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文檔簡介

第一章蛋白質(zhì)化學(xué)蛋白質(zhì)是許多不一樣α-氨基酸按一定序列經(jīng)過酰胺鍵(蛋白質(zhì)化學(xué)中專稱為肽鍵)縮合而成,含有較穩(wěn)定構(gòu)象并含有一定生物功效生物大分子

Protein第1頁

第一節(jié)蛋白質(zhì)元素組成

N含量在各種蛋白質(zhì)中比較靠近15%~18%

,平均為16%。每1g氮相當(dāng)于6.25g蛋白質(zhì)

蛋白質(zhì)平均含N量為16%,這是凱氏定氮法測定蛋白質(zhì)含量理論依據(jù):

粗蛋白質(zhì)含量=蛋白質(zhì)含N量×6.25第2頁方法:慣用6mol/L鹽酸或4mol/L硫酸,回流煮沸時(shí)間約20h。優(yōu)點(diǎn):不引發(fā)消旋作用,得到是L-氨基酸。缺點(diǎn):色氨酸被沸酸完全破壞;含有羥基氨基酸(絲氨酸、蘇氨酸)有一小部分被分解;天冬酰胺和谷氨酰胺酰胺基被水解成了羧基。第二節(jié)蛋白質(zhì)氨基酸組成

1.酸水解一、蛋白質(zhì)水解第3頁2.堿水解方法:普通用5mol/L氫氧化鈉煮沸10-20h。

優(yōu)點(diǎn):色氨酸在水解中不受破壞。

缺點(diǎn):多數(shù)氨基酸受到不一樣程度破壞,產(chǎn)生消旋現(xiàn)象,得到是D-和L-氨基酸混合物。另外,引發(fā)精氨酸脫氨(生成鳥氨酸和尿素)。第4頁3.酶水解方法:用于蛋白質(zhì)肽鏈斷裂蛋白水解酶或稱蛋白酶(proteinase)已經(jīng)有十各種,慣用有胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶(或稱糜蛋白酶)及胃蛋白酶等。優(yōu)點(diǎn):不產(chǎn)生消旋作用,也不破壞氨基酸。水解位點(diǎn)特異,用于一級結(jié)構(gòu)分析,肽譜

缺點(diǎn):使用一個(gè)酶往往水解不徹底,需幾個(gè)酶協(xié)同作用才能使蛋白質(zhì)完全水解。該法主要用于部分水解。第5頁二、氨基酸功效:

1.組成蛋白質(zhì)2.一些aa及其衍生物充當(dāng)化學(xué)信號(hào)分子

-aminobutyricacid(

-氨基丁酸)、Serotonic(5-羥色胺,血清擔(dān)心素)、melatonin(褪黑激素,N-乙酰-甲氧基色胺),都是神經(jīng)遞質(zhì),后二者是色氨酸衍生物(神經(jīng)遞質(zhì)是一個(gè)神經(jīng)細(xì)胞產(chǎn)生影響第二個(gè)神經(jīng)細(xì)胞或肌肉細(xì)胞功效物質(zhì))。Thyroxine(甲狀腺素,動(dòng)物甲狀腺thyroidgland產(chǎn)生Tyr衍生物)和吲哚乙酸(植物中Trp衍生物)都是激素(激素就是一個(gè)細(xì)胞產(chǎn)生調(diào)整其它細(xì)胞功效化學(xué)信號(hào)分子)。第6頁

3.氨基酸是許多含N分子前體物

核苷酸和核酸含氮堿基、血紅素、葉綠素合成都需要aa

4.一些基本氨基酸和非基本aa是代謝中間物

精氨酸、Citrulline(瓜氨酸)、Ornithine(鳥氨酸)是尿素循不(Ureacycle)中間物,含氮廢物在脊椎動(dòng)物肝臟中合成尿素是排除它們一個(gè)主要機(jī)制。第7頁

三、氨基酸結(jié)構(gòu)與分類18發(fā)覺Asp,1938年發(fā)Thr,當(dāng)前已發(fā)覺180各種。不過組成蛋白質(zhì)aa常見有20種,稱為基本氨基酸(編碼蛋白質(zhì)氨基酸),還有一些稱為稀有氨基酸,是多肽合成后由基本aa經(jīng)酶促修飾而來。另外還有存在于生物體內(nèi)但不組成蛋白質(zhì)非蛋白質(zhì)氨基酸(約150種)。(一)編碼蛋白質(zhì)氨基酸(20種)也稱基本氨基酸或標(biāo)準(zhǔn)氨基酸,有對應(yīng)遺傳密碼。

第8頁α-氨基酸普通結(jié)構(gòu)氨基在α-位,為L-構(gòu)型.除脯氨酸外,均為α-氨基酸除甘氨酸外,均為手性氨基酸第9頁氨基酸分類1.按R基化學(xué)結(jié)構(gòu)分類

能夠分為三類:脂肪族、芳香族和雜環(huán)族

脂肪族氨基酸含一氨基一羧基中性氨基酸甘氨酸Gly,

G丙氨酸Ala,

A纈氨酸Val,

V亮氨酸Lue,

L異亮氨酸Ile,

I第10頁R基均為中性烷基(Gly為H),R基對分子酸堿性影響很小,它們幾乎有相同等電點(diǎn)。(6.0±0.03)

Gly是唯一不含手性碳原子氨基酸,所以不具旋光性。從Gly至Ile,R基團(tuán)疏水性增加,Ile是這20種a.a中脂溶性最強(qiáng)之一(除Phe2.5、Trp3.4、Tyr2.3以外)。

第11頁絲氨酸(Ser,S)蘇氨酸(Thr,T)半胱氨酸(Cys,C)甲硫氨酸(Met,M)含羥基或硫脂肪族氨基酸第12頁含羥基有兩種:Ser和ThrSer-CH2OH基(pKa=15),在生理?xiàng)l件下不解離,但它是一個(gè)極性基團(tuán),能與其它基團(tuán)形成氫鍵,含有主要生理意義。在大多數(shù)酶活性中心都發(fā)覺有Ser殘基存在。Thr中-OH是仲醇,含有親水性,但此-OH形成氫鍵能力較弱,所以,在蛋白質(zhì)活性中心中極少出現(xiàn)。Ser和Thr-OH往往與糖鏈相連,形成糖蛋白。含硫兩種:Cys、Met

Cys中R含巰基(-SH),Cys含有兩個(gè)主要性質(zhì):(1)在較高pH值條件,巰基離解。(2)兩個(gè)Cys巰基氧化生成二硫鍵,生成胱氨酸(Cys—s—s—Cys)

第13頁二硫鍵在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)中含有主要意義。Cys還經(jīng)常出現(xiàn)在酶活性中心。MetR中含有甲硫基(-SCH3),硫原子有親核性,易發(fā)生極化,所以,Met是一個(gè)主要甲基供體。Cys與結(jié)石在細(xì)胞外液如血液中,Cys以胱氨酸(Cystine)氧化形式存在,胱氨酸溶解性最差。胱氨酸尿(Cystinuria)是一個(gè)遺傳病,因?yàn)殡装彼峥缒み\(yùn)輸缺點(diǎn)造成大量胱氨酸排泄到尿中。胱氨酸在腎(Kidney)、輸尿管(ureter)、膀胱(urinarybladder)中結(jié)晶形成結(jié)石(Calculus,calculi),結(jié)石會(huì)造成疼痛、發(fā)炎甚至尿血。大量服用青霉胺(Penicillcemine)能降低腎中胱氨含量,因?yàn)榍嗝拱放c半胱氨酸形成化合物比胱氨酸易溶解。第14頁酸性氨基酸及酰胺天冬氨酸(Asp,D)谷氨酸(Glu,E)天冬酰胺(Asn,N)谷氨酰胺(Gln,Q)第15頁Asp、Glu,普通稱酸性氨基酸Asp側(cè)鏈羧基pKa(β-COOH)為3.86,Glu側(cè)鏈羧基pKa(γ-COOH)為4.25它們是在生理?xiàng)l件下帶有負(fù)電荷僅有兩個(gè)

氨基酸。Asn、Gln

酰胺基中氨基易發(fā)生氨基轉(zhuǎn)移反應(yīng),轉(zhuǎn)氨基反應(yīng)在生物合成和代謝中有主要意義第16頁堿性氨基酸

賴氨酸(Lys,K)精氨酸(Arg,R)組氨酸(His,H)雜環(huán)第17頁LysR側(cè)鏈上含有一個(gè)氨基,側(cè)鏈氨基pKa為10.53。生理?xiàng)l件下,Lys側(cè)鏈帶有一個(gè)正電荷(—NH3+),同時(shí)它側(cè)鏈有4個(gè)C直鏈,柔性較大,使側(cè)鏈氨基反應(yīng)活性增大。(如肽聚糖短肽間連接)Arg是堿性最強(qiáng)氨基酸,側(cè)鏈上胍基是已知堿性最強(qiáng)有機(jī)堿,pKa值為12.48,生理?xiàng)l件下完全質(zhì)子化。His含咪唑環(huán),咪唑環(huán)pKa在游離氨基酸中和在多肽鏈中不一樣,前者pKa為6.00,后者為7.35,它是20種氨基酸中側(cè)鏈pKa值最靠近生理pH值一個(gè),在靠近中性pH時(shí),可離解平衡。它是在生理pH條件下唯一含有緩沖能力氨基酸。His含咪唑環(huán),一側(cè)去質(zhì)子化和另一側(cè)質(zhì)子化同時(shí)進(jìn)行,因而在酶酸堿催化機(jī)制中起主要作用。

第18頁2、芳香族氨基酸苯丙氨酸(Phe,F)酪氨酸(Tyr,Y)色氨酸(Trg,W)第19頁都含有共軛π電子體系,易與其它缺電子體系或π電子體系形成電荷轉(zhuǎn)移復(fù)合物(charge-transfercomplex)或電子重合復(fù)合物。在受體—底物、或分子相互識(shí)別過程中含有主要作用。這三種氨基酸在近紫外區(qū)有特殊吸收峰,蛋白質(zhì)紫外吸收主要來自這三種氨基酸,在280nm處,Trp>Tyr>Phe。Phe疏水性最強(qiáng).。酪氨酸-OH磷酸化是一個(gè)十分普遍調(diào)控機(jī)制,Tyr在較高pH值時(shí),酚羥基離解。Trp有復(fù)雜π共軛休系,比Phe和Tyr更易形成電荷轉(zhuǎn)移絡(luò)合物。第20頁3、雜環(huán)氨基酸組氨酸(His,H)脯氨酸(Pro,P)第21頁P(yáng)ro,有時(shí)也把His、Trp歸入這類。Pro是唯一一個(gè)環(huán)狀結(jié)構(gòu)氨基酸,它α-亞氨基是環(huán)一部分,所以含有特殊剛性結(jié)構(gòu)。它在蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)中含有極主要作用,普通出現(xiàn)在兩段α-螺旋之間轉(zhuǎn)角處,Pro殘基所在位置必定發(fā)生骨架方向改變第22頁2.按R基極性分類(能否與水形成氫鍵)

20種基本氨基酸能夠分成以下四組:

1、非極性氨基酸(八種)Ala、Val、Leu、Ile、Phe、Trp、Met、Pro這類氨基酸R基都是疏水性,在維持蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)中起著主要作用。2、極性不帶電荷氨基酸(七種)

6種,絲氨酸、蘇氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺。這類氨基酸側(cè)鏈都能與水形成氫鍵,所以很輕易溶于水。酪氨酸-OH磷酸化是一個(gè)十分普遍調(diào)控機(jī)制,Ser和Thr-OH往往與糖鏈相連,Asn和Gln-NH2很輕易形成氫鍵,所以能增加蛋白質(zhì)穩(wěn)定性。第23頁3、極性帶正電荷氨基酸三種堿性氨基酸:Lys、Arg、His在pH7時(shí)帶正電荷。當(dāng)膠原蛋白中Lys側(cè)鏈氧化時(shí)能形成很強(qiáng)分子間(內(nèi))交聯(lián)。Arg胍基堿性很強(qiáng),與NaOH相當(dāng)。His是一個(gè)弱堿,在pH6.0時(shí),HisR基50%以上質(zhì)子化,但pH7.0時(shí),質(zhì)子化分子不到10%His是R基pK值在7附近唯一氨基酸。是天然緩沖劑,它往往存在于許多酶活性中心。

第24頁

4、極性帶負(fù)電荷氨基酸

兩種酸性氨基酸:Asp、Glu。在pH6~7時(shí),谷氨酸和天冬氨酸第二個(gè)羧基解離,所以,帶負(fù)電荷。酶活性中心:His、Ser、Cys非極性aa普通位于蛋白質(zhì)疏水關(guān)鍵,帶電荷aa和極性aa位于表面。

第25頁三個(gè)有特征氨基酸

一是脯氨酸(Pro),因?yàn)樗且粋€(gè)環(huán)狀亞氨基酸。它氨基和其它氨基酸羧基形成肽鍵有顯著特點(diǎn),較易變成順式肽鍵。第26頁二是甘氨酸(Gly),它是唯一在α-碳原子上只有兩個(gè)氫原子,沒有側(cè)鏈氨基酸。為此它既不能和其它殘基側(cè)鏈相互作用,也不產(chǎn)生任何位阻現(xiàn)象,進(jìn)而在蛋白質(zhì)立體結(jié)構(gòu)形成中有其特定作用。第三個(gè)是半胱氨酸(Cys)。它個(gè)性不但表現(xiàn)在其側(cè)鏈有一定大小和含有高度化學(xué)反應(yīng)活性,還在于兩個(gè)Cys能形成穩(wěn)定帶有二硫(橋)鍵胱氨酸。二硫鍵不但能夠在肽鏈內(nèi),也能夠在肽鏈間存在。更有甚者,一樣一對二硫鍵能含有不一樣空間取向。

第27頁(浙江大學(xué)題)按氨基酸R基極性性質(zhì)將其分為哪幾類?請寫出各類性質(zhì),氨基酸名稱以及三字符號(hào)和單子符號(hào)解析:主要考查編碼蛋白質(zhì)20種氨基酸結(jié)構(gòu)和極性及單字和三字符號(hào)第28頁二、非編碼蛋白質(zhì)氨基酸也稱修飾氨基酸,是在蛋白質(zhì)合成后,由基本氨基酸修飾而來。Prothrombin(凝血酶原)中含有

-羧基谷氨酸,能結(jié)合Ca2+。結(jié)締組織中最豐富蛋白質(zhì)膠原蛋白含有大量4-羥脯氨酸和5-羥賴氨酸。(1)4-羥脯氨酸(2)5-羥賴氨酸這兩種氨基酸主要存在于結(jié)締組織纖維狀蛋白(如膠原蛋白)中。(3)6-N-甲基賴氨酸(存在于肌球蛋白中)

(4)г-羧基谷氨酸

存在于凝血酶原及一些含有結(jié)合Ca2+離子功效蛋白質(zhì)中。(5)Tyr衍生物:3.5-二碘酪氨酸、甲狀腺素(甲狀腺蛋白中)(6)鎖鏈素由4個(gè)Lys組成(彈性蛋白中)。第29頁(三)非蛋白質(zhì)氨基酸除參加蛋白質(zhì)組成20各種氨基酸外,生物體內(nèi)存在大量氨基酸中間代謝產(chǎn)物,它們不是蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)單元,但在生物體內(nèi)含有很多生物學(xué)功效,如尿素循環(huán)中L-瓜氨酸和L-鳥氨酸。(1)L-型α–氨基酸衍生物L(fēng)-瓜氨酸L-鳥氨酸(2)D-型氨基酸D-Glu、D-Ala(肽聚糖中)、D-Phe(短桿菌肽S)(3)β-、γ-、δ-氨基酸β-Ala(泛素前體)、γ-氨基丁酸(神經(jīng)遞質(zhì))。第30頁β-丙氨酸是遍多酸(泛酸)(一個(gè)維生素)前體成份γ–氨基丁酸是傳遞神經(jīng)沖動(dòng)化學(xué)介質(zhì)L-瓜氨酸、L-鳥氨酸是尿素循環(huán)中間體第31頁甜菜堿肌氨酸鳥氨酸胍氨酸第32頁四、氨基酸主要理化性質(zhì)(一)普通物理性質(zhì)α-氨基酸為無色晶體,熔點(diǎn)極高,普通在200℃以上。有無味、有味甜、有味苦、谷氨酸單鈉鹽有鮮味,是味精主要成份。各種氨基酸在水中溶解度差異很大,除胱氨酸和酪氨酸外普通都能溶于水,并能溶解于稀酸或稀堿中,但不能溶解于有機(jī)溶劑。通常酒精能把氨基酸從其溶液中沉淀析出。脯氨酸和羥脯氨酸能溶于乙醇或乙醚中。第33頁(二)氨基酸光吸收組成蛋白質(zhì)20種氨基酸在可見光區(qū)都沒有光吸收,但在遠(yuǎn)紫外區(qū)(<220nm)都有光吸收。在近紫外區(qū)(220-300nm)只有酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸有吸收光能力,因?yàn)樗鼈兒斜江h(huán)共軛雙鍵系統(tǒng)。Tyr:max=275nm,275=1.4x103;Phe:max=257nm,257=2.0x102;Trp:max=280nm,280=5.6x103蛋白質(zhì)因?yàn)楹蠺yr、Phe、Trp(尤其Tyr和Trp),也有紫外光吸收能力,普通最大吸收在280nm處。第34頁分光光度計(jì)定量分析依據(jù):Lambert-Beer定律A=LogIo/I=εCL第35頁所謂兩性離子是指在同一個(gè)氨基酸分子上帶有能放出質(zhì)子-NH3+正離子和能接收質(zhì)子-COO-負(fù)離子。氨基酸是兩性電解質(zhì)。

(三)、氨基酸酸堿性質(zhì)第36頁氨基酸在晶體和水溶液中主要以兼性離子形式存在α-氨基酸都含有-COOH和-NH2,都是不揮發(fā)結(jié)晶固體,熔點(diǎn)200-350℃,不溶于非極性溶劑,而易溶于水,這些性質(zhì)與經(jīng)典羧酸(R-COOH)或胺(R-NH2)顯著不一樣。三個(gè)現(xiàn)象:①晶體熔點(diǎn)高→離子晶格,不是分子晶格。②不溶于非極性溶劑→極性分子③介電常數(shù)高(氨基酸使水介電常數(shù)增高,而乙醇、丙酮使水介電常數(shù)降低。)→水溶液中氨基酸是極性分子。第37頁原因:α-羧基pK1在2.0左右,當(dāng)pH>3.5,α-羧基以-COO-形式存在。α-氨基pK2在9.4左右,當(dāng)pH<8.0時(shí),α-氨基以α-NH3+形式存在。在pH3.5-8.0時(shí),帶有相反電荷,所以氨基酸在水溶液中是以兩性離子離子形式存在。Gly熔點(diǎn)232℃比對應(yīng)乙酸(16.5℃)、乙胺(80.5℃)高,可推測氨基酸在晶體狀態(tài)也是以兩性離子形式存在。第38頁氨基酸兩性解離性質(zhì)及等電點(diǎn)

pH=pI

凈電荷=0pH<pI凈電荷為正pH>pI凈電荷為負(fù)CHRCOOHNH3+CHRCOONH2CHRCOONH3++H++

OH-+H++

OH-(pK′1)(pK′2)在一定pH條件下,氨基酸分子中所帶正電荷數(shù)和負(fù)電荷數(shù)相等,即凈電荷為零,在電場中既不向陽極也不向陰極移動(dòng),此時(shí)溶液pH值稱為該種氨基酸等電點(diǎn)(isoelectricpoint,pI)。--即氨基酸等電點(diǎn)是它展現(xiàn)電中性時(shí)所處環(huán)境pH值。1、概念第39頁氨基酸解離常數(shù)可用測定滴定曲線試驗(yàn)方法求得第40頁在pH2.34和pH9.60處,Gly含有緩沖能力。滴定開始時(shí),溶液中主要是Gly+。起點(diǎn):100%Gly+凈電荷:+1第一拐點(diǎn):50%Gly+,50%Gly±平均凈電荷:+0.5第二拐點(diǎn):100%Gly±凈電荷:0等電點(diǎn)pI第三拐點(diǎn):50%Gly±,50%Gly-平均凈電荷:-0.5終點(diǎn):100%Gly-凈電荷:-1第一拐點(diǎn):pH=pK+lg[Gly±]/[Gly+],pH=pK1=2.34第二拐點(diǎn):100%Gly±,凈電荷為0,此時(shí)pH值稱氨基酸等電點(diǎn)pI。第三拐點(diǎn):pH=pK2+lg[Gly-]/[Gly±]=pK2=9.6第41頁Handerson-Hasselbalch方程:pH=pKa+log[質(zhì)子受體/質(zhì)子供體]計(jì)算緩沖溶液pH主要公式緩沖容量與緩沖正確濃度相關(guān),越濃緩沖能力越大與pH及pK相關(guān),pH=pK時(shí)緩沖能力最大2.計(jì)算緩沖正確濃度比值計(jì)算在任一pH條件下一個(gè)酸或堿(或氨基酸)離子化百分?jǐn)?shù)第42頁2、氨基酸等電點(diǎn)計(jì)算

可見,氨基酸pI值等于該氨基酸兩性離子兩側(cè)基團(tuán)pK′值之和二分之一。pI=2pK′1+pK′2一氨基一羧基AA等電點(diǎn)計(jì)算:pI=2pK′2+pK′3二氨基一羧基AA等電點(diǎn)計(jì)算:pI=2pK′1+pK′2一氨基二羧基AA等電點(diǎn)計(jì)算:第43頁A.等電點(diǎn)時(shí),氨基酸溶解度最小,輕易沉淀。利用該性質(zhì)可分離制備一些氨基酸。比如谷氨酸生產(chǎn),即將微生物發(fā)酵液pH值調(diào)至3.22(谷氨酸等電點(diǎn))而使谷氨酸沉淀析出。B.利用各種氨基酸等電點(diǎn)不一樣,可經(jīng)過電泳法、離子交換法等在試驗(yàn)室或工業(yè)生產(chǎn)上進(jìn)行混合氨基酸分離或制備。氨基酸等電點(diǎn)可由其分子上解離基團(tuán)解離常數(shù)來確定--3、應(yīng)用第44頁1.某氨基酸溶于pH7水中,所得氨基酸溶液pH為8,問此氨基酸pI是大于8、等于8還是小于8?解析:主要從氨基酸解離特點(diǎn)考慮,先確定其兩性離子狀態(tài)(即等電點(diǎn)狀態(tài)),然后分析氨基酸溶液變?yōu)?時(shí)是從水中吸收了質(zhì)子還是釋放了質(zhì)子。解答:氨基酸晶體主要以兩性離子形式存在,溶于pH7水中,溶液pH從7升為8,說明氨基酸在溶解過程中從水中吸收了質(zhì)子。溶液中有以下平衡:AA±

+H2OAA+

+OH-要使AA+所帶電荷為零,必須加堿,這會(huì)使pH>8,故氨基酸pI>

8。第45頁2.計(jì)算以下溶液pH值:(1)0.1mol/LGly0.05mol/LNaOH等體積混合液(2)0.1mol/LGly0.05mol/LHCl等體積混合液解答:(1)Gly和NaOH反應(yīng)為:+H3N-CH2-COO-+NaOHH2N-CH2-COO-Na++H2OGly±Gly-0.1mol/LGly0.05mol/LNaOH等體積混合后[Gly-]=[OH-]=0.05/2=0.025(mol/L)[Gly±]=(0.1-0.05)/2=0.025(mol/L)此時(shí)溶液存在以下平衡:+H3N-CH2-COO-H2N-CH2-COO-+H+Ka2依據(jù)公式pH=pKa+lg[質(zhì)子受體/質(zhì)子供體]混合后溶液pH值為pH=pKa2+lg([Gly-]/[Gly±])=9.6+lg(0.025/0.025)=9.6第46頁(2)Gly和HCl反應(yīng)為:+H3N-CH2-COO-+HClCl-

+H3N-CH2-COOHGly±Gly+0.1mol/LGly0.05mol/LHCl等體積混合后[Gly+]=[H+]=0.05/2=0.025(mol/L)[Gly±]=(0.1-0.05)/2=0.025(mol/L)此時(shí)溶液存在以下平衡:+H3N-CH2-COO-

+H3N-CH2-COOHKa1依據(jù)公式pH=pKa+lg[質(zhì)子受體/質(zhì)子供體]混合后溶液pH值為pH=pKa1+lg([Gly±]/[Gly+])=2.34+lg(0.025/0.025)=2.34第47頁3.制備1LpH3.2,0.1mol/L甘氨酸緩沖液,需0.1mol/L甘氨酸鹽酸鹽(Cl-+H3N-CH2-COOH)和0.1mol/L甘氨酸(+H3N-CH2-COO-)各多少?解答:甘氨酸鹽酸鹽(Cl-+H3N-CH2-COOH)實(shí)際上為二元酸,它解離式為+H3N-CH2-COO-+H+

+H3N-CH2-COOHKa1Gly±Gly+pH=pKa1+lg([Gly±]/[Gly+]),3.2=2.34+lg([Gly±]/[Gly+])lg([Gly±]/[Gly+])=3.2-2.34=0.86,[Gly±]/[Gly+]=7.24因?yàn)榕渲聘拾彼峋彌_溶液所用甘氨酸鹽酸鹽和甘氨酸原始濃度相同,所以它們濃度之比就是它們所用體積之比,VGly±

/VGly+=7.24已知緩沖溶液總體積為1L,VGly±/(1-VGly±)=7.24,VGly±=0.879(L),VGly+=0.121(L)第48頁(四)氨基酸化學(xué)性質(zhì)

氨基酸是離子化合物,但在溶液狀態(tài)時(shí),存在以下平衡:化學(xué)反應(yīng)中可用左邊結(jié)構(gòu)式表示氨基酸。氨基酸分子α-氨基、α-羧基能參加反應(yīng),有側(cè)鏈R基團(tuán)也能參加反應(yīng)

第49頁1.α-NH2參加反應(yīng)A.?;磻?yīng)①?;噭浩S氧酰氯、叔丁氧甲酰氯、苯二甲酸酐、對-甲苯磺酰氯。這些酰化劑在多肽和蛋白質(zhì)人工合成中被用作氨基保護(hù)劑。②丹磺酰氯(DNS-Cl,5—二甲基氨基萘-1-磺酰氯)DNS—Cl可用于多肽鏈—NH2末端氨基酸標(biāo)識(shí)和微量氨基酸定量測定。NGly—Ala—Ser—Leu—PheC→→→→NDNS—Gly—Ala—Ser—Leu—PheC水解DNS—Gly、Ala、Ser、Leu、PheDNS-氨基酸在紫外光激發(fā)后發(fā)黃色熒光。第50頁③(生物體內(nèi))在酶和ATP存在條件下,羧酸也可與氨基酸氨基作用,形成?;a(chǎn)物。苯甲酸與Gly氨基?;磻?yīng)是生物體內(nèi)解毒作用一個(gè)經(jīng)典例子。苯甲酸是食品防腐劑,在生物體內(nèi)轉(zhuǎn)變成N-苯甲酰-Gly后,可經(jīng)尿排出。第51頁B.烷基化反應(yīng)α-氨基中氮是一個(gè)親核中心,能發(fā)生親核取代反應(yīng)。Sanger反應(yīng)(2,4一二硝基氟苯,DNFB或FDNB)二硝基苯基氨基酸(DNP-氨基酸),黃色,層析法判定,被Sanger用來測定多肽NH2末端氨基酸。Edman反應(yīng)(苯異硫氰酸酯,PITC)苯氨基硫甲酰衍生物(PTC-氨基酸)→苯乙內(nèi)酰硫脲衍生物(PTH-氨基酸)PTH-氨基酸,無色,能夠用層析法分離判定。被Edman用來判定多肽NH2末端氨基酸第52頁

含硫氨基酸烷基化反應(yīng)硫原子也是親核中心,可發(fā)生親核取代反應(yīng)。生物體內(nèi),最主要甲基化試劑是S-腺苷甲硫氨酸(SAM),是由Met與ATP作用得到S-烷基化產(chǎn)物。在酶催化下,SAM能夠使各種生物分子氨基甲基化,如磷脂酰膽堿生物合成。S-腺嘌呤核苷-高半胱氨酸(比Cys多一個(gè)-CH2)第53頁C.形成西佛堿反應(yīng)西佛堿是以氨基酸為底物一些酶促反應(yīng)如轉(zhuǎn)氨基反應(yīng)中間物。氨基酸α-氨基能與醛類化合物反應(yīng)生成弱堿,即所謂西佛堿(Schiff’sbase)。第54頁D.與甲醛反應(yīng)

用NaOH滴定氨基酸甲醛滴定法判斷蛋白質(zhì)水解或合成進(jìn)度第55頁E.與亞硝酸反應(yīng)在標(biāo)準(zhǔn)條件下測定生成N2體積,即可計(jì)算出氨基酸量。用途:范斯萊克(VanSlyke)法測定氨基氮基礎(chǔ)。可用于氨基酸定量和蛋白質(zhì)水解程度測定。第56頁F.與熒光胺反應(yīng)熒光胺熒光產(chǎn)物熒光產(chǎn)物激發(fā)波長λx=390nm,發(fā)射波長

λM=475nm,該反應(yīng)非常靈敏(1ng),可依據(jù)熒光強(qiáng)度εM測定氨基酸含量第57頁G.脫氨基反應(yīng)經(jīng)對應(yīng)氨基酸氧化酶、轉(zhuǎn)氨酶催化反應(yīng)。第58頁2、α-羧基參加反應(yīng)脫羧基反應(yīng):是生成胺類主要反應(yīng)成鹽、成酯分別與堿、醇作用,可用于羧基保護(hù)成酰氯反應(yīng)(使羧基活化)氨基被保護(hù)后,羧基可與二氯亞砜或五氯化磷反應(yīng),生成酰氯。此反應(yīng)使氨基酸羧基活化,易與另一個(gè)氨基酸氨基結(jié)合,在多肽人工合成中慣用。第59頁3、α-氨基和α-羧基參加反應(yīng)(1)與茚三酮反應(yīng)慣用于氨基酸定性或定量檢測脯氨酸和羥脯氨酸與茚三酮反應(yīng)產(chǎn)生黃色物質(zhì),其余全部α-氨基酸與茚三酮反應(yīng)均產(chǎn)生藍(lán)紫色物質(zhì)。第60頁(2)成肽反應(yīng)這是多肽和蛋白質(zhì)生物合成基本反應(yīng)。第61頁(1)Tyr酚基

在3和5位上可發(fā)生親電取代反應(yīng),如碘化、硝化。

Pauly反應(yīng)——可用于檢測TyrTyr酚基能夠與重氮化合物,如重氮苯磺酸,結(jié)合生成橘黃色化合物橘黃色4.側(cè)鏈R基參加反應(yīng)第62頁(2)His咪唑基與重氮鹽(重氮苯磺酸)反應(yīng)棕紅色附:咪唑基性質(zhì)組氨酸含有咪唑基,它pK2值為6.0,在生理?xiàng)l件下含有緩沖作用。組氨酸中咪唑基能夠發(fā)生各種化學(xué)反應(yīng)。能夠與ATP發(fā)生磷?;磻?yīng),形成磷酸組氨酸,從而使酶活化。組氨酸咪唑基也能發(fā)生烷基化反應(yīng)。生成烷基咪唑衍生物,并引發(fā)酶活性降低或喪失第63頁簡述組氨酸作用解答:(1)His咪唑基pK值在氨基酸和多肽鏈中分別為6.00和7.35,后者靠近生理?xiàng)l件。故在生理?xiàng)l件下,咪唑基既能夠作為質(zhì)子受體,又能夠作為質(zhì)子供體,在pH7附近含有顯著緩沖能力。血紅蛋白因?yàn)楹休^多His殘基,使其在pH7附近有顯著緩沖能力。(2)His咪唑基供出質(zhì)子或接收質(zhì)子速度十分快速,因而在很多酶活性中心都有His殘基參加(3)組氨酸中咪唑基能夠發(fā)生各種化學(xué)反應(yīng)。能夠與ATP發(fā)生磷?;磻?yīng),形成磷酸組氨酸,從而使酶活化。(4)組氨酸咪唑基也能發(fā)生烷基化反應(yīng)。生成烷基咪唑衍生物,并引發(fā)酶活性降低或喪失

第64頁(3)Cys巰基(-SH)參加反應(yīng)--性質(zhì)很活潑作用:這些反應(yīng)可用于巰基保護(hù)。C6H5CH2ClA.在弱堿性條件下,與鹵代烴(如芐氯、碘乙酰胺等)反應(yīng),生成穩(wěn)定烴基衍生物。第65頁作用:與金屬離子螯合性質(zhì)可用于體內(nèi)解毒。B.與各種金屬離子,如對羥基汞苯甲酸,形成穩(wěn)定程度不一樣絡(luò)合物第66頁作用:氧化還原反應(yīng)可使蛋白質(zhì)分子中二硫鍵形成或斷裂。胱氨酸+2H-2HC.很輕易被氧化形成二硫鍵(-S-S-)第67頁次磺酸sulfenic

亞磺酸sulfinic磺酸sulfonicS-nitrosothiolS-nitrothiol第68頁(4)羥基參加反應(yīng)作用:可用于修飾蛋白質(zhì)(酶)。二異丙基氟磷酸

Ser和Thr羥基能夠與酸作用形成酯。在蛋白質(zhì)分子中,Ser常與磷酸結(jié)合。SersSer是大多數(shù)蛋白水解酶活性中心主要組分,各種?;噭┠芘c酶活性中心Ser羥基作用,造成酶失活。Ser第69頁(一)電

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