B站生信教程 13 GSEA學(xué)習(xí)資料

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基因集富集分析

GSEA

(Gene-setenrichmentanalysis)

2021.08.11一種是基于篩選的差異基因

另一種是不篩選差異基因,預(yù)定義的基因集A，自己的表達(dá)數(shù)據(jù)集B（排序）。富集分析：圖片來源:

MolOmics.2019;15(1):50-58.

Geneexpressionprofile-baseddrugscreenidentifiesSAHAasanoveltreatmentforNAFLD?每一條垂直線表示基因集中的一個基因。

ES:代表基因集下基因在排序列表的頂部或底部被過表達(dá)的程度。

圖片來源：FrontOncol.2020;18;10:591356.

DevelopmentofaNovelAutophagy-RelatedPrognosticSignatureandNomogramforHepatocellularCarcinoma累計的ES

歸一化后的ES

FDRq-val是多重假設(shè)檢驗矯正后的p值

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