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文檔簡介
生物化學(xué)復(fù)習(xí)-蛋白質(zhì)第一頁,共87頁。
第一節(jié)蛋白質(zhì)的元素組成
N含量在各種蛋白質(zhì)中比較接近
15%~18%
,平均為16%。每1g氮相當(dāng)于6.25g的蛋白質(zhì)
蛋白質(zhì)平均含N量為16%,這是凱氏定氮法測定蛋白質(zhì)含量的理論依據(jù):
粗蛋白質(zhì)含量=蛋白質(zhì)含N量×6.25第二頁,共87頁。方法:常用6mol/L的鹽酸或4mol/L的硫酸,回流煮沸時間約20h。優(yōu)點(diǎn):不引起消旋作用,得到的是L-氨基酸。缺點(diǎn):色氨酸被沸酸完全破壞;含有羥基的氨基酸(絲氨酸、蘇氨酸)有一小部分被分解;天冬酰胺和谷氨酰胺的酰胺基被水解成了羧基。第二節(jié)蛋白質(zhì)的氨基酸組成
1.酸水解一、蛋白質(zhì)的水解第三頁,共87頁。2.堿水解方法:一般用5mol/L氫氧化鈉煮沸10-20h。
優(yōu)點(diǎn):色氨酸在水解中不受破壞。
缺點(diǎn):多數(shù)氨基酸受到不同程度的破壞,產(chǎn)生消旋現(xiàn)象,得到的是D-和L-氨基酸的混合物。此外,引起精氨酸脫氨(生成鳥氨酸和尿素)。第四頁,共87頁。3.酶水解方法:用于蛋白質(zhì)肽鏈斷裂的蛋白水解酶或稱蛋白酶(proteinase)已有十多種,常用的有胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶(或稱糜蛋白酶)及胃蛋白酶等。優(yōu)點(diǎn):不產(chǎn)生消旋作用,也不破壞氨基酸。水解位點(diǎn)特異,用于一級結(jié)構(gòu)分析,肽譜
缺點(diǎn):使用一種酶往往水解不徹底,需幾種酶協(xié)同作用才能使蛋白質(zhì)完全水解。該法主要用于部分水解。第五頁,共87頁。二、氨基酸的功能:
1.組成蛋白質(zhì)2.一些aa及其衍生物充當(dāng)化學(xué)信號分子
-aminobutyricacid(
-氨基丁酸)、Serotonic(5-羥色胺,血清緊張素)、melatonin(褪黑激素,N-乙酰-甲氧基色胺),都是神經(jīng)遞質(zhì),后二者是色氨酸衍生物(神經(jīng)遞質(zhì)是一個神經(jīng)細(xì)胞產(chǎn)生的影響第二個神經(jīng)細(xì)胞或肌肉細(xì)胞功能的物質(zhì))。Thyroxine(甲狀腺素,動物甲狀腺thyroidgland產(chǎn)生的Tyr衍生物)和吲哚乙酸(植物中的Trp衍生物)都是激素(激素就是一個細(xì)胞產(chǎn)生的調(diào)節(jié)其它細(xì)胞的功能的化學(xué)信號分子)。第六頁,共87頁。
3.氨基酸是許多含N分子的前體物
核苷酸和核酸的含氮堿基、血紅素、葉綠素的合成都需要aa
4.一些基本氨基酸和非基本aa是代謝中間物
精氨酸、Citrulline(瓜氨酸)、Ornithine(鳥氨酸)是尿素循不(Ureacycle)的中間物,含氮廢物在脊椎動物肝臟中合成尿素是排除它們的一種重要機(jī)制。第七頁,共87頁。
三、氨基酸的結(jié)構(gòu)與分類1809年發(fā)現(xiàn)Asp,1938年發(fā)Thr,目前已發(fā)現(xiàn)180多種。但是組成蛋白質(zhì)的aa常見的有20種,稱為基本氨基酸(編碼的蛋白質(zhì)氨基酸),還有一些稱為稀有氨基酸,是多肽合成后由基本aa經(jīng)酶促修飾而來。此外還有存在于生物體內(nèi)但不組成蛋白質(zhì)的非蛋白質(zhì)氨基酸(約150種)。(一)編碼的蛋白質(zhì)氨基酸(20種)也稱基本氨基酸或標(biāo)準(zhǔn)氨基酸,有對應(yīng)的遺傳密碼。
第八頁,共87頁。α-氨基酸的一般結(jié)構(gòu)氨基在α-位,為L-構(gòu)型.除脯氨酸外,均為α-氨基酸除甘氨酸外,均為手性氨基酸第九頁,共87頁。氨基酸的分類1.按R基的化學(xué)結(jié)構(gòu)分類
可以分為三類:脂肪族、芳香族和雜環(huán)族
脂肪族氨基酸含一氨基一羧基的中性氨基酸甘氨酸Gly,G丙氨酸Ala,A纈氨酸Val,V亮氨酸Leu,L異亮氨酸Ile,I第十頁,共87頁。R基均為中性烷基(Gly為H),R基對分子酸堿性影響很小,它們幾乎有相同的等電點(diǎn)。(6.0±0.03)
Gly是唯一不含手性碳原子的氨基酸,因此不具旋光性。從Gly至Ile,R基團(tuán)疏水性增加,Ile是這20種a.a中脂溶性最強(qiáng)的之一(除Phe2.5、Trp3.4、Tyr2.3以外)。
第十一頁,共87頁。絲氨酸(Ser,S)蘇氨酸(Thr,T)半胱氨酸(Cys,C)甲硫氨酸(Met,M)含羥基或硫脂肪族氨基酸第十二頁,共87頁。含羥基的有兩種:Ser和ThrSer的-CH2OH基(pKa=15),在生理?xiàng)l件下不解離,但它是一個極性基團(tuán),能與其它基團(tuán)形成氫鍵,具有重要的生理意義。在大多數(shù)酶的活性中心都發(fā)現(xiàn)有Ser殘基存在。
Thr中的-OH是仲醇,具有親水性,但此-OH形成氫鍵的能力較弱,因此,在蛋白質(zhì)活性中心中很少出現(xiàn)。Ser和Thr的-OH往往與糖鏈相連,形成糖蛋白。含硫的兩種:Cys、Met
Cys中R含巰基(-SH),Cys具有兩個重要性質(zhì):(1)在較高pH值條件,巰基離解。(2)兩個Cys的巰基氧化生成二硫鍵,生成胱氨酸
(Cys—s—s—Cys)
第十三頁,共87頁。
二硫鍵在蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)中具有重要意義。
Cys還常常出現(xiàn)在酶的活性中心。Met的R中含有甲硫基(-SCH3),硫原子有親核性,易發(fā)生極化,因此,Met是一種重要的甲基供體。Cys與結(jié)石在細(xì)胞外液如血液中,Cys以胱氨酸(Cystine)氧化形式存在,胱氨酸的溶解性最差。胱氨酸尿(Cystinuria)是一種遺傳病,由于胱氨酸的跨膜運(yùn)輸缺陷導(dǎo)致大量的胱氨酸排泄到尿中。胱氨酸在腎(Kidney)、輸尿管(ureter)、膀胱(urinarybladder)中結(jié)晶形成結(jié)石(Calculus,calculi),結(jié)石會導(dǎo)致疼痛、發(fā)炎甚至尿血。大量服用青霉胺(Penicillcemine)能降低腎中胱氨的含量,因?yàn)榍嗝拱放c半胱氨酸形成的化合物比胱氨酸易溶解。第十四頁,共87頁。酸性氨基酸及酰胺天冬氨酸(Asp,D)谷氨酸(Glu,E)天冬酰胺(Asn,N)谷氨酰胺(Gln,Q)第十五頁,共87頁。Asp、Glu,一般稱酸性氨基酸Asp側(cè)鏈羧基pKa(β-COOH)為3.86,Glu側(cè)鏈羧基pKa(γ-COOH)為4.25它們是在生理?xiàng)l件下帶有負(fù)電荷的僅有的兩個
氨基酸。Asn、Gln
酰胺基中氨基易發(fā)生氨基轉(zhuǎn)移反應(yīng),轉(zhuǎn)氨基反應(yīng)在生物合成和代謝中有重要意義第十六頁,共87頁。堿性氨基酸
賴氨酸(Lys,K)精氨酸(Arg,R)組氨酸(His,H)雜環(huán)第十七頁,共87頁。Lys的R側(cè)鏈上含有一個氨基,側(cè)鏈氨基的pKa為10.53。生理?xiàng)l件下,Lys側(cè)鏈帶有一個正電荷(—NH3+),同時它的側(cè)鏈有4個C的直鏈,柔性較大,使側(cè)鏈的氨基反應(yīng)活性增大。(如肽聚糖的短肽間的連接)Arg是堿性最強(qiáng)的氨基酸,側(cè)鏈上的胍基是已知堿性最強(qiáng)的有機(jī)堿,pKa值為12.48,生理?xiàng)l件下完全質(zhì)子化。第十八頁,共87頁。His含咪唑環(huán),咪唑環(huán)的pKa在游離氨基酸中和在多肽鏈中不同,前者pKa為6.00,后者為7.35,它是20種氨基酸中側(cè)鏈pKa值最接近生理pH值的一種,在接近中性pH時,可離解平衡。它是在生理pH條件下唯一具有緩沖能力的氨基酸。His含咪唑環(huán),一側(cè)去質(zhì)子化和另一側(cè)質(zhì)子化同步進(jìn)行,因而在酶的酸堿催化機(jī)制中起重要作用。第十九頁,共87頁。2、芳香族氨基酸苯丙氨酸(Phe,F)酪氨酸(Tyr,Y)色氨酸(Trg,W)第二十頁,共87頁。都具有共軛π電子體系,易與其它缺電子體系或π電子體系形成電荷轉(zhuǎn)移復(fù)合物(charge-transfercomplex)或電子重疊復(fù)合物。在受體—底物、或分子相互識別過程中具有重要作用。這三種氨基酸在近紫外區(qū)有特殊吸收峰,蛋白質(zhì)的紫外吸收主要來自這三種氨基酸,在280nm處,Trp>Tyr>Phe。Phe疏水性最強(qiáng).。酪氨酸的-OH磷酸化是一個十分普遍的調(diào)控機(jī)制,Tyr在較高pH值時,酚羥基離解。Trp有復(fù)雜的π共軛休系,比Phe和Tyr更易形成電荷轉(zhuǎn)移絡(luò)合物。第二十一頁,共87頁。3、雜環(huán)氨基酸組氨酸(His,H)脯氨酸(Pro,P)第二十二頁,共87頁。Pro,有時也把His、Trp歸入此類。Pro是唯一的一種環(huán)狀結(jié)構(gòu)的氨基酸,它的α-亞氨基是環(huán)的一部分,因此具有特殊的剛性結(jié)構(gòu)。它在蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)中具有極重要的作用,一般出現(xiàn)在兩段α-螺旋之間的轉(zhuǎn)角處,Pro殘基所在的位置必然發(fā)生骨架方向的變化第二十三頁,共87頁。2.按R基的極性分類(能否與水形成氫鍵)
20種基本氨基酸可以分成以下四組:
1、非極性氨基酸(八種)
Ala、Val、Leu、Ile、Phe、Trp、Met、Pro
這類氨基酸的R基都是疏水性的,在維持蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)中起著重要作用。2、極性不帶電荷的氨基酸(七種)
6種,絲氨酸、蘇氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺。這類氨基酸的側(cè)鏈都能與水形成氫鍵,因此很容易溶于水。酪氨酸的-OH磷酸化是一個十分普遍的調(diào)控機(jī)制,Ser和Thr的-OH往往與糖鏈相連,Asn和Gln的-NH2很容易形成氫鍵,因此能增加蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性。第二十四頁,共87頁。3、極性帶正電荷的氨基酸
三種堿性氨基酸:Lys、Arg、His
在pH7時帶正電荷。當(dāng)膠原蛋白中的Lys側(cè)鏈氧化時能形成很強(qiáng)的分子間(內(nèi))交聯(lián)。Arg的胍基堿性很強(qiáng),與NaOH相當(dāng)。His是一個弱堿,在pH6.0時,His的R基50%以上質(zhì)子化,但pH7.0時,質(zhì)子化的分子不到10%His是R基的pK值在7附近的唯一的氨基酸。是天然的緩沖劑,它往往存在于許多酶的活性中心。
第二十五頁,共87頁。
4、極性帶負(fù)電荷的氨基酸
兩種酸性氨基酸:Asp、Glu。在pH6~7時,谷氨酸和天冬氨酸的第二個羧基解離,因此,帶負(fù)電荷。酶的活性中心:His、Ser、Cys非極性aa一般位于蛋白質(zhì)的疏水核心,帶電荷的aa和極性aa位于表面。
第二十六頁,共87頁。三個有特性的氨基酸
一是脯氨酸(Pro),因?yàn)樗且粋€環(huán)狀的亞氨基酸。它的氨基和其它氨基酸的羧基形成的肽鍵有明顯的特點(diǎn),較易變成順式肽鍵。第二十七頁,共87頁。二是甘氨酸(Gly),它是唯一的在α-碳原子上只有兩個氫原子,沒有側(cè)鏈的氨基酸。為此它既不能和其它殘基的側(cè)鏈相互作用,也不產(chǎn)生任何位阻現(xiàn)象,進(jìn)而在蛋白質(zhì)的立體結(jié)構(gòu)形成中有其特定的作用。第三個是半胱氨酸(Cys)。它的個性不僅表現(xiàn)在其側(cè)鏈有一定的大小和具有高度的化學(xué)反應(yīng)活性,還在于兩個Cys能形成穩(wěn)定的帶有二硫(橋)鍵的胱氨酸。二硫鍵不僅可以在肽鏈內(nèi),也可以在肽鏈間存在。更有甚者,同樣的一對二硫鍵能具有不同的空間取向。
第二十八頁,共87頁。(浙江大學(xué)2006年題)按氨基酸R基的極性性質(zhì)將其分為哪幾類?請寫出各類的性質(zhì),氨基酸的名稱以及三字符號和單子符號解析:主要考察編碼蛋白質(zhì)的20種氨基酸的結(jié)構(gòu)和極性及單字和三字符號第二十九頁,共87頁。二、非編碼的蛋白質(zhì)氨基酸也稱修飾氨基酸,是在蛋白質(zhì)合成后,由基本氨基酸修飾而來。Prothrombin(凝血酶原)中含有
-羧基谷氨酸,能結(jié)合Ca2+。結(jié)締組織中最豐富的蛋白質(zhì)膠原蛋白含有大量4-羥脯氨酸和5-羥賴氨酸。(1)4-羥脯氨酸(2)5-羥賴氨酸這兩種氨基酸主要存在于結(jié)締組織的纖維狀蛋白(如膠原蛋白)中。(3)6-N-甲基賴氨酸(存在于肌球蛋白中)
(4)г-羧基谷氨酸
存在于凝血酶原及某些具有結(jié)合Ca2+離子功能的蛋白質(zhì)中。(5)Tyr的衍生物:3.5-二碘酪氨酸、甲狀腺素(甲狀腺蛋白中)(6)鎖鏈素由4個Lys組成(彈性蛋白中)。第三十頁,共87頁。(三)非蛋白質(zhì)氨基酸除參與蛋白質(zhì)組成的20多種氨基酸外,生物體內(nèi)存在大量的氨基酸中間代謝產(chǎn)物,它們不是蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)單元,但在生物體內(nèi)具有很多生物學(xué)功能,如尿素循環(huán)中的L-瓜氨酸和L-鳥氨酸。(1)L-型α–氨基酸的衍生物
L-瓜氨酸L-鳥氨酸(2)D-型氨基酸
D-Glu、D-Ala(肽聚糖中)、D-Phe(短桿菌肽S)(3)β-、γ-、δ-氨基酸β-Ala(泛素的前體)、γ-氨基丁酸(神經(jīng)遞質(zhì))。第三十一頁,共87頁。β-丙氨酸是遍多酸(泛酸)(一種維生素)的前體成分γ–氨基丁酸是傳遞神經(jīng)沖動的化學(xué)介質(zhì)
L-瓜氨酸、L-鳥氨酸是尿素循環(huán)的中間體第三十二頁,共87頁。甜菜堿肌氨酸鳥氨酸胍氨酸第三十三頁,共87頁。四、氨基酸的重要理化性質(zhì)(一)一般物理性質(zhì)
α-氨基酸為無色晶體,熔點(diǎn)極高,一般在200℃以上。有的無味、有的味甜、有的味苦、谷氨酸的單鈉鹽有鮮味,是味精的主要成分。各種氨基酸在水中的溶解度差別很大,除胱氨酸和酪氨酸外一般都能溶于水,并能溶解于稀酸或稀堿中,但不能溶解于有機(jī)溶劑。通常酒精能把氨基酸從其溶液中沉淀析出。脯氨酸和羥脯氨酸能溶于乙醇或乙醚中。第三十四頁,共87頁。(二)氨基酸的光吸收構(gòu)成蛋白質(zhì)的20種氨基酸在可見光區(qū)都沒有光吸收,但在遠(yuǎn)紫外區(qū)(<220nm)均有光吸收。在近紫外區(qū)(220-300nm)只有酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸有吸收光的能力,因?yàn)樗鼈兒斜江h(huán)共軛雙鍵系統(tǒng)。
Tyr:max=275nm,275=1.4x103;Phe:max=257nm,257=2.0x102;Trp:max=280nm,280=5.6x103
蛋白質(zhì)由于含有Tyr、Phe、Trp(尤其Tyr和Trp),也有紫外光吸收能力,一般最大吸收在280nm處。第三十五頁,共87頁。分光光度計(jì)定量分析依據(jù):Lambert-Beer定律A=LogIo/I=εCL第三十六頁,共87頁。
所謂兩性離子是指在同一個氨基酸分子上帶有能放出質(zhì)子的-NH3+正離子和能接受質(zhì)子的-COO-負(fù)離子。氨基酸是兩性電解質(zhì)。
(三)、氨基酸的酸堿性質(zhì)第三十七頁,共87頁。氨基酸在晶體和水溶液中主要以兼性離子形式存在α-氨基酸都含有-COOH和-NH2,都是不揮發(fā)的結(jié)晶固體,熔點(diǎn)200-350℃,不溶于非極性溶劑,而易溶于水,這些性質(zhì)與典型的羧酸(R-COOH)或胺(R-NH2)明顯不同。三個現(xiàn)象:①晶體熔點(diǎn)高→離子晶格,不是分子晶格。②不溶于非極性溶劑→極性分子③介電常數(shù)高(氨基酸使水的介電常數(shù)增高,而乙醇、丙酮使水的介電常數(shù)降低。)→水溶液中的氨基酸是極性分子。第三十八頁,共87頁。原因:α-羧基pK1在2.0左右,當(dāng)pH>3.5,α-羧基以-COO-形式存在。α-氨基pK2在9.4左右,當(dāng)pH<8.0時,α-氨基以α-NH3+形式存在。在時,帶有相反電荷,因此氨基酸在水溶液中是以兩性離子離子形式存在。Gly熔點(diǎn)232℃比相應(yīng)的乙酸(16.5℃)、乙胺(80.5℃)高,可推測氨基酸在晶體狀態(tài)也是以兩性離子形式存在。第三十九頁,共87頁。氨基酸的兩性解離性質(zhì)及等電點(diǎn)
pH=pI
凈電荷=0pH<pI凈電荷為正pH>pI凈電荷為負(fù)CHRCOOHNH3+CHRCOONH2CHRCOONH3++H++
OH-+H++
OH-(pK′1)(pK′2)在一定的pH條件下,氨基酸分子中所帶的正電荷數(shù)和負(fù)電荷數(shù)相等,即凈電荷為零,在電場中既不向陽極也不向陰極移動,此時溶液的pH值稱為該種氨基酸的等電點(diǎn)(isoelectricpoint,pI)。--即氨基酸的等電點(diǎn)是它呈現(xiàn)電中性時所處環(huán)境的pH值。1、概念第四十頁,共87頁。氨基酸的解離常數(shù)可用測定滴定曲線的實(shí)驗(yàn)方法求得第四十一頁,共87頁。在pH2.34和pH9.60處,Gly具有緩沖能力。滴定開始時,溶液中主要是Gly+。起點(diǎn):100%Gly+
凈電荷:+1第一拐點(diǎn):50%Gly+
,50%Gly±
平均凈電荷:+0.5第二拐點(diǎn):100%Gly±
凈電荷:0等電點(diǎn)pI第三拐點(diǎn):50%Gly±
,50%Gly-
平均凈電荷:-0.5終點(diǎn):100%Gly-
凈電荷:-1第一拐點(diǎn):pH=pK+lg[Gly±]/[Gly+],pH=pK1=2.34第二拐點(diǎn):100%Gly±,凈電荷為0,此時的pH值稱氨基酸的等電點(diǎn)pI。第三拐點(diǎn):pH=pK2+lg[Gly-]/[Gly±]=pK2=9.6第四十二頁,共87頁。Handerson-Hasselbalch方程:pH=pKa+log[質(zhì)子受體/質(zhì)子供體]計(jì)算緩沖溶液pH的主要公式緩沖容量與緩沖對的濃度有關(guān),越濃緩沖能力越大與pH及pK有關(guān),pH=pK時緩沖能力最大2.計(jì)算緩沖對的濃度比值計(jì)算在任一pH條件下一種酸或堿(或氨基酸)
離子化的百分?jǐn)?shù)第四十三頁,共87頁。2、氨基酸等電點(diǎn)的計(jì)算
可見,氨基酸的pI值等于該氨基酸的兩性離子兩側(cè)的基團(tuán)pK′值之和的二分之一。pI=2pK′1+pK′2一氨基一羧基AA的等電點(diǎn)計(jì)算:pI=2pK′2+pK′3二氨基一羧基AA的等電點(diǎn)計(jì)算:pI=2pK′1+pK′2一氨基二羧基AA的等電點(diǎn)計(jì)算:第四十四頁,共87頁。A.等電點(diǎn)時,氨基酸的溶解度最小,容易沉淀。利用該性質(zhì)可分離制備某些氨基酸。例如谷氨酸的生產(chǎn),即將微生物發(fā)酵液的pH值調(diào)至3.22(谷氨酸的等電點(diǎn))而使谷氨酸沉淀析出。B.利用各種氨基酸的等電點(diǎn)不同,可通過電泳法、離子交換法等在實(shí)驗(yàn)室或工業(yè)生產(chǎn)上進(jìn)行混合氨基酸的分離或制備。氨基酸的等電點(diǎn)可由其分子上解離基團(tuán)的解離常數(shù)來確定--3、應(yīng)用第四十五頁,共87頁。1.某氨基酸溶于pH7的水中,所得氨基酸溶液的pH為8,問此氨基酸的pI是大于8、等于8還是小于8?解析:主要從氨基酸的解離特點(diǎn)考慮,先確定其兩性離子狀態(tài)(即等電點(diǎn)狀態(tài)),然后分析氨基酸溶液變?yōu)?時是從水中吸收了質(zhì)子還是釋放了質(zhì)子。解答:氨基酸晶體主要以兩性離子形式存在,溶于pH7的水中,溶液的pH從7升為8,說明氨基酸在溶解的過程中從水中吸收了質(zhì)子。溶液中有如下平衡:AA±
+H2OAA+
+OH-要使AA+
所帶電荷為零,必須加堿,這會使pH>8,故氨基酸的pI>8。第四十六頁,共87頁。2.計(jì)算下列溶液的pH值:(1)0.1mol/LGly0.05mol/LNaOH的等體積混合液
(2)0.1mol/LGly0.05mol/LHCl的等體積混合液解答:(1)Gly和NaOH的反應(yīng)為:+H3N-CH2-COO-+NaOHH2N-CH2-COO-Na++H2OGly±Gly-0.1mol/LGly0.05mol/LNaOH的等體積混合后[Gly-]=[OH-]=0.05/2=0.025(mol/L)[Gly±]=(0.1-0.05)/2=0.025(mol/L)此時溶液存在如下平衡:+H3N-CH2-COO-H2N-CH2-COO-+H+Ka2根據(jù)公式pH=pKa+lg[質(zhì)子受體/質(zhì)子供體]混合后溶液的pH值為pH=pKa2+lg([Gly-]/[Gly±])=9.6+lg(0.025/0.025)=9.6第四十七頁,共87頁。(2)Gly和HCl的反應(yīng)為:+H3N-CH2-COO-+HClCl-
+H3N-CH2-COOHGly±Gly+0.1mol/LGly0.05mol/LHCl的等體積混合后[Gly+]=[H+]=0.05/2=0.025(mol/L)[Gly±]=(0.1-0.05)/2=0.025(mol/L)此時溶液存在如下平衡:+H3N-CH2-COO-
+H3N-CH2-COOHKa1根據(jù)公式pH=pKa+lg[質(zhì)子受體/質(zhì)子供體]混合后溶液的pH值為pH=pKa1+lg([Gly±]/[Gly+])=2.34+lg(0.025/0.025)=2.34第四十八頁,共87頁。3.制備1LpH3.2,0.1mol/L甘氨酸緩沖液,需0.1mol/L甘氨酸鹽酸鹽(Cl-+H3N-CH2-COOH)和0.1mol/L甘氨酸(+H3N-CH2-COO-)各多少?解答:甘氨酸鹽酸鹽(Cl-+H3N-CH2-COOH)實(shí)際上為二元酸,它的解離式為+H3N-CH2-COO-+H+
+H3N-CH2-COOHKa1Gly±Gly+pH=pKa1+lg([Gly±]/[Gly+]),3.2=2.34+lg([Gly±]/[Gly+])lg([Gly±]/[Gly+])=3.2-2.34=0.86,[Gly±]/[Gly+]=7.24因?yàn)榕渲聘拾彼峋彌_溶液所用的甘氨酸鹽酸鹽和甘氨酸的原始濃度相同,所以它們的濃度之比就是它們所用的體積之比,VGly±
/VGly+=7.24已知緩沖溶液的總體積為1L,VGly±/(1-VGly±
)=7.24,
VGly±=0.879(L),VGly+=0.121(L)第四十九頁,共87頁。(四)氨基酸的化學(xué)性質(zhì)
氨基酸是離子化合物,但在溶液狀態(tài)時,存在下列平衡:化學(xué)反應(yīng)中可用左邊的結(jié)構(gòu)式表示氨基酸。氨基酸分子的α-氨基、α-羧基能參加反應(yīng),有的側(cè)鏈R基團(tuán)也能參加反應(yīng)
第五十頁,共87頁。1.α-NH2參加的反應(yīng)A.?;磻?yīng)①?;噭浩S氧酰氯、叔丁氧甲酰氯、苯二甲酸酐、對-甲苯磺酰氯。這些?;瘎┰诙嚯暮偷鞍踪|(zhì)的人工合成中被用作氨基保護(hù)劑。②丹磺酰氯(DNS-Cl,5—二甲基氨基萘-1-磺酰氯)DNS—Cl可用于多肽鏈—NH2末端氨基酸的標(biāo)記和微量氨基酸的定量測定。NGly—Ala—Ser—Leu—PheC→→→→NDNS—Gly—Ala—Ser—Leu—PheC水解DNS—Gly、Ala、Ser、Leu、PheDNS-氨基酸在紫外光激發(fā)后發(fā)黃色熒光。第五十一頁,共87頁。③(生物體內(nèi))在酶和ATP存在條件下,羧酸也可與氨基酸的氨基作用,形成?;a(chǎn)物。苯甲酸與Gly的氨基的?;磻?yīng)是生物體內(nèi)解毒作用的一個典型的例子。苯甲酸是食品防腐劑,在生物體內(nèi)轉(zhuǎn)變成N-苯甲酰-Gly后,可經(jīng)尿排出。第五十二頁,共87頁。B.烷基化反應(yīng)α-氨基中的氮是一個親核中心,能發(fā)生親核取代反應(yīng)。Sanger反應(yīng)(2,4一二硝基氟苯,DNFB或FDNB)二硝基苯基氨基酸(DNP-氨基酸),黃色,層析法鑒定,被Sanger用來測定多肽的NH2末端氨基酸。Edman反應(yīng)(苯異硫氰酸酯,PITC)苯氨基硫甲酰衍生物(PTC-氨基酸)→苯乙內(nèi)酰硫脲衍生物(PTH-氨基酸)PTH-氨基酸,無色,可以用層析法分離鑒定。被Edman用來鑒定多肽的NH2末端氨基酸第五十三頁,共87頁。
含硫氨基酸的烷基化反應(yīng)硫原子也是親核中心,可發(fā)生親核取代反應(yīng)。生物體內(nèi),最重要的甲基化試劑是S-腺苷甲硫氨酸(SAM),是由Met與ATP作用得到的S-烷基化產(chǎn)物。在酶催化下,SAM可以使多種生物分子的氨基甲基化,如磷脂酰膽堿的生物合成。S-腺嘌呤核苷-高半胱氨酸(比Cys多一個-CH2)第五十四頁,共87頁。C.形成西佛堿反應(yīng)西佛堿是以氨基酸為底物的某些酶促反應(yīng)如轉(zhuǎn)氨基反應(yīng)的中間物。氨基酸的α-氨基能與醛類化合物反應(yīng)生成弱堿,即所謂西佛堿(Schiff’sbase)。第五十五頁,共87頁。D.與甲醛的反應(yīng)
用NaOH滴定氨基酸甲醛滴定法判斷蛋白質(zhì)水解或合成的進(jìn)度第五十六頁,共87頁。E.與亞硝酸的反應(yīng)在標(biāo)準(zhǔn)條件下測定生成的N2體積,即可計(jì)算出氨基酸的量。用途:范斯萊克(VanSlyke)法測定氨基氮的基礎(chǔ)??捎糜诎被岫亢偷鞍踪|(zhì)水解程度的測定。第五十七頁,共87頁。F.與熒光胺反應(yīng)熒光胺熒光產(chǎn)物熒光產(chǎn)物激發(fā)波長λx=390nm,發(fā)射波長
λM=475nm,該反應(yīng)非常靈敏(1ng),可根據(jù)熒光強(qiáng)度εM測定氨基酸含量第五十八頁,共87頁。G.脫氨基反應(yīng)經(jīng)相應(yīng)的氨基酸氧化酶、轉(zhuǎn)氨酶催化的反應(yīng)。第五十九頁,共87頁。2、α-羧基參加的反應(yīng)脫羧基反應(yīng):是生成胺類的重要反應(yīng)成鹽、成酯分別與堿、醇作用,可用于羧基的保護(hù)成酰氯的反應(yīng)(使羧基活化)氨基被保護(hù)后,羧基可與二氯亞砜或五氯化磷反應(yīng),生成酰氯。此反應(yīng)使氨基酸的羧基活化,易與另一個氨基酸的氨基結(jié)合,在多肽的人工合成中常用。第六十頁,共87頁。3、
α-氨基和α-羧基參加的反應(yīng)(1)與茚三酮的反應(yīng)常用于氨基酸的定性或定量檢測脯氨酸和羥脯氨酸與茚三酮反應(yīng)產(chǎn)生黃色物質(zhì),其余所有的α-氨基酸與茚三酮反應(yīng)均產(chǎn)生藍(lán)紫色物質(zhì)。第六十一頁,共87頁。(2)成肽反應(yīng)這是多肽和蛋白質(zhì)生物合成的基本反應(yīng)。第六十二頁,共87頁。(1)Tyr的酚基
在3和5位上可發(fā)生親電取代反應(yīng),如碘化、硝化。
Pauly反應(yīng)——可用于檢測TyrTyr的酚基可以與重氮化合物,如重氮苯磺酸,結(jié)合生成橘黃色化合物橘黃色4.側(cè)鏈R基參加的反應(yīng)第六十三頁,共87頁。(2)His的咪唑基與重氮鹽(重氮苯磺酸)的反應(yīng)棕紅色附:咪唑基的性質(zhì)
組氨酸含有咪唑基,它的pK2值為6.0,在生理?xiàng)l件下具有緩沖作用。組氨酸中的咪唑基能夠發(fā)生多種化學(xué)反應(yīng)??梢耘cATP發(fā)生磷?;磻?yīng),形成磷酸組氨酸,從而使酶活化。組氨酸的咪唑基也能發(fā)生烷基化反應(yīng)。生成烷基咪唑衍生物,并引起酶活性的降低或喪失第六十四頁,共87頁。簡述組氨酸的作用解答:(1)His的咪唑基pK值在氨基酸和多肽鏈中分別為6.00和7.35,后者接近生理?xiàng)l件。故在生理?xiàng)l件下,咪唑基既可以作為質(zhì)子受體,又可以作為質(zhì)子供體,在pH7附近具有明顯的緩沖能力。血紅蛋白由于含有較多的His殘基,使其在pH7附近有明顯的緩沖能力。(2)His的咪唑基供出質(zhì)子或接受質(zhì)子的速度十分迅速,因而在很多酶的活性中心均有His殘基參與(3)組氨酸中的咪唑基能夠發(fā)生多種化學(xué)反應(yīng)。可以與ATP發(fā)生磷?;磻?yīng),形成磷酸組氨酸,從而使酶活化。(4)組氨酸的咪唑基也能發(fā)生烷基化反應(yīng)。生成烷基咪唑衍生物,并引起酶活性的降低或喪失
第六十五頁,共87頁。(3)Cys巰基(-SH)參加的反應(yīng)--性質(zhì)很活潑作用:這些反應(yīng)可用于巰基的保護(hù)。C6H5CH2ClA.在弱堿性條件下,與鹵代烴(如芐氯、碘乙酰胺等)反應(yīng),生成穩(wěn)定的烴基衍生物。第六十六頁,共87頁。作用:與金屬離子的螯合性質(zhì)可用于體內(nèi)解毒。B.與各種金屬離子,如對羥基汞苯甲酸,形成穩(wěn)定程度不同的絡(luò)合物第六十七頁,共87頁。作用:氧化還原反應(yīng)可使蛋白質(zhì)分子中二硫鍵形成或斷裂。胱氨酸+2H-2HC.很容易被氧化形成二硫鍵(-S-S-)第六十八頁,共87頁。次磺酸sulfenic
亞磺酸sulfinic磺酸sulfonicS-nitrosothiolS-nitrothiol第六十九頁,共87頁。(4)羥基參加的反應(yīng)作用:可用于修飾蛋白質(zhì)(酶)。二異丙基氟磷酸
Ser和Thr的羥基能夠與酸作用形成酯。在蛋白質(zhì)分子中,Ser常與磷酸結(jié)合。SersSer是大多數(shù)蛋白水解酶活性中心的主要組分,多種酰基化試劑能與酶活性中心的Ser羥基作用,導(dǎo)致酶的失活。Ser第七十頁,共87頁。(一)電泳分離舉例:Glu、Leu、His、Lys,4種混合樣,在pH6.0時,泳動方向及相對速度。
GluLeuHisLyspI3.225.987.599.74五、氨基酸的分析分離
第七十一頁,共87頁。(二)分配層析一般原理
層析即色層分析又稱色譜(chromatograph)固定相(stationaryphase)流動相(mobilephase)1891年Nerst
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