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遺傳譜系備份取材計(jì)劃一、概述
遺傳譜系備份取材計(jì)劃旨在通過(guò)系統(tǒng)化的樣本采集、存儲(chǔ)和管理,為遺傳學(xué)研究、疾病診斷、基因治療等提供可靠的數(shù)據(jù)支持。本計(jì)劃遵循科學(xué)規(guī)范,確保樣本質(zhì)量與安全性,滿(mǎn)足長(zhǎng)期存儲(chǔ)與后續(xù)分析的需求。以下是詳細(xì)的實(shí)施步驟與要點(diǎn)。
二、計(jì)劃目標(biāo)
(一)樣本采集
1.明確采集需求:根據(jù)研究目的確定所需樣本類(lèi)型(如血液、唾液、組織等)。
2.制定采集方案:包括樣本量、采集頻率、保存條件等。
3.優(yōu)化采集流程:確保操作標(biāo)準(zhǔn)化,減少樣本污染風(fēng)險(xiǎn)。
(二)樣本處理
1.快速處理:采集后立即進(jìn)行去污、分離等操作,減少細(xì)胞降解。
2.分裝保存:將樣本分裝成小份,避免反復(fù)凍融。
3.添加保護(hù)劑:根據(jù)樣本類(lèi)型添加RNA酶抑制劑、抗凝劑等。
(三)樣本存儲(chǔ)
1.選擇存儲(chǔ)條件:
-血液/組織:-80℃冷凍保存。
-唾液/細(xì)胞:RNA/DNA樣本需加入RNAlater等保護(hù)液,-20℃保存。
2.規(guī)范記錄:建立樣本庫(kù)管理系統(tǒng),記錄樣本編號(hào)、類(lèi)型、采集時(shí)間、處理方法等。
三、實(shí)施步驟
(一)前期準(zhǔn)備
1.設(shè)備準(zhǔn)備:超低溫冰箱、離心機(jī)、核酸提取儀等。
2.試劑準(zhǔn)備:RNA酶抑制劑、DNA提取試劑盒等。
3.人員培訓(xùn):確保操作人員掌握標(biāo)準(zhǔn)化流程。
(二)樣本采集流程
1.知情同意:向參與者說(shuō)明采集目的、流程及風(fēng)險(xiǎn),獲取書(shū)面同意。
2.采集操作:
-血液:使用無(wú)菌采血管,采血量10-20ml,立即抗凝。
-唾液:使用無(wú)RNA酶棉簽或唾液收集管,采集2-3ml。
3.標(biāo)記與運(yùn)輸:樣本立即標(biāo)記,放入2-8℃冷藏箱運(yùn)輸至實(shí)驗(yàn)室。
(三)樣本處理與檢測(cè)
1.處理流程:
(1)血液:離心分離血漿/白細(xì)胞,-80℃保存。
(2)唾液:提取DNA/RNA,純化后保存。
2.質(zhì)量檢測(cè):
(1)DNA:檢測(cè)濃度(>20ng/μl)、純度(A260/A280>1.8)。
(2)RNA:檢測(cè)完整性(RIN值>7),無(wú)降解。
(四)樣本入庫(kù)與維護(hù)
1.入庫(kù)管理:
(1)樣本信息錄入數(shù)據(jù)庫(kù)。
(2)分裝成-80℃凍存管,避免反復(fù)凍融。
2.定期檢查:
(1)檢查凍存管完整性,防止泄漏。
(2)每季度核對(duì)庫(kù)存,剔除過(guò)期樣本。
四、質(zhì)量控制
(一)操作規(guī)范
1.無(wú)菌操作:所有接觸樣本的器械需滅菌處理。
2.避免污染:使用一次性吸頭、離心管等,減少交叉污染。
(二)數(shù)據(jù)管理
1.電子記錄:使用LIMS(實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng))記錄樣本全生命周期數(shù)據(jù)。
2.數(shù)據(jù)備份:定期備份實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),防止丟失。
(三)安全措施
1.樣本運(yùn)輸:使用生物安全級(jí)冷鏈箱,防止解凍。
2.廢棄物處理:符合生物安全規(guī)定,高溫高壓滅菌后丟棄。
五、總結(jié)
一、概述
遺傳譜系備份取材計(jì)劃旨在通過(guò)系統(tǒng)化的樣本采集、存儲(chǔ)和管理,為遺傳學(xué)研究、疾病診斷、基因治療等提供可靠的數(shù)據(jù)支持。本計(jì)劃遵循科學(xué)規(guī)范,確保樣本質(zhì)量與安全性,滿(mǎn)足長(zhǎng)期存儲(chǔ)與后續(xù)分析的需求。以下是詳細(xì)的實(shí)施步驟與要點(diǎn)。
二、計(jì)劃目標(biāo)
(一)樣本采集
1.明確采集需求:根據(jù)研究目的確定所需樣本類(lèi)型(如血液、唾液、組織等)。
(1)血液:適用于DNA提取、細(xì)胞培養(yǎng)、流式細(xì)胞術(shù)等。
(2)唾液:適用于無(wú)創(chuàng)DNA(NIPT)檢測(cè)、基因分型。
(3)組織:適用于基因組測(cè)序、病理分析、藥物靶點(diǎn)驗(yàn)證。
2.制定采集方案:包括樣本量、采集頻率、保存條件等。
(1)樣本量:血液5-10ml,唾液2-5ml,組織1-2g。
(2)采集頻率:根據(jù)研究需求,可一次性采集或分次采集。
3.優(yōu)化采集流程:確保操作標(biāo)準(zhǔn)化,減少樣本污染風(fēng)險(xiǎn)。
(1)采集前:檢查器械滅菌情況,核對(duì)參與者信息。
(2)采集中:避免觸碰到采樣口邊緣,減少細(xì)菌污染。
(3)采集后:立即用消毒棉簽按壓止血,防止血腫。
(二)樣本處理
1.快速處理:采集后立即進(jìn)行去污、分離等操作,減少細(xì)胞降解。
(1)血液:采集后30分鐘內(nèi)分離血漿與血細(xì)胞。
(2)唾液:使用淋巴細(xì)胞分離液進(jìn)行密度梯度離心。
2.分裝保存:將樣本分裝成小份,避免反復(fù)凍融。
(1)血液:分裝成2ml/管,加入抗凝劑EDTA。
(2)唾液:分裝成0.5ml/管,加入RNA保護(hù)劑。
3.添加保護(hù)劑:根據(jù)樣本類(lèi)型添加RNA酶抑制劑、抗凝劑等。
(1)RNA保護(hù):唾液樣本加入0.1%DEPC水處理后的RNAlater。
(2)DNA保護(hù):血液樣本加入100μl/L的EDTA抗凝。
(三)樣本存儲(chǔ)
1.選擇存儲(chǔ)條件:
-血液/組織:-80℃冷凍保存。
(1)冷凍前:緩慢降溫至-20℃,再降至-80℃。
(2)冷凍管:使用聚丙烯管,避免凍裂。
-唾液/細(xì)胞:RNA/DNA樣本需加入RNAlater等保護(hù)液,-20℃保存。
(1)備用:可短期-80℃保存,長(zhǎng)期-20℃。
(2)保護(hù)液:使用commerciallyavailable的RNAstabilizationsolution。
2.規(guī)范記錄:建立樣本庫(kù)管理系統(tǒng),記錄樣本編號(hào)、類(lèi)型、采集時(shí)間、處理方法等。
(1)樣本標(biāo)簽:包含編號(hào)、日期、類(lèi)型、處理方法。
(2)數(shù)據(jù)庫(kù):錄入樣本屬性,如采集者年齡、性別、疾病狀態(tài)。
三、實(shí)施步驟
(一)前期準(zhǔn)備
1.設(shè)備準(zhǔn)備:超低溫冰箱、離心機(jī)、核酸提取儀等。
(1)超低溫冰箱:溫度波動(dòng)<0.1℃,配備備用電源。
(2)離心機(jī):4℃/5℃高速離心機(jī),避免樣本變性。
2.試劑準(zhǔn)備:RNA酶抑制劑、DNA提取試劑盒等。
(1)RNA酶抑制劑:使用diethylpyrocarbonate(DEPC)水處理所有器械。
(2)DNA提取試劑盒:選擇Qiagen或ThermoFisher品牌。
3.人員培訓(xùn):確保操作人員掌握標(biāo)準(zhǔn)化流程。
(1)培訓(xùn)內(nèi)容:樣本采集、處理、存儲(chǔ)、記錄的全流程。
(2)考核標(biāo)準(zhǔn):獨(dú)立操作后進(jìn)行盲樣檢測(cè),合格率≥95%。
(二)樣本采集流程
1.知情同意:向參與者說(shuō)明采集目的、流程及風(fēng)險(xiǎn),獲取書(shū)面同意。
(1)同意書(shū):包含樣本用途、存儲(chǔ)期限、隱私保護(hù)政策。
(2)簽署確認(rèn):參與者親筆簽名,研究人員核對(duì)。
2.采集操作:
-血液:使用無(wú)菌采血管,采血量10-20ml,立即抗凝。
(1)采血管:EDTA抗凝管(藍(lán)色蓋),避免肝素干擾。
(2)采血步驟:消毒皮膚,75%酒精消毒,進(jìn)針角度45°。
-唾液:使用無(wú)RNA酶棉簽或唾液收集管,采集2-3ml。
(1)棉簽:使用無(wú)DNA/RNA酶處理的合成纖維棉簽。
(2)收集管:含0.5ml生理鹽水,混勻后吸取上清。
3.標(biāo)記與運(yùn)輸:樣本立即標(biāo)記,放入2-8℃冷藏箱運(yùn)輸至實(shí)驗(yàn)室。
(1)標(biāo)記規(guī)范:使用防水墨水,包含編號(hào)、日期、采集者信息。
(2)運(yùn)輸要求:≤4小時(shí)到達(dá)實(shí)驗(yàn)室,避免長(zhǎng)時(shí)間冷藏。
(三)樣本處理與檢測(cè)
1.處理流程:
(1)血液:離心分離血漿/白細(xì)胞,-80℃保存。
-離心條件:1500rpm,10分鐘,4℃。
-分裝:血漿立即保存,白細(xì)胞用Ficoll-Paque分離。
(2)唾液:提取DNA/RNA,純化后保存。
-DNA提?。菏褂肣iagenDNA提取試劑盒,柱純化。
-RNA提取:使用RNeasyMiniKit,檢測(cè)完整性。
2.質(zhì)量檢測(cè):
(1)DNA:檢測(cè)濃度(>20ng/μl)、純度(A260/A280>1.8)。
-測(cè)量?jī)x器:NanoDrop2000,重復(fù)測(cè)量3次取平均值。
(2)RNA:檢測(cè)完整性(RIN值>7),無(wú)降解。
-測(cè)量?jī)x器:AgilentBioanalyzer,運(yùn)行標(biāo)準(zhǔn)試劑盒。
(四)樣本入庫(kù)與維護(hù)
1.入庫(kù)管理:
(1)樣本信息錄入數(shù)據(jù)庫(kù)。
-字段:編號(hào)、類(lèi)型、濃度、RIN值、采集者ID等。
(2)分裝成-80℃凍存管,避免反復(fù)凍融。
-容器:Nalgene2ml凍存管,螺旋蓋密封。
2.定期檢查:
(1)檢查凍存管完整性,防止泄漏。
-方法:目視檢查,剔除變形管。
(2)每季度核對(duì)庫(kù)存,剔除過(guò)期樣本。
-記錄:更新數(shù)據(jù)庫(kù)狀態(tài),注明剔除原因。
四、質(zhì)量控制
(一)操作規(guī)范
1.無(wú)菌操作:所有接觸樣本的器械需滅菌處理。
(1)滅菌方法:高壓蒸汽滅菌(121℃,15分鐘)。
(2)器械檢查:滅菌后檢查包裝完整性。
2.避免污染:使用一次性吸頭、離心管等,減少交叉污染。
(1)一次性器械:采血管、吸頭等不可復(fù)用。
(2)多樣本操作:更換工作臺(tái)面,使用不同空間分區(qū)。
(二)數(shù)據(jù)管理
1.電子記錄:使用LIMS(實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng))記錄樣本全生命周期數(shù)據(jù)。
(1)系統(tǒng)功能:樣本追蹤、實(shí)驗(yàn)記錄、報(bào)告生成。
(2)數(shù)據(jù)導(dǎo)入:支持Excel、CSV格式導(dǎo)入。
2.數(shù)據(jù)備份:定期備份實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),防止丟失。
(1)備份頻率:每周自動(dòng)備份。
(2)存儲(chǔ)位置:異地服務(wù)器,避免硬件故障影響。
(三)安全措施
1.樣本運(yùn)輸:使用生物安全級(jí)冷鏈箱,防止解凍。
(1)冷鏈箱:配備溫度記錄儀,運(yùn)輸全程監(jiān)控。
(2)包裝:雙層防漏袋,外層印生物危害標(biāo)識(shí)。
2.廢棄物處理:符合生物安全規(guī)定,高溫高壓滅菌后丟棄。
(1)廢棄物分類(lèi):銳器、化學(xué)試劑、樣本殘留。
(2)處理流程:滅菌(135℃,3分鐘),焚燒處理。
五、總結(jié)
一、概述
遺傳譜系備份取材計(jì)劃旨在通過(guò)系統(tǒng)化的樣本采集、存儲(chǔ)和管理,為遺傳學(xué)研究、疾病診斷、基因治療等提供可靠的數(shù)據(jù)支持。本計(jì)劃遵循科學(xué)規(guī)范,確保樣本質(zhì)量與安全性,滿(mǎn)足長(zhǎng)期存儲(chǔ)與后續(xù)分析的需求。以下是詳細(xì)的實(shí)施步驟與要點(diǎn)。
二、計(jì)劃目標(biāo)
(一)樣本采集
1.明確采集需求:根據(jù)研究目的確定所需樣本類(lèi)型(如血液、唾液、組織等)。
2.制定采集方案:包括樣本量、采集頻率、保存條件等。
3.優(yōu)化采集流程:確保操作標(biāo)準(zhǔn)化,減少樣本污染風(fēng)險(xiǎn)。
(二)樣本處理
1.快速處理:采集后立即進(jìn)行去污、分離等操作,減少細(xì)胞降解。
2.分裝保存:將樣本分裝成小份,避免反復(fù)凍融。
3.添加保護(hù)劑:根據(jù)樣本類(lèi)型添加RNA酶抑制劑、抗凝劑等。
(三)樣本存儲(chǔ)
1.選擇存儲(chǔ)條件:
-血液/組織:-80℃冷凍保存。
-唾液/細(xì)胞:RNA/DNA樣本需加入RNAlater等保護(hù)液,-20℃保存。
2.規(guī)范記錄:建立樣本庫(kù)管理系統(tǒng),記錄樣本編號(hào)、類(lèi)型、采集時(shí)間、處理方法等。
三、實(shí)施步驟
(一)前期準(zhǔn)備
1.設(shè)備準(zhǔn)備:超低溫冰箱、離心機(jī)、核酸提取儀等。
2.試劑準(zhǔn)備:RNA酶抑制劑、DNA提取試劑盒等。
3.人員培訓(xùn):確保操作人員掌握標(biāo)準(zhǔn)化流程。
(二)樣本采集流程
1.知情同意:向參與者說(shuō)明采集目的、流程及風(fēng)險(xiǎn),獲取書(shū)面同意。
2.采集操作:
-血液:使用無(wú)菌采血管,采血量10-20ml,立即抗凝。
-唾液:使用無(wú)RNA酶棉簽或唾液收集管,采集2-3ml。
3.標(biāo)記與運(yùn)輸:樣本立即標(biāo)記,放入2-8℃冷藏箱運(yùn)輸至實(shí)驗(yàn)室。
(三)樣本處理與檢測(cè)
1.處理流程:
(1)血液:離心分離血漿/白細(xì)胞,-80℃保存。
(2)唾液:提取DNA/RNA,純化后保存。
2.質(zhì)量檢測(cè):
(1)DNA:檢測(cè)濃度(>20ng/μl)、純度(A260/A280>1.8)。
(2)RNA:檢測(cè)完整性(RIN值>7),無(wú)降解。
(四)樣本入庫(kù)與維護(hù)
1.入庫(kù)管理:
(1)樣本信息錄入數(shù)據(jù)庫(kù)。
(2)分裝成-80℃凍存管,避免反復(fù)凍融。
2.定期檢查:
(1)檢查凍存管完整性,防止泄漏。
(2)每季度核對(duì)庫(kù)存,剔除過(guò)期樣本。
四、質(zhì)量控制
(一)操作規(guī)范
1.無(wú)菌操作:所有接觸樣本的器械需滅菌處理。
2.避免污染:使用一次性吸頭、離心管等,減少交叉污染。
(二)數(shù)據(jù)管理
1.電子記錄:使用LIMS(實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng))記錄樣本全生命周期數(shù)據(jù)。
2.數(shù)據(jù)備份:定期備份實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),防止丟失。
(三)安全措施
1.樣本運(yùn)輸:使用生物安全級(jí)冷鏈箱,防止解凍。
2.廢棄物處理:符合生物安全規(guī)定,高溫高壓滅菌后丟棄。
五、總結(jié)
一、概述
遺傳譜系備份取材計(jì)劃旨在通過(guò)系統(tǒng)化的樣本采集、存儲(chǔ)和管理,為遺傳學(xué)研究、疾病診斷、基因治療等提供可靠的數(shù)據(jù)支持。本計(jì)劃遵循科學(xué)規(guī)范,確保樣本質(zhì)量與安全性,滿(mǎn)足長(zhǎng)期存儲(chǔ)與后續(xù)分析的需求。以下是詳細(xì)的實(shí)施步驟與要點(diǎn)。
二、計(jì)劃目標(biāo)
(一)樣本采集
1.明確采集需求:根據(jù)研究目的確定所需樣本類(lèi)型(如血液、唾液、組織等)。
(1)血液:適用于DNA提取、細(xì)胞培養(yǎng)、流式細(xì)胞術(shù)等。
(2)唾液:適用于無(wú)創(chuàng)DNA(NIPT)檢測(cè)、基因分型。
(3)組織:適用于基因組測(cè)序、病理分析、藥物靶點(diǎn)驗(yàn)證。
2.制定采集方案:包括樣本量、采集頻率、保存條件等。
(1)樣本量:血液5-10ml,唾液2-5ml,組織1-2g。
(2)采集頻率:根據(jù)研究需求,可一次性采集或分次采集。
3.優(yōu)化采集流程:確保操作標(biāo)準(zhǔn)化,減少樣本污染風(fēng)險(xiǎn)。
(1)采集前:檢查器械滅菌情況,核對(duì)參與者信息。
(2)采集中:避免觸碰到采樣口邊緣,減少細(xì)菌污染。
(3)采集后:立即用消毒棉簽按壓止血,防止血腫。
(二)樣本處理
1.快速處理:采集后立即進(jìn)行去污、分離等操作,減少細(xì)胞降解。
(1)血液:采集后30分鐘內(nèi)分離血漿與血細(xì)胞。
(2)唾液:使用淋巴細(xì)胞分離液進(jìn)行密度梯度離心。
2.分裝保存:將樣本分裝成小份,避免反復(fù)凍融。
(1)血液:分裝成2ml/管,加入抗凝劑EDTA。
(2)唾液:分裝成0.5ml/管,加入RNA保護(hù)劑。
3.添加保護(hù)劑:根據(jù)樣本類(lèi)型添加RNA酶抑制劑、抗凝劑等。
(1)RNA保護(hù):唾液樣本加入0.1%DEPC水處理后的RNAlater。
(2)DNA保護(hù):血液樣本加入100μl/L的EDTA抗凝。
(三)樣本存儲(chǔ)
1.選擇存儲(chǔ)條件:
-血液/組織:-80℃冷凍保存。
(1)冷凍前:緩慢降溫至-20℃,再降至-80℃。
(2)冷凍管:使用聚丙烯管,避免凍裂。
-唾液/細(xì)胞:RNA/DNA樣本需加入RNAlater等保護(hù)液,-20℃保存。
(1)備用:可短期-80℃保存,長(zhǎng)期-20℃。
(2)保護(hù)液:使用commerciallyavailable的RNAstabilizationsolution。
2.規(guī)范記錄:建立樣本庫(kù)管理系統(tǒng),記錄樣本編號(hào)、類(lèi)型、采集時(shí)間、處理方法等。
(1)樣本標(biāo)簽:包含編號(hào)、日期、類(lèi)型、處理方法。
(2)數(shù)據(jù)庫(kù):錄入樣本屬性,如采集者年齡、性別、疾病狀態(tài)。
三、實(shí)施步驟
(一)前期準(zhǔn)備
1.設(shè)備準(zhǔn)備:超低溫冰箱、離心機(jī)、核酸提取儀等。
(1)超低溫冰箱:溫度波動(dòng)<0.1℃,配備備用電源。
(2)離心機(jī):4℃/5℃高速離心機(jī),避免樣本變性。
2.試劑準(zhǔn)備:RNA酶抑制劑、DNA提取試劑盒等。
(1)RNA酶抑制劑:使用diethylpyrocarbonate(DEPC)水處理所有器械。
(2)DNA提取試劑盒:選擇Qiagen或ThermoFisher品牌。
3.人員培訓(xùn):確保操作人員掌握標(biāo)準(zhǔn)化流程。
(1)培訓(xùn)內(nèi)容:樣本采集、處理、存儲(chǔ)、記錄的全流程。
(2)考核標(biāo)準(zhǔn):獨(dú)立操作后進(jìn)行盲樣檢測(cè),合格率≥95%。
(二)樣本采集流程
1.知情同意:向參與者說(shuō)明采集目的、流程及風(fēng)險(xiǎn),獲取書(shū)面同意。
(1)同意書(shū):包含樣本用途、存儲(chǔ)期限、隱私保護(hù)政策。
(2)簽署確認(rèn):參與者親筆簽名,研究人員核對(duì)。
2.采集操作:
-血液:使用無(wú)菌采血管,采血量10-20ml,立即抗凝。
(1)采血管:EDTA抗凝管(藍(lán)色蓋),避免肝素干擾。
(2)采血步驟:消毒皮膚,75%酒精消毒,進(jìn)針角度45°。
-唾液:使用無(wú)RNA酶棉簽或唾液收集管,采集2-3ml。
(1)棉簽:使用無(wú)DNA/RNA酶處理的合成纖維棉簽。
(2)收集管:含0.5ml生理鹽水,混勻后吸取上清。
3.標(biāo)記與運(yùn)輸:樣本立即標(biāo)記,放入2-8℃冷藏箱運(yùn)輸至實(shí)驗(yàn)室。
(1)標(biāo)記規(guī)范:使用防水墨水,包含編號(hào)、日期、采集者信息。
(2)運(yùn)輸要求:≤4小時(shí)到達(dá)實(shí)驗(yàn)室,避免長(zhǎng)時(shí)間冷藏。
(三)樣本處理與檢測(cè)
1.處理流程:
(1)血液:離心分離血漿/白細(xì)胞,-80℃保存。
-離心條件:1500rpm,10分鐘,4℃。
-分裝:血漿立即保存,白細(xì)胞用Ficoll-Paque分離。
(2)唾液:提取DNA/RNA,純化后保存。
-DNA提取:使用QiagenDNA提取試劑盒,柱純化。
-RNA提?。菏褂肦NeasyMiniKit,檢測(cè)完整性。
2.質(zhì)量檢測(cè):
(1)DNA:檢測(cè)濃度(>20ng/μl)、純度(A260/A280>1.8)。
-測(cè)量?jī)x器:NanoDrop2
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