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2025年大學(xué)《生物信息學(xué)》專(zhuān)業(yè)題庫(kù)——免疫治療藥效評(píng)估和生物信息學(xué)挑戰(zhàn)考試時(shí)間:______分鐘總分:______分姓名:______一、選擇題(每題2分,共10分)1.下列哪項(xiàng)不是免疫治療的主要類(lèi)型?A.免疫檢查點(diǎn)抑制劑B.CAR-T細(xì)胞療法C.細(xì)胞因子療法D.小分子靶向藥物2.在免疫治療藥效評(píng)估中,通常不作為主要療效評(píng)估指標(biāo)的是?A.客觀(guān)緩解率(ORR)B.無(wú)進(jìn)展生存期(PFS)C.總生存期(OS)D.血清淀粉樣蛋白A(SAA)水平3.下列哪個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)主要提供基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)?A.DrugBankB.ChEMBLC.NCBIGeneD.Swiss-Prot4.用于序列比對(duì)的生物信息學(xué)工具是?A.BLASTB.SAMtoolsC.GATKD.HaplotypeCaller5.在生物信息學(xué)分析中,用于評(píng)估基因表達(dá)差異的常用方法是?A.基因測(cè)序B.基因芯片C.差異表達(dá)分析D.蛋白質(zhì)質(zhì)譜二、填空題(每空2分,共10分)1.免疫治療的主要機(jī)制是通過(guò)激活或抑制機(jī)體的免疫系統(tǒng)來(lái)達(dá)到治療目的,其中免疫檢查點(diǎn)抑制劑主要作用于______通路。2.在免疫治療藥效評(píng)估中,安全性評(píng)估指標(biāo)包括血液學(xué)毒性、______毒性和非血液學(xué)毒性。3.生物信息學(xué)中的NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)提供了多種基因和蛋白質(zhì)信息,其中Gene數(shù)據(jù)庫(kù)主要收錄______。4.序列比對(duì)是生物信息學(xué)中的基本操作,BLAST算法的核心思想是______。5.在基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析中,常用的統(tǒng)計(jì)方法包括t檢驗(yàn)、______和方差分析。三、簡(jiǎn)答題(每題5分,共20分)1.簡(jiǎn)述免疫治療的基本原理及其在腫瘤治療中的應(yīng)用。2.免疫治療藥效評(píng)估中常用的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)方法有哪些?請(qǐng)舉例說(shuō)明。3.生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)在免疫治療研究中有哪些應(yīng)用?請(qǐng)列舉至少三種數(shù)據(jù)庫(kù)及其主要功能。4.簡(jiǎn)述生物信息學(xué)在免疫治療藥效評(píng)估中的挑戰(zhàn)和應(yīng)對(duì)策略。四、論述題(20分)結(jié)合實(shí)際案例,分析免疫治療藥效評(píng)估中的主要挑戰(zhàn),并提出相應(yīng)的應(yīng)對(duì)策略。試卷答案一、選擇題1.D解析:免疫治療的主要類(lèi)型包括免疫檢查點(diǎn)抑制劑、CAR-T細(xì)胞療法和細(xì)胞因子療法。小分子靶向藥物屬于靶向治療,不屬于免疫治療的主要類(lèi)型。2.D解析:免疫治療藥效評(píng)估的主要療效評(píng)估指標(biāo)包括客觀(guān)緩解率(ORR)、無(wú)進(jìn)展生存期(PFS)和總生存期(OS)。血清淀粉樣蛋白A(SAA)水平通常用于評(píng)估炎癥反應(yīng),不是主要的療效評(píng)估指標(biāo)。3.C解析:NCBIGene數(shù)據(jù)庫(kù)主要提供基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù),包括基因序列、基因功能等信息。DrugBank主要提供藥物信息,ChEMBL主要提供化合物信息,Swiss-Prot主要提供蛋白質(zhì)序列和功能信息。4.A解析:BLAST(BasicLocalAlignmentSearchTool)是用于序列比對(duì)的生物信息學(xué)工具。SAMtools主要用于序列alignments的處理和分析,GATK(GenomeAnalysisToolkit)主要用于高通量測(cè)序數(shù)據(jù)的變異檢測(cè),HaplotypeCaller是GATK的一部分,用于調(diào)用變異。5.C解析:在生物信息學(xué)分析中,用于評(píng)估基因表達(dá)差異的常用方法是差異表達(dá)分析?;驕y(cè)序和基因芯片是獲取基因表達(dá)數(shù)據(jù)的技術(shù),蛋白質(zhì)質(zhì)譜是用于蛋白質(zhì)分析的技術(shù)。二、填空題1.共刺激/共抑制解析:免疫檢查點(diǎn)抑制劑主要作用于共刺激/共抑制通路,通過(guò)阻斷這些通路來(lái)激活或抑制免疫反應(yīng)。2.腫瘤解析:安全性評(píng)估指標(biāo)包括血液學(xué)毒性、腫瘤毒性和非血液學(xué)毒性。腫瘤毒性是指治療藥物對(duì)腫瘤本身的影響。3.基因和蛋白質(zhì)信息解析:NCBIGene數(shù)據(jù)庫(kù)主要收錄基因和蛋白質(zhì)信息,包括基因序列、基因功能、蛋白質(zhì)序列和蛋白質(zhì)功能等。4.局部一致性解析:BLAST算法的核心思想是局部一致性,即尋找兩個(gè)序列中具有最高相似度的區(qū)域。5.ANOVA(方差分析)解析:在基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析中,常用的統(tǒng)計(jì)方法包括t檢驗(yàn)、ANOVA(方差分析)和非參數(shù)檢驗(yàn)等。三、簡(jiǎn)答題1.免疫治療的基本原理是通過(guò)激活或抑制機(jī)體的免疫系統(tǒng)來(lái)達(dá)到治療目的。免疫檢查點(diǎn)抑制劑通過(guò)阻斷共刺激/共抑制通路來(lái)激活T細(xì)胞,從而增強(qiáng)對(duì)腫瘤細(xì)胞的殺傷作用。CAR-T細(xì)胞療法通過(guò)改造患者自身的T細(xì)胞,使其能夠特異性識(shí)別和殺傷腫瘤細(xì)胞。細(xì)胞因子療法通過(guò)使用細(xì)胞因子來(lái)調(diào)節(jié)免疫反應(yīng),增強(qiáng)抗腫瘤免疫。免疫治療在腫瘤治療中具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì),可以提高療效并減少副作用。2.免疫治療藥效評(píng)估中常用的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)方法包括隨機(jī)對(duì)照試驗(yàn)(RCT)、前瞻性隊(duì)列研究、回顧性隊(duì)列研究和病例對(duì)照研究。隨機(jī)對(duì)照試驗(yàn)是免疫治療藥效評(píng)估中最常用的方法,通過(guò)隨機(jī)分配患者到治療組和對(duì)照組,比較兩組之間的療效和安全性。前瞻性隊(duì)列研究是在治療開(kāi)始前收集患者信息,并在治療過(guò)程中隨訪(fǎng),以評(píng)估療效和安全性?;仡櫺躁?duì)列研究是利用已有的臨床數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,病例對(duì)照研究是通過(guò)比較患病和未患病人群的特征來(lái)評(píng)估療效。3.生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)在免疫治療研究中有多種應(yīng)用。NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)提供了基因和蛋白質(zhì)信息,可以用于研究免疫相關(guān)基因和蛋白質(zhì)的功能。UCSCGenomeBrowser提供了基因組瀏覽器,可以用于查看基因組數(shù)據(jù)和進(jìn)行基因組分析。KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)提供了通路信息,可以用于研究免疫相關(guān)通路。這些數(shù)據(jù)庫(kù)為免疫治療研究提供了重要的數(shù)據(jù)支持。4.生物信息學(xué)在免疫治療藥效評(píng)估中的挑戰(zhàn)包括數(shù)據(jù)質(zhì)量控制、生物標(biāo)志物識(shí)別和模型建立等。數(shù)據(jù)質(zhì)量控制是確保分析結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性,需要通過(guò)數(shù)據(jù)清洗、數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化等方法來(lái)提高數(shù)據(jù)質(zhì)量。生物標(biāo)志物識(shí)別是尋找能夠預(yù)測(cè)療效和毒性的生物標(biāo)志物,可以通過(guò)基因表達(dá)分析、蛋白質(zhì)組學(xué)分析等方法來(lái)進(jìn)行。模型建立是建立預(yù)測(cè)模型,可以通過(guò)機(jī)器學(xué)習(xí)、深度學(xué)習(xí)等方法來(lái)進(jìn)行。應(yīng)對(duì)策略包括提高數(shù)據(jù)質(zhì)量、開(kāi)發(fā)新的生物信息學(xué)方法、加強(qiáng)多中心合作等。四、論述題免疫治療藥效評(píng)估的主要挑戰(zhàn)包括療效評(píng)估的準(zhǔn)確性、生物標(biāo)志物的識(shí)別和模型的建立等。療效評(píng)估的準(zhǔn)確性是確保治療效果的關(guān)鍵,需要通過(guò)嚴(yán)格的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和數(shù)據(jù)分析來(lái)提高準(zhǔn)確性。生物標(biāo)志物的識(shí)別是尋
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