粳稻品種真實性和純度SSR分子標(biāo)記檢測法范圍本文件規(guī)定了粳稻（OryzasativaL.japonica）品種真實性和品種純度SSR分子標(biāo)記的檢測原理、檢測方法和結(jié)果報告。本文件適用于江蘇地區(qū)推廣的粳稻品種的真實性驗證和真實性身份鑒定，也適用于粳稻常規(guī)種、雜交種及其親本的純度檢測。江蘇秈稻品種（包括常規(guī)種、雜交種及其親本）的真實性和純度測定可參照執(zhí)行。本文件不適用于粳稻實質(zhì)性派生品種（EssentiallyDerivedVariety,EDV）和轉(zhuǎn)基因品種的鑒定。規(guī)范性引用文件下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中，標(biāo)注日期的引用文件，僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件；不標(biāo)注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改單）適用于本文件。GB/T39917-2021主要農(nóng)作物品種真實性和純度SSR分子標(biāo)記檢測稻術(shù)語和定義GB/T39917—2021界定的術(shù)語和定義適用于本文件。4總則簡單序列重復(fù)（SSR）是一類由2個~6個堿基組成的串聯(lián)重復(fù)DNA序列。水稻不同品種在SSR重復(fù)次數(shù)上會存在差異，這種差異可在世代間穩(wěn)定遺傳。篩選在品種間重復(fù)次數(shù)變異豐富的SSR位點是利用SSR分子標(biāo)記鑒定品種真實性和純度的關(guān)鍵。采用固定數(shù)量的SSR引物對抽取品種的代表性樣品DNA進(jìn)行擴增和電泳檢測，并通過與標(biāo)準(zhǔn)樣品比較或與已知品種SSR指紋數(shù)據(jù)庫比對，可對抽樣品種的真實性或身份進(jìn)行鑒定。篩選能夠鑒別品種群體中異常個體的SSR引物，進(jìn)而利用其檢測該品種的一定數(shù)量個體，根據(jù)檢測到的異常個體數(shù)占比，可對該品種的整體一致性或純度作出評價。中國栽培稻分為秈稻和粳稻兩個亞種，江蘇水稻以粳稻為主。秈稻和粳稻在基因組組成和生態(tài)適應(yīng)性上存在明顯差異，造成一些SSR位點的重復(fù)次數(shù)差異在秈稻品種間廣泛存在，但卻不存在于粳稻品種間。依據(jù)江蘇粳稻品種間的序列變異特征，篩選在品種間變異豐富的SSR位點，結(jié)合GB/T39917-2021中的SSR位點和檢測流程，可提高SSR標(biāo)記在江蘇粳稻品種真實性和純度檢測中的鑒定效率。5檢測方法5.1基本要求檢測平臺、樣品要求、儀器設(shè)備、試劑溶液配制、檢測程序、DNA提取、PCR擴增、擴增產(chǎn)物分離和數(shù)據(jù)分析應(yīng)符合GB/T39917—2021的規(guī)定。5.2真實性檢測5.2.1根據(jù)分辨率高、多態(tài)性信息含量值高、染色體分布均勻、與GB/T39917—2021間的銜接等篩選原則，本文件確定76對SSR引物作為江蘇粳稻品種真實性鑒定引物，其中48對為GB/T39917—2021中的引物（編號為PR01~PR48），另外28對為新增引物（編號R49~R76）見表1。5.2.2利用76對引物構(gòu)建江蘇已知粳稻品種及部分雜交秈稻品種的SSR指紋數(shù)據(jù)庫。各對引物擴增的部分代表性帶紋和品種見附錄A。5.2.3進(jìn)行品種真實性驗證檢測時，將76對SSR引物分為Ⅰ組和Ⅱ組兩組依次進(jìn)行，其中I組為GB/T39917—2021中的48對引物；II組為新增的28對引物。在Ⅰ組引物檢測中，若檢測到可以判定“否定”結(jié)果的差異位點數(shù)的，終止檢測；未檢測到或檢測到但未達(dá)到可以判定“否定”結(jié)果的差異位點數(shù)的，應(yīng)繼續(xù)完成Ⅱ組引物的檢測。5.2.4進(jìn)行品種真實性身份鑒定檢測時，應(yīng)完成全部76對引物檢測，可采用I組和II組序貫方式進(jìn)行，也可采用其它次序進(jìn)行。利用江蘇已推廣粳稻品種的SSR指紋數(shù)據(jù)庫，通過指紋數(shù)據(jù)比對篩查確定具體品種。經(jīng)比較后與已知品種存在沒有位點差異或差異位點數(shù)不足而無法得出結(jié)論或有爭議的，允許采用田間種植鑒定方法等其他方法進(jìn)行進(jìn)一步檢測鑒定。5.3純度檢測5.3.1品種純度檢測所選的引物，應(yīng)通過檢測樣品預(yù)試驗，從76對SSR引物中篩選出能夠準(zhǔn)確識別該樣品品種中異常個體的引物。5.3.2異常個體的類型不同，所選引物和數(shù)目也應(yīng)不同。篩選時應(yīng)綜合考慮引物的雜合度、DNA快速提取和多重引物組合電泳的潛力，選擇合適引物。注：雜交種異常個體主要類型為自交、異交、混雜；常規(guī)種和雜交親本種子異常個體為異交、混雜。5.3.3篩選結(jié)果表明樣品在個別位點存在遺傳不穩(wěn)定狀況的可將其剔除；檢測樣品存在嚴(yán)重遺傳不穩(wěn)定狀況的可終止純度測定。5.4引物合成5.4.1真實性檢測或身份鑒定引物表1給出了28對新增的真實性驗證或身份鑒定引物，其中各引物染色體位置參考的基因組版本號為Os-Nipponbare-Reference-IRGSP-1.0。選用PAGE電泳，只需合成普通引物，采用單引物電泳；選用熒光毛細(xì)管電泳，應(yīng)在正向引物的5’端標(biāo)記熒光染料合成引物，采用單引物或組合引物電泳。表1新增的28對真實性驗證或身份鑒定引物編號引物名稱染色體（位置bp）退火溫度℃引物序列（5'→3'）標(biāo)記熒光R49RM13311（1670278）55正向：CACCAGCTTCATGCATGCFAM反向：AGCACTCAACTGATGCAGTGR50RM91（23326225）55正向：GGTGCCATTGTCGTCCTCVIC反向：ACGGCCCTCATCACCTTCR51RM38251（36471203）55正向：AAAGCCCCCAAAAGCAGTACVIC反向：GTGAAACTCTGGGGTGTTCGR52ZY24.5-2-62（5126573）55正向：CACTCCTACTTCCTCCGTTFAM反向：AGGCGTGATGTTCTACTGTTAR53RM13582（10185685）55正向：GATCGATGCAGCAGCATATGNED反向：ACGTGTGGCTGCTTTTGCR54RM54722（30643072）55正向：CACTCAAGACCAGACCTGTACGPET反向：CGGCACGTCATTGTAGTGACR55RM2183（8406429）55正向：TGGTCAAACCAAGGTCCTTCFAM反向：GACATACATTCTACCCCCGGR56RM32973（13289444）55正向：CTCGTACTCCTCTTCCACCGVIC反向：GTAACCTAGCTGCCCCTTCCR57LG25.4-3-13（25378971）55正向：AACTGAATAATAAGCCAACCPET反向：AGAATGCTCTGAGGGATGTR58XG16.6-4-14（15247546）55正向：AAAGTGTCCCAGTCCATTFAM反向：CCTTTACTCGCCAGATGCR59RM13594（20032557）55正向：CTCGCGAGGAAGAAGACAACPET反向：CGCCGGCTGGTTAATTAATCR60RM37965（488187）55正向：ATTAGCCTTTAATTCCACTGFAM反向：ATACAAACAAACAGCTTGTGR61RM11155（14816294）55正向：GCTGCAATTTATACCGGAGGPET反向：AGCCACCACCATCTATCTGCR62RM31836（12448177）55正向：GCTCCACAGAAAAGCAAAGCVIC反向：TGCAACAGTAGCTGTAGCCGR63RM71936（20258707）55正向：ATGTGGGAATTTCTAGCCCCNED反向：CCCTAGTTTTCCAAATGGCCR64RM4126（30328850）55正向：CACTTGAGAAAGTTAGTGCAGCFAM反向：CCCAAACACACCCAAATAC注：標(biāo)記熒光欄中所列的熒光標(biāo)記如FAM等僅作為示例，只適用于本文件中的檢測平臺使用。表1（續(xù)）編號引物名稱染色體（位置bp）退火溫度℃引物序列（5'→3'）標(biāo)記熒光R65RM57117（3142306）55正向：GTCCATGCATCCATCTCTAGFAM反向：ACGGAAGGAATACGTCTGTAR66RM68727（4660489）55正向：GGATGAACACTGATGATGGCFAM反向：ACCTCCACCACGATATCCACR67RM547N8（5592401）55正向：GTCAAGATCATCCTCGTAGCNED反向：TGTCGATTGTATCAGTTTGGR68RM228258（11759304）55正向：AGCACATCACAAACCTACCCTACCVIC反向：CCTAATTAATCCCGCGGAACCR69RM54858（24072903）55正向：CTTCCACAAGCTTGGCTAGGPET反向：AATGCCATCCCCTACTCATGR70WY13.3-99（13265227）55正向：CTGACTCCGACATCCGAAACFAM反向：AACCCTGGCAAGTAGTAAAGR71RM568910（13554862）55正向：GCACATGGTGAGACGTCCTCFAM反向AAGTCCTGTAGTAGGTCACACCGR72RM5918N11（3025975）55正向：AAAGGAAAGCCACAGAAGTGNED反向：TTGCAACCAGGTTGGTAAGAR73RM536N11（8990595）55正向：ACATGCACCAGAGTTCATAATFAM反向：TTTCTTTGCTCAGACCTTACAR74RM2780812（7358562）55正向:GGAAGTGCCCGATTAGTATAGGFAM反向:ATCACCTACTACCTCCATTTCAGGR75ZY15.1-12-412（24434567）55正向：TAACGGTTGGATGTTTTGCTFAM反向：AGAGTTTTCGATGCTTTGATR76RM697312（694000）55正向：CAACTCCAGCTTCGCCAACVIC反向：CGGCCACACCTAAATAAACG注：標(biāo)記熒光欄中所列的熒光標(biāo)記如FAM等僅作為示例，只適用于本文件中的檢測平臺使用。5.4.2品種純度檢測引物表2給出了13對品種純度檢測推薦引物，作為優(yōu)先篩選的候選引物。篩選時，可用至少含20粒的小樣品進(jìn)行試驗，依據(jù)5.3的要求，確定適宜的引物或引物組合。推薦的13對引物未達(dá)到效果的，可選擇另外63對引物或其他引物進(jìn)行篩選。表2品種純度檢測推薦引物編號引物名稱染色體（位置bp）退火溫度℃引物序列（5'→3'）標(biāo)記熒光PR01RM5831（8329859）55正向：AGATCCATCCCTGTGGAGAGFAM反向：GCGAACTCGCGTTGTAATCPR07RM3367（21872197）55正向：CTTACAGAGAAACGGCATCGVIC反向：GCTGGTTTGTTTCAGGTTCGPR14RM2082（35141667）55正向：TCTGCAAGCCTTGTCTGATGPET反向：TAAGTCGATCATTGTGTGGACCPR18RM2536（5426496）55正向：TCCTTCAAGAGTGCAAAACCPET反向：GCATTGTCATGTCGAAGCCPR19RM4817（2876164）55正向：TAGCTAGCCGATTGAATGGCFAM反向：CTCCACCTCCTATGTTGTTGPR23RM22411（27673250）55正向：ATCGATCGATCTTCACGAGGNED反向：TGCTATAAAAGGCATTCGGGPR43RM5674（34718825）55正向：ATCAGGGAAATCCTGAAGGGFAM反向：GGAAGGAGCAATCACCACTGPR46RM2789（19320429）55正向：GTAGTGAGCCTAACAATAATCNED反向：TCAACTCAGCATCTCTGTCCR57LG25.4-3-13（25378971）55正向：AACTGAATAATAAGCCAACCPET反向：AGAATGCTCTGAGGGATGTR65RM57117（3142306）55正向：GTCCATGCATCCATCTCTAGFAM反向：ACGGAAGGAATACGTCTGTAR67RM547N8（5592401）55正向：GTCAAGATCATCCTCGTAGCNED反向：TGTCGATTGTATCAGTTTGGR71RM568910（13554862）55正向：GCACATGGTGAGACGTCCTCFAM反向：AAGTCCTGTAGTAGGTCACACCGR74RM2780812（7358562）55正向：GGAAGTGCCCGATTAGTATAGGFAM反向：ATCACCTACTACCTCCATTTCAGG注：標(biāo)記熒光欄中所列的熒光標(biāo)記如FAM等僅作為示例，只適用于本文件中的檢測平臺使用。6結(jié)果報告真實性鑒定和純度檢測的結(jié)果報告應(yīng)符合GB/T39917—2021的要求。附錄A（資料性）等位基因擴增片段信息表A.1列出了76對引物在江蘇推廣粳稻品種及部分秈稻品種中擴增的片段長度范圍、主要等位基因擴增片段大小，以及參照樣品對應(yīng)的擴增片段信息。其中參照樣品只是列舉，考慮到在某一SSR位點多個品種存在相同的擴增片段大小，確認(rèn)某一品種在該位點擴增片段大小與參照樣品是相同的，該品種也可替代相應(yīng)的參照樣品。另外，GB/T39917-2021中的48對引物在本表中的擴增范圍是與GB/T39917-2021給出的范圍間進(jìn)行了整合，保留了最大擴增范圍值。表A.1已知品種主要等位基因擴增片段信息引物等位基因擴增片段參照樣品編號名稱范圍/bp片段定義/bp名稱擴增片段/bpPR01RM583

157~198157保稻701157/157178鎮(zhèn)糯19號178/178180浙粳優(yōu)1758180/189183武育粳18號183/183186蘇秀326號186/186189太湖糯2號189/189192淮糯12號192/192195蘇香粳3號195/195198武運粳23號198/198PR02RM424

239~287239蘇香粳3號239/239278連黑糯1號278/278287PR03RM85

75~1407580蘇香粳3號80/8085武香粳10085/8595甬優(yōu)16號85/95140PR04RM471

98~12098鹽稻18號98/100100豐粳1606100/104102蘇香粳2號102/102104蘇香粳3號104/104120PR05RM598144~168144甬優(yōu)1516144/147147甬優(yōu)1516144/147150武運粳29號150/150156淮稻56156/156159武育粳18號159/159表A.1（續(xù)）引物等位基因擴增片段參照樣品編號名稱范圍/bp片段定義/bp名稱擴增片段/bpPR05RM598144~168162蘇香粳3號162/162165168甬優(yōu)2640168/168PR06RM190

103~126103鎮(zhèn)稻16號103/103120蘇香粳3號120/120122鎮(zhèn)稻15號122/122124揚粳3012124/124126太湖糯2號126/126PR07RM336

119~196119136太湖糯2號136/136145148蘇香粳2號148/148154揚育粳2號154/154157皖墾粳516157/157160太湖糯160/160163鹽稻10號163/163166蘇香粳3號166/166169金地糯288169/169191193196PR08RM72

147~214147甬優(yōu)4543147/151151常優(yōu)粳11號151/151154鎮(zhèn)稻32號154/154156甬優(yōu)1662156/156172南粳9108172/172175蘇香粳3號175/175184187鎮(zhèn)稻11號187/187190武運粳24號190/190214PR09RM219

182~248182184186蘇秀10號186/186188190192淮稻13號192/192表A.1（續(xù)）引物等位基因擴增片段參照樣品編號名稱范圍/bp片段定義/bp名稱擴增片段/bpPR09RM219

182~248194196198鎮(zhèn)稻13198/198200華豐稻1號200/200202南粳55202/202220金香糯1號220/220230連粳18號230/230244淮稻33244/244248PR10RM590

117~150117132134甬優(yōu)6818134/136136甬優(yōu)6818134/136139蘇香粳3號139/139142145甬優(yōu)1516139/145148常優(yōu)粳13號139/148150PR11RM209

102~162102鎮(zhèn)稻18號102/102104常農(nóng)粳6號104/104108111連粳10號111/111118鹽糯17118/118121鹽田育3號121/121126蘇香粳2號126/126128津稻263128/128134常農(nóng)粳10號134/134139連粳17號139/139141甬優(yōu)2640141/141152蘇秀326號152/152162PR12RM19

209~252209鹽稻12號209/209213南粳5718213/213216蘇香粳2號216/216233浙粳優(yōu)1758233/235235浙粳優(yōu)1758233/235242寧粳8號242/242表A.1（續(xù)）引物等位基因擴增片段參照樣品編號名稱范圍/bp片段定義/bp名稱擴增片段/bpPR12RM19

209~252246蘇香粳3號246/246252PR13RM1195

138~152138142常優(yōu)粳158142/146144中江粳228144/144146南粳55146/146148150152常農(nóng)粳13號152/152PR14RM208

159~181159167蘇香粳2號167/167169泗稻785169/169171太湖糯2號171/171175179蘇香粳3號179/179181揚育粳2號181/181PR15RM232121~179121129蘇鹽粳302129/129150152蘇香粳2號152/152158蘇香粳3號158/158160通粳981160/160162金粳18162/162179PR16RM119

153~190153武運粳29號153/153157163166蘇香粳3號166/166190PR17RM267136~168136蘇香粳3號136/136138太湖糯2號138/138168PR18RM253

117~163117甬優(yōu)16號117/117125武香糯7368125/125129蘇稻5號129/129131武育粳18號131/131135蘇香粳3號135/135表A.1（續(xù)）引物等位基因擴增片段參照樣品編號名稱范圍/bp片段定義/bp名稱擴增片段/bpPR18RM253

117~163137通優(yōu)粳1號137/137141143149豐粳3227149/149151鎮(zhèn)稻16號151/151154武育粳39號154/154163PR19RM481

138~189138141太湖糯141/141144鹽稻10號144/144147甬優(yōu)2640144/147156159南粳優(yōu)293159/162162南粳優(yōu)293159/162165蘇香粳3號165/165168171連粳13號171/171180甬優(yōu)6711147/180189PR20RM339

130~187130甬優(yōu)1516130/137137鎮(zhèn)稻15號137/137140華粳15號140/140143蘇香粳3號143/143187廣陵優(yōu)粳187/187PR21RM316

190~214190192甬優(yōu)16號192/192194蘇香粳2號194/194196南粳9108196/196214南粳優(yōu)293214/214PR22RM258

126~167126128130134144146148揚農(nóng)粳1030148/148167表A.1（續(xù)）引物等位基因擴增片段參照樣品編號名稱范圍/bp片段定義/bp名稱擴增片段/bpPR23RM224117~159117123蘇香粳3號123/123125太湖糯125/125139通粳981139/139141廣陵優(yōu)粳141/141157常農(nóng)粳6號157/157159武運粳24號159/159PR24RM17

143~189143太湖糯2號143/143156蘇香粳3號156/156159泗稻785159/159161泗稻20號161/161166鎮(zhèn)糯19號166/166189PR25RM493

208~266208212蘇香粳3號212/212236甬優(yōu)1516212/236242245揚育粳2號245/245248武運粳23號248/248266PR26RM561181~198181常優(yōu)粳10號181/185185連粳11號185/185187蘇香粳3號187/187191蘇香粳2號191/191195太湖糯195/195198PR27RM8277

163~217163甬優(yōu)6718163/179167遷粳26號167/167179甬優(yōu)16號179/203182常優(yōu)粳7號182/209185華粳7號185/185188鹽田育3號188/188191鎮(zhèn)稻448191/191197連粳11號197/197200203蘇香粳3號203/203206連粳10號206/206表A.1（續(xù)）引物等位基因擴增片段參照樣品編號名稱范圍/bp片段定義/bp名稱擴增片段/bpPR27RM8277

163~217209武運粳29號209/209212豐粳1606212/212217PR28RM551

166~210166178184186188蘇香粳3號188/188190華粳7號190/190194連粳11號194/194210PR29RM274146~162146149蘇香粳3號149/149152武運粳27號152/152162揚育粳2號162/162PR30RM176

113~136113117常農(nóng)粳6號117/117123泗稻20號123/123127蘇香粳2號127/127133太湖糯2號133/133136蘇香粳3號136/136PR31RM432

168~188168常優(yōu)粳7號168/188172鎮(zhèn)稻13172/172184蘇墾118184/184188蘇香粳3號188/188PR32RM331

146~176146149152太湖糯2號152/152155蘇香粳2號155/155158廣陵優(yōu)粳158/158176PR33OSR28133~187133169南粳5055169/169172蘇香粳3號172/172175金粳18175/175181甬優(yōu)2640172/181187常優(yōu)粳6號172/187表A.1（續(xù)）引物等位基因擴增片段參照樣品編號名稱范圍/bp片段定義/bp名稱擴增片段/bpPR34RM311

156~190156揚農(nóng)香28156/156158揚育粳2號158/158162蘇香粳3號162/162166176常農(nóng)粳11號176/176182寧香粳9號182/182184186188揚農(nóng)糯418188/188190甬優(yōu)4543190/190PR35RM21

122~168122蘇香粳2號122/122124揚育粳2號124/124130泗稻20號130/130132華粳7號132/132134太湖糯134/134136蘇香粳3號136/136140南粳9212140/140142太湖糯2號142/142146武運粳27號146/146152南粳晴谷152/152154常優(yōu)粳10號154/154156鎮(zhèn)稻14156/156158新稻25158/158160162常農(nóng)粳6號162/162164甬優(yōu)4543139/164168豐粳200168/168PR36RM3331

106~166106110常優(yōu)粳11號110/128118122連粳15號122/122126蘇香粳3號126/126128蘇香粳2號128/128130南粳優(yōu)293126/130166PR37RM443

109~139109121蘇香粳3號121/121表A.1（續(xù)）引物等位基因擴增片段參照樣品編號名稱范圍/bp片段定義/bp名稱擴增片段/bpPR37RM443

109~139123常農(nóng)粳7號123/123139PR38RM490

87~1088791通優(yōu)粳1號91/9193常優(yōu)粳15893/9997蘇香粳3號97/9799太湖糯2號99/99103105108南粳9108108/108PR39RM71

113~214113118121鎮(zhèn)稻15號121/121123蘇香粳3號123/123148揚育粳3號148/148214PR40RM423244~304244268上農(nóng)粳219268/268271蘇香粳3號271/271289蘇秀867號289/289304PR41RM571

163~204163180甬優(yōu)6711180/186184皖墾粳516184/184186蘇香粳3號186/186188太湖糯188/188204PR42RM231168~196168172甬優(yōu)1662172/172188甬優(yōu)6818188/194192太湖糯2號192/192194蘇香粳3號194/194196鎮(zhèn)稻36號196/196PR43RM567

239~280239鎮(zhèn)稻17239/239244連粳11號244/244248連糯1號248/248250金粳18250/250表A.1（續(xù)）引物等位基因擴增片段參照樣品編號名稱范圍/bp片段定義/bp名稱擴增片段/bpPR43RM567

239~280252254256武運粳29號256/256258260266通粳981266/266270甬優(yōu)16號270/270280連粳7號280/280PR44RM289

71~12771889092108通粳981

108/108127PR45RM542

71~1167188鎮(zhèn)稻11號88/8890100102106108110112114116PR46RM278126~158126中稻1號126/126128蘇香粳3號128/128140142144150武育粳528150/150158PR47RM332

155~179155158161連粳11號161/161164蘇香粳3號164/164167鎮(zhèn)糯20號167/167179表A.1（續(xù)）引物等位基因擴增片段參照樣品編號名稱范圍/bp片段定義/bp名稱擴增片段/bpPR48RM7102168~199168蘇香粳2號168/168170淮粳801170/170176188蘇香粳3號188/188190淮稻36190/190199甬優(yōu)6718168/199R49RM1331123~145123鹽稻10號123/123131蘇香粳3號131/131133137南粳9108137/137139通優(yōu)粳1號139/139143145常優(yōu)粳7號131/145R50RM9111~199111121大糧202121/143126蘇香粳3號126/126128揚育粳2號128/128131135甬優(yōu)4543135/182137連黑糯1號137/137139揚育粳3號139/139143連粳7號143/143148武運6296148/148152156159180泗稻20號180/180182通粳981182/182184甬優(yōu)1526184/184186太湖糯2號186/186189揚農(nóng)稻1號189/189199R51RM3825130~163130139145常優(yōu)粳11號145/158148連糯1號148/148150淮稻13號150/150表A.1（續(xù)）引物等位基因擴增片段參照樣品編號名稱范圍/bp片段定義/bp名稱擴增片段/bpR51RM3825130~163154蘇香粳2號154/154156連粳11號156/156158蘇香粳3號158/158160寧香粳11160/160163常農(nóng)粳8號163/163R52ZY24.5-2-6206~258206蘇秀326號206/206208皖墾粳1514208/208211徐稻15號211/211224甬優(yōu)1526224/228228常優(yōu)粳7號224/228231揚農(nóng)粳1030231/231233蘇香粳3號233/233236蘇稻5號236/236244華粳7號244/244250泗稻15號250/250252太湖糯2號252255蘇香粳2號255/255258R53RM1358150~190150153常農(nóng)粳16號153/153155157太湖糯157/157164南粳9108164/164166南粳5818166/166168174連黑糯1號174/174176鹽粳21號176/176178淮稻13號178/178180蘇香粳3號180/180182常農(nóng)粳12號182/182190常優(yōu)粳7號164/190R54RM5472134~179134甬優(yōu)6711134/145145太湖糯145/145150蘇秀10號150/150152蘇香粳3號152/152154華粳7號154/154163連粳11號163/163表A.1（續(xù)）引物等位基因擴增片段參照樣品編號名稱范圍/bp片段定義/bp名稱擴增片段/bpR54RM5472134~179165167甬優(yōu)2640134/167169177134/177179常優(yōu)粳10號154/179R55RM218114~154114太湖糯114/114119蘇粳1180119/119123126南粳518126/126128徐稻3號128/128131134蘇香粳2號134/134136金武粳1號136/136145南粳9108145/145154武運粳80154/154R56RM3297151~180151蘇香粳3號151/151162蘇香粳2號162/162168172175178180R57LG25.4-3-1144~171144蘇秀326號144/144151153新稻20153/153155太湖糯155/155169中科鹽3號169/169171蘇香粳3號171/171R58XG16.6-4-1192~219192寧粳5號192/192198武育粳377198/198213蘇香粳3號213/213215南粳0212215/215219鎮(zhèn)稻448219/219R59RM1359115~150115甬優(yōu)4543115/121121蘇香粳2號121/121123泗稻301123/123129太湖糯2號129/129表A.1（續(xù)）引物等位基因擴增片段參照樣品編號名稱范圍/bp片段定義/bp名稱擴增片段/bpR59RM1359115~150133南粳9108133/133135鎮(zhèn)稻14135/135137蘇香粳3號137/137140新科稻21140/140143常農(nóng)粳7號143/143150R60RM379684~10684鎮(zhèn)稻11號84/8489蘇香粳3號89/8992太湖糯92/929597連粳17號97/97102寧粳5號102/102104淮稻14號104/104106徐稻11號106/106R61RM1115139~163139揚粳糯2號139/139146148武運6296148/148152廣陵優(yōu)粳152/152155157蘇香粳3號157/157161甬優(yōu)2640161/161163常農(nóng)粳16號163/163R62RM3183121~140121寧粳5號121/121124新稻20124/140133138蘇秀326號138/138140蘇香粳3號140/140R63RM7193127~200127137蘇香粳3號137/137139蘇秀10號139/139146淮稻26號146/146155南粳8911155/155157159連糯1號159/159163金香玉1號163/163174176鎮(zhèn)稻16號176/176200表A.1（續(xù)）引物等位基因擴增片段參照樣品編號名稱范圍/bp片段定義/bp名稱擴增片段/bpR64RM412171~198171蘇香粳2號171/171173揚粳5118173/173179常農(nóng)粳16號179/179190武育粳18號190/190196大糧202196/196198蘇香粳3號198/198R65RM5711110~164110113蘇香粳3號113/113115鎮(zhèn)稻18號115/115117華瑞稻1號117/117119揚農(nóng)糯418119/119123126常優(yōu)粳7號126/129129常優(yōu)粳11號126/129132甬優(yōu)1516132/152135蘇研9981135/135138泰香粳999138/138142武香粳9127142/142145寧粳5號145/145148蘇秀326號148/148152甬優(yōu)1516132/152154常優(yōu)粳6號148/154161徐稻19號161/161164R66RM687274~9274華瑞稻1號74/7478蘇香粳3號78/788186通粳98186/8690南粳505590/9092寧粳5號92/92R67RM547N110~195110119140144甬優(yōu)1526144/147147太湖糯2號147/147150武育粳18號150/150153南粳49153/153表A.1（續(xù)）引物等位基因擴增