《產(chǎn)前外顯子組測(cè)序遺傳咨詢(xún)及報(bào)告規(guī)范(征求意見(jiàn)稿)》編制說(shuō)明_第1頁(yè)
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附件2

《產(chǎn)前外顯子組測(cè)序遺傳咨詢(xún)及報(bào)告規(guī)范

(征求意見(jiàn)稿)》編制說(shuō)明

一、工作簡(jiǎn)況

(一)任務(wù)來(lái)源

1、編制背景

隨著基因包(panel)測(cè)序、臨床/醫(yī)學(xué)外顯子組測(cè)序

(clinical/medicalexomesequencing)、全外顯子組測(cè)

(wholeexomesequencing)甚至全基因組測(cè)序(wholegenome

sequencing)等下一代測(cè)序(NextGenerationSequencing,NGS)

技術(shù)在臨床的廣泛應(yīng)用,疾病診斷、治療和預(yù)后都得到了更豐富、

更精準(zhǔn)的提示和建議。

在產(chǎn)前診斷領(lǐng)域,近年來(lái)也有逐漸增多的基于外顯子組測(cè)序

(exomesequencing,ES)技術(shù)的應(yīng)用嘗試。雖然國(guó)外針對(duì)這些

技術(shù)的臨床應(yīng)用出臺(tái)了相關(guān)指南、共識(shí)以及聯(lián)合聲明,但目前國(guó)

際上對(duì)這些技術(shù)在胎兒產(chǎn)前診斷應(yīng)用中的很多方面,如檢測(cè)方案、

數(shù)據(jù)解讀、結(jié)果報(bào)告等還處于摸索和循證階段。在產(chǎn)前診斷領(lǐng)域,

由于胎兒表型信息嚴(yán)重匱乏,針對(duì)臨床意義不確定(variantsof

uncertainsignificant,VUS)的基因變異及與檢測(cè)指征不相符

的意外發(fā)現(xiàn)等,一般建議依照檢測(cè)前咨詢(xún)溝通意見(jiàn)形成的協(xié)議進(jìn)

行報(bào)告。

目前國(guó)內(nèi)對(duì)ES的產(chǎn)前診斷應(yīng)用缺乏專(zhuān)家共識(shí)或指南,針對(duì)

具體操作過(guò)程中諸如知情告知的主要覆蓋內(nèi)容、數(shù)據(jù)分析的流程、

結(jié)果的解讀、報(bào)告的撰寫(xiě)及遺傳咨詢(xún)等方面均亟需細(xì)化。鑒于此,

國(guó)內(nèi)多家已經(jīng)開(kāi)展產(chǎn)前外顯子組測(cè)序檢測(cè)的產(chǎn)前診斷機(jī)構(gòu)或?qū)?/p>

驗(yàn)室在以國(guó)內(nèi)外最新指南和專(zhuān)家共識(shí)為參考的前提下,針對(duì)ES

在產(chǎn)前診斷中的臨床應(yīng)用細(xì)節(jié)展開(kāi)討論,重點(diǎn)對(duì)產(chǎn)前外顯子組測(cè)

序的檢測(cè)前咨詢(xún)要點(diǎn)、數(shù)據(jù)分析流程、報(bào)告標(biāo)準(zhǔn)及內(nèi)容和檢測(cè)后

咨詢(xún)等提供技術(shù)層面建議,以期達(dá)到ES在產(chǎn)前診斷中規(guī)范應(yīng)用

的目的。

2、必要性

(1)技術(shù)應(yīng)用的規(guī)范管理必要性

產(chǎn)前ES技術(shù)已在全國(guó)多家醫(yī)療機(jī)構(gòu)和第三方檢測(cè)機(jī)構(gòu)開(kāi)展

應(yīng)用。新的遺傳學(xué)檢測(cè)技術(shù)極大地為明確疾病原因提供了技術(shù)支

持的同時(shí),也帶來(lái)了許多問(wèn)題。不同的機(jī)構(gòu)由于技術(shù)能力不一,

對(duì)此技術(shù)的應(yīng)用尤其是適應(yīng)癥把握、報(bào)告撰寫(xiě)及解讀存在非常大

的差異,過(guò)度檢測(cè)、過(guò)度引產(chǎn)普遍存在。對(duì)臨床和病人造成非常

大的困擾。對(duì)此類(lèi)技術(shù)的單位資質(zhì)、實(shí)驗(yàn)室資質(zhì)、人員資質(zhì)要求

等,目前也無(wú)統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)可以參照?qǐng)?zhí)行。因此,加強(qiáng)對(duì)此類(lèi)技術(shù)

的管理非常有必要,一個(gè)規(guī)范的管理體系對(duì)技術(shù)的正規(guī)開(kāi)展可以

起到有效的監(jiān)管、技術(shù)引導(dǎo)作用。

(2)產(chǎn)前ES報(bào)告范圍的行業(yè)統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)必要性

雖然產(chǎn)前ES可以檢測(cè)從幾個(gè)基因到成千上萬(wàn)個(gè)基因,但目

前醫(yī)學(xué)以及遺傳學(xué)的認(rèn)知存在邊界,很多可以檢測(cè)的基因以及變

異不能明確其臨床后果,因此對(duì)于胎兒,不設(shè)邊界的報(bào)告是非常

危險(xiǎn)的。由于目前對(duì)醫(yī)學(xué)知識(shí)的認(rèn)識(shí)局限性,對(duì)很多變異的臨床

意義現(xiàn)階段無(wú)法明確;一些疾病由于外顯率低,雖然在胎兒檢測(cè)

到了此致病變異,但對(duì)胎兒的發(fā)生表型可能性很低;還有一些變

異雖然是致病性的,但其完全不會(huì)影響胎兒出生后的生活質(zhì)量

(但對(duì)胎兒出生后生活質(zhì)量的影響微乎其微).....對(duì)這些變異,

是不是需要報(bào)告,如果不報(bào)告應(yīng)該怎么處理,目前國(guó)內(nèi)外尚沒(méi)有

一個(gè)統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn),迫切需要盡快出臺(tái)一個(gè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn),給廣大產(chǎn)前

診斷業(yè)內(nèi)人員一個(gè)明確的指導(dǎo)。

(二)協(xié)作單位

本標(biāo)準(zhǔn)起草的主編單位:廣東省婦幼保健院。

本標(biāo)準(zhǔn)起草的參加單位:廣州醫(yī)科大學(xué)附屬第三醫(yī)院、中山

大學(xué)附屬第三醫(yī)院、中山大學(xué)附屬第一醫(yī)院、深圳華大基因股份

有限公司、廣州嘉檢醫(yī)學(xué)檢測(cè)有限公司、北京貝瑞和康生物技術(shù)

有限公司、貝勒醫(yī)學(xué)院、深圳市人民醫(yī)院、深圳市婦幼保健院、

深圳市龍崗區(qū)婦幼保健院、深圳南山區(qū)婦幼保健院、東莞市婦幼

保健院、惠州市第一婦幼保健院、中山市博愛(ài)醫(yī)院、江門(mén)市婦幼

保健院、廣東省人民醫(yī)院、粵北人民醫(yī)院、清遠(yuǎn)市人民醫(yī)院、廣

州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院、暨南大學(xué)附屬第一醫(yī)院、南方醫(yī)科大

學(xué)附屬珠江醫(yī)院。

(三)主要工作過(guò)程

1、起草階段

標(biāo)準(zhǔn)起草工作組經(jīng)過(guò)技術(shù)調(diào)研、咨詢(xún),收集、消化有關(guān)資料,

并結(jié)合具體臨床應(yīng)用的實(shí)際需求為主要參考依據(jù),于2020年5

月提出編制團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)《產(chǎn)前外顯子組測(cè)序遺傳咨詢(xún)及報(bào)告規(guī)范團(tuán)

體標(biāo)準(zhǔn)》的計(jì)劃。經(jīng)學(xué)會(huì)與標(biāo)準(zhǔn)起草工作組主要成員研究,決定

由學(xué)會(huì)提出,廣東省婦幼保健院主編,其它單位共同參與起草,

于2020年5月18日上報(bào)團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)《產(chǎn)前外顯子組測(cè)序遺傳咨詢(xún)

及報(bào)告規(guī)范團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)》立項(xiàng)申請(qǐng)書(shū),經(jīng)學(xué)會(huì)秘書(shū)長(zhǎng)審批通過(guò),在

6月8日正式發(fā)布立項(xiàng)公告,并于同日在全國(guó)團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)平臺(tái)發(fā)布

立項(xiàng)公示。

立項(xiàng)公示后,起草工作組加快標(biāo)準(zhǔn)編制工作節(jié)奏,著手開(kāi)展

標(biāo)準(zhǔn)的編制工作并組織多次起草工作組的會(huì)議討論。標(biāo)準(zhǔn)的內(nèi)容

綜合了多方意見(jiàn),于2020年7月底完成了編寫(xiě),上報(bào)學(xué)會(huì)團(tuán)體

標(biāo)準(zhǔn)辦公室。學(xué)會(huì)團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)辦公室人員于8月初完成了對(duì)本標(biāo)準(zhǔn)

內(nèi)容的審核和格式重排,并征求了廣東省標(biāo)準(zhǔn)化研究院專(zhuān)家的修

改意見(jiàn)。標(biāo)準(zhǔn)起草工作組于8月初對(duì)返修版本進(jìn)行了討論和定

稿,正式向?qū)W會(huì)提出發(fā)布征求意見(jiàn)。

2、征求意見(jiàn)階段

標(biāo)準(zhǔn)起草工作組擬計(jì)劃在2020年8月前完成本團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)編

制意見(jiàn)征求稿,在8-9月內(nèi)進(jìn)行廣泛征求意見(jiàn),主要方式是:將

標(biāo)準(zhǔn)編制說(shuō)明和征求意見(jiàn)稿通過(guò)全國(guó)團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)平臺(tái)發(fā)布公示,面

向相關(guān)行業(yè)的單位和個(gè)人征求意見(jiàn)。到2020年9月初,將各意

見(jiàn)匯總,組織專(zhuān)家集中討論修改。

3、審查階段

標(biāo)準(zhǔn)起草工作組對(duì)收集到的意見(jiàn)進(jìn)行認(rèn)真分析和處理,對(duì)征

求意見(jiàn)稿進(jìn)行最后修改,形成標(biāo)準(zhǔn)送審稿初稿,于2020年9月

初召開(kāi)送審稿會(huì)審會(huì)議,對(duì)送審稿初稿進(jìn)行研討,會(huì)后根據(jù)會(huì)議

研討意見(jiàn)對(duì)標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行完善,于2020年9月上旬形成送審稿,報(bào)

標(biāo)準(zhǔn)主管單位審查。

(四)起草組成員及其工作

本標(biāo)準(zhǔn)起草成員:尹愛(ài)華、張彥、劉維強(qiáng)、章鈞、林少賓、

黃輝、張巍、任志林、王游聲、楊亞平;參與修改人:黎青、陳

敏、郭輝、謝建生、魏鳳香、張靜、劉彥慧、何怡、陳劍虹、王

德剛、唐佳、李萍、范舒舒、譚衛(wèi)荷、何志暉、查慶兵、閆瑞玲、

江凌曉、楊芳、丁紅珂、劉暢、劉玲、齊一鳴、黃演林、張琪、

曾玉坤、劉淵、余麗華、王興旺、李發(fā)科。

各起草成員皆參與了本標(biāo)準(zhǔn)的研究、討論和不同章節(jié)的編寫(xiě)。

二、標(biāo)準(zhǔn)編制原則和確定標(biāo)準(zhǔn)主要內(nèi)容

(一)標(biāo)準(zhǔn)編制原則

以國(guó)內(nèi)外最新指南和專(zhuān)家共識(shí)為參考的前提下,結(jié)合我國(guó)我

省實(shí)際情況,針對(duì)產(chǎn)前外顯子組測(cè)序技術(shù)的臨床應(yīng)用,對(duì)臨床適

應(yīng)癥把握、檢測(cè)前咨詢(xún)、實(shí)驗(yàn)室質(zhì)控、報(bào)告標(biāo)準(zhǔn)及報(bào)告范圍等進(jìn)

行規(guī)范,為省內(nèi)外顯子組測(cè)序技術(shù)在產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用提供標(biāo)準(zhǔn)

化指導(dǎo)。

使用范圍:本標(biāo)準(zhǔn)旨在規(guī)定產(chǎn)前遺傳學(xué)診斷中外顯子組測(cè)序

(ES)的檢測(cè)前咨詢(xún)、知情同意書(shū)、數(shù)據(jù)分析流程、報(bào)告內(nèi)容與

要求以及檢測(cè)后咨詢(xún)。

本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了產(chǎn)前遺傳學(xué)診斷中,外顯子組測(cè)序(ES)的應(yīng)

用前提、知情同意、檢測(cè)前中后的質(zhì)量控制、數(shù)據(jù)分析流程、報(bào)

告內(nèi)容及要求。

本標(biāo)準(zhǔn)適用于具備產(chǎn)前診斷資質(zhì)(分子遺傳)的醫(yī)院或與其

合作建立的大學(xué)分子診斷實(shí)驗(yàn)室以及獨(dú)立醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所等機(jī)構(gòu)在

開(kāi)展NGS測(cè)序技術(shù)對(duì)胎兒標(biāo)本進(jìn)行人類(lèi)基因組變異檢測(cè)時(shí)進(jìn)行

全流程規(guī)范管理(包括但不局限于數(shù)據(jù)分析、結(jié)果判讀以及報(bào)告

出具過(guò)程)

(二)標(biāo)準(zhǔn)主要內(nèi)容

1.產(chǎn)前ES檢測(cè)前咨詢(xún)和知情告知

2.產(chǎn)前ES申請(qǐng)單

3.產(chǎn)前ES標(biāo)本質(zhì)量評(píng)估標(biāo)準(zhǔn)

4.產(chǎn)前ES實(shí)驗(yàn)操作標(biāo)準(zhǔn)化要求

5.產(chǎn)前ES室內(nèi)質(zhì)控、室間質(zhì)評(píng)要求

6.產(chǎn)前ES數(shù)據(jù)分析流程

7.產(chǎn)前ES結(jié)果報(bào)告建議

8.產(chǎn)前ES報(bào)告單編寫(xiě)建議

9.產(chǎn)前ES報(bào)告發(fā)放后的工作建議及檢測(cè)后咨詢(xún)

10.疑難病例的多學(xué)科會(huì)診

三、主要試驗(yàn)(或驗(yàn)證)的分析、綜述報(bào)告,技術(shù)經(jīng)濟(jì)論證,

預(yù)期的經(jīng)濟(jì)效果

本標(biāo)準(zhǔn)僅進(jìn)行文獻(xiàn)研究。

本標(biāo)準(zhǔn)在研制過(guò)程中參考了下列文件:

國(guó)家衛(wèi)生健康委員會(huì)關(guān)于印發(fā)開(kāi)展產(chǎn)前篩查技術(shù)醫(yī)療機(jī)構(gòu)

基本標(biāo)準(zhǔn)和開(kāi)展產(chǎn)前診斷技術(shù)醫(yī)療機(jī)構(gòu)基本標(biāo)準(zhǔn)的通知(國(guó)衛(wèi)幼

函[第2019]297號(hào)).

國(guó)家衛(wèi)生健康委員會(huì),《腫瘤個(gè)體化治療檢測(cè)技術(shù)指南(試

行)》,2015-7-30

王秋菊,沈亦平,鄔伶仟等.遺傳變異分類(lèi)標(biāo)準(zhǔn)與指南[J].

中國(guó)科學(xué)(生命科學(xué)),2017,047(006):668-688.

劉維強(qiáng),盧建,章鈞,等,產(chǎn)前遺傳學(xué)診斷拷貝數(shù)變異和純

合區(qū)域的數(shù)據(jù)分析解讀及報(bào)告規(guī)范化共識(shí),中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜

志,2020,37(7):701-708

InternationalSocietyforPrenatalDiagnosis;

SocietyforMaternalandFetalMedicine;Perinatal

QualityFoundation.JointPositionStatementfromthe

InternationalSocietyforPrenatalDiagnosis(ISPD),the

SocietyforMaternalFetalMedicine(SMFM),andthe

PerinatalQualityFoundation(PQF)ontheuseofgenome-

widesequencingforfetaldiagnosis.PrenatDiagn.

2018;38(1):6-9.doi:10.1002/pd.5195

MonaghanKG,LeachNT,PekarekD,PrasadP,RoseNC;

ACMGProfessionalPracticeandGuidelinesCommittee.The

useoffetalexomesequencinginprenataldiagnosis:a

pointstoconsiderdocumentoftheAmericanCollegeof

MedicalGeneticsandGenomics(ACMG).GenetMed.

2020;22(4):675-680.doi:10.1038/s41436-019-0731-7

四、標(biāo)準(zhǔn)涉及的相關(guān)知識(shí)產(chǎn)權(quán)說(shuō)明

本標(biāo)準(zhǔn)涉及產(chǎn)前外顯子組測(cè)序技術(shù)的臨床應(yīng)用,對(duì)檢測(cè)前咨

詢(xún)、知情告知同意書(shū)、申請(qǐng)單、實(shí)驗(yàn)室質(zhì)控、數(shù)據(jù)分析流程、報(bào)

告范圍、報(bào)告內(nèi)容、檢測(cè)后咨詢(xún)、隨訪(fǎng)及多學(xué)科會(huì)診等內(nèi)容進(jìn)行

了規(guī)范。

相關(guān)擬納入本標(biāo)準(zhǔn)的技術(shù)具備一定先進(jìn)性,同時(shí)已具備臨床

應(yīng)用基礎(chǔ)。

本標(biāo)準(zhǔn)不涉及專(zhuān)利。

五、采用國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)的程度與水平的簡(jiǎn)要說(shuō)明

雖然國(guó)外針對(duì)產(chǎn)前外顯子組測(cè)序技術(shù)的臨床應(yīng)用出臺(tái)了相

關(guān)指南及專(zhuān)家共識(shí),但大都停留在學(xué)術(shù)研究層面,且由于國(guó)情不

同,針對(duì)具體應(yīng)用過(guò)程中知情告知細(xì)節(jié)、數(shù)據(jù)的詳細(xì)分析流程,

尤其是結(jié)果如何報(bào)告、解讀、撰寫(xiě)及遺傳咨詢(xún)等方面均亟需細(xì)化。

在產(chǎn)前診斷領(lǐng)域,由于檢測(cè)標(biāo)本的特殊性,胎兒表型信息的嚴(yán)重

匱乏。針對(duì)臨床意義不確定的變異及與檢測(cè)指征不相符的意外發(fā)

現(xiàn)等,這些連專(zhuān)業(yè)人士也無(wú)法判定其臨床意義的變異并不能給遺

傳咨詢(xún)提供更加有用的信息,反而會(huì)增加孕婦的焦慮和不安,因

此選擇性報(bào)告更有利。

目前國(guó)內(nèi)對(duì)ES的產(chǎn)前應(yīng)用尚無(wú)共識(shí)和規(guī)范,具體操作過(guò)程

中諸如知情告知的細(xì)節(jié)、數(shù)據(jù)分析的流程、結(jié)果的解讀、報(bào)告的

撰寫(xiě)及遺傳咨詢(xún)等方面均亟需規(guī)范化。鑒于此,國(guó)內(nèi)多家已經(jīng)開(kāi)

展產(chǎn)前ES檢測(cè)的產(chǎn)前診斷機(jī)構(gòu)或?qū)嶒?yàn)室在以國(guó)外最新指南和專(zhuān)

家共識(shí)為參考的前提下,針對(duì)ES在產(chǎn)前診斷中的臨床應(yīng)用細(xì)節(jié)

展開(kāi)討論,重點(diǎn)對(duì)適應(yīng)征、檢測(cè)前咨詢(xún)、數(shù)據(jù)分析流程、報(bào)告標(biāo)

準(zhǔn)及報(bào)告內(nèi)容等提供技術(shù)層面建議,以期達(dá)到規(guī)范ES技術(shù)在產(chǎn)

前診斷中的應(yīng)用進(jìn)而達(dá)到讓更多人受益的目的。

六、重大意見(jiàn)分歧的處理經(jīng)過(guò)和依據(jù)

無(wú)。

七、其他應(yīng)予說(shuō)明的事項(xiàng)

無(wú)。

附件2

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(征求意見(jiàn)稿)》編制說(shuō)明

一、工作簡(jiǎn)況

(一)任務(wù)來(lái)源

1、編制背景

隨著基因包(panel)測(cè)序、臨床/醫(yī)學(xué)外顯子組測(cè)序

(clinical/medicalexomesequencing)、全外顯子組測(cè)

(wholeexomesequencing)甚至全基因組測(cè)序(wholegenome

sequencing)等下一代測(cè)序(NextGenerationSequencing,NGS)

技術(shù)在臨床的廣泛應(yīng)用,疾病診斷、治療和預(yù)后都得到了更豐富、

更精準(zhǔn)的提示和建議。

在產(chǎn)前診斷領(lǐng)域,近年來(lái)也有逐漸增多的基于外顯子組測(cè)序

(exomesequencing,ES)技術(shù)的應(yīng)用嘗試。雖然國(guó)外針對(duì)這些

技術(shù)的臨床應(yīng)用出臺(tái)了相關(guān)指南、共識(shí)以及聯(lián)合聲明,但目前國(guó)

際上對(duì)這些技術(shù)在胎兒產(chǎn)前診斷應(yīng)用中的很多方面,如檢測(cè)方案、

數(shù)據(jù)解讀、結(jié)果報(bào)告等還處于摸索和循證階段。在產(chǎn)前診斷領(lǐng)域,

由于胎兒表型信息嚴(yán)重匱乏,針對(duì)臨床意義不確定(variantsof

uncertainsignificant,VUS)的基因變異及與檢測(cè)指征不相符

的意外發(fā)現(xiàn)等,一般建議依照檢測(cè)前咨詢(xún)溝通意見(jiàn)形成的協(xié)議進(jìn)

行報(bào)告。

目前國(guó)內(nèi)對(duì)ES的產(chǎn)前診斷應(yīng)用缺乏專(zhuān)家共識(shí)或指南,針對(duì)

具體操作過(guò)程中諸如知情告知的主要覆蓋內(nèi)容、數(shù)據(jù)分析的流程、

結(jié)果的解讀、報(bào)告的撰寫(xiě)及遺傳咨詢(xún)等方面均亟需細(xì)化。鑒于此,

國(guó)內(nèi)多家已經(jīng)開(kāi)展產(chǎn)前外顯子組測(cè)序檢測(cè)的產(chǎn)前診斷機(jī)構(gòu)或?qū)?/p>

驗(yàn)室在以國(guó)內(nèi)外最新指南和專(zhuān)家共識(shí)為參考的前提下,針對(duì)ES

在產(chǎn)前診斷中的臨床應(yīng)用細(xì)節(jié)展開(kāi)討論,重點(diǎn)對(duì)產(chǎn)前外顯子組測(cè)

序的檢測(cè)前咨詢(xún)要點(diǎn)、數(shù)據(jù)分析

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