,確保其長(zhǎng)期保存和維護(hù)。四、研究進(jìn)度安排階段性進(jìn)展|完成時(shí)間---|---選題確定|2022年9月文獻(xiàn)調(diào)研|2022年10月菌株的篩選和保藏|2022年11月DNA提取和文庫(kù)構(gòu)建|2023年1月文庫(kù)測(cè)序和初步數(shù)據(jù)處理|2023年3月存儲(chǔ)條件和介質(zhì)的選擇|2023年4月儲(chǔ)存模式和管理程序的建立|2023年6月論文撰寫(xiě)和答辯準(zhǔn)備|2023年9月五、參考文獻(xiàn)1.Farajzadeh-Sheikh,A.,Badalyan,S.,Asadpour,L.,&Shahbazi,E.(2021).AnoverviewofBacillussubtilis,anexcellentplantgrowth-promotingrhizobacterium.AppliedMicrobiologyandBiotechnology,105(7),3141-3150.2.Zygmunt,W.A.,?o?,M.,&W?grzyn,G.(2021).Bacteriophagesinmedical,industrial,andenvironmentalbiotechnology:strategiesforeffectiveapplication.BiotechnologyAdvances,45,107820.3.Marraffini,L.A.,&Sontheimer,E.J.(2010).CRISPRinterferencelimitshorizontal
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