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文檔簡(jiǎn)介
ICS11.220
CCSB41
53
云南省地方標(biāo)準(zhǔn)
DB53/T1059.2—2021
滇金絲猴檢疫技術(shù)第2部分:毛首線蟲實(shí)
驗(yàn)室檢測(cè)技術(shù)規(guī)范
QuarantinetechniqueforRhinopithecusbieti
—Part2:TechnicalspecificationsforlaboratoryexaminationofCapillaria
2021-09-30發(fā)布2021-10-14實(shí)施
云南省市場(chǎng)監(jiān)督管理局發(fā)布
1
DB53/T1059.2—2021
目??次
前言...................................................................................................................................................................III
引言.....................................................................................................................................................................Ⅴ
1范圍.................................................................................................................................................................1
2規(guī)范性引用文件.............................................................................................................................................1
3術(shù)語和定義.....................................................................................................................................................1
4縮略語.............................................................................................................................................................1
5試驗(yàn)原理.........................................................................................................................................................2
6試驗(yàn)條件.........................................................................................................................................................2
6.1實(shí)驗(yàn)室通用要求.....................................................................................................................................2
6.2人員要求.................................................................................................................................................2
6.3生物安全要求.........................................................................................................................................2
7儀器設(shè)備和試劑.............................................................................................................................................2
7.1主要儀器設(shè)備.........................................................................................................................................2
7.2主要試劑.................................................................................................................................................2
8樣品采集與保存.............................................................................................................................................3
9試驗(yàn)步驟.........................................................................................................................................................3
9.1形態(tài)學(xué)檢測(cè).............................................................................................................................................3
9.2PCR檢測(cè)..................................................................................................................................................3
10試驗(yàn)數(shù)據(jù)處理...............................................................................................................................................3
10.1蟲卵檢測(cè)...............................................................................................................................................4
10.2蟲體檢測(cè)...............................................................................................................................................4
附錄A(規(guī)范性)糞樣的采集和保存方法...............................................................................................5
附錄B(規(guī)范性)毛首線蟲的基本形態(tài)特征...........................................................................................7
I
DB53/T1059.2—2021
前??言
本文件按照GB/T1.1-2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定起
草。
本文件是DB53/T1059《滇金絲猴檢疫技術(shù)》的第2部分。DB53/T1059已經(jīng)發(fā)布了以下部分:
——第1部分:產(chǎn)氣莢膜梭菌實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)技術(shù)規(guī)范;
——第2部分:毛首線蟲實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)技術(shù)規(guī)范;
——第3部分:隱孢子蟲實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)技術(shù)規(guī)范;
——第4部分:志賀桿菌實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)技術(shù)規(guī)范。
請(qǐng)注意本文件的某些內(nèi)容可能涉及專利。本文件的發(fā)布機(jī)構(gòu)不承擔(dān)識(shí)別專利的責(zé)任。
本文件由云南省林業(yè)與草原局、云南省市場(chǎng)監(jiān)督管理局共同提出。
本文件由云南省林業(yè)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)(YNTC02)歸口。
本文件主要起草單位:云南農(nóng)業(yè)大學(xué)、云南省標(biāo)準(zhǔn)化研究院、昆明動(dòng)物園、云南省動(dòng)物衛(wèi)生監(jiān)督所。
本文件主要起草人:楊建發(fā)、黃艷梅、蒙英雯、朱勛程、衡昭君、楊俊、鄒豐才、陳培富、宋海洋、
張譽(yù)方、李云喬、朱尤帥。
III
DB53/T1059.2—2021
引言
滇金絲猴(Rhinopithecusbieti)是中國特有珍稀瀕危靈長(zhǎng)類動(dòng)物,屬于國家Ⅰ級(jí)重點(diǎn)保護(hù)野生
動(dòng)物,列入《世界自然保護(hù)聯(lián)盟》(IUCN)瀕危物種紅色名錄。編制并發(fā)布DB53/T1059《滇金絲猴檢
疫技術(shù)》地方標(biāo)準(zhǔn),推進(jìn)滇金絲猴疫病診斷的標(biāo)準(zhǔn)化和規(guī)范化,指導(dǎo)從事野生動(dòng)物保護(hù)相關(guān)的專業(yè)人員
按規(guī)范程序?qū)嵤?duì)滇金絲猴相關(guān)病原的實(shí)驗(yàn)室檢測(cè),為滇金絲猴的科學(xué)研究和保護(hù)工作提供病原或疫病
調(diào)查的基礎(chǔ)數(shù)據(jù),為滇金絲猴檢疫、疫病監(jiān)測(cè)和防治提供重要的參考依據(jù),促進(jìn)滇金絲猴繁育和擴(kuò)群,
維護(hù)地區(qū)物種與生態(tài)平衡,提升生物多樣性保護(hù)成效。
本文件已發(fā)布4個(gè)部分:
——第1部分:產(chǎn)氣莢膜梭菌實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)技術(shù)規(guī)范。本部分從產(chǎn)氣莢膜梭菌實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)技術(shù)的總則、
產(chǎn)氣莢膜梭菌分型、儀器設(shè)備和試劑、樣品、試驗(yàn)步驟、試驗(yàn)數(shù)據(jù)處理等方面制定了規(guī)范;
——第2部分:毛首線蟲實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)技術(shù)規(guī)范。本部分從毛首線蟲實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)技術(shù)規(guī)范的試驗(yàn)原理、
試驗(yàn)條件、儀器設(shè)備和試劑、樣品采集與保存、試驗(yàn)步驟、試驗(yàn)數(shù)據(jù)處理等方面制定了規(guī)范;
——第3部分:隱孢子蟲實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)技術(shù)規(guī)范。本部分從隱孢子蟲實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)技術(shù)的試驗(yàn)原理、試
驗(yàn)條件、儀器設(shè)備和試劑、樣品、試驗(yàn)步驟、試驗(yàn)數(shù)據(jù)處理等方面制定了規(guī)范;
——第4部分:志賀桿菌實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)技術(shù)規(guī)范。本部分從志賀桿菌實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)技術(shù)涉及的總則、志
賀桿菌分類、儀器設(shè)備和試劑、樣品、試驗(yàn)步驟、試驗(yàn)數(shù)據(jù)處理等方面制定了規(guī)范。
Ⅴ
DB53/T1059.2—2021
滇金絲猴檢疫技術(shù)
第2部分:毛首線蟲實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)技術(shù)規(guī)范
1范圍
本文件規(guī)定了滇金絲猴(Rhinopithecusbieti)檢疫技術(shù)中毛首線蟲實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)技術(shù)規(guī)范的試驗(yàn)原理、
試驗(yàn)條件、儀器設(shè)備和試劑、樣品采集與保存、試驗(yàn)步驟、試驗(yàn)數(shù)據(jù)處理。
本文件適用于滇金絲猴檢疫技術(shù)中毛首線蟲實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對(duì)應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
GB19489實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求
3術(shù)語和定義
下列術(shù)語和定義適用于本文件。
3.1
線蟲nematodes
線蟲動(dòng)物門為假體腔動(dòng)物,線蟲屬通常呈圓柱形,線狀或毛發(fā)狀,某些種類呈鞭狀或球狀。不分節(jié),
兩側(cè)對(duì)稱并具有三胚層假體腔,一般為雌雄異體。蟲體大小隨種類不同差別較大,雄蟲一般較雌蟲小。
寄生性線蟲最常見寄生于消化道。
3.2
毛首線蟲trichuris
毛首線蟲是滇金絲猴最為常見也是危害最大的消化道線蟲。蟲卵隨滇金絲猴糞便排到外界,在糞便
和土壤中發(fā)育為感染性蟲卵;經(jīng)口感染后,幼蟲在小腸內(nèi)孵出,鉆入腸絨毛間發(fā)育,然后移行到盲腸和
結(jié)腸內(nèi)發(fā)育為成蟲。
4縮略語
下列縮略語適用于本文件。
PCR:聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)PolymeraseChainReaction
TAE:Tris-乙酸電泳緩沖液TrisAcetate-EDTABuffer
DNA:脫氧核糖核酸DeoxyribonucleicAcid
NCBI:美國國家生物技術(shù)信息中心NationalCenterforBiotechnologyInformation
BLAST:基于局部序列比對(duì)算法的搜索工具BasicLocalAlignmentSearchTool
1
DB53/T1059.2—2021
5試驗(yàn)原理
鏡檢滇金絲猴消化道內(nèi)的毛首線蟲蟲卵或蟲體,依據(jù)其形態(tài)特征鑒定病原;采用PCR方法開展分子
鑒定。
6試驗(yàn)條件
6.1實(shí)驗(yàn)室通用要求
實(shí)驗(yàn)室應(yīng)滿足GB19489的要求。
6.2人員要求
采樣與試驗(yàn)人員具有相應(yīng)的專業(yè)知識(shí)。
6.3生物安全要求
采樣及試驗(yàn)過程中做好自身防護(hù),試驗(yàn)結(jié)束后的檢驗(yàn)器具要進(jìn)行消毒處理,廢棄樣品要及時(shí)進(jìn)行無
害化集中處理。
7儀器設(shè)備和試劑
7.1主要儀器設(shè)備
7.1.1正置光學(xué)顯微鏡。
7.1.2載玻片及蓋玻片若干,漏斗、玻璃棒、燒杯。
7.1.3金屬篩:60目。
7.1.4PCR擴(kuò)增儀。
7.1.5高速臺(tái)式離心機(jī)。
7.1.6單道可調(diào)移液器(量程0.5μL~10μL、2μL~20μL、10μL~100μL和100μL~1000μL)。
7.1.7電子天平(量程0.01mg~10000mg)。
7.1.8恒溫水浴鍋:36℃±1℃,65℃±1℃。
7.1.9電泳槽、電泳儀,紫外凝膠成像儀,渦旋振蕩器。
7.2主要試劑
7.2.1飽和食鹽水。
7.2.22.5%重鉻酸鉀液。
7.2.3基因組DNA提取試劑盒。
7.2.42×TaqPCRMasterMix。
7.2.5DL2000DNAMarker。
7.2.6無菌水。
7.2.750×TAE緩沖液:Tris堿242g和57.1mL冰醋酸,用雙蒸水定容到1L。
7.2.8核酸染料,用于凝膠成像顯示條帶。
7.2.91%瓊脂糖凝膠:1g瓊脂糖與100mL1×TAE緩沖液,加熱融化均勻,加入10μL核酸染料,60℃
時(shí),倒入膠槽,插上樣品梳。室溫下待凝膠凝固后,垂直向上拔出固定在凝膠中的樣品梳。
2
DB53/T1059.2—2021
8樣品采集與保存
糞樣的采集和保存方法見附錄A。
9試驗(yàn)步驟
9.1形態(tài)學(xué)檢測(cè)
9.1.1蟲卵檢測(cè)
采用飽和食鹽水漂浮法,毛首線蟲卵富集在飽和液表面。取糞樣5g,加飽和食鹽水50mL,用玻璃
棒攪勻,通過60目金屬篩或雙層紗布過濾到干凈燒杯中,靜置0.5h;蘸取表面液膜,點(diǎn)樣于載玻片上,
蓋上蓋玻片,進(jìn)行鏡檢。
9.1.2蟲體檢測(cè)
用生理鹽水清洗干凈蟲體,放于載玻片,滴加乳酸酚透明液2~3滴,蓋上蓋玻片,在光學(xué)顯微鏡下
觀察透明蟲體的內(nèi)部形態(tài)構(gòu)造。對(duì)于存疑蟲體,結(jié)合下述PCR擴(kuò)增方法對(duì)其進(jìn)行蟲種鑒定。
9.2PCR檢測(cè)
9.2.1DNA提取和保存
取糞樣,用商品化DNA提取試劑盒進(jìn)行DNA提取,提取步驟按照DNA提取試劑盒說明書進(jìn)行。1周內(nèi)使
用到的DNA,放置于4℃冰箱中;需要長(zhǎng)期保存的DNA,放置于-20℃冰箱中。
9.2.2PCR擴(kuò)增
9.2.2.1PCR擴(kuò)增引物
針對(duì)線蟲線粒體細(xì)胞色素C氧化酶第一亞基(COXI)基因設(shè)計(jì)引物,此引物靈敏度和特異性較高。
上下游引物序列如下:
JB3:5′-TTTTTTGGGCATCCTGAGGTTTAT-3′;JB4.5:5′-TAAAGAAAGAACATAATGAAAATG-3′。
9.2.2.2PCR擴(kuò)增體系
PCR擴(kuò)增體系為25μL,包括2×TaqPCRMasterMix12.5μL,無菌水10.5μL,引物JB3和JB4.5
各0.5μL,DNA模板1.0μL。
9.2.2.3PCR擴(kuò)增程序
用PCR擴(kuò)增儀設(shè)置反應(yīng)程序,94℃預(yù)變性5min;94℃變性30s,55℃退火45s,72℃延伸1min,設(shè)
置36個(gè)循環(huán)反應(yīng),最后72℃延伸5min,16℃結(jié)束反應(yīng),同時(shí)設(shè)陰性對(duì)照和陽性對(duì)照。
9.2.2.4PCR產(chǎn)物檢測(cè)
PCR擴(kuò)增完成后,取PCR產(chǎn)物5μL,加入1%瓊脂糖凝膠電泳孔中,以DL2000DNAMarker作為參照,
110V電壓電泳30min。將凝膠取出放入紫外凝膠成像儀中觀察并拍照。若出現(xiàn)預(yù)期的420bp左右的條
帶,擴(kuò)增條帶進(jìn)行測(cè)序后驗(yàn)證。
10試驗(yàn)數(shù)據(jù)處理
3
DB53/T1059.2—2021
10.1蟲卵檢測(cè)
經(jīng)飽和食鹽水漂浮法鏡檢發(fā)現(xiàn)如附錄B中圖B.1所示的蟲卵,直接判定為滇金絲猴毛首線蟲感染陽
性。若發(fā)現(xiàn)存疑蟲卵,對(duì)其進(jìn)行PCR擴(kuò)增后,將PCR產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果與NCBIGenBank中的序列進(jìn)行BLAST在
線比對(duì),判定是否為滇金絲猴毛首線蟲感染陽性。
10.2蟲體檢測(cè)
對(duì)蟲體進(jìn)行鏡檢觀察到如附錄B中B.2描述的蟲體,直接判定為滇金絲猴毛首線蟲感染陽性。若發(fā)現(xiàn)
存疑蟲體,對(duì)其進(jìn)行PCR檢測(cè)后,將PCR產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果與NCBIGenBank中的序列進(jìn)行BLAST在線比對(duì),判
定是否為滇金絲猴毛首線蟲感染陽性。
BA
4
DB53/T1059.2—2021
CA
附錄A
(規(guī)范性)
糞樣的采集和保存方法
A.1采樣工具
一次性PE手套、自封袋、樣品管、記號(hào)筆、標(biāo)簽紙等。
A.2糞樣新鮮程度判定
將糞便樣品放于自封袋,根據(jù)糞便表面的濕潤(rùn)程度、完整程度以及氣味等條件,判斷糞便樣品的新
鮮程度并記錄。
A.3糞樣的選取原則
A.3.1應(yīng)采集滇金絲猴新鮮糞樣,同一堆糞樣只采集一份樣品,兩堆樣品的距離應(yīng)大于3m。
A.3.2如遇到滇金絲猴母幼糞樣應(yīng)分開采集;依據(jù)母猴和幼猴的糞樣大小有明顯差異作出判斷,并在
備注欄記錄。
A.4樣品采集方法
A.4.1采集糞樣外部和內(nèi)部的樣品,每次采樣時(shí)應(yīng)更換新的PE手套,以避免樣品間的交叉污染。
A.4.2采集時(shí),直接剝?nèi)》蛛x新鮮糞樣的表層部分和內(nèi)部部分,分別放入自封袋,貼上樣品標(biāo)簽紙,
寫上樣品編號(hào),將樣品管放入自封袋,并再次寫上樣品編號(hào)。
A.4.3同一堆糞樣應(yīng)盡量多取樣品。
A.5樣品記錄與編號(hào)
在采集糞樣時(shí),應(yīng)填寫《滇金絲猴糞樣采集記錄表》(見表A.1)。記錄采
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