醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計處理與軟件的應(yīng)用(與“數(shù)據(jù)”有關(guān)的共85張)_第1頁
醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計處理與軟件的應(yīng)用(與“數(shù)據(jù)”有關(guān)的共85張)_第2頁
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文檔簡介

醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計處理與軟件的應(yīng)用第一頁,共85頁。SAS軟件簡介

SAS是美國與西歐使用最為廣泛的三大著名統(tǒng)計分析軟件(SAS,SPSS和SYSTAT)之一,是目前國際上最為流行的一種大型統(tǒng)計分析系統(tǒng),被譽為統(tǒng)計分析的標(biāo)準(zhǔn)軟件。是國際上公認(rèn)的最權(quán)威的統(tǒng)計軟件。以苛刻嚴(yán)格著稱于世的美國FDA新藥審批程序中,新藥試驗結(jié)果的統(tǒng)計分析規(guī)定只能用SAS進(jìn)行,其他軟件的計算結(jié)果一律無效!哪怕只是簡單的均數(shù)和標(biāo)準(zhǔn)差也不行!由此可見SAS的權(quán)威地位。2004年開始中國新藥臨床試驗結(jié)果規(guī)定應(yīng)用SAS軟件分析。第二頁,共85頁。SAS與SPSS比較作為統(tǒng)計軟件大家族里的“傻瓜相機”,SPSS的功能是最弱的,但易用性排在所有統(tǒng)計軟件之首。不過SPSS的易用性也極大的限制了它的功能和可擴展性。除了SPSS本身的菜單提供的功能,用戶無法通過編程或者插件來擴展它的功能,而且SPSS提供的都只是最基本的常用的方法。第三頁,共85頁。SAS全球?qū)I(yè)認(rèn)證SAS專業(yè)認(rèn)證是一項擁有極高國際聲譽的專業(yè)認(rèn)證,在歐美等國的職場上流行的一句話“IfyouhaveaSAScertification,Youwillneverloseyourjob”。銷售模式:只租不售(每5年一個周期)財富500強中97%的企業(yè)都在使用SAS商業(yè)智能解決方案

第四頁,共85頁。第五頁,共85頁。2003年(301醫(yī)院與軍事醫(yī)科院博士生)各統(tǒng)計軟件使用情況第六頁,共85頁。Pubmed檢索SCI英文文獻(xiàn)各統(tǒng)計軟件使用情況第七頁,共85頁。SAS軟件功能進(jìn)行數(shù)據(jù)管理數(shù)據(jù)輸入、建庫、保存……進(jìn)行統(tǒng)計分析t檢驗方差分析卡方檢驗相關(guān)、回歸秩和檢驗……第八頁,共85頁。SAS的安裝SAS8.12版本是windows操作系統(tǒng)下的32位軟件,和其他windows系統(tǒng)下的軟件安裝方法類似。用鼠標(biāo)左鍵雙擊光盤根目錄下的setup圖標(biāo),然后按照提示安裝。第九頁,共85頁。SAS的啟動單擊開始菜單“程序”項。桌面上雙擊此快捷方式也可啟動SAS。第十頁,共85頁。執(zhí)行開始菜單中程序單項【程序】-【TheSASSystem】-【TheSASSystemforWindows】第十一頁,共85頁。SAS退出方式1:選擇關(guān)閉按鈕方式2:執(zhí)行菜單命令【File】→【Exit】方式3:在命令框執(zhí)行BYE或ENDSAS命令第十二頁,共85頁。SAS窗口PGM窗口(ProgramEditor):提供編寫SAS程序的文本編輯器LOG窗口:顯示執(zhí)行程序過程中的相關(guān)信息OUTPUT窗口:顯示程序運行的結(jié)果命令窗口與探索者窗口第十三頁,共85頁。程序編輯窗口日志窗口結(jié)果輸出窗口探索者窗口命令窗口第十四頁,共85頁。第十五頁,共85頁。第十六頁,共85頁。第十七頁,共85頁。SAS程序的編寫一個完整的SAS程序一般由數(shù)據(jù)步(DATA步)和過程步(PROC步)兩部分組成。DATA步以DATA語句開始,通過指定數(shù)據(jù)集名稱、定義變量名及類型和讀入數(shù)據(jù)等建立SAS數(shù)據(jù)集。過程步以PROC語句開始,通過調(diào)用不同的分析模塊來分析SAS數(shù)據(jù)集。第十八頁,共85頁。其它格式的數(shù)據(jù)庫直接導(dǎo)入轉(zhuǎn)換:excel(.xls);dbase(.dbf);lotus(.wk)等將數(shù)據(jù)讀入系統(tǒng),建立數(shù)據(jù)集(直接輸入Editor窗口)。SAS數(shù)據(jù)集建立第十九頁,共85頁。外部數(shù)據(jù)導(dǎo)入例:有一批體檢數(shù)據(jù),包括受檢者的姓名、性別、年齡、身高、體重信息。要求按性別分別計算身高、體重的描述性統(tǒng)計量:均值、標(biāo)準(zhǔn)差、最大值、最小值。該數(shù)據(jù)以Excel.xls文件形式儲存。文件名稱:tijiandata.xls第二十頁,共85頁。第二十一頁,共85頁。ImportData第二十二頁,共85頁。第二十三頁,共85頁。第二十四頁,共85頁。第二十五頁,共85頁。庫標(biāo)記導(dǎo)入的SAS數(shù)據(jù)庫文件名第二十六頁,共85頁。第二十七頁,共85頁。探索者窗口第二十八頁,共85頁。第二十九頁,共85頁。第三十頁,共85頁。在Editor程序編輯窗口輸入源程序數(shù)據(jù)步:將數(shù)據(jù)讀入系統(tǒng),建立數(shù)據(jù)集:DATA語句開始,后面加上數(shù)據(jù)庫的名字。INPUT語句描述數(shù)據(jù)變量,用$表示變量是字符型CARDS語句指示后面是數(shù)據(jù),每行為一個觀測數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)間無分號。數(shù)據(jù)最后以“;”開頭的空行結(jié)束。每個語句都以“;”結(jié)束。第三十一頁,共85頁。SAS程序數(shù)據(jù)步格式Data<數(shù)據(jù)庫名稱>;Input<變量名1>$<變量名2>….<變量名K>@@;Cards;..............................;第三十二頁,共85頁。數(shù)據(jù)步

過程步第三十三頁,共85頁。SAS過程步對數(shù)據(jù)集中數(shù)據(jù)進(jìn)行分析、處理。以PROC語句開始,調(diào)用SAS過程。每個語句都以“;”結(jié)束。整個程序最后要有RUN語句。第三十四頁,共85頁。過程步第三十五頁,共85頁。SAS程序的書寫格式不分大小寫單個名稱中不能空格,不同名稱間必須空格一行可寫多條語句,用分號分割一條語句可寫多行數(shù)據(jù)行后不加分號,數(shù)據(jù)最后單獨加分號行程序用“RUN;”語句結(jié)束第三十六頁,共85頁。運行SAS程序方式一:鼠標(biāo)點擊執(zhí)行按鈕方式二:按功能鍵“F8”方式三:執(zhí)行菜單命令Run→Submit方式四:在命令框輸入SUBMIT命令并執(zhí)行第三十七頁,共85頁。第三十八頁,共85頁。SAS程序?qū)嵗?/p>

某學(xué)生上學(xué)期8門課程的分?jǐn)?shù)分別為88,90,87,76,92,78,80,86。試用SAS編程求其平均分?jǐn)?shù)。(1)

在PGM窗口鍵入下列程序

datafenshu;inputchengji@@;cards;88

90

87

76

92

78

80

86;procmeans;varchengji;run;

過程步數(shù)據(jù)步第三十九頁,共85頁。查看結(jié)果(output窗口)AnalysisVariable:chengji

N

Mean

StdDev

Minimum

Maximum

-----------------------------------------------------------------------

8

84.6250000

5.8782286

76.0000000

92.0000000

-----------------------------------------------------------------------

從結(jié)果看出,該學(xué)生上學(xué)期8門課程的平均成績?yōu)?4.625。第四十頁,共85頁。查看運行過程及出錯信息激活LOG窗口(F6)

黑色文字:源程序及運行情況藍(lán)色文字:程序運行情況的說明信息紅色文字:出錯信息綠色文字:警告信息第四十一頁,共85頁。第四十二頁,共85頁。保存SAS程序及其他窗口內(nèi)容激活相應(yīng)窗口,然后選擇:方式一:鼠標(biāo)點擊“存盤”工具按鈕方式二:執(zhí)行菜單命令【File】→【Save】/【Saveas】可保存程序、數(shù)據(jù)文件、運行結(jié)果、日志等。SAS保存成純文本格式文件(.txt)。第四十三頁,共85頁。保存的文件的名第四十四頁,共85頁。在SAS系統(tǒng)內(nèi)打開已保存的文件只能在ProgramEdit窗口打開文件,選擇:方式一:鼠標(biāo)點擊“打開”工具按鈕方式二:執(zhí)行菜單命令【File】→【Open】可打開以前保存的程序、數(shù)據(jù)文件、運行結(jié)果、日志等文件及其他文本格式的文件。第四十五頁,共85頁。SAS程序主要關(guān)鍵詞means;(n,mean,std,Q1,Q3,CV,median,clm…)

univariatenormal;(正態(tài)性檢驗,均數(shù)是否為0的假設(shè)檢驗:參數(shù)與非參數(shù)檢驗)ttest;(兩個樣本均數(shù)比較的t檢驗)anova;(各樣本含量相等的方差分析)

glm;(各樣本含量不等的方差分析)npar1way;(非參數(shù)檢驗)

reg;(線性回歸方程:單元或多元)corr;(線性相關(guān):線性相關(guān)或秩相關(guān))freq;(卡方、Fisher檢驗)logistic;(非線性回歸)

lifetest;(生存分析)proc第四十六頁,共85頁。定量資料的描述性分析第四十七頁,共85頁。分析結(jié)果第四十八頁,共85頁。定量資料的正態(tài)性檢驗第四十九頁,共85頁。正態(tài)性檢驗結(jié)果第五十頁,共85頁。配對設(shè)計的t-test為了比較兩種方法對乳酸飲料中脂肪的含量測定結(jié)果是否不同,隨機抽取了10份乳酸飲料制品,分別采用哥特里-羅紫法和脂肪酸水解法測定其結(jié)果,問兩種方法檢測結(jié)果是否不同?編號哥特里-羅紫法脂肪酸水解法10.8400.58020.5910.50930.6740.50040.6320.31650.6870.33760.9780.51770.7500.45480.7300.51291.2000.997100.8700.506第五十一頁,共85頁。第五十二頁,共85頁。第五十三頁,共85頁。成組設(shè)計資料的t-test國產(chǎn)藥進(jìn)口藥-5-176448634777607458-2-14897277486361705436228266-14采用國產(chǎn)藥物和進(jìn)口藥物治療絕經(jīng)后婦女骨質(zhì)疏松癥,試比較兩種藥物的療效是否有差別第五十四頁,共85頁。第五十五頁,共85頁。第五十六頁,共85頁。完全隨機設(shè)計資料的方差分析(教科書73頁)安慰劑組2.4g組4.8g組7.2g組3.532.422.860.894.593.362.281.064.344.322.391.082.662.342.281.273.592.682.481.633.132.952.281.894.042.632.321.743.532.862.612.163.652.933.643.373.852.172.582.974.072.723.651.693.932.223.682.114.192.902.652.812.962.973.022.52第五十七頁,共85頁。第五十八頁,共85頁。方差齊性檢驗第五十九頁,共85頁。第六十頁,共85頁。第六十一頁,共85頁。第六十二頁,共85頁。第六十三頁,共85頁。第六十四頁,共85頁。第六十五頁,共85頁。四格表資料的χ2-test組別有效無效合計有效率胞磷膽堿4665288.5%神經(jīng)節(jié)

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