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DNA納米結(jié)構(gòu)功能化策略與生物學(xué)應(yīng)用新進(jìn)展一、引言1.1DNA納米結(jié)構(gòu)的研究背景20世紀(jì)中葉,DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的發(fā)現(xiàn),為生命科學(xué)的發(fā)展帶來了革命性的突破,也開啟了人類對(duì)遺傳信息深入探索的大門。隨著科技的不斷進(jìn)步,科學(xué)家們逐漸不滿足于對(duì)DNA遺傳功能的研究,開始探索利用DNA分子獨(dú)特的結(jié)構(gòu)和性質(zhì)構(gòu)建納米級(jí)別的結(jié)構(gòu)與器件,由此,DNA納米技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生。自1982年NedSeeman首次提出利用DNA分子構(gòu)建復(fù)雜二維或三維結(jié)構(gòu)的設(shè)想以來,DNA納米技術(shù)經(jīng)歷了從理論構(gòu)想到實(shí)驗(yàn)實(shí)現(xiàn),再到廣泛應(yīng)用探索的快速發(fā)展歷程,成為了納米科技領(lǐng)域中一個(gè)極具活力和潛力的研究方向。DNA納米結(jié)構(gòu)是DNA納米技術(shù)的核心成果,它是指通過精確設(shè)計(jì)和控制DNA分子的堿基序列,利用其自組裝特性構(gòu)建而成的具有特定形狀、尺寸和功能的納米級(jí)結(jié)構(gòu)。DNA作為遺傳信息的載體,其獨(dú)特的雙螺旋結(jié)構(gòu)和堿基互補(bǔ)配對(duì)原則為納米結(jié)構(gòu)的構(gòu)建提供了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。這種獨(dú)特的構(gòu)建方式使得DNA納米結(jié)構(gòu)具備了諸多傳統(tǒng)材料難以企及的優(yōu)勢(shì)??删幊绦允荄NA納米結(jié)構(gòu)最為突出的特性之一。研究人員可以根據(jù)需求精確設(shè)計(jì)DNA序列,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)納米結(jié)構(gòu)形狀、大小和功能的精準(zhǔn)調(diào)控。通過合理設(shè)計(jì)DNA鏈的長(zhǎng)度、堿基組成以及互補(bǔ)區(qū)域,能夠構(gòu)建出如納米管、納米籠、納米折紙等各種復(fù)雜形狀的DNA納米結(jié)構(gòu)。這種可編程性為實(shí)現(xiàn)定制化的納米器件和功能材料提供了可能,使得科學(xué)家們能夠根據(jù)不同的應(yīng)用場(chǎng)景和需求,設(shè)計(jì)并制造出具有特定功能的DNA納米結(jié)構(gòu),如用于藥物遞送的納米載體、用于生物傳感的納米探針等??蓪ぶ沸砸彩荄NA納米結(jié)構(gòu)的重要優(yōu)勢(shì)。DNA分子中的堿基序列可以作為獨(dú)特的地址標(biāo)簽,用于識(shí)別和定位特定的納米結(jié)構(gòu)或結(jié)合位點(diǎn)。這使得DNA納米結(jié)構(gòu)能夠在復(fù)雜的生物體系或納米器件中實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)的定位和相互作用。在生物傳感器中,利用DNA的可尋址性可以將識(shí)別探針精確地固定在特定位置,提高傳感器對(duì)目標(biāo)物的檢測(cè)特異性和靈敏度;在藥物遞送系統(tǒng)中,可尋址性使得納米載體能夠準(zhǔn)確地將藥物輸送到病變部位,提高治療效果并減少對(duì)正常組織的損傷。此外,DNA納米結(jié)構(gòu)還具有近原子結(jié)構(gòu)精度,能夠在納米尺度上實(shí)現(xiàn)高度精確的構(gòu)建。這種高精度使得DNA納米結(jié)構(gòu)在模擬生物分子的結(jié)構(gòu)和功能、構(gòu)建納米級(jí)的生物反應(yīng)器以及實(shí)現(xiàn)分子水平的信息存儲(chǔ)和處理等方面具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。一些研究利用DNA納米結(jié)構(gòu)精確模擬蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu),為蛋白質(zhì)功能的研究和藥物設(shè)計(jì)提供了新的模型和方法;還有研究嘗試?yán)肈NA納米結(jié)構(gòu)構(gòu)建分子級(jí)別的信息存儲(chǔ)系統(tǒng),展現(xiàn)了其在未來數(shù)據(jù)存儲(chǔ)領(lǐng)域的潛在應(yīng)用價(jià)值。除上述特性外,DNA納米結(jié)構(gòu)還具備良好的生物相容性和可降解性,這使得它們?cè)谏镝t(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用中具有天然的優(yōu)勢(shì),能夠安全地與生物體系相互作用,避免引發(fā)嚴(yán)重的免疫反應(yīng)或?qū)ι矬w造成長(zhǎng)期的不良影響。而且,DNA納米結(jié)構(gòu)的制備方法相對(duì)簡(jiǎn)單,成本較低,有利于大規(guī)模生產(chǎn)和實(shí)際應(yīng)用的推廣。這些獨(dú)特性質(zhì)使得DNA納米結(jié)構(gòu)在眾多領(lǐng)域展現(xiàn)出巨大的應(yīng)用潛力,吸引了來自化學(xué)、生物學(xué)、物理學(xué)、材料學(xué)等多個(gè)學(xué)科領(lǐng)域科研人員的廣泛關(guān)注和深入研究,成為了跨學(xué)科研究的熱點(diǎn)之一。1.2研究目的和意義本研究旨在深入探索DNA納米結(jié)構(gòu)的功能化策略及其在生物學(xué)領(lǐng)域的創(chuàng)新應(yīng)用,充分挖掘DNA納米結(jié)構(gòu)獨(dú)特性質(zhì)所蘊(yùn)含的巨大潛力,為生物學(xué)研究和生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用開辟新的道路。在生物學(xué)研究方面,DNA納米結(jié)構(gòu)的可編程性和可尋址性為研究生物分子間的相互作用提供了前所未有的工具。通過精確設(shè)計(jì)DNA納米結(jié)構(gòu),使其能夠模擬生物分子的天然環(huán)境,研究人員可以更深入地了解蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)-核酸等相互作用的機(jī)制,這些相互作用對(duì)于細(xì)胞的正常生理功能以及疾病的發(fā)生發(fā)展過程至關(guān)重要。利用DNA納米結(jié)構(gòu)構(gòu)建的生物傳感器,能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)生物標(biāo)志物的高靈敏度和高特異性檢測(cè),有助于早期疾病診斷和生物過程的實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè),為生物學(xué)研究提供了更為精準(zhǔn)和高效的分析手段。通過將特定的DNA序列設(shè)計(jì)到納米結(jié)構(gòu)中,使其能夠與目標(biāo)生物標(biāo)志物發(fā)生特異性結(jié)合,并通過熒光、電化學(xué)等信號(hào)轉(zhuǎn)換方式,實(shí)現(xiàn)對(duì)生物標(biāo)志物的快速、準(zhǔn)確檢測(cè),為疾病的早期預(yù)警和診斷提供了有力支持。在生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用領(lǐng)域,DNA納米結(jié)構(gòu)展現(xiàn)出了巨大的應(yīng)用前景。作為藥物遞送載體,DNA納米結(jié)構(gòu)具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。其可編程性使得研究人員能夠精確控制藥物的裝載、釋放和靶向遞送,提高藥物的療效并減少副作用。通過在DNA納米結(jié)構(gòu)表面修飾特定的靶向分子,如抗體、適配體等,使其能夠特異性地識(shí)別并結(jié)合到病變細(xì)胞表面的受體上,實(shí)現(xiàn)藥物的精準(zhǔn)遞送,從而提高治療效果,減少對(duì)正常組織的損傷。而且,DNA納米結(jié)構(gòu)的良好生物相容性和可降解性,使其在體內(nèi)應(yīng)用中更加安全可靠,降低了長(zhǎng)期積累對(duì)生物體造成的潛在風(fēng)險(xiǎn)。在基因治療中,DNA納米結(jié)構(gòu)可以作為基因載體,將治療性基因準(zhǔn)確地遞送至目標(biāo)細(xì)胞,為遺傳疾病的治療提供了新的策略。通過合理設(shè)計(jì)DNA納米結(jié)構(gòu),使其能夠有效地包裹和保護(hù)基因,并實(shí)現(xiàn)基因的高效轉(zhuǎn)染和表達(dá),有望為一些傳統(tǒng)治療方法難以治愈的遺傳疾病帶來新的治療希望。DNA納米結(jié)構(gòu)的研究對(duì)于多領(lǐng)域的發(fā)展具有重要意義。在材料科學(xué)領(lǐng)域,DNA納米結(jié)構(gòu)為構(gòu)建新型納米材料提供了靈感和模板。其高度精確的自組裝特性,為制備具有特定功能和結(jié)構(gòu)的納米材料提供了新的方法和途徑,有望推動(dòng)納米材料在能源、催化、電子等領(lǐng)域的應(yīng)用發(fā)展。在納米技術(shù)領(lǐng)域,DNA納米結(jié)構(gòu)的研究進(jìn)一步拓展了納米尺度下的制造和操控技術(shù),促進(jìn)了納米器件的小型化、智能化和功能化發(fā)展,為未來納米科技的突破奠定了基礎(chǔ)。本研究對(duì)DNA納米結(jié)構(gòu)功能化及其生物學(xué)應(yīng)用的深入探究,不僅有助于推動(dòng)生物學(xué)和生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的技術(shù)創(chuàng)新和發(fā)展,為解決重大疾病診療等實(shí)際問題提供新的思路和方法,還將促進(jìn)跨學(xué)科領(lǐng)域的交叉融合,帶動(dòng)材料科學(xué)、納米技術(shù)等相關(guān)領(lǐng)域的共同進(jìn)步,具有重要的科學(xué)意義和實(shí)際應(yīng)用價(jià)值。二、DNA納米結(jié)構(gòu)功能化的原理與方法2.1DNA納米結(jié)構(gòu)的基本原理2.1.1DNA的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)DNA(脫氧核糖核酸)作為生命遺傳信息的核心載體,其結(jié)構(gòu)特點(diǎn)是構(gòu)建DNA納米結(jié)構(gòu)的基石。1953年,沃森(Watson)和克里克(Crick)提出了著名的DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型,揭示了DNA分子由兩條反向平行的多核苷酸鏈圍繞同一個(gè)中心軸相互纏繞形成右手螺旋結(jié)構(gòu)。每條鏈由脫氧核糖、磷酸基團(tuán)和含氮堿基組成,其中脫氧核糖和磷酸基團(tuán)交替連接構(gòu)成了DNA鏈的骨架,而含氮堿基則伸向螺旋內(nèi)部。DNA中的含氮堿基主要有四種,分別是腺嘌呤(A)、鳥嘌呤(G)、胸腺嘧啶(T)和胞嘧啶(C)。堿基之間遵循嚴(yán)格的互補(bǔ)配對(duì)原則,即A與T通過兩個(gè)氫鍵配對(duì),G與C通過三個(gè)氫鍵配對(duì),這種堿基互補(bǔ)配對(duì)原則賦予了DNA分子高度的特異性和穩(wěn)定性。DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的直徑約為2納米,每10.5個(gè)堿基對(duì)形成一個(gè)完整的螺旋周期,螺距約為3.4納米,這些精確的尺寸和結(jié)構(gòu)參數(shù)使得DNA在納米尺度上具有高度的規(guī)則性和可預(yù)測(cè)性。這種規(guī)則性為構(gòu)建DNA納米結(jié)構(gòu)提供了天然的模板,研究人員可以根據(jù)需求精確設(shè)計(jì)DNA序列,通過堿基互補(bǔ)配對(duì)來控制DNA分子的組裝和相互作用,從而構(gòu)建出具有特定形狀和功能的納米結(jié)構(gòu)。DNA分子還具有良好的柔韌性和剛性平衡。雙鏈DNA在一定程度上表現(xiàn)出剛性,能夠維持其螺旋結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性,這對(duì)于構(gòu)建具有確定形狀和尺寸的納米結(jié)構(gòu)至關(guān)重要。而單鏈DNA則具有較高的柔韌性,能夠通過折疊和卷曲形成各種復(fù)雜的二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu),如發(fā)夾結(jié)構(gòu)、假結(jié)結(jié)構(gòu)等。這種柔韌性和剛性的特性使得DNA能夠在納米結(jié)構(gòu)的構(gòu)建中發(fā)揮多種作用,既可以作為構(gòu)建結(jié)構(gòu)框架的剛性元件,也可以作為實(shí)現(xiàn)動(dòng)態(tài)變化和功能調(diào)控的柔性元件。DNA的結(jié)構(gòu)特點(diǎn),包括雙螺旋結(jié)構(gòu)、堿基互補(bǔ)配對(duì)原則以及柔韌性與剛性的平衡,為DNA納米結(jié)構(gòu)的構(gòu)建提供了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)和豐富的可能性。這些特點(diǎn)使得DNA納米結(jié)構(gòu)能夠在納米尺度上實(shí)現(xiàn)精確的設(shè)計(jì)和組裝,為其在生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、材料科學(xué)等領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用奠定了理論基礎(chǔ)。2.1.2DNA納米結(jié)構(gòu)的構(gòu)建方式DNA納米結(jié)構(gòu)的構(gòu)建是一個(gè)復(fù)雜而精妙的過程,依賴于多種獨(dú)特的構(gòu)建方式,每種方式都有其獨(dú)特的原理和特點(diǎn),為實(shí)現(xiàn)多樣化的納米結(jié)構(gòu)提供了可能。DNA折紙術(shù)是構(gòu)建DNA納米結(jié)構(gòu)的一種極具創(chuàng)新性和影響力的方法,由PaulRothemund在2006年首次提出。其核心原理是利用一條長(zhǎng)的單鏈DNA(通常來自噬菌體M13mp18等)作為腳手架鏈,通過設(shè)計(jì)一系列短的DNA片段(稱為“訂書釘鏈”),使其與腳手架鏈上特定區(qū)域的堿基進(jìn)行互補(bǔ)配對(duì),從而將長(zhǎng)鏈DNA折疊成預(yù)定的形狀。這些訂書釘鏈就像“圖釘”一樣,將腳手架鏈固定在特定的位置,確保整個(gè)結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性。在構(gòu)建一個(gè)矩形的DNA納米結(jié)構(gòu)時(shí),研究人員會(huì)根據(jù)矩形的尺寸和形狀,精確設(shè)計(jì)訂書釘鏈的序列和長(zhǎng)度,使其與腳手架鏈在相應(yīng)的位置互補(bǔ)結(jié)合,從而引導(dǎo)腳手架鏈折疊成矩形結(jié)構(gòu)。通過這種方式,可以構(gòu)建出各種復(fù)雜的二維和三維形狀,如三角形、五角星、納米管、納米籠等,甚至可以實(shí)現(xiàn)更為復(fù)雜的圖案和結(jié)構(gòu),如具有特定圖案的DNA納米芯片。DNA折紙術(shù)的優(yōu)點(diǎn)在于其高度的可編程性和精確性,能夠在納米尺度上實(shí)現(xiàn)原子級(jí)別的結(jié)構(gòu)控制,使得構(gòu)建出的納米結(jié)構(gòu)具有極高的精度和可重復(fù)性。而且,這種方法相對(duì)簡(jiǎn)單,通過合理設(shè)計(jì)DNA序列和實(shí)驗(yàn)條件,就能夠在實(shí)驗(yàn)室中較為容易地實(shí)現(xiàn)復(fù)雜結(jié)構(gòu)的構(gòu)建。瓦片組裝法也是一種常用的構(gòu)建DNA納米結(jié)構(gòu)的方法,它基于DNA瓦片的自組裝原理。DNA瓦片是由多條短的DNA鏈通過堿基互補(bǔ)配對(duì)形成的具有特定形狀和結(jié)構(gòu)的基本單元,這些瓦片單元可以通過進(jìn)一步的組裝形成更大、更復(fù)雜的納米結(jié)構(gòu)。DNA瓦片通常設(shè)計(jì)成具有特定的粘性末端,這些粘性末端可以與其他瓦片的互補(bǔ)粘性末端進(jìn)行堿基配對(duì),從而實(shí)現(xiàn)瓦片之間的連接和組裝。通過精心設(shè)計(jì)瓦片的形狀、大小和粘性末端的序列,可以精確控制組裝過程和最終形成的納米結(jié)構(gòu)的形態(tài)。利用不同形狀的DNA瓦片可以組裝成周期性的二維晶格結(jié)構(gòu),如正方形晶格、三角形晶格等,也可以通過多層瓦片的堆疊構(gòu)建三維納米結(jié)構(gòu)。瓦片組裝法的優(yōu)勢(shì)在于其能夠?qū)崿F(xiàn)大規(guī)模的自組裝,通過簡(jiǎn)單的混合和反應(yīng)條件控制,就可以使大量的DNA瓦片自動(dòng)組裝成所需的納米結(jié)構(gòu),適合于制備具有規(guī)則周期性結(jié)構(gòu)的納米材料。而且,由于DNA瓦片的設(shè)計(jì)相對(duì)靈活,可以通過改變瓦片的結(jié)構(gòu)和組成來引入各種功能基團(tuán),為構(gòu)建功能性DNA納米結(jié)構(gòu)提供了便利。除上述兩種常見方法外,還有一些其他的構(gòu)建方式也在DNA納米結(jié)構(gòu)的研究中發(fā)揮著重要作用。如基于DNA單鏈環(huán)化和連接的方法,可以構(gòu)建出各種環(huán)形或鏈狀的DNA納米結(jié)構(gòu);利用DNA分子的雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng),能夠?qū)崿F(xiàn)DNA納米結(jié)構(gòu)的動(dòng)態(tài)組裝和調(diào)控,通過引入特定的觸發(fā)分子,可以控制納米結(jié)構(gòu)的形成和變化過程。這些不同的構(gòu)建方式相互補(bǔ)充,為研究人員提供了豐富的工具和手段,使得他們能夠根據(jù)具體的研究需求和應(yīng)用場(chǎng)景,選擇合適的方法來構(gòu)建具有特定形狀、尺寸和功能的DNA納米結(jié)構(gòu),推動(dòng)DNA納米技術(shù)在各個(gè)領(lǐng)域的發(fā)展和應(yīng)用。2.2DNA納米結(jié)構(gòu)功能化的主要方法2.2.1化學(xué)修飾法化學(xué)修飾法是對(duì)DNA納米結(jié)構(gòu)進(jìn)行功能化的基礎(chǔ)且重要的手段,它通過在DNA分子上引入特定的化學(xué)基團(tuán),改變其理化性質(zhì)和功能特性,從而滿足不同應(yīng)用場(chǎng)景的需求。DNA分子具有多個(gè)可修飾位點(diǎn),包括堿基、磷酸骨架和脫氧核糖等。在堿基上,常見的修飾方式有甲基化修飾,通過在腺嘌呤(A)、胞嘧啶(C)等堿基的特定位置引入甲基基團(tuán),能夠影響DNA與蛋白質(zhì)的相互作用。在基因表達(dá)調(diào)控中,某些基因啟動(dòng)子區(qū)域的DNA甲基化狀態(tài)會(huì)影響轉(zhuǎn)錄因子與DNA的結(jié)合能力,進(jìn)而調(diào)控基因的表達(dá)水平。在DNA納米結(jié)構(gòu)中,對(duì)堿基進(jìn)行甲基化修飾可以改變其與蛋白質(zhì)或其他生物分子的識(shí)別和結(jié)合特性,為構(gòu)建具有特定生物功能的納米結(jié)構(gòu)提供了可能。磷酸骨架也是常用的化學(xué)修飾位點(diǎn)之一。通過對(duì)磷酸基團(tuán)進(jìn)行修飾,如引入帶正電荷的氨基等基團(tuán),可以改變DNA納米結(jié)構(gòu)的表面電荷性質(zhì)。這一改變對(duì)其在生物體系中的行為具有重要影響,因?yàn)楸砻骐姾蓵?huì)影響納米結(jié)構(gòu)與細(xì)胞、生物分子之間的相互作用。帶正電荷修飾的DNA納米結(jié)構(gòu)更容易與帶負(fù)電荷的細(xì)胞膜相互作用,從而提高細(xì)胞對(duì)納米結(jié)構(gòu)的攝取效率,在藥物遞送等應(yīng)用中具有潛在價(jià)值。脫氧核糖上同樣可以進(jìn)行化學(xué)修飾,例如在2'-羥基位置進(jìn)行修飾,能夠改變DNA的穩(wěn)定性和生物活性。引入氟原子或甲氧基等基團(tuán)可以增強(qiáng)DNA分子對(duì)核酸酶的抗性,延長(zhǎng)其在生物體內(nèi)的半衰期,這對(duì)于需要在體內(nèi)長(zhǎng)時(shí)間發(fā)揮作用的DNA納米結(jié)構(gòu),如作為長(zhǎng)效藥物載體或基因治療載體,具有重要意義。化學(xué)修飾法不僅能夠改變DNA納米結(jié)構(gòu)的物理化學(xué)性質(zhì),還能賦予其新的功能。在DNA納米結(jié)構(gòu)表面修飾熒光基團(tuán),如熒光素、羅丹明等,能夠使納米結(jié)構(gòu)具有熒光特性。這些熒光標(biāo)記的DNA納米結(jié)構(gòu)在生物成像和生物傳感領(lǐng)域有著廣泛應(yīng)用。在細(xì)胞成像中,將熒光修飾的DNA納米結(jié)構(gòu)靶向遞送至細(xì)胞內(nèi)特定位置,可以實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)細(xì)胞內(nèi)的生物過程;在生物傳感器中,利用熒光信號(hào)的變化來檢測(cè)目標(biāo)物的存在和濃度,實(shí)現(xiàn)對(duì)生物分子的高靈敏度檢測(cè)。修飾生物素也是常見的化學(xué)修飾策略,生物素與親和素之間具有極高的親和力,通過在DNA納米結(jié)構(gòu)上修飾生物素,可以利用生物素-親和素系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)納米結(jié)構(gòu)與其他生物分子或材料的特異性連接,拓展了DNA納米結(jié)構(gòu)在生物醫(yī)學(xué)和材料科學(xué)等領(lǐng)域的應(yīng)用。2.2.2生物分子偶聯(lián)法生物分子偶聯(lián)法是將生物分子與DNA納米結(jié)構(gòu)相結(jié)合,賦予其生物活性和功能特異性的重要功能化策略,在生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用中展現(xiàn)出獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。其原理基于生物分子與DNA分子之間的特異性相互作用或化學(xué)反應(yīng)??贵w是具有高度特異性識(shí)別能力的生物分子,將抗體與DNA納米結(jié)構(gòu)偶聯(lián),主要通過化學(xué)交聯(lián)的方式實(shí)現(xiàn)。利用抗體分子上的氨基、羧基等活性基團(tuán)與DNA分子上相應(yīng)的反應(yīng)基團(tuán),在交聯(lián)劑的作用下形成穩(wěn)定的共價(jià)鍵連接。戊二醛、N-羥基琥珀酰亞胺(NHS)和1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亞胺鹽酸鹽(EDC)等常用交聯(lián)劑,能夠有效地促進(jìn)抗體與DNA納米結(jié)構(gòu)之間的偶聯(lián)反應(yīng)。這種偶聯(lián)后的DNA納米結(jié)構(gòu)-抗體復(fù)合物,能夠利用抗體的特異性識(shí)別功能,靶向結(jié)合到特定的抗原上,如腫瘤細(xì)胞表面的特異性抗原。在癌癥診斷和治療中,將攜帶有熒光標(biāo)記或藥物的DNA納米結(jié)構(gòu)與腫瘤特異性抗體偶聯(lián),可實(shí)現(xiàn)對(duì)腫瘤細(xì)胞的精準(zhǔn)識(shí)別和靶向治療,提高治療效果并減少對(duì)正常細(xì)胞的損傷。蛋白質(zhì)與DNA納米結(jié)構(gòu)的偶聯(lián)也是生物分子偶聯(lián)法的重要應(yīng)用。蛋白質(zhì)具有多種生物功能,如酶的催化活性、蛋白質(zhì)的信號(hào)傳導(dǎo)功能等。通過基因工程技術(shù),可以在蛋白質(zhì)的特定位置引入能夠與DNA分子特異性結(jié)合的標(biāo)簽,如組氨酸標(biāo)簽(His-tag)、生物素標(biāo)簽等。利用這些標(biāo)簽與DNA分子上相應(yīng)的結(jié)合位點(diǎn)(如鎳離子親和柱、鏈霉親和素等)之間的特異性相互作用,實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)與DNA納米結(jié)構(gòu)的偶聯(lián)。將具有催化活性的酶與DNA納米結(jié)構(gòu)偶聯(lián),可以構(gòu)建具有生物催化功能的納米反應(yīng)器。在生物分析中,這種納米反應(yīng)器能夠利用酶的催化作用,對(duì)目標(biāo)底物進(jìn)行特異性催化反應(yīng),通過檢測(cè)反應(yīng)產(chǎn)物來實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)物的高靈敏度檢測(cè);在生物合成中,可用于催化特定的化學(xué)反應(yīng),合成生物活性物質(zhì)。核酸適配體作為一種特殊的寡核苷酸序列,也常與DNA納米結(jié)構(gòu)進(jìn)行偶聯(lián)。核酸適配體能夠通過堿基互補(bǔ)配對(duì)與DNA納米結(jié)構(gòu)特異性結(jié)合,同時(shí)它又能特異性識(shí)別并結(jié)合到目標(biāo)分子上,如小分子、蛋白質(zhì)、細(xì)胞等。將核酸適配體與DNA納米結(jié)構(gòu)偶聯(lián)后,可利用核酸適配體的靶向識(shí)別功能,使DNA納米結(jié)構(gòu)能夠精準(zhǔn)地定位到目標(biāo)物上。在藥物遞送中,將藥物裝載到DNA納米結(jié)構(gòu)上,并與靶向病變細(xì)胞的核酸適配體偶聯(lián),能夠?qū)崿F(xiàn)藥物的靶向遞送,提高藥物在病變部位的濃度,增強(qiáng)治療效果。生物分子偶聯(lián)法在生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用中具有顯著優(yōu)勢(shì)。它能夠極大地提高DNA納米結(jié)構(gòu)的靶向性,使其能夠精準(zhǔn)地作用于目標(biāo)細(xì)胞或生物分子,減少對(duì)正常組織和細(xì)胞的影響,降低副作用。通過偶聯(lián)不同功能的生物分子,還可以賦予DNA納米結(jié)構(gòu)多種生物活性,實(shí)現(xiàn)多功能一體化的應(yīng)用,如同時(shí)實(shí)現(xiàn)診斷和治療的功能。而且,生物分子本身具有良好的生物相容性,與DNA納米結(jié)構(gòu)偶聯(lián)后,不會(huì)顯著影響其在生物體內(nèi)的安全性和穩(wěn)定性,為其在體內(nèi)的應(yīng)用提供了保障。2.2.3核酸適配體結(jié)合法核酸適配體結(jié)合法是基于核酸適配體獨(dú)特的篩選和結(jié)合原理,實(shí)現(xiàn)DNA納米結(jié)構(gòu)對(duì)特定目標(biāo)物高效靶向識(shí)別的功能化方法,在生物醫(yī)學(xué)和生物分析等領(lǐng)域具有重要應(yīng)用價(jià)值。核酸適配體是通過指數(shù)富集的配體系統(tǒng)進(jìn)化技術(shù)(SELEX)從隨機(jī)寡核苷酸文庫中篩選得到的單鏈DNA或RNA分子。其篩選過程基于核酸適配體與目標(biāo)分子之間的特異性相互作用。首先構(gòu)建一個(gè)包含大量不同序列的隨機(jī)寡核苷酸文庫,文庫中寡核苷酸序列的多樣性為篩選提供了豐富的分子基礎(chǔ)。將該文庫與目標(biāo)分子(如蛋白質(zhì)、小分子、細(xì)胞等)進(jìn)行孵育,文庫中的寡核苷酸分子會(huì)與目標(biāo)分子發(fā)生相互作用,其中一些具有特定序列和結(jié)構(gòu)的寡核苷酸能夠與目標(biāo)分子特異性結(jié)合。通過多次重復(fù)結(jié)合、洗脫和擴(kuò)增的循環(huán)過程,逐步富集出與目標(biāo)分子具有高親和力和特異性結(jié)合能力的核酸適配體。在每一輪篩選中,未與目標(biāo)分子結(jié)合的寡核苷酸被洗脫去除,而與目標(biāo)分子結(jié)合的寡核苷酸則被洗脫下來并進(jìn)行擴(kuò)增,作為下一輪篩選的文庫。經(jīng)過多輪篩選后,得到的核酸適配體能夠特異性地識(shí)別并結(jié)合目標(biāo)分子,其解離常數(shù)(Kd)可以達(dá)到皮摩爾到納摩爾水平,具有與傳統(tǒng)抗體相媲美的結(jié)合能力。核酸適配體與目標(biāo)分子的結(jié)合主要依賴于其獨(dú)特的三維結(jié)構(gòu)。核酸適配體在溶液中能夠折疊形成復(fù)雜的二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu),如發(fā)夾結(jié)構(gòu)、假結(jié)結(jié)構(gòu)、G-四鏈體結(jié)構(gòu)等,這些結(jié)構(gòu)中包含的特定環(huán)、莖等基序能夠與目標(biāo)分子的特定部位相互作用,形成氫鍵、范德華力、靜電相互作用等多種非共價(jià)鍵,從而實(shí)現(xiàn)特異性結(jié)合。核酸適配體與蛋白質(zhì)的結(jié)合,可能是通過其特定的結(jié)構(gòu)與蛋白質(zhì)的活性位點(diǎn)或其他關(guān)鍵區(qū)域相互作用,阻斷蛋白質(zhì)的功能或調(diào)節(jié)其活性;與小分子的結(jié)合則是通過適配體結(jié)構(gòu)與小分子的形狀、電荷分布等互補(bǔ)匹配,實(shí)現(xiàn)高親和力的結(jié)合。在靶向識(shí)別應(yīng)用中,核酸適配體結(jié)合法展現(xiàn)出獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。將核酸適配體與DNA納米結(jié)構(gòu)結(jié)合后,利用核酸適配體的特異性識(shí)別能力,DNA納米結(jié)構(gòu)能夠精準(zhǔn)地靶向目標(biāo)物。在腫瘤診斷中,針對(duì)腫瘤細(xì)胞表面特異性標(biāo)志物篩選得到的核酸適配體與DNA納米結(jié)構(gòu)結(jié)合,可構(gòu)建腫瘤靶向診斷探針。這些探針能夠特異性地識(shí)別并結(jié)合腫瘤細(xì)胞,通過熒光標(biāo)記、放射性標(biāo)記或其他信號(hào)檢測(cè)手段,實(shí)現(xiàn)對(duì)腫瘤細(xì)胞的靈敏檢測(cè)和定位,有助于腫瘤的早期診斷和病情監(jiān)測(cè)。在藥物遞送領(lǐng)域,將藥物負(fù)載于DNA納米結(jié)構(gòu)上,并結(jié)合靶向病變組織的核酸適配體,能夠?qū)崿F(xiàn)藥物的精準(zhǔn)遞送。核酸適配體引導(dǎo)DNA納米結(jié)構(gòu)靶向病變細(xì)胞,提高藥物在病變部位的濃度,增強(qiáng)治療效果,同時(shí)減少藥物對(duì)正常組織的毒副作用。而且,核酸適配體具有良好的化學(xué)穩(wěn)定性、易于合成和修飾等特點(diǎn),相較于傳統(tǒng)抗體,更便于制備和應(yīng)用,為DNA納米結(jié)構(gòu)的功能化和靶向應(yīng)用提供了有力的工具。三、DNA納米結(jié)構(gòu)功能化在生物傳感中的應(yīng)用3.1生物分子檢測(cè)的原理與機(jī)制3.1.1基于DNA雜交的檢測(cè)原理DNA雜交是基于DNA分子獨(dú)特的堿基互補(bǔ)配對(duì)原則,這一特性是DNA納米結(jié)構(gòu)功能化應(yīng)用于生物分子檢測(cè)的核心原理之一。當(dāng)兩條具有互補(bǔ)堿基序列的DNA單鏈在適宜的條件下相遇時(shí),它們會(huì)通過堿基之間的氫鍵相互作用,形成穩(wěn)定的雙鏈DNA結(jié)構(gòu)。在標(biāo)準(zhǔn)的DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)中,腺嘌呤(A)總是與胸腺嘧啶(T)配對(duì),形成兩個(gè)氫鍵;鳥嘌呤(G)則與胞嘧啶(C)配對(duì),形成三個(gè)氫鍵,這種高度特異性的堿基配對(duì)關(guān)系使得DNA雜交具有極高的準(zhǔn)確性和選擇性。在生物分子檢測(cè)中,基于DNA雜交的檢測(cè)過程通常涉及設(shè)計(jì)一段與目標(biāo)生物分子(如特定的DNA、RNA序列或蛋白質(zhì)等)具有互補(bǔ)序列的DNA探針。將DNA探針固定在固體支持物表面,如金納米顆粒、硅片、微流控芯片等,構(gòu)建成生物傳感器。當(dāng)含有目標(biāo)生物分子的樣品與傳感器接觸時(shí),若樣品中存在與探針互補(bǔ)的序列,探針與目標(biāo)分子之間會(huì)發(fā)生特異性雜交反應(yīng),形成雙鏈結(jié)構(gòu)。這一雜交過程會(huì)引起傳感器表面物理化學(xué)性質(zhì)的變化,通過相應(yīng)的信號(hào)轉(zhuǎn)換機(jī)制,將這種變化轉(zhuǎn)化為可檢測(cè)的信號(hào),從而實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)生物分子的檢測(cè)。在基于熒光信號(hào)檢測(cè)的DNA雜交生物傳感器中,會(huì)對(duì)DNA探針進(jìn)行熒光標(biāo)記。當(dāng)探針與目標(biāo)分子雜交形成雙鏈后,熒光基團(tuán)的環(huán)境發(fā)生改變,其熒光強(qiáng)度、熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)效率等熒光特性也會(huì)相應(yīng)改變。如果在同一探針上標(biāo)記供體熒光基團(tuán)和受體熒光基團(tuán),當(dāng)探針呈單鏈狀態(tài)時(shí),兩個(gè)熒光基團(tuán)距離較遠(yuǎn),不會(huì)發(fā)生有效的FRET;而當(dāng)探針與目標(biāo)分子雜交形成雙鏈后,兩個(gè)熒光基團(tuán)靠近,發(fā)生FRET,供體熒光強(qiáng)度降低,受體熒光強(qiáng)度增強(qiáng),通過檢測(cè)這種熒光信號(hào)的變化,就可以判斷目標(biāo)分子的存在和濃度。電化學(xué)DNA雜交生物傳感器則是利用雜交前后電極表面電荷分布、電子傳遞速率等電化學(xué)性質(zhì)的改變來檢測(cè)目標(biāo)分子。將DNA探針修飾在電極表面,當(dāng)探針與目標(biāo)分子雜交后,電極表面的電荷密度和界面電子轉(zhuǎn)移電阻發(fā)生變化,通過測(cè)量電極的電化學(xué)信號(hào),如電流、電位等,就可以實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)分子的定量檢測(cè)。在某些基于循環(huán)伏安法的電化學(xué)DNA雜交傳感器中,雜交后的雙鏈DNA會(huì)阻礙電極表面的電子傳遞,導(dǎo)致氧化還原峰電流減小,通過檢測(cè)電流的變化就能夠確定目標(biāo)分子的濃度。表面等離子共振(SPR)技術(shù)也是常用于DNA雜交檢測(cè)的一種方法。當(dāng)入射光以特定角度照射到金屬表面時(shí),會(huì)激發(fā)表面等離子體共振,產(chǎn)生共振吸收峰。將DNA探針固定在金屬薄膜表面,當(dāng)目標(biāo)分子與探針雜交時(shí),會(huì)引起金屬表面折射率的變化,從而導(dǎo)致SPR信號(hào)的改變。通過實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)SPR信號(hào)的變化,可以實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)雜交反應(yīng)的進(jìn)程,實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)生物分子的快速、靈敏檢測(cè),這種方法無需標(biāo)記,操作簡(jiǎn)便,在生物分子檢測(cè)中具有廣泛的應(yīng)用前景。3.1.2核酸適配體在檢測(cè)中的作用核酸適配體在生物分子檢測(cè)中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用,其獨(dú)特的性質(zhì)為提高檢測(cè)的靈敏度和選擇性提供了有力支持。核酸適配體是通過指數(shù)富集的配體系統(tǒng)進(jìn)化技術(shù)(SELEX)從隨機(jī)寡核苷酸文庫中篩選得到的單鏈DNA或RNA分子,能夠特異性地識(shí)別并結(jié)合各種目標(biāo)分子,包括小分子、蛋白質(zhì)、細(xì)胞等。核酸適配體與目標(biāo)分子之間的特異性結(jié)合能力源于其獨(dú)特的三維結(jié)構(gòu)。核酸適配體在溶液中能夠折疊形成復(fù)雜的二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu),如發(fā)夾結(jié)構(gòu)、假結(jié)結(jié)構(gòu)、G-四鏈體結(jié)構(gòu)等,這些結(jié)構(gòu)中包含的特定環(huán)、莖等基序能夠與目標(biāo)分子的特定部位相互作用,形成氫鍵、范德華力、靜電相互作用等多種非共價(jià)鍵,從而實(shí)現(xiàn)高度特異性的結(jié)合。核酸適配體與蛋白質(zhì)的結(jié)合,可能是通過適配體結(jié)構(gòu)中的特定環(huán)與蛋白質(zhì)的活性位點(diǎn)緊密結(jié)合,阻斷蛋白質(zhì)的功能;與小分子的結(jié)合則是通過適配體的三維結(jié)構(gòu)與小分子的形狀、電荷分布等精確互補(bǔ)匹配,實(shí)現(xiàn)高親和力的結(jié)合。在提高檢測(cè)靈敏度方面,核酸適配體展現(xiàn)出顯著優(yōu)勢(shì)。由于其與目標(biāo)分子具有高親和力,能夠在極低濃度下與目標(biāo)分子特異性結(jié)合。將核酸適配體作為識(shí)別元件應(yīng)用于生物傳感器中,可以大大提高傳感器對(duì)目標(biāo)分子的檢測(cè)靈敏度。在基于熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)的核酸適配體傳感器中,將熒光供體和受體分別標(biāo)記在核酸適配體的不同位置,當(dāng)適配體與目標(biāo)分子結(jié)合時(shí),其構(gòu)象發(fā)生變化,導(dǎo)致熒光供體和受體之間的距離改變,F(xiàn)RET效率發(fā)生變化,從而產(chǎn)生可檢測(cè)的熒光信號(hào)。由于核酸適配體與目標(biāo)分子的高親和力結(jié)合,即使目標(biāo)分子濃度極低,也能引發(fā)明顯的構(gòu)象變化和熒光信號(hào)改變,使得檢測(cè)靈敏度大幅提高,能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)痕量生物分子的檢測(cè)。核酸適配體在提高檢測(cè)選擇性方面也表現(xiàn)出色。其高度的特異性識(shí)別能力使其能夠準(zhǔn)確地區(qū)分目標(biāo)分子與其他結(jié)構(gòu)相似的分子。在復(fù)雜的生物樣品中,存在著眾多干擾物質(zhì),傳統(tǒng)的檢測(cè)方法往往難以避免非特異性結(jié)合,導(dǎo)致檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性受到影響。而核酸適配體能夠憑借其獨(dú)特的結(jié)構(gòu)與目標(biāo)分子特異性結(jié)合,有效減少非特異性吸附,提高檢測(cè)的選擇性。針對(duì)某種特定腫瘤標(biāo)志物篩選得到的核酸適配體,能夠特異性地識(shí)別該腫瘤標(biāo)志物,而對(duì)樣品中其他非目標(biāo)蛋白質(zhì)、細(xì)胞成分等幾乎不發(fā)生結(jié)合,從而在復(fù)雜的生物樣品中準(zhǔn)確檢測(cè)出目標(biāo)腫瘤標(biāo)志物,為腫瘤的早期診斷提供可靠依據(jù)。核酸適配體還具有易于修飾和多功能化的特點(diǎn),這進(jìn)一步拓展了其在生物分子檢測(cè)中的應(yīng)用。通過化學(xué)修飾,可以在核酸適配體上引入各種功能基團(tuán),如熒光基團(tuán)、生物素、納米顆粒等。引入熒光基團(tuán)可以直接用于熒光檢測(cè);連接生物素后,可以利用生物素-親和素系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)與其他生物分子或材料的特異性連接,進(jìn)一步放大檢測(cè)信號(hào);與納米顆粒偶聯(lián)則可以結(jié)合納米材料的獨(dú)特性質(zhì),如金納米顆粒的局域表面等離子體共振效應(yīng)、量子點(diǎn)的高效熒光發(fā)射等,提高檢測(cè)的靈敏度和多樣性。將核酸適配體與金納米顆粒偶聯(lián),利用金納米顆粒的聚集導(dǎo)致的顏色變化,實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)分子的可視化檢測(cè),無需復(fù)雜的儀器設(shè)備,操作簡(jiǎn)便,適用于現(xiàn)場(chǎng)快速檢測(cè)。3.2具體應(yīng)用案例分析3.2.1疾病標(biāo)志物的檢測(cè)在疾病早期診斷中,準(zhǔn)確檢測(cè)疾病標(biāo)志物至關(guān)重要,而DNA納米結(jié)構(gòu)功能化在這一領(lǐng)域展現(xiàn)出卓越的應(yīng)用潛力,以腫瘤標(biāo)志物和病毒核酸檢測(cè)為例,其優(yōu)勢(shì)得以充分彰顯。腫瘤標(biāo)志物是腫瘤細(xì)胞產(chǎn)生或機(jī)體對(duì)腫瘤細(xì)胞反應(yīng)而產(chǎn)生的一類物質(zhì),它們?cè)谀[瘤的早期診斷、病情監(jiān)測(cè)和預(yù)后評(píng)估中具有重要意義。甲胎蛋白(AFP)是一種重要的肝癌標(biāo)志物,傳統(tǒng)檢測(cè)方法在靈敏度和特異性上存在一定局限。而基于DNA納米結(jié)構(gòu)功能化的檢測(cè)方法則展現(xiàn)出獨(dú)特優(yōu)勢(shì)。研究人員利用DNA折紙技術(shù)構(gòu)建了具有特定三維結(jié)構(gòu)的DNA納米探針,在其表面修飾了對(duì)AFP具有特異性識(shí)別能力的核酸適配體。當(dāng)該納米探針與含有AFP的樣品接觸時(shí),核酸適配體會(huì)特異性地結(jié)合AFP,導(dǎo)致DNA納米探針的構(gòu)象發(fā)生變化。通過將熒光基團(tuán)標(biāo)記在DNA納米探針的特定位置,利用熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)原理,當(dāng)探針構(gòu)象變化時(shí),熒光基團(tuán)之間的距離和相對(duì)位置改變,F(xiàn)RET效率發(fā)生變化,從而產(chǎn)生可檢測(cè)的熒光信號(hào)變化。這種檢測(cè)方法能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)AFP的高靈敏度檢測(cè),檢測(cè)限可達(dá)皮摩爾級(jí)別,大大提高了肝癌早期診斷的準(zhǔn)確性和靈敏度。而且,由于核酸適配體的高度特異性識(shí)別能力,有效減少了其他生物分子的干擾,提高了檢測(cè)的特異性,降低了假陽性率。在病毒核酸檢測(cè)方面,DNA納米結(jié)構(gòu)功能化同樣發(fā)揮著重要作用。以新冠病毒核酸檢測(cè)為例,新冠病毒的遺傳物質(zhì)為單鏈RNA,通過逆轉(zhuǎn)錄可將其轉(zhuǎn)化為cDNA,以便利用基于DNA納米結(jié)構(gòu)的檢測(cè)技術(shù)進(jìn)行分析。研究團(tuán)隊(duì)設(shè)計(jì)了一種基于DNA雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(HCR)的納米檢測(cè)體系。在該體系中,首先合成兩條部分互補(bǔ)的DNA發(fā)夾鏈,它們?cè)谌芤褐刑幱诜€(wěn)定的發(fā)夾結(jié)構(gòu),不會(huì)發(fā)生反應(yīng)。當(dāng)加入新冠病毒的cDNA作為觸發(fā)鏈時(shí),觸發(fā)鏈會(huì)與其中一條發(fā)夾鏈的特定區(qū)域雜交,打開發(fā)夾結(jié)構(gòu),暴露的單鏈部分又會(huì)與另一條發(fā)夾鏈雜交,引發(fā)鏈?zhǔn)椒磻?yīng),形成長(zhǎng)鏈狀的DNA納米結(jié)構(gòu)。通過在發(fā)夾鏈上標(biāo)記熒光基團(tuán),隨著HCR反應(yīng)的進(jìn)行,熒光信號(hào)不斷增強(qiáng),實(shí)現(xiàn)對(duì)新冠病毒核酸的靈敏檢測(cè)。這種方法不僅具有高靈敏度,能夠檢測(cè)到極低濃度的病毒核酸,而且檢測(cè)速度快,可在短時(shí)間內(nèi)完成檢測(cè),滿足了疫情防控中對(duì)快速、準(zhǔn)確檢測(cè)的需求。同時(shí),通過合理設(shè)計(jì)DNA序列,能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)新冠病毒特定變異株的特異性檢測(cè),為疫情的精準(zhǔn)防控提供了有力支持。DNA納米結(jié)構(gòu)功能化在疾病標(biāo)志物檢測(cè)中的應(yīng)用,為臨床診斷帶來了新的技術(shù)手段和方法。其高靈敏度、高特異性以及快速檢測(cè)等優(yōu)勢(shì),有助于實(shí)現(xiàn)疾病的早期發(fā)現(xiàn)和精準(zhǔn)診斷,為患者的治療和康復(fù)爭(zhēng)取寶貴時(shí)間,在臨床診斷領(lǐng)域具有廣闊的應(yīng)用前景和重要的實(shí)際應(yīng)用價(jià)值。3.2.2環(huán)境污染物的監(jiān)測(cè)隨著工業(yè)化進(jìn)程的加速和人類活動(dòng)的日益頻繁,環(huán)境污染物對(duì)生態(tài)系統(tǒng)和人類健康構(gòu)成了嚴(yán)重威脅。準(zhǔn)確監(jiān)測(cè)環(huán)境污染物的種類和濃度,對(duì)于環(huán)境保護(hù)和人類健康至關(guān)重要。DNA納米結(jié)構(gòu)功能化在檢測(cè)重金屬離子和有機(jī)污染物方面展現(xiàn)出獨(dú)特的優(yōu)勢(shì),為環(huán)境監(jiān)測(cè)領(lǐng)域帶來了新的技術(shù)手段和方法。在重金屬離子檢測(cè)方面,以鉛離子(Pb2?)為例,傳統(tǒng)檢測(cè)方法存在檢測(cè)過程繁瑣、靈敏度有限等問題。基于DNA納米結(jié)構(gòu)功能化的檢測(cè)技術(shù)則提供了一種高效、靈敏的解決方案。研究人員利用核酸適配體對(duì)Pb2?的特異性識(shí)別能力,設(shè)計(jì)并構(gòu)建了基于DNA納米結(jié)構(gòu)的Pb2?檢測(cè)探針。核酸適配體在與Pb2?結(jié)合后,其構(gòu)象會(huì)發(fā)生特異性變化,這種變化可以通過與DNA納米結(jié)構(gòu)的相互作用進(jìn)行信號(hào)轉(zhuǎn)換和放大。將核酸適配體修飾在DNA納米管的表面,當(dāng)Pb2?存在時(shí),核酸適配體與Pb2?結(jié)合,導(dǎo)致DNA納米管的表面電荷和結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,進(jìn)而影響其在溶液中的電化學(xué)性質(zhì)。通過電化學(xué)檢測(cè)方法,如差分脈沖伏安法(DPV),可以精確檢測(cè)這種電化學(xué)信號(hào)的變化,實(shí)現(xiàn)對(duì)Pb2?的高靈敏度檢測(cè),檢測(cè)限可低至納摩爾級(jí)別。而且,這種檢測(cè)方法具有良好的選擇性,能夠有效區(qū)分Pb2?與其他金屬離子,減少環(huán)境中復(fù)雜成分的干擾。在有機(jī)污染物監(jiān)測(cè)方面,以多環(huán)芳烴類污染物芘為例,DNA納米結(jié)構(gòu)功能化也展現(xiàn)出顯著的應(yīng)用潛力。芘是一種常見的具有致癌、致畸和致突變性的有機(jī)污染物,對(duì)其進(jìn)行準(zhǔn)確檢測(cè)至關(guān)重要。科研人員利用DNA分子與芘之間的π-π堆積作用,構(gòu)建了基于DNA納米結(jié)構(gòu)的芘檢測(cè)傳感器。通過將特定序列的DNA修飾在金納米顆粒表面,形成DNA-金納米顆粒復(fù)合物。芘分子能夠通過π-π堆積作用與DNA結(jié)合,導(dǎo)致DNA-金納米顆粒復(fù)合物的團(tuán)聚狀態(tài)發(fā)生改變。金納米顆粒在團(tuán)聚前后其表面等離子體共振吸收峰發(fā)生明顯變化,通過紫外-可見吸收光譜檢測(cè)這種吸收峰的變化,就可以實(shí)現(xiàn)對(duì)芘的快速、靈敏檢測(cè)。當(dāng)芘濃度增加時(shí),DNA-金納米顆粒復(fù)合物團(tuán)聚程度增加,溶液顏色由紅色逐漸變?yōu)樽仙?,這種可視化的顏色變化也使得該檢測(cè)方法無需復(fù)雜儀器,可用于現(xiàn)場(chǎng)快速篩查。DNA納米結(jié)構(gòu)功能化在環(huán)境污染物監(jiān)測(cè)中的應(yīng)用,具有重要的意義。它不僅提高了環(huán)境污染物檢測(cè)的靈敏度和選擇性,能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)痕量污染物的準(zhǔn)確檢測(cè),而且檢測(cè)方法相對(duì)簡(jiǎn)單、快速,為環(huán)境監(jiān)測(cè)提供了更為便捷、高效的技術(shù)手段。這有助于及時(shí)發(fā)現(xiàn)環(huán)境中的污染物,為環(huán)境保護(hù)政策的制定和污染治理措施的實(shí)施提供科學(xué)依據(jù),對(duì)于維護(hù)生態(tài)平衡和保障人類健康具有重要的推動(dòng)作用。四、DNA納米結(jié)構(gòu)功能化在藥物遞送中的應(yīng)用4.1藥物載體的特性與優(yōu)勢(shì)4.1.1DNA納米結(jié)構(gòu)作為藥物載體的優(yōu)勢(shì)DNA納米結(jié)構(gòu)作為藥物載體,在現(xiàn)代藥物遞送領(lǐng)域展現(xiàn)出諸多顯著優(yōu)勢(shì),這些優(yōu)勢(shì)使其成為極具潛力的新型藥物遞送系統(tǒng)。生物相容性是DNA納米結(jié)構(gòu)作為藥物載體的重要優(yōu)勢(shì)之一。DNA作為生物體遺傳信息的載體,是生物體內(nèi)天然存在的生物大分子,其在體內(nèi)的代謝過程相對(duì)清晰且溫和。當(dāng)DNA納米結(jié)構(gòu)進(jìn)入生物體內(nèi)時(shí),免疫系統(tǒng)對(duì)其具有較低的免疫原性,不會(huì)引發(fā)強(qiáng)烈的免疫反應(yīng)。這使得DNA納米結(jié)構(gòu)能夠在體內(nèi)較為穩(wěn)定地存在,并順利完成藥物遞送任務(wù),減少了因免疫排斥導(dǎo)致的藥物載體失效或?qū)ι矬w造成損傷的風(fēng)險(xiǎn)。與傳統(tǒng)的一些合成高分子材料或無機(jī)納米材料作為藥物載體相比,DNA納米結(jié)構(gòu)的生物相容性大大提高了其在體內(nèi)應(yīng)用的安全性和可靠性。在體內(nèi)實(shí)驗(yàn)中,將DNA納米結(jié)構(gòu)作為藥物載體注入動(dòng)物體內(nèi),經(jīng)過長(zhǎng)期觀察發(fā)現(xiàn),動(dòng)物的各項(xiàng)生理指標(biāo)未出現(xiàn)明顯異常,組織和器官也未出現(xiàn)明顯的炎癥反應(yīng)或損傷,證明了DNA納米結(jié)構(gòu)良好的生物相容性??删幊绦允荄NA納米結(jié)構(gòu)的另一突出優(yōu)勢(shì),這為藥物遞送系統(tǒng)的精準(zhǔn)設(shè)計(jì)提供了強(qiáng)大的工具。研究人員可以根據(jù)藥物的性質(zhì)、作用靶點(diǎn)以及預(yù)期的藥物釋放模式等因素,精確設(shè)計(jì)DNA納米結(jié)構(gòu)的序列和結(jié)構(gòu)。通過合理設(shè)計(jì)DNA鏈的長(zhǎng)度、堿基組成以及互補(bǔ)區(qū)域,能夠構(gòu)建出具有特定形狀、尺寸和功能的納米結(jié)構(gòu)。為了實(shí)現(xiàn)藥物的靶向遞送,可以在DNA納米結(jié)構(gòu)表面修飾特定的靶向分子,如抗體、適配體等。通過基因工程技術(shù)或化學(xué)偶聯(lián)方法,將靶向分子準(zhǔn)確地連接到DNA納米結(jié)構(gòu)的特定位置,使其能夠特異性地識(shí)別并結(jié)合到病變細(xì)胞表面的受體上,實(shí)現(xiàn)藥物的精準(zhǔn)定位和遞送。而且,通過改變DNA納米結(jié)構(gòu)的內(nèi)部空間結(jié)構(gòu)和化學(xué)組成,還可以精確控制藥物的裝載量和釋放速率。在設(shè)計(jì)用于治療腫瘤的DNA納米藥物載體時(shí),可以根據(jù)腫瘤細(xì)胞的特點(diǎn)和藥物的需求,設(shè)計(jì)合適的納米結(jié)構(gòu),使其能夠高效地裝載抗癌藥物,并在到達(dá)腫瘤部位后,根據(jù)腫瘤微環(huán)境的刺激(如pH值變化、酶濃度變化等),精確控制藥物的釋放,提高藥物的療效??煽蒯尫盘匦允荄NA納米結(jié)構(gòu)作為藥物載體的又一關(guān)鍵優(yōu)勢(shì)。在藥物治療過程中,藥物的釋放速率和釋放時(shí)間對(duì)治療效果有著至關(guān)重要的影響。DNA納米結(jié)構(gòu)可以通過多種方式實(shí)現(xiàn)藥物的可控釋放。利用DNA分子對(duì)特定環(huán)境因素的響應(yīng)性,如pH值、溫度、離子強(qiáng)度、酶等,設(shè)計(jì)智能型DNA納米藥物載體。當(dāng)載體處于正常生理環(huán)境時(shí),藥物被穩(wěn)定地包裹在納米結(jié)構(gòu)內(nèi)部;而當(dāng)載體到達(dá)病變部位,遇到病變微環(huán)境中的特異性刺激因素時(shí),DNA納米結(jié)構(gòu)的構(gòu)象發(fā)生變化,從而觸發(fā)藥物的釋放。在腫瘤組織中,由于腫瘤細(xì)胞的代謝活動(dòng)異常旺盛,其微環(huán)境的pH值通常比正常組織低?;诖耍梢栽O(shè)計(jì)對(duì)酸性環(huán)境敏感的DNA納米結(jié)構(gòu),當(dāng)載體進(jìn)入腫瘤微環(huán)境后,酸性條件促使DNA納米結(jié)構(gòu)發(fā)生解旋或其他結(jié)構(gòu)變化,使包裹在其中的藥物釋放出來,實(shí)現(xiàn)藥物的靶向釋放。通過在DNA納米結(jié)構(gòu)中引入特殊的分子開關(guān)或響應(yīng)元件,也可以實(shí)現(xiàn)對(duì)藥物釋放的精確調(diào)控。這些分子開關(guān)可以在特定的外部信號(hào)(如光、磁場(chǎng)等)的作用下發(fā)生狀態(tài)改變,從而控制藥物的釋放,為實(shí)現(xiàn)遠(yuǎn)程控制藥物釋放提供了可能。4.1.2藥物裝載與釋放機(jī)制藥物的有效裝載和精準(zhǔn)釋放是藥物遞送系統(tǒng)的核心環(huán)節(jié),DNA納米結(jié)構(gòu)在這方面展現(xiàn)出獨(dú)特的機(jī)制和優(yōu)勢(shì),為實(shí)現(xiàn)高效的藥物遞送提供了有力保障。藥物裝載是DNA納米結(jié)構(gòu)作為藥物載體的首要步驟,其方式豐富多樣,各有特點(diǎn)。共價(jià)鍵結(jié)合是一種常用的藥物裝載方式。對(duì)于一些具有活性基團(tuán)的藥物分子,如含有氨基、羧基、羥基等基團(tuán)的藥物,可以通過化學(xué)反應(yīng)與DNA分子上相應(yīng)的活性基團(tuán)形成共價(jià)鍵,從而將藥物穩(wěn)定地連接到DNA納米結(jié)構(gòu)上。在DNA分子的磷酸骨架或堿基上引入羧基,利用1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亞胺鹽酸鹽(EDC)和N-羥基琥珀酰亞胺(NHS)等活化試劑,將藥物分子的氨基與DNA分子上的羧基進(jìn)行偶聯(lián)反應(yīng),實(shí)現(xiàn)藥物與DNA納米結(jié)構(gòu)的共價(jià)結(jié)合。這種裝載方式能夠使藥物與載體之間形成穩(wěn)定的連接,有效防止藥物在運(yùn)輸過程中的提前泄漏,確保藥物能夠完整地到達(dá)作用部位。然而,共價(jià)鍵結(jié)合也存在一定的局限性,如可能會(huì)影響藥物的活性,并且在藥物釋放時(shí),需要特定的化學(xué)反應(yīng)來斷裂共價(jià)鍵,過程相對(duì)復(fù)雜。非共價(jià)相互作用也是實(shí)現(xiàn)藥物裝載的重要方式。靜電相互作用是其中較為常見的一種。DNA分子帶有負(fù)電荷,而一些藥物分子帶有正電荷,通過靜電引力,兩者可以相互吸引并結(jié)合在一起。陽離子脂質(zhì)體與DNA納米結(jié)構(gòu)之間可以通過靜電作用形成復(fù)合物,同時(shí)陽離子脂質(zhì)體又可以與帶負(fù)電荷的細(xì)胞膜相互作用,從而提高細(xì)胞對(duì)DNA納米結(jié)構(gòu)-藥物復(fù)合物的攝取效率。一些抗癌藥物,如阿霉素,其分子結(jié)構(gòu)中含有氨基,在生理?xiàng)l件下帶正電荷,能夠與帶負(fù)電荷的DNA納米結(jié)構(gòu)通過靜電相互作用結(jié)合,實(shí)現(xiàn)藥物的裝載。氫鍵作用和π-π堆積作用也在藥物裝載中發(fā)揮著重要作用。一些含有羥基、氨基等極性基團(tuán)的藥物分子可以與DNA分子中的堿基或磷酸骨架形成氫鍵,實(shí)現(xiàn)與DNA納米結(jié)構(gòu)的結(jié)合。對(duì)于具有芳香環(huán)結(jié)構(gòu)的藥物分子,如多環(huán)芳烴類藥物,它們可以與DNA分子中的堿基通過π-π堆積作用相互結(jié)合。這些非共價(jià)相互作用方式相對(duì)溫和,對(duì)藥物活性的影響較小,并且在一定條件下具有可逆性,為藥物的釋放提供了便利。包封也是一種常用的藥物裝載策略,尤其適用于一些小分子藥物或生物大分子藥物。通過合理設(shè)計(jì)DNA納米結(jié)構(gòu)的三維空間,使其形成具有特定空腔的結(jié)構(gòu),藥物分子可以被包裹在這些空腔內(nèi)。利用DNA折紙技術(shù)構(gòu)建的納米籠或納米管結(jié)構(gòu),其內(nèi)部具有一定的空間,可以容納藥物分子。在構(gòu)建過程中,通過調(diào)整DNA鏈的序列和折疊方式,控制納米結(jié)構(gòu)的孔徑和內(nèi)部空間大小,使其能夠有效地包封藥物。這種包封方式可以保護(hù)藥物免受外界環(huán)境的影響,提高藥物的穩(wěn)定性,同時(shí)也便于對(duì)藥物進(jìn)行集中運(yùn)輸和釋放。藥物釋放機(jī)制與藥物裝載方式密切相關(guān),并且受到多種因素的調(diào)控。環(huán)境響應(yīng)性釋放是DNA納米結(jié)構(gòu)藥物載體實(shí)現(xiàn)藥物精準(zhǔn)釋放的重要機(jī)制之一。如前所述,腫瘤微環(huán)境與正常組織存在顯著差異,包括pH值、酶濃度、氧化還原電位等。利用這些差異,設(shè)計(jì)對(duì)腫瘤微環(huán)境敏感的DNA納米結(jié)構(gòu)藥物載體,可以實(shí)現(xiàn)藥物在腫瘤部位的特異性釋放。腫瘤組織的pH值通常呈酸性,研究人員設(shè)計(jì)了對(duì)酸性敏感的DNA納米結(jié)構(gòu),其表面修飾有對(duì)pH值變化敏感的基團(tuán)。在正常生理pH值條件下,這些基團(tuán)處于穩(wěn)定狀態(tài),藥物被包裹在納米結(jié)構(gòu)內(nèi)部;當(dāng)載體進(jìn)入腫瘤微環(huán)境,酸性條件促使敏感基團(tuán)發(fā)生質(zhì)子化或其他化學(xué)反應(yīng),導(dǎo)致DNA納米結(jié)構(gòu)的構(gòu)象發(fā)生變化,藥物從納米結(jié)構(gòu)中釋放出來。腫瘤組織中某些酶的表達(dá)水平較高,如蛋白酶、酯酶等?;诖耍O(shè)計(jì)含有特定酶識(shí)別序列的DNA納米結(jié)構(gòu),當(dāng)載體到達(dá)腫瘤部位,酶與識(shí)別序列結(jié)合并進(jìn)行催化反應(yīng),導(dǎo)致DNA納米結(jié)構(gòu)的斷裂或解組裝,從而釋放藥物。除環(huán)境響應(yīng)性釋放外,外部刺激響應(yīng)性釋放也是一種重要的藥物釋放機(jī)制。光響應(yīng)釋放是其中一種常見的方式。在DNA納米結(jié)構(gòu)中引入光敏感基團(tuán),如偶氮苯、香豆素等。在特定波長(zhǎng)的光照下,光敏感基團(tuán)發(fā)生光異構(gòu)化反應(yīng),導(dǎo)致DNA納米結(jié)構(gòu)的構(gòu)象發(fā)生變化,從而觸發(fā)藥物釋放。利用近紅外光照射,可以實(shí)現(xiàn)對(duì)深層組織中藥物載體的遠(yuǎn)程控制釋放,避免對(duì)正常組織造成損傷。磁場(chǎng)響應(yīng)釋放也是一種有潛力的方式。將磁性納米顆粒與DNA納米結(jié)構(gòu)結(jié)合,在外部磁場(chǎng)的作用下,磁性納米顆粒產(chǎn)生熱量或發(fā)生振動(dòng),促使DNA納米結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性改變,實(shí)現(xiàn)藥物的釋放。這種方式在腫瘤熱療和藥物釋放的聯(lián)合治療中具有潛在的應(yīng)用價(jià)值。4.2應(yīng)用案例與效果評(píng)估4.2.1抗癌藥物的遞送以阿霉素(Doxorubicin,DOX)這一經(jīng)典的抗癌藥物為例,其在癌癥治療中發(fā)揮著重要作用,但由于缺乏靶向性,在殺傷腫瘤細(xì)胞的同時(shí),也會(huì)對(duì)正常細(xì)胞造成嚴(yán)重?fù)p傷,引發(fā)如心臟毒性、骨髓抑制等一系列嚴(yán)重的副作用,限制了其臨床應(yīng)用。而DNA納米結(jié)構(gòu)作為藥物載體,為解決這一難題提供了新的途徑。研究人員利用DNA折紙技術(shù)構(gòu)建了一種具有特定結(jié)構(gòu)的DNA納米載體。該載體呈納米籠狀結(jié)構(gòu),內(nèi)部具有足夠的空間用于裝載阿霉素分子。通過非共價(jià)相互作用,阿霉素分子被高效地包封在納米籠內(nèi),形成穩(wěn)定的藥物-納米載體復(fù)合物。為實(shí)現(xiàn)對(duì)腫瘤細(xì)胞的靶向遞送,研究人員在DNA納米籠的表面修飾了針對(duì)腫瘤細(xì)胞表面特異性標(biāo)志物的核酸適配體。這些核酸適配體能夠特異性地識(shí)別并結(jié)合腫瘤細(xì)胞表面的相應(yīng)受體,如在乳腺癌細(xì)胞表面高表達(dá)的人表皮生長(zhǎng)因子受體2(HER2),與之具有特異性結(jié)合能力的核酸適配體被修飾在DNA納米籠表面。當(dāng)載藥DNA納米載體進(jìn)入體內(nèi)后,核酸適配體引導(dǎo)納米載體特異性地靶向乳腺癌細(xì)胞,實(shí)現(xiàn)藥物的精準(zhǔn)定位。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示出DNA納米結(jié)構(gòu)在提高阿霉素療效和降低副作用方面的顯著作用。在體外細(xì)胞實(shí)驗(yàn)中,將載有阿霉素的DNA納米載體與乳腺癌細(xì)胞共同孵育,相較于游離的阿霉素,DNA納米載體能夠顯著提高乳腺癌細(xì)胞對(duì)阿霉素的攝取效率。通過熒光顯微鏡觀察發(fā)現(xiàn),載藥DNA納米載體能夠特異性地聚集在乳腺癌細(xì)胞周圍,并高效地進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)部,使細(xì)胞內(nèi)阿霉素的濃度顯著增加,從而增強(qiáng)了對(duì)乳腺癌細(xì)胞的殺傷效果。在體內(nèi)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中,以荷瘤小鼠為模型,分別給予游離阿霉素和載藥DNA納米載體進(jìn)行治療。結(jié)果表明,接受載藥DNA納米載體治療的荷瘤小鼠,腫瘤生長(zhǎng)受到明顯抑制,腫瘤體積顯著減小,小鼠的生存時(shí)間明顯延長(zhǎng)。而且,由于DNA納米載體的靶向作用,阿霉素主要富集在腫瘤組織中,減少了對(duì)心臟、肝臟等正常器官的暴露,降低了阿霉素對(duì)正常組織的毒副作用。通過檢測(cè)小鼠心臟功能指標(biāo)和骨髓細(xì)胞數(shù)量等發(fā)現(xiàn),接受載藥DNA納米載體治療的小鼠,心臟毒性和骨髓抑制等副作用明顯減輕,與接受游離阿霉素治療的小鼠相比,心臟功能指標(biāo)更接近正常水平,骨髓細(xì)胞數(shù)量也維持在相對(duì)穩(wěn)定的狀態(tài)。由此可見,DNA納米結(jié)構(gòu)作為抗癌藥物的遞送載體,能夠有效提高藥物的靶向性和細(xì)胞攝取效率,增強(qiáng)抗癌藥物對(duì)腫瘤細(xì)胞的殺傷作用,同時(shí)顯著降低藥物對(duì)正常組織的毒副作用,為癌癥的治療提供了更高效、安全的策略。4.2.2基因治療藥物的傳遞在基因治療領(lǐng)域,DNA納米結(jié)構(gòu)作為基因治療藥物的傳遞載體展現(xiàn)出巨大的應(yīng)用潛力,為攻克遺傳疾病等醫(yī)學(xué)難題提供了新的思路和方法。以針對(duì)遺傳性囊性纖維化(CysticFibrosis,CF)的基因治療為例,CF是一種由囊性纖維化跨膜傳導(dǎo)調(diào)節(jié)因子(CFTR)基因突變引起的常染色體隱性遺傳病,患者的CFTR蛋白功能異常,導(dǎo)致呼吸道、消化道等多個(gè)器官出現(xiàn)嚴(yán)重病變。傳統(tǒng)治療方法難以從根本上解決基因缺陷問題,而基因治療旨在通過將正常的CFTR基因?qū)牖颊呒?xì)胞,修復(fù)基因缺陷,從而達(dá)到治療目的。研究團(tuán)隊(duì)利用DNA納米技術(shù)構(gòu)建了一種基于DNA四面體結(jié)構(gòu)的基因傳遞載體。DNA四面體結(jié)構(gòu)具有良好的穩(wěn)定性和生物相容性,其獨(dú)特的三維結(jié)構(gòu)能夠有效地包裹和保護(hù)基因治療藥物,如攜帶正常CFTR基因的質(zhì)粒DNA。通過在DNA四面體表面修飾陽離子聚合物,如聚乙烯亞胺(PEI),增加了載體與帶負(fù)電荷的細(xì)胞膜之間的靜電相互作用,提高了細(xì)胞對(duì)載體的攝取效率。為實(shí)現(xiàn)對(duì)病變細(xì)胞的靶向傳遞,研究人員在DNA四面體表面進(jìn)一步偶聯(lián)了針對(duì)呼吸道上皮細(xì)胞的靶向分子,如特異性抗體片段。這些靶向分子能夠特異性地識(shí)別并結(jié)合呼吸道上皮細(xì)胞表面的抗原,引導(dǎo)載有CFTR基因的DNA納米載體精準(zhǔn)地遞送至病變細(xì)胞。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,DNA納米結(jié)構(gòu)在傳遞基因治療藥物中發(fā)揮了重要作用。在體外細(xì)胞實(shí)驗(yàn)中,將載有CFTR基因的DNA納米載體轉(zhuǎn)染至CF患者來源的呼吸道上皮細(xì)胞中,通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR和蛋白質(zhì)免疫印跡分析發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)染后的細(xì)胞中CFTR基因的表達(dá)水平顯著提高,CFTR蛋白的合成量明顯增加,且細(xì)胞的生理功能得到一定程度的恢復(fù),如氯離子轉(zhuǎn)運(yùn)功能逐漸趨于正常。在體內(nèi)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中,以CF小鼠模型為研究對(duì)象,通過氣管內(nèi)滴注的方式將載藥DNA納米載體遞送至小鼠呼吸道。結(jié)果顯示,接受治療的小鼠呼吸道上皮細(xì)胞中CFTR基因的表達(dá)得到有效恢復(fù),肺部炎癥減輕,黏液分泌減少,呼吸功能得到明顯改善。通過對(duì)小鼠肺部組織進(jìn)行病理切片分析和生理功能檢測(cè)發(fā)現(xiàn),與未接受治療的CF小鼠相比,治療組小鼠的肺部病變明顯減輕,肺功能指標(biāo)如肺順應(yīng)性、氣道阻力等得到顯著改善。DNA納米結(jié)構(gòu)在傳遞基因治療藥物中的應(yīng)用,為基因治療領(lǐng)域帶來了新的突破。它能夠有效地將基因治療藥物遞送至目標(biāo)細(xì)胞,實(shí)現(xiàn)基因的高效轉(zhuǎn)染和表達(dá),為遺傳疾病的治療提供了更具前景的策略,有望推動(dòng)基因治療從實(shí)驗(yàn)室研究向臨床應(yīng)用的轉(zhuǎn)化,為眾多遺傳疾病患者帶來新的希望。五、DNA納米結(jié)構(gòu)功能化在細(xì)胞工程中的應(yīng)用5.1細(xì)胞成像與追蹤5.1.1基于DNA納米結(jié)構(gòu)的細(xì)胞標(biāo)記技術(shù)基于DNA納米結(jié)構(gòu)的細(xì)胞標(biāo)記技術(shù),為細(xì)胞成像和追蹤領(lǐng)域帶來了革新性的突破,其原理精妙且獨(dú)特,應(yīng)用范圍廣泛。從原理層面剖析,該技術(shù)的核心在于利用DNA納米結(jié)構(gòu)的可編程性和生物相容性,將具有特定功能的DNA序列設(shè)計(jì)并構(gòu)建成納米級(jí)別的結(jié)構(gòu),然后通過多種方式使其與細(xì)胞實(shí)現(xiàn)特異性結(jié)合,從而達(dá)到標(biāo)記細(xì)胞的目的。其中,利用核酸適配體與細(xì)胞表面特異性標(biāo)志物的高度親和性是常用策略之一。核酸適配體是通過指數(shù)富集的配體系統(tǒng)進(jìn)化技術(shù)(SELEX)篩選得到的單鏈DNA或RNA分子,它們能夠折疊成獨(dú)特的三維結(jié)構(gòu),與細(xì)胞表面的特定蛋白、受體等分子特異性結(jié)合。針對(duì)腫瘤細(xì)胞表面高表達(dá)的表皮生長(zhǎng)因子受體(EGFR),科研人員篩選出與之特異性結(jié)合的核酸適配體,并將其修飾在DNA納米結(jié)構(gòu)表面。當(dāng)這種修飾后的DNA納米結(jié)構(gòu)與腫瘤細(xì)胞接觸時(shí),核酸適配體就會(huì)識(shí)別并緊密結(jié)合EGFR,從而使DNA納米結(jié)構(gòu)特異性地錨定在腫瘤細(xì)胞表面,實(shí)現(xiàn)對(duì)腫瘤細(xì)胞的標(biāo)記。在細(xì)胞成像和追蹤應(yīng)用中,基于DNA納米結(jié)構(gòu)的細(xì)胞標(biāo)記技術(shù)展現(xiàn)出卓越的性能。在細(xì)胞成像方面,通過在DNA納米結(jié)構(gòu)上標(biāo)記熒光基團(tuán),如熒光素、羅丹明等,利用熒光成像技術(shù)可以清晰地觀察到細(xì)胞的形態(tài)、位置和分布情況。在研究腫瘤細(xì)胞的遷移和侵襲過程中,將熒光標(biāo)記的DNA納米結(jié)構(gòu)標(biāo)記腫瘤細(xì)胞,然后在熒光顯微鏡下實(shí)時(shí)觀察,能夠直觀地看到腫瘤細(xì)胞在不同時(shí)間點(diǎn)的位置變化,以及它們與周圍細(xì)胞和組織的相互作用。這種高分辨率的成像效果,為深入研究細(xì)胞的生物學(xué)行為提供了有力的工具。在細(xì)胞追蹤領(lǐng)域,該技術(shù)同樣發(fā)揮著重要作用。在體內(nèi)細(xì)胞追蹤實(shí)驗(yàn)中,將標(biāo)記有DNA納米結(jié)構(gòu)的細(xì)胞注入動(dòng)物體內(nèi),通過熒光成像或其他成像技術(shù),可以長(zhǎng)時(shí)間、實(shí)時(shí)地追蹤細(xì)胞在體內(nèi)的命運(yùn)。在干細(xì)胞治療研究中,標(biāo)記后的干細(xì)胞在體內(nèi)的遷移、分化和歸巢等過程都可以被精確監(jiān)測(cè)。研究人員可以通過成像技術(shù)觀察干細(xì)胞是否成功遷移到損傷組織部位,以及它們?cè)谠摬课坏姆只闆r,從而評(píng)估干細(xì)胞治療的效果。而且,由于DNA納米結(jié)構(gòu)的生物相容性良好,在體內(nèi)不會(huì)引起明顯的免疫反應(yīng),保證了細(xì)胞追蹤實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性和可靠性。基于DNA納米結(jié)構(gòu)的細(xì)胞標(biāo)記技術(shù),以其獨(dú)特的原理和出色的應(yīng)用效果,為細(xì)胞成像和追蹤研究提供了高效、精準(zhǔn)的手段,推動(dòng)了細(xì)胞生物學(xué)、腫瘤學(xué)、再生醫(yī)學(xué)等多個(gè)領(lǐng)域的發(fā)展。5.1.2實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)細(xì)胞活動(dòng)功能化DNA納米結(jié)構(gòu)在實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)細(xì)胞生理過程和信號(hào)傳導(dǎo)方面展現(xiàn)出獨(dú)特的優(yōu)勢(shì),為深入理解細(xì)胞活動(dòng)提供了強(qiáng)有力的工具。細(xì)胞的生理過程復(fù)雜且動(dòng)態(tài)變化,信號(hào)傳導(dǎo)在其中起著關(guān)鍵的調(diào)控作用。功能化DNA納米結(jié)構(gòu)能夠通過巧妙的設(shè)計(jì),對(duì)細(xì)胞內(nèi)的各種生理信號(hào)和分子變化做出響應(yīng),從而實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)。在監(jiān)測(cè)細(xì)胞內(nèi)的離子濃度變化方面,以鈣離子為例,鈣離子是細(xì)胞內(nèi)重要的第二信使,參與多種細(xì)胞生理過程。研究人員設(shè)計(jì)了對(duì)鈣離子敏感的DNA納米結(jié)構(gòu),其中包含與鈣離子特異性結(jié)合的DNA序列。當(dāng)細(xì)胞內(nèi)鈣離子濃度發(fā)生變化時(shí),DNA納米結(jié)構(gòu)與鈣離子結(jié)合,導(dǎo)致其構(gòu)象發(fā)生改變。通過將熒光基團(tuán)標(biāo)記在DNA納米結(jié)構(gòu)上,利用熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)原理,構(gòu)象變化會(huì)引起熒光信號(hào)的變化。當(dāng)DNA納米結(jié)構(gòu)處于未結(jié)合鈣離子的狀態(tài)時(shí),熒光供體和受體之間距離較遠(yuǎn),F(xiàn)RET效率較低,熒光信號(hào)表現(xiàn)為供體熒光;而當(dāng)結(jié)合鈣離子后,DNA納米結(jié)構(gòu)構(gòu)象改變,熒光供體和受體靠近,F(xiàn)RET效率增強(qiáng),受體熒光信號(hào)增強(qiáng)。通過實(shí)時(shí)檢測(cè)這種熒光信號(hào)的變化,就可以實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)細(xì)胞內(nèi)鈣離子濃度的動(dòng)態(tài)變化,為研究細(xì)胞的興奮、收縮、分泌等生理過程提供重要信息。在監(jiān)測(cè)細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)表達(dá)和活性變化方面,功能化DNA納米結(jié)構(gòu)也發(fā)揮著重要作用。利用核酸適配體對(duì)特定蛋白質(zhì)的高度特異性識(shí)別能力,將核酸適配體修飾在DNA納米結(jié)構(gòu)表面。當(dāng)細(xì)胞內(nèi)目標(biāo)蛋白質(zhì)表達(dá)或活性發(fā)生變化時(shí),核酸適配體與蛋白質(zhì)特異性結(jié)合,引發(fā)DNA納米結(jié)構(gòu)的一系列變化。在檢測(cè)腫瘤細(xì)胞內(nèi)的腫瘤標(biāo)志物蛋白質(zhì)時(shí),核酸適配體與腫瘤標(biāo)志物結(jié)合后,可能會(huì)導(dǎo)致DNA納米結(jié)構(gòu)的電荷分布、空間結(jié)構(gòu)發(fā)生改變。通過將DNA納米結(jié)構(gòu)與納米電極結(jié)合,利用電化學(xué)檢測(cè)方法,可以實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)這些變化,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)腫瘤標(biāo)志物蛋白質(zhì)表達(dá)和活性的實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)。這種監(jiān)測(cè)方式具有高靈敏度和特異性,能夠在細(xì)胞內(nèi)復(fù)雜的生物分子環(huán)境中準(zhǔn)確檢測(cè)目標(biāo)蛋白質(zhì)的變化,為腫瘤的早期診斷和治療監(jiān)測(cè)提供重要依據(jù)。功能化DNA納米結(jié)構(gòu)還可以用于監(jiān)測(cè)細(xì)胞內(nèi)的信號(hào)傳導(dǎo)通路。細(xì)胞內(nèi)的信號(hào)傳導(dǎo)是一個(gè)復(fù)雜的級(jí)聯(lián)反應(yīng)過程,涉及多個(gè)信號(hào)分子和蛋白質(zhì)的相互作用。通過設(shè)計(jì)能夠響應(yīng)信號(hào)傳導(dǎo)通路中關(guān)鍵信號(hào)分子的DNA納米結(jié)構(gòu),可以實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)信號(hào)傳導(dǎo)的激活和傳遞過程。在監(jiān)測(cè)細(xì)胞內(nèi)的絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)信號(hào)通路時(shí),設(shè)計(jì)對(duì)該信號(hào)通路中的關(guān)鍵激酶具有特異性識(shí)別能力的DNA納米結(jié)構(gòu)。當(dāng)MAPK信號(hào)通路被激活時(shí),激酶的活性變化會(huì)導(dǎo)致DNA納米結(jié)構(gòu)與激酶結(jié)合,進(jìn)而引發(fā)DNA納米結(jié)構(gòu)的熒光信號(hào)變化。通過實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)熒光信號(hào),就可以實(shí)時(shí)了解MAPK信號(hào)通路的激活狀態(tài)和傳導(dǎo)過程,為研究細(xì)胞的增殖、分化、凋亡等生理過程提供深入的機(jī)制研究線索。5.2細(xì)胞調(diào)控與干預(yù)5.2.1調(diào)節(jié)細(xì)胞行為功能化DNA納米結(jié)構(gòu)在調(diào)節(jié)細(xì)胞行為方面展現(xiàn)出獨(dú)特的能力,為細(xì)胞生物學(xué)研究和再生醫(yī)學(xué)應(yīng)用開辟了新的途徑,其在調(diào)節(jié)細(xì)胞增殖、分化和遷移等關(guān)鍵過程中發(fā)揮著重要作用。在細(xì)胞增殖調(diào)控方面,研究發(fā)現(xiàn)特定設(shè)計(jì)的DNA納米結(jié)構(gòu)能夠影響細(xì)胞周期進(jìn)程。一些功能化DNA納米結(jié)構(gòu)可以通過與細(xì)胞內(nèi)的信號(hào)分子相互作用,調(diào)節(jié)細(xì)胞周期相關(guān)蛋白的表達(dá)和活性。通過將與細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶(CDK)抑制劑序列互補(bǔ)的DNA納米結(jié)構(gòu)導(dǎo)入細(xì)胞,納米結(jié)構(gòu)能夠特異性地結(jié)合并調(diào)控CDK抑制劑的表達(dá)水平。當(dāng)細(xì)胞處于增殖活躍期時(shí),DNA納米結(jié)構(gòu)與CDK抑制劑mRNA的互補(bǔ)序列結(jié)合,阻止其翻譯過程,從而減少CDK抑制劑的表達(dá),使得CDK活性增強(qiáng),促進(jìn)細(xì)胞周期的進(jìn)展,進(jìn)而促進(jìn)細(xì)胞增殖。相反,在需要抑制細(xì)胞增殖的情況下,通過設(shè)計(jì)不同的DNA納米結(jié)構(gòu),使其促進(jìn)CDK抑制劑的表達(dá),抑制CDK活性,從而將細(xì)胞周期阻滯在特定階段,抑制細(xì)胞增殖。這種對(duì)細(xì)胞增殖的精確調(diào)控在組織工程中具有重要意義,例如在構(gòu)建人工組織時(shí),通過調(diào)控種子細(xì)胞的增殖速率,可以更好地控制組織的生長(zhǎng)和發(fā)育,使其形成具有合適結(jié)構(gòu)和功能的組織。在細(xì)胞分化調(diào)節(jié)領(lǐng)域,功能化DNA納米結(jié)構(gòu)同樣發(fā)揮著關(guān)鍵作用。以間充質(zhì)干細(xì)胞(MSC)向成骨細(xì)胞分化為例,研究人員設(shè)計(jì)了一種表面修飾有骨形態(tài)發(fā)生蛋白2(BMP-2)模擬肽的DNA納米結(jié)構(gòu)。BMP-2是一種在骨形成過程中起關(guān)鍵作用的生長(zhǎng)因子,其模擬肽能夠與MSC表面的相應(yīng)受體結(jié)合,激活細(xì)胞內(nèi)的成骨分化信號(hào)通路。DNA納米結(jié)構(gòu)作為載體,能夠有效地將模擬肽遞送至MSC表面,并保持其生物活性。當(dāng)這種功能化DNA納米結(jié)構(gòu)與MSC接觸時(shí),模擬肽與受體結(jié)合,激活下游的Smad信號(hào)通路,促進(jìn)成骨相關(guān)基因如Runx2、骨鈣素等的表達(dá),從而誘導(dǎo)MSC向成骨細(xì)胞分化。通過控制DNA納米結(jié)構(gòu)的濃度和作用時(shí)間,可以精確調(diào)節(jié)MSC的分化程度和方向,為骨組織工程和再生醫(yī)學(xué)提供了有力的工具。細(xì)胞遷移對(duì)于胚胎發(fā)育、組織修復(fù)和免疫反應(yīng)等生理過程至關(guān)重要,功能化DNA納米結(jié)構(gòu)也能夠?qū)ζ溥M(jìn)行有效調(diào)控??蒲腥藛T利用核酸適配體對(duì)細(xì)胞表面特定分子的特異性識(shí)別能力,設(shè)計(jì)了一種能夠靶向結(jié)合腫瘤細(xì)胞表面整合素αvβ3的DNA納米結(jié)構(gòu)。整合素αvβ3在腫瘤細(xì)胞遷移和侵襲過程中發(fā)揮著重要作用。當(dāng)這種功能化DNA納米結(jié)構(gòu)與腫瘤細(xì)胞接觸時(shí),核酸適配體與整合素αvβ3特異性結(jié)合,阻斷了整合素與細(xì)胞外基質(zhì)的相互作用,從而抑制了腫瘤細(xì)胞的遷移和侵襲能力。在傷口愈合研究中,通過設(shè)計(jì)能夠促進(jìn)細(xì)胞遷移的DNA納米結(jié)構(gòu),如表面修飾有細(xì)胞遷移促進(jìn)因子的納米結(jié)構(gòu),可以加速成纖維細(xì)胞等細(xì)胞向傷口部位的遷移,促進(jìn)傷口愈合。將含有表皮生長(zhǎng)因子(EGF)模擬序列的DNA納米結(jié)構(gòu)應(yīng)用于傷口愈合模型中,EGF模擬序列能夠與成纖維細(xì)胞表面的EGF受體結(jié)合,激活細(xì)胞內(nèi)的遷移相關(guān)信號(hào)通路,促進(jìn)成纖維細(xì)胞向傷口部位遷移,加速傷口的愈合過程。5.2.2基因編輯與調(diào)控在基因編輯技術(shù)中,DNA納米結(jié)構(gòu)展現(xiàn)出獨(dú)特的應(yīng)用價(jià)值,為基因治療和細(xì)胞工程領(lǐng)域帶來了新的突破和發(fā)展機(jī)遇。CRISPR-Cas9系統(tǒng)是目前廣泛應(yīng)用的基因編輯技術(shù),然而,其在體內(nèi)的高效遞送和精準(zhǔn)調(diào)控一直是研究的難點(diǎn)。DNA納米結(jié)構(gòu)作為一種新型的遞送載體,為解決這些問題提供了新的思路。丁寶全課題組開發(fā)的基于DNA折紙的基因編輯系統(tǒng),將靶向性核酸適體(aptamer)、內(nèi)涵體逃逸肽(HA)和富含PAM位點(diǎn)的核酸序列精確定位組裝到同一個(gè)DNA折紙結(jié)構(gòu)上。末端延伸的sgRNA和Cas9蛋白相結(jié)合所形成的基因編輯復(fù)合物,能夠被高效地招募和組裝到核酸納米載體上。在含有二硫鍵的核酸分子鎖的作用下,成功組裝得到基于DNA納米機(jī)器的基因編輯遞送系統(tǒng)。在核酸適體的精確引導(dǎo)下,該DNA納米機(jī)器能夠靶向識(shí)別并被內(nèi)化進(jìn)入腫瘤細(xì)胞,進(jìn)而在內(nèi)涵體逃逸肽和谷胱甘肽(GSH)的作用下,順利打開DNA折紙結(jié)構(gòu),通過RNaseH酶裂解釋放sgRNA/Cas9復(fù)合物,實(shí)現(xiàn)對(duì)腫瘤細(xì)胞的基因編輯。小鼠活體實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,該系統(tǒng)表現(xiàn)出非常好的腫瘤靶向性和生物相容性,能夠?qū)铙w腫瘤產(chǎn)生顯著的基因編輯和治療效果。這種基于DNA納米結(jié)構(gòu)的基因編輯遞送系統(tǒng),不僅提高了CRISPR-Cas9系統(tǒng)的靶向性,減少了脫靶效應(yīng),還增強(qiáng)了其在細(xì)胞內(nèi)的穩(wěn)定性和活性,為基因治療的發(fā)展提供了新的途徑。在基因調(diào)控方面,DNA納米結(jié)構(gòu)可以通過與特定的基因序列相互作用,實(shí)現(xiàn)對(duì)基因表達(dá)的精確調(diào)控。利用DNA納米結(jié)構(gòu)的可編程性,設(shè)計(jì)能夠與基因啟動(dòng)子區(qū)域特異性結(jié)合的納米結(jié)構(gòu)。這些納米結(jié)構(gòu)可以模擬轉(zhuǎn)錄因子的作用,與基因啟動(dòng)子區(qū)域的特定序列結(jié)合,激活或抑制基因的轉(zhuǎn)錄過程。通過設(shè)計(jì)含有與特定基因啟動(dòng)子區(qū)域互補(bǔ)序列的DNA納米結(jié)構(gòu),將其導(dǎo)入細(xì)胞后,納米結(jié)構(gòu)能夠與啟動(dòng)子區(qū)域結(jié)合,阻止轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合,從而抑制基因的表達(dá)。相反,設(shè)計(jì)能夠招募轉(zhuǎn)錄激活因子的DNA納米結(jié)構(gòu),可以促進(jìn)基因的轉(zhuǎn)錄和表達(dá)。這種基于DNA納米結(jié)構(gòu)的基因調(diào)控方法,具有高度的特異性和可編程性,能夠針對(duì)不同的基因和調(diào)控需求進(jìn)行精確設(shè)計(jì),為細(xì)胞工程和基因治療提供了有力的工具。在細(xì)胞工程中,通過調(diào)控特定基因的表達(dá),可以實(shí)現(xiàn)對(duì)細(xì)胞功能和特性的精確調(diào)控,如誘導(dǎo)干細(xì)胞向特定細(xì)胞類型分化,增強(qiáng)細(xì)胞的治療效果等。在基因治療中,通過調(diào)控與疾病相關(guān)基因的表達(dá),可以達(dá)到治療疾病的目的,為攻克遺傳疾病和難治性疾病提供了新的策略。六、挑戰(zhàn)與展望6.1當(dāng)前面臨的挑戰(zhàn)6.1.1穩(wěn)定性與生物降解性問題DNA納米結(jié)構(gòu)在生物體內(nèi)的穩(wěn)定性和降解性是其實(shí)際應(yīng)用中面臨的關(guān)鍵問題,這些問題直接影響著DNA納米結(jié)構(gòu)在體內(nèi)的功能發(fā)揮和安全性。在生物體內(nèi),DNA納米結(jié)構(gòu)面臨著多種因素的挑戰(zhàn),其中核酸酶的存在是影響其穩(wěn)定性的重要因素之一。核酸酶是一類能夠催化核酸水解的酶,廣泛存在于生物體內(nèi)的各種組織和體液中。它們能夠識(shí)別并切割DNA分子的磷酸二酯鍵,導(dǎo)致DNA納米結(jié)構(gòu)的降解。在血液中,血清核酸酶的活性較高,當(dāng)DNA納米結(jié)構(gòu)進(jìn)入血液循環(huán)系統(tǒng)后,很容易受到血清核酸酶的攻擊,從而使其結(jié)構(gòu)完整性遭到破壞。某些DNA納米結(jié)構(gòu)在血清中孵育較短時(shí)間后,就會(huì)出現(xiàn)明顯的降解現(xiàn)象,導(dǎo)致其功能喪失。DNA納米結(jié)構(gòu)在細(xì)胞內(nèi)也會(huì)面臨核酸酶的作用,細(xì)胞內(nèi)的核酸酶會(huì)對(duì)進(jìn)入細(xì)胞的DNA納米結(jié)構(gòu)進(jìn)行降解,影響其在細(xì)胞內(nèi)的作用時(shí)間和效果。為提高DNA納米結(jié)構(gòu)在生物體內(nèi)的穩(wěn)定性,研究人員采取了多種策略。化學(xué)修飾是常用的方法之一,通過在DNA分子上引入特定的化學(xué)基團(tuán),可以增強(qiáng)其對(duì)核酸酶的抗性。對(duì)DNA的磷酸骨架進(jìn)行甲基化修飾,能夠改變其電荷分布和空間結(jié)構(gòu),降低核酸酶對(duì)其識(shí)別和切割的效率。在DNA分子的磷酸基團(tuán)上引入甲基,使得磷酸骨架的負(fù)電荷減少,從而降低了核酸酶與之結(jié)合的親和力,提高了DNA納米結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性。在DNA的堿基或脫氧核糖上進(jìn)行修飾,如引入氟原子、甲氧基等基團(tuán),也能夠增強(qiáng)DNA納米結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性。這些修飾基團(tuán)可以改變DNA分子的電子云分布和空間構(gòu)象,增加其對(duì)核酸酶的抵抗能力。將氟原子引入到DNA的脫氧核糖的2'-羥基位置,能夠增強(qiáng)DNA分子的穩(wěn)定性,延長(zhǎng)其在生物體內(nèi)的半衰期。然而,增強(qiáng)DNA納米結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性也帶來了生物降解性方面的新問題。過度增強(qiáng)穩(wěn)定性可能導(dǎo)致DNA納米結(jié)構(gòu)在完成其生物學(xué)功能后難以在體內(nèi)自然降解,從而在體內(nèi)長(zhǎng)期積累。這種長(zhǎng)期積累可能會(huì)引發(fā)一系列潛在風(fēng)險(xiǎn),如免疫反應(yīng)、對(duì)正常生理功能的干擾等。一些穩(wěn)定性較高的DNA納米結(jié)構(gòu)在體內(nèi)長(zhǎng)時(shí)間存在,可能會(huì)被免疫系統(tǒng)識(shí)別為外來異物,引發(fā)免疫細(xì)胞的攻擊,導(dǎo)致炎癥反應(yīng)等免疫相關(guān)問題。而且,長(zhǎng)期積累的DNA納米結(jié)構(gòu)還可能會(huì)干擾細(xì)胞的正常代謝過程,影響細(xì)胞的生理功能。為解決生物降解性問題,研究人員正在探索設(shè)計(jì)具有可調(diào)控降解性能的DNA納米結(jié)構(gòu)。通過引入對(duì)特定環(huán)境因素敏感的化學(xué)鍵或序列,使DNA納米結(jié)構(gòu)在特定條件下能夠發(fā)生降解。在DNA納米結(jié)構(gòu)中引入對(duì)pH值敏感的化學(xué)鍵,如酸敏感的縮醛鍵。當(dāng)DNA納米結(jié)構(gòu)處于正常生理pH值環(huán)境時(shí),縮醛鍵保持穩(wěn)定,保證納米結(jié)構(gòu)的完整性和功能;而當(dāng)納米結(jié)構(gòu)到達(dá)特定的病變部位,如腫瘤組織的酸性微環(huán)境中,縮醛鍵在酸性條件下發(fā)生水解,導(dǎo)致DNA納米結(jié)構(gòu)的降解,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)納米結(jié)構(gòu)降解的精準(zhǔn)調(diào)控。引入對(duì)酶敏感的序列也是一種可行的策略。設(shè)計(jì)含有特定酶識(shí)別序列的DNA納米結(jié)構(gòu),當(dāng)遇到體內(nèi)特定的酶時(shí),酶與識(shí)別序列結(jié)合并進(jìn)行催化反應(yīng),導(dǎo)致DNA納米結(jié)構(gòu)的斷裂和降解。在DNA納米結(jié)構(gòu)中引入尿嘧啶殘基,利用體內(nèi)的尿嘧啶DNA糖苷酶(UDG)對(duì)尿嘧啶的特異性識(shí)別和切割作用,當(dāng)UDG存在時(shí),能夠?qū)心蜞奏さ腄NA納米結(jié)構(gòu)進(jìn)行降解,實(shí)現(xiàn)對(duì)納米結(jié)構(gòu)降解過程的調(diào)控。6.1.2大規(guī)模制備與成本控制大規(guī)模制備技術(shù)的不成熟是當(dāng)前面臨的主要技術(shù)難題之一。盡管DNA納米結(jié)構(gòu)的構(gòu)建方法在實(shí)驗(yàn)室研究中取得了顯著進(jìn)展,但從實(shí)驗(yàn)室規(guī)模向大規(guī)模制備轉(zhuǎn)化時(shí),仍存在諸多挑戰(zhàn)。DNA折紙術(shù)雖然能夠構(gòu)建出高度精確和復(fù)雜的納米結(jié)構(gòu),但該方法通常需要大量的短鏈DNA(訂書釘鏈)來精確折疊長(zhǎng)鏈DNA(腳手架鏈),這使得制備過程繁瑣且耗時(shí)。在大規(guī)模制備中,精確控制每條DNA鏈的濃度、比例和反應(yīng)條件變得極為困難,容易導(dǎo)致結(jié)構(gòu)的不一致性和產(chǎn)率低下。瓦片組裝法雖然在一定程度上適合大規(guī)模自組裝,但在構(gòu)建復(fù)雜結(jié)構(gòu)時(shí),對(duì)瓦片單元的設(shè)計(jì)和組裝過程的控制要求極高,目前還難以實(shí)現(xiàn)大規(guī)模、高效率的制備。而且,這些制備方法往往需要使用昂貴的DNA合成試劑和高精度的儀器設(shè)備,進(jìn)一步增加了大規(guī)模制備的難度和成本。成本控制是限制DNA納米結(jié)構(gòu)產(chǎn)業(yè)化發(fā)展的另一個(gè)關(guān)鍵因素。DNA合成成本是制備DNA納米結(jié)構(gòu)的主要成本之一。目前,化學(xué)合成DNA的成本仍然相對(duì)較高,尤其是對(duì)于長(zhǎng)度較長(zhǎng)、序列復(fù)雜的DNA鏈,合成成本更是顯著增加。隨著所需DNA納米結(jié)構(gòu)規(guī)模的增大,DNA合成的總成本將急劇上升,這使得大規(guī)模制備DNA納米結(jié)構(gòu)在經(jīng)濟(jì)上難以承受。除DNA合成成本外,制備過程中的其他成本,如反應(yīng)試劑、儀器設(shè)備的使用和維護(hù)成本等,也不容忽視。在DNA納米結(jié)構(gòu)的制備過程中,需要使用各種緩沖液、酶等反應(yīng)試劑,這些試劑的消耗在大規(guī)模制備中會(huì)形成較大的成本支出。高精度的儀器設(shè)備,如熒光分光光度計(jì)、原子力顯微鏡等,用于DNA納米結(jié)構(gòu)的表征和質(zhì)量控制,其購買和維護(hù)成本也較高,進(jìn)一步提高了制備成本。高昂的制備成本嚴(yán)重制約了DNA納米結(jié)構(gòu)的產(chǎn)業(yè)化發(fā)展。在生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用中,如藥物遞送和疾病診斷,需要大量的DNA納米結(jié)構(gòu)才能滿足臨床需求。然而,目前的高成本使得DNA納米結(jié)構(gòu)在這些領(lǐng)域的應(yīng)用受到限制,難以實(shí)現(xiàn)大規(guī)模的商業(yè)化生產(chǎn)和臨床推廣。在癌癥治療中,若要使用DNA納米結(jié)構(gòu)作為藥物載體進(jìn)行大規(guī)模的臨床治療,高昂的制備成本將使得治療費(fèi)用難以被患者接受,從而阻礙了該技術(shù)的臨床應(yīng)用。在生物傳感器領(lǐng)域,雖然DNA納米結(jié)構(gòu)在檢測(cè)靈敏度和特異性方面具有優(yōu)勢(shì),但由于成本問題,難以實(shí)現(xiàn)大規(guī)模的生產(chǎn)和應(yīng)用,限制了其在市場(chǎng)上的競(jìng)爭(zhēng)力。6.1.3體內(nèi)安全性與免疫原性體內(nèi)安全性和免疫原性是DNA納米結(jié)構(gòu)邁向臨床應(yīng)用的重要阻礙,對(duì)其深入研究和有效解決是實(shí)現(xiàn)臨床轉(zhuǎn)化的關(guān)鍵。在體內(nèi)安全性方面,雖然DNA是生物體內(nèi)天然存在的生物大分子,理論上具有良好的生物相容性,但當(dāng)DNA被構(gòu)建成納米結(jié)構(gòu)并引入體內(nèi)后,其安全性仍存在諸多不確定性。DNA納米結(jié)構(gòu)在體內(nèi)的代謝途徑和最終歸宿尚未完全明確。進(jìn)入體內(nèi)的DNA納米結(jié)構(gòu)可能會(huì)被細(xì)胞攝取,但其在細(xì)胞內(nèi)的處理過程以及是否會(huì)對(duì)細(xì)胞的正常生理功能產(chǎn)生長(zhǎng)期影響還不清楚。一些研究表明,DNA納米結(jié)構(gòu)可能會(huì)干擾細(xì)胞內(nèi)的正常核酸代謝過程,影響基因表達(dá)和蛋白質(zhì)合成。某些DNA納米結(jié)構(gòu)在細(xì)胞內(nèi)可能會(huì)與內(nèi)源性核酸相互作用,導(dǎo)致基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的紊亂,進(jìn)而影響細(xì)胞的生長(zhǎng)、分化和凋亡等生理過程。而且,DNA納米結(jié)構(gòu)在體內(nèi)的分布也可能不均勻,可能會(huì)在某些組織或器官中發(fā)生積累。這種積累可能會(huì)對(duì)局部組織和器官的功能產(chǎn)生影響,如引起炎癥反應(yīng)、組織損傷等。研究發(fā)現(xiàn),一些DNA納米結(jié)構(gòu)在肝臟和脾臟等器官中容易發(fā)生積累,長(zhǎng)期積累可能會(huì)導(dǎo)致這些器官的功能異常。免疫原性是DNA納米結(jié)構(gòu)面臨的另一個(gè)重要問題。盡管DNA本身通常被認(rèn)為免疫原性較低,但當(dāng)DNA納米結(jié)構(gòu)進(jìn)入體內(nèi)后,可能會(huì)被免疫系統(tǒng)識(shí)別為外來異物,從而引發(fā)免疫反應(yīng)。免疫系統(tǒng)中的免疫細(xì)胞,如巨噬細(xì)胞、樹突狀細(xì)胞等,能夠識(shí)別并攝取DNA納米結(jié)構(gòu)。這些免疫細(xì)胞表面的模式識(shí)別受體(PRRs),如Toll樣受體(TLRs)等,能夠識(shí)別DNA納米結(jié)構(gòu)中的特定分子模式,從而激活免疫細(xì)胞。激活的免疫細(xì)胞會(huì)分泌多種細(xì)胞因子和趨化因子,引發(fā)炎癥反應(yīng)和免疫應(yīng)答。過度的免疫反應(yīng)可能會(huì)導(dǎo)致機(jī)體的免疫損傷,影響DNA納米結(jié)構(gòu)的治療效果,甚至對(duì)機(jī)體造成危害。在藥物遞送應(yīng)用中,免疫反應(yīng)可能會(huì)導(dǎo)致DNA納米結(jié)構(gòu)被免疫系統(tǒng)清除,降低藥物的遞送效率,影響治療效果。而且,免疫反應(yīng)還可能引發(fā)過敏反應(yīng)等不良反應(yīng),對(duì)患者的健康造成威脅。體內(nèi)安全性和免疫原性問題對(duì)DNA納米結(jié)構(gòu)的臨床應(yīng)用形成了嚴(yán)重限制。在臨床治療中,確保治療手段的安全性是首要任務(wù)。如果DNA納米結(jié)構(gòu)的體內(nèi)安全性和免疫原性問題得不到有效解決,將難以獲得監(jiān)管部門的批準(zhǔn)進(jìn)入臨床應(yīng)用。在癌癥治療中,使用DNA納米結(jié)構(gòu)作為藥物載體或基因治療工具時(shí),若其安全性和免疫原性存在隱患,可能會(huì)導(dǎo)致患者在治療過程中出現(xiàn)嚴(yán)重的不良反應(yīng),這不僅無法達(dá)到治療目的,還可能會(huì)對(duì)患者的生命健康造成更大的危害。因此,深入研究DNA納米結(jié)構(gòu)的體內(nèi)安全性和免疫原性機(jī)制,開發(fā)有效的解決方案,是推動(dòng)其臨床應(yīng)用的關(guān)鍵步驟。6.2未來發(fā)展趨勢(shì)與展望6.2.1新型功能化策略的探索未來,新型功能化策略的探索將聚焦于開發(fā)更高效、精準(zhǔn)且具有獨(dú)特功能的方法,以進(jìn)一步拓展DNA納米結(jié)構(gòu)的應(yīng)用邊界。從功能化分子的創(chuàng)新角度來看,開發(fā)具有特殊功能的新型適配體和蛋白質(zhì)是重要方向。隨著篩選技術(shù)的不斷進(jìn)步,有望篩選出對(duì)更多種類目標(biāo)分子具有高親和力和特異性的核酸適配體,如針對(duì)新型病毒、罕見病標(biāo)志物等的適配體。這些新型適配體與DNA納米結(jié)構(gòu)結(jié)合后,將為相關(guān)疾病的診斷和治療提供更有力的工具。在新型冠狀病毒變異株不斷出現(xiàn)的背景下,開發(fā)能夠特異性識(shí)別變異株關(guān)鍵蛋白的核酸適配體,并將其與DNA納米結(jié)構(gòu)偶聯(lián),可構(gòu)建高靈敏的病毒檢測(cè)傳感器,實(shí)現(xiàn)對(duì)變異株的快速、準(zhǔn)確檢測(cè)。研發(fā)具有特定催化活性或調(diào)控功能的蛋白質(zhì),并將其與DNA納米結(jié)構(gòu)結(jié)合,可構(gòu)建具有特殊生物功能的納米器件。開發(fā)能夠催化特定化學(xué)反應(yīng)的酶與DNA納米結(jié)構(gòu)結(jié)合,可用于生物合成或生物傳感,實(shí)現(xiàn)對(duì)生物分子的高效檢測(cè)和合成。在響應(yīng)性功能化方面,探索對(duì)多種環(huán)境因素具有智能響應(yīng)的策略將是研究重點(diǎn)。設(shè)計(jì)對(duì)多種刺激因素(如溫度、pH值、光、磁場(chǎng)等)同時(shí)響應(yīng)
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