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文檔簡介

2025年pCR培訓(xùn)試卷及答案一、單項(xiàng)選擇題(每題2分,共30分)1.以下關(guān)于聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)基本原理的描述,錯(cuò)誤的是:A.通過溫度循環(huán)實(shí)現(xiàn)DNA雙鏈的解鏈與引物結(jié)合B.延伸階段溫度通常為72℃,依賴TaqDNA聚合酶的5'→3'聚合活性C.每個(gè)循環(huán)后目標(biāo)DNA片段數(shù)量呈指數(shù)增長(2?)D.變性階段溫度需低于引物退火溫度以保證雙鏈分離2.熒光定量PCR(qPCR)中,SYBRGreenⅠ染料的作用機(jī)制是:A.與雙鏈DNA小溝結(jié)合,發(fā)射熒光B.特異性標(biāo)記目標(biāo)基因的探針C.僅與單鏈DNA結(jié)合產(chǎn)生熒光D.通過水解探針釋放報(bào)告基團(tuán)3.設(shè)計(jì)PCR引物時(shí),以下不符合原則的是:A.引物長度18-25個(gè)堿基,GC含量40%-60%B.3'端避免連續(xù)3個(gè)G/C堿基C.兩條引物的Tm值差異超過5℃D.引物內(nèi)部避免形成二級(jí)結(jié)構(gòu)4.PCR反應(yīng)體系中,dNTP的主要作用是:A.提供DNA合成的原料B.維持反應(yīng)體系pH穩(wěn)定C.激活Taq酶活性D.防止引物二聚體形成5.以下哪種情況會(huì)導(dǎo)致PCR擴(kuò)增出現(xiàn)非特異性條帶?A.模板DNA純度過高B.引物濃度過低C.退火溫度過低D.循環(huán)次數(shù)過少6.實(shí)時(shí)熒光定量PCR中,Ct值的定義是:A.熒光信號(hào)達(dá)到設(shè)定閾值時(shí)的循環(huán)數(shù)B.擴(kuò)增曲線平臺(tái)期的熒光強(qiáng)度值C.引物與模板完全結(jié)合的時(shí)間點(diǎn)D.延伸階段結(jié)束時(shí)的溫度值7.進(jìn)行PCR實(shí)驗(yàn)時(shí),防止氣溶膠污染的關(guān)鍵操作是:A.使用高壓滅菌的槍頭B.在超凈工作臺(tái)外配制反應(yīng)體系C.定期用紫外線照射PCR實(shí)驗(yàn)室D.所有試劑分裝后反復(fù)凍融8.逆轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)的關(guān)鍵步驟是:A.將RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNAB.直接以RNA為模板進(jìn)行擴(kuò)增C.無需使用引物D.僅需DNA聚合酶參與9.以下關(guān)于TaqDNA聚合酶的描述,正確的是:A.具有3'→5'外切酶活性,可校正錯(cuò)配B.最適反應(yīng)溫度為55℃C.高溫(95℃)下仍能保持活性D.只能用于定性PCR,不能用于定量10.PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳后出現(xiàn)“引物二聚體”條帶,可能的原因是:A.模板DNA濃度過高B.引物設(shè)計(jì)時(shí)3'端互補(bǔ)C.dNTP濃度過低D.延伸時(shí)間過長11.定量PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線的斜率為-3.32時(shí),擴(kuò)增效率約為:A.50%B.80%C.100%D.120%12.以下哪種PCR技術(shù)可用于單核苷酸多態(tài)性(SNP)檢測?A.多重PCRB.巢式PCRC.等位基因特異性PCR(AS-PCR)D.降落PCR(TouchdownPCR)13.PCR反應(yīng)中,Mg2?濃度過高可能導(dǎo)致:A.引物與模板結(jié)合效率降低B.Taq酶活性被抑制C.非特異性擴(kuò)增增加D.擴(kuò)增產(chǎn)物量減少14.進(jìn)行qPCR實(shí)驗(yàn)時(shí),內(nèi)參基因的作用是:A.驗(yàn)證引物特異性B.校正不同樣本間的加樣誤差C.提高目標(biāo)基因的擴(kuò)增效率D.替代目標(biāo)基因作為檢測對(duì)象15.以下關(guān)于PCR循環(huán)參數(shù)設(shè)置的描述,錯(cuò)誤的是:A.變性時(shí)間過長可能導(dǎo)致Taq酶失活B.退火時(shí)間過短可能影響引物與模板結(jié)合C.延伸時(shí)間應(yīng)根據(jù)目標(biāo)片段長度調(diào)整(通常1kb/1min)D.循環(huán)次數(shù)越多,擴(kuò)增產(chǎn)物量越高二、填空題(每空1分,共20分)1.PCR反應(yīng)的三個(gè)基本步驟是________、________和________。2.熒光定量PCR的兩種常用方法是________(基于染料)和________(基于探針)。3.引物的Tm值計(jì)算公式為:Tm=________(適用于長度≤20bp的引物)。4.PCR反應(yīng)體系的核心成分包括模板DNA、________、________、________、緩沖液(含Mg2?)。5.為避免交叉污染,PCR實(shí)驗(yàn)室應(yīng)分區(qū)設(shè)置,通常分為________、________、________和________四個(gè)區(qū)域。6.定量PCR中,若擴(kuò)增效率低于90%,可能的原因是________或________。7.巢式PCR通過________輪擴(kuò)增提高檢測靈敏度,其設(shè)計(jì)的關(guān)鍵是________。8.逆轉(zhuǎn)錄PCR中,常用的逆轉(zhuǎn)錄酶有________(如M-MLV)和________(如AMV)。三、簡答題(每題6分,共30分)1.簡述PCR引物設(shè)計(jì)的主要原則(至少5條)。2.列舉3種PCR實(shí)驗(yàn)中常見的污染類型,并說明對(duì)應(yīng)的防控措施。3.比較普通PCR與熒光定量PCR的異同點(diǎn)(從原理、檢測方法、應(yīng)用場景三方面分析)。4.分析qPCR擴(kuò)增曲線出現(xiàn)“平臺(tái)期提前”的可能原因及解決方法。5.某實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行HPV基因檢測時(shí),陰性對(duì)照出現(xiàn)擴(kuò)增條帶,可能的原因有哪些?應(yīng)如何排查?四、案例分析題(每題10分,共20分)案例1:某實(shí)驗(yàn)員使用qPCR檢測細(xì)胞中某基因的表達(dá)量,結(jié)果顯示目標(biāo)基因Ct值為32(正常范圍25-28),內(nèi)參基因Ct值為18(正常范圍16-20)。問題:(1)分析目標(biāo)基因Ct值偏高的可能原因;(2)提出至少3種優(yōu)化措施。案例2:某實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行結(jié)核桿菌PCR檢測時(shí),擴(kuò)增產(chǎn)物電泳后未出現(xiàn)目標(biāo)條帶(陽性對(duì)照正常),但陰性對(duì)照無條帶。問題:(1)列舉可能導(dǎo)致該現(xiàn)象的原因(至少4個(gè));(2)設(shè)計(jì)排查流程。答案一、單項(xiàng)選擇題1.D2.A3.C4.A5.C6.A7.C8.A9.C10.B11.C12.C13.C14.B15.D二、填空題1.變性(解鏈)、退火(復(fù)性)、延伸(合成)2.SYBRGreen法、TaqMan探針法3.4×(G+C)+2×(A+T)4.引物、dNTP、TaqDNA聚合酶5.試劑準(zhǔn)備區(qū)、樣本處理區(qū)、PCR擴(kuò)增區(qū)、產(chǎn)物分析區(qū)6.引物設(shè)計(jì)不合理(或二聚體)、模板質(zhì)量差(或濃度過低)7.兩、兩對(duì)引物(外引物和內(nèi)引物)嵌套8.莫洛尼鼠白血病病毒逆轉(zhuǎn)錄酶、禽成髓細(xì)胞瘤病毒逆轉(zhuǎn)錄酶三、簡答題1.引物設(shè)計(jì)原則:(1)長度18-25bp,避免過短導(dǎo)致特異性下降;(2)GC含量40%-60%,避免過高或過低影響退火溫度;(3)兩條引物Tm值差異≤2℃,確保同步結(jié)合模板;(4)3'端避免連續(xù)3個(gè)G/C(防止錯(cuò)配),且不能互補(bǔ)(防止引物二聚體);(5)引物內(nèi)部避免形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)(ΔG≤-5kcal/mol);(6)引物序列應(yīng)特異性匹配目標(biāo)基因,避免與非目標(biāo)序列同源(可通過BLAST驗(yàn)證)。2.常見污染類型及防控:(1)氣溶膠污染:PCR產(chǎn)物形成的微小顆粒擴(kuò)散,防控措施為使用帶濾芯槍頭、實(shí)驗(yàn)后紫外線照射、分區(qū)操作(擴(kuò)增區(qū)與其他區(qū)物理隔離);(2)交叉污染:樣本間DNA互相污染,措施為樣本處理時(shí)使用一次性耗材、嚴(yán)格分區(qū)(樣本處理區(qū)獨(dú)立)、設(shè)置陰性對(duì)照;(3)試劑污染:引物或dNTP等試劑被DNA污染,措施為分裝試劑、使用專用移液器、定期檢測試劑空白對(duì)照。3.普通PCR與qPCR異同:-原理:普通PCR通過溫度循環(huán)擴(kuò)增DNA,終點(diǎn)法檢測;qPCR在擴(kuò)增過程中實(shí)時(shí)監(jiān)測熒光信號(hào)(基于染料或探針),通過Ct值定量。-檢測方法:普通PCR依賴電泳觀察條帶(定性/半定量);qPCR通過熒光強(qiáng)度變化直接定量(絕對(duì)/相對(duì)定量)。-應(yīng)用場景:普通PCR用于基因克隆、定性檢測(如病原體篩查);qPCR用于基因表達(dá)分析(如mRNA定量)、病原體載量檢測(如病毒拷貝數(shù))、SNP分型等需要精確定量的場景。4.qPCR平臺(tái)期提前的可能原因及解決:原因:(1)模板濃度過高,導(dǎo)致早期耗盡dNTP或引物;(2)循環(huán)次數(shù)過多,擴(kuò)增進(jìn)入平臺(tái)期;(3)反應(yīng)體系中Mg2?或dNTP濃度過高,加速反應(yīng)進(jìn)程。解決方法:(1)稀釋模板至合適濃度(通過預(yù)實(shí)驗(yàn)確定最佳模板量);(2)減少循環(huán)次數(shù)(通常25-40次,根據(jù)目標(biāo)基因豐度調(diào)整);(3)優(yōu)化反應(yīng)體系(降低Mg2?或dNTP濃度,重新配置體系)。5.陰性對(duì)照出現(xiàn)擴(kuò)增條帶的可能原因及排查:可能原因:(1)實(shí)驗(yàn)室環(huán)境被PCR產(chǎn)物污染(氣溶膠污染);(2)陰性對(duì)照管被樣本或陽性對(duì)照污染(操作不當(dāng));(3)試劑(如引物、dNTP)被目標(biāo)DNA污染;(4)引物特異性差,擴(kuò)增出非目標(biāo)序列(如引物二聚體與目標(biāo)條帶大小相近)。排查流程:(1)更換陰性對(duì)照管及所有耗材,重新配制反應(yīng)體系(使用新批次試劑);(2)檢測試劑空白對(duì)照(僅加體系成分,無模板),若陽性則試劑污染;(3)檢查引物特異性(通過BLAST比對(duì)或熔解曲線分析);(4)對(duì)實(shí)驗(yàn)室環(huán)境進(jìn)行清潔(紫外線照射+75%乙醇擦拭),并檢測環(huán)境拭子(如桌面、移液器)是否含目標(biāo)DNA。四、案例分析題案例1:(1)目標(biāo)基因Ct值偏高的可能原因:①細(xì)胞中目標(biāo)基因表達(dá)量低(如實(shí)驗(yàn)處理導(dǎo)致基因沉默);②RNA提取過程中降解(cDNA合成量少);③逆轉(zhuǎn)錄效率低(反轉(zhuǎn)錄酶活性下降或反應(yīng)條件不當(dāng));④qPCR引物效率低(引物二聚體或與模板結(jié)合不充分);⑤模板加樣量不足(移液誤差導(dǎo)致cDNA加入量少)。(2)優(yōu)化措施:①增加RNA上樣量(確保逆轉(zhuǎn)錄模板充足);②使用更高效的逆轉(zhuǎn)錄酶(如熱穩(wěn)定逆轉(zhuǎn)錄酶);③重新設(shè)計(jì)qPCR引物(通過軟件驗(yàn)證Tm值和特異性);④進(jìn)行梯度稀釋實(shí)驗(yàn)(確定最佳模板濃度);⑤檢查移液槍準(zhǔn)確性(校準(zhǔn)移液器,使用帶濾芯槍頭減少誤差)。案例2:(1)可能原因:①臨床樣本中結(jié)核桿菌DNA含量過低(如樣本采集量不足或處理過程中丟失);②DNA提取失敗(裂解不充分或抑制物殘留,如痰液中的黏液蛋白抑制Taq酶);③引物或探針失效(保存不當(dāng)導(dǎo)致降解);④PCR反應(yīng)條件不適(退火溫度過高,引物無法結(jié)合;延伸時(shí)間過短,長片段擴(kuò)增不完全);⑤Ta

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